4QYFA

Chk1 kinase domain in complex with aminopyrazine compound 13
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
278
structure length
269
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of the 1,7-diazacarbazole class of inhibitors of checkpoint kinase 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 82
structure length 269
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qyfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4qyfA01
2X9FA 3BPRA 2J9MA 3Q9ZA 4HYSA 4FSTA 3N4VA 1Q99A 2O8YA 3N4UA 2R3OA 5A4EA 3QTRA 4TNBA 1OB3A 4JVGA 2BRHA 3D4QA 4O7VA 5EYDA 3E8DA 4JX7A 5D7VA 2FSOX 3BKBA 3LXLA 4KKHA 3KEXA 4BBMA 1UVRA 4YTHA 1H27A 3ENMA 2WU7A 3GFEA 3IDBA 2W99B 3QX4A 4YHTA 1ZZ2A 4L01A 1ERKA 1UU7A 3R28A 3V04A 3RCDA 4V01A 2OH0E 5LMAA 2BAKA 5CU6A 4I5CA 2WQMA 5EM8A 1APME 4ZZNA 5JZJA 5A4QA 1AGWA 3BRBA 4QYGA 5KKRC 4FX3A 4FIEA 5CU4A 3FI3A 2PK9A 3AG9A 2FVDA 2WTKB 2VWWA 4OTHA 4HVDA 4DH5A 3TG1A 5FLFA 3DOGA 3T3VA 2E2BA 3Q9YA 2VD5A 5H8GA 5HBJA 4QMLA 3RAHA 4D0WA 4TTHB 1W0XC 3NW5A 3KMWA 1T45A 2QHNA 2WOTA 3TWJA 3VUKA 5CVGA 4EZ3A 3H4JA 5C8MA 1Q3WA 4G6OA 5M4FA 4J8MA 5A54A 2ONLC 3L8SA 5FEEA 2XNNA 4E7WA 2BRMA 2IZTA 4FZ6A 3AT2A 4XYFA 2C5OA 2PY3A 3Q2MA 2C47A 3LFAA 3C51A 2WNTA 1XH4A 3RHKA 3B2TA 3ENHA 1UNLA 2QI8A 3PRIA 4M67A 1GZNA 2VTOA 2OJFE 4UMQA 5DOSA 3SXRA 4F6UA 4I6FA 4H3QA 3KXNA 2EB3A 4ANSA 4DG3E 4DBNA 4F0GA 4DE4A 2UVXA 4FKWA 2YEXA 2BDFA 3LCTA 3WYXA 2OI4X 4GH2A 3KREA 3VO3A 4TYIA 4F9CA 2X4ZA 3VBVA 5LCJA 4BHNA 4Z55A 3MFTA 3LJ2A 4JBOA 1PF8A 4U6RA 3KCFA 1YDRE 4FI1A 5HESA 4QPMA 4LOPA 4KIKB 4JIKA 3EFJA 1PKGA 4H36A 3MPAA 4ZTSA 4F7JA 4J71A 4TYGA 1BL6A 2C5YA 3P1AA 3WOWA 4LUDA 5CNOA 5E1EA 2E9OA 4O0TA 3ROYA 3V8SA 5CEKA 3U4WA 4QYFA 5DT0A 2CN8A 4X7QA 3Q60A 1YHWA 3RK5A 4GG5A 5HX6A 2P2HA 4KRCA 2UZWE 