3Q52A

Structure of phosphorylated pak1 kinase domain
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
293
structure length
292
Chain Sequence
DEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAIRQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELIQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structural insights into the autoactivation mechanism of p21-activated protein kinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 1
total genus 96
structure length 292
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3q52A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3q52A01
5H8GA 5HCYA 3FYJX 4TY1A 3M11A 4YJPA 1O9UA 1J91A 4BIEA 2WQOA 4KINA 4FG7A 2UW4A 4ZMEA 4KBKA 4YZNA 2C69A 3JPVA 2JD5A 3MY1A 4YNOA 3L8XA 4FIIA 4DLIA 4WG5A 2Y4IC 4CMTA 4QMYA 4YPSA 2C68A 2HZ4A 4USFA 5LOHA 4V04A 3CS9A 3UVPA 2ITXA 3S2PA 3WARA 2QHNA 1YWNA 3DK3A 1YDRE 1H1SA 4DITA 5L3AA 2XM9A 3VW6A 4BCPA 1Z9XA 3CTHA 4UXQA 3LM5A 4M13A 3HX4A 3MFUA 1FVVA 4A4LA 3UOKA 4R3RA 5F1ZA 5IQGA 5GINE 3MTLA 4JI9A 4NUSA 4GKHA 4YJTA 4FTUA 1BI8A 2R3NA 4ZSAA 3CQWA 5JFXA 5CZHA 3RAKA 2GNHA 3RALA 4JNWA 2C47A 1UVRA 1DS5A 1PXMA 2I0HA 5E8TA 3F2RA 3GC9A 1G5SA 2R3JA 3S4QA 5B7VA 3ZRLA 2KTYA 4HYSA 5AWMA 4QTCA 3UYTA 3V8WA 3EZRA 3IOKA 4AFEA 3FE3A 4E20A 4EKLA 4EUTA 3CD3A 4BDDA 3HUCA 3QKLA 5CU0A 5IZFA 2YIYA 4XLVA 4QO9A 3TKIA 2XJ1A 3R02A 3QTRA 4K9YA 5FTOA 4RIOA 5A46A 5IQBA 3FZ1A 5L2TA 4O7YA 4AFJA 3FQSA 2W1FA 4JQ8A 5TKDA 2VV9A 4D2VA 2UW0A 4F99A 2ETRA 3TIZA 4EI4A 3V51A 3OZ6A 2W1ZA 4IFGA 4L7FA 2W5BA 4QYEA 4LGHA 4YJRA 2YISA 3WF9A 5IA0A 4F6WA 5HGIA 1ZRZA 1PXOA 5I3OA 5KKRC 3Q9XA 3C5IA 3GU4A 1Q62A 4DT9A 3NUAA 2Y0AA 2IWIA 4BCNA 5HU9A 1ZYLA 3QUEA 4F64A 4WNMA 4FEWA 4FTKA 3CIKA 2C1BA 4FZ6A 4QMSA 1BKXA 2QVSE 2WTJA 2VWBA 2O65A 4IWOA 3D5XA 4ANOA 1Q8UA 4RMZA 4AP7A 1PMUA 4RJ5A 4FTRA 4OT6A 5GIOE 1LR4A 1OPKA 3ORLA 4C4IA 5LWNA 5D41A 1OUKA 4MQ1A 4GT5A 3D15A 3VS1A 4JX7A 4IQ6A 4DH5A 4KIPA 4A9SA 2QOHA 4MBLA 3WIGA 3LFFA 3R00A 4FSRA 4O0RA 4PMTA 4XBRA 3UOHA 3I5NA 