3ACJA

Crystal structure of imidazo pyrimidine derivative bound to the kinase domain of human lck, (auto-phosphorylated on tyr394)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
271
structure length
270
Chain Sequence
KPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNETAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Ab initio fragment molecular orbital study of ligand binding to leukocyte-specific protein tyrosine (LCK) kinase
rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK
total genus 88
structure length 270
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3acjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3acjA01
5HQ0A 1I44A 4UALA 4BTJA 3QQUA 3PWDA 4M13A 5DOSA 2JBOA 5EHLA 3RAWA 5LVOA 1GNGA 3VRYA 4RX9A 3CD8A 3MFRA 3NVMB 2YEXA 3E88A 5JK3A 3NNXA 2GQRA 3K2LA 2J0IA 4O21A 5HX6A 5L3AA 3EL7A 1PRYA 2C5NA 5L8KA 3QTZA 3ZONA 4KBCA 3HNGA 4BCOA 2A1AB 3FI8A 4DE4A 2PE1A 2Y8OA 4JDKA 4EK5A 3F88A 2BZIB 5DI1A 4BI1A 4DTAA 1OI9A 3P1AA 5HORA 4FI1A 3BU6A 5CTPA 3UG1A 1IA9A 2CCHA 3KRJA 4XOZA 3ERKA 5L4QA 4FTCA 5IA1A 2W9FB 4U6RA 4MAOA 4ZSEA 4EOSA 4E5WA 1PY5A 4F4PA 4PMMA 2W1FA 5M56A 3N4UA 3DOGA 3ZEPA 3DTCA 3D7TB 4CG9A 3TTIA 2UZUE 5CSHA 2QOLA 1NVRA 1HOWA 3EFWA 2PVNA 1R0PA 3CPCA 3QX2A 3NCGA 4G1WA 4BY9E 1MQBA 3UDBA 2I40A 4FV2A 5ANKA 3VBVA 3BLHA 5A54A 4PUZA 1G8AA 2XK9A 3FHIA 4EWQA 4DFYA 1OGUA 4EOMA 4MYGA 4ZMEA 4GKHA 1K9AA 2W17A 4GEOA 4K8AA 4NKAA 5CU6A 3IKAA 4F63A 4Y46A 5IA3A 3DTWA 3Q2MA 2X7GA 1Q61A 5DGZA 5CAUA 1KV2A 2H96A 1YVJA 2B9HA 2CLQA 4G2FA 5KMNA 5HKMA 1IASA 5CF8A 2IG7A 4F08A 2WNTA 3NNWA 3QYZA 3H9RA 4FG7A 5E8UA 3PSCA 2VTTA 4I3ZA 5HBHA 5AUVA 3EFJA 2WQBA 2XKDA 3L9NA 5A9UA 2WKMA 4FEQA 4GIHA 2VTLA 3A61A 4V0GB 4FIIA 1CKIA 3DXNA 3PP1A 4GU6A 5DRDA 4WNMA 4BI0A 1BUHA 4KIQA 3R7IA 5IQAA 3GC8A 4IANA 4QP9A 4G16A 4QP1A 4CT1A 1XBAA 1YDRE 4QNAA 4IWQA 4LV5A 3P7BA 4RG0A 1WCCA 4QMZA 4BCPA 2B55A 3QRKA 3VUKA 4RJ6A 1E1XA 2HW6A 1XH5A 3JY0A 4OTGA 1Z5MA 1ZOEA 4UYNA 5E8XA 4RFYA 4U7ZA 2X2MA 3E92A 1OIYA 2HY81 1M7NA 