3R04A

The discovery of novel benzofuran-2-carboxylic acids as potent pim-1 inhibitors
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
271
structure length
271
Chain Sequence
ESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title The discovery of novel benzofuran-2-carboxylic acids as potent Pim-1 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase pim-1
total genus 81
structure length 271
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r04A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r04A01
1XBCA 3SOAA 4W4XA 4UXLA 5JFVA 4AOTA 3T9TA 2NRYA 3TUBA 4R7BA 3UVRA 4O96A 4AT4A 3A61A 3BYUA 3VS3A 4EH8A 4QMXA 2PZPA 4PWNA 4HOKA 4IVAA 1ZZLA 4PL5A 1APME 1FMOE 2GDOA 2W96B 5C4LA 2PMIA 2W1FA 5IKWA 5KX8A 3KRJA 3DBDA 4DFYA 5AV2A 2QOCA 3D0EA 3HMMA 2PU8A 3NW5A 3SV0A 2REIA 3OOMA 5KMKA 4DT9A 4BZNA 4ASXA 3FLYA 3KMUA 3FMMA 2VTJA 1K3AA 3TV6A 1SM2A 5EM7A 4ZSJA 5DRDA 5H8GA 3RZFA 4C2WA 4UMUA 3A7HA 4LMNA 3FDNA 1JWHA 1P4FA 4I24A 4AP7A 2YDJA 2R0IA 4U81A 3IQ7A 2WQBA 4CFVA 4GS6A 2FSMX 1MRVA 4L68A 3S4QA 2ZV9A 4O0VA 1P2AA 4OTWA 2B9JA 2QOLA 5GJFA 1DAWA 4E5BA 3DZOA 5EYDA 5F20A 4U3YA 5AR3A 3UNZA 3VS1A 3KULA 4RFZA 5I4NA 3TUDA 4KBKA 2BILB 3UO6A 4EKLA 4HVIA 2GNHA 1KV1A 4QMNA 3KREA 1ZLTA 4R1VA 1W83A 3KF7A 3CS9A 3ZFYA 3G9LX 3GFWA 4ANLA 1XWSA 2OF4A 5CSVA 2HW7A 3OTUA 1WZYA 3GBZA 5AADA 4FF8A 4JIAA 4DN5A 1UWJA 4DG0E 5A6OA 3R8MA 3KRXA 4W9XA 4QMOA 3DK3A 4B9DA 5M09A 2PZRA 3VUDA 4Y85A 4RMZA 4GRBA 3SQQA 5AX3A 2IW9A 5AM6A 1Y6BA 3S1HA 1OKWA 2FSOX 4ACGA 4U8ZA 3QTSA 5HLPA 2ZM3A 3UP7A 2HZNA 1U5RA 4R5YA 3BEAA 3GOPA 4YJNA 4CT2A 5LVNA 4FOBA 3NSZA 4E6DA 4X2JA 5LCJA 3H3CA 4UV0A 4R78A 5IDNA 2W9ZB 3CEKA 1VYWA 3DPKA 2JIUA 2XKEA 3V8TA 2O5KA 5CVFA 2OZAB 2GFCA 4DE4A 1ZYLA 4G3DA 2J0KA 3OVVA 5GZ9A 5TR6A 3D5WA 5IEVA 1JOWB 2F57A 3IECA 2FSLX 4UYAA 2CMWA 1G3NA 3SOCA 2XYNA 3LXKA 3W8QA 4GKHA 2YJRA 3K3IA 2BRHA 3QA0A 4L44A 4CVAA 3JY9A 3ZDUA 4JX7A 2ZB0A 3N9XA 3SRVA 3DJ6A 5I9YA 4HGSA 4TYEA 5K5NA 5CEKA 4A4XA 4C62A 4HVHA 4IX5A 3ZLWA 3PRFA 1PXLA 1ZOEA 2PMNX 3F61A 4DEHA 4CQEA 4TRLA 