1W2DA

Human inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with mn2+/adp/ins(1,3,4,5)p4
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
SFKAAGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILASLAER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords INOSITOL-TRISPHOSPHATE 3-KINASE A
publication title Structure of a Human Inositol 1,4,5-Trisphosphate 3-Kinase; Substrate Binding Reveals Why It is not a Phosphoinositide 3-Kinase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 265
sequence length 265
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1w2dA00
4O4EA 2A98A 1W2FA 2AQXA 1TZDA 4FRFA 4O4CA 1W2CA 4O4DA 2IF8A 4O4BB 1W2DA 4O4FA 2IEWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IA0A 2J50A 4QP3A 5CZHA 3VUKA 4BDGA 4EQUA 1OMWA 3B2WA 4C0TA 4FL1A 3S3IA 3JVSA 4NW6A 3P23A 4PDPA 4CTBA 4DH3A 3QHWA 4Z55A 2DWBA 2WTJA 1STCE 3TIZA 3RWQA 2WOTA 3FC1X 3IW6A 4YP8A 2WTVA 2IZRA 3GT8A 2X6EA 3QD3A 3FMMA 3COHA 2GSFA 5IDPA 3HYHA 3PJ3A 2BRNA 3OWLA 2VZ6A 4NUSA 4BIEA 4O0RA 3TUBA 3ORMA 2VTTA 3GXLA 4GL9A 4CZYB 2Z7QA 2C6EA 2ERKA 3EJ1A 4XMOA 4CSVA 3I1AA 5ANJA 5IPJA 1PYEA 3CR0A 5JFVA 4DFLA 4FT0A 3VUMA 2PMLX 4FYNA 3TZ9A 2OO8X 3EQHA 3FLYA 4G9CA 3I81A 5FM2A 1X8BA 2WAJA 1ZOGA 3D0EA 2BTSA 4IB1A 4JR3A 4DEAA 1YOJA 4IDVA 5FG8A 1XH9A 2W1CA 3FMLA 2JIUA 3L1SA 3TKIA 4Z9LA 4MAOA 5E8WA 5CX9A 3G33A 4U3ZA 3ZBFA 4E7WA 5K3YA 1JWHA 4CNHA 4I6QA 3HMNA 5AM6A 4BDEA 3BQCA 1ZMUA 1PMVA 5EDRA 2O0UA 4EOKA 4MXAA 1BL6A 4U45A 2XCKA 4KS8A 5BYZA 3RPRA 3OEZA 3VBWA 4C8BA 1GAGA 2PZPA 4QP9A 5E90A 2QONA 1PXNA 3CKXA 5HNGA 3D5VA 2P3GX 5J7BA 1WMKA 1M2RA 4FR4A 4ACGA 2XUUA 3CEKA 4H36A 3RJCA 3ACJA 4CVAA 4WHZA 4RBLA 1Z57A 3VQHA 4G16A 5DR9A 1IRKA 2P2IA 2PVRA 4NIFA 4M66A 3TIYA 4X6QC 5J8IA 5L6WL 3UO4A 4AZSA 4YNEA 4FT7A 4J52A 3HV5A 3FYJX 4XG4A 2VTHA 4YLJA 2CN5A 1BKXA 4IVBA 5EOBA 2E9NA 3W8QA 