4CT2A

Human pdk1-pkczeta kinase chimera
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
284
structure length
277
Chain Sequence
KKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKIVEKRHIPYVQREKDVMSRLDHPFFVKLYFCFQDDEKLYLGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDETCTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARANFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEGLIFAKIIKLEYDFPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular Mechanism of Regulation of the Atypical Protein Kinase C by N-Terminal Domains and an Allosteric Small Compound.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-PHOSPHOINOSITIDE-DEPENDENT PROTEIN KINASE 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 277
sequence length 284
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ct2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ct2A01
4R5SA 3NRMA 2QKWB 3CTHA 4JBQA 3RP9A 2PHKA 4G5JA 4QP9A 5I3RA 5E9EA 2UW6A 4ZS4A 3QTQA 3ZYAA 4M69A 3U87A 2YFXA 1H0WA 5EI6A 2V62A 4ZZOA 1J1CA 3MN3A 4S2ZA 4APCA 5DE2A 3PPKA 3TNWA 1HCLA 4TTHB 4HCVA 4ALWA 4QYEA 4I0RA 5KMNA 4JAIA 4KKEA 5C4KA 3OG7A 5EKNA 4B4LA 1FVTA 2BZHB 5D12A 4W4YA 4IX3A 4NKSA 1QPCA 5C27A 2DWBA 1SVHA 4FK6A 3P08A 2X4FA 3DT1A 4AF3A 3SRVA 2IVVA 1Q97A 4J7BA 4XG7A 4EORA 3JPVA 3R73A 4ZY4A 2J5EA 5K5XA 3NMUF 4FV5A 3RZBA 4FMQA 2ZM3A 3EZRA 3PFQA 3L9NA 3R8LA 4GK3A 4D55A 3UG1A 5L6OA 3BYSA 3NIEA 4WUAA 3UVRA 3KULB 1YOMA 4ZXTA 1BL6A 3R7VA 4FKWA 4FK3A 3UOKA 2HYYA 4ASDA 4TY1A 2WXVA 3RAIA 3FL5A 1H07A 4LOOA 4OAVB 3BHUA 4BTKA 2F7ZE 4M69B 2W1HA 1G8SA 4DG2E 1OPLA 5JZJA 1OL2A 4OTIA 4XP0A 3QTXA 5ANJA 4F08A 4XYFA 5GJFA 5JN2A 1OBDA 4CXAA 2GFCA 1GJOA 3BYVA 2WTDA 3H3CA 4YO6A 4M12A 5LWNA 3D7ZA 3CJGA 2C1BA 3ZLYA 2CSNA 2VX0A 3I6UA 5AR4A 4ZTLA 3VF9A 1ZRZA 2F2CB 4HVGA 5GZ9A 3I0QA 3NNWA 5J5SA 3R21A 3V8WA 4XG3A 4K11A 3TL8A 5C03A 3TV4A 4QMNA 2DQ7X 3D14A 5HGIA 5C8MA 4D4RA 5EM5A 3TDVA 4LOQA 3W32A 4KSPA 2CGVA 3QTIA 4F9BA 2YIRA 4DGLC 4MX9A 1ZY4A 3K54A 4JR3A 2PVJA 4RWKA 3NIZA 2YM7A 4E5WA 4JDHA 3RINA 5E91A 3L8PA 4JIAA 4PPBA 