1Q8ZA

The apoenzyme structure of the yeast sr protein kinase, sky1p
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
363
structure length
354
Chain Sequence
GYHPAFKGEPYKDARYILVRKLGWGHFSTVWLAKDMVNNTHVAMKIVRGDKVYTEAAEDEIKLLQRVNDADNTKEDSMGANHILKLLDHFNHKGPNGVHVVMVFEVLGENLLALIKKYEHRGIPLIYVKQISKQLLLGLDYMHRRCGIIHTDIKPENVLMEIVDSPENLIQIKIADLGNACWYDEHYTNSIQTREYRSPEVLLGAPWGCGADIWSTACLIFELITGDFLFETKDDDHIAQIIELLGELPSYLLRNGKYTRTFFNSLLRNISKLKFWPLEDVLTEKYKFSKDEAKEISDFLSPMLQLDPRKRADAGGLVNHPWLKDTLGMEEIRVPDRELYGSGSDIPGWFEEVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleotide-Induced Conformational Changes in the Saccharomyces cerevisiae SR Protein Kinase, Sky1p, Revealed by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords SR Protein Kinase
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 106
structure length 354
sequence length 363
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-08-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1q8zA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1q8zA01
2YLEA 2VN9A 4QT1A 5HTIA 3BE9A 2GQSA 2A1AB 4D9UA 4NTTA 5BVFA 2C6OA 2BRGA 2YAAA 4M14A 4NKSA 4C35A 5CALA 3R63A 3PY3A 1XH4A 1Y6BA 2HZ4A 4YGAA 1ATPE 3DBCA 4HJOA 5FXQA 5CYIA 1J1BA 3PPKA 2PK9A 5DT0A 4J95A 3RBWA 3ZC5A 3FSFA 2IWIA 3OZ6A 4KKGA 3F3TA 3RNYA 4JIKA 3MFRA 4FV7A 3OW4A 5LMAA 4HVIA 5DE2A 3WI6A 3PJ1A 4JNWA 2GNIA 4XP0A 3P7AA 3BU6A 4DTKA 1WZYA 2RG5A 2C5OA 2VTMA 2C0OA 4F1MA 4FTJA 4QP3A 3CGOA 3DAKA 3VS4A 1KOAA 1S9IA 2PPQA 4Z7GA 2XJ2A 3BYVA 2PTKA 1LUFA 3WZDA 4DG3E 1JBPE 3D0EA 4G2FA 3BEAA 4ZZMA 5HLNA 3E7VA 3WILA 4E1ZA 2W1EA 5AR3A 3LAUA 4C4HA 5J1WA 1G8AA 3UG2A 3LVPA 2HYYA 3MTFA 4USEA 3QLGA 1P2AA 2ITPA 4DCAA 4APCA 1Q3DA 2W06A 2RL5A 5EI2A 3P78A 4FF8A 2WQNA 4TKSA 2R3GA 4GU9A 1NW1A 4MXAA 4PPCA 4IM0A 2OZAB 1ZOHA 3EQIA 4IX6A 4YTFA 4DH5A 2OI4X 2C69A 3DDPA 5F20A 2J0LA 3ERKA 2B9FA 4Q9ZA 1P14A 5KHXA 3TJCA 4L8MA 4BTJA 4M68A 4RQKA 3MPMA 4D1XA 3OCSA 5L4QA 3CBLA 5JT2A 2W96B 3BHHA 4XMOA 5KE0A 3GOPA 4RFYA 5FXSA 4ZJJA 3ORPA 3R2BA 1CDKA 3FMJA 3A99A 4ALUA 1YOMA 4GRBA 3UOLA 4F6WA 1PHKA 3T9IA 4HYIA 3WF6A 4CFWA 