2YJRA 5AX3A 3G0FA 4PTGA 4QYYA 2J5FA 3EQGA 2UV2A 4IADA 1YRPA 2C1BA 4O21A 4O91A 4AT3A 5BQ0A 4MTAA 1PXKA 3JUHA 3S2PA 1CKIA 4DGLC 3A7JA 4YZDA 2P2IA 4YHFA 5ANDA 1WBWA 4APCA 4IJPA 2C5NA 3VS7A 3ATTA 2NPQA 3PPJA 5KKRB 3BIZA 4CG8A 1P5EA 2QURA 2JAVA 1KE8A 2CKEA 1BX6A 3NYOA 3NYVA 4RT7A 3PWDA 4ASXA 2XKCA 1IA8A 2VWBA 3A7HA 4R3PA 1OIUA 5DEWA 1CKJA 5J1VA 3D5WA 2XIXA 3O0GA 4FL1A 4I5MA 5E8VA 5CANA 4HYUA 3NX8A 5EYMA 5KMLA 3QBNA 4YBJA 4TYHA 3W2QA 4O7WA 3RWQA 5B7VA 2W4OA 3QRUA 5AR3A 1X8BA 4HZRA 4EOIA 3KULA 4BWKA 4FYOA 2C3KA 3UO5A 5K9IA 4IX4A 5DGZA 2QNJA 2Z02A 2EXEA 3BGPA 3D2KA 3S3IA 3BV3A 5JGBA 4Q9SA 3LM0A 1O6YA 5HTCA 2XJ0A 1R39A 2JDOA 4MX9A 5I3RA 4YR8A 3QXOA 5I9UA 4YZCA 3A62A 4ZS0A 5CU2A 3GFWA 4LRKA 5AV2A 5B2LA 2VZ6A 3DTCA 4U9AA 4EH9A 3M11A 4IWOA 4R7HA 5HU3A 1OPLA 3O7LD 4AWIA 1ZRZA 3ZLWA 5TE0A 4BKJA 2OIDA 2X4FA 4F09A 4CTCA 3IECA 2B52A 4I23A 3QYZA 5DHJA 4W4WA 4AT5A 3DJ5A 2YM8A 2PUUA 3ZRKA 3EKKA 4MWIA 3DNEA 1PXNA 5AP7A 5B0XA 2XRUA 4I92A 3UIMA 3ZFMA 2B9FA 1JWHA 4FKIA 4JT3A 3C0GA 2YDKA 3HV7A 4MH7A 3TZ8A 1M14A 2RGPA 2A4LA 5K3YA 2JFMA 4OBOA 4E5WA 2ACXA 4IEBA 2P0CA 3HMIA 4PDPA 3KGAA 4WHZA 2QLQA 2OGVA 2GNJA 4MD8E 4WBOA 4CV8A 2HENA 4QQCA 4XG2A 4CFVA 2WMAA 2IN6A 4R8QA 2C6EA 4I24A 3LZBA 3PXKA 4FKQA 4PMSA 5CEQA 4C2VA 4O1OA 4YC6A 5BUIA 3LMIA 5CU3A 3E5AA 4O0SA 5HE3A 4Z16A 4GS6A 5K4IA 4IDVA 4QP2A 4TT7A 3KF7A 3MVHA 3IG7A 5CVHA 4CRLA 5GZ8A 1Q8UA 3VUGA 5F9EA 1O9UA 4ENXA 4G31A 4RX7A 1VR2A 3MFUA 3RJCA 3KK9A 2EU9A 4IAKA 5ANIA 2B55A 3JS2A 3EQHA 4CLIA 5KHWA 4O7LA 4XMOA 5EDQA 3T8OA 4C37A 2VX1A 4FIFA 4F65A 3PSCA 1QPCA 5FDPA 4D9TA 4D2TA 4IZYA 4Y5QA 3WE4A 3EIDA 4A07A 3GU4A 2QKRA 5EOBA 4PPAA 4E20A 3I7BA 3MY5A 3R00A 4RGJA 4EJNA 5TOZA 3NW6A 4IWPA 5CSVA 4C0TA 5T68A 4C59A 4LRJA 3FYKX 2OF4A 4M0YA 4ARKA 5BUJA 4D2RA 2UZBA 4BN1A 2VWIA 