3PJ2A 3Q04A 4EOIA 4RJ8A 2IVTA 1YDSE 2OU7A 2YA9A 3FLNC 1NVQA 4RT7A 5FLFA 1ZMUA 5GHVA 5DWRA 5AP4A 5G6VA 3FXXA 3QBNA 4BFMA 1NY3A 2UZTA 2XKCA 4G3DA 3BLRA 4IZAA 4WD5A 3TI1A 5DR6A 4D55A 5EYDA 4AZVA 4ZJVA 2QNJA 4ASEA 3TKHA 4IX6A 2YISA 3V5PA 4C3FA 3U8WA 4IE9A 5E7RA 4LYNA 4R1YA 4IAFA 4E26A 3BWJA 3PY3A 1UKHA 4FV5A 2IZRA 2Z7SA 5CVFA 3WE8A 3COKA 4C4IA 3BHHA 4I21A 4CYIA 1UV5A 2FH9A 3GNIB 1DAWA 1ZWSA 4IWOA 4WKQA 1XJDA 5GZ8A 4FL3A 2BALA 4EH3A 3C50A 3ZRMA 3C7QA 4QMYA 3D2KA 3V5JA 4O0YA 3LJ1A 2IW6A 1F3MC 3MY5A 1PMVA 3F3ZA 3PFQA 4FVRA 2GNLA 4L43A 5IUHA 3IQ7A 3S4QA 3LMHA 3MH0A 4RJ5A 3QQFA 3QTSA 4D9UA 3KMWA 1J1BA 2C6EA 4X2GA 3UO5A 2SRCA 5HLWA 4DFBA 2WMTA 3ZH8A 5B2KA 4Y95A 3UG2A 2IZUA 3V5TA 3RTPA 2W05A 3KXXA 2QOFA 3SW7A 3GCSA 5KBQA 2O5KA 4FTMA 4TW9A 4CCUA 4JRVA 4RZVA 2YDJA 5HCYA 4II5A 1TKIA 4EQMA 1XO2B 1QMZA 2E9UA 2HOGA 3GB2A 3MVLA 5AAGA 3TZ9A 4ZTRA 3TNWA 5EKNA 4KINA 2UVZA 1Q5KA 2JEDA 4CSVA 2G01A 2JFLA 3E63A 4U43A 4NCTC 4BBMA 4RX5A 4RZWA 1YXXA 4CLJA 2J51A 5HG8A 4J52A 4AT3A 2RGPA 1P14A 4ZOGA 4AT5A 4PDSA 4BCJA 3TJDA 2XK3A 1KV1A 4I94A 4GK4A 2FO0A 4XV3A 5EH0A 3VIDA 4IVBA 3MIYA 3BEAA 4H1JA 4F6WA 5DT4A 3VF9A 1OM1A 3SA0A 3AD4A 3GBZA 3A60A 4BIDA 4NTTA 5C9CA 5IA4A 4D2PA 5CX9A 3Q5IA 3I0OA 4FKRA 1H08A 3OBGA 4DEAA 3Q9ZA 3V51A 3KRLA 5LVMA 1V0PA 1H00A 2O63A 5EI2A 4UWBA 5D10A 4FR4A 4CFNA 4UWYA 3ORXA 4G31A 2C1BA 1R0EA 3KMUA 5D7AA 1K2PA 3BIZA 3G9LX 2G2FA 3BRBA 1IAJA 2GS7A 5F4NA 4XG8A 2VWIA 4RC4A 2Y9QA 3JYAA 3R8MA 4WBBB 3QGYA 4JVGA 4C62A 3C0GA 5CANA 4NYEA 4WO5A 2R9SA 3QUPA 4F9AA 2IPXA 4BTKA 2GNIA 4HGTA 3RVGA 3V8SA 4C33A 2NNWB 4FTJA 4EH7A 5HU9A 1WVXA 4BBEA 2PVKA 4GU9A 3SXSA 3IGOA 3FQSA 2X2LA 3UZRA 3WZJA 3UZPA 3NUNA 3GU5A 4ANBA 4O7RA 4K0YA 4CYJA 2HELA 3MTLA 2WTJA 1Y8GA 2A19B 4CV8A 3VBXA 3KL8A 3CE3A 2XEYA 2XIXA 4L8MA 5AP6A 4PTGA 4ZJJA 4HNFA 1BLXA 1YOJA 3QZHA 2CKEA 2EUFB 4AZTA 4IAZA 3LMIA 4O7NA 4L3JA 4O0WA 2JITA 3QALE 3E8CA 2W9ZB 4TNDA 3D9VA 3R02A 3PJ8A 5LARA 4O7ZA 3U9CA 3UIXA 4GSBA 4QP2A 5H9BA 4F6UA 4ACMA 3IDCA 1JLUE 2KTYA 4DTKA 4W8DA 4CFVA 5BQ0A 