3C13A

Low ph-value crystal structure of emodin in complex with the catalytic subunit of protein kinase ck2
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
GPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The Catalytic Subunit of Human Protein Kinase CK2 Structurally Deviates from Its Maize Homologue in Complex with the Nucleotide Competitive Inhibitor Emodin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 112
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3c13A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3c13A02
2EXCX 2OF4A 2JDVA 2X6DA 2XJ0A 3ZM4A 5H8EA 3P4KA 2W5HA 1ZYSA 3DNDA 4RC2A 5ANIA 5JFVA 5FWKK 3K54A 4YNEA 4EYJA 4FTTA 3LXPA 3FXZA 4ASDA 3U55A 4L7FA 2IPXA 1CKJA 3ZHPC 3ZRKA 2ETKA 3OMVA 2GS2A 1JNKA 4PMSA 4X3FA 5EYKA 5FTGA 5FM3A 2UVZA 2J4ZA 4APCA 1PXJA 2JDSA 4DH3A 1W98A 4C58A 5L2TA 4BCKA 4ZY6A 4EBWA 1H28A 4L00A 4JG8A 4DG0E 2RFEA 4X2JA 5HI2A 4J97A 4DBNA 3RP9A 1G8SA 3SLSA 2RF9A 5HE1A 4WNPA 3TNIA 1XH6A 1OI9A 2ZB0A 2WZJA 4R7BA 5L8LA 1IA8A 2Z7RA 2CSNA 2RFSA 4ENXA 4F9WA 3ZSGA 2C5VA 3VHKA 3QRTA 5AM6A 3HV6A 3MB7A 4AOIA 4FSQA 4QPMA 3R9RA 2EB2A 4R7HA 3RK9A 4Q5HA 3FZSA 5CSHA 4YC3A 2JKQA 5AP7A 4FV0A 4I5PA 5E1SA 3AXWA 2IW9A 4E4XA 4CFWA 2NNWB 4RJ4A 5EOBA 5DEWA 3EMGA 1J1BA 4NSTA 1PXMA 2X2LA 3LFDA 5FP5A 1H1WA 4L3LA 4RX5A 3UIBA 5LVLA 3IS5A 4X3FB 4LUDA 5KZIA 2GQRA 3VAPA 2Y4IC 2UZUE 3HMOA 4JQEA 3R8ZA 3ZUTA 4RX9A 4EI4A 4E20A 3E93A 5EHOA 4RQKA 3PA4A 4C3PA 4DINA 3QQKA 3FZTA 4XX9A 4ZTSA 5LCJA 3QQJA 3FZ1A 3R2BA 4G9RA 4ZTLA 3R7VA 3RHKA 2I7QA 2FSLX 4FYNA 3PG3A 2JIVA 2WTJA 5AUZA 4QMLA 3QALE 3AC3A 3DXNA 4DN5A 3L8XA 3P7BA 3ZM9A 3KXMA 2JBPA 3D83A 3I1AA 5HESA 4B6LA 5JKGA 2QI8A 5L6WL 3AD4A 3FE3A 4LQMA 2GPHA 5FBNC 3RALA 2Y9QA 4DF3A 5J7BA 2PVHA 4Y85A 1CMKE 4YBKA 4YP8A 4ANQA 3G6HA 3R8VA 4CV8A 3G51A 2JFMA 3S4QA 4ONAA 3H30A 1R39A 3OXIA 2VO0A 3DFAA 4RZWA 1PXPA 1CDKA 3AMAA 4FNWA 5AA8A 2ITXA 5I9ZA 4IX5A 2J2IB 2CN5A 4TNBA 4V0GA 1U54A 3DA6A 3ZUUA 1QPCA 2F7EE 3PWYA 2HYYA 