4QPMA

Structure of bub1 kinase domain
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
345
structure length
329
Chain Sequence
PNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQKQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLESAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Substrate-Specific Activation of the Mitotic Kinase Bub1 through Intramolecular Autophosphorylation and Kinetochore Targeting.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
total genus 90
structure length 329
sequence length 345
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 4qpmA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qpmA02
4CFUA 3TNPC 4CYIA 5DBXA 3A7JA 3OUNB 2UW3A 3UPXA 3SXFA 4NKSA 4O27B 2JD5A 4XG7A 4ZTQA 3ZHPC 1Q4LA 1SNUA 2I0YA 3EYHA 4LM5A 5IEYA 3R0TA 4TNDA 3ZFYA 4E7WA 2W06A 1XKKA 4LV5A 4BYJA 2PVHA 3GBZA 4TYHB 5A4CA 4MF1A 2H96A 2VTIA 3HV3A 1OKWA 4CZUA 2EWAA 5CEOA 2BTSA 3BHTA 3OW3A 2DS1A 1KE9A 1XBAA 3I79A 5FBOA 1K9AA 4ACDA 4O1OA 2JGZA 3ORPA 2W96B 2QO7A 2WTCA 1OL2A 4FSQA 4ASEA 1H27A 5KMJA 3NW7A 5BVEA 2JDOA 3NIEA 1W7HA 3OC1A 1H1WA 4EK4A 5DVRA 3KQ7A 4X2KA 3R6XA 4HPTE 4U97A 3GOKA 3QD0A 4B0GA 3UG2A 1H0WA 2O64A 4XYFA 4B99A 4FV4A 2WMWA 3OOMA 2G2FA 4QMZA 3D5UA 4S32A 4UN0C 1QPJA 5EDPA 4I5PA 2C0IA 3VUDA 2GNJA 5JFVA 5EK7A 2PE1A 3EN9A 4C7TA 2BZHB 2PUUA 3RNIA 4E6AA 4Q9ZA 1ZMVA 3BEAA 4BDGA 1YWNA 2X39A 4EH6A 4EK3A 2BRBA 4C8BA 2R3FA 3RMFA 5JKGA 2BR1A 3E7OA 1TQIA 2ZV7A 2UZBA 1AQ1A 3ANRA 4M15A 4DEDA 4PUZA 3SXRA 2AYPA 3TN8A 1YDRE 5HHWA 5ETFA 3L9MA 3W33A 3QZHA 3O7LD 4LFIA 3KRXA 4ZXTA 4HVHA 1BLXA 5DT0A 3QALE 5HLPA 3MWUA 3EHAA 4PNKA 3GCQA 2YCSA 4MAOA 5LVNA 1UKIA 4LV8A 4EH8A 1UU9A 4MF0A 3QTIA 4RGJA 4MKCA 3QKMA 1UU7A 3DNDA 2XJ0A 3A4PA 3OCSA 1CKJA 3QCSA 3H3CA 4G6NA 2IVSA 3UYSA 4EHVA 4JQEA 3FMEA 4I5MA 4IB3A 2R3QA 1I44A 3VC4A 5GHVA 4XCUA 5IA5A 3AC4A 3V04A 4FTJA 2NRYA 2GSFA 