4O4DA

Crystal structure of an inositol hexakisphosphate kinase ehip6ka in complexed with atp and ins(1,4,5)p3
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
PDGQYLLKPCLSHRERDFYLHIKDDKEWTGTGIIPKFYGVELHEFGFGELEFIRMENLMYKYKRPFVLDLKIGTQTWDPETASSKMKKRLVVDSTSTTTSLGVRFSGMERNIGEEKPILYSRYLCTHEVNTRDSLKEYIKLFFNDGKKYRKELVPYFISQLDKMIEVMKKREYKMFSSSVLFVYDSTTTLEDKKYNCKMIDFAHNWILSEEECTVEDGFLFGLNNLKSILEDIENEFKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Entamoeba histolytica
publication title IP6K structure and the molecular determinants of catalytic specificity in an inositol phosphate kinase family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inositol hexakisphosphate kinase
total genus 77
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature ec 2.7.4.21: Inositol-hexakisphosphate kinase.
pdb deposition date 2013-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 4o4dA00
4O4EA 2IF8A 4FRFA 4O4DA 1W2FA 4O4CA 1TZDA 2A98A 4O4BB 2IEWA 1W2DA 1W2CA 4O4FA 2AQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FSRA 4IHPA 2WIHA 3VW8A 4IAZA 1OITA 2ZDUA 1AQ1A 4J98A 3VBVA 5HO7A 4ASXA 2PVJA 5AAGA 5CF5A 2EXMA 3QYZA 5CLPA 4BCNA 4FV7A 3VO3A 1JSVA 3AQVA 3HMNA 4A06A 1Q8ZA 3D5VA 4GEOA 4QMUA 2X2MA 4N4SA 4F7LA 3HV7A 4M0YA 3COMA 4ZSJA 4ZJJA 5CI6A 1K2PA 5LWNA 2CGUA 5EM8A 3AC4A 4KSPA 4GVJA 4L45A 4JBVA 4YNEA 3L8VA 4DYMA 2R3PA 3BHYA 1OPJA 1WZYA 5J95A 1PMUA 5EM5A 4F0IA 2GPHA 4LI5A 5FEQA 3SOCA 2RF9A 3R7IA 3FY0A 1FGIA 3LMGA 2X81A 3AD5A 4WKQA 3ZSGA 3BU3A 1H25A 3VHEA 4QNAA 3UVRA 3U6HA 2WTKB 5L8LA 3BRBA 4ZJIA 5T6KA 2NO3A 4MNFA 5CVFA 1ZOGA 3PUPA 2DQ7X 3IGGA 4MEDA 4MXZA 5CWZA 4E4NA 3DFAA 2F49A 4FTJA 2WMWA 3FZPA 2GS6A 3F7ZA 4P4CA 5IDPA 2VN9A 3NNWA 3GBZA 4HPUE 4ITHA 4M84A 2ACXA 4TYIA 4CQEA 3FLZA 3A7GA 2JFLA 4EUUA 5CEOA 2PTKA 2W4KA 4FTNA 2HYYA 4YZNA 3OCGA 3NPCA 5C8NA 3IOKA 2PVHA 5H8BA 3UYSA 4PY1A 2R3GA 4D5KA 4GJ3A 3UGCA 4YJPA 2GQGA 3FL5A 4FT9A 4FTKA 3PVGA 4L3LA 5AP2A 2R3HA 3GGFA 5KMJA 2WB8A 2Y6OA 1VEBA 4ZOGA 2C6DA 3GU7A 3U4UA 5K0XA 3MY0A 1GNGA 3QZFA 4FNYA 1M2PA 2Z7QA 5AP7A 3D7ZA 3D2IA 2JFMA 4FKOA 4X6RA 3NYXA 3PSCA 3OTUA 3E8CA 3NUNA 3VBYA 4EH9A 4I20A 3CQWA 1QPJA 3MVLA 4JDIA 1ZRZA 3NS9A 4A7CA 3A7IA 4MF0A 1H8FA 