2B54A

Human cyclin dependent kinase 2 (ckd2)complexed with din-232305
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Synthesis and biological evaluation of 1-aryl-4,5-dihydro-1h-pyraxolo[3,4-d]pyrimidin-4-one inhibitors of cyclin dependent kinases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
total genus 75
structure length 298
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2b54A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2b54A01
3LFQA 4BR3A 3G15A 2PULA 3VC4A 4MTAA 3BU6A 3GB2A 2YZAA 4LMUA 4EYJA 3QTQA 4W8EA 4FTOA 1XWSA 2WMRA 2X4ZA 4CT2A 4NM0A 4S34A 3HDMA 3E7OA 3DKFA 3DFAA 2VGPA 1ZYDA 3GENA 4KIKA 4X2GA 4EOLA 5E8WA 4IE9A 3EFKA 1NXKA 3NUNA 4PPCA 4UWCA 1CDKA 3IGOA 4U9AA 4Y5HA 3VBYA 1G8AA 3OD6X 2BTSA 3A4OX 2VRXA 4QP8A 3FHRA 5D10A 5T3QA 2ITZA 4DTAA 2J50A 1PMNA 2C6LA 3JUHA 4OUCA 3MVLA 3QQJA 4QMMA 1IRKA 4D28A 4JBVA 5IA2A 5KMJA 1KSWA 2C3LA 3HL7A 5M09A 3Q5IA 3UOKA 5HQ0A 2C47A 2JDVA 3QU0A 3FQSA 4ANLA 5J7HA 4EH2A 3L9PA 5C01A 3F5GA 2QOQA 5CLPA 5ETIA 4LI5A 4R5SA 5BX0A 2R7BA 4FNXA 5AADA 2B0QA 3FKLA 2UZOA 3UE4A 3FYJX 3RBWA 4BN1A 4IC7A 2YDKA 3FQHA 4X6RA 5FWKK 5C4KA 3W1FA 2HZ4A 5E1EA 2XK3A 1RE8A 4GG5A 3VUKA 2AUHA 4GKIA 3QCSA 5CSHA 4D2VA 4FZAB 4KRCA 4G5PA 4XP0A 3SHEA 4NIFA 5A54A 4JRNA 4QMXA 4DN5A 5KKRC 3QC4A 3HMOA 4IAAA 4FG7A 4EONA 4XG7A 5E8XA 2O0UA 3MFUA 3LVPA 4MEDA 4BHNA 4AFJA 4KS7A 4JS8A 2PVMA 5CTPA 4D1XA 1WVWA 2BHEA 4GT3A 5HORA 2OXXA 3MESA 5KO1A 2HELA 1KOBA 4KRDA 3IONA 1ZOGA 3P1AA 5CEIA 3ZSIA 4C34A 2J5EA 2WOTA 3LMGA 3JYAA 2A2AA 2QU5A 3E3BX 4WA9A 4F70A 5JGDA 4AE9A 5K9IA 2XCKA 2VO0A 4FV5A 1JAMA 2XBAA 4FKUA 3JS2A 4PV0A 3G90X 3V5JA 2XRUA 3EYGA 2YM7A 4MBLA 2VX0A 3QYZA 1PXIA 4HZRA 5CQUA 3CP9A 3WF9A 2B9HA 2XVDA 3H9RA 2QOHA 5CQWA 3V3VA 2BFXA 2QOOA 2R3GA 5HNBA 1OL7A 5KUPA 1IA9A 3BYOA 5DN3A 3CY3A 4ACGA 4O83A 4BCIA 5AAEA 5IQBA 2X8DA 3CS9A 1UV5A 3VS3A 2OBJA 4AU8A 3FKOA 3FPQA 2OF2A 3UP7A 2V0DA 3R22A 4KBKA 1Q8TA 3F3ZA 3TDWA 4KNBA 4TYJA 4E20A 1ZYJA 3ZEPA 