2WQNA 3MA3A 3NR9A 3UYTA 3ZO1A 5KZIA 2UW8A 4FSRA 3G90X 4ZLOA 1IEPA 2PU8A 1DAYA 4CXAA 4Q5HA 3C0HA 1OL6A 3V5JA 3EQRA 4YJQA 2J51A 3K2LA 3E7OA 1W98A 4PV0A 3UE4A 1QCFA 1PMNA 4D1XA 4D4VA 2ITOA 3C4FA 4YMJA 2R3FA 3CD3A 4FV8A 3UOHA 5L6WL 1V0OA 3I81A 5C1QB 3Q2JA 3ZFYA 3V3VA 1K9AA 4ID7A 4E4MA 4FEQA 3I79A 3MVJA 2V7OA 2KULA 2VWYA 3KL8A 4IM2A 2OJ9A 5ETFA 4ZY4A 4QQJA 2OZOA 4RZWA 4QP1A 4UZHA 4ZTQA 3FAAA 5CX9A 4C3PA 5JSMA 3TI1A 3D83A 4OBPA 3DXQA 1P14A 3WZUA 4MXXA 3LCDA 2GDOA 1AQ1A 2NNWB 2C6TA 3GCSA 3OT3A 4IQ6A 5I9VA 2OJGA 3P7BA 4O38A 4NZWB 2XP2A 4NIFB 2YZAA 4X6QC 5HI2A 4HZSA 4CT2A 5HE2A 4O7YA 4C58A 4BFMA 3R9RA 3A2CA 3TT0A 5HIBA 2VAGA 2AUHA 4I1ZA 3VWAA 1OUYA 3RMFA 4O96A 3PLSA 4BGHA 3OCBA 3ZRMA 3MY0A 1H08A 4U79A 4QTCA 2X7GA 4Q5EA 4S32A 1PYXA 4U40A 1UKIA 3TJCA 1ZMUA 3DTWA 2GPHA 4M14A 4JG6A 1NVQA 4IMYA 4KSQA 4ASEA 5AUUA 5HU9A 1JKSA 2WELA 5CASA 3R9NA 4OAVB 3JPVA 1TQPA 2JLDA 4KS7A 3Q4UA 2GQGA 2CGVA 1HCLA 3E88A 3EMGA 3NAXA 3O8TA 3DJ6A 3LOKA 4PP7A 4FKSA 3SW4A 3I6UA 5H8EA 2ITTA 4AX8A 3BU6A 5JEBA 3T9TA 3U55A 3BHHA 3VS2A 5CQUA 3FY2A 5A6OA 4FBXA 3RGFA 4YJVA 4NL0A 4MF0A 5C8NA 4NW5A 4I0SA 3E3PA 4BCOA 4AZEA 2YLFA 4CYIA 4F9BA 4D1ZA 4N70A 4C57A 5KCVA 2JDVA 1OIYA 4F63A 4F7SA 3ANQA 3EL7A 5H3QA 5A46A 5CXZA 3MDYA 4BDDA 1H07A 1YHSA 2ZYBA 3QA8A 1LUFA 2OU7A 4OTIA 4MKCA 3VHEA 4E4XA 3ZC6A 1FMOE 2ITNA 3IW8A 5K4JA 4FNZA 3REPA 3EFWA 4AW5A 5DE2A 4K18A 3V5LA 3AC5A 4RA4A 3TV6A 3PVWA 4BDJA 5ACBC 4CLJA 2PUPA 2WMQA 5FWKK 3DCVA 3O23A 2BKZA 4C33A 5JT2A 4C2WA 4FTCA 4FSNA 5E91A 1Q62A 2BZKB 1MQ4A 5AV0A 4ZY5A 3QGWA 5J9YA 3OG7A 5JRQA 2X6DA 5LQFA 5CSWA 3JVRA 4FV5A 3A8WA 3QTUA 4AP7A 3L9LA 1OBGA 3AOXA 1DS5A 4CFXA 5ANJA 3QA0A 3ORPA 5EM5A 3SW7A 4DEBA 3PWYA 4EKKA 3QC9A 2GNGA 3AT3A 4WNPA 3AGMA 3UMXA 1UKHA 2R3HA 4IM0A 1OKVA 4R7BA 3HDNA 2ITWA 