2ESMA 2JEDA 5DRDA 4PF4A 5B2MA 2VX3A 3BLQA 5J7HA 4QNYA 3SC1A 2EWAA 3LOKA 4FTLA 4KIPA 1H0VA 2YIYA 4ANNA 2VWUA 2W1HA 1Q5KA 2XKFA 2JBOA 3COMA 3OVVA 4L9IA 3A8XA 5G6VA 4ASXA 2RL5A 4AZTA 2OIQA 2ZDUA 4BC6A 5H8BA 3MH1A 4O0SA 4YPDA 4BDKA 1LP4A 5DEYA 4ITJA 4BCGA 3UC3A 3D4QA 1GOLA 3ITZA 4DGNA 4HCTA 1FVTA 5E91A 2C1AA 4RJ3A 4MWHA 4WKQA 5ETIA 4CV8A 1PMEA 4K0YA 1U54B 4K11A 3LMGA 3KXGA 2XK8A 3QYZA 2QHMA 4JDJA 3PUPA 3OOGA 4RX7A 5AUUA 2QLUA 2XYUA 4BL1A 4Y5HA 4XS2A 1CTPE 4RVTA 4CFUA 3A99A 1Y8GA 4O6LA 4K1BA 3TI1A 2VWZA 3DXNA 2UZLA 4IB5A 5BVOA 2HK5A 2GNHA 1B38A 5LJJA 4KBKA 1O6KA 2R3JA 3P0MA 3QQJA 4YC3A 4Z16A 4FBXA 1FPUA 3GOKA 5HQ0A 2WQEA 2XK7A 3JY0A 2JKOA 5AP6A 3IDPA 1LR4A 3FZ1A 4FZ6A 5DR2A 4RX9A 4NEUA 2I0VA 5HTCA 5I9XA 1UWJA 4AOIA 2VN9A 3RPVA 5HLPA 2YDJA 4G3GA 4AT4A 3UPZA 3QAME 4XH6A 5BUJA 3KCFA 5CSVA 3MTLA 4UXQA 1REJA 5CEMA 2Y0AA 4JBOA 4ASZA 3MVHA 2JDVA 5JFSA 1OKZA 3OG7A 1ZYCA 4LGHA 3UNZA 4FKQA 2ZMCA 4JQ7A 5ETCA 4E6DA 2QCSA 4ZJIA 4QMTA 3NNWA 1XBBA 3JPVA 1TZDA 2XKDA 2YITA 1JQHA 2YM4A 2A2AA 3H30A 5EKOA 1IG1A 2BHHA 3AXWA 4KBCA 4TZRA 4O4EA 3PXKA 2GTMA 3HEGA 3VBXA 4Z7HA 4MYGA 3W8LA 3QKMA 4O1PA 4EOPA 4M69B 2ONLC 4RIWB 3IG7A 4K2RA 5GJFA 3RM7A 3ZUVA 2WTCA 4XLVA 3UQGA 2C6KA 2QOOA 3QF9A 4BZOA 1OL1A 3GU6A 4QP6A 5L8JA 4C33A 1BYGA 4YZNA 2ZV2A 3AMAA 3F3WA 3PXYA 4Q2AA 3DTWA 3R8LA 3GC7A 2OIBA 3KF4A 3ANRA 3QZIA 4TN6A 3RHKA 4DTKA 4EJNA 3BGZA 4DH7A 3QXOA 4V0GA 3C0IA 3UOKA 3WARA 4MD7E 3WILA 4YTFA 3QQKA 2W4JA 4E6QA 4FV2A 4QMPA 1GIJA 5CSHA 4M67A 2OH0E 3IDBA 4AGWA 2C3IB 5FP6A 2C0IA 3WZEA 5KX8A 3DOGA 5GJGA 4JQ8A 5CEKA 2VTNA 5DHJA 1WBTA 2QI8A 3KC3A 3F61A 2PZ5A 4RA5A 3ZH8A 3NUUA 4I6HA 3C4WA 3O23A 3REPA 2PUUA 4MD9E 1PYXA 5CAVA 5E7RA 3FL4A 3LFDA 3OF0A 4W4YA 3TNWA 1DI9A 3FWQA 3U6HA 3O2MA 4GFGA 1UV5A 3ACKA 2YHVA 3ENHA 2UW9A 3FBVA 4L00A 4FRFA 5AP4A 3ENMA 3GENA 3H10A 2VAGA 3ULZA 4RJ8A 3QZGA 5CVHA 4EZ3A 3FSKA 