3EH9A 4CT1A 2EB3A 5DIAA 4XV9A 4G1WA 5BQ0A 3N4TA 3TTJA 1BX6A 3UQFA 3ROCA 4TL0A 5BX0A 1JSTA 4NWMA 3COHA 3COMA 4FZ7A 3AG9A 3V5PA 3A7IA 5LMKC 2I1MA 4D2SA 4J95A 4F7JA 4WD5A 3KXGA 5HCZA 5L2TA 4OBPA 2A27A 4WNMA 3WILA 3EN4A 5EYKA 3WZDA 4ACDA 4FTRA 5BUEA 5IQDA 4UEUA 3AD5A 3IDCA 3PSDA 4RMZA 3RBWA 3QTUA 3MPMA 5ANKA 4JG7A 5EM7A 5ETCA 4A9TA 1YOLA 3QZIA 4U43A 3ZFMA 4U97A 1URWA 5LVLA 3GCVA 5ANDA 1NVQA 2QU5A 5I3OA 2C0IA 2YWVA 3ACJA 2BMCA 3PG1A 3QXPA 4KKGA 5JK3A 3MDYA 5GZ8A 2W7XA 4ZLYA 4ERKA 4EJ7A 1NY3A 1XH8A 4II5A 4X6QC 4EOJA 3TWJA 4XEYA 2A19B 5BYYA 1FINA 5AR2A 3BEAA 2XJ2A 4Q5HA 2IZTA 2QD9A 4O1OA 3DK6A 5JQ8A 4G3DA 4Y73A 2ACXA 4BYIA 2UZUE 4B8MA 2CNUA 3UOLA 2Y7JA 4UWBA 3UMXA 4IX5A 3PLSA 4YNEA 1T46A 2B1PA 3W2OA 3B2WA 3OOMA 4EUTA 2GMXA 4QPAA 4IEBA 3P79A 4W9XA 5M55A 1CSNA 2VX1A 3REPA 5AA8A 4YLLA 3MFSA 2OJIA 1ZMWA 3R9NA 3UC3A 5EG3A 3FQEA 1Y91A 2X2MA 4O0RA 5IMXA 3IS5A 3FI3A 4AZVA 2BHHA 4BCHA 4O0WA 4CGAA 3FC1X 2WNTA 4PV0A 3T8OA 3K5VA 1OGUA 4BCMA 4D28A 4RX9A 5KE0A 3VBQA 2PVKA 4BCPA 1M14A 3S1HA 5E8XA 3JR1A 3TDWA 4W4WA 3UJGA 1PHKA 5CEPA 4RJ4A 5EYDA 4OBQA 2YHVA 3DKCA 2VO7A 4BDBA 4N6YA 2BZJA 4JQ8A 2Z7QA 3LCDA 2AUHA 4I23A 3EYHA 5FRIA 4W4XA 3RWQA 3OVVA 3DBCA 3KRWA 2CJMA 3LMIA 2PTKA 4FC0A 1REKA 5ACBC 3BYOA 5CT7A 5CS6A 4EC9A 1JBPE 4LRMA 4MXZA 4UBAA 4Y72A 2QOCA 2E9NA 3FKLA 1H1SA 4HVIA 3FLZA 3RMFA 5IU2A 4XRLA 3LXNA 5AFVA 3GU5A 3R22A 3FC2A 4H3BA 4PX6A 4D2VA 4HGLA 3CD8A 3DKFA 4BHNA 1LR4A 4YJSA 4K2RA 1H1WA 3F69A 3OP5A 3A8XA 4CSVA 3NR9A 4G6LA 3DXQA 2W1DA 4AXAA 4X2KA 3U6HA 3ATSA 2CMWA 1ZZLA 3NNVA 3E8CA 3IPHA 4IC7A 3HV7A 3LXLA 1OIQA 4EBVA 1HCKA 4YU2A 4NT4A 3QRKA 4FIEA 4JAJA 5AUXA 4AGDA 3R2YA 5TO8A 5HTCA 4OLIA 4Y46A 2JAVA 4F09A 3WARA 1AGWA 4W4VA 2XF0A 4RZVA 4WBBB 3OY1A 5LMKA 5BVKA 5DH3A 2B0QA 1JKSA 4I6QA 4BF2A 5EQYA 5IZFA 2C6KA 3W1FA 2W9ZB 1U5RA 3ZC5A 4ZIMA 1PYXA 5I9UA 3BHTA 2W06A 4G16A 3U4WA 4MXXA 4EH9A 2RKUA 2C1AA 1XBAA 2EWAA 2QOKA 4EOLA 2XNNA 3QZHA 4F1TA 3LAUA 2F57A 2Q0NA 2W4JA 2YLEA 2Y6MA 3VF8A 3ZUVA 2VWZA 1YW2A 1FVVA 3H9FA 3H0YA 2WTKC 5KZ0A 5FP6A 3TZMA 4WG3A 4FBXA 1Q5KA 2BCJA 3LVPA 3A7JA 3ULIA 