2IW8A

Structure of human thr160-phospho cdk2-cyclin a f82h-l83v-h84d mutant with an o6-cyclohexylmethylguanine inhibitor
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
298
structure length
297
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEHVDQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
publication title Dissecting the Determinants of Cyclin-Dependent Kinase 2 and Cyclin-Dependent Kinase 4 Inhibitor Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
total genus 83
structure length 297
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2006-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2iw8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2iw8A01
4DHFA 1UWHA 2JITA 3IW5A 5AR3A 5M51A 4DEBA 4FKOA 1XBBA 2VGPA 3DY7A 4K9YA 3HMOA 5CAOA 4U40A 4S32A 2CLQA 4EQCA 3IOPA 3LFEA 1WCCA 4QQTA 5LMKC 5CNOA 4CTCA 1OPLA 4OTWA 3WI6A 3TDWA 5A3XA 3SXSA 2J90A 3C4XA 2VTQA 2O5KA 4ZJIA 3BYMA 1W84A 2X8IA 4LM5A 2ITXA 2QI8A 4DFYA 5ANJA 4EK5A 3TKHA 2VZ6A 1BX6A 2XM9A 3EQPA 4KS8A 4PMMA 3CCNA 3ORXA 5HI2A 4RIWA 3LHJA 5HBHA 3A99A 4P5ZA 4FIHA 2XKFA 3ETAA 4FV3A 4H39A 3HNGA 2XYNA 2OXDA 5AV1A 4NIFB 1WAKA 3F2NA 2Z2WA 1WVWA 2QNJA 3SGCA 3QQKA 2VGOA 5JH6A 4RWIA 5GNKA 3S1HA 2GNIA 4NKAA 4F9WA 4LYNA 5CEQA 2FYSA 3E8CA 2UW0A 3TV7A 3FBVA 2A27A 2WEVA 5KZIA 3OCSA 2UZUE 2GNJA 4C4JA 3OXTA 3NW7A 4J99A 4TYHB 1H1PA 4QP9A 3UTOA 3FL4A 4GFOA 5FXQA 4BGGA 3H0YA 1Y8YA 5TR6A 4Y73A 2XNBA 3BWFA 5HORA 5BVWA 5BVDA 3E8DA 3QL8A 4IVDA 4PQNA 5HO6A 2CJMA 3ZYAA 4C59A 4A9UA 2P4IA 2VD5A 2WMUA 4QPAA 4ANQA 4E8AA 2PZYA 3FLQA 5AR2A 2XMYA 2EWAA 3D4QA 5TKDA 4L44A 4ZTLA 4JDJA 4BRXA 3PIZA 4PTGA 4TWNA 3VBXA 5KMMA 2XBAA 3F5UA 4EHZA 3FXXA 2PHKA 5FM2A 5M56A 3HUCA 3FC2A 4QP6A 4EOJA 4EBVA 2UZTA 3EMGA 3ENMA 4QMLA 3DXNA 4GYIA 5HBEA 4H58A 4PNIA 3C5UA 2Y4IB 5EW9A 4HZRA 3NW5A 3JY9A 3OEZA 4BWXA 4PMPA 3HAMA 3GU4A 4X7QA 3DAKA 4NL0A 5A9UA 2QVSE 4WBBB 3RTPA 3RPOA 4PPAA 4ZXTA 5LARA 3UIBA 1PYXA 4NW5A 1YXUA 2R3MA 3O50A 3OXIA 3ROYA 2XVDA 3UGCA 2BRNA 5AX3A 2OI4X 4YJQA 2ZV9A 