3PVUA 5DYJA 3OWJA 3ORNA 2FSMX 3NUXA 3PXFA 5FP6A 4A4XA 2PVNA 4L67A 1Y57A 3D4QA 2RFDA 4UY9A 3RGFA 3H3CA 2OXXA 3EYGA 4FVRA 4FUYA 3UOLA 3VQHA 3U6HA 5HESA 4FR4A 3ZC6A 2EU9A 1YKRA 4ASZA 5EDPA 3PZHA 5FGKA 4FT7A 5DIAA 2YAKA 3KRWA 3ZLXA 2GQRA 5ITAA 3IW6A 3VW8A 3RM7A 2VX3A 3O17A 2VWZA 4XG2A 4JJRA 4O2ZA 2C6LA 4O7LA 2HXQA 2WMUA 4PV0A 4AA0A 5M57A 5D12A 3ZO3A 3FQEA 5ETIA 4IW0A 1YDTE 4DG3E 5A4CA 3R63A 4CKJA 2HWOA 2VZ6A 4GT3A 3GVUA 5E8ZA 4X2NA 3WE4A 5LWMA 2CGXA 4GCJA 4MQ2A 3RWQA 4UYNA 5E8YA 5L6OA 3PXKA 3FDNA 3NUUA 2WMSA 3ALOA 1KOAA 4D0WA 2PL0A 2G01A 3COIA 3UBDA 1K9AA 1ZOEA 2ZDUA 1PXLA 4GJ3A 4FKOA 3LXPA 4NU1A 4U79A 4WNKA 3U51A 5FLFA 4CYJA 5CI7A 3IDCA 5IEXA 3RPOA 5M44A 4BCKA 2F7XE 1NVQA 3L8VA 3LW0A 3MYGA 5M55A 4ZMFA 5J5SA 4RIYB 2O0UA 4MF0A 5DMZA 3OTUA 2ZMCA 3LPBA 3MY5A 4UXLA 4DE4A 4YUQA 4XHKB 5AP3A 3POOA 5EDRA 2CLXA 2P2HA 2IW6A 4FV0A 2IW8A 3CJFA 3ORIA 4EOJA 2XVDA 5GHVA 4LOOA 3FL5A 1GIHA 3SG9A 1JSVA 4F7LA 4F9CA 1XH7A 4AZSA 4R78A 5T68A 4XG6A 2NNWB 2BZIB 3FHIA 2J9MA 4FTTA 4O0XA 4O22A 3TZMA 2EXMA 3EL7A 3DBEA 1OIRA 1QPCA 4W4WA 5LVLA 4J96A 4FV7A 5LCKA 2E9PA 4FTLA 2J5FA 3NW6A 4JDJA 3ZLYA 5KMIA 1LEZA 4XBUA 4ZSJA 4F7NA 4F9YA 3L9LA 1IASA 3ZU7A 4R5SA 3OW4A 2OICA 3P79A 4CT2A 5CVGA 4AOTA 4AZWA 2Z7SA 4Y5QA 2C3KA 3EN4A 4HCTA 5EW9A 2YWVA 5C4LA 3U4WA 1F3MC 4IVCA 2BAKA 3VWAA 5IQHA 2BZHB 2YM7A 3FC1X 1OUYA 3Q32A 4ACDA 5C8KA 4FSQA 2NP8A 1QPEA 3AQVA 3MVJA 3QALE 5GJDA 4UWYA 2ITYA 3PY3A 3SXSA 4JRNA 2YIWA 4X0MA 3UIBA 4MNEB 5IA1A 1P2AA 3TTIA 3BHHA 1ND4A 4D1SA 2QKRA 4FA2A 3LCDA 4XYFA 1PYEA 1AD5A 3QUPA 4X2JA 5E1SA 2HZIA 4DTBA 4R7HA 2ZV2A 2ZYBA 4FKQA 4BCOA 2GS7A 5AEPA 2OIDA 3BWJA 5CTPA 5BVKA 4QQ5A 5AUTA 3E64A 3H0YA 4CFUA 5HE2A 3O8UA 4D2WA 5A14A 5J7BA 4S2ZA 4BDBA 5E8SA 2XNBA 5LJJA 2XEZA 5C26A 4O7WA 3MB7A 4OT5A 5KUPA 2UW5A 3F61A 4ACGA 2WXVA 4EL9A 3UGCA 3VBXA 3OP5A 4IZ5A 4JDHA 5IF1A 4YLLA 3KKVA 4NIFB 4OTDA 5AV1A 3MH0A 2W1HA 4DCEA 4W4YA 5AJQA 2F7ZE 3AC1A 4HZSA 4S30A 4DA5A 4YJNA 3CTJA 3O96A 5EFQA 4KIQA 1YDSE 1CKIA 2C6KA 4UYAA 4KNBA 3QKKA 