3R7EA

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-1-67
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r7eA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r7eA01
3LXKA 2A2AA 4WG5A 3ZLSA 3PPZA 4ALUA 1SM2A 4FTAA 4CYIA 5ANJA 4ZZNA 5JGDA 1RDQE 4PWNA 5EG3A 3WF6A 4QYEA 2C6MA 1JSTA 2ETRA 4L53A 4NZWB 2QR7A 3FMJA 4QMPA 2ERZE 5AX9A 4BTKA 4D2PA 3KREA 2ZDTA 1P4FA 4YLKA 2VNYA 3QCSA 4S31A 3A2CA 2OG8A 4BIEA 1KUTA 4F09A 3MPAA 3EZVA 3TIYA 4EH8A 5EH0A 2YCRA 3E64A 5LARA 4FNXA 4ANBA 3MGYA 4IIRA 4R7BA 4G3FA 4F6SA 4QQTA 4I24A 5HI2A 3UVRA 3VO3A 3WF5A 2ZMCA 3E7OA 5HTCA 2YIXA 5CVFA 3RI1A 4CFNA 5L3AA 5M56A 4HGLA 3OC1A 3VIDA 3JVRA 4F6WA 4AGWA 4UXQA 4CFXA 2DWBA 1E1VA 4CEGA 3ODZX 1OZ1A 4XMOA 4JVGA 4BCGA 3QF9A 4YJRA 3CKWA 3LQ8A 1R3CA 3TNIA 3N9XA 4CNHA 4QP9A 2UZNA 4LOOA 3BHTA 3I79A 5DFPA 5IISA 2G2FA 3D2IA 3K5VA 3R2BA 3HUCA 3KRJA 3QFVA 5LMAA 2HXQA 4YHTA 3KRWA 3KMWA 3GC7A 4BCHA 5HEZA 3QU0A 5J7HA 2VTLA 1MQ4A 1CKIA 3WOWA 5EDRA 5JT2A 5JRQA 3OWPA 2I0VA 4UWCA 1Z9XA 5CSHA 3QKLA 2R3KA 4BDEA 4PL5A 3ZFXA 2YZLA 1ZYDA 4FL1A 4G31A 4UMPA 5BX0A 4E5AX 2QOHA 3FPQA 1FINA 5IEVA 5CALA 1VEBA 3PE1A 4O7WA 3A7GA 5FDPA 2YM4A 1OIQA 4G1WA 1OPLA 4JQ7A 2YIYA 4K0YA 1ZYJA 4MBLA 5ANDA 3ZRKA 4CLIA 3DFAA 3RAWA 3G15A 2UZEA 4J8NA 3GOPA 5AP6A 5AR8A 2R3RA 3ZLYA 3H30A 3W2CA 2FO0A 2IJMA 3VBQA 2W5HA 4YJOA 3VWAA 2UV2A 4MD8E 4YSMA 4C3FA 1PW2A 4D2WA 3DB6A 3OW4A 3QTSA 3GENA 3NUSA 3EH9A 3ORZA 3QQGA 4FC0A 4S34A 3G6HA 3PIXA 2GS6A 5CI7A 5AJQA 3UVPA 3EN7A 5DRDA 1BL7A 4QMSA 1PYXA 4IBMA 3QRJA 1XH9A 2R3LA 4C58A 4DEDA 4AZFA 4E8AA 5CNOA 4PP7A 4DFBA 4CTCA 3VBTA 2EB2A 4MHAA 3R8PA 4ALVA 3F88A 1IAJA 2R3QA 2C5XA 3A7FA 4MQ1A 3UOJA 2X6EA 3MW1A 2BMCA 4WUAA 2RFNA 5M51A 2JIVA 4W9XA 4EQMA 4B8MA 5IQDA 3I0OA 5LVPA 5B7VA 4FR4A 3A7IA 3QXPA 3OUNB 4G3CA 4R5YA 4UZDA 5IEYA 4EOMA 2IW6A 3QLGA 2EB3A 2JKKA 2BPMA 4XX9A 2XRUA 5A4QA 3ZH8A 3IGOA 5JFWA 4O0WA 5JN2A 4G6LA 2JDOA 