4O4DA

Crystal structure of an inositol hexakisphosphate kinase ehip6ka in complexed with atp and ins(1,4,5)p3
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
PDGQYLLKPCLSHRERDFYLHIKDDKEWTGTGIIPKFYGVELHEFGFGELEFIRMENLMYKYKRPFVLDLKIGTQTWDPETASSKMKKRLVVDSTSTTTSLGVRFSGMERNIGEEKPILYSRYLCTHEVNTRDSLKEYIKLFFNDGKKYRKELVPYFISQLDKMIEVMKKREYKMFSSSVLFVYDSTTTLEDKKYNCKMIDFAHNWILSEEECTVEDGFLFGLNNLKSILEDIENEFKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Inositol hexakisphosphate kinase
publication title IP6K structure and the molecular determinants of catalytic specificity in an inositol phosphate kinase family.
pubmed doi rcsb
source organism Entamoeba histolytica
molecule tags Transferase
total genus 77
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature ec 2.7.4.21: Inositol-hexakisphosphate kinase.
pdb deposition date 2013-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 4o4dA00
1TZDA 2IEWA 4O4EA 4O4FA 2IF8A 1W2CA 1W2FA 1W2DA 4FRFA 4O4CA 2A98A 4O4DA 4O4BB 2AQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CQEA 4TYIA 4O38A 5J79A 2UZEA 3DQXA 3FY2A 1W0XC 1VR2A 1GIJA 3ORKA 4UMQA 5EYKA 3KB7A 4PRJA 3RBWA 2QG5A 3PIYA 3V8SA 4C3FA 4EZ7A 5L6OA 3R02A 1H07A 4MYGA 5BVKA 3EYHA 3IDBA 3CPBA 2UZVA 4PMMA 5CF5A 4XOZA 4BDIA 3H0YA 1ZMWA 2C6TA 4NM5A 3EN9A 4OAVB 3TNHA 1O6YA 1OUYA 1Y6BA 4CV8A 1V0OA 4FTOA 4NH1A 4JDHA 4U5JA 5ETIA 2C6EA 4DFZE 2GHMA 4M67A 4BBFA 4WKQA 2BUJA 5KHWA 5M4FA 2C5XA 3NUUA 5CF8A 3KK8A 2OJ9A 3QQUA 3PG3A 4ZTNA 3TZ8A 4GFGA 4U79A 2XNOA 4RFMA 5IUIA 4UMTA 5L2TA 1ZMUA 2X2MA 4O0YA 4RFYA 4BBEA 3ZSGA 1WVYA 2CPKE 2ZDTA 3DU8A 5CAOA 2PVMA 3LJ1A 3R6XA 3EL7A 4W4XA 4XX9A 3QGWA 3FC1X 4HVIA 2R4BA 5AA8A 4ZJVA 4RQVA 5HTIA 4FZ6A 2C6LA 4KABA 4ASDA 4KRDA 5EI8A 4B99A 2R3GA 5AV2A 2P0CA 1OPLA 1IG1A 2WTVA 1UNHA 3QTQA 3ZTXA 5AP0A 2HWOA 2WTKC 3PE2A 4IX6A 5ANEA 4H36A 4KKHA 2OGVA 4U45A 3K3JA 2F2CB 2QC6A 4G2FA 4QTEA 3F3TA 2UUEA 5K5XA 2CLQA 3QUDA 5DR9A 4N6YA 