4Y95A 5CU6A 4IC8A 5AA9A 5HBHA 5HI2A 3ZLSA 3BHVA 4JT3A 4YP8A 4FGRA 2WMQA 4RQKA 3R83A 4DTKA 1JKKA 4NKAA 3P78A 3GENA 1KWPA 3A8WA 1XHAA 5HIDA 1FQ1B 2E9UA 3BE2A 4LUDA 5KZIA 4D58A 4F09A 3PE1A 2CSNA 3ZFYA 4DN5A 2PZYA 1XBBA 3RAWA 2C3IB 1O6KA 5CXHA 3RK7A 5BUEA 3CSVA 2BHHA 3MI9A 1FBNA 4D0XA 4F0FA 4IHPA 5BX0A 4FTQA 2AC3A 5CSHA 4CFXA 4PMMA 2BFYA 4D2RA 5J9YA 3TJDA 4OBQA 2VGPA 4PDSA 3FKOA 1PXIA 5KZ0A 3W8QA 4U8ZA 4X3FB 5B2LA 3DBCA 4IM3A 4IX6A 2CGVA 4Z55A 4FIEA 2IVUA 3DFAA 2VTJA 3OY3A 4AW1A 4J98A 3UG2A 3MFSA 5DE2A 3PXYA 3TNHA 4I22A 2HENA 4YZ9A 4JG6A 5FXSA 2GQSA 3CY3A 3ZBXA 3KU2A 2CKQA 1R0PA 1H1QA 3F3WA 1J7UA 4KS7A 4ZS0A 2XBJA 2ITVA 2QO7A 4RG0A 5L2WA 4ARKA 1R1WA 2UW6A 3UDBA 2VWVA 2OJGA 2CPKE 2WGJA 4TN6A 2YFXA 3DNEA 3L1SA 5CNNA 4ZZMA 3DZQA 3UC4A 4K8AA 2F7EE 4W4VA 5DT3A 5I0BA 4O7SA 4P90A 5FTQA 4YTIA 1Y6AA 2WQNA 3OWLA 3QTZA 4JX3A 3SRVB 4WD5A 3GQLA 5FEDA 3TJCA 2OJ9A 3AD6A 4BDAA 2C5YA 4ZTMA 1YHVA 4MD8E 1PXPA 3AD4A 5EI8A 4Y85A 2WU6A 2VTOA 3FMLA 2BTRA 3EN5A 4QQJA 3PJ2A 4RIYA 2H9VA 4GJ2A 2HYYA 3IDPA 3R30A 4OBPA 4OTHA 4CQGA 4R8QA 3BU3A 3GOKA 2W5AA 1YOJA 3Q6UA 2C5VA 3F66A 3PP1A 3QRKA 5KX8A 5CAUA 3AT3A 2PVFA 4F1TA 2JGZA 2JDVA 4M0ZA 4C61A 3ALNA 2GS2A 2YABA 2R3RA 3I5ZA 3HDNA 3SW4A 3DK6A 2JEDA 4TYJA 2C6DA 1PW2A 1SZMA 4ONAA 3IO7A 2UZNA 3VBYA 3EQDA 3LFCA 2B9JA 4RA4A 3OXTA 5EHLA 3UO5A 3NIEA 3E7OA 4FVPA 2NRUA 3UC3A 5AIRA 4DGLC 3WYXA 3IS5A 3SHEA 1WBSA 5A4TA 2A2AA 1W8CA 3I79A 2ZOQA 3VS2A 2G2FA 3AC2A 2PSQA 5FG8A 1XKKA 4EHEA 2I1MA 4K1BA 1HCLA 1RW8A 3DXNA 4QP2A 4YPDA 2HOGA 3NNXA 5TOZA 3VS7A 3EMGA 3DLSA 4AZTA 2GPHA 3TUBA 3C13A 4MKCA 3MH3A 4QMUA 3GI3A 4MD9E 3SX9A 3CLYA 3DB8A 4FKVA 4FL1A 4XOZA 5M06A 2C0OA 4H3PA 3ACKA 2WD1A 2VO7A 4XMOA 3PPJA 2YWPA 5FXRA 3V8SA 4XP2A 4JBVA 1G8SA 4TNBA 3E8NA 4F6UA 4H3BA 4WBOA 4APCA 4ASXA 3T3VA 4BIDA 3F2AA 4FE2A 3GCQA 3NRMA 4CKIA 3PSBA 3TG1A 2IPXA 4C38A 2VWWA 3KXNA 3KRXA 3V5JA 4KABA 4FGBA 3DJ5A 2QURA 5E9EA 1J1BA 4BKYA 1YRPA 4LG4A 3Q5IA 5K9IA 3AMBA 2YCFA 3BEGA 4KS8A 4NIFA 4PL4A 3U4UA 5KHWA 4P7EA 1NA7A 