3LFCA

Human p38 map kinase in complex with rl99
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
351
structure length
334
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKSQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDSELKILDFGATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSLESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Development of novel thiazole-urea compounds which stabalize the inactive conformation of p38 alpha
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 97
structure length 334
sequence length 351
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lfcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lfcA01
1FINA 1OGUA 3NAXA 3GGFA 4M13A 1GNGA 3D2IA 5FBOA 3EH9A 3M1SA 2E9UA 4IJPA 4L3PA 2QG7A 4L44A 4O7RA 4ALUA 4DYMA 2P55A 2RL5A 3D4QA 4QP9A 3R9HA 3W2SA 3COMA 3WZEA 4YUQA 4UEUA 2WEVA 3OXIA 3Q4ZA 2X9EA 3U6HA 4GUBA 3SHEA 3OCBA 3HKOA 2XKFA 3EQCA 4FTQA 3ROYA 4NU1A 5M06A 4JBVA 5IU2A 4PMPA 5E8VA 3VS6A 4J52A 3E7VA 4YBJA 5CALA 4C3PA 3KRXA 4KD1A 1WCCA 3JXWA 4IBMA 5DI1A 4R7HA 4GMYA 4XG9A 3VULA 4CLJA 4EH9A 2JITA 4BDHA 2KTYA 4D1XA 3ODYX 4U8ZA 5JZNA 1UWJA 3DCVA 3DLSA 4ANLA 3BELA 5HG5A 3T8OA 4BTMA 1OPLA 5DT0A 3Q4CA 5T6KA 3QRUA 2WFYA 4DC2A 3KVXA 4XP2A 5J8IA 4O7YA 2FSTX 2W9FB 4O2ZA 4BYJA 2YIWA 1YDSE 2OZAB 4EHZA 2C6EA 1XBCA 2PVNA 3BZ3A 5HG8A 5HOAA 1PXKA 4U80A 3QZFA 3VIDA 3QCSA 4AZTA 4DFNA 5I4NA 4R78A 2OH0E 2PZYA 3DNEA 4OUCA 1XH5A 4X6RA 5CEIA 3MBLA 3ORKA 5HU3A 5AA8A 1KUTA 4YC6A 3OF0A 4DT8A 4L67A 3DLZA 5EI2A 3GEQA 5M4IA 1R39A 2B9HA 2O8YA 1M7QA 4JG6A 4PTCA 4XG4A 4XLVA 4Y73A 5K0KA 3U4WA 3VUHA 3D14A 2EB3A 4GS6A 3U8WA 5FEEA 3VHEA 1ZYSA 5JRSA 4FVQA 4BTKA 1JOWB 3GQLA 3QKMA 2C6OA 2ZJWA 4C4EA 4BCHA 3MGYA 4UMRA 1KOAA 1H01A 5ANKA 5CEQA 2B4SB 3F3UA 3ZFMA 5BPYA 2PZIA 3P86A 3TL8A 5HHWA 1U5RA 3R6XA 5DIAA 4ZSLA 3N4UA 3Q2JA 1Q62A 3V5TA 1MRVA 3F3ZA 5JFVA 3CXWA 2LGCA 3FMNA 3NRMA 2WMUA 3LXKA 4FKGA 3KC3A 4MBJA 4IADA 2P33A 2YWPA 2CLXA 2RFSA 3U51A 2PMOX 2W1IA 4X2NA 3AOXA 1WBNA 3HV3A 3MFTA 4BR3A 