3UMWA

Crystal structure of pim1 kinase in complex with inhibitor (z)-2-[(1h-indazol-3-yl)methylene]-6-methoxy-7-(piperazin-1-ylmethyl)benzofuran-3(2h)-one
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
268
structure length
264
Chain Sequence
QYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Rational evolution of a novel type of potent and selective proviral integration site in Moloney murine leukemia virus kinase 1 (PIM1) inhibitor from a screening-hit compound.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase pim-1
total genus 81
structure length 264
sequence length 268
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-11-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3umwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3umwA01
4YBKA 4LOQA 2HW7A 3PY0A 4XP2A 1H1RA 5HTCA 1OKWA 5AP2A 1KV2A 5IF1A 3VBXA 1KE7A 4QMYA 2VAGA 3UTOA 2J6MA 3TEIA 1ZXEA 4A4XA 2IG7A 3HVCA 3VUHA 1GZ8A 3CIKA 3HAMA 1O6YA 4FSNA 3ZXZA 3D94A 2VWWA 4AN3A 2B9FA 3HV5A 4CG8A 3MY5A 4FTAA 2PVLA 1BX6A 4FEXA 5IA1A 1APME 1SMHA 4IWQA 2I7QA 3FKLA 3HECA 1UA2A 2GQSA 3TZ7A 3FPMA 3LFQA 4R78A 4C0TA 4OAVB 1CDKA 4RZWA 4YJOA 3EKKA 4WIHA 2C68A 2X4ZA 2PE1A 2VN9A 3CR0A 2XK6A 4DFXE 4A06A 4ANBA 3DB8A 4NJ3A 2B4SB 2OSCA 3O50A 4IAZA 4IWDA 3S1HA 5M06A 2FSOX 3BLHA 3BV3A 3FQEA 4YNEA 1UU9A 5LMKC 3FXWA 1ZLTA 3KA0A 3Q9ZA 4CKRA 4UZDA 5A6NA 1YHSA 5IH6A 2QKRA 3ZM9A 4L67A 4U3ZA 1XR1A 4ALUA 4F7SA 5E8SA 3CY3A 5DR9A 4Z9LA 4JXFA 4FTQA 3ZO4A 3F2RA 3DNEA 5HE1A 2I6LA 3G51A 4BY9E 2ONLC 5CT7A 4A4LA 2E9OA 3T8OA 3AOXA 3DK7A 5JT2A 2ZVAA 5TT7A 4C4IA 1XBAA 2VRXA 4TWPA 3G6GA 3H3CA 4HZSA 4QYHA 3C4CA 4RX5A 3FSKA 5CAUA 4BC6A 3P9JA 2B55A 1OZ1A 3E8DA 4BDEA 4JRNA 2YCRA 5CAVA 3OTUA 4FGBA 3DGKA 3NCGA 4KRCA 3W8LA 3ZLYA 4FUXA 4XYFA 4BDKA 4CFUA 5CAOA 3LLAA 3BEAA 4FV6A 4AZTA 4EH6A 3NNVA 1OMWA 4W4VA 4EHEA 2G2IA 3ORXA 4MXCA 4KWPA 5AP7A 4FNWA 4C36A 4ZLYA 4QMPA 4RBLA 3EN9A 4EHVA 3KULA 4PMSA 2WD1A 2WXVA 4X2NA 4X0MA 5AM7A 3UJGA 1Q8TA 1J7IA 2WZJA 2Y8OA 4M69B 3ZRKA 4YU2A 4WG3A 2BAJA 1YVJA 4B0GA 2HIWA 