2VWBA 3ZFXA 4DGGA 3M2WA 5LVOA 2UVYA 4O96A 3F66A 2LAVA 3EQDA 4AP7A 4C38A 2R4BA 2X7FA 3PG3A 3HA6A 4MBIA 5HVJA 5HE0A 4F70A 4DE4A 3OBGA 3OOGA 3LMGA 4J53A 5FXRA 3MWUA 2I6LA 3AC3A 5CEIA 5J7BA 4GIHA 4KS8A 2G15A 4ASXA 3RM6A 1JWHA 3UGCA 2HIWA 4ANLA 4N0SA 3BEGA 3EFLA 3FI4A 2GS7A 2VTSA 4EOOA 3EQFA 3ZSGA 3P78A 2UW5A 3QHRA 4HVHA 3E63A 1JKTA 3KC3A 4N57A 2REIA 1Y6AA 3VO3A 4OTHA 3ANQA 3F5PA 2LGCA 1APME 1XH9A 4DGOA 3SW7A 3A61A 2RGPA 4O6LA 3GC7A 3ZO1A 4FIFA 4DTKA 4TNDA 4M7IA 4Q9ZA 3SDJA 2JKMA 1ERKA 3ZXTA 3Q5ZA 3HLLA 1SNXA 3FLYA 5HBEA 2XK9A 2QHMA 2HY0A 4QYHA 1UWHA 3Q6WA 4RJ8A 3GC8A 3OD6X 2WMWA 3KCKA 2OSCA 2VTMA 4EQMA 4D1XA 4ANBA 2B9FA 4FEWA 2XIYA 2CGWA 2R7IA 3LHJA 2UW4A 1JNKA 3OTUA 4BCOA 1OIUA 2W05A 5AUVA 5JZNA 5HE1A 5D41A 4DH8A 4EOMA 4DT9A 5FEQA 1YDRE 2Y8OA 3NUUA 5IQFA 1YI6A 5FLFA 4FEXA 2XZSA 2WOTA 4Y85A 4E4NA 4QTEA 3IW6A 2IN6A 4FZFB 3BWFA 4AA4A 5EYCA 2PULA 2E2BA 3MYGA 3U9NA 2VGOA 5HVYA 4BCIA 4XS2A 4PRJA 2CNQA 2FSOX 5DFPA 2H96A 3DJ5A 4PL5A 3UMWA 5I0BA 5I9ZA 3L9PA 1E9HA 4CG9A 1BUHA 4OTPA 3FLQA 4PNIA 4YZNA 2OKRA 1XO2B 5JGAA 3TI1A 4GS6A 3NVKI 4LG4A 5E8TA 5HX8A 2SRCA 5CLPA 3G6GA 2GHMA 2GU8A 3C4ZA 5ANGA 5ACKA 3MVHA 2HY81 2YN8A 3MY0A 1XHAA 3SOAA 3LCSA 3HRCA 1REJA 3MV5A 5E90A 4B7TA 4QQJA 4YPDA 1P2AA 1YRPA 4AFJA 5I9XA 4RLKA 2FO0A 4C34A 3MH1A 4O86A 4R78A 4RX5A 2C5OA 1Q8WA 2B9HA 2V5QA 5KNJA 4PUZA 4AWIA 1PRYA 1PYEA 2DUVA 1YVJA 2UZLA 5K0XA 5M4IA 2GQSA 4YMJA 2A0CX 4YJQA 5EOBA 2PZRA 4WNOA 4JDIA 2W0JA 3PXFA 2W1CA 2GNFA 3ODYX 3E8EA 3HMPA 1Z9XA 3R9RA 1AD5A 4XRJA 4H3QA 2R3MA 3LXPA 3TNIA 2XIKA 4AE6A 4XV2A 5AP2A 4NK9A 2WU7A 1JQHA 3K3IA 3W2PA 4MCVA 3C4EA 2A4LA 5AUUA 2ETMA 4RVMA 3BZ3A 3QL8A 5LCKA 4D2RA 2Q83A 5JRQA 3QYWA 2Y4PA 4YNOA 3QUDA 2JDTA 1JKKA 2XS0A 4OTFA 4IWQA 3QYZA 4FT3A 2GNGA 2OJFE 2A2AA 3V8SA 4AA5A 4O7NA 2WB8A 5CSPA 2HZ4A 3FMDA 5KUPA 4DFUA 2ITNA 3O0GA 4BY9E 2VTRA 2ZMDA 1H01A 3DQWA 4JBVA 4NW5A 5C9CA 4A7CA 3ZOSA 5JFSA 3SGCA 2BROA 3CCNA 4IB3A 3L9LA 3GT8A 1CKJA 3LFQA 3CQEA 3HV6A 2YITA 3WZUA 1ZYLA 4BR3A 4K18A 4L3PA 2BKKA 1H1PA 4EK8A 4D2TA 4LI5A 4F7SA 4FKGA 2HZIA 3PE2A 4KWPA 4F9AA 4E26A 