4IANA

Crystal structure of apo human prpf4b kinase domain
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
330
structure length
321
Chain Sequence
RVNIGEVLDKRYNVYGYTGQGVFSNVVRARDNARANQEVAVKIIRNNELMQKTGLKELEFLKKLNDADPDDKFHCLRLFRHFYHKQHLCLVFEPLSMNLREVLKKYGKDVGLHIKAVRSYSQQLFLALKLLKRCNILHADIKPDNILVNESKTILKLCDFGSASHVADNDITPLVSRFYRAPEIIIGKSYDYGIDMWSVGCTLYELYTGKILFPGKTNNHMLKLAMDLKGKMPNKMIRKGVFKDQHFDQNLNFMYIEVDREKVTVMSTINPTKDLLADLILPEDQRKKVHQLKDLLDQILMLDPAKRISINQALQHAFIQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Evaluation of Cancer Dependence and Druggability of PRP4 Kinase Using Cellular, Biochemical, and Structural Approaches.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog
total genus 100
structure length 321
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ianA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ianA01
2J2IB 3IECA 2OF4A 4BKZA 1ZLTA 4EQCA 4RX5A 3SG8A 4RGJA 4Y72A 4FKWA 5KBRA 4X2NA 4HNFA 5T68A 2P33A 3RZBA 3ETAA 3PJ1A 2F4JA 3A7HA 4WRGA 4RZWA 5GZ9A 4R78A 3GCQA 1Y6AA 3FMMA 5J9YA 1FGIA 1OIRA 2YACA 3Q5IA 5HVJA 2B9FA 4H36A 3UNJA 1K3AA 4U45A 1H25A 3BE9A 4UV0A 3VBVA 2E9VA 2VGPA 4PPAA 4QYYA 5EYMA 3RCDA 3VQUA 2J0JA 3OTVA 4D2PA 2JIIA 3PTGA 5IF1A 1QL6A 3E64A 1XR1A 2OU7A 5K4IA 1YXTA 2ETMA 3P79A 3MN3A 5BUJA 5M4CA 3U6JA 4I6HA 4PDYA 3M2WA 3DPKA 3EN5A 3MESA 3ZSGA 2X7GA 4KIKA 3UBDA 1DM2A 4GK4A 4E73A 1TQPA 2YIYA 3OC1A 2CLQA 2VUWA 3BGQA 2P2IA 3N51A 5BVFA 4BWKA 3PLSA 4KKEA 3EB0A 4FT7A 4JIAA 3U87A 3S1HA 1YHVA 2O64A 5AR2A 3VIDA 4YUQA 2R3FA 3AD6A 4ZJJA 1XBBA 4BI2A 4DAWA 5J79A 4AW5A 4JJRA 4O0RA 3TKHA 5I9ZA 1ZWSA 5I4NA 2E9OA 4HW7A 5IA4A 2Z7QA 4WIHA 4D9TA 4X2FA 3CTQA 4A7CA 1VR2A 5LVMA 3QWKA 5E9EA 5HTBA 1OBGA 2QOLA 3PLAE 1Y57A 3BHTA 3Q53A 5KHWA 2ITYA 3GU6A 4RMZA 2X4ZA 2E2BA 2J51A 4ACCA 4N4SA 3VBTA 3I7CA 2OJ9A 4O7TA 3UOJA 3R1QA 3MA3A 3SRVB 3F7WA 3RAWA 1WBPA 3FEGA 4JX7A 2C0TA 2Z7RA 3A2CA 4K1BA 2W1CA 2C5YA 4CQGA 2XNGA 3JUHA 4WNPA 4YHTA 4WOVA 3OCGA 4MKCA 4QMXA 3ZDIA 2WEIA 3BELA 4FSWA 4KBCA 1IA9A 5J5TA 2XNNA 3I0OA 5A4QA 5BPYA 4FKVA 4AT4A 5L6PA 