5M09A 4D1ZA 4IEBA 3R1QA 4KIQA 1RW8A 2ZMDA 3REPA 3TNWA 3CBLA 3OZ6A 1H08A 1ZY5A 4MQ2A 3EQPA 3UQGA 4FSUA 4F6UA 4O96A 4I20A 3OWJA 3R02A 4CFFA 2WB8A 4EQUA 5F95A 4M15A 1WFCA 5HX8A 4KKHA 2J90A 4KS7A 2IN6A 3EQRA 3IOKA 4JX3A 4O86A 1Q41A 3UPZA 4ZMFA 2YIRA 3TZMA 3ORPA 3GUBA 3KFAA 4FTLA 4YPDA 2QC6A 5CSHA 4TRLA 5CX9A 4NZWB 4A4OA 5J87A 1YDTE 4FV0A 1PMVA 1G3NA 1U46A 2V22A 4GMYA 3UBDA 3VUGA 2Z7QA 3SA0A 3C5IA 4BICA 4O0RA 4NFMA 2QNJA 4O27B 5CAQA 3TUDA 3FHRA 4FZ7A 2ZM3A 4ZY6A 4DG3E 2ZB0A 4JBVA 1ZOEA 4JR7A 4AXAA 3R1YA 4W4YA 1RJBA 3RZFA 1H26A 4FX3A 4LFIA 4BCGA 3DTWA 2AUHA 2BRHA 4BDAA 4Q2AA 5E8UA 2R3IA 4EKKA 3TUCA 1Z9XA 3IGGA 3CY2A 2X81A 2J50A 1H00A 4FSQA 4K77A 3DJ6A 3KRLA 4FKPA 4DEEA 4GFGA 4V05A 1U5RA 4WNKA 4RVMA 4Y5HA 2QHMA 3FLNC 4RZVA 3MVHA 4FV7A 4TYEA 1JSTA 3F9NA 4I0SA 3QTQA 3I0QA 3E88A 1IR3A 2GFSA 1TQPA 3UQCA 3ZTXA 5BUIA 2VX0A 2YFXA 3H4JA 4XS2A 4DH1A 4BTFA 1YQJA 4J96A 5F1ZA 2Y6MA 5I9WA 1LP4A 3TNPC 3WYYA 4QO9A 2C0IA 2QR7A 5AP4A 2B0QA 1P4FA 5CF6A 1Y8GA 2JDSA 3ZBXA 3NW7A 2JFMA 4B4LA 5LMBA 5M4CA 4FSWA 5K3YA 5IZFA 3AC1A 2YWPA 4G3GA 3LIJA 4QNYA 4R3RA 4ACGA 3CXWA 4ANOA 3KRJA 3C0GA 4D2PA 3SG8A 1IA8A 1STCE 3QF9A 3FZOA 2PVNA 2BDWA 3E63A 4UMUA 3W8QA 4BTMA 3K3IA 3I7CA 3PJ8A 4IX5A 5E7RA 3D9VA 4RSSA 5HE3A 2ZDUA 3W55A 4Z3VA 2IPXA 3KMUA 4BIBA 2CKEA 1YDSE 2XK4A 4P5QA 4RIYB 3BYVA 3QBNA 5DWRA 4F70A 2OGVA 3G9LX 5CEOA 4LRJA 1H01A 5CNOA 4D4VA 5AAEA 4WNOA 3V01A 4QQJA 2BRNA 4L53A 4YJPA 2QU5A 1YHVA 3COHA 3VHEA 4NU1A 4RA4A 3R8MA 2O64A 3DT1A 1JSVA 2JDVA 3RCDA 1YHWA 4KRDA 4LI5A 4RVKA 5EI8A 4RIWA 3QC9A 1KOBA 2F7ZE 5CEMA 2F7XE 3OCSA 4IVDA 5TKDA 3RALA 5BMSA 5AWMA 3ZXTA 3PPJA 4RFYA 3B8QA 4F6WA 3OP5A 3RNIA 3UOLA 2G01A 5IKWA 4O83A 4IAKA 5D9HA 1CKIA 2IVTA 3QQGA 4O84A 2PMNX 5EOBA 2UW6A 3PPKA 5L6WL 4BRXA 4FV1A 2PZ5A 3LMGA 4NCTC 1R3CA 1ZRZA 4O7TA 4YURA 1OUKA 1WAKA 2VTJA 2VUWA 1QCFA 4LMNA 3EYHA 4CFMA 1YOJA 2B7AA 4W4WA 1YXTA 5ACKA 4I3ZA 2B52A 4MQ1A 2VTHA 3QLGA 2R3QA 4YSMA 4DEAA 1KE5A 5I3OA 2B9HA 5CAPA 3E3BX 1OBDA 2ITQA 5GJFA 2PMIA 4NKAA 2WIHA 2QD9A 5ETFA 4TYJA 5C26A 3AT4A 3QQJA 2OJJA 