5AV3A 3H4JA 4UMQA 3CJFA 2CCIA 2UVZA 2WMXA 4JQEA 1Y6BA 5JRSA 4TYGA 3NYNA 3I7BA 5IUHA 4HPTE 3FSFA 2OW3A 4EYJA 4XHKB 4WSYA 4EOMA 1M2QA 2BDJA 2V22A 4QYHA 4DG0E 4R3CA 5IDNA 5L4QA 4ZTNA 2X0QA 5D9HA 1UU8A 3UYSA 4RVKA 3S00A 2W0JA 3V5TA 3O7LD 3KA0A 1SVHA 5AX9A 4WBOA 2Y4IB 3MA6A 4USDA 5KBQA 3F3UA 3PIYA 1SYKA 3Q96A 4NWMA 1YI4A 3D7TA 4FSZA 3Q4TA 3FZRA 4DGMA 3ORTA 1W84A 4QOXA 4IANA 4BI1A 3LE6A 4R3RA 2I40A 3Q2MA 1H0WA 3ZXTA 3BU6A 1WBSA 3GC9A 3VN9A 3EFLA 3NEWA 4MNFA 5CI7A 5AR4A 4CT1A 2AUHA 4EWQA 2WZJA 4DEDA 4J96A 1V1KA 5E8SA 2PMOX 3FY0A 4QD6A 4YBJA 5BUEA 3D5UA 2WFYA 3ZHPC 4FI1A 4E4MA 2O3PA 5AR8A 1XJDA 3OC1A 3QGYA 4JL9A 3NR9A 2YWPA 3DS6A 5HX6A 4ZSLA 4I0TA 3MSSA 2X81A 5DRBA 2VNWA 2IW9A 4IEBA 4XBUA 3ZEPA 4CZUA 3F5PA 2YIRA 5CASA 2J0IA 4H1JA 1FOTA 4FTOA 4OTDA 5A3XA 3QUDA 2I6LA 2XEYA 4NKAA 5I4NA 3MY0A 4TXCA 4ZXTA 2Z7RA 4E20A 3R21A 3KU2A 3KRLA 3V51A 4DGOA 1OKVA 4FG8A 4UZDA 4YHJA 5HO7A 5HVKA 4YZ9A 3ZLXA 3OS3A 3PPZA 3R02A 4QTCA 5HG9A 3ALOA 2X7OA 3LCDA 3VHKA 4IMYA 3PXZA 3F7WA 2RG6A 3L9PA 3HP5A 4IB0A 4NSTA 4IWPA 3K5VA 4XG6A 4DHFA 4I5HA 5E8YA 2H6DA 2WMSA 4XNEA 5ANGA 4EHVA 2R4BA 2RFNA 4FNXA 4EOLA 1ZZ2A 1P14A 2QVSE 4EBWA 2ZJWA 5AWMA 2BILB 4D9UA 5IF1A 2X2LA 3E88A 3NLBA 4NM3A 4GCJA 1XH8A 2XJ2A 3AQVA 3P7AA 5C8MA 4GU6A 4MHAA 3Q6UA 3PWDA 4XV9A 3HNGA 3A7HA 1OPLA 3NAYA 1OZ1A 3EMGA 5FQDC 3UG1A 3H9OA 4B7TA 2VGOA 2GHGA 3OZ6A 2JIVA 2VO7A 4TYHA 4XUFA 3E3BX 4NW5A 1YOLA 3BPRA 3UVPA 4BI0A 1PMNA 3AMYA 4XRJA 2GNJA 4WRSA 4IVCA 3MJ2A 4ANBA 3HGKA 4JG6A 4ZJJA 4MBLA 4FVPA 2EVAA 4PTCA 3QC9A 3NYXA 3VW8A 3NUPA 1OIQA 2XP2A 3P7BA 3AC1A 5AUZA 2QD9A 1CM8A 2O63A 4LMUA 5G1XA 4CCUA 2JFLA 4FSUA 4NM5A 5T6KA 5EK7A 3MPTA 2C0OA 3EYGA 3R2YA 1UU3A 4RWLA 3OD6X 4GUBA 2HY81 3GBZA 5EHLA 4HCUA 1Z9XA 5CSXA 3IS5A 5IZFA 4EHGA 4CFFA 2JIIA 4P7EA 4FOCA 3S2PA 1O6LA 2XRUA 5AR7A 4X2KA 1OITA 2W1FA 2AYPA 1P4OA 2JLDA 5AM7A 2GU8A 4BCFA 2LAVA 