3I60A 1WBTA 4M68A 1SVGA 1YVJA 5L2SA 2C5VA 4E6CA 4AT5A 3KU2A 2IVSA 3WIKA 5LMBA 3HRFA 4EOLA 4DITA 4EOKA 2OXDA 2XP2A 5FXQA 3U9NA 4APCA 4RBLA 4NH1A 1B38A 3LM0A 2QU6A 4PTCA 3KCFA 2NPQA 3HA6A 4EKLA 4RG0A 3IW7A 4HZSA 5CTPA 3UZPA 1PXIA 3BX5A 5BYZA 3VUKA 4DBNA 4LG4A 3C4FA 3UMXA 5HIEA 2NO3A 3R00A 4GKHA 2CGXA 2GNIA 4L7FA 5A54A 5DG5A 2CKQA 4BR3A 2PUIA 3KEXA 4JRVA 3FQHA 4GW8A 3GT8A 2W1FA 4A9TA 3LHJA 4KB8A 4QMZA 1W0XC 2UZVA 2OSCA 2XA4A 3IW4A 1ZMUA 5L2TA 4C34A 3PG3A 2YM6A 3SLSA 1K9AA 2H96A 3RPYA 1Q8WA 2BZJA 2YAKA 4WG3A 2W4KA 3E93A 3NUAA 3DBEA 3NSZA 4BTJA 2B9FA 3CP9A 3VUTA 4OUCA 5FP5A 4AW0A 1J1CA 2B9HA 4ZJVA 4AU8A 3SG9A 2R5TA 1H1RA 1OB3A 2C6OA 3EQHA 4O7TA 3Q2JA 1JSUA 4LGDA 5FTGA 3FDNA 3RPVA 5ANOA 1GIIA 3NNUA 3R02A 1CDKA 5KNJA 2PMOX 2F7EE 3WILA 3CSVA 4PY1A 4WBBB 5GZAA 2CNUA 1ZY4A 1GIHA 2XRWA 4FK3A 1QPEA 4JG6A 3LCSA 3TZMA 1F0QA 1H24A 2UZDA 3DKCA 5JMSA 1NT2A 4X6QC 3EMGA 4KIQA 3E62A 4GYIA 4YLJA 5ANIA 5BVKA 3RPSA 3PP0A 4HVGA 5EM7A 4GK2A 3BLHA 4G6OA 4H1MA 3TG1A 4KWPA 4YJPA 4HGTA 5FM3A 4DEGA 3UIUA 3OHTA 5ACKA 1U4DA 3C0IA 2DS1A 1WFCA 1P14A 1VJYA 3E8CA 2F49A 3R8ZA 4UEUA 2B54A 4DEHA 5HVYA 3WE8A 5F94A 3A7HA 3P86A 3RKBA 3HMMA 4UYAA 4GK4A 1MRYA 4FVPA 1H1WA 1YDTE 3O8PA 4IZ7A 3W2SA 1M7QA 3FXZA 2VWBA 3PWDA 5IA4A 3MB7A 3QQLA 1BL6A 4IB5A 4IDTA 4FTJA 4NW5A 2PUNA 2C0IA 3R28A 2JKQA 1RJBA 4WSYA 4BWXA 4B4LA 2ZM1A 4DG3E 3AC2A 4ZOGA 3V51A 4EL9A 4HYSA 4PDYA 5GJFA 4IFGA 2R7IA 2PMNX 2FSLX 4PPAA 3G33A 4AW1A 4YJUA 3AXWA 2PE0A 3GI3A 4RJ7A 2PULA 4TW9A 1LEWA 4L3LA 2YJRA 4RA5A 2X1NA 3NUXA 4G9CA 5AAEA 2HWOA 1OKVA 5D7VA 3H3CA 2W4JA 5I3RA 5KMJA 4YPDA 2R3NA 3DK7A 4YHFA 4RVMA 3EN5A 3R8MA 4C4GA 4FEQA 4BWPA 3R7OA 2Y6MA 3F3ZA 4YZCA 5A4TA 5H3QA 2PVJA 4E73A 4EI4A 4LL5A 3PIZA 4M13A 3NUYA 4XG2A 4DEEA 4WNMA 4GVAA 3BCEA 4ZY4A 4C38A 1U54A 5J9LA 3DAJA 4MYGA 5AP4A 2WTVA 2EXEA 3U54A 5K5XA 2C1BA 4EHVA 2WO6A 3O96A 1GZ8A 4GS6A 4N6ZA 3WZKA 4UMRA 2XEYA 