4FZDB 5FUTA 4A9TA 3PPZA 2R3PA 5DLSA 4ZXTA 4DGOA 2W1HA 4Y73A 4ZTLA 5I9XA 4I4FA 3BELA 2XM9A 4IX4A 4PMTA 5FM2A 1YI4A 2Y4IC 3DAKA 3GQIA 4R77A 3DAEA 3NWWA 4AQCA 2JBOA 2WQBA 3FLWA 3KRXA 4L6QA 1WVXA 3HV4A 3P08A 4U3YA 3UIMA 4U9AA 3VBYA 2JAMA 5DYJA 1WVWA 4FV2A 3SXRA 3UP7A 1URWA 2X2KA 1F3MC 3F88A 5CNNA 2UZOA 1YWRA 3MYGA 1LUFA 2HY0A 2JC6A 4FKTA 1MQ4A 2YISA 3F82A 3RBWA 3PJCA 2JLDA 4ZZOA 4EORA 2W17A 3TV4A 4W9XA 4NM0A 3W2CA 3PIXA 3CP9A 3U4WA 1SYKA 5D7VA 2OJGA 1H1QA 1IA9A 4FT5A 1NW1A 3FI4A 4DBXA 4FZAB 5HIDA 5J1WA 4EOOA 4AZEA 4MF0A 3BLQA 1YOLA 3PSCA 5HESA 5IU2A 2ITOA 3PVUA 1ZOHA 5E91A 4C3RA 1VEBA 1H4LA 5FDPA 2XNGA 4JG8A 3VC4A 4N6YA 2C69A 3FYJX 5DI1A 3ORIA 4IVCA 3VRZA 4R3CA 2VNWA 4QP3A 3BHYA 4S31A 2I0EA 5AEPA 2X6EA 3LJ1A 4IJPA 1R1WA 3MH1A 3ZS5A 4FIFA 4CTCA 3WF6A 3DOGA 3A4OX 2V62A 3NRMA 4R5YA 4RQVA 5AP1A 5KBQA 1GIHA 2KULA 5D10A 3D5VA 5JGDA 4PRJA 1AQ1A 2PY3A 3MJ1A 4ZJJA 3TCPA 3GCUA 4EZ3A 3GC8A 1WBSA 3MPTA 5ANJA 5EW3A 4AOJA 5L2SA 2PULA 2OBJA 2BUJA 4ZTNA 4TWOA 4BDIA 4D1XA 3NMUF 2ITYA 4H36A 4MNFA 4U5JA 4OBQA 4FTRA 1Q24A 3P78A 4O38A 2ZV7A 3OBJA 5D7AA 2YIYA 2NRUA 2CLXA 5EH0A 5ITAA 1M7QA 1V0PA 1J91A 3E93A 5KMIA 2VTTA 3WYXA 3VQUA 3I4BA 2WEIA 3S4QA 4M0ZA 2UW9A 3R2YA 3PVWA 4RPVA 2GNJA 5HCZA 3WE8A 3GB2A 2PVMA 4F1OA 5L4QA 3GU6A 3TV7A 4HVHA 1JPAA 1MRYA 3OXZA 4JJRA 3OG7A 4JQ8A 2RSVA 4L43A 2CGWA 1M2PA 2WQEA 3HDMA 4IFGA 5FG8A 4QOXA 4O7ZA 2QG5A 4EOLA 1OGUA 2OJ9A 4I23A 3AD4A 4PV0A 4XX9A 4EUUA 3BQCA 4OTFA 3TNHA 4NW5A 5HO8A 1WZYA 3NUXA 4TT7A 2QOFA 4CD0A 4ZTQA 3VHKA 3AC3A 1J3HA 5EM8A 2BFXA 3CD3A 3QYZA 2VTQA 3FZRA 4K0YA 4HW7A 4H3PA 4P4CA 3EOCA 2VTOA 3VBVA 1J7LA 2WTJA 4H1JA 3M42A 3NUSA 2XJ0A 3QKLA 4FSZA 1BL7A 3A8XA 5E92A 3R7OA 4FTIA 5KHXA 3SG9A 2F4JA 3KKVA 2QOHA 2QKWB 5HNBA 3LE6A 2WIPA 3WZKA 4ALVA 3RP9A 4GRBA 2PVJA 4RC4A 3ZCLA 1KUTA 5IUHA 3Q2JA 3GCSA 5FDXA 5AV2A 4QTEA 1BL6A 1R0PA 4RX8A 3F3ZA 3IW5A 4G16A 3HMPA 3OEFX 1JQHA 4LV8A 5L2WA 4IBMA 4N70A 2F7EE 4UZHA 3MIAA 1M14A 3CPBA 3I81A 5A4CA 3SV0A 4CGAA 3IKAA 4IC7A 4D9UA 4LGHA 3KC3A 4QQ5A 2V0DA 1OL7A 5AP6A 3UG2A 3EWHA 3MW1A 