3GQIA

Crystal structure of activated receptor tyrosine kinase in complex with substrates
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
307
structure length
304
Chain Sequence
ELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGAFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEFSFNPSHNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQELDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title The selectivity of receptor tyrosine kinase signaling is controlled by a secondary SH2 domain binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Basic fibroblast growth factor receptor 1
total genus 86
structure length 304
sequence length 307
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gqiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gqiA01
4HYSA 4XNEA 3KMMA 5GJDA 4HVIA 2XJ1A 2WHBA 3ZO2A 5HVKA 2CGXA 5ETFA 3D2IA 2XCKA 5J8IA 3GEQA 1FMOE 3TT0A 3P23A 4EH5A 3NAXA 4N4SA 5DE2A 4D2WA 3O17A 2NNWB 2R3NA 2FA2A 3CXWA 4C62A 4QP2A 2PVHA 2W1DA 1ZYSA 5DA3A 5HCYA 2C5VA 4M97A 2OU7A 1KE5A 3UG1A 3JVSA 4M7IA 3O7LD 4D2TA 3LIJA 3CIKA 4YO4A 4ZTNA 5HX6A 5DT0A 4PL3A 4HJOA 5CF5A 2OJGA 3RAIA 1A06A 4QMQA 3JPVA 2YAKA 5J9LA 4DBXA 4C3PA 1FINA 1H1PA 2X9EA 2FVDA 5G6VA 3R8VA 4HW7A 3VJOA 4NT4A 2PVNA 4EK4A 4EORA 4C37A 2C0OA 4APCA 2BAJA 5AR3A 4EONA 4LRMA 3IECA 4JX3A 5CQUA 5KZIA 3CY2A 1SYKA 3LFCA 5DR2A 4M14A 2I7QA 3OT8A 3BELA 3E87A 3L8VA 4XG4A 4A9UA 4LOQA 4IZYA 4AZFA 5BMMA 4JRVA 3T3UA 2IG7A 4O7RA 2KULA 1FVTA 3ZCLA 3E92A 4PTGA 3GC9A 3WYXA 3FWQA 4AW5A 5IEYA 3Q5IA 2J0MB 4J96A 4BZNA 1PMNA 3TKUA 5E9EA 5A4EA 2G15A 4CRSA 3ZHPC 2J0IA 3HDNA 4QQCA 4UV0A 2Y4PA 4FKSA 3EN9A 1U5RA 2A27A 1R3CA 4EOIA 4U40A 4KABA 2OXDA 1PY5A 4W4XA 2QG7A 3ORXA 4RJ3A 4C4EA 4O0SA 3VAPA 2C6TA 4FMQA 3LCSA 1BUHA 5IEVA 3G90X 4NSTA 4KIQA 1LPUA 1PXOA 3LMIA 2ITWA 4FNZA 4IMYA 3QQLA 2C1AA 4DFNA 2BRNA 4FG8A 4X2KA 5CALA 2GFCA 4K18A 4E1ZA 1V0BA 4DEEA 4HVSA 3LLTA 1VYWA 4RFYA 1YI6A 4IZ7A 1HCKA 3PUPA 4BDKA 3EN4A 4U42A 4YPSA 3HYHA 2GU8A 3I4BA 4EQCA 4BCFA 4QOXA 1GZNA 2QQ7A 1FVVA 3DPKA 3MVHA 