3UQGA 2PSQA 1FOTA 4NIFA 5HGIA 4CLIA 3S95A 2C68A 3KULA 2JIVA 4YC8A 3TZMA 3A8XA 3GXLA 4FSMA 1W98A 4KIQA 4Q9SA 3RHXA 4QQCA 3AMBA 3DXPA 4DEHA 4MCVA 3VBYA 2AYPA 3ET7A 3TUCA 4JR3A 3SRVB 5LMKA 5IQFA 3PP0A 5FBOA 4FZAB 3CR0A 2R64A 4QRCA 4XOYA 3QTIA 5FDPA 5GIOE 4XLIA 2A4LA 4MWHA 5HE0A 5EQEA 5K4IA 2HZIA 2XRWA 3TXOA 2PVJA 3OVVA 4FG8A 4W8DA 4JBVA 1U59A 5JMSA 1BX6A 3F7ZA 4FT7A 5I9WA 4NZWB 4X7QA 3HMIA 3SOAA 5DRBA 5C9CA 3OUKA 3QTQA 4RQVA 1ZARA 3CSVA 4CG8A 1H01A 4FOCA 1ZAOA 2VWYA 3OD6X 4XNEA 5C1QB 4Q5HA 4FT9A 3C0IA 3CD8A 4OUCA 1W8CA 2G2FA 1O6KA 4OW8A 3C13A 2Y8OA 2PMNX 2RGPA 2YIRA 4JBOA 4PL3A 5K5XA 4LFIA 3QRIA 4KKHA 4MX9A 4O0WA 2IO6A 3TWJA 5IQHA 3UOJA 4AW2A 1OKYA 4UALA 3LOKA 4WD5A 2GS7A 5I9ZA 2FGIA 2JKOA 4GL9A 3PG1A 4BYJA 1XH5A 4EYMA 3OY1A 2VRXA 3ZO2A 1TQPA 5IH5A 4M3QA 4G6OA 4U3ZA 4BKYA 4OT6A 5TF9A 4JDJA 4PRJA 2YM5A 3OOGA 3FZPA 4G9RA 5M4IA 4DINA 3QUPA 4MXCA 4NJ3A 1MRUA 3F61A 5DPVA 1W82A 4XOZA 2W05A 4FKLA 4QMWA 4RIWA 1YXXA 5ITAA 4O83A 4DE4A 3WIKA 3PXFA 2WEIA 5KHWA 4F63A 3HUCA 1RW8A 3TACA 5LVPA 2HWPA 2PE1A 5ANDA 4YLLA 3ZO3A 4X2GA 5FDXA 3GCQA 2YCRA 4L46A 3MY1A 3BYUA 4RFZA 4FSRA 5AR8A 3UYTA 4O0YA 5AP7A 4J8NA 4RVTA 5JH6A 1F0QA 4KA3A 4YLKA 4IAIA 3DJ6A 3NDMA 3QWKA 4K6ZA 3SC1A 4J53A 2X6DA 4BZNA 5LCKA 4NM7A 4EEVA 5HE1A 2NNWB 2ITQA 4PP9A 3FMMA 4R5SA 2CNUA 4C38A 3MGYA 3VO3A 4QTCA 4YJNA 5HBEA 1QPJA 4TYGA 4I6QA 2PVLA 3AC4A 1OL1A 3VF9A 1NT2A 2OH0E 1CSNA 5CT7A 3AC2A 5E91A 3GCVA 3A2CA 4YC6A 4F9YA 4DF3A 3BHVA 3S4QA 4FNYA 4OBOA 3U9NA 4IANA 3FXZA 3RPOA 2PVYA 3GCUA 1WAKA 5LWNA 4MD9E 3HDMA 2W9ZB 4RZVA 3ZUUA 4LI5A 3OWJA 4HNIA 3FMKA 4KS7A 4RG0A 5CAVA 4K9YA 4LRMA 2C0TA 4C0TA 4P5QA 3TUDA 3V01A 2KULA 3MSSA 3VS7A 4AOTA 4HYHA 3IW6A 2GNJA 3RWPA 3P4KA 3JY9A 4PQNA 2ZV9A 3VS5A 3ZH8A 3GBZA 3JYAA 3LCDA 3ZFYA 4ASDA 5AR5A 4GK3A 2QR8A 2OG8A 4GV1A 4IVBA 3ENHA 4EH6A 1QMZA 4IX3A 1IRKA 4FG9A 3UNKA 4QTEA 1FGKA 3C0HA 3R04A 2BILB 4KINA 3MFSA 5AX3A 3VUHA 5CENA 4L52A 1Y6AA 5HICA 3EZRA 3EQGA 5C8KA 5HCXA 4BCHA 3K5VA 4GYIA 4EC9A 3U8WA 3FQEA 4D4YA 4M7IA 4QMOA 5GZ8A 1J1CA 1H24A 4RBLA 5E8SA 3UIMA 3FQSA 3NUNA 5CEIA 2OW3A 4E8AA 2VTJA 3ZM4A 3EN9A 4YSJA 4RIXA 5EW9A 