1W2DA

Human inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with mn2+/adp/ins(1,3,4,5)p4
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
SFKAAGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILASLAER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords INOSITOL-TRISPHOSPHATE 3-KINASE A
publication title Structure of a Human Inositol 1,4,5-Trisphosphate 3-Kinase; Substrate Binding Reveals Why It is not a Phosphoinositide 3-Kinase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 94
structure length 265
sequence length 265
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1w2dA00
2A98A 4O4EA 1W2FA 1W2CA 4FRFA 4O4DA 1TZDA 4O4BB 4O4FA 1W2DA 4O4CA 2AQXA 2IEWA 2IF8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I0TA 4HVDA 2IO6A 4RLKA 4D2VA 3IW4A 4QYEA 3S2PA 4A9SA 3Q3BA 4NM5A 4EK3A 3H0YA 5HO7A 3DQXA 3DV3A 5AM6A 1UWHA 3UG2A 3GXLA 5CZHA 1BKXA 2CGWA 2JITA 4X7QA 1ATPE 1I44A 3L1SA 3Q9YA 3F82A 4BCJA 4C34A 5CTPA 4USDA 3RZBA 5CNOA 4R1VA 3COHA 4YLJA 2W1ZA 4CFMA 2FO0A 2FSOX 3ENHA 2IW8A 2UW9A 1DAYA 2CCIA 2FVDA 3SRVA 3RWQA 5J5TA 3QTZA 2YLEA 2YERA 3D0EA 4FVRA 4JAJA 4F1OA 2PVFA 4TW9A 2FB8A 3EHAA 4F4PA 2J0IA 5JFXA 4Y8DA 5HO8A 4JQ8A 2XBJA 4FIHA 2BZHB 4MXAA 3BWFA 2X7GA 4DG3E 3KCFA 2C5OA 3MY1A 5K0XA 2GS2A 2QO7A 4HYSA 3R8MA 3JVRA 4F0GA 4FG7A 2BAKA 2OICA 1UNGA 2C6EA 2PE2A 1YWNA 4CD0A 3EQDA 3VRZA 4MNEA 3RM6A 4FV0A 5EI6A 4CZYB 2WTDA 3EIDA 4FZAB 5KNJA 3OS3A 4D9TA 3DKGA 4DGLC 4ZLZA 5J95A 5ANOA 4HJOA 4UV0A 1V0BA 5L6PA 3MFSA 2GNGA 4AS0A 4GSBA 3NAYA 4QP8A 2ETRA 4YJOA 4JQEA 5AUWA 5H8BA 3RALA 2KTYA 1YI3A 3G51A 3IPHA 3O96A 4RVKA 4XBRA 5IUHA 5DR6A 2WO6A 1A06A 5AV2A 3FL4A 3RGFA 4AW1A 1Z57A 3LXPA 3A2CA 2J4ZA 4TRLA 3ULZA 4Z7GA 1SM2A 2JIUA 3LCOA 1P5EA 2EUFB 4IB1A 3HMOA 3M11A 2VGOA 5LMKA 3IG7A 4WNOA 5AAFA 3S00A 3G2FA 3PJ3A 3LCDA 4QPSA 4XH6A 5AUTA 2B9FA 3P1AA 4PRJA 5HG5A 3PIXA 3DT1A 3Q6UA 4CKRA 4TPTA 3QKMA 4NCTA 2GTNA 3IK3A 3RPYA 3W2QA 4F9YA 2V7OA 3LFBA 4QMMA 3HMIA 1OECA 3BLRA 4JRNA 1O9UA 2WTKC 5AP4A 1OKYA 4FZ7A 4GVJA 2XK4A 5HCZA 3V5JA 3NS9A 3NUSA 3FLSA 4FTTA 3G6GA 