5FWKK

Atomic cryoem structure of hsp90-cdc37-cdk4 complex
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
IKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALTPVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDWPRDVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Atomic Structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 Reveals that Hsp90 Traps and Stabilizes an Unfolded Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK PROTEIN HSP 90 BETA
total genus 52
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2016-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
K PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5fwkK00
4YUQA 3VJNA 3UGCA 3ZLWA 1YVJA 4IE9A 1GJOA 2W0JA 5HLPA 4AZEA 1YQJA 4BWPA 3GU8A 1F3MC 2PL0A 3QD2B 3H4JA 4YNOA 2WMWA 2YZAA 4AZSA 3NPCA 3JS2A 4FSRA 3QALE 2E9OA 3VW6A 4FBXA 3VS3A 4BCFA 2BFYA 3HRFA 4II5A 5BPYA 4LRKA 2QO7A 5CEOA 3THBA 3O7LD 4Q5HA 5DI1A 4ZTSA 4XG7A 2X2MA 5GNKA 3O71A 4TWOA 2REIA 3BHVA 3SD0A 3D0EA 4RWLA 4F9AA 4NIFB 1O6YA 3RP9A 4IX3A 4KKGA 1H25A 2W4KA 3QUDA 4UMRA 3NYNA 5BMSA 5CYIA 3WARA 3IQ7A 3FQHA 3PA4A 2OW3A 2VGOA 3EMGA 4ALUA 4HNFA 5DT0A 4U3YA 2YWPA 4F9CA 3LCKA 4RIOA 4MXAA 3NUNA 1M7QA 4MNEB 3NIEA 2UW7A 4FTLA 1P4FA 1Y8GA 3TKUA 4DH5A 2RG5A 3CE3A 4JNWA 5CNNA 4LRMA 3QLGA 2W99B 4DFYA 2IZTA 4DLJA 5I5ZA 4C2VA 4NFNA 4RC3A 3ZUTA 3PYYA 2PMIA 3VIDA 2WPAA 2YM8A 5K3YA 3PP0A 5FBOA 4AF3A 4MKCA 3ELJA 4QP9A 3NNVA 4FX3A 1OZ1A 3FZPA 3KRRA 2XKEA 3BWFA 3H3CA 1PY5A 2C6KA 4OTHA 3B2WA 4TYHA 5E90A 3BYVA 4YP8A 2QONA 3AXWA 2QI8A 2OIBA 3F6XA 4EHZA 3VS5A 2IO6A 2CPKE 4C4HA 5FDXA 4ANQA 4X3FB 3RZBA 1ZYLA 1SVEA 3TV4A 1YI6A 4F64A 1W0XC 1W8CA 3MFRA 2BZHB 5DT4A 2IZUA 3CP9A 3EQDA 4XS2A 4U45A 2VO7A 1ZARA 4MX9A 4P90A 4QYGA 3NNUA 2XS0A 3ZTXA 5KKRB 2IZSA 4AFJA 3JVRA 1WBVA 5JGBA 4I6BA 2X2KA 4E20A 4XV2A 3ZUVA 4TL0A 1V0BA 2ITOA 2QVSE 4W4WA 3D7TA 4QPAA 2Z8CA 3MJ1A 3UVQA 3QTSA 3UIXA 3E87A 3HV4A 4HJOA 4FKIA 4C57A 4WA9A 2YM6A 3QX4A 1JSVA 5JMSA 4DN5A 4EH9A 3PIXA 3HNGA 4FV7A 4JRNA 4BYIA 