4WT6A

Crystal structure of human pim-1 kinase in complex with a thiadiazolamine-indole inhibitor.
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of 5-(1H-indol-5-yl)-1,3,4-thiadiazol-2-amines as potent PIM inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
total genus 81
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-10-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4wt6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4wt6A01
3ORTA 5M4UA 3M2WA 3EKNA 4EH9A 3R0TA 2BZJA 2JDSA 2WEVA 4KINA 4N6ZA 4DFXE 1P14A 2PVJA 3CPCA 4R1YA 3TDWA 4JIKA 4ZSGA 5HHWA 4X2GA 3ZM9A 4ZMFA 2W9ZB 3T3UA 1JBPE 2XK6A 3BWJA 1R0PA 4D4SA 5E1EA 1PXNA 4AT4A 5TO8A 3QLFA 4O7WA 1H27A 3HEGA 3E5AA 4M69B 2W06A 5HORA 3KCKA 3N4UA 2W9FB 3FZTA 2YDJA 3GU5A 4GG7A 4IFGA 4I94A 1WAKA 4F09A 3TUBA 1LP4A 2QCSA 3DKGA 3RPOA 2AYPA 3HUCA 4QTEA 3KA0A 3COIA 2OWBA 4IVBA 3R8MA 5J7HA 3L9LA 3DGKA 4YU2A 1Y6BA 2JIVA 3LFAA 5D1JA 1OIRA 3QA0A 3C4FA 2RSVA 4G3FA 4R8QA 3ZBFA 3O96A 4CFMA 1IAJA 4J98A 4G5JA 5GIPE 4FKIA 4E6QA 2PUNA 3GB2A 1RDQE 2OSCA 3Q3BA 1PF8A 3F6XA 2CNQA 2HXLA 5M08A 3P08A 3DOGA 2OK1A 5CEMA 2F4JA 4HPTE 5JZNA 3KXXA 3FC2A 2CLQA 3V51A 3QCYA 5FP6A 5AV4A 4IB0A 4RVLA 2EUFB 3MH2A 4M66A 4PPCA 5EQEA 2DQ7X 3HMIA 4O2ZA 1ZYDA 2YLFA 2WMTA 4BWKA 4CKIA 1VZOA 3UZRA 4FK3A 2I6LA 2OZOA 4TTHB 3V5LA 5DT4A 2F49A 3HRCA 3NX8A 2OJFE 1GNGA 3UP2A 5IUGA 3E8DA 5E8VA 1TQPA 1PMUA 4USEA 2ZM4A 1OIUA 5EG3A 5CZIA 3Q9WA 5E7RA 1L3RE 3DLZA 3TDVA 3Q2MA 3MFRA 4DEEA 2W1HA 1SZMA 5TT7A 2GQGA 3RTPA 3CXWA 2W17A 4LUDA 2GNGA 4U0IA 3VUHA 2OJ9A 4BY9E 4EZ7A 5BX0A 4PMMA 5AP2A 2XNPA 4EOKA 3D5XA 4XJ0A 3OT3A 1Q8WA 3F7WA 5EYCA 1Y6AA 4ZTQA 1J1CA 2J90A 4GUEA 3MTLA 5AADA 4JAJA 3P7BA 5L2SA 2OXDA 1M17A 3HNGA 2YM6A 3QL8A 1R1WA 2XK3A 1Q4LA 1Q8TA 3QWKA 4FNZA 5AAEA 3W2CA 3FI4A 1YDRE 3KU2A 4NW5A 4ZTHA 3DTWA 2W1CA 4GK2A 5JK3A 1H01A 4GRBA 3SAYA 3TI1A 3ZONA 1URWA 2C5NA 4FMQA 3E3PA 5EOLA 1Q24A 4K77A 5L2IA 2QODA 2LGCA 2REIA 3LFCA 2VO7A 4X6QC 3BEGA 