3V8WA 5HNBA 3E88A 3DKGA 4FKWA 5HTCA 5BUJA 1W0XC 4OTPA 3WZUA 2BDJA 3MY1A 4BICA 2XK3A 2JKKA 4RC2A 2RG6A 5B2KA 3P78A 1JKSA 3D5XA 4GL9A 4I6HA 4D4RA 3OEZA 2FSTX 4YJUA 4YZDA 1WBOA 2Y0AA 3C4EA 3TCPA 3EH9A 4C4JA 4M67A 4OUCA 4CTCA 3AOXA 4WSYA 3KRLA 4KWPA 3CPCA 4ACMA 3T9IA 1JKLA 2WKMA 3NUSA 3VJNA 5CF8A 2GQSA 1GZKA 4MX9A 3G6HA 4KD1A 4HCUA 1BLXA 3GP0A 4EOLA 4YO6A 4G3GA 4P4CA 3TJDA 2R3MA 3GFEA 5F1ZA 3P9JA 4IACA 3CTHA 3R1QA 5DT4A 2ITVA 2OBJA 4ACHA 2V7OA 4C38A 2VO3A 3FYJX 3P79A 4IJ9A 3BLRA 3ZO4A 3VF9A 3B2WA 4D5KA 1NY3A 2XUUA 5EHYA 3SXRA 1R0EA 3I5ZA 3QGYA 3DFAA 5CY3A 3RMFA 3B8RA 4OT6A 4QTBA 3FI4A 5B2LA 4FTQA 3FLZA 3KXHA 3SA0A 4KIKA 4NTSA 3ZDIA 2RGPA 3E8EA 4WO5A 4F09A 2V5QA 4WNPA 3P86A 3COHA 5AP6A 4BCOA 4FV6A 2IJMA 1FGKA 4LL0A 3BCEA 4QMWA 4A06A 3CTQA 1IASA 3QQJA 4RQVA 2PVJA 4QYHA 4MNFA 4MCVA 2WIHA 4BHZA 2R3LA 3OXTA 3NNXA 2GS6A 4BFMA 3R9RA 2OIDA 4IM2A 4FKGA 5KO1A 4ZSLA 3IW7A 3H0YA 3ALNA 2QR8A 4IAKA 3EN4A 4ACCA 4E4NA 1H24A 4GK3A 3HRBA 3V6SA 4BVUA 4KUJA 3EQIA 3RPOA 3QL8A 3BIZA 1B38A 3QLFA 2ERKA 2YEXA 2YM7A 2ZM1A 5EDPA 5E8TA 3GCQA 4O1PA 2OH4A 1XKKA 4AOJA 2VTMA 1RQQA 4TW9A 4XHKB 5TT7A 3E5AA 2XRWA 4GVAA 4WRSA 3UODA 4HYSA 2ITQA 2Y6OA 2C6EA 3VS7A 3LLAA 4FKUA 4OAUC 3UNKA 2ZJWA 3PXRA 3HKOA 2XBJA 5AIRA 4YLJA 2HIWA 3LMGA 3FJQE 5FBOA 3NS9A 2G2FA 5HD4A 4XP3A 3NLBA 5DIAA 4YJVA 1OIQA 5EYMA 2OJGA 3P7CA 2PE1A 3FLNC 1YXUA 3MIAA 2F49A 4K2RA 4NFMA 2XS0A 4FKLA 3RINA 3IOKA 4RVTA 5EDQA 2PTKA 3S3IA 3NUNA 4G2FA 1Q5KA 3F5XA 3A99A 3KRRA 4BWPA 5IMXA 3U87A 3RAIA 1R1WA 3C4FA 4I21A 3TV4A 3IW8A 4F6WA 2Z7QA 2G01A 4CV9A 5D41A 3HLLA 1L8TA 2ITTA 4EQMA 3BYOA 2W5BA 2XYUA 3ATSA 1ATPE 5L4QA 1OZ1A 3WF9A 1G8AA 4R3PA 5IMEA 4J8MA 3KA0A 2O2UA 3JPVA 5I3RA 2XNBA 4MXZA 3SDJA 2XNPA 3QXPA 3NW6A 4QYEA 3ZUUA 4S31A 4HPUE 4RC4A 1XJDA 4TWOA 3WIGA 2Z02A 5BMMA 4YU2A 1QMZA 2BCJA 4U41A 4NWMA 4NIFA 3FY0A 5DT3A 4EQCA 4FIIA 2W7XA 3IGOA 4HCTA 4WBOA 4CYIA 4J7BA 4BIDA 3MJ2A 4N6YA 4QYGA 3VW8A 4BGQA 4V05A 4FZAB 2CKQA 5EW9A 2JFLA 5IA2A 3LM0A 3ORXA 4ZTRA 3COIA 2XNOA 3FUPA 2J5FA 4OTQA 4YHTA 4CSVA 4E3CA 3Q9ZA 4Y46A 2VX3A 