4CZYB

Complex of neurospora crassa pan2 (wd40-cs1) with pan3 (pseudokinase and c-term)
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
412
structure length
403
Chain Sequence
IPKDRRENLQKKLFHMQQLLPNSGLPNLDRWHSLFPLDTKATRNSTCFGYPSWMYKAQNNKNGRHFALRRIEGYRLTNEKAILNVTKEWKKIINANIVTVHEAFTTEFFGDSSLIFVYDFHPLSETLYDHHFPPNRNTNKIPENLLWSYVCQIANALLAIHNAKLAARCLELSKIIWENNRIRLAACSILDVLHHDSPNRKTIEELQQEDFVKFGRIILALATNTPTLNFNNIDAALATIVPRYSTQLRGVLEWLIKPSAPGETKTVETLLGGITTHLANFANFVMQESDEKEFHLMRELENGRIARLMFKLSVVNERGDSHNWSETGERLLLKLFRDYVFHQVDADGKARLDTNHYLNCLSKLDASSEEQILLTSRDNATVFVVSYRSIRQMLDRAYGELGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Gene regulation
source organism Neurospora crassa
publication title An Asymmetric Pan3 Dimer Recruits a Single Pan2 Exonuclease to Mediate Mrna Deadenylation and Decay.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PAB-DEPENDENT POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE SUBUNIT PAN2
total genus 114
structure length 403
sequence length 412
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF18101 Pan3_PK Pan3 Pseudokinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4czyB01
4ANNA 3EJ1A 2YHVA 4Q9SA 1OL5A 2VNYA 3FZTA 3MJ2A 2C3JA 1AD5A 2JDTA 1OIQA 3QQUA 4FTQA 4GU9A 4MBJA 4U97A 5FTOA 1DS5A 2WU7A 5CEKA 2A2AA 3VBXA 4EKKA 2OU7A 4M69A 5DWRA 3WIKA 5I9YA 3KULA 4EOPA 5JZJA 3ZDUA 3CKWA 4Y73A 5IH5A 3MH0A 5HG9A 2WOUA 3TUDA 2IW6A 4FVPA 5CT7A 4E5WA 3TWJA 2YIXA 4CKIA 5AUUA 2R3MA 4MF0A 2WTKC 4YURA 4BCKA 4EHVA 2ACXA 4C33A 4M84A 3F3UA 3UC3A 2ZV7A 3QL8A 4MX9A 3GOKA 1TQMA 3TUCA 2JKKA 4NKAA 5CTPA 2BROA 3L9LA 4IX3A 5ANOA 3DKGA 3CQUA 3BKBA 3VS7A 4OAUC 1G3NA 4HPTE 5AUXA 4PDSA 4GVAA 2BMCA 3BV3A 3NYOA 5LARA 4MQ2A 1I44A 5CSPA 3IO7A 3DK6A 4GL9A 2GHLA 3R01A 5KMNA 4JG8A 5DR9A 3B8QA 5EM8A 2XB7A 3WZKA 3BU6A 2Z8CA 1SMHA 5HCZA 1YXTA 2YM6A 2I6LA 4RQVA 4BDEA 2GDOA 3F7ZA 5EDPA 3VBQA 2UZDA 4RIWA 3PG1A 3PXFA 4HZSA 3PVUA 3Q52A 3QXPA 4ZJIA 1YDRE 3DV3A 3THBA 3VHEA 3CCNA 3A62A 4UN0C 4PL3A 3O2MA 1J91A 2Y6OA 2XNGA 3LFSA 4FK3A 3V8SA 4L6QA 5KKRB 4BTMA 4RWKA 4DINA 3E93A 5AP5A 4I6QA 3MTLA 4QMWA 3EQIA 2AUHA 3HUBA 4F7SA 