3PWYA 4JR3A 3A7GA 5AV4A 2GNGA 3BQRA 5EYDA 3GFWA 3QQUA 5J1VA 5BVKA 4E5BA 4KSQA 2I0HA 2VRXA 2OH4A 2JEDA 1CSNA 1OMWA 3FQSA 2XIYA 4JLCA 4OBOA 4P2KA 5JFXA 3OY3A 4UV0A 3OWPA 2VWVA 5HU3A 2P0CA 3VHEA 4BCJA 1FOTA 4E4XA 5M44A 2W9FB 5T68A 3WBLA 3I0OA 2H8HA 3R02A 2BZIB 4FIEA 4C33A 4YJTA 3MVHA 4EOLA 3LCOA 4N70A 4ITHA 3KY2A 4WUAA 3FLYA 3DNEA 5K0KA 1ZYDA 3OT3A 4RVLA 4NU1A 2XRWA 2J0IA 2PVRA 3EWHA 2QC6A 4MNEB 5HE3A 3KU2A 4RJ4A 2V7OA 5CU6A 5EH0A 2O3PA 2W1DA 3QX2A 4LGDA 4QO9A 4KBKA 3U6HA 5AP0A 3R8PA 3NNWA 4C34A 4GT5A 5BUJA 4JXFA 5I9XA 1FGIA 3QYWA 1P5EA 3V3VA 5IUGA 2OF2A 4UXQA 4O0YA 3GCPA 5F95A 4A7CA 5IUHA 4JT3A 1IRKA 1JKTA 3AOXA 2V5QA 3DFAA 3RCDA 3KC3A 4OAUC 4NCTA 2UW8A 2XNBA 3ACKA 3MFSA 5J95A 4UY9A 5E8SA 4I4FA 4EQUA 5CANA 1M14A 5DH3A 4DFXE 5A14A 3U4WA 2QURA 3OWJA 2VTRA 4GVJA 2B9FA 2VTLA 2IVTA 3HEGA 4XG6A 3PY0A 2XH5A 3EFLA 3RALA 2R3PA 3Q2MA 2ZDUA 3FC1X 4LUDA 3PSDA 3O71A 3QRUA 4MBJA 3QLFA 1QPEA 4ZEGA 2WQOA 4QPSA 3QA8A 4TTHB 4FX3A 2C6LA 2WMTA 3R1NA 2JKQA 3KK9A 4TXCA 5AM7A 4YPDA 4FTOA 4IVBA 4ZY5A 4FUXA 2UZNA 4EUTA 4ZLYA 5DE2A 4ACHA 5CEPA 3OUKA 4D2RA 3LFSA 2BIKB 4HCVA 3P7BA 4RX7A 5DIAA 5AP5A 2EU9A 5FDPA 3L9LA 3ORZA 3NDMA 4AGWA 3NIZA 4MXZA 3SX9A 4QP3A 3BZ3A 4BHZA 4FVRA 3LOKA 3RM6A 5KKRB 3ETAA 3VUHA 3DK7A 4LG4A 4TYGA 3HGKA 2C6KA 2WOTA 3Q5IA 3U87A 1H25A 1YXVA 4QP2A 5DOSA 4EWQA 4OTPA 2WTDA 5DRDA 3S00A 4QP6A 3VS1A 4V01A 4N6YA 4FBXA 4BIEA 4MYGA 5LJJA 4NIFB 1ZYCA 2R0IA 3LZBA 4CEGA 3OD6X 4A06A 2YISA 4KIKB 4HZSA 3D5XA 4W4YA 4QPMA 2ZM3A 3O96A 4GMYA 2XYNA 4KA3A 1G5SA 2WEIA 4UZHA 2ZYBA 4NM0A 3ZRMA 2VWUA 3W8QA 5AP1A 1ZZ2A 3MH2A 4AW2A 1O6YA 2OH0E 1HCLA 2UW5A 3LXLA 4U40A 4E26A 4ACMA 3N9XA 4ERWA 5FXRA 4X3JA 4D28A 3CGFA 5ANEA 3R00A 4P5QA 3R7OA 4D5HA 4JG6A 4KRCA 2QNJA 4G5JA 2X0GA 4D4YA 3MV5A 5HTBA 5CVFA 1JLUE 3FBVA 4CFMA 5M57A 4DGNA 5L2WA 1XR1A 4ZLZA 2XM9A 3LW0A 4IM0A 4RIOA 3O0GA 4ANLA 1GAGA 2C6MA 2Z7SA 4BDDA 