5BVEA 2WMWA 3TIYA 5TO8A 3W16A 4DCAA 4RJ6A 3O23A 3ZBFA 3U55A 4EOOA 3WI6A 4MNEB 4FNWA 4FG8A 3RBWA 4OBPA 5HX6A 5E8VA 1OIYA 2CLXA 2Y4IC 5M4IA 2V0DA 4RT7A 2WTIA 4PTEA 5FM2A 4FKRA 2QOIA 5A14A 2NPQA 5HLNA 3RHXA 3PWYA 1DM2A 2XRUA 4YSJA 2OFVA 2R0UA 2WMSA 1B39A 3CBLA 2QKRA 3JUHA 1WCCA 3F3TA 4NFNA 5E8YA 4C4HA 4ENXA 5CZHA 3G0EA 2CCIA 3LQ5A 4FZFB 2PWLA 4JOAA 2WHBA 3SHEA 2UVZA 4JJRA 4RIYB 3NW7A 3CJFA 4BCQA 4MBJA 4YLKA 4G1WA 4LUEA 5AR2A 3W18A 3SLSA 3F2AA 4D28A 4J96A 2Y6MA 2F7ZE 2JDSA 3LCOA 4GFOA 4EWHA 3V6RA 4EOKA 4F1OA 2FB8A 3PP1A 1Q8YA 2J4ZA 3R7IA 2UZUE 4FTAA 5EYKA 4FV0A 1R78A 5HD7A 4C4IA 4O38A 3ZC5A 4F70A 4FMQA 3FI2A 1KUTA 2I0EA 1YWNA 3HA6A 1W8CA 5J5TA 3DXPA 4FV7A 3U8WA 4D2SA 5FQDC 2UZBA 4FUXA 2WTCA 4GJ2A 4R1YA 4CV8A 4JNWA 5HOAA 3PY3A 2XIZA 1H8FA 1YHSA 2F7XE 2R3HA 2WU6A 4XRJA 3N4VA 2C6DA 4NJDA 2UW0A 3II5A 4O0WA 3PIXA 4M13A 4DAWA 4TNDA 3PRIA 3M11A 4I93A 4J99A 3RALA 4AN2A 4JRVA 3RZBA 3HAMA 2OJIA 3QXOA 3LVPA 4HPTE 5I5ZA 4OTGA 3ROCA 2I0HA 3EQGA 2X7GA 2BAQA 1G5SA 3FYKX 3VUKA 3ZSIA 5DE2A 4DFLA 1A48A 3PSBA 1LEWA 1PKDA 2JFMA 4L01A 2B4SB 2XK8A 1NVQA 1YI4A 2QO7A 4CRLA 2ZM4A 1MQ4A 3KMWA 2RF9A 2XP2A 2PZYA 1TQIA 3GEQA 5T68A 3UG2A 4C02A 2ONLA 3LFDA 2JKOA 1FMKA 5HTBA 5DR9A 5IG1A 1J7LA 4IIRA 1RJBA 2IVUA 4BZOA 3H9FA 4Y95A 1BI8A 3VBXA 3U6HA 5M07A 1OBDA 3NWWA 2CKEA 4IWOA 2YIWA 4QPMA 5ANKA 4D0XA 1M14A 2QG7A 1OIRA 3PJ3A 4MD8E 4Y5HA 4ZTHA 1WFCA 5DT0A 3LOKA 4CZTA 3LM5A 4EC8A 3WF6A 5L6OA 2CNQA 4S34A 1PW2A 1VYZA 2VZ6A 4WNKA 5HTIA 2B52A 3FI8A 1ZY4A 1ZYJA 3Q04A 3NX8A 2Y8OA 3HDMA 3BI6A 3V5JA 2JKMA 3DCVA 5HVJA 2JDTA 4H05A 4NL0A 4D1ZA 4O82A 3G5DA 3FL4A 4LFIA 5JEBA 3FMDA 2VV9A 4U97A 3HRFA 4DCEA 3FXXA 3GU6A 2WEIA 2XCKA 4XV2A 4B8LA 4HGLA 4GIHA 3R30A 4PP7A 3MH3A 1I44A 3VQHA 4C34A 4YO4A 1REKA 1PXPA 1PMUA 2IWIA 3FMEA 4GW8A 4JBOA 4AGWA 2BTRA 1H1PA 5EHLA 4JRNA 4TN6A 3N51A 3OC1A 4TPTA 3RPYA 2YDKA 2R7IA 3W1FA 3OS3A 4ZJVA 4I0SA 4CD0A 1PMNA 4QNYA 1YOLA 5I9WA 1YKRA 4FT5A 4O0SA 5CAVA 5CI7A 1UNGA 3A7JA 3JVRA 4IW0A 4PP9A 4G9RA 4X3JA 5G1XA 5K3YA 5CTPA 4L42A 3UIUA 3FMKA 3FKNA 3WILA 2CJMA 