2OZOA 5DRBA 4MBIA 1REKA 2QO7A 3COMA 4TTHB 5F4NA 3GVUA 3AC8A 4S33A 2XIKA 5BVOA 5HX6A 1BLXA 3F2RA 2XIYA 4Q2AA 5E8SA 3T3UA 4M12A 3T8OA 4HVIA 5HOAA 3RK5A 1APME 3FI2A 4CMUA 2YWVA 4IDVA 3E8NA 3GU7A 3KF4A 3RM6A 4O96A 4FVRA 3FI8A 4I6FA 4L3JA 2VTSA 4R7IA 2AC3A 4XG3A 1WVXA 5KZ0A 2OJ9A 3OG7A 1H27A 2W1EA 2YDJA 4UXLA 4ZY6A 3NYXA 3K3JA 4GIIA 3IS5A 4XLVA 3V5LA 5B2MA 4JLCA 3PVBA 3AC5A 4IZAA 3QALE 4ANLA 1JNKA 3TWJA 4YU2A 1W82A 3ZRMA 1BI7A 1Y8GA 4L9IA 4BRXA 4AXAA 3PJ8A 3LLAA 2QOIA 2W9ZB 4UMQA 1E1XA 2P55A 4X2KA 1J7IA 3V5TA 5DNRA 4NWMA 2YM5A 4M3QA 2R9SA 5EQYA 3RAKA 3WI6A 4PP9A 3PSCA 4LMNA 1PMVA 5JRSA 5A4CA 3AG9A 2X4ZA 2QLQA 5CT0A 3FMEA 4EJNA 4FG8A 2YACA 1SVEA 2W7XA 2J6MA 1V0PA 3E92A 3NAXA 4LFIA 2RFEA 3E8DA 4Z9LA 3ATSA 3KK8A 4KNBA 3Q4UA 4I6HA 2V7AA 1BKXA 2UW4A 3RK9A 4A06A 2QOQA 2KTYA 2ZB0A 4FTMA 3UO6A 4FIJA 3SXRA 3P79A 3DXPA 4EYJA 3R01A 4EHEA 5AFVA 4UYNA 2YN8A 5DWRA 2X2MA 3I0QA 4WT6A 2R3IA 2VGPA 4FKTA 1TQPA 3VS0A 3W2OA 3A8XA 5JSMA 5J7BA 1REJA 3N51A 4AZWA 4TWOA 4C59A 3FBVA 4KUJA 3MPTA 5M09A 3PVWA 3D7TB 4X3FC 2YCQA 3MIYA 5C9CA 2XBJA 3KA0A 4DGOA 1LR4A 3I1AA 4IFCA 3VQUA 4TWCA 2C5NA 2GS7A 4V05A 3VUHA 4ERWA 2PVMA 4FV2A 5CU4A 1Q41A 4ZTHA 5F1ZA 2VNWA 2ZYBA 4GT5A 4D0XA 5BVEA 2G15A 3R2YA 4M15A 3FMLA 4IB3A 3LCKA 3ZMMA 3HNGA 3F5PA 3RCDA 3ENMA 2PUUA 3O2MA 1FMKA 2FVDA 2GS2A 4RIOA 2IO6A 1EH4A 4L00A 4XJ0A 4O1PA 3LMHA 4I0TA 3UNZA 2XNEA 4FEUA 3FMKA 2BRBA 4DN5A 5M4UA 2QOOA 5L2WA 1J7UA 3MH3A 1ZOGA 5LWMA 4WHZA 2NNWB 5GIPE 3KCKA 3LW0A 1Q24A 5CVGA 1R0EA 4XP3A 2OIDA 2Z60A 4G5JA 1L3RE 3PJCA 5F20A 3Q60A 4WG4A 2QLUA 4IW0A 2XK8A 5KMKA 2BKKA 3EFWA 1KE6A 4G6NA 3ODYX 1ND4A 4A9SA 2O2UA 4JL9A 3BU3A 2UW0A 2AYPA 1JPAA 3DT1A 3MFTA 2WMBA 3PJ2A 5AV4A 1MP8A 4OTPA 3V8TA 3DK6A 5CZHA 1DI8A 4EOOA 3G2FA 2XIZA 2YIRA 2OIBA 3ERKA 3R63A 3RWPA 2B55A 2FB8A 2NRUA 2C1AA 2FSOX 4CFVA 3NZ0A 5AMNA 3UOLA 2VX1A 4DFZE 5L6PA 2WTIA 3JS2A 4E3CA 4NM7A 3GOKA 2E9UA 3Q4CA 