4YC3A 4FTMA 1ZWSA 4O2ZA 2GFCA 3BGQA 4CXAA 3D5WA 4CZTA 4F7SA 4F6UA 4PP7A 4GS6A 3NRMA 4TWPA 3V8WA 5HG9A 1UNGA 3A60A 3R30A 4GG5A 3WARA 4F1MA 3ZU7A 4LGGA 3LCTA 4IVDA 4JRNA 4E6CA 2IZTA 1E9HA 5EM6A 2J90A 3KN6A 1YI6A 3FY2A 3UG1A 3K5UA 1DAYA 2A4LA 3EL7A 5EG3A 1U59A 4ENXA 3AT4A 4RJ8A 2YCQA 5AWMA 3CS9A 5H2UA 1PKDA 2OXDA 2PHKA 3UODA 3CQUA 4C2WA 4JBPA 4YLKA 3WZKA 1P14A 4NFNA 3TACA 2PL0A 3DB8A 3SV0A 2F7XE 2F9GA 4OBQA 4O0RA 4EH4A 3TNQB 1OIRA 3BYMA 4RJ5A 4PDSA 1Q8YA 1T45A 4PQNA 1YWVA 3Q53A 4CFWA 1SVEA 3ERKA 3IS5A 5KHWA 2GCDA 3NUNA 3BI6A 4MXCA 3MVJA 5FM3A 3HMNA 2X4ZA 3AC1A 4NM5A 5JH6A 1JNKA 4XH6A 5C8NA 4BCQA 4CCBA 2OXXA 3A7HA 3HKOA 2XP2A 4I0SA 3VUIA 4CYJA 4U41A 1K3AA 4NJ3A 4L45A 5FLFA 4AE6A 4JI9A 3FQEA 3JS2A 4WSQA 2JFMA 2QKRA 3P23A 4NWMA 1S9JA 3PVBA 2VO3A 5HORA 2UV2A 2XZSA 1J1CA 1PMNA 4G6OA 5JZJA 4ASXA 4RA4A 4GUEA 3EN6A 5IF1A 1O9UA 4BTMA 5FM2A 3PY1A 2WU7A 4RIYB 1I09A 4O0TA 4PL4A 2W4OA 5D41A 5KBQA 4WT6A 3UJGA 1RE8A 3QRTA 2EB2A 5CZIA 3VBXA 5I0BA 4Z55A 3UO6A 5CYIA 2CGVA 2GNIA 2J9MA 2XNEA 4GL9A 4EKKA 2F2CB 4G1WA 4DG2E 1BMKA 3AQVA 4YO4A 2Q0BA 1SM2A 2ITZA 3JY9A 4IAZA 2IW9A 3LCKA 4BRXA 2VN9A 5BYYA 4L67A 4FTKA 3BV3A 4XP3A 4I20A 3MH0A 1HOWA 5EI6A 3ZS5A 5LMKC 2UZWE 2R5TA 3G5DA 3VQUA 2HK5A 4J95A 4FTCA 4BCPA 3MW1A 3NUPA 5M4UA 2YN8A 5D11A 3UZPA 3EQCA 2XK9A 4MXOA 3OF0A 5A3XA 3NYNA 1H1SA 2JKMA 4IX6A 4FV9A 3TJDA 3F5PA 3TV7A 4JBOA 4K18A 3RPOA 3MN3A 3F88A 3LQ8A 4NW6A 1TKIA 2O5KA 3AC3A 3WF7A 3VHKA 2H34A 5CF4A 3SHEA 4FSZA 5AV3A 3P79A 3A4OX 3NUSA 3ZO4A 4CZYB 2X2MA 2W1HA 1DI8A 1R39A 2HWPA 3DKFA 2QOQA 3PUPA 2ERZE 4Y5QA 3LIJA 2OBJA 5EHOA 3O7LB 3O8UA 4XG3A 4CCUA 4BBMA 4FTQA 2ZM4A 4ANMA 1H1QA 4IZ7A 5D1JA 3TV6A 4RRVA 4OTQA 3ZO2A 3NUYA 3VUTA 3ZUTA 5M55A 5L2SA 5LCJA 3RNYA 3E93A 2J0JA 4AZEA 4YSJA 3U51A 3UZTA 3AGMA 2X8EA 3HL7A 4RIXA 3C9WA 5D7VA 2WMQA 2NP8A 4IBMA 2W0JA 1W83A 1M2PA 2REIA 4Y85A 3O17A 1ZOEA 4FV3A 2CGWA 