1WCCA

Screening for fragment binding by x-ray crystallography
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
298
structure length
283
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Fragment-Based Lead Discovery Using X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 283
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2004-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1wccA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1wccA01
1R78A 4N6ZA 2HY0A 5AR3A 5LCJA 3E3PA 3NAXA 2GQSA 5KX8A 4O7YA 5BX0A 1M2RA 4W8EA 4O7ZA 4YURA 3BHYA 4RVMA 2IW8A 4BB4A 5E8ZA 4ZTRA 1IG1A 4BDCA 3B2TA 3SDJA 4ERKA 2WOUA 3A7GA 3UNKA 3KQ7A 5KZ0A 1Q8UA 3OD6X 1MRUA 3A7JA 1GOLA 2AC3A 2F49A 4KBKA 4FTCA 4LOOA 4RFZA 3RM7A 1OL1A 2G2FA 3QX4A 1FVRA 2XUUA 4CNHA 5B2LA 3UIXA 4HGEA 3KK8A 2ZOQA 2GTMA 5DT4A 3PG1A 3ZUVA 1NVSA 3R9DA 1F5QA 4IAFA 5C27A 3R7YA 2PVJA 4BCJA 1ZAOA 2UW9A 3R7VA 2PUPA 1Q8WA 4UYNA 4E5AX 5KMOA 1J7LA 2WZJA 4X3FC 5JZNA 3C51A 2PZIA 3PXKA 3E7OA 2Z02A 1Q8TA 3U51A 2VTIA 2WMSA 3DBCA 3DLZA 1JOWB 4YC6A 3UP7A 4L67A 4DF3A 3PXYA 5M53A 3BCEA 4PTEA 3TEIA 4DFUA 4M67A 3BLRA 1YI3A 5A9UA 1KE7A 1WMKA 5JN2A 4DGOA 5EQYA 4YHTA 4LG4A 5EHYA 1IA8A 2XNBA 4R5YA 2FSTX 5AUZA 4AGUA 4CFWA 1GZKA 5L8JA 5K4JA 4LYNA 1SM2A 3CD3A 4XNEA 3POOA 2B0QA 2ZV7A 2I40A 3GC8A 4XH6A 1T46A 2PU8A 5AX3A 2WQEA 5DT0A 4FKUA 1YOMA 2XJ0A 4FSNA 4X2KA 4M69B 3ATSA 3M1SA 5DEYA 4CG8A 2JKMA 2R5TA 3FMHA 4JG6A 5M44A 4J7BA 1M14A 4OTFA 4U42A 3UPZA 2BZJA 2PZYA 5IDPA 2HW7A 4GG7A 1WCCA 2ERZE 3OWLA 4BDJA 4F1TA 3FUPA 1H8FA 3ORZA 5M09A 2G1TA 2BFXA 3KGAA 4NJDA 4AW5A 4AE9A 3QX2A 3KC3A 5F4NA 4GYGA 5K0KA 3ACKA 2B52A 3KXXA 4AA5A 3AC2A 4JBPA 1NT2A 1YDRE 1W8CA 3Q52A 5HG9A 3NAYA 5FWKK 4K8AA 4RG0A 2I7QA 5BUJA 2QKRA 4GK3A 3TJDA 4YZBA 5EHOA 5HE3A 4M0ZA 2C5XA 1XO2B 1OIUA 1OL5A 3CQEA 5IKWA 4NYEA 3DK3A 4I22A 4I3ZA 3OW4A 4IQ6A 3RINA 3U6JA 3ATTA 5IUIA 3LFAA 2C47A 3PA5A 4ANSA 3C4WA 4E7WA 2YAAA 3PWDA 3W8LA 3U6HA 3HA8A 2WTKB 4TWOA 2ZM3A 