2BZIB 2XK9A 3VS4A 2F7XE 4AS0A 2AYPA 3QD2B 4FODA 4YU2A 4BCJA 5EQYA 4O2PA 3UNJA 4FC0A 2FSLX 4CZUA 4DC2A 4PL3A 1I09A 2VTJA 3UPZA 3KXZA 4BTMA 3TNQB 1AD5A 4L8MA 1FINA 4ERKA 1GZ8A 3HDMA 2OG8A 3G51A 3LM5A 5DRDA 4TXCA 4AZVA 3VVHA 3IW6A 3SGCA 1R0PA 1JSTA 3QALE 4UALA 1Z9XA 5FP6A 3UG2A 2J90A 4FTTA 5AM7A 2OIQA 4LOQA 3ZLSA 3CBLA 3PZEA 1U4DA 3EQCA 2YWVA 5IEVA 3OWJA 4PRJA 1OITA 4CGAA 3OBGA 1Y6BA 4YZNA 4FYNA 4QPSA 3GC0A 1YI6A 3QRKA 3W16A 3QUDA 5LWNA 2IW9A 5H8BA 5HGIA 2FSTX 2YIYA 3BQRA 1LEWA 3MW1A 3HP2A 5EW3A 5IUHA 2CGWA 5KE0A 4QP9A 3K3IA 1J1CA 1OL5A 2ZV8A 5HBEA 1WCCA 3AMBA 5IQFA 4FUXA 4IX6A 3RZBA 3H10A 1H4LA 2YCQA 1F0QA 1P4OA 3MPTA 2GHGA 4P5ZA 3WZDA 5IH4A 4DBXA 3GXLA 2WMTA 3UOKA 4EH5A 1QPEA 5EFQA 5C8KA 1Z57A 4B99A 3AD4A 3P23A 2ITZA 3R0TA 3MH1A 4U80A 2ZV9A 4FKRA 1XH5A 2QOIA 3VUIA 3QQUA 3QCSA 4B4LA 4GRBA 4R1YA 2VX0A 3RK7A 4QMXA 5FBNC 3F3WA 3NYXA 3F82A 2PE0A 4PMMA 4MQ2A 5AR8A 2GU8A 3FI2A 3VUTA 3P5KA 3MIAA 4TWPA 1ZMWA 3IKAA 4K33A 2RG5A 2VRXA 4CRSA 3UOJA 5BYLA 5E8XA 3FLQA 3ZS5A 5CAQA 3KVWA 1ZYDA 4IAIA 3FZOA 4BY9E 4EWQA 1O6LA 4OR5A 5ETIA 3PXZA 2HY0A 3AQVA 3GC8A 4UWBA 1PXJA 2BZJA 3AD5A 3C4ZA 4I6HA 4YJRA 4ZJIA 2FA2A 3MH0A 4FTLA 3VHKA 5HLNA 4JIAA 4XOYA 3L8VA 3LIJA 3VS5A 1URWA 4DGNA 2BAJA 4AGCA 2FH9A 3UVPA 5BNJA 4GU6A 2A0CX 5E9EA 2ZDTA 3BYSA 1B6CB 2JGZA 2WEIA 4I4EA 3A4PA 2V22A 4DG0E 1XJDA 3FI4A 3T9IA 3DU8A 4M69B 3LJ1A 1RJBA 2XK3A 1ZAOA 2ZMDA 3BYMA 4J8NA 5AA8A 5K0XA 1HCKA 1BLXA 4WKQA 5EHLA 4K77A 4FNYA 5K5XA 5LMBA 3VNTA 2YHVA 3QCQA 4G34A 5ANOA 2XNOA 4EK8A 3DS6A 3DZOA 1VJYA 2BIYA 1H01A 5AUXA 4R6VA 3F3ZA 2X1NA 3CR0A 3RWPA 3G5DA 4L00A 4F4PA 1ZYCA 4R3CA 1R78A 5L6PA 3DGKA 3R21A 3FKOA 4XX9A 3SG9A 2R7BA 3CE3A 1YDSE 2G2HA 3DKFA 4UWYA 2OXXA 2WMVA 4JAJA 4XP3A 3R7OA 3R9OA 3UOLA 3VBWA 5GIPE 4RVKA 2PUNA 3UG1A 4ANQA 1XBAA 