5ITAA

Crystal structure of braf kinase domain bound to az-vem
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
271
structure length
250
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHASETKFEMKKLIDIARQTARGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDNTVKIGDFGLSILWMAPEVIRMNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIEMVGRGSLSPDLSKVRSNCPKRMKRLMAECLKKKRDERPSFPRILAEIEELA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title An integrated model of RAF inhibitor action predicts inhibitor activity against oncogenic BRAF signaling
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 78
structure length 250
sequence length 271
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5itaA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5itaA01
5B2MA 4JOAA 2XIRA 4O91A 3R1QA 4FE2A 1H1RA 4WG5A 1ZARA 3DAKA 5JH6A 4E4MA 4P5QA 3UIUA 5F94A 5JFVA 4R8QA 1ATPE 5HKMA 3FZSA 1BL6A 3COMA 4DBXA 3RBWA 3NWWA 4UWBA 4CYJA 2PPQA 4W9XA 4JS8A 4AX8A 5BNJA 3RK7A 3W32A 3UQFA 3QD3A 2UZNA 4GFGA 1J91A 4JR3A 4EK5A 4AZEA 4F65A 4DH8A 4L68A 2GQGA 2JBPA 2C5OA 4Z7HA 5DEYA 4O27B 2NPQA 4UY9A 4O0YA 4YTIA 5K4IA 3IGGA 2BIYA 4NH1A 3DCVA 5ANKA 4C8BA 4N6ZA 1XKKA 3BLQA 2DS1A 3AC5A 3D4QA 5IQCA 4FTIA 4G6NA 3R30A 4FV7A 4I94A 5LMKC 1PY5A 2WTCA 4IWDA 4BI2A 3MPTA 4IWPA 3PIXA 1U5QA 4I24A 3RINA 4XV2A 5KBRA 3TG1A 5IQDA 1FVRA 3KXMA 3O96A 2WTJA 3E7VA 2OF2A 3P7CA 3ACKA 4OT5A 4AA0A 1M2PA 5M56A 3IDBA 4HVSA 1KSWA 4FVPA 3OEZA 5CNNA 4EH9A 5B0XA 1YXSA 2WOTA 4B4LA 2PZIA 4LQMA 4QPSA 1Z5MA 2GNIA 4FEUA 1CSNA 4JG8A 4BGGA 1XQZA 5KMKA 4FYNA 5HBJA 4GEOA 3AC3A 3R04A 5GINE 4FV0A 3QYZA 4ZJVA 4AU8A 5EI8A 2W4JA 1UV5A 5AR7A 1XH8A 2X0GA 4O7RA 4MYGA 4NKAA 1KV2A 1QPJA 3C0GA 5CVGA 5J95A 4KS8A 5AV1A 3TZ9A 4WSYA 3V5QA 3TNHA 2YLEA 2OZAA 3KKVA 1OIUA 1SYKA 4CSVA 2B9IA 3LCSA 5FQDC 5AV3A 1GOLA 4FBXA 1OL5A 2FSOX 3E8EA 3AT3A 4I6QA 1ZYCA 4AW0A 4BTFA 4UMRA 4F9AA 4NM5A 1Q8WA 3W10A 4C2WA 4MF1A 4EH5A 1B6CB 2PVRA 3ZFMA 4KNBA 4E6CA 3KY2A 5IMXA 1MQ4A 5FTGA 1M2RA 5CSWA 4S30A 3Q4UA 5EYMA 4DFNA 5I9XA 