5ETAA 4R7HA 2VTHA 4U7ZA 3VUKA 4IX5A 2OKRA 4IX6A 3GOKA 4L6QA 4YJPA 1DI9A 3FY0A 4H1JA 2BDWA 1O6LA 3L9MA 3KMMA 1GJOA 3UZRA 2ACXA 1MQBA 4M66A 4CFVA 2Y0AA 4IM0A 1K9AA 4EH6A 4L01A 3U9CA 5KO1A 3LMIA 2VTLA 4QP6A 5AM6A 4RQKA 3QWKA 3S95A 4A9YA 3KRRA 3IO7A 2E9UA 4FKJA 2QCSA 4GEOA 3BYUA 3K2LA 4JX7A 1P5EA 4DT8A 3TM0A 2C0TA 2R9SA 4TWNA 1OGUA 1Q5KA 2GNLA 4II5A 3VJOA 1OKZA 4FE2A 1W84A 1UKHA 4HNFA 4FZFB 3F3ZA 1OL7A 4UZHA 4XV2A 4JR3A 3NNWA 1H1PA 3UPXA 2B4SB 2WPAA 5IA0A 5CEOA 4IZ5A 5I3OA 2E9OA 1J3HA 2ZV2A 1M7NA 3EZVA 3NNVA 3MYGA 3PYYA 1P14A 2QC6A 4JRVA 1H0WA 2HWOA 4LV8A 3ORIA 3L9PA 4IVCA 5EQPA 3PA3A 2JITA 5J5SA 3JY9A 3A7IA 5DE2A 4GK4A 4A7CA 4F7NA 4IW0A 4YJUA 3R63A 2PYWA 2J0JA 3PP1A 3LVPA 2YJSA 4NK9A 5DOSA 5BYLA 5CZHA 3MIAA 4F6SA 2PVRA 4U6RA 4TRLA 4O1PA 3IONA 5HI2A 4IVBA 4UMQA 3AC8A 4RLLA 5DIAA 2PHKA 3QCXA 3FLNC 5CEPA 4FV1A 5EHLA 3H10A 3V5LA 4QTEA 5CASA 1IAHA 5CAOA 3NCZA 4AZVA 3QUEA 2Q83A 2WTDA 2W05A 2DYLA 3GU6A 2JDOA 3L8VA 3EN6A 1BYGA 2XIRA 3EQCA 4FX3A 4PY1A 4XLIA 5L6WL 3WIKA 1PF8A 4DYMA 2PUIA 2OXYA 5EDQA 3WF6A 3COHA 1U4DA 4M14A 2P55A 1U54A 2JDTA 3NUSA 4KIKB 4NSTA 4DEEA 2ITUA 4DCAA 4IB1A 4FTRA 4ZTQA 4BDKA 5CQWA 4GSBA 3NPCA 4G3DA 3RTPA 4RQVA 3ZCLA 5CF8A 3PLAE 3ZONA 4IFGA 4JBVA 1OECA 1PXKA 4PTCA 4LFIA 4QQJA 1U54B 4WNOA 5J8IA 5TE0A 4RIXA 3V8WA 5IUGA 3ZZEA 2ITXA 3DU8A 2CCHA 3CGFA 5HIEA 4PRJA 4FT5A 3MIYA 2X7OA 4CQGA 2CNVA 4HYSA 5FG8A 2ETMA 2P2HA 5AR7A 5BVWA 1STCE 5ANEA 2BAKA 3A61A 3OXIA 5J9LA 2W4OA 5TR6A 4ZS4A 2XBJA 1R3CA 5E92A 4PDOA 3AD4A 4ACGA 4OTDA 2QU6A 4OTRA 5F95A 4MX9A 4AWIA 2O0UA 3TWJA 2HYYA 4RX8A 5EOBA 2H6DA 2Q0BA 3VBTA 4D2VA 4BICA 5K9IA 4GCJA 5AM7A 1FMKA 1OI9A 5IPJA 4FZAB 4FK6A 3ELJA 2B9HA 4QTAA 4Q5HA 2Z7QA 4XV1A 2QHNA 3GC0A 3MSSA 1YOLA 1Z57A 4CT1A 5FXRA 5KMKA 3ORLA 2XVDA 4C4GA 2J9MA 3A8WA 1GNGA 3IW7A 4IWQA 5CNOA 4D9UA 5HU3A 3RPOA 3D5VA 1LEZA 5G6VA 4RZVA 2C0IA 4CCUA 2Y4IC 4W4YA 4MCVA 3W2OA 4N57A 2YLEA 2OJ9A 2J0MB 2ITYA 2PMOX 3QTRA 3CKXA 4L44A 4GK2A 4BCIA 4E20A 2ITOA 3Q60A 