4O4FA 4MTAA 4XNEA 4H3BA 3WF7A 5CF6A 3MSSA 3P86A 5AP3A 2QO9A 2XK3A 2J6MA 3DLZA 1TQMA 1ZOEA 5CVHA 3TJCA 4FV7A 3FLZA 5IEYA 2Z7LA 2X8DA 2J0MB 2W1HA 3QCXA 2OZOA 4S33A 2BDFA 2OKRA 4PQNA 3F66A 3IONA 3E5AA 2A19B 1WBOA 3NYVA 3T9IA 2R2PA 3UQFA 4XG3A 4CFXA 4EOKA 3UZTA 4FC0A 4I0SA 3PTGA 3AXWA 3JYAA 5E92A 5TE0A 3AT3A 5J5SA 3C50A 2BPMA 3QRUA 3PA3A 5L8LA 2JFLA 4G9CA 3NPCA 5L2SA 4TTHB 1XWSA 4I3ZA 4TKSA 5HNBA 4B9DA 3AC4A 4L6QA 4O4DA 4EOMA 5K5XA 4KIKA 1R1WA 5AX3A 3F3ZA 2HZ0A 4FR4A 3V5QA 3ZXZA 1OPJA 4I92A 4Q9SA 2YIRA 4EOIA 1KOBA 3BU3A 1G3NA 4TY1A 4NT4A 3TTJA 5CEOA 2C3JA 4FTLA 2Z7SA 5DVRA 2IZSA 3D5UA 1QCFA 2ITXA 3D7TB 4ZSAA 4GEOA 1Y6AA 3ALNA 4CFUA 4KIOA 4E4XA 3M42A 5EOBA 5J7HA 1Z5MA 2OWBA 3BYSA 4FKOA 2X4ZA 4AT5A 2RFSA 4J95A 4UMRA 3H4JA 4RFMA 5AA8A 4BDFA 4HYIA 4ASEA 2X8EA 4NIFB 5BUJA 3IDPA 1GAGA 3EOCA 5CAUA 4NM3A 2PVHA 2VO6A 3QLFA 4K33A 2WXVA 1JAMA 3HV7A 4BKJA 3FKNA 2RGPA 3C0IA 1R3CA 4U9AA 2C3KA 3LXNA 4O96A 1TQPA 4FTIA 4QPMA 2QURA 4LOQA 2ITPA 4DEAA 3W16A 2JKOA 2WQNA 4J71A 2C0TA 3BBWA 3K54A 2V7AA 3LJ2A 3U51A 1YOJA 2WGJA 2X0PA 3FI3A 4O0XA 4TNBA 4ALWA 2UZEA 4APPA 3EWHA 4E6CA 1X8BA 4MQ1A 3FBVA 1PXNA 4FNWA 3GNIB 4OT5A 2BTRA 4V0GA 5ETCA 4ANSA 4DLJA 4YO4A 5JGDA 3CC6A 2JC6A 3MIAA 4IJ9A 2X7FA 3GU6A 2WTCA 3EB0A 2V55A 5HBJA 3DCVA 2E9PA 2QQ7A 4RVLA 2A0CX 1XH6A 3NUXA 5ICPA 4RC3A 3W2SA 4MX9A 4XV2A 5AP0A 4LGGA 2PHKA 5JRQA 4M8TA 3VBWA 2PWLA 3SOAA 1H1WA 2ACXA 4RJ7A 4OTIA 5HU9A 2YIXA 3OFMA 2X0OA 2OZAB 4L44A 5IF1A 2JKKA 3CS9A 4A9UA 4YNOA 1FPUA 5GJGA 3R22A 4ZXTA 3MB7A 5CAPA 3F3UA 1YXUA 2IZUA 1WBWA 5H8EA 3ODYX 3PSCA 3KMUA 4LFIA 4B8LA 4DEIA 2ERKA 4LRMA 2OO8X 3PVBA 3RK5A 4RLLA 4W4WA 4R5YA 4ZOGA 3TKIA 4IADA 4YBKA 4M0ZA 5A4QA 2YM8A 3GU5A 3GCUA 3F5GA 2NP8A 4J97A 4FSMA 4ASZA 2W1IA 4AWIA 3PG1A 2Z60A 4AW2A 4MEDA 2OZAA 5HZNA 2EXEA 2J5FA 2J5EA 5CWZA 4F99A 4C4FA 2WNTA 2HXLA 4UWCA 1YVJA 4J1RA 1H25A 3WILA 4YP8A 5EW3A 2ITZA 2QC6A 4ZSJA 3ZDUA 1ZYSA 4AW5A 3BU5A 3DKOA 4U6RA 4J53A 2ZV7A 5HE0A 5A4LA 3QFVA 2PMIA 4RZVA 4U3ZA 2XKFA 3WARA 3R01A 3ANRA 1ZOHA 5E8ZA 3GOPA 5L3AA 2UW3A 5IMXA 4DH8A 4OBOA 4QP4A 2RG5A 2PZPA 4ASXA 5DR2A 