2Z02A 3VS1A 1OKZA 2PMLX 4H39A 3BU3A 4N70A 4YLJA 3LFQA 2J5EA 4BRXA 4WUNA 3KULB 3PE1A 1YW2A 5J9ZA 4N4SA 5AFVA 4QTEA 4GFGA 3C4ZA 2BZHB 4AA0A 4O91A 4F0GA 3QD4A 5AV1A 3B2WA 3FE3A 4NM7A 4KSPA 1URCA 2HZ4A 4YNEA 4BCQA 4IVCA 3UVRA 2ZDUA 3MH3A 4CEGA 4DN5A 5AV4A 4JBOA 3C1XA 4NM3A 4QP7A 1CKJA 4FSRA 2F2CB 3ZC6A 2HXQA 3EQHA 3EWHA 3QX4A 3P7CA 4FSUA 4KAOA 5BVKA 5LCKA 4I0SA 3R9NA 4FV3A 2JKOA 3R00A 4UXLA 4V04A 3QD3A 4FV7A 5CS6A 1JNKA 1NXKA 3OOMA 2BAKA 2QLUA 5E8SA 3QC9A 2RF9A 3A7IA 4JQ8A 4EOOA 4S33A 5T3QA 3BYSA 3FYKX 2YFXA 3MJ2A 4G6NA 4IB0A 4C35A 2JKKA 1LR4A 3Q5ZA 4TWPA 4EOPA 2RFNA 3WARA 2PZ5A 1E9HA 4MXYA 4ONAA 4BDAA 2C69A 4FTTA 2G15A 2C0IA 5A4QA 4F0FA 3PJ3A 4RJ7A 3P86A 3QZIA 5B7VA 5C8KA 3FMJA 4UN0C 4XX9A 4FSQA 4I20A 4NJ3A 1BI7A 5AR4A 3U54A 3I79A 3HRFA 4KBAA 2OIDA 2XM8A 5JFXA 5IF1A 2YJSA 4QTDA 2QCSA 3R9OA 3KFAA 4BR3A 3R7EA 3CQEA 4F0IA 3F6XA 5CU4A 5AM6A 4BKYA 2BHHA 4XCUA 2BCJA 3MVHA 3BHVA 5KKRB 2YCRA 3ANRA 1XH6A 3DB8A 2WMBA 4UV0A 3REPA 2B54A 4OTWA 4U81A 4GJ3A 4U97A 2ZB1A 3PE2A 4H36A 3TV7A 2QI8A 3NR9A 4E4MA 4ZP5A 1JSVA 2F4JA 2YM5A 2OGVA 3CD3A 1UNHA 3E8DA 3FI4A 2ITXA 4ZTQA 3DY7A 2FGIA 5AA8A 3FI2A 4BI2A 3WZDA 1PHKA 4MCVA 2VO0A 4QMNA 5I5ZA 3F2NA 3JXWA 4I6BA 5CEKA 5JT2A 2UVYA 1XHAA 2UZLA 4D4SA 3PYYA 4IJ9A 4C4EA 5KMKA 1UU8A 2W7XA 4F9YA 5IQCA 4I6QA 4L52A 2OIQA 4M68A 3PWYA 2PUPA 3FMNA 3SW4A 3UTOA 4H58A 4E5AX 3O23A 5M07A 5H3QA 4R77A 3LPBA 5DN3A 4IEBA 2WGJA 5KNJA 4ACHA 4R8QA 4WG5A 2PVLA 3UNKA 2UW5A 3OEFX 5DG5A 3DKFA 3R73A 2OKRA 3LKMA 4DG3E 2E9OA 2HYYA 3OG7A 3NWWA 1KE7A 4AOTA 2VO3A 1VEBA 2V0DA 2WTVA 4JIAA 2VO7A 3N4VA 2CGVA 4F1TA 4N6ZA 5ETFA 3W33A 5EYKA 3QTRA 5I0BA 3VVHA 5B2MA 5EQEA 5K4IA 5IQIA 3NUXA 3R7OA 3V01A 4M0ZA 4EWHA 3NUSA 4F70A 2AC5A 5AR3A 5HG9A 3HP2A 5LMBA 4F9CA 5EW9A 4KUJA 2R0UA 4KSQA 4L53A 3OCTA 4O84A 1QPCA 3AMBA 1XH8A 4JLCA 5A6OA 2UZVA 1A9UA 4EUUA 2YITA 3HAMA 3GOPA 3BCEA 1H01A 3NUPA 5EI8A 3MSSA 2WMXA 4GVAA 4OT5A 3VF8A 5JGDA 1XH7A 3MVMA 4L01A 3CGFA 2XJ2A 4LGGA 4AOJA 5JFVA 2IWIA 5AM7A 5F94A 5A4CA 4AT4A 4OAUC 4O2ZA 4OUCA 