4MXOA 3ZS5A 2B9JA 3OWPA 1PXKA 4PL5A 3ODZX 3S00A 2PPQA 3KFAA 4M0ZA 3UOLA 4IX5A 2R3QA 3Q04A 2YIQA 1ZY4A 1ZYCA 5DT0A 4L43A 4ACHA 4ALUA 4I6BA 2B9IA 3VQHA 3NR9A 2GNGA 1V1KA 4ORKA 4KBCA 1P14A 3PXQA 2VU3A 3O2MA 5L6PA 4FEQA 2RIOA 2FVDA 3EKNA 3CGOA 3MPTA 3TACA 4MXCA 2PZPA 4O7NA 1APME 1I44A 2PMNX 5JH6A 3K5VA 3REPA 1R0EA 3KK9A 2ZMCA 4G3GA 5L6OA 1KUTA 4UYNA 3GU6A 5GNKA 3HMNA 2UUEA 4MXAA 3GCVA 4RBLA 4APCA 5JFXA 5DT4A 3NSZA 3BU3A 3R7EA 4EOSA 4BZNA 3FLYA 3GVUA 4MKCA 2KULA 4L53A 3ZTXA 5LWNA 5IQCA 2QONA 3CIKA 4R3CA 1BYGA 4YJRA 4DFLA 3RZBA 3EL8A 3MN3A 4U43A 5T6KA 2CKOA 4NUSA 5F4NA 4FR4A 3UO4A 2YM3A 4FT0A 2YJSA 4K2RA 4KAOA 3PA4A 3OF0A 3MY0A 4I20A 4E93A 4KIPA 4RJ8A 3BEGA 2IZSA 2OI4X 3FC1X 4JNWA 4RMZA 4K77A 5LVLA 3V01A 2VWVA 2CMWA 2IZRA 2W0JA 4BDCA 5D9HA 4BDFA 3ZSHA 4LGGA 4I0TA 5DBXA 3R9OA 4CMUA 3LM0A 3PPJA 4RQVA 5HVKA 5L2IA 4J52A 3EL7A 4X2FA 4BGHA 4BICA 3AQVA 5ETFA 3QFVA 3E92A 4F0IA 1OMWA 3ZDUA 1DAWA 4GVJA 1B6CB 4QMOA 2Y6MA 1UU9A 2V22A 3WZEA 4QO9A 2R7IA 3RPYA 2WMVA 4MX9A 1DAYA 4O0VA 4G6LA 4TXCA 2X7FA 3FE3A 4HGEA 3W2QA 3W2OA 4QPMA 3ERKA 2GNLA 5HICA 5LVMA 3UNKA 4C4EA 4GFMA 2ZV9A 4LYNA 5JMSA 2E2BA 2HW7A 4IFGA 3IQ7A 3R8UA 2YITA 3HDNA 3ALNA 5AP7A 3EN6A 4MBJA 4IVDA 3HZTA 3P9JA 3D14A 4IBMA 3V5LA 5CF6A 5EDRA 3QZGA 4XRJA 1YXXA 2X9EA 3NYOA 4M12A 3A8WA 5H8BA 1OL2A 1M14A 3BLQA 1V0PA 3ZO2A 1OGUA 2W5BA 3LCSA 3UPZA 4FTCA 4XEYA 3R28A 4FV2A 5M07A 3BBTB 3LJ0A 4YHTA 2JIUA 1Z9XA 1FVVA 3AD6A 2WTDA 4U44A 4GJ2A 1YI3A 2ZDUA 4XBRA 5AUTA 2R64A 4M13A 5AWMA 4AGDA 4PMPA 4QP2A 5ETAA 3UMWA 1IA8A 3BLRA 4IX3A 4YLKA 4YO6A 1PXJA 1XH8A 3LQ5A 3NIZA 1PKGA 4I4FA 5E1SA 5CAQA 1CSNA 4QP9A 5HU3A 4C0TA 3ORLA 3KXNA 2WOUA 3ULIA 3FWQA 4F7NA 4G5JA 2ERKA 4FG9A 4IM3A 4BBMA 4DFNA 3QRUA 4M68A 4CMTA 2HYYA 3SOCA 4NEUA 4M66A 5D7AA 4U8ZA 3I6WA 5AV1A 4IB1A 5JZNA 1CMKE 5H8EA 2E9PA 3WI6A 3TV7A 1IAHA 5BMSA 2YCRA 1ZOHA 3E7VA 4C37A 4EORA 2O63A 4GV1A 1Z5MA 4CD0A 1PXMA 2OJJA 3PWDA 4YMJA 4AE6A 3PVGA 4WNOA 5ITAA 2CPKE 5TT7A 3WILA 4CFFA 