3NDMA 4ID7A 3W2SA 3CD3A 1XR1A 3LPBA 4QMOA 4FTAA 3T9IA 3LJ0A 4O1OA 4KIKA 3ENHA 3QALE 4XG9A 2WTIA 1BMKA 1BL7A 5HESA 3DBQA 4AZTA 4Y85A 2VTPA 2DQ7X 5ICPA 3R9HA 4F64A 2X9EA 3EQPA 3IO7A 3PA5A 4AGDA 4HYSA 5I9WA 4NUSA 3ZO3A 1R78A 3FY0A 4UXLA 3U4WA 2B53A 4G3GA 1U46A 4EWHA 1LPUA 1UU9A 4CTBA 4U0IA 2PVHA 4DGMA 3SAYA 4NT4A 4ZY5A 2YIWA 3E7VA 3OMVA 3HDMA 1PXIA 3GENA 5AX9A 4QQTA 5HO8A 3VS7A 3RWPA 3KVXA 2ZV2A 5I9YA 3BELA 2EVAA 3W16A 3OHTA 5BQ0A 1ZYSA 4UWYA 2ESMA 4HVDA 4YJUA 4JDKA 4WBBB 4DGOA 2EUFB 3RKBA 3FL5A 3KCFA 3KN5A 5CQUA 4MXAA 1R39A 4D0WA 3FYJX 3I4BA 4EUUA 2NRYA 3ZM4A 1W2DA 2JIVA 2QODA 3BLHA 4EOPA 2GTMA 2O2UA 4Y72A 3W18A 3OXZA 3RPRA 2ACXA 1TQIA 3KRXA 1ATPE 2OJIA 2YACA 3F5XA 4LV8A 4RVLA 4BDKA 4PL5A 3FUPA 3ORNA 4QP1A 2QKWB 3ZC6A 2JGZA 3EYGA 3OOGA 5DT3A 4F7SA 4RVMA 4FV2A 1OL7A 4BKJA 5L2SA 3BHVA 4KBCA 1XWSA 4KIQA 3U87A 3UP2A 4EUTA 3KRLA 5AAGA 4YBKA 3AXWA 4DEAA 2VU3A 1XJDA 2XIXA 3D7ZA 2I0VA 4WG4A 5HGIA 3MN3A 2QNJA 3E8DA 2YDIA 3BGPA 2WU7A 4B8LA 5AR3A 1GNGA 5IUGA 4PF4A 3KKVA 4I5MA 4X2KA 5E90A 2X1NA 5F94A 4HPTE 2ZMDA 4Y73A 2WAJA 5HCXA 5J5SA 1YI6A 5L3AA 2OKRA 2UZBA 2YA9A 3A4PA 3Q9WA 3JVSA 3ZC5A 4BFMA 4OBPA 4TNDA 4FEQA 4U3YA 5FRIA 3QCXA 2YM6A 3OG7A 4BDHA 1CDKA 1H4LA 2W1HA 2WPAA 3UOLA 1Q8YA 5ANDA 3FWQA 2R9SA 4QRCA 3R7YA 4NJ3A 4A9TA 4ENYA 5EYCA 3L9LA 3GP0A 3CLYA 4O4DA 3HV3A 1SYKA 1ZXEA 4RC2A 4U42A 1YHVA 5TE0A 5CASA 5J5TA 2IW8A 3TL8A 3COIA 4PNKA 2BHHA 3FE3A 4E73A 5IISA 2OH0E 4D2PA 3Q4UA 5EYMA 3L1SA 3TZ9A 3PVGA 4N4SA 1KV1A 4YNOA 4IM3A 3JY0A 3DBFA 1BI8A 3F7ZA 3ORPA 3ZRKA 5A6OA 3W8LA 2ITWA 1Q8WA 1ZYCA 5IKWA 4LOPA 2OBJA 4X3JA 5A4CA 2QLUA 2WMTA 4J98A 2C5VA 3RAWA 5HU9A 4PL3A 3QLFA 3TKIA 3C4XA 3TXOA 4AXAA 4D2VA 4D58A 3DAKA 4BRXA 3V5PA 2W1CA 3BWJA 2DWBA 5HKMA 3ZLYA 5HG9A 4QNYA 3QBNA 2VX1A 4ZSGA 3VIDA 3Q60A 5L6WL 3PYYA 3KXMA 5D1JA 1ZYDA 4YSMA 4XH6A 3ZFMA 4BTMA 1OVEA 4I41A 3TV4A 3RWQA 1RQQA 1ZZ2A 1GIHA 2C6OA 4Z9LA 2Y4PA 2P4IA 4FF8A 4ANMA 4FZDB 1RE8A 2XH5A 3FXZA 2EB3A 2WQOA 