2F4JA 3RVGA 4D28A 5CF5A 3COIA 1W83A 5HHWA 4XYFA 2R64A 1FMOE 2PE0A 1ZYLA 4M68A 5E8VA 2VX0A 2W1IA 5DGZA 3VBQA 4TY1A 3VRYA 3OXZA 1FQ1B 2XK3A 5HU9A 4N4SA 4D55A 2BRBA 1I09A 4UZHA 1JVPP 4FODA 1Q4LA 2I0YA 1GJOA 4DH1A 4BHZA 3WZUA 2X39A 4YZMA 2PHKA 3NW5A 2Y8OA 3O8UA 1OIRA 2QODA 4C3PA 4O0YA 2B52A 5CF4A 4JR7A 4JLCA 4ZTHA 4Y83A 4Z7GA 3L9LA 5BX0A 2NRUA 2RFDA 5CXHA 4RIOA 4C58A 3LJ2A 4DEGA 3FI3A 4IIRA 3UMXA 4L3PA 5JKGA 3V5WA 3UZTA 1UKIA 5FTQA 2WMWA 3KKVA 5EYKA 3HP2A 3OCBA 3BZ3A 3BYVA 2GNFA 4C2VA 2JAMA 4ERKA 4GG7A 4F9AA 4ZLZA 3VUTA 3KMMA 2I1MA 5I9ZA 4RMZA 5KMIA 2E9OA 1H00A 4W8DA 5DG5A 3VS1A 3EN5A 4LV5A 2HXQA 3HRBA 3QTIA 4YHTA 3UBDA 3MA3A 4EZ7A 3LFFA 3QTSA 2R9SA 4CLIA 2C47A 2VWIA 4MXZA 1ZAOA 2FUMA 3ZYAA 1YKRA 3BYSA 5DLSA 1ZOEA 4NZWB 2C68A 2FB8A 3NUYA 2GS2A 3GU8A 2XBJA 3B2TA 2YM8A 4AACA 4C3RA 2BRMA 5EI6A 2WQOA 4GW8A 3ROCA 5C03A 4AFJA 4E4NA 5L2QA 5B0XA 1NY3A 2EXMA 4G17A 2HCKA 2XRWA 1WAKA 2HYYA 4EK6A 4EUTA 2Q0NA 4WG4A 3MYGA 5AA8A 5DE2A 4R5YA 3ORPA 3EKKA 2IVUA 2FSMX 4X3FA 2HZ0A 4PQNA 4E6AA 4MNEA 1E9HA 2ITZA 1OECA 2PVFA 3R30A 2R3FA 4S33A 5H8EA 3FMKA 4C4IA 3UP7A 1IEPA 1K9AA 3I79A 4OTRA 4YJNA 4EL9A 4FMQA 4O0VA 3LW0A 1PY5A 2YDIA 3M11A 3DJ7A 3I0OA 3QL8A 4FV8A 1M52A 4QP8A 2W17A 3V6RA 3A2CA 3VS7A 1IA8A 1U59A 4DFZE 3DCVA 5H9BA 5EDQA 3V5JA 3V8TA 4C4HA 5AA9A 4OTIA 2J7TA 1PXIA 4D0WA 2PY3A 3MY5A 2XH5A 4PDSA 1O6YA 4CD0A 3Q4CA 4CMOA 4FZFB 4L52A 5HNBA 2BZKB 4AW2A 3PA4A 5DI1A 3Q5ZA 4W8EA 5IA2A 2B4SB 3W1FA 5CQUA 2QOLA 4RVLA 4BWPA 4RJ5A 2ERZE 4FTQA 5KKRB 4MBJA 3VWAA 2X9EA 2ZB1A 4U6RA 5C27A 4DITA 2ZM3A 3EWHA 2ITPA 5AR5A 2WNTA 4FTNA 4Y85A 4Q5HA 2ITWA 4U42A 4M12A 4F09A 3FKOA 1XHAA 3R1NA 3OBJA 3RK9A 2IEWA 4KIOA 2OXYA 4F9YA 3K2LA 5HI2A 1DAWA 2X7FA 3ORNA 4M7IA 3PVWA 3RAIA 3U9CA 3CQEA 3W16A 1AGWA 5ITAA 2NPQA 3GCUA 4TYIA 5DWRA 5JZNA 3RK5A 3D5XA 3TTIA 2VV9A 3IKAA 3R63A 1URWA 2W4OA 4NCTC 2UZNA 3OXTA 3R00A 