3C4XA 3LJ2A 4LMNA 4U6RA 4BI0A 3UQFA 3ZLWA 2QOCA 4AXAA 4I5HA 3CEKA 5A4QA 4O4CA 4QMVA 5C8KA 5KMOA 2B9HA 3ZRKA 1W2CA 4OLIA 3SXRA 3WF9A 3FWQA 3DNEA 3QRIA 4FIHA 2B55A 3OOMA 3OG7A 4OT6A 4RQKA 3RPRA 4ASEA 4IAFA 5HNBA 4ENXA 3AGMA 3D94A 3RTPA 2XK3A 2VX3A 3R9NA 3K54A 3K3IA 4DBNA 2ETKA 4CXAA 1WBWA 2VWZA 4NK9A 4XNEA 5B7VA 2XIXA 1BI8A 4BTMA 5KMIA 4C38A 3ZFYA 5K4JA 3HV6A 3S4QA 5IA3A 3SOAA 4NM0A 4WOVA 2X7FA 4F7NA 4BN1A 1LPUA 3Q4ZA 3ZXTA 1NVQA 4B8MA 4EH7A 3W10A 3F3ZA 4GT3A 5HG9A 1KV2A 5HIDA 3S3IA 3QQHA 2B7AA 1OI9A 3QTRA 3CIKA 5M4CA 1XH6A 1E9HA 3EH9A 1PMNA 5T3QA 4KSQA 5AX3A 4C4IA 4J8NA 4NW5A 3WZUA 4JR7A 4APPA 4QMXA 2QURA 2ZB1A 4HYIA 3HKOA 4YZ9A 4YHJA 1JLUE 2H96A 2BRHA 4FSUA 5G1XA 3U9CA 1M2RA 1V0PA 3QQUA 4GVAA 5J7BA 1YRPA 3G0EA 2W05A 2BCJA 5JFXA 3FBVA 3I6WA 3MH3A 2E9NA 1YDSE 4IM3A 2VWXA 4BZNA 3ZO1A 3LQ5A 3KF7A 4C4EA 3D2KA 3PJ1A 3PY0A 1AGWA 4WSYA 3QF9A 3ZZWA 4E73A 4O0TA 5EM6A 5EK7A 4N6ZA 2W1IA 3E3PA 1YI6A 1JQHA 3R73A 4CFWA 4RC4A 3COKA 5DN3A 3I5ZA 2IN6A 3EQBA 4QPAA 4AWIA 1UWJA 3MA3A 3FI2A 2XK7A 4O0YA 2A98A 1YI4A 5FLFA 5IDNA 4U80A 1IEPA 2IVTA 3KC3A 1CSNA 1GZOA 2ZDTA 3HMMA 3LJ0A 3A4PA 4YGAA 4K6ZA 5E8UA 5I9YA 3RMFA 5BVNA 4V0GB 3F2NA 1PKGA 4UALA 4MWIA 3PIXA 4ZLOA 4BTKA 2C5VA 4IAKA 2CGXA 4EK6A 2C3JA 2WD1A 3O96A 2UZNA 3QRTA 4W9WA 2PZ5A 3BIZA 3FZ1A 5HTCA 5HTBA 4C61A 3QZIA 4V05A 3UNZA 2Y7JA 5KZIA 3EN7A 4NCTA 3RJCA 3KRJA 3MVHA 4EQUA 4IJPA 5HIEA 3PRIA 2ITUA 5M4UA 3E7OA 5JQ5A 2WFYA 3HRCA 2Z8CA 3GU8A 4MBLA 4BF2A 4CMOA 3GQLA 4U9AA 3W33A 4D1ZA 5E92A 4BGGA 4IADA 3ZFMA 1LEWA 2GU8A 3RM6A 3P7CA 4OUCA 4TYEA 2V0DA 4UZHA 3RPOA 4YZCA 4YJUA 2WMRA 4DCEA 1Q99A 5AR5A 3IDPA 1ERKA 2XRWA 2C6IA 3HRBA 4FEQA 4HVIA 2BUJA 2WEVA 4B0GA 2QHMA 2XK6A 4XRJA 4MXYA 2OFVA 1SNXA 3OMVA 3C51A 3QKKA 2ITQA 2XNMA 4Y8DA 3AOXA 5DGZA 4X7QA 4RJ5A 2BZHB 3GVUA 2BRNA 2HAKA 2YIQA 4RGJA 4J53A 5AUVA 4QO9A 2DS1A 5DPVA 3NSZA 3F7WA 4BCMA 4ACMA 5DG5A 3ORLA 2ZV8A 3QXPA 3ANRA 2XKCA 4U97A 3E8EA 3W2PA 2VO6A 3BV2A 3C1XA 4DINA 3G33A 1E1VA 4JDHA 1H4LA 5TOZA 3AD6A 4PNIA 2R3LA 2X2LA 3LFSA 3LHJA 2ITTA 3PXZA 4RT7A 3ZDUA 4AN3A 4PWNA 4DFNA 1OKZA 4EK5A 2JD5A 1GY3A 4YHTA 2ZM4A 2Y8OA 5AR3A 5FDXA 4L46A 2FYSA 4KS7A 4ZIMA 2Z2WA 3VUGA 4QMOA 4BDAA 4DH3A 3RK7A 2QONA 1W7HA 1KOAA 3BI6A 