3D9VA 4GSBA 3OOMA 3E8CA 5HO6A 4ZY4A 5GZAA 5JZNA 1GZ8A 4EK6A 2PE2A 4AT3A 4EH2A 4L6QA 3SA0A 3FHIA 4I6QA 3R1YA 5A6OA 3ATSA 1BYGA 1I09A 5DGZA 3F5XA 2W9ZB 4FOBA 4ASXA 5DMZA 4P4CA 1KE7A 4UN0C 2OZAB 3COHA 1YHVA 4ZLZA 4R1VA 4AZSA 1Y91A 3FL5A 3O0GA 3C51A 2CGXA 1DI8A 1AGWA 1W83A 2W1DA 4UXLA 4NU1A 3RZFA 5D9HA 3SG9A 3KRLA 4PV0A 5DT4A 4BTMA 3RGFA 5AP6A 2B4SB 5HVYA 4F6SA 4HVDA 2HZ4A 3Q60A 2PMLX 5AP1A 4DFZE 5HE3A 4O7NA 2QOQA 4NM5A 5EG3A 4AA5A 3FMMA 4F7JA 4KSPA 2UV2A 1XR1A 4PTGA 3MI9A 3SC1A 4X21A 1U54B 5JFSA 3LCTA 2PVYA 4GUBA 3V04A 1M2PA 2CCHA 4FEWA 4QMNA 4AA0A 3P9JA 1QPEA 4NJ3A 5IA0A 4FE2A 4U5JA 2H34A 5ANOA 4EYMA 2JDOA 4JRVA 3QYWA 4CG9A 2CNUA 2W1CA 5K5NA 3HVCA 4NUSA 5D41A 5AP5A 3R8UA 4DTKA 2IZUA 4PNIA 4TN6A 4JR7A 2XVDA 1Q8UA 2PY3A 2YITA 4C8BA 3H0ZA 3E3BX 3UVQA 3KULB 4FVRA 2E9UA 3H9OA 3VRYA 3VJOA 4AW2A 4C4GA 3QLFA 3C13A 3NAYA 2YJRA 2UW5A 3OFMA 4XG6A 3R1SA 4AS0A 2Q0NA 3FSKA 3KMUA 1JOWB 4BDDA 2C6DA 3NUXA 3ET7A 3MJ2A 3ORTA 5KBQA 3TZ7A 5H9BA 5KZ0A 2OI4X 4O0SA 5EM7A 3T9IA 4DEGA 2HW6A 4NKAA 2R3FA 3LHJA 5BVOA 1ZZLA 4YURA 1PKDA 3EN5A 1UU7A 4QMWA 5J95A 3QC4A 4K6ZA 4FT5A 2OICA 3MFUA 2G1TA 4C02A 4QP9A 1WZYA 2YCQA 5ANJA 3Q04A 2WAJA 2XK6A 3REPA 5BUIA 5L2IA 2XIYA 3HLLA 3II5A 4TWCA 4DAWA 3OTUA 5F94A 4O0XA 1ZYJA 5I9UA 4IMYA 3F3UA 4TYHB 5KNJA 3DT1A 4UX9A 4FL1A 2Z2WA 4XG8A 2OLCA 2XM9A 2JKMA 2XCHA 3OBJA 4WBOA 3TNQB 3EFJA 2EVAA 4GK2A 4FICA 4U3ZA 5DYJA 4CFMA 2PVNA 5DHJA 2R0UA 2C5XA 1Y8GA 4G2FA 4IC8A 2PUPA 2VN9A 3D4QA 3GEQA 5FQDC 2OG8A 4JQ7A 1DAWA 4PUZA 4YTFA 5AMNA 5KHWA 5H3QA 2VWUA 4LGGA 2X7OA 4C4HA 3MTLA 2E9PA 4BC6A 1YHWA 4HJOA 4RIXB 3UQCA 1QL6A 3L8SA 4M7IA 3RAWA 3OCBA 2YERA 2YLFA 2X6EA 1KE9A 3DDQA 5M55A 2YIYA 4NTTA 4DGMA 5AR8A 4RIWA 3IOPA 4XG9A 5FGKA 2YIXA 4DFNA 5K5XA 4E5AX 3W8QA 3DS6A 4NCTC 3IG7A 3CJGA 3GU5A 2F7XE 2F2UA 3W2CA 2OF2A 3BHUA 1UNHA 5CZHA 3KFAA 3QL8A 3F9NA 3B2WA 4GYGA 4IAFA 4ZJJA 1FINA 2E9VA 5M53A 5FUTA 3JYAA 3QKLA 4HPTE 1RJBA 3M1SA 4CZTA 3ZFMA 4DGOA 5AUVA 2QO7A 3BU3A 4IXPA 3HRFA 4J71A 