1VJYA 3G9LX 5J9LA 2VO3A 1K3AA 4LRJA 3KULA 4IAAA 3OXZA 4B8LA 4JBVA 3UO5A 3W2PA 2F7XE 1IASA 3BYOA 1JSUA 4GVAA 1FMOE 2GNHA 5EM7A 5JZNA 3W55A 3BWFA 4ENYA 1LEWA 2WMXA 1JLUE 3V51A 3AGMA 1CTPE 5EFQA 3QD4A 5HU9A 3WF5A 2IW9A 1Y6BA 4K11A 3HMPA 3JVRA 3H0YA 3MY1A 5CF8A 3CPBA 3PY0A 2J0KA 4FZ7A 2CLQA 5TE0A 4ALWA 5IQAA 3QD0A 3PIYA 4M13A 3FKNA 4FEWA 3ORPA 4Y8DA 2C1BA 1H01A 3CJGA 3NUXA 2GS2A 4F1TA 3ZRKA 3NX8A 4Q9ZA 5E8TA 5HE0A 2GHGA 5CAPA 3HUCA 2JKMA 1GY3A 3UC4A 3FQSA 3BYMA 1Q97A 5CQWA 4NW5A 3LIJA 4CRLA 2Q0NA 2WU6A 5GJGA 2VX3A 4YZBA 2A4LA 4Q9SA 3WZJA 4K2RA 5FXRA 2PZRA 4OTHA 2XKFA 3LFFA 1NVRA 3FKOA 3L1SA 5FP5A 4HPUE 5HD7A 4BCKA 5C1QB 4R1YA 1R1WA 2O65A 5J7HA 5CAVA 4DBNA 3C4EA 4N70A 1WBSA 4MCVA 4J8NA 3OT3A 4UMPA 1YI3A 4H1JA 3H9OA 5A9UA 4YHFA 5CU3A 5M08A 1ZAOA 2R3KA 3V5LA 3U4UA 4F9WA 5E7RA 4OTGA 5L6WL 4NYEA 5K5XA 4OLIA 4M8TA 5J5TA 5D11A 3RK9A 3OTUA 3PA3A 2B9JA 5AP5A 1PKGA 3NIZA 1P5EA 4WKQA 3RM6A 3TEIA 1NY3A 3IOKA 4X2JA 2UZUE 3E5AA 4F1MA 4TWPA 2UZLA 1UU8A 4YBJA 4UB7A 3CLYA 4MXZA 5LWMA 3UNJA 4IWOA 2J9MA 2HY81 5CENA 4TWNA 4BCNA 3E8CA 4WBOA 3EN6A 1OKZA 4EORA 3K5UA 4ZTHA 3UC3A 3A4OX 3ZZEA 3WZDA 4L3JA 4RWKA 4EOIA 1WZYA 1OBGA 2RL5A 4AOTA 4RJ7A 1QMZA 4KAOA 2JKKA 3E64A 3DKGA 3F3TA 3GU7A 5ANEA 4M0ZA 5KX8A 1IA8A 4EJ7A 4FKVA 3A4PA 2VWVA 3UG1A 3BIZA 3HMNA 2XUUA 4NUSA 3EQGA 3QKKA 4G1WA 4ZMEA 4C4JA 4AE6A 5KMLA 4UBAA 4IQ6A 3HP2A 4W4YA 4RQKA 2CN5A 4XX9A 4Y5HA 5CZIA 4ZLZA 5HLWA 1DAWA 1ZRZA 2EU9A 2PE1A 5EDQA 5CSXA 5AP6A 3FEGA 2E9PA 3F5PA 5KKRB 1OL6A 2QOOA 3FQHA 4W9WA 3DU8A 1G8SA 3PXKA 3DXNA 2CCIA 5AUXA 3VBXA 2JAVA 2ONLA 5LARA 4JL9A 3UG2A 3VS6A 3BHVA 2P4IA 4FKQA 4YNEA 2Y0AA 4YPSA 3VIDA 2IVSA 3CD3A 2C6MA 5BVWA 5HNGA 3DZOA 3BE2A 1KE8A 3V8WA 2Y6OA 2E2BA 3VUDA 5FEQA 3GCSA 2R3PA 4YLLA 2R3MA 5C01A 4GK3A 2PE2A 4IB5A 3CY3A 4LL5A 4RJ3A 3UJGA 2ONLC 1YHVA 3Q53A 4KINA 4OR5A 5ETFA 4I5MA 2C3KA 2ETMA 4IMYA 3BU3A 1KWPA 3PSCA 1W98A 2Y7JA 3P4KA 3ZFXA 3C4FA 2OW3A 2J51A 4TYJA 1REJA 5E92A 3EB0A 4J52A 3ZONA 4BF2A 4H05A 2QR8A 1W8CA 2ZM3A 2YHVA 1XWSA 4JG7A 4DHFA 2GNJA 1H27A 3IG7A 3EN9A 4M15A 4OT6A 