2G2IA 5CWZA 5CENA 4C0TA 5TR6A 4G5PA 3TM0A 1DM2A 2XRWA 3DKCA 4MKCA 2UVXA 2C6MA 2GFSA 4E6DA 4BHZA 3A4OX 4G5JA 5LXMA 3EZRA 4TYGA 2VTNA 4QMSA 3C0IA 3M1SA 3RPRA 4BKJA 3MH2A 4HZSA 4OBPA 4U80A 3ZO2A 2B9JA 4PV0A 1UU3A 3UMXA 1YKRA 2XNGA 1Y6BA 4NU1A 2CNQA 5KHWA 1JKTA 4GYIA 4NFNA 3WIGA 3C5IA 4XG4A 5ANIA 5C26A 2BDFA 4G17A 5IQBA 4IFCA 5M53A 1B38A 2CJMA 4HCTA 3BV3A 5L2SA 3BLQA 4FKJA 4V01A 2UZDA 4YZNA 4FEWA 3F66A 2BIKB 3E62A 3R04A 5L2WA 2C5VA 4OT6A 2YLFA 5KHXA 3O17A 1OL6A 4FYNA 4E20A 4IVDA 3R8UA 3A7FA 4E1ZA 5HTBA 3RAKA 3VO3A 1ZYLA 3EQRA 1ZMWA 4IM0A 4KKGA 4MQ1A 1ZOHA 4HYIA 3FWQA 1UU9A 4QYEA 4B99A 4DLIA 2F57A 3BGPA 5HX8A 2V55A 2XNOA 4OLIA 4QYFA 2W4OA 3DJ5A 4GK2A 3LXLA 5AP5A 3FZPA 3MBLA 5LVPA 5FBNC 3EJ1A 1M2PA 2OZAB 3LHJA 5J8IA 5ETCA 4QMLA 2YIRA 2BROA 4A9UA 3R30A 2A2AA 2VN9A 2Y4PA 4O0TA 4CZYB 3FQHA 4HGSA 3SAYA 3C51A 3CS9A 5CVGA 3DU8A 1JBPE 5FEQA 2I0YA 5K5NA 4MHAA 2YZAA 5LQFA 3D94A 4PP7A 5IQEA 2RG6A 3A4PA 5AJQA 4LM5A 4Q9ZA 4O0RA 4IJPA 4LOQA 1J1CA 2BRHA 3TKUA 2X6EA 3D5UA 2LGCA 3GU6A 3D83A 3EKKA 3LCTA 4H05A 3OMVA 4MK0A 1YHWA 4UZDA 3GU4A 4GMYA 4TYIA 2YM4A 5AUYA 1WAKA 1Q97A 4AZSA 3S1HA 5CYIA 5IMXA 2ITVA 2PVFA 4EKKA 5AIKA 5CT0A 4AFJA 5I9UA 2OXDA 3QYWA 3QKLA 4UMUA 3ZO1A 5H8BA 4ZS4A 3OWJA 2YZLA 4J97A 4GT4A 3VNTA 3KRXA 3EN4A 3F3UA 3AGLA 3JS2A 3WF6A 4EZ7A 3FZTA 5FM3A 3T8OA 1Q8YA 4QP3A 2BFYA 3AMAA 3O51A 4H1MA 1IG1A 2FVDA 3OTUA 2QODA 4MXAA 5CI6A 3WIKA 5TO8A 4YZCA 4XP0A 2C0OA 3R8LA 4J8NA 2C5YA 4MX9A 5BVNA 4HYSA 4U5JA 3ULZA 2PVRA 2W1EA 4ANOA 2OW3A 1M17A 3GEQA 3SRVB 4AZWA 4RWIA 4C61A 1OBDA 4DGGA 2YAAA 5TT7A 2C0TA 4NCTA 5GIPE 1YXVA 3ETAA 1WZYA 1LEWA 3D15A 4GKIA 5D7VA 4Y83A 5E90A 2UW7A 4GL9A 2F2UA 4NUSA 5K5XA 2V62A 3BYUA 3FAAA 5FDXA 2VTHA 3I81A 3BZ3A 3V8TA 5B2LA 1WFCA 3NUAA 5K0KA 4S31A 3WE4A 3ZO3A 2WMSA 3COIA 3EFKA 3NAYA 3Q9WA 3LLTA 3S2PA 4B4LA 1KSWA 3OCBA 2JIUA 2YIQA 3ODYX 2R64A 3DCVA 4X2FA 3CLYA 5JMSA 5H8EA 3QD2B 2IZSA 2W1CA 3VS7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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