1W2DA

Human inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with mn2+/adp/ins(1,3,4,5)p4
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
SFKAAGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILASLAER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of a Human Inositol 1,4,5-Trisphosphate 3-Kinase; Substrate Binding Reveals Why It is not a Phosphoinositide 3-Kinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSITOL-TRISPHOSPHATE 3-KINASE A
total genus 94
structure length 265
sequence length 265
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1w2dA00
4O4CA 4O4EA 2A98A 4O4BB 2AQXA 1W2CA 1W2DA 2IF8A 4O4DA 4FRFA 1TZDA 1W2FA 2IEWA 4O4FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IA8A 1MQBA 5CNOA 3BU3A 3U6HA 3WI6A 5BUEA 5J87A 5LCJA 4RJ4A 2OJGA 4EUTA 1OGUA 5AR2A 4CLIA 5A6OA 3BQRA 3U6JA 3M1SA 2GS6A 4X7QA 4OW8A 4ACCA 3QA0A 2XEYA 4RGJA 4YHFA 4YLKA 1XH7A 3A7JA 3BBWA 3RZFA 5HG9A 3Q32A 4QT1A 5E7RA 1GZNA 1H1WA 2LAVA 3QX2A 4I5PA 4NT4A 4ONAA 3Q60A 4BCIA 1SNUA 4HPTE 2H9VA 3OROA 3I4BA 3VF9A 5J5TA 3IK3A 3LCSA 3QBNA 2EU9A 2A4LA 4USDA 5DFPA 5DE2A 3V5TA 5FBNC 2R2PA 2UVZA 4F6SA 1JKKA 3BGPA 4KD1A 2BMCA 5EK7A 5ETCA 3VUIA 3L9MA 3Q9YA 2X0OA 3TEIA 3BCEA 4JJRA 3NDMA 3G33A 4FG7A 4JIAA 2VU3A 5FLFA 4ZY4A 1RE8A 2RFDA 5HTCA 3U6IA 3C5UA 2IVSA 4S30A 3MFSA 5CENA 3CKWA 1YHVA 4IWDA 4O6EA 3VW8A 4O4FA 4QP7A 5HKMA 3NUXA 3O71A 3UO6A 3I7CA 4JG6A 5JFSA 2FO0A 4R7IA 4O0RA 2XRUA 5BPYA 5CZHA 3IDCA 1AGWA 3CY3A 2DS1A 4QP1A 5KE0A 2QO2A 5GHVA 1OUKA 3AD5A 3WZKA 5KZIA 5J8IA 3KN6A 2ITVA 2QHNA 2WMRA 3R8PA 1QCFA 5HNBA 1SNXA 5L2IA 3KULB 3LCKA 4QTAA 1XBAA 4XCUA 5CU2A 1KOAA 2ITUA 4ZJIA 3EKNA 3PPKA 4BYJA 5JGBA 5M53A 3POOA 2HWOA 5B2KA 3QWKA 5F95A 3CD8A 4FSMA 4U43A 4APPA 3MIYA 4GK3A 1JKSA 3R21A 1TQPA 2W1CA 1G5SA 5CU3A 4I20A 4NM3A 5CEMA 3H9FA 2C5XA 3QX4A 4OTWA 3BWFA 1Q4LA 3C4EA 4FKSA 1IASA 3QKMA 3ZSIA 4ZJVA 3NLBA 4C2VA 1LEWA 2C6MA 4HYUA 2OKRA 4JAJA 3BYVA 3OBJA 2R3HA 4F7SA 4B8MA 4NW5A 2P4IA 4ACDA 4L6QA 5EOLA 1YDRE 2BDFA 4NJDA 2XBJA 1V0PA 2Z7RA 4FTRA 4JL9A 5EM5A 4EK8A 5HIDA 2PE1A 3VVHA 4QMZA 