2X6DA 4IVCA 3FI2A 2F7EE 2REIA 3OC1A 3F3ZA 2ZDTA 3PWYA 3FZPA 3MY5A 1PF8A 1JKTA 3R1NA 2WHBA 2W9FB 5HE3A 5E8WA 2HWOA 2QD9A 4YHJA 3TKUA 4RIXB 1NVQA 3E8NA 3TNQB 3D7TB 3IOPA 2ACXA 2J0MB 4CGAA 2X8IA 4YLKA 3G0EA 4CZUA 2IZRA 1XBBA 2ZV8A 5FBNC 3QHRA 4F7SA 1RDQE 4JRNA 5JFSA 4ASZA 4IVDA 4JQ8A 4XLVA 3VNTA 3W18A 4DN5A 3KXGA 3FUPA 2JC6A 5AA9A 3TNPC 3AMAA 3O17A 2BRBA 4KRDA 5H8EA 2WIPA 4C35A 5BQ0A 4GCJA 5B2LA 1QL6A 3TUCA 3DFAA 4ZZOA 3RALA 2P33A 4PL3A 1E9HA 1OPJA 4IZAA 4GU6A 1W82A 2OIBA 3OW4A 2LGCA 2I0VA 4TWOA 4AW5A 1DI9A 4BCPA 3OMVA 5JGAA 5AP3A 3R9NA 4D2SA 1ZOHA 3HV7A 4FKSA 3KL8A 1H1QA 2J4ZA 3NNXA 5ANDA 4QNAA 5IUIA 2PUNA 3F6XA 2RFNA 5J5SA 3EYHA 2XNBA 1OZ1A 3LPBA 3HA6A 2BVAA 4GJ2A 4QQCA 3AT2A 4F9YA 1CDKA 5F20A 4QMTA 3HGKA 3TKHA 4AG8A 4QTAA 2IVUA 3OFMA 4U40A 4FV1A 4FSMA 4PMTA 3Q6WA 3NYXA 2ETKA 3HX4A 4GFMA 4LRKA 4M97A 2OU7A 2XIZA 4GT4A 5TO8A 3LFEA 4FKGA 4QOXA 3T8OA 4CMTA 4F7JA 3DJ7A 3Q52A 3QRJA 3L9NA 3P79A 3QGWA 4FTLA 4O0WA 3Q9YA 4ZTNA 2HZNA 3EZRA 4MTAA 4BKZA 2YJRA 1Z57A 2WQMA 1PJKA 2XEYA 5HG7A 3VW8A 5DBXA 4TW9A 3QRTA 4UMTA 2WQOA 4ZIMA 2B9FA 4D4RA 2JDRA 5IUHA 4D4YA 3LQ8A 4UEUA 5E90A 4CV9A 2C69A 3LFSA 3COIA 3BV2A 1NW1A 5F4NA 4YPDA 5GNKA 3DJ5A 3PVWA 3KMMA 5LMBA 3R9DA 1KE9A 2ZDUA 4EH7A 3W1FA 3GI3A 5GZ8A 2ITPA 3BCEA 2X39A 3R9HA 4BCHA 3UOKA 2BR1A 3GQIA 3WF7A 4CG9A 5CAQA 5EH0A 3FPQA 3OY3A 1CKJA 4FZ6A 4JBOA 3RI1A 3V04A 2YIXA 1IR3A 4M14A 4PMPA 4C4FA 3KXXA 4UYAA 5ANIA 3HRCA 3VWAA 4A9TA 3FMKA 1BI8A 3HYHA 4BB4A 2YCFA 4EJNA 4C4IA 2W99B 4U7ZA 1BLXA 1XR1A 2PTKA 4MBIA 2ITXA 4P90A 5G1XA 2OBJA 2R0UA 4DTBA 4ERWA 3F88A 5DR6A 3DB8A 5M4IA 2VWUA 3MH3A 4EK6A 3GC8A 2BPMA 4RJ6A 5H8GA 2PK9A 3MA3A 3QTQA 5AWMA 2YM4A 5D9HA 3FC2A 2WMTA 4QP1A 3MDYA 3BU6A 3Q4CA 1RQQA 2CNUA 1KV1A 4FT7A 5GIOE 2BUJA 3A60A 4BDHA 3QZGA 4HGLA 4R1VA 4CMOA 3DBFA 4HVGA 4C62A 5AUTA 1KE7A 2XK4A 4M3QA 4OBOA 5FBOA 5E4HA 4FGRA 4RT7A 3QQFA 5CZHA 4ZTSA 4D0XA 3RKBA 3SXSA 5KKRC 1OL1A 2JFMA 3QQKA 1Q4LA 3NAXA 2FH9A 2RG6A 4HCVA 5BYZA 3KU2A 3LJ1A 3MWUA 1QPCA 3NUPA 4O2PA 3V8TA 3WF6A 4D2VA 4EOQA 4C36A 3I6UA 3C4XA 4RX5A 