5CNOA 3ZSHA 4FL3A 3L8SA 4ASEA 3BLRA 3UP7A 2WU7A 4IVAA 3LE6A 5G6VA 4EJ7A 4GKIA 2IZUA 4E4NA 4FG8A 2XK9A 4YJVA 4RFZA 4A9UA 3ATTA 3UZTA 2ZJWA 4I5PA 4O7NA 4Q2AA 4DEGA 2FGIA 3PYYA 5BVEA 2GHLA 4FV1A 3Q5ZA 4WIHA 5HLWA 3ZDIA 3K5UA 3R71A 5EI6A 2ITUA 2BFXA 1ZYJA 2P0CA 5JFVA 4TWNA 4USEA 1LEWA 2OJFE 3DDPA 2R4BA 4YJOA 3GCSA 4EORA 4XNEA 3A2CA 4KKEA 4HVGA 3U9NA 2V5QA 4IAFA 2AUHA 3N4UA 1SVGA 3DAKA 4GU6A 3HP5A 1SYKA 4G17A 5FEQA 1VJYA 1ATPE 3H0ZA 5IH5A 1H8FA 2HK5A 2XKFA 1KE6A 3MS9A 3R7YA 3OOMA 4I5CA 4L6QA 3FMDA 5EYCA 3UYSA 4TL0A 2XYNA 2BKKA 3OEFX 3ODYX 4X3FA 1H24A 4RRVA 3QTWA 2QOKA 3DY7A 3DB6A 5LCJA 4BC6A 4M3QA 4YC6A 3NGAA 4PPBA 4AG8A 5E8UA 4ANLA 5HTIA 4CRSA 1WBNA 2AYPA 4DYMA 1JLUE 4ANQA 3FLSA 2WMWA 4IADA 5DRDA 4EQCA 1PXKA 5LMKC 2X9EA 5AUYA 3GC8A 1WBPA 2YHVA 1V0PA 3MY0A 2R3HA 3HV5A 3QGWA 3UE4A 5AR7A 3UVRA 4LOPA 3QRIA 3NYNA 5EQPA 1W7HA 3F3UA 3R9HA 2B9IA 4EK3A 4L43A 5DI1A 3C4ZA 2CMWA 2H6DA 3ID6C 2X8EA 2B1PA 3SRVA 5EKOA 3UODA 4S32A 2FVDA 3O8TA 5K3YA 4BZNA 2W96B 4CZUA 4EOIA 1H1RA 3BU5A 1OIUA 4IMYA 4WT6A 4I4EA 4YZDA 3ZZWA 3PY0A 2PHKA 4NK9A 1JWHA 2ZAZA 1U5RA 4E4XA 2BALA 4GW8A 3KA0A 3OXIA 2XCKA 1RQQA 1XQZA 2BCJA 5HQ0A 3P86A 2CGUA 1R39A 3I4BA 5KMOA 1STCE 3FSKA 3LM0A 5GIPE 4YLKA 1Q8ZA 3TNPC 4FTMA 1OBDA 5EM7A 2Y4PA 5BVNA 3QXOA 1KOBA 3CR0A 3PZEA 3R6XA 4FKGA 4C4JA 4LYNA 4ZLOA 2P33A 3Q4ZA 4RVKA 4FOCA 4J99A 5JSMA 3R7EA 3FBVA 5FBOA 5DH3A 1XWSA 3R1QA 3V5WA 5HVYA 1GZNA 3NYXA 5H9BA 1OBGA 4ZP5A 5LARA 4RLLA 3RPSA 3KVWA 4LV5A 2YJSA 3TCPA 3RCDA 3GCUA 2WQMA 3ODZX 4QPSA 2OXDA 4RC3A 3U8WA 1YI6A 4GRBA 2VWXA 4NTTA 4FZFB 4UMUA 2WMVA 2BIYA 4QMQA 3QL8A 3ET7A 4E6QA 4TTHB 4AUAA 2KULA 1UU3A 3F69A 5GZ8A 2AC5A 4QMPA 4PTEA 3I7CA 3Q6WA 1CMKE 2VO6A 2XMYA 3M2WA 2DS1A 3NR9A 4KRCA 4U6RA 4XG3A 4XLIA 3QTQA 2XK8A 1RE8A 3B2WA 3ZUVA 3VUGA 2HELA 4WRGA 1GJOA 4AGUA 2C6IA 2VTSA 3ZH8A 2B9HA 4I24A 4AZEA 2YDJA 2XIKA 2OBJA 3PG1A 5J5TA 3Q3BA 5M07A 5IH6A 4I4FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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