3KRLA 4FKQA 1M17A 2WMSA 3A7IA 3NEWA 2R0IA 4XG3A 3ZFYA 3WF6A 1LEZA 1OITA 3MH0A 3PJ8A 3ZH8A 3KY2A 2PMIA 3Q4ZA 4QYFA 2B4SB 4JOAA 5F20A 2BALA 3P7BA 3Q5IA 4FIIA 4L53A 2HK5A 2CJMA 1RW8A 2X7FA 4DFLA 4FV6A 4KSPA 2Z8CA 3BYOA 4G3DA 4FV4A 4TYHB 5HGIA 2BAQA 2ITOA 3TZMA 3MH1A 4GV1A 4I6QA 4BTJA 4ENXA 3IECA 5CYIA 1MQ4A 4J52A 2VTOA 4JX7A 2WKMA 5IUGA 1PW2A 2VWWA 2P55A 3MBLA 3FV8A 5CAVA 3OW3A 2W06A 4UZDA 1LPUA 2WMTA 5CANA 3EN6A 3ZHPC 4AA4A 3A4PA 3FAAA 3TNPC 2C69A 3ZO3A 4BDGA 2O2UA 5JK3A 4ZLYA 5A4TA 3LMGA 5ETFA 2WMXA 1EH4A 3OT8A 3TZ8A 3HDNA 3GGFA 4BDIA 4ASDA 3ZXTA 3IW6A 1UU3A 5KKRB 3HRFA 4ZSLA 3E3BX 2YIXA 2V22A 4FGBA 3NYOA 2BILB 3BI6A 3GUBA 2UZUE 4G5JA 2DQ7X 4MD9E 4BCOA 2VWUA 2PVFA 1TVOA 2UW9A 4R1YA 4CRLA 3O23A 1RJBA 1DS5A 4M0ZA 4J53A 5ANJA 3MFTA 2OXDA 5E8UA 1Q24A 2R3PA 4BIBA 3MTFA 4PWNA 5ITAA 4MXOA 1MP8A 1UU8A 4AA0A 3VUDA 2F7EE 4NK9A 1O6KA 4H1MA 3NGAA 3VRZA 1WVXA 2PZ5A 3R2YA 3S2PA 2ETKA 2H8HA 4I6FA 1NVQA 4ZOGA 4QP2A 2OSCA 4RWLA 3W1FA 4DYMA 5F4NA 5CEQA 3TT0A 1B39A 2EXCX 3CEKA 4UYAA 5DH3A 1ZZLA 2PY3A 2YFXA 3EFKA 4LUEA 3H0ZA 4W4YA 3PSDA 3A7FA 3UP7A 3VS3A 2C3KA 4QMSA 1OL1A 5IH4A 2F2UA 5BVWA 3COKA 4FKWA 1WVYA 4JVGA 3E8DA 3VUTA 4C3RA 2ITXA 4HNIA 2R3KA 2WTVA 2AC3A 3SOCA 4UMRA 3BGZA 5A4EA 5IH5A 4MYGA 3VRYA 3ERKA 2I0YA 3OEZA 3D5UA 4PPBA 4YSJA 3V51A 3HV4A 2W7XA 4IIRA 3C9WA 4KS8A 4AU8A 3JS2A 4FTNA 4FSYA 2X8DA 3MV5A 5H8GA 5CF6A 1YWNA 1QPDA 1J1CA 2X2LA 4YO4A 4L44A 5L8JA 1NVSA 1CTPE 3ZLXA 2BDWA 1KV1A 4BL1A 4LG4A 2E9NA 1P2AA 4ENYA 5JGAA 1OKZA 4ARKA 2OJFE 4PX6A 3QQFA 3FZRA 3S1HA 3CJGA 2XK3A 3NW7A 3LIJA 2VTLA 4PNIA 4F6WA 1OIYA 4BIDA 2JBOA 4HZRA 4XG4A 3ORTA 5HNIX 2R3OA 1ATPE 4LL5A 4BCKA 2WMUA 4BTKA 5DEWA 3ZSHA 1JLUE 4XV1A 4FICA 2BHEA 5FEDA 4GG7A 5GZ9A 2ZB0A 4M7IA 1WZYA 3NIEA 2UZOA 5HG8A 4F99A 2R3GA 3IS5A 4CMUA 4G2FA 3HEGA 3LPBA 3LHJA 3QD0A 2QOHA 3EHAA 4OT5A 4BIEA 1UNLA 2A19B 4O4EA 3D5VA 4QMNA 3PY1A 3OEFX 3KXHA 3R9HA 1MUOA 4EOLA 4UXLA 5H8BA 4XG7A 3RAWA 3UMXA 1ZXEA 4XLIA 4BHZA 2YAKA 4JG8A 2I40A 4M13A 3PVGA 4RJ3A 3BKBA 4QTBA 4NIFA 2BVAA 5CQUA 5DOSA 4BDAA 4DEAA 1K3AA 5LCKA 3NYVA 1W2CA 4GUEA 4LYNA 3U9NA 4FV9A 