4HYUA 5D7AA 3H4JA 3PIYA 5TOZA 2GNLA 2IVVA 1VZOA 2J51A 3PG3A 2ITVA 3T9IA 3BBWA 1VYZA 2F2UA 2YDIA 4YJPA 4AG8A 4M97A 3LE6A 2C6TA 3COIA 3ZEWA 4FIFA 2R3LA 4IHPA 4BI1A 1BL7A 3TUBA 4F7JA 1Q8UA 2BHEA 5HO7A 3F9NA 4RX9A 3JUHA 1XQZA 3G6GA 4DGMA 2X2LA 5L8LA 4KB8A 2PZRA 2WQEA 4HVIA 5KKRC 3QCXA 4DEGA 4I23A 3OCTA 5TF9A 1Z9XA 4YJOA 1ZZLA 3UOLA 4EWHA 5IDPA 2XIXA 4QMSA 4TRLA 4CV8A 5C01A 4LRKA 1BL6A 1R1WA 4XOYA 3BQCA 1ZXEA 4BL1A 4KSPA 5J9YA 3GCUA 1PXIA 2YA9A 5AMNA 4YZBA 2CCIA 5CU3A 2XYUA 5HD4A 2X9EA 2VX1A 4RWIA 3BYOA 5AP2A 4UMUA 2YDKA 4TN6A 4GUBA 4V0GB 4YC8A 4FZ7A 3QXPA 3TNIA 5TT7A 5L6PA 3L9PA 4FZAB 5EYMA 4R1YA 2WD1A 2VAGA 1UVRA 3LAUA 2BCJA 3BHYA 3E8NA 4FNWA 1ZYLA 4HZRA 2QOBA 3R7YA 3ZM4A 4BB4A 5GZ9A 3F6XA 1Q24A 5EM8A 3DBDA 4UX9A 3ZYAA 3IKAA 3V5QA 4XV2A 3RHKA 3WIKA 1OPJA 3I6WA 1KV2A 2QOFA 3DBCA 3DTWA 5EHYA 3FXZA 2R0UA 2J0KA 2G1TA 4GG7A 2ETMA 2W17A 3LXPA 1OPKA 1GJOA 4NFMA 1YDTE 4V05A 3Q9YA 5AUWA 5HG7A 3IG7A 5CEQA 3OZ6A 4TWNA 3RM7A 3ZLWA 5EI8A 4ZJVA 5E91A 5AR4A 4E93A 5IMXA 4A07A 2GU8A 2C30A 2QKWB 5E8XA 3Q32A 3FHIA 4L68A 4GEOA 4NT4A 4PL3A 4BTKA 4DLJA 4YU2A 1QMZA 3TZMA 2FH9A 4GJ2A 3HMIA 3VBQA 2YLFA 5JGBA 4EOSA 2X6EA 2Z7RA 5KMKA 4EOIA 2WKMA 2B9IA 5C26A 3EQGA 3NYOA 3V5PA 2R64A 4C35A 3SDJA 3HRBA 4JAJA 4D9UA 1NVQA 2VTHA 3PA4A 4YBJA 4RVTA 3BGPA 4F9YA 3P86A 4FKRA 4ALUA 2Q0NA 4ZP5A 5AV1A 4R8QA 4X0MA 2PVNA 5AUVA 3FXXA 3PSCA 3R8MA 2ONLC 4UEUA 3UBDA 2G2HA 1UWHA 2GNHA 3QZGA 3TT0A 2GDOA 4BYIA 3FLQA 4F0FA 2XUUA 3SXSA 5ICPA 3ZZWA 2P3GX 3ZMMA 4FSWA 4UWCA 2W5BA 5BMMA 3BLHA 2FVDA 2G15A 1ZOHA 4HGTA 2XIKA 2Y6OA 3FLNC 4O2PA 5I4NA 2OIQA 2UZOA 3FMJA 3NSZA 2PMIA 4EL9A 2OFUA 5T3QA 2O63A 4QMLA 5HG5A 4WNPA 4L8MA 4EUUA 5HEZA 4KNBA 1XH4A 3FC2A 4M66A 3IDBA 3TCPA 4L6QA 3TEIA 1WMKA 3U9NA 2C0TA 3IDCA 3R04A 4JIKA 3ITZA 4IMYA 3QHRA 3CD3A 4QQ5A 4M69B 3GU7A 5JN2A 5LCKA 3EYGA 3KRJA 1XWSA 3W2SA 4AACA 2O8YA 4GYIA 4RLLA 1O6LA 2JDVA 