3FWQA 3OC1A 3DXPA 3EYGA 4BIDA 4EK4A 3DK3A 4DE4A 4YO6A 1OITA 4FG8A 2NRUA 4FX3A 4KAOA 4JDIA 5FG8A 3Q9YA 4FODA 2W7XA 3B2WA 3L8XA 5AUYA 3EFWA 4J97A 4V04A 3SD0A 3TCPA 4Y5HA 2PVFA 5CQWA 2R3KA 3DJ5A 3BYMA 4H05A 3O0GA 4E6QA 4IFCA 5FTGA 2PMIA 3EN4A 3IO7A 4JS8A 2W5AA 3LCSA 5ACKA 3HAMA 2PVHA 3JYAA 4K8AA 5GZ8A 3GCSA 5LVMA 4CG9A 2JIVA 5E8YA 4B8LA 1XH4A 4XP3A 4E5BA 5DPVA 4AAAA 3Q52A 1PXOA 3MV5A 3BI6A 3NEWA 3HLLA 3LM0A 3RNIA 5CLPA 1NA7A 1L3RE 2XJ1A 3VBQA 5AIRA 3VO3A 3UOKA 2F7EE 3F2RA 3VBYA 5A6OA 3BGQA 3R7OA 4O7LA 3LXPA 5HCYA 3NPCA 4MNFA 5LWMA 1H1PA 4HGSA 3WF7A 2C3IB 2ZDUA 3RTPA 2A2AA 5HKMA 5A14A 5IMEA 4FV9A 4X2JA 2QR7A 2FUMA 4AZSA 4FTOA 1MQ4A 3IPHA 5AV3A 1JPAA 5CU2A 4AOTA 4BCKA 5JK3A 5LMBA 4GU9A 4GKHA 4DFBA 2ZOQA 1YHWA 5B0XA 3W32A 2YM4A 3O17A 4M97A 5ICPA 3NUPA 2CDZA 3BBWA 3QL8A 3WBLA 3FZRA 3A60A 4LGHA 4F0FA 2OO8X 3O8UA 2BFXA 2OSCA 4RLKA 1G8SA 3FYKX 4GUEA 3BE2A 3UG1A 3LFAA 1JKTA 2WEIA 1OL5A 3NNVA 3VWAA 1PW2A 4WBOA 1URWA 3PY3A 2XH5A 4XRJA 4O0RA 3WI6A 4AW0A 4GFMA 5HD7A 3BHYA 4RWLA 4FV1A 4GFOA 4FBXA 3PE1A 4EK8A 3PJCA 4C4GA 2E9NA 3BIZA 1H8FA 1IASA 2PTKA 3Q9WA 4X7QA 4BZNA 3UQFA 3BPRA 3AGLA 2QOKA 4EKKA 4QTAA 4WKQA 5I9UA 4B4LA 4DA5A 4FV8A 5IEYA 4UMQA 1YOJA 3I6UA 3EHAA 2OICA 2YERA 3KEXA 4RJ3A 4I22A 3EFJA 3QLFA 2C0IA 1S9IA 2VN9A 3C5UA 2BAKA 4G17A 2C6KA 2HIWA 5CNNA 4QP4A 4CVAA 4ITHA 1OKYA 2HW7A 3WARA 3UQGA 3LFQA 3ZZWA 3ORMA 4C57A 5HBEA 5T68A 3O2MA 5K9IA 2IVSA 2X81A 4I20A 4AW2A 5M56A 3TT0A 2H6DA 1PRYA 2Q83A 3AG9A 2C5OA 4PY1A 2R3QA 2QKWB 3ZH8A 4BKYA 3D5VA 4AWIA 2CNUA 4APPA 1AD5A 3O51A 4XV1A 2NO3A 3NIEA 3LLTA 5E8ZA 4UALA 2O63A 5D1JA 4EH7A 1Q41A 5AP4A 4Y72A 2VO0A 3V6SA 5J87A 4GRBA 3PJ2A 3G0FA 1QPEA 3BLRA 4EOQA 3NSZA 4A9TA 4FVRA 4FUYA 5J7BA 4CZYB 4EC9A 4GCJA 5LCKA 4P2KA 2VTPA 3BLHA 4Q5HA 4XP0A 1ZYDA 5TE0A 1G3NA 5CF4A 4TT7A 2XK7A 3JR1A 3NCZA 5FDXA 2YZLA 4LRKA 4EK5A 5AFVA 2XM8A 4YTCA 2CCIA 1O6KA 4CFVA 2V7OA 4RVKA 3MDYA 2W4OA 3WF8A 4V05A 3GU6A 5JGAA 4RVMA 1FGIA 1NT2A 2C3KA 5CS6A 2AC3A 3EB0A 1CTPE 4GJ2A 1XKKA 5CU4A 2W1FA 4BDBA 1RQQA 2GPHA 