4BKJA 3FZPA 5CEOA 4D4RA 1SM2A 1IR3A 2RGPA 2C30A 2WQBA 4AZSA 3C4XA 3IW7A 5CEKA 5C26A 2ZDUA 4X0MA 1ZARA 3NIZA 2HCKA 5EI8A 5GJDA 3FXZA 5CF8A 3AMAA 1OMWA 3UIXA 4BI2A 4G6OA 5HICA 1Q8WA 1WBTA 4V01A 5E8ZA 2VX1A 4FKIA 4G9RA 2VO7A 3Q6WA 4YJUA 1OIUA 3QRKA 2B55A 4ZTNA 4FBXA 4EK3A 1V0OA 3CP9A 1ZYJA 1ZRZA 4X6QC 5F1ZA 4YBKA 3DKFA 4NZWB 2PK9A 1OVEA 2Z60A 4PRJA 4W4XA 3DJ5A 3UDBA 3E93A 5HE1A 3Q9ZA 2IO6A 4DGNA 2J50A 4Y95A 4NFNA 4NFMA 1H26A 4TNBA 3LAUA 2IWIA 4BI1A 2PUUA 2CMWA 4TN6A 4NM7A 4CKRA 1FVVA 3WILA 4MCVA 3R7OA 3WE8A 3N51A 1Q8ZA 2W96B 3HLLA 2W1ZA 3DY7A 3L1SA 4GS6A 2UW8A 4ITIA 5CY3A 4DG3E 2E9VA 2YIWA 3QLFA 5TT7A 3QL8A 5EM7A 3NRMA 4D4SA 4ZSAA 3G90X 2BPMA 2ESMA 2BRGA 3OOGA 3Q6UA 3RINA 3ZBFA 3UGCA 3E8CA 2C0IA 3NUPA 2C6OA 3TXOA 2Y9QA 4RSSA 5I9XA 2B9IA 2W4OA 1XBCA 2GMXA 4WG4A 4RLLA 3NX8A 5KCVA 3A99A 4WRGA 3C0GA 4BHNA 5DA3A 2GNFA 2IVUA 3SXRA 2V7OA 4F08A 4YU2A 4YC6A 3ZMMA 1T45A 4OTIA 2B9HA 3GEQA 4AW1A 4EH8A 5K0XA 2BFYA 3MTLA 3C4ZA 3LFEA 1F0QA 5HLPA 4ZJJA 1XWSA 2JIVA 3C13A 3TKUA 3MY0A 5AUZA 3A7GA 3L8PA 4NJ3A 2F57A 3QRTA 4KKGA 4AZEA 4OLIA 2W1FA 4I41A 5FEQA 4AGUA 4CTBA 4WNMA 4OTRA 3VHKA 3WE4A 2ERZE 4JRVA 4QTCA 1M7QA 4ZTLA 2YDKA 4DG2E 4J7BA 4FV7A 4F4PA 2HELA 4U79A 3VBTA 4XNEA 2JKKA 1UWJA 3W2CA 4WD5A 5CSVA 4QD6A 4C02A 3E8EA 3MJ1A 3OWLA 5J9LA 2ONLA 2R3RA 1H1PA 2FGIA 4KABA 2YAAA 4MWHA 5EW3A 3O17A 2IW8A 3GQLA 4FZ6A 4IB1A 4EL9A 3CQWA 3R01A 2IJMA 1GNGA 5EH0A 5HE3A 3QZIA 2ITNA 3FMHA 3HKOA 2Y0AA 2IW6A 4R6VA 5E8SA 1F5QA 3JY0A 4G31A 2BFXA 3GCUA 2WMVA 4DFZE 2W1HA 4IB5A 3TV6A 1W7HA 2EB3A 2PVRA 4EC9A 3DV3A 4HOKA 2VNWA 1NVRA 5GZAA 4KIKA 3WOWA 1PY5A 2YWPA 3GFWA 4Y8DA 1YKRA 5E8YA 5AV1A 5AAGA 4FKLA 5B2MA 4BDKA 4A4LA 3VS0A 5LQFA 4XBRA 1H8FA 3OWKA 2G2IA 3K5UA 4ZSEA 2Y4IC 4BKZA 5HZNA 2G9XA 2PZRA 3DAKA 4L9IA 2BAJA 3I79A 3O50A 3PG3A 5DRDA 3JY9A 4EUUA 5A4QA 5CAUA 3SLSA 4IVCA 4JS8A 1H27A 4ITHA 3A62A 3E88A 4EOMA 3S95A 4F65A 5IDNA 3AOXA 5JH6A 3KMWA 1R0EA 5LVLA 4C0TA 3GP0A 3PLSA 4GL9A 4YJQA 4F1OA 5AR5A 4L7SA 2ZDTA 3DA6A 5LARA 2GHLA 4BB4A 4EHVA 3ZTXA 5LVMA 4DH1A 4L42A 2J6MA 3HX4A 3V3VA 3RALA 3BPRA 1TKIA 4IC8A 2VTAA 