4H1JA 2FH9A 4I0RA 4AQCA 3MVHA 2YLFA 3CGFA 3UYTA 3W8LA 4EWHA 3QCYA 3FZRA 4F6SA 1XBCA 2GCDA 4L7FA 1DM2A 2HYYA 2W1EA 3QX4A 4FOCA 4E4NA 3ROCA 2NRYA 3U8WA 5CI6A 3COMA 2V22A 3UVRA 3R2BA 2XH5A 5AIKA 3BHHA 4ZTRA 5EI2A 3KRRA 2XNNA 2JEDA 3PWDA 4A9YA 3MJ1A 3MVJA 4YJUA 4X2FA 4NUSA 5LVMA 2YDKA 3DBCA 2O8YA 3DFCB 4HPTE 3RJCA 5M56A 1LPUA 3GOKA 2VX1A 3ZUTA 3W32A 5HTCA 3GC0A 4QD6A 2J9MA 2BALA 1JVPP 5M55A 2XIKA 3SXSA 3R7YA 1BL7A 2BRNA 4RJ5A 5ETFA 4ZJVA 3QUPA 1OMWA 2YCFA 4N4SA 4TT7A 3FQEA 4CQEA 5KKRB 4FSQA 2UW0A 4M7IA 1URWA 2BZJA 3K2LA 2W99B 2VO0A 4IZ5A 5DT3A 4NFNA 4PF4A 3UNJA 5B0XA 1H1SA 1NVRA 3I0QA 1ZYDA 3O51A 1IRKA 4DHFA 2ITOA 2XYUA 3P9JA 4NM7A 5AP7A 3AT2A 3L8XA 5E8WA 2XJ2A 3H0ZA 3D5XA 2R3JA 1Y8GA 1YXSA 2QOCA 3C4XA 3D9VA 4WNPA 4I5CA 4L7SA 4IZAA 4LQMA 3GEQA 3QUDA 5AUXA 4ANBA 5M4CA 2WQMA 3GCVA 4ZY5A 5IA4A 3PLSA 2YM4A 2HK5A 5LVLA 3NW5A 3HNGA 1OITA 4EQMA 1R78A 5AA9A 1SVEA 2QR7A 3KVWA 3QGYA 1AD5A 3IECA 4FKUA 4Y83A 3QA0A 5HG9A 4CTCA 2OF2A 2OIBA 4D58A 1E1VA 2QVSE 2VNYA 3TZMA 1O6KA 4JBPA 4HW7A 4GUEA 3MFRA 3ORLA 2YN8A 4G3DA 2FSTX 3R8UA 1YDSE 3FZPA 3MBLA 3SLSA 1Y8YA 1OI9A 1IA8A 2C0OA 3KULB 2E9UA 4IJPA 1PXLA 2XNGA 2UZNA 4QMSA 3MTFA 5FXRA 1K9AA 3BYOA 2ETKA 3F7ZA 4L42A 4MVFA 4U0IA 3VJOA 3IS5A 2UW8A 2BVAA 4JRVA 3NNUA 1M7NA 4JX7A 4S30A 3TTIA 3GC9A 3VS0A 3OY1A 4J98A 2GSFA 2QLQA 3PG3A 4FSZA 2RKUA 1M17A 4YZ9A 3RBWA 4II5A 3QTRA 5EYCA 3ZO2A 4QMNA 4FI1A 5JK3A 2UW6A 3FHRA 2OI4X 2R7IA 3R28A 4DN5A 3KULA 4Y46A 1H08A 1APME 3OEFX 4UALA 4NSTA 3UOHA 1PHKA 1UU3A 2JKMA 3C51A 4J7BA 4BDAA 2WKMA 1JOWB 4H3PA 5CASA 4USEA 1H0WA 4G31A 3VS4A 2DWBA 1ZWSA 3Q32A 5AAGA 1BLXA 4MD8E 1Y91A 4D0WA 3EMGA 1GZNA 3HEGA 3QRKA 3V5WA 3A62A 4HGEA 4ITHA 4RX7A 2X9EA 3U9CA 5LCKA 2QOBA 3FMLA 4MK0A 5CT7A 4YNEA 3QRTA 5HGIA 5IEVA 2ZMDA 2PE1A 5IH5A 2YDJA 3ZO4A 2FA2A 2CHLA 4MWIA 2W4JA 4XJ0A 1R0EA 2IVUA 5A4EA 4FV4A 4DFYA 2AQXA 2XZSA 4FG9A 3EQBA 3R9DA 5EM6A 3VWAA 4MBIA 3D15A 5AJQA 5ANGA 4O4BB 5HD7A 4C3PA 3QHWA 2HIWA 3EZVA 4HYHA 2HY0A 3G33A 4UWBA 3QHRA 4QP1A 3C1XA 3ZU7A 5JGAA 3TI1A 4EQCA 2VTMA 3VS6A 3DAKA 4YUQA 3OWKA 3BEGA 5CT0A 3QWKA 3LFAA 