2VO0A

Structure of pka-pkb chimera complexed with c-(4-(4-chlorophenyl)-1-(7h-pyrrolo(2,3-d)pyrimidin-4-yl)piperidin-4-yl)methylamine
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
343
structure length
340
Chain Sequence
KGEQESVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLTKLEFSFKDNSNLYMVMEYAPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLMIDQQGYIKVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Bos taurus
publication title Identification of 4-(4-Aminopiperidin-1-Yl)-7H-Pyrrolo[2,3-D]Pyrimidines as Selective Inhibitors of Protein Kinase B Through Fragment Elaboration.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE, ALPHA-CATALYTIC SUBUNITPROTE
total genus 108
structure length 340
sequence length 343
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vo0A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vo0A02
4L7FA 4M66A 4LUDA 2QODA 2YM7A 3UIUA 4BCFA 4EK6A 3SGCA 2QU6A 2R2PA 3AGLA 3EWHA 3FWQA 4FTNA 4LMNA 4I6BA 5C1QB 3O51A 1XBCA 4C36A 5CANA 4CSVA 4KKEA 1YQJA 4BI2A 3QRKA 5IQEA 4BDBA 2W99B 3G2FA 5LOHA 4O7RA 2VGOA 2W9ZB 4PL3A 3FLSA 2OO8X 1OL5A 2CPKE 3MPMA 3OZ6A 3BU5A 2XJ1A 5A4TA 3PJCA 3ZUUA 2PVRA 4IB3A 2BIYA 4FZ7A 4XG6A 3IG7A 2QLQA 4N0SA 4GK3A 5M07A 2X2KA 3EKKA 3FZSA 1P5EA 2W1HA 5BUIA 1A48A 2HELA 2UV2A 4ASDA 4GK2A 2GU8A 4E6CA 4L3PA 2A19B 3OOMA 4NIFA 1YRPA 5KMMA 3MWUA 5JH6A 3LW0A 3MIAA 4MF0A 4Y5HA 2P2HA 3TNHA 2PWLA 1FMKA 2PVLA 4FTJA 2WTCA 3BLQA 3C4XA 4WSYA 5EK7A 4DGOA 5EOBA 3WZJA 5A4EA 1IRKA 4YBJA 3F61A 3QBNA 1MP8A 4JVGA 3EQGA 4PX6A 5KBQA 2GFCA 2OG8A 3UG2A 3KRWA 3CE3A 3OWJA 3DBEA 5K3YA 2VTQA 3KN5A 4PTGA 1FOTA 3C0IA 3Q5ZA 2OZAA 4IM2A 3PP0A 3PJ8A 4FUXA 3V8TA 2FB8A 3CLYA 3FJQE 3BIZA 2IZSA 4IXPA 2B9FA 4BDEA 4CYIA 2V7AA 4F7JA 3CY2A 1H0WA 3HAVA 4Q5HA 3NUNA 1P4OA 4DFBA 4D2SA 2PZRA 3LFAA 3HRFA 2OLCA 4EJNA 2V22A 2GNHA 2HK5A 5E8VA 4O0TA 3GOKA 4RFZA 2R5TA 2BUJA 2FSOX 5F94A 3SRVB 4YURA 5A6OA 1O9UA 3EQBA 3DKFA 5HG7A 3R8PA 5IH5A 2VTMA 1ZMUA 1PY5A 5EYMA 3R7OA 5M56A 4FNZA 3QF9A 2ERKA 5L6WL 4CT2A 3FYKX 4V05A 4K6ZA 4GKIA 