4TWPA 4ANNA 4FG9A 2F7EE 2C47A 3PP0A 4FTNA 1F0QA 3U9NA 2ACXA 3P4KA 3UVPA 4D2WA 1BX6A 5AUXA 2QCSA 1K2PA 1H25A 3PE2A 5ACKA 4DTBA 3EQBA 4PPBA 5DOSA 4EK3A 1U5QA 3BLHA 5HG5A 1H1SA 4O7NA 3OY1A 3VS0A 5EQPA 3DTCA 4CQGA 5C03A 5HG9A 4WKQA 3MWUA 4FV1A 2YAAA 4BI2A 3BU5A 4FSYA 1YI3A 5EKOA 3GENA 3CCNA 4I5MA 5I9ZA 2BRGA 4RA5A 5J7BA 4W9WA 4NCTA 4G5PA 4S2ZA 3K54A 3ZLYA 2P0CA 2E9NA 4L7SA 2GNJA 2BMCA 1PYXA 3R0TA 5EFQA 4Y72A 3RAKA 1Q4LA 3GCSA 4QP2A 3SXSA 4KS8A 5DEYA 2W4KA 3D7ZA 2Y9QA 2W1IA 3FHRA 3TACA 3G0FA 2YN8A 4EOIA 1UU9A 2BRNA 2RFNA 4I5CA 5JZNA 4U9AA 5HORA 3W32A 3OF0A 1IRKA 2UUEA 3V04A 5F94A 3ZZEA 3HV4A 1UU3A 1YXVA 4AWIA 3DLZA 5A4EA 3ZHPC 2C69A 3LJ1A 2W1DA 2V55A 4D2RA 5L8LA 3LJ2A 2HCKA 4O0UA 3DAKA 4XG4A 3PJCA 5KMMA 4UYNA 3VULA 4YPDA 2XK7A 3ZRKA 4I94A 4QMZA 4BCGA 3MFSA 4BF2A 4I92A 3ACJA 5I3OA 5E9EA 4YLLA 1R3CA 3CY3A 4KKEA 4JX3A 4GFGA 2ITZA 4XX9A 3ORMA 4QQJA 4GT4A 4TTHB 5CU0A 1DAYA 5E7RA 4AGDA 2BAKA 4KKGA 4E6QA 3Q4ZA 1OUKA 5AV3A 4H36A 4EHGA 4KIOA 3FKOA 3G6GA 3KXMA 4AU8A 3AC2A 1U54B 2C5NA 3PG1A 2RFEA 4BTMA 4LRKA 3F9NA 3R8LA 5H2UA 4JT3A 3A7IA 1IEPA 5IH4A 1GOLA 5JFSA 3EMGA 1E1XA 4C35A 4EK4A 2XZSA 4NCTC 4YTHA 4IVCA 4J52A 5AJQA 1YI6A 5CVHA 3WYXA 3IS5A 5KE0A 2R3OA 5ITAA 5LXMA 4WOVA 5M4UA 5HESA 4IQ6A 4Q2AA 5D11A 4YR8A 4IH8A 3SRVB 3IK3A 3ATTA 2BKKA 2PVMA 1CKIA 3Q9WA 2WOTA 3Q4CA 3E93A 4M0ZA 4M0YA 5JT2A 3GVUA 2GPHA 5AA9A 2UW5A 3A4PA 2WEVA 3F5PA 3OWPA 5D10A 3PA5A 1LR4A 4EZ3A 4X6RA 2KULA 2HXQA 2B9IA 5CSWA 4RSSA 3QLGA 2OH0E 2IZRA 1I09A 2OK1A 3O8UA 4MVFA 2VD5A 2IVVA 3IO7A 4YP8A 5IQFA 3CGOA 2QR7A 2WMUA 5CAPA 1XQZA 3BQRA 4APCA 4UX9A 3CXWA 4IHPA 3BQCA 2XK9A 5K0KA 4Q5EA 2VAGA 5FTQA 3SW4A 2I1MA 3LFSA 3PY1A 4FNZA 4N6ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3L9P A;  5FGK A;  4F7L A;  3HP5 A;  5BYL A;  4HCV A;  3F5G A;  5K9I A;  3L8S A;  4YTC A;  4DGO A;  2PUI A;  4D58 A;  3MIY A;  1PRY A;  2VWV A;  2WTJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XBC A;  3SOA A;  4W4X A;  4UXL A;  5JFV A;  4AOT A;  3T9T A;  2NRY A;  3TUB A;  4R7B A;  3UVR A;  4O96 