4V0GB 5FBOA 4N6YA 5HIBA 3TN8A 4RIYA 4ANQA 4FE2A 3ZRLA 4R3PA 4GKIA 2WMWA 3GC9A 3EN4A 4JDKA 4XG6A 5E8TA 4QP4A 5GZAA 4I6BA 3R7UA 4WBBB 3UDBA 1Q99A 3WIKA 3P1AA 4NEUA 5IQGA 1XJDA 5ANOA 2PVFA 5JQ5A 2OICA 5HVYA 2XRWA 4GS6A 3GU5A 4OTHA 3HL7A 3HYHA 4FBXA 4GH2A 4EK5A 1CKPA 4HCUA 2A2AA 3V5JA 3UE4A 5C9CA 2VO6A 3EIDA 4EK4A 4ZSGA 2BKZA 2ERKA 1LPUA 3UODA 4MVFA 4IIRA 4LUEA 4NIFB 3CPCA 3COMA 2FSOX 3QRUA 4HJOA 2Y9QA 3L9NA 4J52A 4DGGA 2XKFA 4FEVA 2I0VA 3L8SA 4BBFA 5M07A 5EDQA 4L3JA 5J9ZA 3GT8A 2IZRA 4I24A 4KIOA 3GOPA 3EMGA 3UZPA 4BDEA 1YOJA 1OPLA 3WYYA 4DH8A 3PWDA 3R73A 4DG3E 2PSQA 4QRCA 3VUHA 4IFGA 3O17A 3GGFA 3QTZA 2F7XE 3CGOA 1CDKA 1ZYLA 4G3FA 4RSSA 4Y73A 3FXZA 3ZSHA 4R77A 3MI9A 4C4IA 4JAIA 4RJ6A 4E6CA 4GL9A 2EVAA 3R1YA 5FGKA 5A6OA 2CN5A 3RHKA 3R7VA 4F7LA 4LRMA 4Z9LA 5FP5A 2UZOA 3BI6A 4D5KA 1SNXA 1MQBA 3KXGA 5EQPA 1GZOA 3R02A 1PYEA 1YI4A 2BAJA 4EOIA 3FKNA 2Z7LA 3R8VA 2QURA 2FVDA 1PY5A 4I21A 1QPDA 3ZC5A 4QQTA 4YJNA 4DEBA 3QQUA 1IEPA 3QCYA 2XIZA 3F5PA 2HOGA 2GNLA 1LP4A 2C5XA 4HVSA 4UYNA 4RFMA 3PE1A 5HU3A 4JAJA 1YDRE 2QODA 2XNBA 2UVYA 2YISA 4P2KA 4HPTE 4DGNA 5M51A 2B0QA 3PXRA 1UV5A 3QUPA 4E7WA 2DS1A 3NCZA 2R0UA 4NJ3A 1BI8A 4C4JA 4J96A 4QPMA 1OKWA 4ZTNA 5EI6A 5F1ZA 1AQ1A 4EH8A 2PMIA 3PJ2A 2XKDA 3FDNA 4FT0A 1MUOA 3PSBA 4PV0A 5DG5A 5AAFA 4O0YA 3TG1A 5BUEA 4S30A 3W10A 3M42A 3EHAA 4CKIA 4Z16A 4WHZA 5LVLA 4DEIA 2QOCA 4F6WA 1L3RE 3PA5A 1PXIA 1UNHA 2ITWA 2WMAA 4CTCA 3ZO4A 3QQFA 4NTSA 3PJCA 3QTWA 4U81A 3R71A 3RPVA 5IQCA 5HIEA 2XF0A 5T3QA 3DGKA 3UQFA 4FSZA 3PIXA 3AMBA 4C58A 3FWQA 2KTYA 2YA9A 2WIPA 3EN9A 4BCIA 4B7TA 2W9FB 2G01A 5HI2A 3MSSA 2X1NA 3OBJA 3UIXA 2Y7JA 5L8JA 3GCUA 4LOOA 4BKYA 3ORPA 4V04A 4KS8A 5EDRA 1UWJA 3ORTA 1H24A 5EG3A 3OCTA 2YM6A 2VAGA 3VUTA 4IAYA 4C2WA 5BMSA 2FUMA 3MPTA 4QMOA 2XNMA 3O8TA 4XLIA 3QD4A 1UKHA 4QMSA 3O2MA 3DB8A 4JLCA 5H8GA 3W2PA 4QNYA 1ZAOA 4GIHA 3WBLA 2CGUA 4L67A 3ORNA 4F08A 1IASA 4IZ5A 5CU4A 2Y4IB 3GNIB 4GIIA 4EYMA 3F5XA 1IAJA 4EH3A 3CY3A 3FSFA 4AGUA 5DT4A 3C4WA 3OOGA 3W16A 3C4ZA 4G3DA 4D2SA 4WG3A 3SXRA 2BVAA 3D5UA 2X39A 3HGKA 4NWMA 4FODA 3QGYA 