4OUCA 4IMYA 3F2AA 4XG8A 3PXKA 5ETAA 3EQPA 3LFNA 3EFWA 4QMXA 4RWKA 1ZY5A 5F94A 3FPQA 3ZLYA 5BNJA 2WMAA 5G1XA 4TXCA 4AW0A 3HP5A 2XNBA 3BV3A 3OMVA 2WAJA 4BZDA 2VTLA 3W1FA 4YHJA 3O23A 2BTSA 3R7GA 1Q8TA 3DFAA 5AV3A 2QHNA 3A4PA 3F88A 1J91A 4I5MA 4U44A 4RJ6A 4U41A 4QYFA 2BAJA 3UC4A 3A7JA 3RKBA 1OPLA 3RM7A 4EC9A 4PDOA 1IEPA 5EHLA 4XRLA 4YJNA 2EB3A 4FYNA 3KY2A 3KEXA 4ACCA 5AADA 3R1YA 3MV5A 3QYZA 3ZHPC 2ZVAA 2UZVA 4J8MA 4CYIA 4U7ZA 4FSWA 3L9NA 2X81A 3E87A 3QTUA 4P2KA 3LFFA 5LWNA 1O6YA 4N70A 3TZ9A 4L52A 4AX8A 3CPBA 2ZV8A 2OGVA 1OIUA 5DE2A 4BCHA 2EVAA 3WE8A 2O64A 1Q5KA 4X21A 3UP2A 3CJFA 4OBPA 5L2WA 3DXNA 3QAME 3BHVA 3FQHA 3OROA 1AQ1A 2R3FA 2YJRA 4E5BA 4PTEA 1YXXA 4JDHA 4J8NA 4ALVA 3OHTA 1Q97A 1F5QA 2HZIA 3GQIA 4BCKA 3F2NA 4AACA 5C8KA 1O6LA 4LYNA 4F64A 4K77A 1YQJA 4H1MA 3FMEA 2Z8CA 3MDYA 3HZTA 3UC3A 3I0OA 1SNXA 2X0QA 4AXAA 2XYNA 3BV2A 4RJ8A 3VULA 1H1QA 4F09A 4I6BA 2BILB 4L9IA 4AZVA 4K18A 4D2TA 1U54A 3A61A 4J52A 3U87A 4BDDA 3HRBA 3NEWA 4ZTQA 3QKKA 2W17A 4JBQA 5CSXA 2VX0A 3BLHA 4YZMA 2JFMA 3GBZA 1P14A 4ZP5A 3F5UA 2RSVA 4BDGA 4DH7A 4NK9A 3NW7A 4DLIA 2X0GA 2VWXA 4B99A 5J7BA 3O7LB 4X3FB 3GCQA 4C33A 4ANLA 4UZDA 3AGMA 4YU2A 2GNLA 4FTQA 2WQBA 3GU7A 2OJGA 4YHFA 3HMNA 4U40A 2Y7JA 4C3FA 3ELJA 4BDCA 2I0YA 3NYNA 3E8EA 3EQIA 4RIXB 4RMZA 4DG0E 3DBQA 3DK3A 3LM0A 4RX8A 5CU4A 5KE0A 5JKGA 4H36A 4P5ZA 4ACMA 1OUYA 4KBKA 3WYYA 4C4JA 4ENXA 2Y4PA 4D4SA 3OEZA 4APCA 5M57A 3CJGA 3B8QA 4FBXA 4D2RA 3RTPA 1WBVA 4J99A 4D5HA 3HRCA 2GPHA 2YCSA 4RJ4A 3RVGA 5CSVA 4QMOA 2XJ1A 1H24A 4AGCA 3QQLA 1F0QA 1JSVA 2LAVA 4AOTA 2C30A 3ZC6A 4O21A 5GNKA 4KB8A 4QMWA 2ITUA 1UKIA 2VZ6A 4FNYA 1W2FA 2QCSA 4RIXA 5A4CA 5GZ8A 5M4IA 4X2NA 4CLJA 1GZOA 3Q52A 1FVRA 4GW8A 2H34A 3PJCA 2IZTA 2UZUE 3MFTA 3VS5A 5AR7A 2OXDA 3O8UA 2AC3A 3EL8A 4EEVA 5JSMA 2XIZA 2R3MA 4DH5A 2W0JA 3LCTA 4ZTMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1WCC A;  1FIN A;  4UMQ A;  2OSC A;  5D12 A;  2W1D A;  3MVM A;  4HOK A;  4C37 A;  4JG7 A;  3CR0 A;  2ITW A;  5TOZ A;  3O71 A;  1TKI A;  4TYH B;  5LCJ A;  3SW7 A;  2X2K A;  3LFD A;  5HBE A;  4FOB A;  