3A62A 2DQ7X 1U54B 4FGBA 4OTWA 4PPBA 3DJ6A 3G2FA 3WF9A 2WB8A 4GCJA 2HWOA 2BILB 2WQMA 4X2NA 3KMMA 3VULA 4YHFA 2P2HA 3WZJA 4QTEA 4GK4A 3MDYA 2XM8A 3LFFA 3P9JA 3SRVB 4RFZA 2YIWA 4J97A 1GNGA 3ZH8A 1XJDA 3EQPA 4FTAA 3ORTA 2VWBA 3MFUA 4MD9E 4E20A 4KKEA 2B4SB 1M7NA 3FSFA 4LOOA 3W2RA 5K5XA 2PMOX 4IFCA 3RPVA 2QOIA 1O6KA 3AT3A 5H9BA 2RIOA 2WO6A 2B9JA 4YJRA 4I24A 3A2CA 1DM2A 2QHMA 5HG8A 4YJSA 1E1XA 2HY81 5FXSA 1YOMA 3LJ0A 1XH5A 1WVXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4FT7 A;  1K2P A;  3GU5 A;  3QAM E;  3VO3 A;  3S0O A;  4DH3 A;  1N3T A;  5AEP A;  4BBE A;  3AMY A;  4PNI A;  5CVG A;  4CKR A;  5LOH A;  1NXK A;  5B2M A;  4IZA A;  4PV0 A;  4A9T A;  3JYA A;  3PP1 A;  2YJR A;  5HO6 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4CFU A;  3TNP C;  4CYI A;  5DBX A;  3A7J A;  3OUN B;  2UW3 A;  3UPX A;  3SXF A;  4NKS A;  4O27 B;  2JD5 A;  4XG7 A;  4ZTQ A;  3ZHP C;  1Q4L A;  1SNU A;  2I0Y A;  3EYH A;  4LM5 A;  5IEY A;  3R0T A;  4TND A;  3ZFY A;  4E7W A;  2W06 A;  1EFU B;  1XKK A;  4LV5 A;  4BYJ A;  2PVH A;  3GBZ A;  4TYH B;  5A4C A;  4MF1 A;  2H96 A;  2VTI A;  3HV3 A;  1OKW A;  4CZU A;  2EWA A;  5CEO A;  2BTS A;  3BHT A;  3OW3 A;  2DS1 A;  1KE9 A;  1XBA A;  3I79 A;  5FBO A;  1K9A A;  4ACD A;  4O1O A;  2JGZ A;  3ORP A;  2W96 B;  2QO7 A;  2WTC A;  1OL2 A;  4FSQ A;  4ASE A;  1H27 A;  5KMJ A;  3NW7 A;  5BVE A;  2JDO A;  3NIE A;  1W7H A;  3OC1 A;  1H1W A;  4EK4 A;  5DVR A;  3KQ7 A;  4X2K A;  3R6X A;  4HPT E;  4U97 A;  1IS8 A;  3GOK A;  3QD0 A;  4B0G A;  3UG2 A;  1H0W A;  2O64 A;  4XYF A;  4B99 A;  4FV4 A;  2WMW A;  3OOM A;  2G2F A;  4QMZ A;  3D5U A;  4S32 A;  4UN0 C;  1QPJ A;  5EDP A;  4I5P A;  2C0I A;  3VUD A;  2GNJ A;  5JFV A;  5EK7 A;  2PE1 A;  3EN9 A;  4C7T A;  2BZH B;  2PUU A;  3RNI A;  4E6A A;  4Q9Z A;  1ZMV A;  3BEA A; 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