1S9JA 3PXZA 4I93A 5EM8A 3HYHA 2XM9A 4Y8DA 5FBOA 4F63A 4ZJIA 1M2PA 4I6QA 4XRLA 4D2VA 5D7AA 5ETCA 5B2KA 5CEOA 3RNYA 3QLFA 5E8UA 4JDHA 4PX6A 4MAOA 4RA4A 4D1ZA 3QUEA 4H58A 4BBEA 5IUGA 4GJ2A 3FQEA 2XIXA 4W4VA 3EFKA 3BHUA 4IH8A 5DOSA 2CSNA 3LQ5A 2FA2A 2JDRA 4LRMA 3V8WA 2J51A 4NM5A 3U6JA 4DG0E 4PQNA 5CF8A 4QTEA 2WEIA 2WELA 3FKNA 4OTRA 3SHEA 2IWIA 4BZNA 2RL5A 2UW7A 4U97A 4GT3A 1YXUA 4FT5A 3DK3A 3FZOA 1PF8A 2I7QA 2C6DA 4QRCA 1PMUA 3BHVA 4ZMFA 4WNPA 3CLYA 3DXNA 5E1EA 3C4WA 4ZLOA 4FSMA 4HGSA 3VQHA 2P33A 3RAIA 5BUJA 3FMHA 3ULZA 2J0JA 4M8TA 3QYZA 4RX5A 1P4OA 4BKYA 4NJ3A 4LGHA 1M17A 4FKQA 4LUDA 4XOYA 4I0RA 3IW5A 4YNEA 4PMPA 2PZRA 1GY3A 1G8AA 4JR7A 4CFWA 2O8YA 5EW3A 5D12A 3EB0A 3QGYA 4QYHA 5EDQA 4MNEB 4TRLA 3WZEA 4R77A 5DH3A 2C0OA 4BL1A 5E8VA 1OIYA 4CZTA 5JK3A 1DI9A 5JFVA 4EOIA 4IE9A 4O21A 4U79A 3BHYA 3VBXA 3U51A 3FAAA 4D55A 3GC0A 3LOKA 5FD2A 2PZYA 4O7NA 4K18A 3ORXA 3TNHA 4HVSA 3R30A 5FLFA 3Q53A 4ACHA 3F3VA 1JLUE 2IN6A 3AMAA 3NW5A 4FOCA 4MWHA 1H28A 4RSSA 4HVDA 5IQFA 3TTJA 2XH5A 4BCOA 5C8MA 3PE2A 2G2IA 3D5UA 2WMQA 3P7CA 5DBXA 3HRBA 1JQHA 2PMIA 2WTCA 3L9LA 2ZAZA 2VRXA 4LV8A 3IDBA 3U6IA 3OWLA 1ZZ2A 1IR3A 3PG1A 4EH6A 4O7LA 3DQWA 2W99B 4RLLA 4RJ6A 4C8BA 2XKDA 4N0SA 2JFLA 3AGMA 4YZMA 1JVPP 4A9YA 4BZDA 4FF8A 3QKMA 4ASXA 4AOIA 2QHMA 3T9TA 3BWJA 4C62A 4DA5A 5C27A 4AUAA 4R3CA 4FICA 2JC6A 2ACXA 3R6XA 5J5SA 1P5EA 4ASEA 2QKRA 3I7CA 2E9VA 3AD6A 4HZRA 5HNGA 5FWKK 4DEAA 4G5PA 2C6IA 4AQCA 4ZS4A 3OXZA 4NK9A 1ZY5A 3JY0A 3FJQE 4YMJA 4O84A 4NFNA 4USDA 2I0EA 2JIIA 1ZMWA 3E87A 4NCTA 3VC4A 3JR1A 4QP4A 4XV3A 1ZZLA 3W33A 4O2ZA 3MH0A 3CQWA 2PZPA 3TCPA 4HPUE 4EOPA 4QMMA 2R64A 4F9AA 1IG1A 4FTRA 2CGWA 3ZZEA 3PSDA 1DS5A 2ETMA 2EUFB 3CCNA 5DVRA 2WQOA 5E8XA 4QMYA 1K2PA 2OWBA 1GIJA 3DJ5A 1MRVA 3W2PA 2WZJA 2BRMA 4DTAA 2F57A 3LJ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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