1JKSA 3LXKA 3MV5A 1SNUA 4RWLA 1Q4LA 3TJCA 3TNQB 2GHGA 2OJFE 1W0XC 1ZYJA 3R8PA 3QCXA 5EHLA 3VRYA 3UOLA 4IB3A 2VD5A 3DK7A 3GEQA 3FZSA 2XVDA 3OVVA 5IKWA 1RJBA 4QP8A 2C6KA 2CJMA 4I23A 5H8EA 1WVYA 3UC3A 3OOGA 2FO0A 3AMYA 2IVSA 4G3EA 5CANA 4JLCA 2QOLA 2WELA 3AC8A 3FV8A 4O0UA 2HZIA 2IJMA 3EJ1A 4U5JA 5GNKA 4L67A 5CY3A 3SLSA 5DEWA 4BC6A 3F82A 2HWOA 1TKIA 5J7HA 2ITZA 4DFLA 1P4OA 4YZMA 4PP7A 5L2QA 5JRSA 1UU7A 2V7AA 4R7IA 2C30A 1UKHA 3L9PA 4J97A 3TIYA 3ZOSA 2CSNA 1REJA 3FLWA 3QD2B 4W4YA 5IUGA 4BDKA 3PE2A 1GIHA 3C50A 3CCNA 2CMWA 2VWVA 3JPVA 2VUWA 5F95A 3JVSA 4ACHA 5HNGA 4BCHA 3BLQA 4LQMA 5T68A 3Q6UA 3R8MA 1RQQA 5FEEA 3GCQA 1JAMA 3R1SA 4WBBB 2DYLA 3Q6WA 2GFSA 2J0JA 4XP0A 4ZY6A 3WE8A 4Z16A 3R22A 4DC2A 5HBJA 3IONA 2RGPA 3LIJA 4FSNA 4JJRA 4A07A 2XEZA 3OF0A 3NUSA 4UEUA 2OZAA 1M7NA 3KVWA 4S34A 2VGOA 3P79A 2QQ7A 4DH8A 3NR9A 4DEHA 4JRNA 3FMKA 3QXOA 3ORMA 2UW3A 4EKKA 1YDTE 4ZTHA 3PVBA 4AU8A 5I0BA 4DFXE 4MBIA 3EKNA 3DAJA 1WBOA 4YSMA 4IE9A 5EKNA 2G01A 4ZZMA 3NAYA 2JIIA 2NRYA 3PA3A 4M8TA 3ZEWA 1W98A 3DA6A 3R7UA 3COIA 3MN3A 3ODYX 1MQBA 4FV5A 5IH5A 4PV0A 4C4GA 2ITXA 5L2IA 4YTCA 3Q5ZA 2WTCA 5CU3A 4FUYA 4PMPA 5A4EA 4YJSA 5DEYA 3C4CA 1PHKA 2RFNA 4AF3A 2W7XA 1V0OA 3HEGA 3ORXA 4YPDA 5AWMA 4CNHA 3I7CA 2V55A 2OJGA 3TUDA 3SXSA 3DNDA 4PPCA 3P1AA 3V5JA 2UW7A 4ZS0A 2H6DA 4DH5A 5J5TA 4WG3A 4M68A 3RK9A 2X0OA 2QODA 2WMSA 3TT0A 4I21A 5IA0A 1WBVA 4FL2A 5DA3A 2VWIA 3LCKA 5H2UA 5J5SA 4RJ8A 3F5XA 4GRBA 3IKAA 4TWNA 3EWHA 4TXCA 1PXOA 5IPJA 4WSQA 2V62A 4BWPA 4GSBA 3VWAA 3W2SA 4O1PA 5JGDA 4R1VA 3OEZA 5JZJA 4EC9A 2W9ZB 4UV0A 3VUHA 5BYYA 3KEXA 3HDMA 3SRVA 2I0HA 2G2FA 3CBLA 4B99A 1YXVA 5BX0A 4FYOA 4CRSA 3OWJA 1MRUA 4O0RA 5AADA 4HPTE 4DG0E 1I44A 2X39A 4BL1A 4E7WA 1H26A 4JVGA 4O2PA 4S2ZA 3R8VA 3DK3A 5CZHA 3PJCA 1NVRA 1J91A 4EOJA 3CY2A 4F64A 3H9OA 3OEFX 3RZBA 3RWQA 4F99A 3KXMA 4E26A 2HZ4A 3OUNB 5JSMA 2ITWA 4CKJA 2FSOX 2X0GA 4XG9A 5DH3A 5K0KA 4UB7A 2XBAA 4MXCA 5J87A 4WG5A 3R8UA 2WXVA 2JIUA 1BL6A 3M42A 3AD4A 5JZNA 2J4ZA 4E20A 5BVOA 2RL5A 2OJ9A 3MJ2A 3CE3A 4ZTRA 4LUDA 4ANNA 5IH6A 1GJOA 2OFUA 4E6DA 4NTSA 1EH4A 4R8QA 3FZTA 5D41A 4KABA 5AA8A 5AJQA 2XUUA 1ZWSA 2PY3A 4F63A 4GYIA 3T8OA 3HZTA 2C3KA 3LQ8A 5IA2A 4XHKB 2J50A 3Q9XA 4G5JA 4HNIA 1FQ1B 1KE8A 