3A7FA 3GT8A 4FE2A 4HZSA 3WBLA 3QF9A 1APME 4JBVA 4CZUA 4FTCA 3QGWA 4X3JA 4DA5A 3UJGA 1FGKA 5C03A 3ZSGA 3KXXA 4QTEA 4O2ZA 2J7TA 4TPTA 3CD8A 5ETIA 1H0VA 4CTCA 4A9SA 4EOSA 4HGLA 2CCHA 1YDTE 3BE9A 2XNEA 4RZWA 3WE4A 4BICA 3ORZA 4D5KA 3MFTA 5AR2A 3IONA 4ZLOA 3QRUA 4X2JA 2W0JA 4FZFB 2XBJA 5AP0A 4GFGA 4JS8A 3QX2A 5IA5A 5DH3A 5IKWA 3IOPA 3VBTA 4EH2A 1IASA 4DEGA 3CY3A 5JK3A 3UQGA 3TUBA 2H9VA 4FKIA 4GW8A 4NM3A 4QRCA 3QGYA 3PVGA 4YLKA 5A4CA 3EMGA 3G6HA 2WPAA 5E8XA 3UBDA 4MBJA 1NVQA 4ALUA 2UW8A 3MY5A 3E8EA 3R8PA 1JOWB 2X7FA 2AC3A 3PFQA 4X3FA 3L9LA 3LFAA 4MWIA 3R9OA 5B2LA 3VUIA 4L01A 1GIHA 3LJ1A 1W7HA 4NW5A 1BX6A 4CGAA 3R02A 2VNYA 3SRVB 4PTEA 4C34A 4D1XA 1Q8WA 2Y8OA 3PJ3A 5C9CA 3R7OA 3LXLA 1IEPA 5GIPE 4MNFA 3OF0A 3L8XA 4QP4A 2A19B 3PSCA 3D5UA 4MXXA 3HA6A 3WARA 5CS6A 5E91A 3K3JA 4B0GA 2RFDA 4ZY5A 1IR3A 1YI3A 2CGUA 4WOVA 5AR4A 3EKKA 1WFCA 5E8ZA 4RJ4A 1DS5A 3KFAA 2ITNA 1F5QA 4E3CA 1H1RA 3D14A 4IVBA 4EZ7A 3RZFA 2WELA 3ATTA 5L2SA 5IUHA 3ZBXA 5BX0A 4MEDA 4BCJA 2XEYA 2IVTA 3CR0A 3D4QA 1J91A 4G3DA 5HIEA 3IOKA 4JBQA 3R2BA 4IE9A 5AJQA 4BDFA 2WQNA 5JQ5A 3CPBA 2B4SB 3Q4UA 5E8VA 4N6YA 3E3PA 2XM9A 3ANQA 1Q8TA 4M12A 5M55A 4EOOA 3E64A 1OKYA 4UXLA 5EM6A 1PXMA 3EZRA 3R28A 4C33A 2PUUA 3MFSA 2BPMA 4YHTA 3VBQA 4ID7A 1IG1A 4YTIA 2PMLX 2ZYBA 3I5ZA 3TEIA 3BGPA 3OW3A 3VS0A 4CKRA 1H01A 2QO7A 3ERKA 4ANOA 3UO5A 2YM3A 3P86A 3ZFYA 3D0EA 5CU0A 1NA7A 4A4OA 3R22A 5FXRA 3S0OA 4AU8A 4F7SA 3OEFX 2YJRA 2ETRA 3VUKA 5KKRC 1XJDA 2YJSA 5C8MA 3RPSA 5L3AA 4HYHA 2WTKC 5B0XA 1LP4A 4CKJA 3HAVA 5IMEA 4FTAA 4IWOA 2X8EA 3GB2A 1YRPA 2VWIA 2GHGA 4AOJA 4K9YA 4LRKA 1PXLA 4R6VA 5T6KA 3R2YA 2WMXA 5AV2A 3F2AA 2PVYA 3HX4A 4FKJA 3FC2A 2XNNA 4ITJA 3W1FA 3VS5A 2VTSA 2VUWA 2X39A 1TQIA 2VWXA 1LUFA 3UE4A 4ASZA 4C57A 4CTBA 3EYHA 2JKKA 4QP3A 3QTWA 2XP2A 4FZ6A 4Z9LA 4E5BA 4DG3E 3F88A 3NVMB 4QMTA 4TNBA 2VX0A 3N4TA 4UMUA 2YABA 5ICPA 3QA8A 4QQTA 1Y6BA 2W17A 3FI3A 3R04A 4AOTA 4ASXA 4ZXTA 4IH8A 2YCFA 3OS3A 3GFWA 4C2WA 3PA4A 3LXPA 2OWBA 3B8QA 5F1ZA 5B2MA 4BN1A 3UQCA 3DLZA 3MB6A 4TWCA 1WMKA 1R78A 4C4HA 3LCOA 3QCYA 