5M51A 2V7OA 2Y9QA 4FTIA 2QODA 5EYMA 3R8VA 2FUMA 3UOKA 4YZNA 5JRSA 4DCEA 3IW4A 2J7TA 4V01A 5ETIA 1H01A 4FYOA 5A4QA 2E2BA 2AUHA 4QMUA 2SRCA 4A07A 2BZJA 3DGKA 4A4LA 3U9NA 1MQ4A 3HV5A 5BUEA 3ANQA 4U0IA 3F69A 1H07A 3LFNA 5CF8A 1H26A 3D2IA 4QTAA 2VO6A 3A7IA 5EI8A 4YJTA 3P5KA 3P23A 2HELA 2YERA 3VF8A 3UC3A 4C61A 3OW4A 2OG8A 1FQ1B 4FVQA 1OPLA 3E8CA 3D14A 4YZCA 4MXZA 1WVYA 3DV3A 3OTUA 4ZY4A 3NGAA 4D2RA 5L3AA 3NUPA 4E5AX 5LCJA 1NXKA 5LWMA 4FTKA 4UMUA 3TZ7A 4QP1A 3C13A 4FTCA 3E88A 2QKWB 3B8RA 5DR6A 3D83A 5JSMA 1CM8A 2BIKB 3EN5A 2QURA 2HYYA 1OPKA 4FZDB 5HIEA 4UYAA 1GIJA 5L8KA 2B9HA 3MIYA 3LPBA 2R3PA 3TZ9A 3NYOA 1STCE 4AA4A 2I0VA 4B7TA 1IR3A 4JXFA 1M2RA 1QPJA 3PE1A 2BHHA 3GNIB 4KD1A 4LRJA 2JDVA 2F4JA 3ZC5A 3HYHA 3LW0A 4CMUA 2UVZA 2WNTA 4Q9ZA 5CX9A 3Q4ZA 5H8EA 2R0IA 4D1XA 4GYIA 5IUGA 2WKMA 4DITA 3W2RA 1UU7A 4ZTRA 4KNBA 3WZEA 2VTNA 2WTJA 4NCTC 4DEEA 3ZM4A 4QNAA 3E93A 3G6GA 3KL8A 4U44A 2P2HA 4NK9A 4FK6A 3FI4A 4IDVA 3QQJA 3BKBA 1DAYA 5HNGA 3FI3A 4G34A 4CRLA 2UZVA 4EHGA 3IK3A 3Q60A 2WTKB 4BIBA 5F4NA 3GU7A 2OZAA 4X7QA 3VUTA 4W8DA 3IO7A 3WZJA 4EI4A 2ITZA 3EN7A 3QUPA 4PNKA 5L2SA 3AOXA 4PMTA 4JS8A 3CPCA 4E1ZA 3NZ0A 1GY3A 1OM1A 1SVGA 3MTLA 4QTBA 3LXNA 2F7XE 5AUYA 1P14A 5HTCA 5LMBA 3KCFA 3LQ8A 3R01A 4O0TA 3FBVA 2C4GA 3L8XA 3NCGA 1LEZA 4WKQA 3R8LA 5CASA 4RIXB 4P5QA 4S34A 4RX7A 2UW0A 1KSWA 2E9PA 2XNBA 2C6OA 2J4ZA 2C1BA 4EOSA 2W7XA 1GAGA 3BHHA 4WRSA 3MW1A 5EYKA 5ANDA 3MJ2A 3AT2A 3NW5A 3DU8A 4YTIA 3QGYA 5AUVA 4AE9A 3ORKA 5J87A 4FKPA 3E8EA 3KCKA 3QRUA 3OUNB 3HX4A 3QZFA 1XH8A 1HCKA 3HMPA 4PMMA 5DMZA 1IRKA 2PVHA 4D1ZA 3SW7A 3ZLYA 2J0IA 4I1ZA 3GT8A 4JVGA 3FKNA 2X4FA 5C8MA 4RJ5A 1APME 2PUUA 3AMAA 3QD3A 2YIXA 3BE9A 3Q9WA 3GQIA 4FKLA 4PPCA 4F65A 4GT4A 4D4VA 3BIZA 4BBEA 1JKSA 4PTGA 4DGOA 3PXYA 3R7EA 5EDPA 4C4FA 2YM7A 4QMTA 3F2AA 3F5PA 3IONA 1RE8A 5E8VA 2JBOA 3JPVA 3EL7A 4HVSA 1VJYA 3CJGA 3O8TA 3DAKA 2YM5A 1H00A 5AV1A 5M4FA 4X2NA 2BTRA 3OY3A 3TKIA 4AW0A 2OF2A 4O22A 4CMOA 2XZSA 3JUHA 5IH6A 2QR7A 2IVVA 3PVGA 3L9PA 3T9IA 4TRLA 4LOOA 4JRVA 3R7UA 