A;  4AT4 A;  3A61 A;  3BYU A;  3VS3 A;  4EH8 A;  4QMX A;  2PZP A;  4PWN A;  4HOK A;  4IVA A;  1ZZL A;  4PL5 A;  1APM E;  1FMO E;  2GDO A;  2W96 B;  5C4L A;  2PMI A;  2W1F A;  5IKW A;  5KX8 A;  3KRJ A;  3DBD A;  4DFY A;  5AV2 A;  2QOC A;  3D0E A;  3HMM A;  2PU8 A;  3NW5 A;  3SV0 A;  2REI A;  3OOM A;  5KMK A;  4DT9 A;  4BZN A;  4ASX A;  3FLY A;  3KMU A;  3FMM A;  2VTJ A;  1K3A A;  3TV6 A;  1SM2 A;  5EM7 A;  4ZSJ A;  5DRD A;  5H8G A;  3RZF A;  4C2W A;  4UMU A;  3A7H A;  4LMN A;  1W2D A;  1JWH A;  1P4F A;  3FDN A;  4I24 A;  4AP7 A;  2YDJ A;  2R0I A;  4U81 A;  3IQ7 A;  2WQB A;  4CFV A;  4GS6 A;  2FSM X;  1MRV A;  4L68 A;  3S4Q A;  2ZV9 A;  4O0V A;  1P2A A;  1XML A;  4OTW A;  2B9J A;  2QOL A;  5GJF A;  1DAW A;  4E5B A;  3DZO A;  5EYD A;  5F20 A;  4U3Y A;  5AR3 A;  3UNZ A;  3VS1 A;  3KUL A;  4RFZ A;  5I4N A;  3TUD A;  4KBK A;  2BIL B;  3UO6 A;  4EKL A;  4HVI A;  2GNH A;  1KV1 A;  4QMN A;  3KRE A;  1ZLT A;  4R1V A;  1W83 A;  3KF7 A;  3CS9 A;  3ZFY A;  3G9L X;  3GFW A;  4ANL A;  1XWS A;  2OF4 A;  5CSV A;  2HW7 A;  3OTU A;  1WZY A;  3GBZ A;  5AAD A;  4FF8 A;  4JIA A;  4DN5 A;  1UWJ A;  4DG0 E;  5A6O A;  3R8M A;  3KRX A;  4W9X A;  4QMO A;  3DK3 A;  4B9D A;  5M09 A;  2PZR A;  3VUD A;  4Y85 A;  4RMZ A;  4GRB A;  3SQQ A;  5AX3 A;  2IW9 A;  5AM6 A;  1Y6B A;  3S1H A;  1OKW A;  2FSO X;  4ACG A;  4U8Z A;  3QTS A;  5HLP A;  2ZM3 A;  3UP7 A;  2HZN A;  1U5R A;  4R5Y A;  3BEA A;  3GOP A;  4YJN A;  4CT2 A;  5LVN A;  4FOB A;  3NSZ A;  4E6D A;  4X2J A;  5LCJ A;  3H3C A;  4UV0 A;  4R78 A;  5IDN A;  2W9Z B;  3CEK A;  1VYW A;  3DPK A;  2JIU A;  2XKE A;  3V8T A;  2O5K A;  5CVF A;  2OZA B;  2GFC A;  4DE4 A;  1ZYL A;  4G3D A;  2J0K A;  3OVV A;  5GZ9 A;  5TR6 A;  3D5W A;  3KIO C;  5IEV A;  1JOW B;  2F57 A;  3IEC A;  4O7Z A;  2FSL X;  4UYA A;  2CMW A;  1G3N A;  3SOC A;  2XYN A;  3LXK A;  3W8Q A;  4GKH A;  2YJR A;  3K3I A;  2BRH A;  3QA0 A;  4L44 A;  4CVA A;  3JY9 A;  3ZDU A;  4JX7 A;  2ZB0 A;  3N9X A;  3SRV A; 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