4EOJA 4ACMA 1PMUA 3QUPA 3WF8A 3CSVA 3VBTA 4Y46A 1XO2B 4L7FA 4B8MA 3POZA 2VX3A 5C26A 5GHVA 5L2WA 4WG3A 2F57A 3IW5A 2O2UA 2X81A 3FMEA 4ZP5A 3QWJA 3PFQA 2G2HA 4TYEA 2VO6A 4L3PA 3DAJA 4CT1A 2C1AA 3ORIA 3COIA 4R8QA 4F9WA 2CLXA 1YWRA 4II5A 4JQ8A 4F9YA 3L8SA 4XV9A 5IQIA 1H1RA 3I79A 4A4LA 4D2PA 3R6XA 3UGCA 4ZSEA 2ACXA 2XEZA 3MGYA 3ACKA 4BF2A 2ETMA 4DH3A 3Q52A 2F49A 1GZOA 3ORTA 1OM1A 5A3XA 3OBJA 5CS6A 1YOLA 3DDPA 4WSQA 3DZQA 3W8QA 4PY1A 4CSVA 2XYNA 4BCNA 2OU7A 4B4LA 4RJ3A 4Y73A 4NYEA 1KE6A 2HWPA 4FNYA 4FSQA 5J79A 4FKJA 5EOBA 3VHEA 3DKOA 1JWHA 5EDPA 5IA4A 3IKAA 4ZY4A 3IW6A 5BVEA 1CTPE 4M14A 4F9CA 2GPHA 5HLPA 4YSMA 2IVUA 2B55A 4HPUE 5CAOA 3KY2A 3LAUA 5IISA 3KQ7A 3SX9A 3C4ZA 3FLSA 3FC2A 5DRDA 3VBXA 2WIHA 3L8VA 4H3BA 5EM8A 4I0SA 4AXAA 3LLAA 4N70A 2OJFE 2JKQA 2YM5A 4IVAA 4O0RA 3V5PA 4M8TA 2XIXA 1A06A 3MPMA 3JVRA 3MSSA 1URCA 4KA3A 4HCVA 2UZTA 1J3HA 3CQUA 3BBWA 2VO7A 5TE0A 3B8RA 4LV8A 4PL4A 3MJ1A 5GJDA 3KXHA 4N4SA 4XG8A 5EDQA 5AIKA 2VWBA 1PYEA 3BKBA 4ZJJA 3TV6A 3AXWA 3LFNA 4C4GA 5BUJA 2GQRA 4PPAA 3VRYA 2CNQA 2P2IA 4PDSA 2WU6A 5TKDA 3ZEWA 4BGGA 4O7WA 5HO6A 1FPUA 4TZRA 2R4BA 1RDQE 4O1OA 4PDPA 3ITZA 3DJ7A 4ZY5A 5J87A 1VZOA 3V6RA 2C6EA 3OMVA 3D83A 3IW4A 3PP0A 3KCFA 3MS9A 4PMMA 4ZOGA 3OVVA 4HNFA 5A4EA 1ZLTA 3L8PA 4U81A 4EC9A 5ACBC 4CQEA 4RJ5A 4DG0E 1DM2A 5F9EA 3TI1A 2C5XA 3Q53A 1M52A 4OAUC 4PTCA 3SLSA 4FZDB 4IWQA 2Z7LA 3LFCA 4ASDA 5JFVA 2IPXA 4RA4A 3R7YA 3RPVA 2Y4IC 4YJUA 3VW6A 3KC3A 4IWPA 4JVGA 4GSBA 1OKVA 3R1QA 3VUIA 5ANOA 4EQCA 5DEWA 5I9ZA 5CYIA 3LKMA 5AP0A 2CHLA 3JR1A 2W4KA 3PE1A 4RWIA 3D2IA 3QQUA 4FV8A 3WYYA 4ENYA 3FI4A 4H05A 5DG5A 1XR1A 2Y8OA 4YZ9A 2WTWA 5HGIA 3WF7A 4A9RA 3UIMA 3ZSGA 3CD8A 2BRBA 3EQPA 3PY3A 2EXMA 5F1ZA 3TUDA 5CT0A 4JG8A 3UMXA 5I9VA 3N4TA 3QTZA 4YPDA 4D9UA 3LXNA 2XKCA 4B9DA 4U40A 2ITOA 3RALA 5JGBA 3SGCA 1PXNA 4F6UA 1JKTA 4OTRA 4RPVA 4ALVA 2XM8A 1G8SA 2NRUA 4AZSA 4OTFA 2A4LA 2F2UA 4EH7A 3QKLA 4YO4A 1YW2A 4J8MA 4HYUA 3HP2A 2WTKC 2XK6A 4FKVA 5EQEA 4F1OA 