3PXKA 1S9JA 3UP2A 4OTRA 4CFNA 2Z7QA 2YABA 2BIYA 3NX8A 4FV1A 4D9TA 5CAUA 4RIYB 4LG4A 3RK9A 4E5BA 2XK6A 1FGKA 1LEWA 4XMOA 3VW8A 4YBKA 4C3RA 3AC8A 5FEDA 1PXJA 4HOKA 2W96B 4E4MA 1H8FA 3PA3A 4L8MA 3MI9A 5C9CA 4F99A 3TUCA 1XH7A 3HMNA 5KMMA 5M4IA 3IDCA 3OW3A 4ZZMA 4E6DA 4I5HA 3RWPA 3G0EA 1KWPA 2YCRA 2YJRA 1OI9A 3SAYA 2QCSA 2OKRA 2XNGA 2GMXA 4WUAA 4YZDA 3R00A 4TWNA 3UYSA 4DFNA 4L7SA 3GP0A 3QTIA 4NTTA 4WT6A 4YTHA 4AACA 1PJKA 2J6MA 4NU1A 4DEHA 4KBCA 4ZSLA 4YTCA 1Q41A 3SXRA 1U5RA 5IDNA 4YZ9A 3BI6A 4AT4A 2VTIA 4FI1A 2J0JA 3DTCA 4IW0A 3UNKA 4ANOA 2XCHA 5BUJA 3BRBA 4KWPA 1BUHA 4H1JA 1FINA 4I3ZA 4J52A 1MQBA 3RZFA 3EQPA 3KULB 4D4SA 5TF9A 2VTSA 3GC9A 4TZRA 4YJNA 3RPRA 2QNJA 5HE0A 3U9CA 4DH7A 4APCA 2ETMA 5KZIA 2P3GX 4ENXA 4N4SA 4FT7A 4QMMA 1XR1A 2JDOA 2KTYA 1OL2A 3BGZA 4FICA 4QD6A 4BRXA 3QUEA 3COKA 3OC1A 5DEWA 3GOPA 2WQBA 2OXYA 2JKKA 3T9TA 1DAWA 4G3DA 2XEYA 3ZRKA 2HZ4A 2VX3A 3W8QA 4QMNA 2G1TA 4E7WA 1WMKA 2PZ5A 3POOA 4C4JA 4GH2A 2GNFA 2E9VA 2QKRA 1O6KA 5A54A 1UVRA 3PTGA 5CALA 4B8LA 4FVPA 3EFWA 3HMOA 3BHTA 3VS4A 3KEXA 1OB3A 5JKGA 3V5WA 5EM8A 1XHAA 5LCKA 3KF4A 3CJFA 4QRCA 3BHYA 4GMYA 3PY3A 3FMMA 4H3PA 2BILB 3U8WA 3ORIA 3BEAA 4X3FC 2R64A 2BALA 3NLBA 3F82A 5AJQA 4G1WA 1BYGA 3FV8A 2J0LA 3FY0A 4PV0A 2GFCA 2JBPA 4BTFA 3OEFX 3P7CA 4TYEA 3C4FA 2XIZA 4OBQA 2VWYA 5J9YA 4I4FA 3P86A 4JG8A 4D1SA 3NNXA 4AU8A 3VBXA 4F9YA 3PJCA 4GK4A 5FG8A 5AR4A 3QZHA 4NT4A 2F9GA 3TG1A 5KKRC 3G5DA 2CMWA 4TW9A 4FKGA 3FMLA 2WU7A 5EK7A 1DI9A 1PF8A 2J90A 1KV2A 4PL4A 5KHXA 3E7VA 5LVMA 3SLSA 4ZJIA 5A4EA 4W9WA 2R0UA 4K0YA 3DCVA 2GS6A 3DLZA 1UU8A 4OUCA 4I6QA 3D5WA 4AA5A 5IH4A 3QAME 2VWUA 2XBJA 4AOJA 1T46A 3R7YA 5GZAA 4ZTHA 4YJVA 4UX9A 2UZNA 5BVWA 3VS7A 1BKXA 3FYKX 5DIAA 3TCPA 2OH0E 3ET7A 3NDMA 4S33A 3AMYA 5CVFA 3KMWA 5TT7A 5I3RA 1R0PA 4ZP5A 3UIBA 3OFMA 4U6RA 2J2IB 5IMEA 5JFVA 4QYEA 4XX9A 4FUXA 1F5QA 4XP2A 4YR8A 3P4KA 3W16A 3MY5A 1NVQA 2PZRA 3Q52A 4YJPA 5CS6A 3ROCA 3ZLSA 4KS8A 1OKYA 1TVOA 4IMYA 3DT1A 3GC8A 4I94A 1SYKA 3PZHA 1NA7A 1W83A 4ASEA 2BFXA 2BKZA 2ONLC 3CS9A 