3G9LX 1A06A 4C7TA 3D0EA 4L9IA 4UXLA 5KZ0A 5KKRB 3IDPA 2G2HA 2NRYA 3PRFA 4EOKA 4OGRA 5GHVA 3GENA 1SNUA 2VTJA 4K6ZA 3MS9A 3NUSA 4O7ZA 4X2JA 2WQBA 4GT4A 3A8XA 1OBGA 2OJFE 1OB3A 3I5NA 3I0OA 4JBQA 4RIYB 4Z7GA 3QCYA 2HZNA 4FTNA 2WO6A 3BHYA 4N0SA 4KRCA 3M2WA 4WG5A 1IR3A 3C51A 3GI3A 3R7YA 4DITA 1YWVA 1JSUA 4OBQA 1AGWA 4CKIA 4ZAUA 4UN0C 2QU6A 3BBTB 3OOGA 3PVBA 5AP0A 3WF8A 4BCGA 4FEUA 1WBOA 1ZZ2A 5L2WA 4YJPA 5AP1A 4D58A 3LXKA 3QRUA 3PDTA 1PXMA 3MY1A 2BRBA 1Y91A 3R1QA 2YJSA 2O3PA 4Q9SA 1K2PA 2E9OA 3VS3A 2R3OA 3QLGA 3BHVA 4CNHA 4IB3A 4I22A 4IAZA 3ZO3A 3CE3A 4O38A 3TIZA 4FODA 3WIKA 2CNQA 4USFA 4XNEA 2W4JA 3VBVA 3E5AA 1OL7A 3GCSA 5CF5A 4RZWA 5ACBC 4DH5A 2E2BA 5C8KA 4IE9A 5HIBA 4CEGA 4ZMFA 4FEWA 5GINE 3SD0A 3R30A 4CCBA 2F49A 2WMTA 3MA6A 2QO2A 4QYEA 4Z55A 5DYJA 4UYNA 3E62A 5F1ZA 4GH2A 2FVDA 3SDJA 4F09A 3VRYA 1PKDA 2QOCA 4WSQA 4XRLA 1QL6A 2CSNA 2ZM3A 5HVJA 3PP0A 4JLCA 2R3GA 3FKNA 4X3FA 5H3QA 5AAFA 3Q6UA 1UU7A 3FPMA 4RX9A 5AM7A 3LJ2A 4HCVA 3VVHA 5EFQA 3I7BA 2UW4A 4OBPA 2WOTA 4N4SA 4BDHA 4O0XA 4I4EA 3RJCA 3ZDIA 3DFCB 5D11A 1FGKA 3OWJA 5ANIA 3FAAA 4ZOGA 2C6MA 2GS7A 2PMIA 5TE0A 3HEGA 2A0CX 2UZBA 3R2BA 5LVMA 3I1AA 5F94A 2YM3A 3PSCA 4YBJA 3W1FA 3PIXA 3FMEA 3F3TA 2H96A 2VTTA 4XCUA 4J97A 4Y72A 4EHEA 4AG8A 2X1NA 4J8NA 2HENA 5E8TA 3ZUUA 1GIJA 5IQCA 3ZU7A 2ITPA 3HV5A 2XKDA 4L6QA 4DCAA 4B8LA 3R9NA 5BMMA 4BC6A 4EWQA 3NGAA 4RRVA 4W4VA 4ALWA 1PXPA 4JIKA 4U5JA 1OUKA 5AV2A 5FTQA 3EWHA 5DT0A 4C38A 2WTCA 4EH3A 1URWA 3ZM4A 5L3AA 2YM7A 4U97A 5CLPA 1YQJA 4FL2A 4ACGA 5HNGA 4EOPA 3ZFXA 3D5UA 2OGVA 4E93A 2VWIA 2BZKB 4XV2A 4LUDA 3LOKA 1VR2A 5HG8A 1KE8A 4J96A 2PVJA 4HCTA 3BYVA 4L8MA 2O64A 3G5DA 4HVSA 3KRWA 3LFDA 1J3HA 2C1BA 2JKQA 2W96B 4FTTA 3VUDA 4EEVA 3U54A 4MF1A 2XNNA 5TF9A 3NVMB 5JEBA 5DFPA 1BLXA 4JR7A 4AN3A 4FTOA 4Q9ZA 3FPQA 1ZZLA 4ASXA 2ZM1A 3IGGA 4IZ7A 5ACKA 5FTGA 3ZC5A 2WMQA 1RJBA 4QD6A 5EDPA 5EOBA 3AC5A 5FP5A 3UOHA 4M68A 1URCA 3SC1A 3DQWA 4MXYA 2ZB0A 4G3CA 4OT5A 4N6YA 3TZ7A 4YP8A 1F5QA 1V0PA 3NR9A 3B2TA 2IJMA 3QGYA 5BMSA 2C6TA 3Q04A 5DRBA 2IZRA 