2YWVA 3GEQA 4AZWA 4IANA 4ITHA 3ZC6A 3R2BA 4C58A 3ENMA 2PWLA 4LM5A 2V7OA 1UWHA 2CNUA 1H26A 2OK1A 2VZ6A 5CANA 3FKOA 3DTWA 4FBXA 4W4WA 4U45A 4ZY6A 4NH1A 4YSMA 4EQMA 5L3AA 2BR1A 2FVDA 3MJ2A 2GHLA 4KS7A 4GS6A 4C4FA 3OEZA 3PE2A 2OICA 4C3RA 3CJGA 3BLQA 3M42A 4TYJA 1WBVA 4RJ8A 2WMVA 3D83A 4RJ6A 3RPRA 3UNZA 3ZUUA 3LCDA 2OIDA 2ZM1A 4ZXTA 4WG4A 4CYIA 3E64A 3UP2A 5IQCA 3HRFA 3V5QA 4IFCA 4QMOA 2R7BA 3D7TA 4BCMA 4AT4A 3C4CA 4HVHA 4FIGA 5BYZA 5FXSA 3VF8A 4KABA 4Z3VA 3VIDA 3WARA 2VUWA 3KK9A 2XKCA 3AXWA 5ACBC 2C6KA 3U6IA 1YWNA 3QXPA 4YLLA 4LI5A 3ZSGA 2UW5A 2ITPA 4HJOA 5GNKA 4DFZE 2VTJA 5DH3A 3V5TA 1I09A 3WE4A 4UMRA 3HGKA 3I6UA 4YJQA 1JBPE 3V5JA 3ZFXA 3ZBXA 4BFMA 3HZTA 3LM5A 5EI8A 4JNWA 3WF7A 3R2YA 1ZZ2A 4IJ9A 4ARKA 5BVDA 2NRUA 4AN3A 2W96B 1OKWA 2OXXA 2VWWA 4D1XA 2QO7A 4JQ8A 4F0GA 2Y6OA 5C4KA 3EKNA 3UO5A 2WIHA 2QQ7A 1YVJA 2UW7A 3NDMA 1W82A 3DBEA 3F2NA 4C34A 4C4EA 4D2SA 3W16A 3DZQA 5AV4A 2PE0A 2W9FB 4PMTA 1ZOHA 3K3IA 3P08A 4O1OA 2BALA 4O7VA 3R6XA 4DH8A 2VU3A 4F65A 1M17A 4G5PA 2GS7A 4HYHA 2BZIB 4ANOA 4IADA 3PTGA 2B54A 2C30A 3FSFA 4QYEA 5BVFA 3PSCA 4DLJA 4OUCA 4AGCA 4RIYA 3VNTA 5CU0A 4IC7A 1H01A 3IW5A 4K0YA 3QAME 3V5PA 1PRYA 4A9SA 1DI8A 5IA1A 3O8TA 4BCNA 1JKLA 4FTMA 3N51A 4EK3A 3OWKA 5LVLA 5JH6A 4FIFA 3REPA 1SNUA 3PRIA 2IVVA 4MYGA 4B9DA 4A9UA 2B55A 3SVVA 2ITNA 4CMUA 3LQ5A 4P7EA 3V8TA 4GKIA 4NL0A 1XHAA 3QTZA 4NUSA 4EJNA 2FA2A 3L8XA 3C0HA 4FV2A 1XH9A 4JLCA 4YC8A 5EI6A 2OJFE 3H0ZA 3UDBA 2YISA 4K77A 3RKBA 2O63A 1URWA 3BHHA 4EQCA 4Z7HA 1YRPA 4BHZA 3LXKA 1RW8A 2BRGA 3G51A 4FIIA 5I9VA 3P5KA 4DTAA 3RZBA 2XIYA 3GFEA 3NZ0A 2GS2A 4WD5A 3FZ1A 2PSQA 4RWJA 5DBXA 4XP2A 3RWQA 5IH6A 3TI1A 1SVEA 3PY3A 4G3FA 3TTIA 5HTBA 4JVGA 1SZMA 3PXZA 3Q5ZA 2XM9A 3QZHA 2YM6A 2QLQA 4HCUA 4PP7A 3BGZA 5CAUA 2OW3A 2NRYA 3QCSA 4F9WA 4Z16A 2J0IA 3COKA 4L3JA 3RHKA 4O84A 2XYNA 4I4FA 3MVMA 5G1XA 2OF4A 3WYYA 3F5PA 3SXRA 4JXFA 3GCPA 2GCDA 4JBQA 2HCKA 4WRSA 3DT1A 4GU9A 4EH5A 4RFMA 4H3QA 2IVTA 4FT0A 1Y91A 3WF5A 3WIGA 