3V5L A;  4F6W A;  1XO2 B;  3NNW A;  3QD4 A;  3HKO A;  1A9U A;  3ZLX A;  2VTA A;  4AA4 A;  3HLL A;  4QP3 A;  4PP7 A;  1MQB A;  2IVS A;  3FYJ X;  4EJN A;  3GFE A;  2RIO A;  4C58 A;  3QRI A;  3R6X A;  1WVY A;  4FKT A;  4HCU A;  4AU8 A;  2X6D A;  3MPA A;  1GII A;  4D1X A;  3LCS A;  3NWW A;  3VF8 A;  4CZT A;  3VBT A;  3S95 A;  3PP1 A;  3TNP C;  3GB2 A;  4H58 A;  4QTA A;  1PW2 A;  4G34 A;  3LCK A;  4MBL A;  3D5W A;  2IVT A;  2C6T A;  3EFL A;  4IAY A;  4DCE A;  4MF0 A;  2OID A;  4FEQ A;  4O4C A;  2ZB1 A;  3EN9 A;  3ROY A;  3QUE A;  2DS1 A;  3LPB A;  4WD5 A;  4YSM A;  5CQW A;  3UJG A;  2FSM X;  5DG5 A;  4RA4 A;  4TWP A;  4BCQ A;  5LXM A;  4OW8 A;  5EW8 A;  2I1M A;  3UG1 A;  5IIS A;  3WZK A;  4DIN A;  2C1A A;  5TO8 A;  4XV9 A;  5L6W L;  3ZMM A;  3B8R A;  2VWI A;  3W8Q A;  3UP7 A;  2V0D A;  4ZJJ A;  5EH0 A;  4EHV A;  5BUE A;  4KS7 A;  3QWJ A;  2QOH A;  5HIC A;  5AND A;  2VTP A;  4BWX A;  5BVW A;  1YHV A;  5CVG A;  5AAE A;  4YTF A;  1XKK A;  4GH2 A;  4M68 A;  3OVV A;  4ACG A;  5KHX A;  3D5V A;  2JLD A;  3Q96 A;  3NCZ A;  5CYI A;  5I9Z A;  3TUC A;  4D2P A;  4BKY A;  5IME A;  3R63 A;  4F7J A;  3POZ A;  4JOA A;  4JT3 A;  4O0R A;  3ERK A;  4UYA A;  4ZTL A;  3NYX A;  3RI1 A;  3MTL A;  3ZSH A;  4AZS A;  1VEB A;  2UZT A;  3PXY A;  4AG8 A;  5CAN A;  4LM5 A;  1OL5 A;  4FKW A;  4BHZ A;  3NLB A;  5LQF A;  3NUN A;  4BI1 A;  1ZOG A;  4L46 A;  5AUV A;  2XEZ A;  2RFD A;  3TUD A;  4IX6 A;  4OLI A;  3EZR A;  5KMN A;  4WNK A;  3DDQ A;  3QTI A;  3OY3 A;  4HVS A;  2EWA A;  4JIK A;  4EH3 A;  4QRC A;  3HUB A;  5E1E A;  5DN3 A;  3IW6 A;  2V5Q A;  3TG1 A;  3HV5 A;  2JAM A;  2WTW A;  4YJR A;  4YJP A;  4C61 A;  3LMG A;  3PIZ A;  4L45 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2X0P A;  2A98 A;  4O4E A;  1W2F A;  1W2C A;  4FRF A;  2X0O A;  1TZD A;  4O4D A;  4O4B B;  4O4F A;  2X0Q A;  1W2D A;  4O4C A;  2AQX A;  2IEW A;  2IF8 A; 
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

 
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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