4CT1A 2XUUA 5IQHA 2UZNA 1QMZA 3RI1A 1F0QA 1APME 3E63A 4NM0A 1JKTA 4OTQA 3QRJA 4BICA 4TNDA 4D0XA 3CC6A 4W8EA 2GNGA 3NIEA 4RX8A 4M84A 4CFNA 2NRUA 3BLQA 3I5ZA 3PXRA 4F63A 5AFVA 1H25A 4IDTA 5C4KA 4E73A 3QKMA 2ITQA 3RCJA 4LGGA 4QTDA 2OZAA 2BCJA 4DA5A 1JKLA 2X4FA 5FBNC 5AUXA 3I4BA 4TYJA 5A4LA 3IW8A 3MPMA 5HO8A 5J95A 2UZVA 3F9NA 3PZHA 4IZYA 3QC4A 3QUPA 4LI5A 5JSMA 3L8VA 3PTGA 4NFMA 4DG0E 5G1XA 1DAYA 5BVKA 3LMHA 1WBPA 3VF8A 3C0HA 2H8HA 1JSVA 5I9WA 3LQ3A 4CVAA 4QMUA 4BTJA 1GOLA 4IX5A 5TO8A 3S4QA 4BB4A 4CLJA 2JLDA 3K5VA 5IH5A 4U7ZA 4WNPA 3TTIA 3FSKA 2QOOA 3P23A 4KAOA 4RVKA 2VTMA 4XLVA 5H9BA 3RKBA 3A7JA 4BCJA 4Z3VA 5IQEA 4LOOA 3O96A 5EI6A 4AE9A 2KTYA 4OR5A 3R7UA 4HZSA 3RAKA 1WBSA 2IVVA 4FEVA 3NPCA 1BKXA 2W1ZA 3HLLA 3RPYA 1U46A 4GVAA 1Z5MA 2YA9A 4IMYA 1E9HA 4QRCA 3NX8A 3ZBFA 4C62A 3PXQA 3FLZA 2UW9A 2PVRA 3C1XA 4I0TA 3LAUA 4FTUA 3A7FA 3DGKA 4UWBA 5H8EA 4MKCA 4J7BA 2ERZE 3F66A 4XX9A 2PY3A 4NWMA 4D4YA 5LCJA 2QO7A 3FYJX 4MF0A 4M69B 2C5YA 2WTVA 2WIHA 3F2RA 3TNIA 3VUTA 4C57A 2V62A 3R1SA 4B4LA 3MFRA 3CR0A 3KMUA 5LJJA 1S9JA 3PJ2A 2WB8A 5H8GA 2W5HA 2LGCA 4E3CA 4M97A 3EL7A 4E7WA 1CDKA 2UVZA 2GHMA 3ORNA 2YWVA 3P1AA 4P4CA 5FUTA 1YHVA 4O0TA 4I94A 4BDGA 2EXMA 2ZJWA 2F7ZE 4FBXA 4FSRA 4FIJA 4EH6A 4FA2A 2C47A 3R7VA 4AFJA 2WEIA 3HRFA 3CTQA 4DH3A 3EQDA 1GZKA 3JPVA 2C6DA 2OXXA 2W9ZB 4PDPA 5IA3A 4FEQA 3C4EA 5J5TA 5EQYA 3FI8A 1V0OA 1SMHA 4H1JA 3V6RA 3IECA 1YDSE 3MH0A 4L3JA 1GAGA 2J6MA 3T9IA 4IB1A 4EHVA 5BQ0A 2X2KA 3KMWA 2VTAA 2HIWA 5DBXA 1U5QA 1T45A 4I24A 5B2MA 1LUFA 3L8SA 1U5RA 4YGAA 4I5CA 2XBJA 3ALNA 3DJ7A 2AUHA 4FV4A 4OTDA 3V5WA 4D2WA 4HVHA 3AGLA 1XBAA 3LFQA 4GMYA 3AGMA 1MQBA 4GUEA 4BY9E 2OBJA 3MBLA 2O0UA 4IHPA 5IA1A 5CSXA 4AU8A 2HZIA 4I6BA 3MTFA 5AR8A 4ACMA 4XP2A 4O7WA 2WTWA 2CLXA 2Y7JA 5CEMA 1REKA 3D5VA 3COMA 3U6IA 4HGTA 4XP0A 5LCKA 5JK3A 3MH2A 1NW1A 1OVEA 4L42A 4NM3A 1YXXA 4BYIA 4OBOA 4R7HA 3O8TA 2ERKA 3OC1A 1LPUA 4G2FA 3C4WA 3F3UA 4C02A 2C5VA 2OF4A 4G5PA 3DBDA 4E5WA 2QURA 4AP7A 3UYSA 3PYYA 5L4QA 3DB8A 4AS0A 4F0GA 4BYJA 4A4OA 2PWLA 3DPKA 