5GHVA 2VZ6A 5LOHA 4GRBA 2A4LA 4IZ7A 4PWNA 4KKGA 4XP3A 5E8ZA 4K9YA 4TTHB 3CEKA 3F5XA 4CXAA 5B0XA 2BAJA 2V55A 5AV0A 4S2ZA 3ORMA 2JBOA 2C3KA 3C13A 3JY9A 2YCSA 3QZGA 4UMTA 1QMZA 5H8GA 1J1CA 3DB6A 4I5HA 5KMLA 1BLXA 2WQNA 3R73A 2BALA 3NUPA 4AG8A 1YOMA 4F9WA 5CALA 2C6TA 4ZTNA 4FNXA 3VIDA 4X0MA 1JSUA 3SQQA 2OFUA 3BHYA 4JBQA 4BICA 4C59A 4TYJA 2HY81 3GU4A 5AR3A 3QTUA 2H6DA 2W4JA 4ANBA 4BDJA 3RI1A 4G3GA 1GZOA 5JMSA 4QMNA 4CCUA 3LCKA 2X9EA 4B0GA 1XQZA 3GCSA 4OGRA 2YWPA 1W83A 2BDWA 2VNWA 3COIA 5EI8A 4I23A 4N0SA 4QP8A 3DJ6A 4ZSJA 3SXRA 3G51A 3MB6A 5CF5A 5IDNA 2QLUA 4WG4A 1K3AA 4F9CA 3W2RA 4FKIA 4JX7A 4P4CA 3S4QA 4EONA 4WKQA 4YTIA 4U9AA 4F1MA 4G6LA 5AP7A 3OT3A 3SLSA 4DEEA 5BPYA 2Z7RA 2HW6A 4YMJA 1TQIA 4PP9A 4ZJJA 4JX3A 4C02A 3PRIA 4RX9A 3G5DA 2RGPA 3AQVA 3C51A 2W1ZA 4N6ZA 5DEWA 3FZRA 3BIZA 3PXYA 4O1PA 3RWQA 1H24A 3TKHA 1F0QA 4O96A 5CAOA 5TF9A 3V01A 3E7OA 5LVPA 1WZYA 3R7UA 3R9HA 4EYMA 4G1WA 4EBWA 1XH8A 1ZMUA 3FHIA 1IA8A 2ZM3A 4KRCA 3MPTA 4PDOA 3FJQE 3RM7A 4TL0A 4EOOA 1DAWA 2J50A 1OL7A 3D7ZA 4D9TA 3BI6A 3MBLA 5C8MA 4DFNA 2W06A 2RG6A 2XP2A 4IAFA 5E7RA 4W4VA 1KE7A 3EFKA 4C4HA 4L7FA 1W98A 3FAAA 3ZC5A 2RF9A 4JAIA 4EK3A 3ZO2A 3GU8A 2WXVA 1BKXA 3DQWA 3CD3A 3E8EA 3F7WA 2R3GA 3C4FA 1Q4LA 3PLSA 3M42A 4G9CA 5CQUA 2C47A 3IW5A 2O65A 2IZTA 1SZMA 3OVVA 2GHGA 3ROCA 2XBAA 3ZU7A 3GXLA 4FV9A 4J1RA 1CMKE 4IX4A 5L2IA 4GJ3A 2CCHA 4FTCA 2BIKB 5M53A 5ANDA 3E3PA 4N6YA 4DEAA 1JSTA 3GB2A 4Y83A 3Q04A 4WHZA 5CU2A 1O6YA 2PZIA 4JXFA 5HE3A 3GCQA 2XJ0A 3HDMA 3P4KA 4D28A 4I3ZA 1ZOEA 4FT3A 4GVJA 2IN6A 5J9LA 3AG9A 4UEUA 3GU7A 4QQCA 4FX3A 5IH6A 3T9IA 4ZK5A 1GAGA 4IBMA 3ZXTA 4F4PA 2XNNA 4RFYA 5HU9A 3CLYA 1RDQE 5AX3A 3A7GA 4M97A 5CI6A 3O71A 5ANJA 2Z60A 3VBTA 5LMKA 4WSQA 5F20A 2PL0A 4YSMA 3PG3A 3G6GA 3ORTA 4KBKA 2PMNX 5HNGA 4BCJA 2QURA 2G2HA 1ZOGA 2V7OA 2WD1A 4D2RA 2G15A 4NFMA 2XK4A 4MK0A 5BMSA 2VTSA 2R3JA 4WBBB 2OIDA 5LVOA 4JL9A 2HWOA 1YXUA 2YCQA 2Z7QA 1ZLTA 4BFMA 4GYGA 1FMKA 2W1EA 2XNMA 4J8NA 4MBLA 5KZIA 4CZUA 5DT0A 4FKUA 4D4SA 1QPEA 3UVPA 1DM2A 1M17A 2WMRA 5CAUA 5IEVA 1ZYLA 4JQEA 4JDKA 4FEQA 4R8QA 1OL2A 4NH1A 3V51A 4ASZA 4TWOA 3FQHA 3RCDA 2BDFA 3RM6A 3TNPC 3VRYA 2O3PA 