5DFPA 4F6SA 3KC3A 1ZMWA 5IQEA 2OKRA 3K3JA 3IQ7A 5HU9A 5CX9A 3VUMA 2XP2A 2VWUA 2YIQA 3MYGA 4QMUA 3W33A 3V5QA 3DNDA 3JYAA 4BCGA 3AC8A 4QMNA 3A8WA 3RMFA 4O86A 4F09A 3QA0A 5EQYA 4GU6A 4ZIMA 3L9LA 4BDBA 3AXWA 2G2FA 2J0KA 4F4PA 2PUPA 4FIGA 4FKJA 3C4CA 5C8MA 3KXHA 5GIOE 3W2OA 4JR7A 3HUCA 3C5IA 3U6HA 2HY81 4IWDA 4NW5A 4O91A 4W4XA 4C02A 2X9EA 3QC4A 5KUPA 3TJCA 4TWCA 3ZSIA 4ZY5A 5CAVA 5E1SA 1NVRA 2P3GX 3V8WA 4M14A 3RCJA 3IG7A 3CTJA 4KIQA 4M97A 2PK9A 5F95A 2C4GA 3PWYA 3TKUA 2VTSA 4BF2A 4FNWA 3RINA 5IEXA 3TTIA 4DFYA 4NK9A 4YTCA 1M7NA 3P7BA 1XWSA 4FOCA 4PMPA 3EQBA 2VN9A 5LWMA 5E8VA 3RK5A 4EBVA 2BMCA 5JT2A 5A14A 5A4TA 2WAJA 2J5FA 3LFDA 3QX2A 3F3UA 4I5PA 3U8WA 4FTKA 4FF8A 4CFXA 3UG1A 2PL0A 3RK7A 3P23A 4O0SA 3AGLA 4EC8A 3OY3A 2CKEA 3DDQA 2GNJA 3HP2A 3PRIA 4C8BA 4CFMA 4FOBA 4ASDA 3R0TA 2PULA 3ORMA 4M8TA 5HESA 4F9CA 4XP2A 2JAMA 1JWHA 4XOYA 2WTWA 4APPA 4W4VA 5CQUA 4EH5A 4RQKA 2G9XA 4GEOA 4BRXA 4U40A 4BTKA 4JDJA 3R1NA 4FTOA 1T46A 2F49A 5HO6A 3F66A 4EK6A 2IZTA 4RX8A 3QTSA 3T3UA 2PZIA 4GSBA 4L3LA 4ZLOA 1FVRA 2ZM1A 1URCA 4MXOA 5CZHA 1HCLA 3GUBA 4U79A 5G6VA 4BCKA 3F2RA 4M12A 5HD7A 2XNOA 3CTHA 5CVHA 1P2AA 5C01A 5CANA 5IUIA 3NEWA 5AADA 1F0QA 3EN6A 4AOJA 2B7AA 3QRIA 5FDPA 3DBQA 1FMOE 3OUKA 3MPAA 4JDHA 5JH6A 4D0XA 4BICA 1ZY4A 2X2KA 3K54A 1H1QA 3CSVA 4U3ZA 4FKUA 2JIVA 2FGIA 2YCRA 2DQ7X 2GNHA 4FTLA 3DFCB 4OTGA 1BUHA 5A6NA 2EXMA 3II5A 4QYHA 5FQDC 3F2AA 3PUPA 2WKMA 5BUIA 1OB3A 3DLSA 3UO4A 3GBZA 4J71A 5EK7A 4IADA 2X7FA 5CI6A 2JDRA 3GB2A 2V5QA 3A99A 4IB3A 3Q9ZA 5IZFA 3UPZA 2XBAA 2PU8A 1FQ1B 3EQRA 4FKOA 2WOUA 5EKNA 3ZHPC 4L42A 3U9CA 1JKLA 4FKLA 2UV2A 4GFGA 3AMAA 4LUDA 2BHHA 2WMTA 4AW2A 2RGPA 5JK3A 2XZSA 4X0MA 4UBAA 5GINE 4ZAUA 4DH3A 4F99A 5AUYA 2QI8A 4FKTA 3P78A 4LGDA 4YJVA 4P7EA 3N4TA 3R00A 4IB1A 1B39A 1WBWA 3DAKA 4WSQA 4ZSAA 2VWBA 4FVPA 4GFMA 3DZOA 1XH9A 2F2UA 3ZUUA 2F9GA 3V8SA 3UO5A 2IPXA 2R64A 1CTPE 3SV0A 2PVMA 5L2SA 3BV2A 1Q41A 3V5LA 5DH3A 3Q9YA 4AA5A 4DG2E 2H34A 3D0EA 4IB0A 4YC3A 5BYZA 5HNBA 2W1FA 4HVHA 3OCBA 4MQ2A 2GMXA 2YIRA 1UU3A 3WF6A 3MY0A 4M69A 1W98A 1OI9A 3IO7A 2OI4X 4L00A 