3L9NA 5C27A 3F3WA 3EZRA 3T3VA 4FTLA 4CFNA 1X8BA 2BZHB 1BX6A 2QI8A 4G6LA 4FIJA 2XEZA 4L01A 4MEDA 1Y57A 4JQ7A 2R64A 4DCEA 4A4LA 2BRBA 3AT3A 4AQCA 2JFMA 3DV3A 3FHIA 3UNJA 1XKKA 4Z7GA 3EFLA 3C0HA 1PY5A 4ZP5A 2H96A 4JQ8A 1KE6A 2WD1A 2JKMA 3HMOA 2YM8A 4D9TA 3VF9A 3D2KA 3EOCA 2W5AA 4PQNA 3G33A 5AV1A 5HG5A 3H4JA 2C6TA 4QT1A 3CPBA 3RPRA 4M84A 3ZOSA 3BCEA 1K9AA 3EKKA 3RAWA 3P9JA 3VS3A 3ZDIA 2QKRA 3MS9A 4XMOA 3MPMA 3ZU7A 5FD2A 2XM8A 3HGKA 5E92A 5C01A 4EC8A 3VN9A 4AW0A 1W7HA 2QO9A 4NJDA 1PXPA 4PMTA 4O7ZA 2EU9A 4MWHA 4RT7A 5GZAA 4DA5A 4C4HA 5DHJA 3JS2A 5DG5A 3UOJA 4BKYA 4HYIA 2PWLA 5HG7A 3KXZA 5M4CA 2W1FA 3QAME 1ZY4A 4FICA 2B54A 4RPVA 3QTQA 2B0QA 4JBVA 4XNEA 3OHTA 4QOXA 2IZTA 4YJOA 4DTKA 3MPAA 5GINE 3SQQA 4JG6A 5CVGA 4G3CA 2OICA 3W2QA 1YDTE 2B4SB 5JFXA 4EHEA 3SRVA 4TL0A 3BI6A 3RCJA 4B8LA 2HZ4A 4E6DA 4KBCA 4MYGA 2R7BA 4OT5A 3R9DA 2XNNA 4G9RA 3QKLA 3DK6A 2EVAA 2IJMA 5HVKA 3M42A 4XS2A 4RIYB 3AMAA 4C8BA 4EJ7A 1YRPA 3A7IA 2E2BA 1B38A 4KWPA 4U3ZA 3LFQA 3NYOA 3NZ0A 3Q04A 4X3FC 1B6CB 3UO6A 3EQGA 4MD8E 3R2YA 3F5UA 4FZAB 4EUTA 3FKNA 3FQSA 4U44A 5H8BA 4FV8A 1EH4A 2B9FA 2HW7A 4F6SA 5F1ZA 2QO2A 2O3PA 5DRDA 3GUBA 3ZH8A 4I6FA 3VULA 3RBWA 4ONAA 4UXLA 1JLUE 2WTVA 3LQ5A 4LV8A 4O83A 3WILA 3G2FA 3KXMA 2UZWE 3BGPA 3R9HA 3PJ2A 2R3KA 4IEBA 3QYZA 1QPCA 3MFSA 4CV8A 2ONLC 3COHA 4CT1A 3AD4A 4O0SA 4FSWA 4QMLA 4GT4A 3RNIA 5B2MA 3MA3A 5AR5A 4I6BA 4LI5A 5J5TA 4IE9A 4IAFA 3GT8A 2DUVA 3V04A 3OROA 4W4WA 2WMSA 2XK9A 2FSOX 3NPCA 4RG0A 2HOGA 2PMLX 3U4UA 4ZZMA 4E4LA 4EZ3A 4OTIA 4HCUA 4LRKA 3BZ3A 4CGAA 4ANQA 5HCYA 5I9UA 3G5DA 4AZFA 3BLHA 3C13A 5IH4A 3JVSA 4H1JA 2WMUA 3B8RA 2OJGA 2PZIA 3FQHA 4LG4A 5D12A 4BRXA 3G9LX 4FKSA 2ZV7A 2YDKA 4DE4A 4QNAA 1NVRA 2C5OA 5CTPA 4JI9A 4YC8A 2PUIA 1RQQA 2VGPA 3GI3A 4GG5A 1TQIA 4XP3A 2Y4IB 3VW6A 3NUAA 1Q8UA 3VUKA 3LZBA 3WZJA 4L3JA 4H05A 4OW8A 4BDEA 3CQUA 2F7EE 4BN1A 3FZRA 4HCTA 3EFJA 1WFCA 3OBJA 4USFA 1ZY5A 2Q83A 2C69A 4CD0A 1WBSA 1QPEA 2WMBA 3CEKA 2QOQA 4LGDA 3DZQA 3QF9A 