2Y6OA 4Z7GA 4GRBA 4TL0A 1IASA 3FQEA 4O21A 4EH3A 5KX8A 4DH8A 4TTHB 4E6AA 5BPYA 2OK1A 3AGMA 4DLIA 3UZTA 3W33A 3EB0A 4AN3A 5A4QA 3TUBA 2ZM3A 4DG0E 3ANRA 4EOSA 3ALOA 4CYJA 2X7GA 5EHYA 3F6XA 4L9IA 3AQVA 4KS7A 4NZWB 2BRHA 3D5VA 5BUEA 2HELA 3C4FA 1IRKA 2J90A 3THBA 2RF9A 2XEYA 5KKRB 5HEZA 3MY1A 3VUDA 4FV9A 4L3PA 4FSNA 2B9FA 4Z3VA 4C3PA 3OUKA 4PL4A 3HV7A 4W9WA 1FVVA 3O71A 4IAIA 4MWIA 4YURA 1JQHA 4RZWA 4AACA 3K5UA 4KRCA 4K8AA 4OTFA 4RX8A 2Z8CA 3LQ8A 3QQJA 4ZLZA 5D12A 3HYHA 4N0SA 3F2NA 2R2PA 4D2WA 3UO5A 2GNHA 3QTSA 3KU2A 3PSDA 4FKUA 3WF8A 2PK9A 2VO0A 2NRUA 3C51A 4I6BA 2UW7A 4OTRA 3BIZA 3SXRA 3L9NA 2ITQA 3KA0A 4ZY6A 5EOBA 4PDOA 3FAAA 3PXKA 2V7OA 3ANQA 3DJ7A 1JPAA 4WA9A 3L8SA 4M13A 1OKZA 4XV1A 3FMHA 2PHKA 1LP4A 1KE7A 4WG3A 2F57A 4WRSA 3PJ2A 1NA7A 4R6VA 3UG2A 3EOCA 3ACJA 3KULB 4FV3A 4U97A 3BE2A 4BCJA 3UYSA 4DFXE 3D5XA 2FYSA 3CC6A 4CSVA 2CGVA 4D4VA 3VBTA 4QTBA 3CTHA 4F70A 1P14A 3F3WA 3QQKA 4ZTQA 4ZJJA 3WZDA 4MKCA 4C33A 2E9UA 5KMMA 5J7HA 5DWRA 4ZK5A 2GNGA 4PMTA 2JKMA 3I79A 2XK6A 3H9FA 4JIAA 5J1WA 3GOKA 2XNMA 3FZSA 4M8TA 3F61A 2JAMA 3FI3A 2UW8A 4FYNA 4BIBA 5GZ8A 4FSTA 5BVOA 2VD5A 4M66A 4C02A 3EN6A 4XOYA 3WZEA 4C58A 5AP7A 2OIQA 3F82A 3KC3A 3NUNA 5CU2A 3C0IA 5ANGA 5AV0A 4AP7A 3L8PA 4L3LA 5AIRA 4D5HA 4G34A 4JOAA 3FZRA 1WVXA 4E4MA 3TIZA 4XHKB 4GG5A 2O8YA 1GZ8A 4OTGA 3PIXA 1PJKA 4FV7A 3O23A 3TNWA 3LXPA 1M17A 4FC0A 4O0TA 3ZU7A 3N9XA 4KSPA 2ZAZA 2C5NA 4P5ZA 1AGWA 3C4WA 3NEWA 4AN2A 5CU3A 2YCRA 4I5PA 5M55A 4FNZA 4L7SA 4O96A 2ZB1A 3V5WA 2Q0NA 4BDBA 5HG7A 5DVRA 2G2HA 3CE3A 5EHOA 1YI3A 2B9HA 1P5EA 4EOMA 2W4KA 2EB2A 3KEXA 2OSCA 3UVPA 4YC3A 4FKPA 3RAKA 3EQIA 2AUHA 1YHSA 2XS0A 5KO1A 3WE4A 2C47A 3KXHA 3UNJA 4MBLA 4A06A 3LCSA 3KK9A 3MFRA 5HI2A 5T6KA 2X0GA 5JFXA 2OJGA 4X2JA 4I6HA 4RIYA 2FB8A 5ACBC 4BI2A 4EYJA 2UZTA 3R2BA 4MHAA 2QU5A 4JG6A 4J96A 4EQCA 3HVCA 1A06A 3BWFA 3NCGA 4FNXA 3QCSA 4M0YA 5CI7A 4U81A 4E6CA 3QFVA 1OM1A 2ITUA 2OXXA 2XK7A 3BQCA 4JL9A 4RIXB 1LR4A 5AWMA 3GT8A 