2VTJA 3LXNA 3R8PA 3DBQA 4OT6A 2PVLA 1XBBA 4XYFA 4FZDB 4AT3A 3BEGA 5I9YA 5LJJA 4N4SA 4QNAA 4PDPA 2XF0A 4NTTA 3BEAA 3FQSA 5AUZA 3OT3A 5IQFA 4J95A 2C5XA 5HLNA 3QYWA 2JBPA 4CQEA 4DEIA 4G6OA 4O83A 3NW6A 3CJFA 3LJ2A 3TIZA 3OROA 2UZEA 4GH2A 5AIKA 4NJDA 2ZM4A 3OWLA 3O7LD 5GZAA 5IA5A 4NSTA 1J1CA 4YURA 3KXMA 5L6OA 1YVJA 1M2PA 4OTGA 2XNGA 5HX8A 3E3BX 5LARA 5BVEA 4FEWA 4FKQA 3RINA 2VTTA 4LGGA 5IH5A 5EDRA 4FSTA 2HWOA 4FZFB 4A7CA 2J7TA 3R02A 4RZWA 4G3EA 4EH4A 4C38A 4I93A 1ZYJA 2FO0A 4ZS0A 1GAGA 3CJGA 1H25A 4YPDA 3M42A 3TKHA 1XQZA 4O0UA 4UMTA 3VJOA 4D2SA 4JLCA 2B9FA 3RWQA 4DH8A 5D7AA 5TT7A 3QX2A 3ZDIA 4D4VA 4H3PA 3IDCA 4LFIA 4MX9A 3V6RA 3F88A 1JSTA 2JKKA 4PTGA 2PL0A 3WOWA 3FMHA 3NNUA 3IW4A 1YXUA 3CTJA 4NH1A 4IVAA 4YZBA 3ANRA 1JVPP 3L8VA 3QTRA 5M44A 5KBRA 4BCIA 3ZHPC 1H1RA 5AR3A 4OTQA 4GT3A 1Y57A 5EYDA 4ZMEA 2DWBA 4IVDA 4OTRA 2PUNA 4S34A 4EOMA 4XG7A 1IA8A 4F70A 4O96A 3UNKA 3W33A 2VZ6A 5AV2A 4I5MA 4KWPA 4AGCA 4I6BA 3PY0A 4BHNA 3NS9A 3BWFA 4RSSA 1PMEA 2YIQA 3E5AA 4DEHA 3LIJA 3PVBA 4MXCA 2YZAA 3MWUA 2R3GA 3SKCA 2QOOA 4QT1A 4JL9A 4PTEA 5KMIA 1JQHA 4BI1A 5CEKA 5ANEA 1YRPA 4EUUA 5EFQA 5CTPA 4ZSJA 3A2CA 3FL4A 1PXLA 2VRXA 4GVAA 3MIYA 1GIIA 5EM6A 2YHVA 4S31A 5E1SA 4CFMA 3CPBA 3COHA 4O0YA 3FKNA 3G15A 4MWIA 4QMPA 4W8DA 2ONLA 4TKSA 4YBKA 5H8GA 2R3JA 2W1GA 3R7IA 2NNWB 2UZLA 3VS2A 1J3HA 1LEZA 3W2QA 1LEWA 3R9NA 4FTJA 2I0EA 1K9AA 1ZWSA 4QYFA 5HTCA 3A8XA 5L6WL 3ZRLA 3UOLA 3N51A 5EH0A 4AN3A 1PMVA 3MIAA 4RFMA 1JSVA 1YI6A 3FY0A 3P0MA 3BGZA 5J95A 4NKAA 4BDCA 3F3VA 3P7AA 2I40A 3T9TA 5JFXA 3HYHA 3RZBA 3ALOA 4R8QA 4AGWA 3V8SA 5B2KA 2X6DA 4E7WA 4Z9LA 4K9YA 4ACCA 1CKJA 3Q32A 4JQ8A 3WF6A 3TTIA 4I4EA 2IZUA 4L3JA 5A46A 2X4ZA 3CPCA 4ZTHA 4MH7A 1PMUA 2VNWA 5BUEA 4K2RA 3OP5A 3LKMA 2I0HA 3ZTXA 2B1PA 5AEPA 3PA4A 4I92A 4LOOA 3R73A 1LP4A 3D5WA 4U43A 3GBZA 4YZMA 2JC6A 3BYVA 2F49A 3ZLWA 3PVWA 2UW0A 4DHFA 3R7GA 4NIFA 5ANIA 2W96B 5J1WA 3SXFA 2R64A 3MA6A 4AXAA 1VYWA 5B7VA 3SW7A 2BRGA 2EU9A 4G6NA 3VNTA 1YI3A 1GOLA 1W0XC 3AMAA 3FLYA 3UVQA 1ZMVA 3CE3A 5IUIA 