4FGRA 3LQ3A 4V0GB 3CTQA 2ONLC 3SXSA 4EBVA 2VTPA 5H8BA 3DBQA 4R77A 3IDCA 2OH4A 5DBXA 4CFMA 5EYDA 3FZRA 4A07A 4O82A 2CGXA 2R3FA 4TL0A 3C7QA 4IVCA 2Y0AA 4J96A 5D1JA 4M13A 2W99B 5AM7A 3BV2A 3TL8A 2WMBA 3IGOA 4MXOA 3IS5A 4G3FA 4ZSJA 4O7SA 3ZFMA 3ZO4A 5CSWA 2C6TA 5HIEA 1NY3A 1U5RA 3RMFA 5KBRA 4AG8A 4CSVA 1ZMVA 3BBTB 1IASA 3GP0A 4JDHA 4YO6A 2YIYA 2BAKA 3OWKA 4MF1A 2RFDA 4F7JA 2WMXA 1PXPA 4AW0A 2YCSA 5HVYA 4M12A 3CC6A 3REPA 3UVQA 3NW7A 2BRHA 3A8WA 1J7UA 2W5HA 4OLIA 4QYEA 4B7TA 5CF4A 4IB1A 4R3CA 2PVHA 1ZYJA 2C3KA 2QODA 4G6LA 1GIJA 2QU6A 2YAKA 1RQQA 2ERZE 4N4SA 2OFVA 3KC3A 5EKNA 3GEQA 4EJ7A 5IPJA 2NRYA 4DFZE 4HZRA 4QMZA 4BHZA 2WMQA 4ASXA 3ATTA 3QTUA 2R3MA 5L2IA 4IAFA 4U43A 1ZYSA 4QP2A 4ANNA 3G9NA 4C4IA 2VX0A 5HG9A 4HVDA 2XYNA 1OI9A 3OC1A 4O86A 1H4LA 3II5A 5CU4A 4Y46A 1PW2A 3OS3A 1GZNA 4KBKA 5EW3A 2I6LA 2JAMA 3ATSA 4X6RA 2Z60A 3L9NA 4O0SA 3N4VA 3LW0A 3DTWA 4JG6A 3OY3A 3C4EA 4YZBA 2OF4A 3H30A 3ZEPA 3V5QA 2OJFE 4E5WA 4PP7A 4MHAA 4PMTA 4ANQA 3QTWA 5E90A 4GG7A 3QX2A 2OIQA 2GHGA 5AV1A 3T8OA 3H0ZA 3RAIA 3DBDA 2QHNA 4WG4A 3W2CA 3GUBA 1KWPA 1M2QA 2GFSA 1BI8A 2JKMA 2R0UA 4FZ6A 2QR7A 3GU8A 3DXQA 2V22A 4BB4A 4ZJVA 2HY81 2ITNA 2UZEA 3IGGA 5C01A 2J0IA 2XCHA 4IAYA 3UIUA 4DFXE 3KULB 5HO6A 3DY7A 4ZTQA 4DTAA 1YHWA 3DT1A 4DGNA 3OWPA 4EWHA 3AMYA 1OZ1A 2QONA 2Y4IB 3FI8A 3OTUA 4EJNA 3UNZA 1HCLA 3UE4A 3F82A 4TW9A 5LOHA 4DH3A 2YABA 1BYGA 2VUWA 4GCJA 3PPJA 4X3FC 3ITZA 3R9HA 5B7VA 4I5HA 3Q6WA 1H26A 4K11A 3N4TA 4CG9A 4FVRA 2HZ0A 5CXHA 4OTWA 4ZJIA 4DFNA 2VNYA 2YHVA 4G3CA 4AW5A 4U41A 4E4NA 4FBXA 2J5FA 5JN2A 4C57A 4IDVA 1PF8A 4PNIA 1XH8A 4XYFA 4XBUA 3Q96A 4AGDA 4O7YA 5AV0A 4CTBA 3A7JA 5JRSA 2UW6A 1REJA 4LOQA 3TI1A 2CJMA 3KMWA 4JIAA 2XJ0A 2BTSA 3GT8A 4GFMA 1I09A 3WF7A 1R39A 4V05A 2XS0A 4FV0A 5DR6A 4HZSA 1JSUA 4F7NA 3C4XA 4RLKA 2V7AA 2P2IA 5GINE 4EYJA 3MW1A 2VTRA 2X6EA 4DEGA 5HESA 4CGAA 3AT3A 2DWBA 3NVMB 3SX9A 4HGEA 5M55A 2WTVA 4XG8A 2F57A 5M07A 4QNYA 1OL7A 4AAAA 4RRVA 4I5CA 4QMXA 2GSFA 4PNKA 3EL7A 2G9XA 4IZAA 2OICA 4TNDA 3TM0A 5DRDA 3MESA 5CASA 2QNJA 5A4CA 4HVGA 3F66A 3FWQA 3O8UA 4AS0A 2GNFA 3FLNC 4IB0A 4RJ3A 3HEGA 2XIXA 1IAHA 4MNEB 