4FL2A 5E92A 3NWWA 2VRXA 4RC4A 4I6HA 4MWIA 4ZOGA 3VUKA 3PJCA 3V3VA 4AT3A 2JLDA 3AGMA 2F7XE 2C69A 3TNQB 4BF2A 5LMBA 4Z3VA 1PXPA 2Q0NA 4R7IA 3JS2A 3E5AA 5EI2A 3FL4A 3VUGA 3FXZA 2B4SB 2F49A 4LRMA 3PIZA 5I4NA 3EWHA 4EHEA 5EG3A 5LVLA 5AP6A 1JKSA 3AXWA 1PXOA 4B6LA 2WMWA 3F5UA 5A46A 1JSVA 3QHWA 5EKOA 1O6KA 5JH6A 2YJRA 1MP8A 1T45A 4X6RA 3AMBA 3KRXA 4GCJA 4I20A 4X3FA 5DRBA 4FK6A 4R7HA 4NJ3A 3TV4A 3JYAA 5CXHA 3EB0A 4G3DA 5IKWA 4FUYA 4E4MA 4F7NA 3CTJA 4O91A 5CU6A 5TR6A 4D5KA 4F99A 5JRQA 3NIEA 3ZZWA 1Y91A 4X2JA 5KX8A 5EK7A 3LFAA 4YTHA 3EQDA 4XLVA 4BCMA 3RHXA 2OG8A 3PPKA 5LMAA 4EJNA 4EL9A 3DB8A 1M7NA 4BHZA 2PVLA 1AQ1A 3MPMA 2WHBA 2WTIA 3LM5A 5CEIA 5JZNA 3LFBA 2XMYA 2R5TA 3R8ZA 2BRNA 2C6DA 4V05A 2HZ0A 2PVKA 2CN5A 1H01A 3S95A 4D4YA 1P4FA 2R3LA 3IW4A 3UOHA 4BWPA 3UO4A 4TYEA 5J1VA 2HZNA 3T9TA 4PDPA 3HA6A 5ACKA 3W2OA 4K18A 4E26A 2JKOA 3PXKA 4MBIA 4CFXA 3ZLWA 4XV9A 3H9OA 3CP9A 3MVJA 4AGDA 1OZ1A 1OMWA 3CQEA 1E1VA 3E63A 5T6KA 1YI6A 3V8WA 4ANMA 3HMIA 4ZY4A 5DMZA 4BDDA 2KTYA 5EYKA 1HCLA 1ZMWA 3AC1A 3CBLA 3K5UA 1X8BA 2AYPA 4F70A 2HYYA 3ZH8A 5CWZA 2OK1A 1Q99A 3QRIA 3L1SA 3ULIA 4M69B 1BL7A 2X9FA 1VJYA 3RPSA 4E20A 4BZDA 1QCFA 5L2TA 3F88A 1MRUA 4XX9A 5ACBC 3S0OA 3UP7A 4K6ZA 2QODA 3EQPA 3LFCA 4E6DA 4QMLA 4EQMA 3R63A 3R30A 3HKOA 4KIPA 4LL5A 4RGJA 3D9VA 3UGCA 1OKVA 3PJ8A 4FKPA 1UNHA 4XG2A 2R9SA 3LFNA 4CKJA 4DN5A 4UMRA 2QOLA 3RBWA 3R04A 3KXMA 5GNKA 3WZUA 2J9MA 3H3CA 4I5MA 4RC2A 4MH7A 1ZAOA 2X2MA 2VX1A 4FKWA 2ZMCA 3PJ3A 1FPUA 3MFSA 3LIJA 4AZSA 3QRTA 5EDQA 5J95A 3NAXA 4KS8A 5I9XA 5HBJA 4GK2A 4XG8A 4KSPA 2JFLA 4WBOA 3GENA 4TNBA 2O64A 3ZBFA 4RA4A 2YLFA 4FZDB 4RIWB 3TEIA 2R4BA 4OTGA 4HCTA 4FZ7A 3TACA 5AAGA 2V62A 1XJDA 2PTKA 4IIRA 3BBWA 5DVRA 4Y95A 1NVQA 4LGHA 5T68A 2VWBA 4F09A 3BGQA 3UJGA 4QMXA 4XG4A 2ZYBA 2F2CB 2XCHA 2XKCA 2XUUA 4GFMA 2BFYA 4DCEA 2J5EA 4YTCA 5GZ8A 3LJ1A 3LXNA 4RVLA 5IZFA 4GIIA 2PUUA 2WQMA 4HGLA 4IWDA 2QOQA 4O0YA 4IQ6A 1SNUA 3TKIA 2WQEA 3I0OA 2J7TA 5ETFA 5C8NA 1FINA 3EN9A 5HESA 3HGKA 3A60A 5L2QA 2UW7A 3QZFA 3JXWA 5B2MA 4YJQA 2PE2A 3NW7A 2BCJA 2FSOX 3LVPA 3EYHA 4DFZE 3OF0A 4JBPA 3R8UA 5EKNA 2J0MB 2JKMA 5AV2A 2ITPA 3QQLA 2OF4A 3RAKA 4EZ7A 1YDTE 