4ASEA 4F9YA 4MQ1A 2WMBA 4FKGA 1E9HA 1O6KA 4CFXA 5KMMA 4GG7A 4LOQA 4HVSA 5ICPA 2JIUA 3CGOA 4O6EA 4FUYA 3RHXA 4MXXA 4XV1A 5DR6A 2WIPA 1W0XC 2HXQA 4RGJA 4I3ZA 4KIPA 5G1XA 5TR6A 1PHKA 2VWXA 3MDYA 4ZK5A 2OBJA 3FDNA 5E1EA 4L01A 1Q61A 1H4LA 2HELA 2XIRA 3NEWA 2UW0A 4HGLA 4MXOA 4RIWB 4UYNA 5KMJA 3BHVA 3ELJA 3UO4A 3VC4A 4YZBA 3NGAA 4GIIA 3U9NA 4GG5A 2EU9A 5ETIA 3V51A 3V8SA 2CLXA 4WNKA 1XO2B 1KV2A 4DGLC 1ZRZA 2CNVA 3O71A 5ANEA 2BTSA 4YBJA 4M97A 4USFA 4TYIA 1UA2A 3R01A 4HZRA 3ZS5A 4WUNA 4A9SA 4GJ3A 3KN5A 4F7NA 3LMHA 4OTPA 1SNUA 4BFMA 3ITZA 2W1EA 2P3GX 4FG9A 4N6YA 5CVFA 4FT9A 1PJKA 3GCUA 4IM0A 1URCA 2HZNA 1P4FA 4MBLA 5C26A 5CXZA 2X9FA 4L9IA 3MW1A 1MRUA 1VEBA 4GRBA 2UZOA 4MH7A 3PLAE 4G17A 2CNQA 2OXDA 4IE9A 4JS8A 4D1XA 2R3PA 4UWYA 4ERKA 2BRMA 2W1ZA 4L44A 5L2QA 3TV6A 4ZTMA 1YXTA 3F69A 4E4NA 5K3YA 2QVSE 3Q32A 5CF4A 4YO6A 4B8MA 1OL1A 3CQEA 3KXZA 4MXYA 1OVEA 2XZSA 4AA4A 4AGCA 5E8YA 3BLHA 3QWJA 3PVUA 4NYEA 3MFSA 1YI6A 2WGJA 3Q4CA 1TQPA 2YEXA 3LFFA 4M8TA 4AW5A 4C37A 3OWJA 3TKUA 5D10A 5HNIX 2YIRA 3AOXA 3UIMA 3D15A 3GOKA 2C5OA 4IWOA 4HPUE 3ZUVA 4CXAA 4TWNA 3KREA 4HYUA 3PSBA 4QQJA 5L8JA 3BQCA 3R63A 4LV5A 4V01A 5AAFA 3TV7A 3ZO4A 3MESA 4EH8A 5ITAA 4DG3E 4FSNA 3H9FA 4MNEA 3SXRA 2UZDA 2E9NA 4MNFA 3WZDA 3H3CA 4KKEA 4USEA 2IW6A 3LQ8A 2C30A 3QCQA 3V5PA 5ANKA 2QOKA 5A4EA 1FQ1B 3F82A 3FQHA 4D2RA 3ZH8A 1YDTE 4FTLA 2FB8A 3IONA 3FYKX 4G9CA 4HVIA 3FLYA 2YHVA 4Y5HA 1MQBA 3LOKA 3GBZA 4TWOA 2WMSA 4O7RA 1YVJA 2RG6A 3ULIA 1FOTA 5DNRA 2XNNA 4MAOA 1MQ4A 4PTEA 4FV5A 4JBOA 3GC7A 1SMHA 3C0HA 5IQBA 5CLPA 3U4UA 3FMDA 3GC8A 4QMOA 3NUUA 4Q5EA 4EHEA 3PRFA 1OKYA 4BCMA 4UMRA 4FGBA 4Y83A 2I6LA 3ANRA 3MN3A 2Z7LA 3AD6A 4YTCA 4DE4A 5FDXA 1JWHA 2ZAZA 3EN6A 3MFRA 4FV1A 3HUCA 2HWPA 2UZEA 4W4XA 4MNEB 1WMKA 5E8VA 5A4TA 4FYOA 1H1RA 3DBDA 3EL7A 4IBMA 5IQAA 2XP2A 5GIPE 5HCYA 4A07A 4RWIA 4FGRA 3R30A 3PJCA 3VUDA 3UIXA 4ANBA 2PU8A 4C4IA 3VW6A 4ZSEA 4AF3A 1I44A 4C59A 3B2TA 4NIFB 3TN8A 3WYXA 3OW4A 3FSFA 4Y46A 4D55A 4FTUA 3CPCA 