1REKA 1OPLA 2ZB0A 2XA4A 3BU6A 5DWRA 1M2QA 3U6JA 4BCOA 2GQRA 3PJCA 3U9CA 4E4MA 2P2IA 4MNEB 4XG7A 4C59A 3WE8A 2VWYA 5EI2A 3CKWA 4IAYA 3V5QA 1Y8YA 4AG8A 4N70A 5DRBA 5CI6A 3Q9YA 5EI6A 5CU3A 3FMMA 3POZA 4OT5A 5J5SA 5TOZA 3TNIA 1Q97A 2CLXA 4DITA 3TDWA 2I0EA 4JLCA 4TTHB 4BL1A 3R1SA 3NUAA 5M56A 4QNYA 3F7WA 3KXMA 3ODYX 2W1HA 3DJ7A 3NCGA 2PWLA 3LMGA 2IVSA 4MQ1A 3RHKA 4WG5A 3RPVA 5DR9A 3W2RA 4LL5A 4C4FA 1CSNA 3MH1A 5ACKA 3D2KA 2JBOA 2OFVA 3Q3BA 3H10A 4CFMA 2OXXA 3KRXA 5AP6A 1H1WA 5JN2A 1AGWA 4EUUA 5I9YA 3HAMA 1JPAA 3C1XA 3QWJA 3PZHA 3FMKA 4FSNA 4JBPA 4EH3A 4UMRA 4EK5A 4C4JA 4EYJA 4OTIA 1ZXEA 3TL8A 4ACMA 5JT2A 5HVJA 2XNBA 3BU5A 2ITOA 3I79A 4F0GA 3EN6A 5TKDA 4R3RA 4EHZA 1ZLTA 1VZOA 4PY1A 5IH6A 1ZYJA 5HIBA 4TZRA 1WVYA 3C9WA 3OG7A 4TWNA 5FEDA 3RINA 5J5TA 2Y6MA 3RVGA 4PDOA 1W0XC 2ERKA 3I1AA 4AT3A 2YDJA 5AR8A 3R71A 4O96A 4QMZA 5HTCA 3DS6A 4GH2A 3UIMA 4LUEA 4MXCA 3ORTA 4J95A 4YLLA 1NVSA 3FLYA 4H58A 2YIYA 3F5UA 3KULA 2NPQA 4NKSA 5HD7A 3UO6A 1Y91A 2ONLC 2UVYA 4L3PA 3DBFA 1IA9A 2RGPA 4FTRA 1ZY4A 4TXCA 4FEXA 4K2RA 2ZV2A 3U6IA 4AFEA 4C3FA 3PIYA 3NSZA 4JR3A 4QT1A 4I92A 4JG6A 4JNWA 4WA9A 4FICA 4AFJA 4ZY4A 3BWJA 4RSSA 3OTVA 4R7BA 3NUYA 4BDDA 2UZDA 2XRUA 4F9WA 5K5NA 3AD6A 2QHNA 2HWOA 5TF9A 3EKNA 1PMVA 3KY2A 4F70A 5CAUA 2XJ0A 3PPZA 1LR4A 1RE8A 2C3IB 4ZIMA 1UKHA 2OJ9A 3MSSA 2BR1A 2BDJA 3FQHA 3GFEA 4FT0A 4I41A 3LCTA 2HAKA 4DGNA 5EQYA 5A4QA 3R73A 5D7VA 1I44A 3DBQA 4XV1A 4HNIA 2KTYA 4UZDA 1ZZ2A 3QTXA 4U45A 3BYVA 4CLIA 5AX9A 4UYNA 3JVRA 3ZUUA 3D94A 3CTHA 4F9AA 5FLFA 4X3FB 1E1XA 3G2FA 2YZAA 3VQHA 5JRSA 4BI1A 2Q83A 4A9YA 3EYGA 5CY3A 5JQ8A 4DH3A 1PXIA 2QR8A 5I3OA 5LVOA 3KREA 3F66A 2WOUA 2PZIA 3E62A 4FGRA 5C8KA 2VO7A 4D9UA 2ZMDA 3POOA 4QYFA 4ZJJA 4OAVB 4KINA 4DEDA 3M42A 1DI8A 3BZ3A 3Q53A 4BIEA 5CAQA 2E9VA 2EWAA 1PKGA 3BV2A 2IW8A 4DINA 3O8UA 3DKCA 3F3UA 4MXZA 1ZOHA 1BYGA 3OCTA 4XP0A 3RALA 4O0RA 2A4LA 4U41A 5BVFA 2F4JA 3DKOA 3WF8A 3N51A 1ZARA 3QTRA 1MRUA 3MA6A 3FC1X 5AWMA 5IEXA 3P4KA 3RAKA 1MQBA 1OB3A 2B9IA 4K8AA 3RK5A 3QKMA 4AE9A 5LWNA 2EXCX 2I0HA 4OBQA 4CFXA 4BYIA 2QC6A 