5HLNA 3TCPA 3HV3A 1M52A 3R7IA 5ETIA 4FI1A 4KIOA 5CX9A 4OTWA 1NT2A 4LMNA 2ZB1A 3VS2A 5GIPE 2W1FA 4TL0A 3HKOA 1OUYA 5ANGA 1T46A 1FMKA 2FYSA 3NVMB 3VS4A 2YIQA 4USFA 4G9CA 3PFQA 1PXOA 3H30A 4MVFA 4EI4A 1XH4A 2VTJA 5CU0A 1OIQA 2W1HA 3U87A 4O7TA 5DR9A 4BZOA 3DA6A 4RC2A 3MB7A 4ZTQA 2VX0A 4JDKA 3EL7A 4L42A 3D7TA 4F0GA 4G3GA 4GYGA 4JX7A 4BYIA 4D28A 3LFAA 5CSVA 1NVSA 4O7WA 2O64A 4E4XA 2QOKA 4H39A 5IQEA 5I9ZA 4G3DA 4CFVA 2IZTA 3MV5A 1G3NA 1YWNA 4NSTA 5HG5A 3QALE 1TQMA 2XM8A 4OBQA 5HIEA 3PPJA 2BDFA 4FC0A 3II5A 3QCYA 4X3JA 4EZ5A 4EH4A 1SMHA 4JI9A 3F66A 3F7ZA 1S9IA 3PJ8A 3FY0A 1FINA 4BCIA 1UU9A 3BHHA 1M14A 4BR3A 2UV2A 2CGWA 2B9HA 4FSQA 4WNOA 1W83A 2XNOA 4BTKA 2I0YA 2YAKA 2R3JA 3VBVA 3Q5ZA 5DMZA 5F9EA 4U81A 2QURA 3UZTA 4MKCA 3RAKA 4O38A 5JMSA 3QUDA 3KF4A 4ASDA 4C02A 4IDVA 4YR8A 2VTIA 4XNEA 1U5RA 4RA4A 2P2HA 4W4VA 4FKOA 4F6WA 5I9VA 5M44A 4EOPA 1WBOA 3NUSA 2O63A 2R3LA 3EQIA 4UV0A 2F49A 4AT3A 3A8XA 5EOLA 3FXWA 2B4SB 4GK2A 5CEIA 3O7LD 4FKJA 3QWJA 1UWJA 5EQYA 2PVKA 3PXYA 3D5WA 3AC2A 4RX8A 4M69A 4GS6A 3UP2A 3DKOA 4OTPA 4BDKA 2VGOA 1OI9A 3I4BA 3ZM9A 3G6HA 3I7CA 4IX5A 2VTMA 3P7BA 3TTIA 4X21A 4CYIA 4B7TA 4D55A 3C5IA 3MESA 5CU2A 3CJFA 4MXYA 4KKHA 4PMSA 2CKEA 2A27A 1YW2A 3QRUA 3F61A 5IQBA 2ITYA 1FVTA 2W1ZA 4J99A 5D10A 4KSQA 1UKIA 2VTLA 4FV9A 3QA8A 2O0UA 1VYZA 3ELJA 3REPA 3ZYAA 4I41A 3MFTA 1MRYA 3UPXA 2JAMA 3EFJA 3BKBA 3H0ZA 5EOBA 5LOHA 2OK1A 3C4ZA 2UUEA 3LFDA 2GHLA 3R2BA 5HG9A 5HTCA 4QMPA 3BHUA 3KXHA 5J1VA 4XHKB 4M84A 4Y95A 3K2LA 3NUNA 5HVKA 4QD6A 5HNBA 3L9PA 4IB0A 1J7UA 3OHTA 4GV1A 4ZZMA 4JXFA 5CEQA 2BTRA 4A9RA 1WBNA 1P4FA 3JXWA 3PYYA 3DNDA 5IQHA 5DPVA 2WNTA 3CCNA 3ORIA 2V62A 3CE3A 3ERKA 3QKLA 4XV1A 5IA3A 2I7QA 3NNVA 2BZKB 4K6ZA 4ZS0A 4D1XA 3LXPA 2XJ2A 3U6HA 3JR1A 1H00A 3DV3A 4ITIA 5CEPA 4O0SA 5IPJA 5EW8A 3ZDIA 4DFLA 1GIJA 4CZTA 3FL5A 2VX1A 2XK8A 3BQRA 4DCAA 3FAAA 4G6OA 1PXMA 4ANLA 3E88A 3KVXA 4K1BA 3IPHA 3R8VA 3H10A 4ONAA 3DQXA 5I0BA 3TDWA 3BELA 1SNXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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