4AA0A 5KMIA 2ETMA 4BDDA 2WTKB 1V0OA 4LV8A 5HE1A 2BKZA 3H0ZA 5TF9A 1ZRZA 3UC4A 5ICPA 3NUSA 2EXMA 1H01A 2H96A 4RJ6A 4RFMA 2YIXA 3K3IA 4E7WA 4YTHA 3Q9ZA 3ULIA 1ZLTA 3OCTA 4UBAA 3VVHA 2FH9A 2IVVA 2QC6A 2H6DA 4E1ZA 3H30A 1QPJA 3IW7A 4K11A 4ZSLA 4FKOA 5EFQA 4CG9A 3FQSA 4BCGA 4RC3A 4AN9A 4S30A 4M13A 3DLZA 5M55A 4FMQA 4IDVA 3VUDA 4YLJA 4FVQA 3ODYX 4ACHA 4E6DA 4IIRA 3W33A 3Q4ZA 4V0GB 3R7YA 1GZNA 1YHWA 4I6HA 5LXMA 2E9NA 5J87A 4G5JA 4FG9A 2WTVA 3KRXA 3FXZA 2C3KA 3OT3A 4MD9E 4G31A 4CQEA 4EH2A 5AUXA 4ZLYA 2VTPA 1OBDA 5BVEA 3EL7A 2JAVA 3L8XA 1YOMA 3TTIA 4XUFA 4YO4A 3KMUA 4A9YA 1W0XC 1H1SA 2C6IA 2UW7A 2XRWA 3ALNA 3QKMA 2IWIA 2JDRA 1UV5A 4TRLA 1Z9XA 2YM5A 4KB8A 3WBLA 4XV9A 5HNBA 3TDVA 5FLFA 2OH0E 4RGJA 3QX2A 3R01A 4IX5A 4WRGA 4MVFA 2OKRA 3CTHA 4UMQA 3W16A 2HOGA 5K5NA 1ZZLA 2P55A 2PUPA 2WMTA 5H3QA 5HGIA 1OIYA 3MIYA 1QCFA 4H3PA 3PA3A 4R7HA 3EIDA 3EN4A 4MXCA 4L6QA 5EDPA 1YI6A 3VRYA 4HVHA 5DR9A 1Y6AA 4C4FA 3GU8A 3D2KA 3R9DA 4IWPA 5KX8A 4JX3A 4U6RA 4MKCA 1YXXA 3NS9A 1BI8A 3QUPA 4LFIA 4XOZA 2BRNA 4IZYA 4FOCA 2C6LA 3GI3A 4PL5A 3U4WA 5KCVA 4IVDA 2VWYA 3QA0A 4M12A 4M8TA 3FI8A 2R3GA 2E9OA 4KABA 2YEXA 4IADA 4O27B 1P2AA 1LPUA 2I40A 3IOPA 3B8RA 4W9XA 4GFMA 3AT4A 2GDOA 4Z9LA 3VUHA 4L00A 1NY3A 5T68A 5IQFA 4JOAA 1Z57A 3PYYA 5ANIA 2RF9A 3P08A 4BIDA 2C6MA 5BUJA 4PDYA 2IVUA 3ATSA 1OZ1A 4DF3A 2WMUA 1XH7A 4U80A 3U6IA 3FLZA 1BUHA 4QQTA 2R4BA 3RAKA 4G17A 4K33A 4AE9A 3GB2A 3OVVA 5DN3A 5FM3A 2FUMA 5FG8A 5J95A 3U8WA 4IJ9A 3VJOA 1XH5A 1JSVA 2CLXA 5CT0A 4DFNA 2Z60A 5KNJA 3D5XA 2ZB0A 4E6AA 2ITVA 1PKDA 2B9HA 3OF0A 2JFMA 2CHLA 3FDNA 4CVAA 4YPDA 4UMTA 4U45A 4YC3A 3KMWA 3FMEA 4GVAA 3VC4A 5EHOA 3SOAA 4FNXA 3I60A 4F64A 2W1IA 4FZAB 4U40A 3QWKA 1PXKA 3FPMA 4R7IA 1ZYJA 5AP6A 4YZMA 5FDPA 5I9YA 3TTJA 4XP3A 3FI2A 4O91A 4JDHA 5CVHA 2WAJA 3MBLA 1YXTA 2XMYA 3FKOA 4FV3A 4N70A 4XCUA 5D7AA 3UVPA 2PUIA 3NW5A 4NM5A 4ACDA 2ONLA 2R3LA 4LQMA 5H8EA 3E3PA 3PLAE 4AE6A 3KKVA 2OIBA 1OM1A 4QP8A 4HPTE 2CKQA 1HCLA 4QMYA 5HQ0A 3BHVA 3E92A 3RAWA 1CKIA 3M42A 4WBBB 4IVAA 4Z7GA 1WBWA 3AMBA 3H9OA 4IZ7A 4YBKA 4USEA 2XKFA 