5G6VA 3FJQE 3TCPA 1J1CA 4HYSA 3QA0A 4AW2A 3ZXZA 3CQWA 4FT3A 4CKRA 4QP3A 4YLLA 4AT5A 3D2KA 4O0UA 4ZTQA 4Z7HA 3OWJA 2Y6OA 2GHGA 5FRIA 4I23A 2XRWA 4DCAA 4FF8A 1Y91A 3LFEA 3QYWA 5A9UA 4AG8A 1GJOA 4FX3A 5DGZA 2GNIA 4CKJA 5HO7A 3KRJA 3BGPA 3C4FA 1H01A 4YTHA 4RLLA 5AV3A 3GI3A 5HX8A 1OBDA 4CFXA 4FTIA 2BIKB 4O0SA 4S32A 2X9FA 3KVWA 3TTJA 4O86A 2O3PA 3DU8A 2W1IA 4UWYA 1MRUA 4YHFA 5CEKA 2Z60A 5ANJA 5D12A 1MQ4A 2YACA 1SM2A 2OH4A 3KCKA 4ERKA 2ONLA 3WE8A 2UZEA 4QNAA 3R7UA 3DPKA 3RK5A 2OIQA 1Y6AA 4U6RA 4BIBA 4RC3A 3Q9XA 4Y85A 3P0MA 3PVBA 1U54B 4X7QA 3ZCLA 2BZKB 3BIZA 2R3KA 3CQEA 5J1WA 3UP2A 5AFVA 3W2PA 3BGQA 2R3HA 4XOZA 3NUPA 4RJ6A 1YWVA 4NU1A 4YURA 4DEGA 2JIVA 3MTFA 4FYOA 2CKPA 2VTRA 2OXDA 1PMVA 3O51A 4IB3A 3MFSA 4C4JA 5E8UA 2PE0A 4FTMA 5IEVA 1Q4LA 4XV1A 3IECA 4EYMA 1I09A 4BBEA 3UG1A 4PF4A 4C3FA 1E1VA 3LQ3A 1WVYA 4V04A 4PMSA 1NY3A 5GIPE 3EQHA 5LMAA 3R7OA 4BCKA 4PNKA 3UQGA 1PF8A 4NJ3A 5IQFA 1PJKA 3DQWA 4F09A 5CI7A 1GIIA 2ZV7A 2GU8A 2WQNA 2XBJA 3D7TB 1RJBA 4I1ZA 1REKA 5FM3A 2WTIA 4JIKA 3ROYA 2B9FA 4JAJA 4BL1A 5HCZA 3N51A 4BTJA 5GZAA 5IQDA 2JAMA 4AS0A 1BL7A 4BC6A 3GC9A 2VUWA 3CTHA 3OUKA 2VWZA 4D0WA 5HHWA 4C7TA 5L8JA 2UZVA 4D4YA 5JFWA 2PVYA 2BHHA 5J9YA 3NZ0A 5FGKA 2UW8A 3TN8A 4BHZA 2P33A 1SVGA 2BILB 1FOTA 1ZZLA 4OR5A 1YI6A 3PIZA 4AQCA 5HCXA 4Q9ZA 4EH9A 2WMSA 5BNJA 3DK7A 4ID7A 4AOIA 2QHNA 3QX4A 4BKZA 2BTRA 3TIYA 3S0OA 4IXPA 1AD5A 4L68A 4BDHA 3V5QA 4EZ3A 2LGCA 4D5KA 3FY2A 3VBWA 4FT9A 3OOMA 4WD5A 5JK3A 1J91A 2UVYA 3F3UA 2JEDA 5J9ZA 4EH6A 2CJMA 3HRCA 3MPAA 3OW3A 3QF9A 4YJPA 3SRVA 3W10A 4FEUA 1WZYA 3BV2A 3HUCA 4HGLA 3ORPA 2X2MA 4HZSA 1J7IA 5K0KA 4AN2A 3W33A 2QHMA 5IUGA 5HTIA 1OVEA 4EC8A 1OL1A 1OPKA 4DAWA 4QNYA 5CSPA 4YU2A 4H39A 2B54A 4FOBA 3BX5A 2J0JA 3VIDA 3UC4A 3RPOA 3GU4A 4LG4A 5FBOA 4BDEA 4WNMA 3C7QA 1M7NA 2ITPA 2W1FA 3HP5A 3IGGA 4KB8A 3VN9A 3WZUA 3OT3A 3OEZA 4BDJA 1W0XC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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