3ZRKA 2UW9A 5KKRB 4OTPA 5AP5A 4QPSA 4BCNA 4UYAA 5IQDA 4RC3A 4X21A 3GCSA 5LQFA 3W32A 3F5UA 3HNGA 4H1JA 2I0YA 2J0LA 2ZAZA 3UOKA 4E3CA 2R3QA 3O50A 1SYKA 5JFVA 2W4JA 3HV6A 3C7QA 1SM2A 4DCEA 2JIUA 2ITTA 2QO2A 1KE8A 3ORZA 4QTCA 3MY1A 3ZMMA 4EOKA 1H27A 2OXYA 4YTFA 3KXNA 3IPHA 4K8AA 2ZB1A 5C8NA 4F0GA 3VWAA 4N0SA 2BAQA 2ETRA 2VWWA 2YM7A 5AFVA 3IW7A 2JDVA 3JR1A 1GZKA 3KMWA 4FL3A 1ZZLA 4PL5A 4WBOA 1H0VA 3KN5A 3ZZEA 4YLKA 4ERWA 2BRGA 4RX9A 4I23A 4CLIA 4J1RA 3TZ7A 4A9TA 3L8PA 5EM5A 1RW8A 2B9IA 1SMHA 1YHSA 4GVAA 1WVXA 5EW9A 5HBHA 3SOAA 5CF4A 3KCKA 2JD5A 3G51A 4BDCA 2WTKC 4IVCA 5HEZA 2RIOA 2W99B 5B2LA 2XNEA 3E8NA 2FYSA 2W96B 4ZZMA 5KE0A 3RALA 3TUDA 3KVXA 3WZKA 3WI6A 1J7IA 3DFAA 3FXWA 4DFNA 4HVGA 5HLWA 4WG5A 2YLEA 5T6KA 2ITPA 3OS3A 4S33A 2YM3A 4BHNA 4F1TA 3RZFA 2YERA 2PZPA 3MIAA 3OW3A 2B9JA 3BHVA 4BCJA 1QMZA 2UW7A 4QMZA 4OAUC 4YBKA 3NGAA 3KL8A 2IN6A 3D7TA 3EKNA 5FTQA 1Q8WA 3TWJA 5M09A 3A60A 3ZLYA 5EM8A 3FY2A 4RJ5A 2UVZA 4BGHA 3W8QA 3OROA 3BU5A 4IVAA 3A61A 3UQGA 3AC1A 4EWHA 2VTIA 2ZDTA 4YHJA 5F20A 3QCSA 3F88A 3THBA 3Q6WA 5ANKA 2UUEA 4DF3A 4UZHA 4D1ZA 1REKA 4IHPA 4R1VA 5DT3A 4UB7A 3TACA 5GIPE 1ZYJA 2WD1A 4GUEA 3UZRA 2RFNA 2VNWA 3P5KA 4OTWA 4YPDA 3IOPA 2R3JA 3IOKA 3KRWA 2B4SB 4FEUA 3G6HA 5CYIA 4EKLA 1OL1A 2Y6MA 4PP7A 5ANJA 3WZEA 3CD3A 4FV3A 3BBTB 1REJA 3T9IA 3ZLSA 3WILA 4CSVA 4FV0A 3A7GA 4USDA 4N6ZA 3COKA 2JAVA 5H9BA 3DZQA 3ID6C 3RWQA 4FK3A 2WQEA 4U97A 4WSYA 4FC0A 2W17A 5LARA 3W55A 4CD0A 1YXXA 5H2UA 4MNEA 2J50A 2ITZA 3R9DA 5L3AA 4YBJA 4FIJA 3R7IA 3RPRA 2QLQA 4O7LA 1H08A 3UNKA 4KRDA 4UZDA 2WEVA 2YWVA 5DR2A 3ATSA 4EONA 4S2ZA 2R3GA 3FLZA 3NPCA 3IDCA 4GV1A 2C3LA 1LUFA 3R04A 2JFMA 2OH4A 2V62A 4P4CA 1XO2B 3SG9A 2ONLC 3G5DA 4IX3A 4K77A 5IMEA 5JN2A 1FOTA 4W4YA 4R7IA 3OBGA 3D83A 1Q8ZA 2IZUA 3CQUA 3R2BA 4I5CA 4IB5A 5J87A 4FTTA 3S3IA 3SOCA 5TT7A 3VO3A 5HORA 1OBDA 3PVWA 4JR3A 3LCSA 4Y46A 3U4WA 4EORA 1JKTA 2HK5A 2PE2A 4C0TA 5A4LA 2UZWE 5AUXA 3NUSA 4OT6A 1R39A 1Q62A 2GNGA 4ONAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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