3AT4A 3GCPA 3GUBA 5AA9A 4AOJA 4GKIA 1O9UA 5CQWA 3GCVA 3OUNB 4FC0A 3KK8A 1FVRA 3QF9A 4FKOA 4S2ZA 2JLDA 5E8TA 4HZSA 4FK6A 2W0JA 3NIZA 2BRBA 1XH8A 5E8SA 4D2VA 4MEDA 1G8AA 2CKEA 4PP9A 3I5NA 3B8RA 3JXWA 3GOPA 2JKOA 3MA6A 4WRGA 4Z7GA 4ZTHA 4CZYB 3BYSA 2R3GA 1RW8A 4IM2A 3A8XA 4OTGA 3C7QA 5AR4A 2VTIA 5J9ZA 3R9DA 2VX0A 3TUDA 5B2MA 3F5GA 3V5JA 4BI0A 1U46A 4K33A 4KRCA 4F9BA 3D5UA 5AP4A 1DI9A 3SOCA 2BDJA 5DFPA 4RVTA 5JN2A 1UWHA 4WSQA 4PPCA 4DFYA 4O6LA 3PTGA 3DKGA 2UZVA 3GCQA 4EWHA 1Z9XA 3FEGA 4YJTA 4G3GA 4BWPA 3ZC6A 3LM5A 2CDZA 3SRVA 4G3FA 3VS1A 2UZTA 3O51A 5G6VA 3FXXA 3OF0A 4GL9A 3OEZA 2YLEA 2R3JA 3LPBA 4IVBA 3A7IA 5EI6A 3N4TA 2H9VA 3UNJA 5IQIA 3MH0A 5AX9A 2E2BA 1XBCA 3G0EA 3Q4UA 4FNXA 3CPBA 4FZ6A 5EDQA 5HCXA 3W32A 1M52A 1A06A 2B53A 3V6SA 1V1KA 2B9JA 3Q96A 4BDEA 3OROA 3W16A 4B0GA 3QQLA 4PDPA 2ZV2A 4CG8A 2OU7A 4AWIA 4DEAA 4F9CA 4G3EA 4OTFA 4U7ZA 4FNZA 1YDRE 3WZJA 5FLFA 4IJ9A 5A46A 5JZJA 3PP0A 5LCKA 4BI2A 4O7TA 4ORKA 3E64A 4RZVA 1APME 4I41A 3GCSA 4C4EA 2WTVA 3V6RA 3Q5IA 4GT4A 3V8TA 4BDAA 3W18A 3WYYA 2XNEA 3VHEA 2V62A 2C1BA 3QCYA 3ZEPA 5HU9A 4CGAA 2X39A 4IAKA 2WTKB 1LUFA 4QTCA 4E93A 1LR4A 1FGIA 3PZHA 4MTAA 5FTQA 4OTQA 3DOGA 5T68A 3TJCA 3R2YA 2X8IA 3HRBA 4RWLA 1YWRA 5BMMA 4O7LA 1YWVA 3DKFA 4PPBA 5BPYA 2YIWA 2XK8A 2J5EA 4E8AA 4IB1A 3ZMMA 3F6XA 4CMOA 2VWBA 3KEXA 1WBSA 4AOTA 5HTBA 3F2RA 2WMAA 5IQFA 4FSUA 4M69A 3M42A 3OW3A 3T3UA 2XIZA 3FKNA 3NAXA 4X6QC 4PL3A 2JD5A 2XKEA 4WUAA 3HAMA 3R00A 3FAAA 3MVHA 4FTKA 3RK5A 3NPCA 4NKSA 3ZOSA 2W4JA 4JIAA 2OJFE 3E8DA 5CQUA 2YABA 4TW9A 5HIDA 4O7SA 3FZOA 4FA2A 2YA9A 5CU2A 2YIQA 4A06A 2IZRA 3UP2A 3OOGA 4IANA 2XK7A 3MPAA 4HCUA 4TWPA 4YZCA 4R77A 5JGBA 2PZ5A 2WIHA 4CCBA 5D7VA 4XP0A 5HQ0A 4Y8DA 4ENYA 4ZJVA 4MCVA 2O5KA 3VUIA 3HDNA 3THBA 1OZ1A 1JSUA 2BMCA 3G2FA 3ODZX 2HW7A 1FMOE 4XV3A 4E26A 4W4WA 4F64A 3R22A 3C5IA 3V8WA 3NNWA 5A6NA 1R3CA 3A4OX 2A27A 5CEIA 2OIBA 4G16A 4IQ6A 3VQHA 3HV5A 3PXYA 3NIEA 2QHNA 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