3GU5A 5A9UA 5HX8A 4IAIA 2QCSA 3RPOA 4A07A 3P08A 4CSVA 3FMDA 4QYGA 4Y73A 3CIKA 3EQRA 4E6AA 4FNXA 5H8EA 4YZ9A 1UA2A 4UV0A 2HENA 4AOJA 2QLQA 4AW5A 1AQ1A 5BMSA 3KXNA 3O8TA 1J1BA 1GZOA 3SRVA 3CPCA 5AWMA 2X9EA 2P33A 3MI9A 4ANNA 5JQ8A 4E8AA 2VGPA 3D7TA 3T9TA 3RAIA 1B38A 4GT4A 3FZOA 3SW7A 2X4FA 4LRJA 4KBAA 3V8WA 3C7QA 3LFSA 3ZCLA 4DINA 4KRCA 2XK6A 3OT3A 4JR3A 2QU5A 2JIUA 2OICA 3CCNA 5HIBA 2G1TA 2XCKA 3LXLA 3P5KA 4KKEA 4K1BA 4I21A 4A9YA 3C50A 1PHKA 3UNZA 2E9UA 3FLZA 2JFMA 3LFCA 3EN4A 5AP6A 3AGMA 5LMKA 4GEOA 2HZNA 3FI2A 4KBCA 1PMUA 3DDQA 2OU7A 3R00A 3EYGA 4FTMA 4W8EA 3I0OA 3IW5A 4WNKA 4AZFA 1VEBA 3KK8A 4FSQA 2R64A 4EQCA 2JDRA 3PFQA 3FMLA 4N6ZA 1JKTA 4AS0A 2QLUA 4FSZA 5K3YA 2UV2A 5FTOA 2RIOA 4G1WA 3AC3A 4UB7A 5AV0A 5C8MA 3GC7A 3EL7A 4QQTA 4O0XA 3FLYA 4Y46A 5DPVA 4LRMA 3UVRA 3PXYA 3OHTA 4KAOA 3ALOA 3BQCA 3ETAA 1XHAA 3QRIA 3CGFA 5TR6A 5FXSA 2ERKA 4U42A 3AC5A 2ZVAA 3DNEA 3LFDA 4RLKA 3BEGA 3MN3A 4YTHA 3I6WA 3HVCA 2W4KA 4HVHA 3HZTA 4IZ5A 4AF3A 3FXWA 4FT5A 3CGOA 3ZO1A 4JLCA 1QMZA 3G9NA 3WZEA 4WUAA 1YI3A 3ALNA 4DGLC 4J99A 4I6BA 1DI8A 3GC9A 5LMBA 3ZRMA 1XKKA 2UW4A 1WBVA 2VO6A 5EM6A 4V04A 4HYIA 4A7CA 4EJNA 4FG9A 4OT6A 4A9UA 3ZU7A 4FNZA 5B7VA 1H1RA 2XUUA 3E63A 3QGWA 3VHEA 4A9TA 4XV9A 3VS5A 3PIYA 1YW2A 4TNDA 4W4WA 2GFSA 2ZYBA 1DAYA 4LMNA 4XG8A 4D5HA 2BZKB 4AQCA 5CF4A 1QPJA 4EQUA 2R7IA 2EXEA 4QP9A 4C58A 3BV3A 5I9YA 5A6NA 5I9ZA 4BCMA 4D2TA 1UKHA 4S34A 3I5NA 2J7TA 3HRCA 3MPMA 2EB2A 1E9HA 3R8MA 5B2LA 4YTCA 2PE0A 4ITJA 4E1ZA 4PUZA 1VR2A 4I22A 4C3PA 3FMMA 2YA9A 5DR2A 4UMUA 2C3JA 3IOKA 2FA2A 5LVOA 2ACXA 3CPBA 3F7ZA 3FI4A 3KA0A 3CTQA 3M2WA 2J5EA 3R22A 5IA5A 4X3JA 2BZHB 2JFLA 2OH4A 5GJGA 2QURA 4MD8E 5ICPA 1GOLA 2BKZA 4E4LA 4IJPA 1H24A 3UO4A 3QQKA 4RMZA 2OI4X 3F69A 2CKEA 5CAOA 4W9WA 4QQJA 4BDHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4O4C A;  2X0Q A;  2A98 A;  4O4E A;  4O4B B;  4FRF A;  2AQX A;  1W2C A;  1W2D A;  2IF8 A;  2X0O A;  4O4D A;  2X0P A;  1TZD A;  1W2F A;  2IEW A;  4O4F A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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