4FG8A 2QOLA 3WILA 2RFNA 4DGOA 4C8BA 3ZXZA 5LMKA 4M14A 2ZM4A 3BU3A 4QP8A 4RZVA 2R3HA 3LKMA 3OTUA 4CMUA 3BV3A 5D41A 4ASEA 2XEZA 4H36A 2F9GA 2C5OA 3QYWA 5EW8A 5BVEA 3U6JA 4P90A 3F3ZA 4OTPA 4RVMA 3RK5A 3ZFMA 2C68A 3NNXA 4YMJA 4X6QC 3UO5A 5HD4A 3PY1A 4BIBA 4EKLA 1JLUE 3TT0A 3K54A 5E7RA 3K3IA 4XYFA 3OFMA 4A4XA 4F70A 4DGMA 4EOSA 3BPRA 3EQFA 2X8DA 4FTQA 3HDMA 2YCSA 4RIXA 4F99A 3G33A 4KIKB 4AN9A 4ALUA 5A6NA 3VS7A 4EUUA 1XJDA 2C6EA 5ICPA 4DF3A 2J9MA 2C5NA 3PJ8A 4GT3A 4GU6A 4KRDA 3VC4A 5CAVA 3RAWA 3WE8A 5L2SA 2BIKB 2HCKA 3F3WA 4MD7E 5E8VA 2B9HA 5K0KA 4FGRA 4BI0A 4M0ZA 5H8BA 3DDPA 5DA3A 1OPJA 3ZONA 3NYNA 1Z57A 2OU7A 4JJRA 4AA0A 3NNVA 1WBTA 3PY3A 2Y6OA 4IAKA 4QYFA 3TTJA 3O17A 4O0SA 4FYOA 3IW4A 5A46A 3SKCA 1X8BA 5FXRA 4R6VA 3POOA 2XH5A 4M8TA 2R4BA 5HNIX 2XK4A 3UC4A 5CU4A 5BYLA 3O8PA 5TOZA 4F9BA 4BGHA 4ZTRA 1M52A 3TNQB 3UODA 4HW7A 4ARKA 4LFIA 4I41A 2YACA 3VW6A 4BBEA 3DKFA 1JSTA 5EOLA 1PF8A 4EKKA 3ENHA 4FSQA 1J7IA 2CGUA 4ZTHA 5L8JA 4ITHA 4QTCA 3ITZA 4FK3A 4ASDA 4RJ7A 3E7OA 2VX1A 5CSPA 2QOQA 4NJDA 3REPA 4ZY4A 2JIIA 3R6XA 4D4VA 3ZM9A 3C4FA 3QZGA 4YUQA 3C4CA 4OW8A 3UO4A 5BVNA 4Y5HA 3OVVA 4H3QA 4BN1A 4UB7A 4J98A 5IA0A 4PF4A 3DDQA 5HCXA 4G9CA 4RX5A 5DVRA 3OW3A 4GU9A 2FSOX 2UW8A 3AT4A 3DAJA 4TZRA 3MWUA 3CKWA 3D94A 4C4IA 1ZOEA 3ZLSA 2PL0A 4MNEA 3ZRKA 2X6DA 2WNTA 3VHEA 4MCVA 3FHIA 3CTHA 4GRBA 4CFUA 3L8XA 4JIAA 5C9CA 2PE1A 3D2IA 4ZMEA 3LFBA 2PVYA 3QD2B 4EYJA 2JDRA 3JUHA 1W82A 4IFGA 4K77A 4RQVA 5HE2A 4EI4A 4CV8A 3LMIA 4LGDA 2XEYA 3HMIA 1GNGA 3JVRA 4HGSA 5HQ0A 3HYHA 1E1VA 3DJ6A 4QP2A 4O7RA 3M42A 1PMVA 4BBFA 4HGEA 3R02A 2UUEA 2AC3A 1XH6A 5L2QA 4AW2A 3BHUA 2O63A 1HOWA 2VWUA 5I9VA 4ZLZA 2FO0A 4FTCA 4ITIA 2QKWB 2XNEA 3ZO4A 5KCVA 1M2QA 2VTRA 4NYEA 3RNIA 3W32A 4N6ZA 3AC3A 3NAYA 4FOBA 4RA5A 4G6OA 3H4JA 4QOXA 1Y57A 4D5KA 2PE2A 2Q0NA 2PTKA 4U9AA 4JS8A 3FQHA 3MW1A 2QOBA 4BR3A 1CMKE 4C2VA 1TQPA 5HZNA 2VO3A 5A54A 3HMPA 3E88A 3FUPA 2XJ0A 3ZEWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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