3TM0A 4BCHA 1A48A 4KIOA 2JKOA 4F1MA 3U51A 3D7TB 3RPSA 3QGYA 3TJDA 4AF3A 3PVUA 4GK4A 1DM2A 4D58A 1BL7A 4FZFB 4DLIA 4EHEA 3UMWA 3G6HA 4S31A 1GZOA 5CAPA 2CMWA 3F7WA 3BQCA 3ODYX 2GQSA 2QO2A 4U7ZA 4LQMA 4RJ8A 3O96A 3HRFA 3WF5A 3TDWA 3FSFA 3QAME 4B9DA 2YDIA 2YM4A 4EOMA 5HEZA 3WF6A 2Y4IC 2YM7A 5FM3A 3ZXZA 4ALWA 4O84A 2YIQA 3VW8A 3TNPC 2UZLA 1PMUA 2PUIA 3KVXA 3R8PA 3FZPA 4KINA 5FP5A 3QFVA 3FMNA 4HPUE 3U87A 1M17A 5AADA 5F20A 4DF3A 2CCIA 3A99A 4NKAA 3KXMA 4OTPA 4K9YA 2HZNA 1GY3A 1L3RE 4BGQA 3A8XA 5BX0A 3VIDA 4ZMEA 2QODA 4PMTA 4QP8A 4BDBA 1JPAA 4L52A 4WUAA 5EI2A 4LL5A 5A6NA 5I9YA 1L8TA 3DB8A 4DFYA 3QQLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2X9F A;  3BPR A;  2J9M A;  3Q9Z A;  4HYS A;  4FST A;  3N4V A;  1Q99 A;  2O8Y A;  3N4U A;  2R3O A;  5A4E A;  3QTR A;  4TNB A;  1OB3 A;  4JVG A;  2BRH A;  3D4Q A;  4O7V A;  5EYD A;  3E8D A;  4JX7 A;  5D7V A;  2FSO X;  3BKB A;  3LXL A;  4KKH A;  3KEX A;  4BBM A;  1UVR A;  4YTH A;  1H27 A;  3ENM A;  2WU7 A;  3GFE A;  3IDB A;  2W99 B;  3QX4 A;  4YHT A;  1ZZ2 A;  4L01 A;  1ERK A;  1UU7 A;  3R28 A;  3V04 A;  3RCD A;  4O4E A;  4V01 A;  2OH0 E;  5LMA A;  2BAK A;  5CU6 A;  4I5C A;  2WQM A;  5EM8 A;  1APM E;  4ZZN A;  5JZJ A;  5A4Q A;  1AGW A;  3BRB A;  4QYG A;  5KKR C;  4FX3 A;  4FIE A;  5CU4 A;  3FI3 A;  2PK9 A;  3AG9 A;  2FVD A;  2WTK B;  2VWW A;  4OTH A;  4O4F A;  4HVD A;  4DH5 A;  3TG1 A;  5FLF A;  3DOG A;  3T3V A;  2E2B A;  3Q9Y A;  2VD5 A;  5H8G A;  5HBJ A;  4QML A;  3RAH A;  4D0W A;  4TTH B;  1W0X C;  3NW5 A;  3KMW A;  1T45 A;  2QHN A;  2WOT A;  3TWJ A;  3VUK A;  5CVG A;  4EZ3 A;  3H4J A;  5C8M A;  1Q3W A;  4G6O A;  5M4F A;  4J8M A;  5A54 A;  2ONL C;  3L8S A;  5FEE A;  2XNN A;  4E7W A;  2BRM A; 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