3DS6A 4EI4A 2YCRA 4IH8A 2EXCX 1DI9A 2JKKA 2XKFA 2VTHA 2CGVA 4OTDA 1KE9A 1Y57A 1DI8A 4YC6A 3R83A 2WMAA 2UZDA 3I81A 5HO6A 5TR6A 2ONLC 5B2LA 3R8LA 3LAUA 5C9CA 4MAOA 3KULA 3R1NA 3MJ1A 1OZ1A 3P9JA 4BKYA 5AUTA 2IVUA 2YCFA 1PXKA 2ZV2A 4IACA 3FC2A 3QYWA 4AE6A 2PE2A 1W8CA 3KKVA 3ZUTA 2R3MA 2BFXA 3UPXA 4YU2A 4HGSA 1QL6A 4QMWA 4BDIA 1PXMA 2E2BA 4OTHA 5AP4A 3EQPA 1OUYA 2W1EA 5E91A 4H1MA 1U4DA 3LFDA 4GL9A 3QCSA 3C7QA 4HVHA 4QTDA 3HV3A 5C1QB 3QWJA 4FTQA 2BHHA 4NIFA 3GCVA 1PKDA 2WMUA 5FBOA 4UMRA 4XOYA 4E4MA 4BCKA 3FMEA 4IB5A 3WYXA 1HOWA 3VQHA 3FLYA 4H39A 3W16A 3F6XA 2QKWB 4JAJA 3WF5A 4FKTA 2WQEA 1YXXA 2QOQA 3MVJA 3TZ7A 4Z3VA 4QQJA 2WNTA 4D4RA 3I4BA 2EWAA 1KV1A 1Y6AA 1RDQE 2W0JA 4H3BA 4PNKA 1FMOE 4HZSA 3ZSIA 4KBAA 2BZKB 3FI4A 4FV0A 4R3PA 3KF4A 3ACKA 5I3OA 5E1SA 1YHVA 3VBWA 4D9TA 2Y4PA 1Q8YA 3TZ9A 1ZARA 5I4NA 4IAIA 2F4JA 3GB2A 4EYMA 4NM7A 3BGQA 4RA4A 4BDFA 3O8PA 2WKMA 5CU4A 2C0IA 4ZP5A 4FOBA 3R9OA 5CASA 2O65A 3DKCA 4IIRA 5AR7A 3Q52A 2YDJA 2XKDA 3PPJA 1M14A 4QPSA 5FXSA 5HE3A 4AW5A 1XH4A 5C03A 5IEVA 3PP1A 1H07A 2PVLA 4TPTA 1UV5A 4IW0A 3F5UA 4RX9A 2WQOA 5TT7A 4AGDA 1X8BA 2BTSA 1G5SA 3DAEA 3Q4TA 2X7OA 2JBOA 3IW6A 3NNVA 1KE6A 2C5OA 3DKGA 2QO7A 3MW1A 4LRJA 2YIWA 4PRJA 1OL2A 2I40A 5ACKA 3C13A 4G6NA 4PP9A 4JG7A 3A7FA 3MFRA 2J9MA 2OIQA 1QPDA 4NSTA 3ODZX 1OL7A 4C2VA 3UP2A 1TQPA 4I5PA 3B2TA 3HA8A 4NJ3A 3VIDA 3EFJA 1OIQA 4FV2A 5EM7A 4ZEGA 2QNJA 1PMVA 2CCIA 3MFUA 3WARA 3ZS5A 3QZHA 4ITIA 4C7TA 3OXTA 4IWPA 4TWCA 5F4NA 5J8IA 3T9TA 4HGTA 4EOKA 2YJRA 4RJ7A 2C5NA 3A4OX 4OTGA 2OH4A 3VBXA 2X0PA 4W9XA 5A6NA 4MCVA 4LYNA 5FD2A 3DB6A 3VUMA 5FM3A 3ZUVA 4BIEA 3QWKA 5BQ0A 2EVAA 3PSBA 3DLSA 4G5PA 5LVPA 1OL5A 4QNYA 3ENMA 4ASDA 3JY9A 4WNOA 4AW1A 1BUHA 3AG9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4O4E A;  2IF8 A;  4FRF A;  4O4D A;  1W2F A;  4O4C A;  1TZD A;  2A98 A;  4O4B B;  2IEW A;  1W2D A;  1W2C A;  4O4F A;  2AQX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2X0O A;  4O4E A;  2IF8 A;  4FRF A;  2X0Q A;  1W2F A;  4O4D A;  4O4C A;  1TZD A;  2A98 A;  2X0P A;  2IEW A;  4O4B B;  1W2D A;  1W2C A;  4O4F A;  2AQX A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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