3O71A 4IC8A 4V0GB 2GQGA 2BPMA 3QTUA 4L46A 4M14A 3II5A 3VUIA 4HCTA 4Y46A 4M8TA 1TQIA 2OICA 3LXNA 2XP2A 4HGLA 3EQBA 5LVLA 1FINA 4RFMA 5JRSA 1YOMA 3S3IA 4AS0A 5A6OA 5IQGA 4EOKA 4U80A 3D14A 3TNQB 2O2UA 1Y6AA 4ZSEA 4YJQA 3IG7A 3ODYX 4GYGA 4YGAA 4FIJA 1WBTA 5FXSA 3C1XA 4E7WA 4BDJA 5IUIA 1R0EA 2W4OA 2XIZA 3D2KA 2NPQA 1A9UA 5F20A 4YTHA 1FOTA 5L8LA 3BE2A 4CKJA 1CM8A 1XHAA 3P7CA 3PA4A 3JR1A 3CPCA 3ZFMA 4LUDA 3TACA 1IAHA 1JLUE 4YHFA 5KO1A 1J7UA 4JS8A 3R9RA 2EXCX 4OTRA 3ZC5A 4ANMA 4DC2A 4WT6A 3WZDA 2CHLA 3GOPA 4F9WA 2O65A 3RPRA 1H24A 2VO7A 3F7WA 3QWKA 4DGLC 2A4LA 3NW5A 3Q5ZA 3FL4A 3MS9A 4EEVA 2YACA 5AJQA 3HLLA 5AP5A 3OOMA 4CSVA 2XZSA 5JFWA 4M66A 3ZOSA 4FKJA 5AFVA 3ALOA 3N4VA 2XBAA 5IDPA 5J9ZA 2WOTA 1L8TA 2GFCA 2XK7A 1Q61A 3C13A 2WTCA 4JIAA 4X21A 5HHWA 5IG1A 2YLFA 3IPHA 2VV9A 3CTJA 1TQMA 5ICPA 1GJOA 2P33A 5HI2A 2YM4A 2BALA 2WQOA 4ACCA 2WEVA 1JNKA 2VTLA 5FEDA 3BV2A 1PF8A 4PTEA 4NKSA 4NIFA 4UXQA 3GCQA 3Q4CA 3A60A 4P5ZA 4CZUA 4EWHA 4KA3A 2RGPA 4JDIA 2IZUA 1CSNA 5A4LA 3CSVA 3UNKA 4IB1A 4ACDA 2YIWA 1H1WA 4PQNA 3BHHA 3QCYA 1UWJA 3MFRA 4GT5A 5A3XA 3C4EA 4AZVA 2C47A 3P5KA 4L42A 5CSWA 3MESA 5DN3A 2OK1A 5EG3A 3EQGA 1S9JA 3PXFA 4UXLA 4QTBA 5CLPA 3TT0A 3MDYA 5BVEA 3U6HA 1I44A 1IEPA 5JQ5A 2ITPA 3HKOA 3RI1A 4BCOA 2X8DA 2OO8X 3QTSA 2R0IA 4ZK5A 2RF9A 4FYNA 3UODA 4Y83A 2XH5A 5TOZA 4WOVA 2YCQA 2BIKB 2XK9A 3JYAA 4J8NA 4U81A 4F0FA 5DMZA 1R78A 4JQEA 4M3QA 1BI7A 1NY3A 4EQCA 3IK3A 4DTAA 2BKZA 3KN6A 3ORLA 4PPBA 4RX7A 3CC6A 4GW8A 5GJGA 1RE8A 3TXOA 3OT3A 3ZH8A 5JMSA 3UOJA 3W2SA 4IM0A 4D28A 4YO4A 4BCHA 4U8ZA 5AV0A 4KABA 3I79A 4F6SA 4WG5A 2FUMA 4TYHA 4V01A 2J2IB 5DH3A 2QOIA 3G0FA 3OVVA 4QMWA 4M13A 4ZLZA 1P5EA 3EFKA 4AWIA 3NIEA 4C38A 2RKUA 3EB0A 2C30A 1PXJA 3AC8A 3DK3A 3EQIA 5DG5A 3OUKA 4BBEA 4YZDA 1G8SA 3BU3A 3DFCB 3FAAA 4AW0A 4FTKA 2R2PA 5HU9A 3JVRA 2NRYA 4UB7A 4IDTA 5GJDA 3QA0A 3R8VA 5C4KA 3JPVA 4QTAA 3GU7A 1T45A 3N51A 1XH7A 3A99A 1FGIA 5AR2A 2QU6A 4AN9A 5IEVA 2ZMCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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