5LJJA 3U54A 3NAXA 1XKKA 2XCKA 1M2RA 4ZLZA 5HEZA 5CXZA 5BVNA 4CLIA 3I4BA 3Q9YA 4BZDA 4KS7A 5EW9A 4FKQA 3AD4A 5HVJA 4BCQA 2JIUA 3DBCA 3WZEA 4FZ6A 5IA3A 3RM7A 3KU2A 3HAMA 2VX3A 2Q83A 3ZS5A 1M2QA 3HRCA 4RJ4A 3PIYA 5AV4A 1YDSE 5JGAA 3P7AA 4XLIA 2P2IA 2ACXA 4PWNA 2XK6A 4J7BA 2QO7A 5CF4A 3I5ZA 4S32A 2GNFA 2QLUA 3VF8A 4BCJA 2OXYA 2CSNA 4H58A 4KIOA 4J53A 2XM8A 4AOTA 4ZMEA 5F95A 5M4FA 5DGZA 4IX3A 1SVHA 4FIGA 1JPAA 4UB7A 4UY9A 3AC2A 4RIXA 4ZK5A 2W1GA 3PZEA 2XIRA 5KE0A 3PJ2A 3HA8A 4CV9A 3FQEA 3C1XA 4AW5A 5L8LA 5JN2A 3AD6A 4D4YA 5HVKA 5E8TA 4MWIA 4IAFA 5BUEA 2XRUA 5FD2A 2CJMA 2Q0NA 3MVLA 4KIPA 4NIFB 3E7VA 5A4LA 5HTIA 4M97A 3ZC6A 1FPUA 3POZA 5B2KA 2G2FA 4FKJA 1BL6A 3ZONA 4EWHA 1KOAA 4F0FA 5HG5A 4ACMA 5EKNA 1H1QA 3DB8A 2W1DA 2WOTA 4DEDA 4O81A 4MYGA 4DFLA 2VX1A 5AR2A 2HWPA 2XJ0A 4RIYA 3GCVA 3NW6A 2AYPA 2OZAB 4FKPA 5FWKK 5BMSA 5IMXA 3AMAA 4O6LA 1XH6A 3EQFA 1XJDA 3QGYA 4PDOA 2BZJA 4AS0A 4FEWA 4JBVA 1H0VA 3HVCA 4G3DA 3IS5A 4IE9A 3OXZA 3UJGA 3QTRA 1LUFA 4WG3A 2B7AA 3IGGA 2I0HA 3NCZA 2X4FA 2P0CA 4DEIA 5CEOA 2YDJA 2ITYA 3TUCA 4GJ2A 4ZY4A 3FMJA 3KF4A 5CALA 1YXUA 3NNVA 4RIOA 4LYNA 1QPCA 2J50A 4GRBA 4MNEA 1IG1A 2F2UA 5T3QA 3MPAA 2GHGA 5JKGA 1GNGA 3VBXA 3ORIA 5EI6A 4NFMA 3VRZA 2J5EA 3ZTXA 4H1JA 2H8HA 3V5LA 5HOAA 4NKSA 3MDYA 3BYUA 3NNUA 4HGEA 3AC1A 3W2SA 4C2VA 5EQPA 2C5YA 4RIWA 4XS2A 3JY0A 4FYOA 5ANOA 3W8LA 4YJOA 4FC0A 2W96B 4G1WA 2UW5A 4S34A 4DGNA 4K2RA 4AWIA 1STCE 4KKGA 3H10A 1XH9A 3EQCA 5I4NA 5M09A 3EQDA 2FA2A 3A7IA 2C68A 5FDXA 1CMKE 1SVGA 3FSKA 3QCXA 3ZUTA 3K5UA 4G9RA 4FEVA 3LFDA 4GK4A 4PMTA 5CSWA 3PPZA 4OTGA 2JC6A 4R5YA 4O7TA 4CKRA 4XMOA 5HE2A 2JKOA 3FAAA 3BRBA 2Y4PA 3WIGA 4DEBA 1M52A 2OFVA 3CJGA 3QUDA 1ZXEA 3PY0A 3U4UA 3RNYA 3A8XA 5IA4A 3KA0A 4HNFA 2PHKA 4G9CA 5ETAA 5JRSA 4ENXA 2PVYA 3COKA 3R7GA 1V0BA 1BL7A 5EM6A 4RBLA 4I6FA 1NW1A 2Y7JA 3R1NA 1H26A 2Y9QA 4M15A 2XEYA 4FV9A 2RFEA 3PXZA 4DG0E 2FYSA 3UC3A 3I7CA 4B6LA 2PMOX 2WPAA 3OOGA 4AACA 5A46A 4ORKA 3QZGA 5AR8A 3ANRA 3GXLA 5AP5A 3QC9A 2J90A 3W2OA 2F2CB 4O7SA 2YERA 5FM2A 4PDPA 3ZMMA 1JSTA 3JPVA 4RVLA 4QP6A 