4X6QC 5M4FA 3Q32A 5LARA 1XQZA 4Y5QA 4NCTA 1JKLA 3W2QA 1JSTA 3BHUA 3QALE 3P78A 4FKRA 5L2WA 1LEZA 3PVUA 5HBEA 3Q4ZA 4PMSA 2IZUA 4II5A 4CT1A 3A8XA 1LEWA 4JJRA 2ZVAA 4WO5A 3FZPA 4B8MA 4DG2E 3RMFA 4QMWA 2W1GA 4ANNA 3H9FA 2CCIA 1BLXA 2W96B 3ULIA 3G0FA 3QA0A 4ACHA 4ONAA 2JC6A 3FMDA 4PPBA 3HZTA 2QR7A 3ROCA 3KRJA 3QZIA 5GHVA 1WVWA 2XMYA 3I0OA 3NUUA 3NX8A 4YO6A 4CFWA 4DEAA 3D7TA 4M69A 3OBJA 3Q4CA 4RZVA 4FL1A 1YOLA 3NYVA 1AQ1A 4FIEA 5L6PA 1SZMA 3DQXA 4TNDA 4C3RA 4CEGA 2C5NA 2LGCA 3DQWA 5DBXA 2YIQA 3UMXA 2CPKE 3DJ5A 5CAOA 5ETAA 4JAIA 5A9UA 2CLQA 5CX9A 3LFDA 5EKOA 3ZBFA 3RZBA 4R1YA 3ZO3A 3HRBA 4WBBB 5AP4A 5FBNC 2GFSA 4E73A 3NNUA 4IX6A 4I4EA 4PMMA 3WYYA 5ETCA 3HVCA 4GKIA 3B2TA 2Z7QA 1UU9A 1NY3A 3L9NA 2YFXA 4MXOA 3F3WA 4D5HA 4PP7A 4XMOA 4Y83A 1YXVA 3JUHA 4V05A 2WMAA 3PJ2A 4MD8E 4RPVA 5FXSA 4A9TA 4BCGA 1BL7A 3T3VA 4F6UA 1B39A 5IQBA 3OXZA 2PMOX 2UW7A 2XJ2A 3QYZA 3EJ1A 5CU6A 2WFYA 3FZSA 4LOPA 1ZMWA 3QD2B 4FSZA 4GV1A 4RFZA 5FBOA 4IJPA 3VHEA 2J5FA 4WD5A 4F7JA 4I6HA 3FAAA 5EW9A 1J1CA 4U43A 3A7HA 5AA9A 1W98A 4NJ3A 3FSFA 5D10A 4HYIA 1H27A 3KN6A 4EK8A 3F6XA 1IAHA 4EWHA 4RBLA 2WMTA 3H0ZA 3F5PA 3RCJA 5M57A 1CM8A 3IGGA 3G9NA 4M0ZA 4E8AA 4S34A 4TN6A 2R7BA 2X81A 2PZYA 4MXYA 3VW6A 3FL4A 3SX9A 1CKPA 2BUJA 4QYHA 3HV3A 2I6LA 2FUMA 3G51A 4BDJA 4EKKA 5AUTA 5BMSA 5IA3A 3LOKA 4R8QA 4ZY6A 1Q8UA 3AC2A 3ATSA 2YACA 4IHPA 4WG3A 3V5LA 5HBHA 5C27A 3KU2A 3QHRA 3OHTA 1KE9A 3O50A 2UW0A 3DDQA 4FKWA 4UWCA 4A7CA 3CJFA 4F6SA 4GYGA 5I5ZA 4XBUA 4FSMA 5A4LA 3SLSA 3RI1A 1TQMA 5AUWA 3QCSA 4EQMA 3TJDA 5BQ0A 3D7ZA 2WKMA 5CSVA 1XH6A 4B6LA 4NU1A 3HGKA 4H1JA 2OJFE 5TR6A 3UOLA 4L3JA 4ANLA 5FD2A 4AF3A 4L53A 4XRLA 4WHZA 4AW0A 5I9VA 4XUFA 2ZV9A 4AZVA 4KBKA 5C26A 2H96A 4IDVA 4AAAA 4Q9SA 2VTRA 3DU8A 2WB8A 2RF9A 3EIDA 3A61A 1JSUA 3RM7A 2Z2WA 3KEXA 1PYEA 1GAGA 2EU9A 3C4ZA 1JVPP 3R63A 4MX9A 1PKDA 1PHKA 4HCTA 3BU3A 4R3PA 2Q0NA 4GVJA 4MCVA 3W16A 4AN2A 4IB1A 1OKVA 3IW8A 4GG5A 5FP6A 4BDGA 4DN5A 2X9FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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