3ZO4A 4IWDA 3IW4A 4X7QA 3QZFA 5AA8A 4N4SA 3FWQA 2QR8A 4F9AA 2W5BA 4O1PA 3VBQA 4NM3A 3FBVA 3G51A 3UODA 3KXHA 4I1ZA 1ZWSA 3G6GA 4YBJA 5IQHA 5IDPA 1JVPP 3BYMA 4CKJA 4QMTA 4U6RA 3GQLA 3SRVB 4UMPA 3UO5A 2NO3A 2BZIB 3HRFA 3R9RA 4XG8A 3F3VA 3FZPA 4RJ4A 3CKXA 5CEKA 3I0QA 3PLAE 5BVEA 4CMOA 4K18A 4R5SA 5AAFA 4D4VA 4IADA 5HX8A 3EIDA 4EORA 1URCA 5CQUA 4Q2AA 2LAVA 4QQJA 4ACDA 1R39A 4CZUA 5IQGA 3QD3A 3DY7A 4HYSA 4NIFA 1OVEA 4O96A 3AD6A 4QTAA 4F4PA 4F6UA 4FIGA 4L53A 3BELA 5K3YA 5DFPA 3MFUA 5LMKA 1OGUA 3LFBA 4Y73A 1OKZA 3DXNA 2GS6A 2PE1A 5IA4A 5AP6A 3VF8A 5HQ0A 4RLKA 3RINA 1YHWA 3OXTA 2VO6A 5LMKC 4IQ6A 4BCQA 3DS6A 3MGYA 4BHNA 4QP4A 2HXQA 4O21A 3S3IA 4OBOA 1UA2A 2B55A 3SG8A 4FODA 3OCSA 4GIIA 4USDA 3C50A 4EWQA 5E1SA 5FLFA 5AUUA 4XG9A 2WQOA 4I5CA 4X2JA 2JDRA 4AA5A 3PWDA 4K11A 3KC3A 4CLJA 1YWRA 3KRRA 3OUKA 1OZ1A 3LW0A 3ZXZA 2B9IA 2PZYA 3VS2A 5BYZA 5J87A 4BTFA 2WKMA 2C6EA 4Y72A 4F9CA 3QUEA 4PUZA 5FG8A 4RGJA 3PP0A 2VTPA 4N0SA 4MBIA 4O6EA 5HG8A 1JKSA 3RGFA 2UZTA 3U6JA 1Q3WA 4DHFA 4IVDA 3ANRA 2VTIA 3PE2A 3S2PA 4FUYA 4BTKA 4J7BA 5CAPA 5JH6A 4QP8A 1M7QA 4BCKA 3F3UA 4KIKB 3VNTA 4IC7A 3BHYA 4YC3A 2RFEA 5CZHA 2QOBA 2X39A 4GK3A 2VWIA 4FEXA 4BI0A 3R1YA 5BUJA 4DEHA 2ITYA 1PXMA 3B2WA 3E3BX 3FLSA 3Q4TA 4OBPA 4UWYA 3CS9A 3PXYA 4YZ9A 5G6VA 4NTTA 4LGHA 3POOA 1NXKA 3LJ2A 4DFUA 2GQSA 4Q9SA 2UW8A 3EFKA 4HW7A 4OTQA 5HLWA 4IM0A 3KFAA 4IWPA 3JXWA 5DBXA 4BCNA 5BMMA 2QO7A 5IMEA 5LVOA 3LJ0A 2G15A 3NNUA 2IWIA 3PY1A 3Q5ZA 4AXAA 4AT3A 4QP6A 5HZNA 4UZDA 1APME 1FGKA 1PHKA 2Y8OA 3CQEA 4M0ZA 5IZFA 3FXXA 3KXGA 4FKUA 1PXKA 4DBNA 4GFMA 4J8MA 4G17A 1A06A 2BPMA 1Z57A 3GP0A 4EUUA 5A4EA 4XEYA 2CN5A 4EBVA 4QYEA 2UVXA 3ZO2A 4X2FA 5I9VA 2F2CB 4IW0A 4U8ZA 5AR8A 4JDHA 3FMJA 2HZNA 4J99A 1LUFA 3GC8A 4YNEA 4NIFB 3VQHA 4D55A 4EH8A 3FSKA 1NVSA 2BKZA 3EQBA 5KCVA 5EHLA 1WCCA 1MRYA 4O38A 5E8WA 4F6WA 3TNHA 2HY81 2I7QA 2ETKA 4BTMA 3TM0A 3VWAA 4P5ZA 5JZJA 2RGPA 4MH7A 3O0GA 5DVRA 4Q9ZA 1QMZA 3F88A 2HELA 3LFEA 5CQWA 2V0DA 3RPSA 