2JKQA 3EQHA 3R21A 4FOCA 4UWBA 5J9ZA 4TT7A 4U7ZA 2J7TA 4Y83A 1OPJA 4R5SA 2J9MA 4K11A 4E7WA 3DOGA 3FJQE 4P2KA 3VBWA 4BDDA 1JKKA 3CPCA 4BGHA 1HCLA 3HMNA 2VWIA 4F9WA 1PYEA 3KULA 4FKGA 4O0WA 3VJOA 4E26A 4EHVA 4EOJA 4QP6A 5I3RA 4Q9SA 3BYOA 3DV3A 3EN7A 1ZRZA 4IX4A 4E5AX 2VTIA 3CKWA 4EC9A 2C69A 2BDJA 4Q9ZA 2YZAA 1BLXA 3I5ZA 2R3FA 5J95A 4IX5A 2QD9A 4CMUA 3D4QA 5B2KA 4CRSA 4I23A 4USDA 3JY9A 2YABA 2IN6A 2ZB0A 4BCIA 1Q41A 5IDNA 5BVWA 5HIDA 4C37A 5AP5A 2HY81 1WVWA 2O65A 2CGWA 4FT3A 5HO6A 2CCHA 3K54A 4N6ZA 3TV7A 3O2MA 4OR5A 4FIIA 4GUEA 2ITOA 4IAKA 2IVTA 2J51A 2PZIA 2XK4A 3I0OA 1SVHA 4AW0A 3PUPA 5AM6A 4HYHA 3UOHA 4Y5HA 3UQCA 3DAEA 4ANQA 4EQUA 1UU8A 3K5VA 3SXFA 4E5BA 4EH8A 4QYFA 4PDSA 2EU9A 3A7JA 3PRIA 5F1ZA 4LRKA 4C4EA 4QTAA 4BTJA 2W1EA 4CXAA 1URWA 1DM2A 4FTCA 4OLIA 5JSMA 3SRVB 4DEEA 2YCSA 4IWQA 3DAJA 5AV4A 1KE6A 1QPEA 4NWMA 5IA3A 3PVUA 3IDPA 3O8TA 1H27A 1GJOA 3CGOA 4LM5A 4OTPA 3TNQB 3BX5A 3UQFA 3QZHA 4QP3A 5CANA 3L8XA 3LFQA 4IZ5A 2JKOA 4XV2A 1Y8GA 3LAUA 2XEZA 3ENMA 4IZYA 2Z7SA 4QP2A 1V1KA 2YM8A 2WQMA 4FTJA 3I7CA 3MH1A 4PNIA 3WIKA 2Q0BA 3EQCA 4PUZA 5AEPA 1TVOA 4O4BB 4X2GA 1YDRE 2R3IA 4BICA 4IWOA 2ERKA 2R3MA 4BI0A 4D1XA 2R3KA 4LYNA 2BAQA 4R3PA 4MXZA 3BKBA 2C0TA 3BV2A 1XH9A 3IW5A 4IB3A 3QQGA 5BYZA 5CAVA 3ALNA 3DKCA 4C2WA 1YI4A 2OW3A 3EZVA 4U9AA 5FP6A 3ODYX 3NX8A 3Q32A 5K4JA 4BL1A 5FM3A 2OF2A 1IA8A 1YXSA 4BDJA 2PE0A 2BRNA 3BU3A 3BCEA 3OFMA 3ORIA 3PSCA 2XF0A 1KE5A 3CQWA 2QLQA 3ZLSA 2Y8OA 3P5KA 3ZCLA 3ORLA 3RGFA 5AR2A 3FPMA 4M14A 3TKHA 3WARA 3VWAA 5HLWA 2IJMA 5FXSA 5B2LA 4AE6A 3C4ZA 3NAXA 2X2LA 5FTOA 2BIYA 2QOKA 3R83A 4OAUC 2RFDA 4H58A 4ZSEA 4GJ3A 4QMXA 2W5BA 3RJCA 2ITPA 3BU6A 4I1ZA 5J9YA 5KNJA 4H39A 3FI4A 1GAGA 3QQFA 3V51A 3BPRA 3OWJA 3WZUA 4BBMA 3I60A 5ETCA 3RCJA 1ZWSA 3CTJA 3W2OA 3M2WA 2VWBA 3FBVA 4D4RA 5B0XA 3RNYA 1FOTA 4B8MA 4FKWA 4WBOA 1OITA 4YZNA 4BCKA 3NUSA 3LFNA 5A14A 4F7LA 4C36A 2WD1A 3TJCA 1RW8A 3SW7A 2BMCA 5I3OA 3ET7A 3UVQA 2IW6A 3LVPA 2Y7JA 2JDVA 