3EQPA 3GNIB 1NA7A 3DLZA 3QKLA 3RKBA 3DK7A 3IK3A 4WNKA 3D5WA 3DJ6A 2XK9A 3BV2A 3DKOA 3SQQA 2YISA 4NFNA 2B54A 2ZOQA 3HVCA 3O8PA 2QO9A 3R8ZA 4O4DA 3LM5A 3NAXA 2O5KA 3WIKA 1CDKA 1AQ1A 1R3CA 3L8VA 5AAFA 2JD5A 2EB2A 4IVAA 5I3OA 4GK3A 5CAQA 5A14A 4FSMA 4CV9A 5EYDA 4D2SA 3O0GA 3KXNA 2JDOA 4U5JA 4AA4A 4QPAA 4LG4A 5DIAA 3TV7A 3H3CA 3H9RA 5EM8A 4RG0A 2UW7A 2W99B 2UZVA 3CGOA 2QLQA 5ANKA 3BKBA 4L7FA 1PJKA 4ZP5A 4JX3A 2OJFE 3DAJA 2W05A 4EQCA 5HICA 4BTKA 3CJGA 3ZRKA 1VJYA 1PKGA 2PVHA 4U9AA 3DQXA 3VS0A 3OCGA 1JKLA 4OTPA 2IZSA 2YJRA 1KOAA 3DU8A 4YTCA 4YJQA 2UZWE 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LCT A;  3HV7 A;  5D1J A;  3GU7 A;  3C1X A;  3RZF A;  3SXR A;  5GJD A;  1Q3D A;  3M1S A;  4O4F A;  3DGK A;  4DG3 E;  2WMA A;  4LL0 A;  3Q9Y A;  4MBI A;  5BVW A;  3QUP A;  3ZON A;  3BHV A;  4BIB A;  4CQE A;  3DBE A;  3E63 A;  1KV2 A;  4ZIM A;  4BYJ A;  2YCQ A;  3QC4 A;  3QX2 A;  5LAR A;  4S2Z A;  2B9F A;  5HO8 A;  2BIK B;  1H1S A;  2PE1 A;  2QC6 A;  5BMM A;  1XH6 A;  4CMU A;  2IZT A;  4EH3 A;  3ZSG A;  4NM0 A;  4EH4 A;  4FIJ A;  3RZB A;  2WMB A;  1WVX A;  1XBC A;  2BRO A;  2QU6 A;  4PUZ A;  4CQG A;  5L8K A;  1RW8 A;  2OKR A;  4R6V A;  3WZK A;  4OT6 A;  3NCG A;  3TNH A;  3R83 A;  3MI9 A;  3PA3 A;  3D2I A;  2WIP A;  2G1T A;  2YN8 A;  3P7C A;  5JEB A;  4C37 A;  4F0I A;  3WIG A;  4FV1 A;  2ZM4 A;  2W06 A;  4G9R A;  4WUN A;  1Q24 A;  3HEC A;  2QOI A;  1QPC A;  3PXR A;  4YJR A;  4KIK B;  1XH4 A;  1WBO A;  2WU7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2X0Q A;  4O4E A;  2A98 A;  1W2F A;  2AQX A;  1TZD A;  2X0P A;  4FRF A;  1W2C A;  4O4D A;  4O4C A;  4O4B B;  2IF8 A;  2X0O A;  1W2D A;  4O4F A;  2IEW A; 
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

 
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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