5TO8A 3OFMA 5KHXA 3WARA 5GJGA 3PUPA 4DH5A 3DJ6A 2VRXA 3QZHA 3UDBA 2W05A 3Q2JA 3F7WA 4WNMA 3V3VA 2QNJA 3ELJA 5I3RA 4K8AA 4KKHA 2BDWA 2GCDA 4HGSA 4C4HA 4NYEA 3LQ3A 3DCVA 4IB5A 4O0SA 4QP2A 5CZHA 4HCUA 4M0ZA 5L4QA 5IA0A 4P5QA 4E3CA 2VTHA 4YTCA 3D7TA 3QQJA 3ACKA 3RVGA 1FVVA 3SVVA 4AF3A 2PMIA 1OPJA 1U59A 4UWCA 4YP8A 4FYNA 5T6KA 4O7NA 3QLFA 2E9PA 2WELA 4CFNA 4FGRA 4OTFA 2BR1A 5D7VA 1K9AA 4O7VA 4JIAA 3CJFA 4JG6A 2ZMDA 3BEAA 3NMUF 3MESA 3ZDIA 4EH3A 2Y4IB 2A2AA 4FX3A 4YC8A 4AFEA 1KWPA 2OBJA 4KIQA 2R0IA 5ANJA 4YJPA 4ZY5A 2OICA 1FVRA 3OUNB 4KSQA 4A9TA 5FXSA 3ZRLA 1J7LA 3G9LX 4BTMA 3Q3BA 4BWPA 4R78A 3UYTA 5JZNA 4IVBA 1ZOEA 5C01A 3UIXA 4J98A 3UO4A 3CGFA 3C0GA 3QCYA 3LJ1A 4JT3A 4XG3A 4XG4A 1UNGA 4MBJA 2FSMX 4RA4A 5FP5A 4AGDA 1H24A 1J7UA 4YHTA 4JQ8A 2HW7A 3ORMA 1W83A 4PMPA 1UU3A 4R77A 2ESMA 5LMAA 2CKPA 4OAVB 5CX9A 5D10A 4FK3A 1JNKA 4MXAA 4AT5A 4NKAA 5L3AA 4X2FA 2V62A 2UZDA 1XHAA 1H00A 2UZNA 2R3PA 3F69A 2E9UA 3AC4A 3ORKA 2QR8A 3KQ7A 4GIHA 2O63A 1YVJA 4YTFA 2HXQA 2BIKB 4JDKA 3IK3A 5E91A 5IEXA 3WI6A 1YI4A 1M7NA 2YWPA 4FV7A 3E8DA 1YWNA 4NK9A 4OGRA 1SVEA 5EYCA 3BV3A 3HX4A 3MTFA 1EH4A 3GFWA 4IAKA 2VGPA 4WRSA 5BX0A 3ATTA 2JGZA 3Q6WA 4C61A 5DIAA 4G2FA 2J6MA 5IH6A 5HHWA 4O86A 5KMLA 2QO2A 4ITHA 5K0XA 3W2QA 3E7OA 5AJQA 5AMNA 4KINA 2EWAA 4L43A 3MGYA 3D5UA 3W1FA 3UZRA 3NR9A 4Z16A 4X2NA 4J8NA 2WGJA 3EQPA 5TR6A 3MA6A 4Y95A 1PKGA 3ZUVA 2A27A 3R1SA 3R73A 4USDA 5A9UA 1W82A 2WTWA 2HY81 4LL0A 3TZ7A 5AV0A 4V0GA 3V5PA 4YO6A 1APME 2JBPA 3DBDA 4WUAA 4XX9A 3RNIA 3SXRA 4BC6A 3F2RA 4TYJA 2OW3A 2W1ZA 4FTLA 4PP9A 4EZ7A 2OXDA 3WE8A 1OB3A 4IACA 5HG9A 5CEMA 4FOBA 2VU3A 4QP9A 4BZNA 3QHRA 2ZOQA 4W8EA 1OL7A 4DFYA 5K5XA 2W4OA 3MFRA 4AA5A 3VQHA 4C2WA 3GGFA 4U0IA 1PF8A 1H07A 2C47A 3FHRA 5AV2A 1TQPA 2C5OA 4FG7A 4HGTA 4NW6A 3TNQB 3FI4A 4UX9A 5AAEA 4ZTNA 3SG8A 1YW2A 4L68A 3CQUA 4EK8A 3BU3A 5AAFA 2J4ZA 5JFVA 4EYJA 1QL6A 3R71A 3ZLYA 4ZXTA 3ORTA 4G3FA 5A6NA 4OW8A 2OF2A 2DS1A 5JQ8A 1KUTA 3DXQA 3HP5A 4FV6A 5EQYA 4KBAA 4QMWA 2UUEA 3JVSA 4FNYA 5CU4A 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