4GYIA 2O64A 3S2PA 3CIKA 3D2KA 3QCQA 3FMKA 3R7EA 4D2SA 4RG0A 1CSNA 2QR8A 4I0TA 2ONLA 4D9UA 5IA1A 5LVOA 4QQCA 3MS9A 3NW5A 3RINA 4IH8A 4GU9A 3MWUA 5EFQA 2JC6A 3IDCA 4KWPA 4QQJA 5AIKA 4LGHA 4TWCA 3R28A 4FKQA 4CFUA 5HOAA 3W55A 4C34A 4UMRA 3PZHA 5LARA 4NM3A 1UKIA 4HW7A 4MCVA 2G1TA 4MEDA 1ZAOA 5HNGA 1ZYLA 3DY7A 3MIYA 2QOOA 2C30A 4G9CA 4JQEA 4K77A 4S2ZA 2XKFA 5FXRA 4GIHA 4XYFA 4CZTA 2C3JA 3C9WA 1OIYA 1YXTA 4I21A 1SM2A 3PJ1A 3PJ8A 4MWHA 3ZRLA 3F7WA 2P2IA 4AQCA 4BKYA 2P3GX 4YHJA 5JT2A 3LHJA 1U59A 3DS6A 5M53A 4UYNA 5KBRA 1PKDA 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 1TZD A;  2IEW A;  4O4E A;  4O4F A;  2IF8 A;  1W2C A;  1W2F A;  1W2D A;  4FRF A;  4O4C A;  2A98 A;  4O4D A;  4O4B B;  2AQX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LXK A;  3QA0 A;  4YLJ A;  4BKZ A;  3PP0 A;  1YKR A;  4G3F A;  4L45 A;  4FR4 A;  3UE4 A;  5DE2 A;  3D5W A;  3GCP A;  2IZS A;  2QOC A;  4CFV A;  4E3C A;  3P7A A;  3P9J A;  3PXR A;  4GT3 A;  4IXP A;  4I4F A;  1REJ A;  5C26 A;  2OJJ A;  3OD6 X;  4KIK B;  4NFN A;  4BCN A;  3WF5 A;  3AT4 A;  3ZEW A;  4AF3 A;  4BCO A;  4A9R A;  4OGR A;  2BAL A;  5H8B A;  3R7I A;  2H34 A;  4EK3 A;  4ANB A;  4C57 A;  3G9L X;  3FPQ A;  1K3A A;  2CLX A;  3OS3 A;  2R7B A;  4GU6 A;  4J1R A;  4LGD A;  4LUD A;  5CYI A;  2LAV A;  4EQM A;  5BVN A;  5FWK K;  4FBX A;  4YNE A;  5CSX A;  1YOJ A;  5CAP A;  4J99 A;  4XLI A;  3ZUT A;  4EK4 A;  2BHE A;  4XBU A;  5C03 A;  3P0M A;  4M68 A;  5CSH A;  5IH5 A;  2RG6 A;  4I3Z A;  4GYG A;  4BVU A;  5K5N A;  3DGK A;  4FTM A;  5CAU A;  1WFC A;  4O0V A;  5D10 A;  3IPH A;  3DK3 A;  4CVA A;  4JLC A;  3K3I A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1TZD A;  2IEW A;  4O4E A;  4O4F A;  2IF8 A;  1W2C A;  1W2F A;  1W2D A;  4FRF A;  4O4C A;  2A98 A;  2X0O A;  4O4D A;  2X0P A;  4O4B B;  2X0Q A;  2AQX A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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