4CFFA 3EN4A 4V04A 3QZGA 4W4XA 1H08A 4QMXA 4GCJA 1UNLA 4FV6A 4IAZA 5IH5A 1FVVA 2HAKA 1P2AA 2C6LA 4C59A 5LVNA 3VS2A 5CQUA 4V05A 3I6WA 3AD6A 2B9JA 3KRLA 4BHNA 3TV6A 3NAXA 4CKJA 5KNJA 4LOPA 3OEZA 5J9LA 5EW8A 3F3UA 4HPTE 2HWOA 1W82A 1ZMWA 2ZDUA 4YTFA 5HQ0A 5KO1A 4IVAA 4PDSA 4UMTA 2BUJA 5CAQA 3UQCA 1WCCA 2HZNA 1QPEA 3LZBA 5AWMA 5AUTA 5CI6A 4EHEA 4YJRA 4KABA 1KE5A 2PMOX 4QYYA 4NW6A 5IUIA 3V3VA 3VNTA 3WE4A 4W8EA 3OTVA 3QRTA 3FQSA 3QTUA 4FKWA 1PW2A 4JJRA 2BPMA 1MRUA 3ORNA 3VF9A 3ZFXA 4QOXA 4I93A 2RG6A 4ZOGA 2C69A 4BICA 4EYMA 4Y83A 3FMJA 5AEPA 3U6JA 4RJ4A 1YI3A 3QZIA 3Q5IA 2XK8A 3OOMA 3TNQB 4YLKA 2E9NA 4EEVA 2VTPA 5KHWA 5D12A 5BX0A 5B2LA 3QRIA 3UG1A 4CMTA 5CEPA 2ITXA 5EOLA 2HW7A 3DY7A 5HBEA 4M68A 2WTKC 4EBWA 4MBIA 3ROYA 3W1FA 2UW9A 3E64A 3I6UA 3D94A 4PP9A 5AA9A 1Q8ZA 5M4CA 2X0GA 4UYNA 3KMMA 4IM3A 4M15A 2EU9A 2ETKA 3FZ1A 2DYLA 4QTEA 4ASZA 5JEBA 1T45A 4R3PA 5ETAA 5GJDA 4PWNA 5HVYA 3NSZA 4BCJA 5KX8A 3PVUA 3W2PA 4ZSJA 4BGGA 5HTIA 3DBCA 2BCJA 1JVPP 3CKWA 5E8ZA 3VBTA 4JDKA 4ALVA 4LOQA 1W7HA 3V8SA 4FV0A 3KXXA 2Q0NA 2XYUA 3DJ7A 4A4OA 2O3PA 2ZV8A 4R8QA 4JI9A 4C33A 4FKRA 1Q8UA 4E4XA 5LVPA 4TWPA 5HI2A 3U6HA 2R3KA 3RPYA 3NCZA 2VNYA 4GFOA 4KBKA 3QYZA 4LFIA 4MD7E 3ZZWA 4EJNA 1J1CA 4FV8A 3FPQA 4YURA 1H0WA 3KK9A 4WNOA 3DA6A 3EOCA 4CQGA 1OL7A 4JX3A 4FSYA 4CEGA 4U42A 1BI7A 3S3IA 1O9UA 1YHVA 4OBOA 3TKHA 3EHAA 3R6XA 4TYIA 3LE6A 2XM8A 2CCIA 4M12A 2HIWA 4FIEA 5EW9A 4FTOA 3MVHA 3QQUA 4DFZE 4B99A 4E73A 3QHRA 4EK4A 5DOSA 3QQFA 4X0MA 1E9HA 2W1CA 2GHMA 2VAGA 3COIA 4GU9A 2RFSA 2F49A 4EH6A 2C3KA 4G16A 3DZQA 5JGAA 3RCDA 3OP5A 5ANGA 3BLRA 2X7GA 5AV3A 1SVHA 4FIFA 5HICA 3RAWA 3EL8A 3RPVA 4BIEA 3MWUA 3QFVA 5ETCA 3DQXA 4D9UA 3DB6A 5HGIA 1V0PA 3FHRA 4DH8A 4RZWA 3PP1A 3OCGA 4UN0C 3FHIA 3RAIA 3GCQA 4QMPA 4EKKA 4CT2A 3D5VA 1DM2A 3A62A 3QKLA 3TV7A 2QOKA 5FXSA 2H96A 3BQRA 3UQGA 1GIIA 2VU3A 2R3LA 4ZIMA 5M55A 1REKA 4IAKA 3ZSGA 3FAAA 4EOLA 3OWKA 2Z60A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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