1PKDA 4ITIA 4YJTA 5HICA 1Y8GA 5C1QB 1OKZA 1WBNA 2GSFA 4DFNA 2BIYA 2VNYA 1VR2A 3QQHA 5AUWA 3V5LA 1OI9A 4CRSA 2J9MA 3LZBA 3ZDUA 2WTKB 3DZQA 4M14A 3I5NA 4I5CA 5AEPA 2BAKA 1IRKA 3PJ3A 2X8IA 4GJ3A 1UNGA 3CPCA 3DXNA 2W4OA 2JFMA 4HW7A 5BVNA 2BILB 1PXOA 4BICA 1NW1A 3AC2A 3GOKA 4KB8A 5AM6A 2PMIA 5KO1A 4YLJA 3FPQA 3KN6A 1OPKA 2X7GA 3K3JA 3BYMA 2R3LA 4FODA 4GMYA 5IUIA 1QL6A 5M56A 2BFXA 3ITZA 2O64A 3LOKA 5ETIA 2XKFA 3R0TA 3AC4A 4DFZE 4FIHA 5HORA 3R8PA 2JITA 2VRXA 4AS0A 3QQGA 2EXCX 2IWIA 1XH7A 4R6VA 4YHTA 3HECA 3ZHPC 4ZMEA 1MRYA 2WTWA 5J9YA 4O7TA 5L8LA 2CGUA 5BVFA 4BDEA 3QFVA 5FGKA 4AOJA 4F6UA 2WTVA 4P5QA 4CT2A 3KB7A 5AUYA 4DEAA 2XIXA 4P90A 3OEZA 3R30A 5A3XA 5E1EA 5AMNA 4IB5A 3TEIA 4ENYA 2J0JA 4KINA 4MHAA 4S30A 2UZEA 3EJ1A 4KRCA 4FYOA 4DLIA 1YHWA 1R39A 3NCZA 3QKLA 4FTCA 2CGXA 2Z7LA 4L53A 1M2QA 5E92A 4YSMA 5D7AA 2OF4A 5HZNA 5CF6A 3PDTA 3FAAA 4QMPA 3ZRLA 3O2MA 4F65A 1ZYSA 2QURA 4IE9A 4QTCA 4UMTA 4AN3A 2P55A 5AUTA 2W5HA 1PXMA 1YXXA 3GEQA 2YEXA 4LV5A 3MBLA 1OMWA 5IMEA 5CWZA 3ZBXA 4U5JA 1YXVA 4IAFA 4AZFA 3PXZA 1JSUA 1W83A 4JQEA 1DAWA 3ULZA 3DDQA 3CQWA 5I4NA 4RVTA 2GQGA 4HJOA 3DNDA 4KABA 4WG5A 1W7HA 4EWHA 3P7AA 4Y5QA 5CTPA 4RJ3A 4YZMA 2JFLA 3TN8A 4CVAA 4EH8A 2YM8A 4M68A 1PMVA 5CSWA 4PF4A 5HNGA 3PYYA 5IQCA 4TPTA 4CFNA 2JIVA 3RNIA 5CAPA 3IQ7A 3IK3A 4I5MA 3QD2B 3ZUTA 4YUQA 3R8ZA 2PZIA 3C7QA 2R3QA 4X21A 2G9XA 3RI1A 4FKQA 4RBLA 1WBOA 3FBVA 3VW6A 4BN1A 5F20A 3MFUA 3B2TA 4LUDA 4CFXA 1YXTA 4AX8A 3AT3A 4IZ7A 2VN9A 2QOHA 3ORLA 4CRLA 5IDNA 1OL5A 4EEVA 4QMYA 2C5YA 3MA3A 5DG5A 3DOGA 5M53A 4FTUA 4C4GA 2CKPA 3GQLA 3V04A 3LW0A 2QOOA 4QMTA 5CVHA 4S34A 3LFCA 3VIDA 5IEVA 1S9JA 1Q3WA 2Y6OA 4MWIA 2R3GA 4HYUA 3HDMA 1OKWA 4KIKB 1MQBA 2R3KA 3QCXA 5TKDA 3VVHA 2CCHA 2XKEA 2G01A 3BELA 4CFVA 4QRCA 3R1NA 3TNHA 4WIHA 5ITAA 4D58A 1NVSA 3N4VA 3SG8A 2FSMX 3VBXA 4TN6A 5GJDA 4NUSA 3ZLSA 3VQUA 3N9XA 1W82A 3I7CA 2G1TA 5J1WA 3MH2A 3FKNA 4MNEA 3D15A 2RL5A 3O96A 1LUFA 4AGCA 5K3YA 3PXQA 5L6WL 3OXTA 4E5AX 1I09A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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