4IHPA 3BQRA 5HO6A 4C35A 1KSWA 2ITWA 2RFDA 1KOBA 4ZTLA 1WBWA 4RBLA 4WUNA 5A4LA 2X9FA 2A2AA 3EWHA 2HZNA 2I6LA 4E6AA 4USFA 1OIQA 4MVFA 4RWLA 4EZ7A 4WG3A 4RT7A 2EB2A 4YBKA 3RAIA 3EOCA 4V04A 3LHJA 1V0OA 3FMJA 3KMWA 3QRKA 3EH9A 4CLJA 3PJ3A 3FHIA 4C61A 5A4EA 4H05A 3UO6A 4CZYB 2W06A 4I93A 4DEHA 5I9XA 3UQGA 4WBOA 4HGSA 2CMWA 3F3UA 3AC4A 4MBIA 2QOHA 1V0PA 3LXNA 4IC8A 2GDOA 4C57A 2YDIA 2DWBA 4YSJA 2CGUA 1CKIA 4G6NA 3C0GA 4JQEA 4KKEA 3Q04A 5HBHA 4PDPA 2C5YA 3SQQA 3ALNA 2E2BA 3DJ7A 4FGBA 3QHRA 5HNGA 3E5AA 3SXSA 3CSVA 3JR1A 1BL7A 5KCVA 4ZLYA 2PMNX 4AG8A 5C4LA 4FKQA 2VWYA 4BF2A 5KMIA 2IZTA 4FV5A 4EHGA 3QD3A 5DRDA 3TKIA 2IG7A 4N4SA 3COIA 5B0XA 4WO5A 4QMTA 4O27B 5GIPE 4EBVA 3DXPA 2W1IA 3N4VA 4DAWA 2XRUA 1G8AA 5JGDA 3MBLA 4LMNA 1CM8A 3TUCA 2XM8A 3BQCA 1XBBA 3NYXA 4FTAA 4ASZA 3LMHA 4R78A 4QPMA 4RC4A 5CEIA 3VHEA 3MH0A 5HIBA 1J1CA 3P1AA 3P7BA 5HG7A 3IGGA 5FQDC 5IUHA 3JVRA 4BBEA 2YZAA 3OG7A 4L3LA 5EQEA 4RIOA 3BYMA 1TKIA 4JBOA 5FXQA 3R8PA 3O96A 1ZWSA 2R3IA 5L2IA 4YP8A 3RK7A 1B38A 5A6NA 2ZDTA 4HOKA 4NWMA 4I0RA 4A4OA 4AN9A 4X2NA 2CN8A 2NO3A 2ZB1A 5JGAA 4OAVB 2R3OA 4H1MA 3VF9A 3AOXA 4DEGA 3O51A 4QMWA 5C03A 3RPSA 4ASEA 2CLXA 4BZDA 3KB7A 4MXYA 4IB0A 3BEAA 1DS5A 1Q24A 5IISA 4U8ZA 3LFQA 4OBQA 5KE0A 1Q8YA 2W17A 4JR7A 2ZM4A 3V01A 4F4PA 4YU2A 2YZLA 1OB3A 2JFMA 2XF0A 2O65A 4XG8A 3UC3A 3CQUA 3KEXA 3LPBA 3BLHA 2C6MA 3SC1A 4D58A 3C4XA 2AC5A 3HUBA 3QTUA 5GJGA 2YJRA 5AIKA 2Q0NA 2PVKA 3EL8A 5CX9A 3NNUA 3R9OA 5M4IA 4I6BA 3GBZA 2ITQA 5CF5A 4GIHA 4DEDA 2IJMA 3G5DA 3DDQA 4BKJA 3UODA 3ZLWA 4BCPA 3BWJA 2BFYA 2UW8A 4NT4A 5A4TA 2QO9A 4QYHA 4NW5A 2QI8A 4NU1A 4DFYA 1QL6A 5LWNA 4KSPA 5AP6A 5I9ZA 3QGWA 3OC1A 4C4IA 2ONLC 4L53A 4DTKA 4YTIA 5M08A 3HV7A 4FG9A 3TN8A 4L00A 2PULA 2W1CA 3CPBA 3ZO1A 3ULZA 4DC2A 3ZH8A 4BCKA 3EB0A 1KV1A 3VHKA 4ZSEA 1GY3A 2J51A 2Z7LA 4AGDA 3R9RA 4OR5A 5E8UA 2F57A 2Y8OA 5F20A 3BPRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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