4NT4A 1KV2A 1YXVA 2PHKA 3A7FA 3FBVA 3Q9XA 4KKHA 4AX8A 4F7SA 3VUIA 4KBCA 1JLUE 1G5SA 4S33A 4CCUA 3SAYA 4EEVA 4TYHB 2OJFE 2VD5A 3QXOA 4HYUA 2O64A 1XH6A 3W2RA 5HEZA 4BCOA 4NW6A 4ZY6A 3WF9A 5EW3A 2VX3A 2WD1A 5CU0A 1J7UA 1XH8A 4FTNA 4YZNA 5HO8A 3QQFA 3TNHA 2W99B 4FIFA 2OIDA 4XBRA 4CEGA 4CFWA 3SW4A 3OTVA 3AC8A 3RK7A 4DCAA 5AAFA 5DT3A 1DS5A 2CKEA 3WIGA 2XP2A 4FVPA 2O65A 4NEUA 4D4SA 3FLQA 3I60A 1PXMA 3MFUA 4R1YA 3QU0A 3TNWA 4II5A 4CGAA 2PVRA 4RX8A 3DS6A 2ZV9A 4RJ6A 3QCYA 3EJ1A 1Q61A 1BI7A 2QHMA 4QP8A 1FQ1B 3OOMA 1W98A 2BDWA 4PPAA 3F5GA 1UWHA 5GNKA 5AP5A 5C4KA 3RPSA 2C5NA 2EXCX 1JKLA 1CSNA 4IIRA 1UA2A 4GT4A 4IB0A 4IX5A 3WZUA 2WKMA 4RZVA 3CC6A 3VS0A 3L1SA 2J0IA 3UP2A 2IW6A 3MJ1A 3UIBA 1IAHA 3CEKA 2W1EA 3LPBA 4XV9A 3QQJA 2E9PA 4FIJA 3TZ9A 1P5EA 5I3OA 4FSRA 3HDMA 4C8BA 4H39A 2DQ7X 4NCTC 5DVRA 2I7QA 2OG8A 3FMMA 4NM7A 4USEA 4USFA 1BLXA 4IM0A 4Y8DA 4ANBA 4DFYA 4L46A 1K2PA 4OTHA 3R8VA 4RBLA 3TNIA 3MFRA 4NFNA 5IUGA 4D1SA 5AADA 3LE6A 1OIQA 4BDFA 4O27B 4XJ0A 1QPCA 4E6DA 1NXKA 4DBXA 4FKSA 3AD6A 4K77A 3QTZA 1Y91A 3OCSA 4BDKA 3DY7A 2FSLX 4EL9A 1OBDA 2F2CB 4B99A 3OS3A 3U55A 5CAOA 1QPJA 2W1HA 2BUJA 4E4LA 4YHTA 3O8PA 3TIYA 1WVWA 3ORPA 3RZFA 5CF8A 1A48A 4KRDA 4ANQA 5FP5A 3EQFA 4M66A 4MAOA 4PV0A 2BALA 2XKCA 2WXVA 3OW3A 2XYUA 5IA1A 4YJQA 1M17A 3R83A 2CKPA 3CKXA 3GVUA 3SVVA 5CAVA 3DTWA 3SXRA 4I0TA 4PPCA 4WG5A 2VTMA 4ZLZA 4MXYA 5FQDC 3A8WA 2OXYA 1MRUA 4N6ZA 4FEUA 3L9PA 3R22A 3GQIA 1AQ1A 4L00A 4XHKB 4D55A 4CKIA 2CKOA 3QTQA 4ZLOA 2GFSA 4F09A 1KV1A 4JQEA 3RI1A 4MXOA 4XCUA 4YZDA 3DKOA 4ZTNA 2YDIA 4C34A 4D2WA 4D5HA 3U6IA 1SZMA 2XNMA 3E92A 3F61A 3HEGA 3CQWA 3NNWA 3LCDA 2PVKA 3KB7A 4FT7A 4X3FA 4FF8A 3UVRA 4IAIA 2WTWA 5CXZA 3DBCA 3E8DA 5ETFA 4HZRA 5DRBA 3EOCA 1OM1A 2C30A 2ZMDA 1UU8A 3AC1A 3OBGA 4JG8A 3CCNA 1YXTA 4MNEA 4PMSA 3TTJA 3CTQA 3UZRA 5JZJA 3F2NA 2X7GA 4YHJA 3MS9A 3BBTB 4NIFB 4C0TA 4FKUA 3UO4A 5FM2A 3LQ5A 4UWCA 2BKKA 3LCOA 4I4FA 4FE2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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