3EKKA 5IQIA 1JKKA 4I0SA 3FI3A 4AT4A 1Q8TA 2ZJWA 1VYWA 4K2RA 4I0RA 5IEVA 3TTIA 3W10A 5BMSA 4HCVA 3FZTA 4C34A 2OXDA 3FMDA 3RHKA 4C61A 4R7HA 4CKIA 4E6AA 4C8BA 5AUYA 4EHVA 5GZAA 4KBAA 4FSNA 4C3RA 4IZ7A 4E4LA 4MEDA 4RJ7A 4AF3A 3QUDA 3V5TA 3PXQA 3PRIA 1ZWSA 1J91A 4N6ZA 2BIYA 4NEUA 3E93A 3IO7A 5A4TA 3QCSA 5H2UA 4U3YA 4YJSA 3U6JA 4XX9A 3NUXA 1GIHA 3JVRA 4U0IA 3V5PA 3MVMA 3FZ1A 1KE8A 2W1DA 4GEOA 4L9IA 3E8CA 5HCYA 2WTKC 2Q83A 3QQJA 4M15A 4FI1A 1WBNA 1YXTA 3GU6A 3NUUA 3QKKA 3AD6A 3OFMA 3OXTA 1X8BA 2BAQA 2W7XA 3ETAA 2VV9A 3ZUVA 5IA1A 3U6IA 3MS9A 3MV5A 3UPZA 2X1NA 4I22A 4WRGA 4J8MA 3FSKA 1H1PA 4I20A 1OITA 4K0YA 4O1PA 3UZPA 4U5JA 3C4WA 1YI3A 2G2IA 2GHMA 4M8TA 3R71A 4X2KA 2BIKB 2BROA 4JG8A 4YLJA 2EUFB 4C3FA 2FUMA 4F4PA 3R73A 4FGBA 3RKBA 4BDIA 2C6KA 4QD6A 1H1QA 1OIQA 4O96A 3LCTA 3HAMA 5HLWA 3AT4A 4EZ7A 2Z8CA 1OUYA 2UW3A 2VTIA 4HGLA 2O65A 4NM0A 3JVSA 3HYHA 4TY1A 3I4BA 3SXFA 3FLQA 4XP2A 4D9TA 2QVSE 4L7SA 3IW7A 2ETKA 4Q5EA 4FTTA 3FUPA 5BQ0A 4FEWA 2G01A 4TYHA 5E8YA 4PDPA 1A48A 4XEYA 2BRBA 4X0MA 1U4DA 3PWYA 4ZTLA 5AR4A 4YSMA 5HORA 4ZS0A 2P3GX 3IPHA 3GOKA 3D5UA 3PA3A 3IK3A 5CSPA 5CAOA 1M52A 3LXPA 5K0XA 3KCFA 4II5A 2I40A 4C3PA 3IW4A 5AJQA 2ZM3A 3QZIA 3RP9A 3WOWA 1MP8A 1OVEA 4MVFA 4O21A 4RWIA 3O23A 5AUZA 3JPVA 4QP1A 5K0KA 4AX8A 5ANOA 5TKDA 5I3OA 4KIOA 1XBAA 3DBEA 4AGCA 3LCSA 4RIXB 1TVOA 2NP8A 4JL9A 3R7YA 2GTMA 2WMWA 2BCJA 1XKKA 3KXNA 4KAOA 4R6VA 3E7OA 4S34A 3VJOA 3QTZA 5CU2A 5EOBA 3OP5A 4F64A 1SM2A 1FMKA 3C5UA 3BLRA 4I21A 4CQGA 5DEWA 3FHIA 4BZDA 4D2TA 5DWRA 5A9UA 5JK3A 2JLDA 4QQJA 1BKXA 2CNVA 3NSZA 1Q97A 2IG7A 1CKJA 2B0QA 2H96A 1Q8WA 2O63A 4M97A 4WNOA 2YEXA 4L7FA 4UMRA 2OXYA 2VX3A 2XIKA 3QX4A 1DI8A 2Z02A 5DVRA 2OIBA 4BTMA 2QOFA 1L3RE 5M4FA 3GQIA 5L2SA 3V04A 4FMQA 4H1MA 2ITTA 3MVHA 4JAIA 4AA4A 3SDJA 4EH8A 4QMQA 5J1VA 5GNKA 5B2MA 4UXQA 1NVSA 2O2UA 2VTHA 2R3JA 3FY2A 3N4UA 1YXSA 2H6DA 2ZOQA 4O7LA 4D2VA 3PJ2A 5FTOA 2CN8A 1KOBA 4O81A 4CV9A 2C6IA 2BALA 3DNDA 1YVJA 5T6KA 3TZ8A 4XV3A 4AU8A 4BN1A 3HKOA 2PZYA 2QOHA 3PIZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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