5D7AA 1UU8A 3AG9A 2X6DA 4Y85A 3VBTA 1CTPE 4FOBA 4HGSA 4DEIA 3UIUA 4C38A 2C3LA 2YEXA 3K5UA 2OO8X 5EKNA 2NNWB 4WNKA 5CEPA 5CEQA 1OB3A 2F2UA 2FSLX 4FKLA 2OLCA 4GUBA 4L9IA 3FLNC 2G01A 5CT7A 3S4QA 4EONA 3I7BA 2PVRA 4KD1A 3RVGA 3THBA 4L67A 4IANA 5AM7A 2YWVA 3M1SA 4YR8A 5ANKA 1A9UA 3UQFA 4MF1A 3CR0A 2QOFA 3WZDA 3TV6A 4FGBA 4QO9A 3SX9A 5DEWA 3G6HA 5HU3A 5BPYA 3VBWA 4BDGA 5BNJA 4JOAA 4KKEA 3UG2A 1UKHA 4FKWA 5J7BA 1Y8YA 2FSTX 4WKQA 2XKCA 5B2LA 4Y46A 1UU3A 2Q0NA 4Q5EA 3A61A 3P7AA 1ZXEA 2C68A 2QOCA 1G8SA 3GC9A 3I6UA 3Q96A 4UYAA 5HEZA 4A4OA 5D7VA 4CKRA 2F57A 4IZ7A 3AQVA 5HCZA 3JUHA 3NRMA 4IZ5A 3LMIA 1YHVA 4JNWA 1XH9A 3LAUA 2CGXA 1MP8A 3HX4A 4AWIA 5JGAA 2O2UA 5FP5A 2J4ZA 4A06A 5DR9A 3EHAA 1WBPA 4YPSA 2YA9A 3S00A 2J2IB 3LCSA 3LQ8A 4YLKA 4C58A 3A4PA 4KAOA 4F64A 4UZHA 4RVKA 3MV5A 3O8TA 4ZS0A 4C4EA 4EC9A 4ZLZA 4LUEA 3LPBA 4IM3A 3DT1A 3VS7A 3VS1A 3N9XA 2PE2A 3OW3A 2EB2A 3HP5A 4FG8A 1NW1A 4GYIA 4PL4A 4AOTA 2YIXA 4L52A 3R2BA 4RJ6A 5I9XA 1QCFA 2QG5A 3R7IA 1STCE 5ETCA 1O6YA 4CRLA 4RA4A 3FI3A 5L4QA 1FVTA 3BV3A 4CVAA 5CENA 4B4LA 5AM6A 2YJRA 4K8AA 4CQEA 4JRNA 4RIOA 5AP5A 3PDTA 5CF5A 4O7LA 2YIRA 3PUPA 2YAKA 2CGVA 2XP2A 4GT5A 2X4FA 4F65A 2X1NA 4FYOA 1AQ1A 4GH2A 2PVFA 3MY5A 2X8IA 1BI8A 4G31A 2CDZA 1RW8A 2WTDA 2WEIA 3EQFA 5H3QA 3LIJA 5FDPA 4TN6A 3VHEA 5AV3A 3D9VA 4LOPA 4WOVA 5M06A 4RVMA 2BALA 4CLIA 5H2UA 3ALNA 3OCBA 2I0VA 2JC6A 5ACBC 5KMOA 2ZV2A 4L00A 4QQ5A 5ITAA 3PZHA 4FTTA 2WTWA 3CCNA 3EB0A 5F95A 2Z7SA 3CD3A 3IDCA 4EHGA 5IPJA 4XLVA 1FGIA 2VX3A 4DEAA 5AUXA 3TNWA 1U59A 5AIKA 5DT3A 3ZLYA 5K4JA 4UBAA 2VWWA 4QYHA 2CNVA 1AD5A 4LQMA 1UWHA 3DQWA 3DU8A 1J3HA 5GJGA 3NUXA 4NYEA 4TZRA 2PL0A 4HGLA 4QMUA 3SLSA 3P78A 2JKQA 3DNDA 3H0YA 5CEOA 5KKRC 3LM5A 4DG2E 5LWMA 5DRBA 5T68A 3VS0A 3PSBA 3TUCA 3NW6A 4IAYA 2BTSA 4AX8A 4RJ3A 2NPQA 1H1SA 1I09A 4H3BA 4MBJA 4R3PA 2JBOA 5K9IA 3FPQA 4EH5A 2Y0AA 2JITA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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