2OJIA 3GU6A 2UZUE 2Y8OA 3BELA 3OP5A 4F0GA 3QRUA 3G2FA 4IVCA 2VX0A 4DG2E 1K2PA 3SXSA 4ACHA 2JFMA 4R1YA 3BQRA 4ERWA 5JSMA 5K9IA 3SVVA 4ZLOA 1ERKA 4YHTA 3F3TA 1IR3A 1PXNA 2OXDA 2GNGA 1XHAA 3ORPA 4C61A 1WBSA 5EYDA 4A9RA 5AEPA 2HOGA 5HD7A 4KKEA 2J4ZA 2XM9A 1JAMA 3E88A 2X0GA 3NNUA 3PY1A 4UYAA 4B4LA 4EBVA 4G17A 4A4XA 2XRWA 4R6VA 3KRJA 2IVSA 5ITAA 3VHKA 2W7XA 2Y4IB 3QQGA 3PWYA 5KBQA 3S00A 2GS2A 1IG1A 4FNYA 2ZV8A 3ACJA 1YKRA 4GEOA 1LEZA 1OITA 4LUEA 1H07A 4IWPA 4H39A 2WMTA 1YWVA 2WZJA 5EM6A 3MH3A 2A0CX 3NIZA 4O2PA 3UVRA 5HTIA 3DOGA 2YABA 3KMMA 4L67A 5ANKA 2QU6A 4OTWA 3BWJA 2XJ2A 3ZYAA 4CMOA 5J7BA 4F08A 4E93A 3ANQA 4LMNA 3WE4A 4O0XA 4D1XA 1LR4A 3WF6A 3TL8A 1WMKA 3DLSA 4ZY6A 4C2VA 4A4LA 4CFWA 4DC2A 2R3HA 5ICPA 4EHGA 2QLQA 3COKA 4PMMA 3ZSGA 4TYHA 4TNDA 5KMMA 3QZIA 1PHKA 2JGZA 4A06A 4AW0A 4E6CA 2H8HA 2X8EA 3GFWA 4IVBA 2EU9A 4IZ5A 3WF9A 4EWQA 4CYIA 2ESMA 5E1EA 2QI8A 3Q32A 3FSFA 1RQQA 4C58A 3BQCA 3M2WA 4PMSA 5D12A 3MN3A 2E9NA 4AGCA 3W55A 3ET7A 5HOAA 2X7FA 2W1CA 2PVNA 4G9RA 5F4NA 3VAPA 2WNTA 3FI3A 4C7TA 5M56A 3CGOA 4IM2A 3CPBA 3UODA 3UYTA 1M7QA 3OWLA 5BVWA 5CNOA 2W1FA 3ORKA 4FV5A 4RJ4A 3G90X 3OUNB 1H25A 4XEYA 4AE9A 5DHJA 4YNOA 2R3OA 3OEZA 3DK3A 5JN2A 3S3IA 2ITTA 2YIYA 2O0UA 3F5PA 3FQSA 4G3EA 4L9IA 4V04A 1V1KA 4GV1A 5IF1A 2HZIA 2NRUA 2W1HA 4O1OA 4BCIA 4BYJA 4UYNA 2ETRA 3F3ZA 3KRRA 3ZO3A 4F0IA 4NM5A 5AAEA 5JRSA 1ZYSA 3W33A 3ZEWA 3IOKA 3TV7A 4IAKA 4BHNA 3NPCA 2XIRA 4DBNA 2XM8A 3QCXA 5E8YA 1Q5KA 3KXZA 5HVKA 4YUQA 5IG1A 4XH6A 4FR4A 4AS0A 1NA7A 3QTQA 2FA2A 5DA3A 3EKKA 3FKNA 1IRKA 2ETMA 2GQGA 3BYUA 2C4GA 1YVJA 3EL7A 2A27A 2UW9A 3LJ0A 4FGBA 3EQFA 4NCTC 4TT7A 3MV5A 4WOVA 2HW7A 2XS0A 2ZB0A 4YBKA 5HKMA 1W7HA 3GNIB 3IS5A 5CVGA 2GFCA 2GNJA 3PSDA 2YFXA 3V8TA 4BBMA 3DY7A 3OXZA 2WTDA 4NJDA 5GJDA 3EQGA 4ZSEA 2CGVA 2YLEA 5AJQA 3EKNA 5JFWA 4GG7A 3IGGA 3O7LD 3SHEA 2YM8A 3M1SA 2G2FA 5KUPA 4JT3A 2HZ4A 2QOCA 4YJTA 4JI9A 3UNKA 1YOLA 4KB8A 4C0TA 3O17A 4GT5A 5B2KA 2P0CA 3BYOA 1VR2A 3ENMA 3U6HA 3DBCA 3RCJA 3HVCA 3MW1A 3R9NA 4BI0A 4CFFA 3RVGA 3P23A 4KNBA 4IX6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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