2QOCA

Human epha3 kinase domain, phosphorylated, amp-pnp bound structure
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
294
structure length
283
Chain Sequence
AKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Autoregulation by the Juxtamembrane Region of the Human Ephrin Receptor Tyrosine Kinase A3 (EphA3).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ephrin receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 283
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2qocA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2qocA01
2VWXA 2C6KA 1STCE 3NGAA 4IM0A 1IR3A 1FGKA 5M57A 4O2PA 1CSNA 5M09A 5DBXA 1SYKA 3M2WA 4ITHA 2QONA 4GYGA 4RFYA 3P1AA 5BUEA 3LJ0A 4BDHA 1GAGA 3EQRA 3CPBA 3PIXA 4GW8A 4UALA 4XS2A 4Q2AA 5BUJA 3RNIA 5JRQA 1ZMUA 2XJ2A 3PVUA 4MD9E 3OG7A 5IDPA 5K0XA 2XJ1A 4OW8A 5K4IA 1XBAA 2UV2A 4C4EA 4F7SA 3F3TA 5EFQA 4FG8A 3P7AA 2QLUA 3WE8A 4MKCA 4D4RA 2EXEA 1GOLA 2RF9A 3NX8A 3KB7A 3SLSA 1J1CA 2PZ5A 2OH4A 5AUXA 1PXLA 3D5WA 4GEOA 1UNHA 1OVEA 4GFGA 2B1PA 2QI8A 4MWIA 4B8LA 3LM0A 3FMJA 2HCKA 4DEIA 3FZ1A 4JDHA 4UX9A 3OT3A 5LMKC 5AIRA 1Y6BA 3O17A 3MY0A 5JKGA 2C0IA 5IEVA 2XYUA 3KN5A 3ALNA 3BPRA 5A4EA 2JEDA 2OF4A 2VO7A 4QPMA 5DOSA 5A4LA 1PMNA 3KN6A 4NL0A 1WBNA 3UIUA 4CT2A 2VWYA 2OBJA 2QG7A 4F09A 4PP9A 4WBBB 4MQ1A 5HE1A 2WQEA 3NUNA 3UO6A 4XX9A 3U4WA 3UVPA 4FSWA 1QPEA 4PNIA 3U6JA 3MFUA 3QGWA 5BQ0A 4TYEA 2I1MA 2H34A 5HG8A 2V55A 4O7VA 1VZOA 3ZXTA 3W18A 2YIWA 2IO6A 3MVLA 5I0BA 3C5IA 1I44A 2JAMA 4FF8A 5A46A 2PE0A 4D2SA 3RK9A 4F0IA 2ZDTA 4IDTA 1ZZLA 4FUYA 3NSZA 3TV7A 3KC3A 4XRLA 3PTGA 4ONAA 2WEIA 2ZMCA 4FEQA 3LMIA 1PXKA 3QF9A 3BHVA 3DK7A 3GCUA 1CKPA 2Y4PA 4TT7A 3QCYA 5H8EA 3UOHA 3WZKA 4E20A 4X3FB 3UOJA 3KXGA 4IAFA 5HBHA 4I3ZA 3GOPA 4X6RA 4EC9A 2X2MA 5AAFA 2B4SB 2Y6MA 1V0BA 4O2ZA 1HCKA 3ORPA 4OTGA 3GU4A 4FOCA 4WBOA 2ZM1A 3ZUTA 5LVOA 2XIXA 2E2BA 3MBLA 1VYZA 4JRNA 3FMKA 1SNUA 4O1PA 2XIRA 4FNWA 3VBXA 3UYSA 2Q0BA 3LXKA 4OTPA 3BEGA 2GS7A 4CNHA 4Z16A 4V01A 3ANQA 4JBOA 2XS0A 4JIAA 4BZNA 4EHZA 3V5JA 3OY1A 4YZBA 1Z5MA 4GG7A 4D5HA 2GU8A 4ZK5A 1Z9XA 3Q53A 3UVRA 5KHWA 2P55A 3UBDA 4S32A 3HVCA 5HU3A 4F9CA 3PXYA 1AQ1A 5ETCA 1JLUE 4ZS0A 4PL3A 5TR6A 4MNFA 1H1SA 2W17A 3ZO2A 3QRKA 2QO9A 3GT8A 4BCNA 2J0KA 4BCIA 1OIRA 5M4CA 3ORKA 3EN9A 1H1RA 3QFVA 4U80A 2X2LA 3VS0A 2ZV8A 4G3EA 3LQ8A 5BVKA 3TDWA 3KK8A 3DAKA 3KXXA 3ZM4A 1ZYDA 3ZUUA 3FI8A 5CEOA 4K18A 3R83A 2GSFA 4DA5A 3W2RA 2YJRA 4Z9LA 3ZBXA 4EOLA 4PNKA 1OIQA 1URWA 2QHNA 4NH1A 3R01A 2Y8OA 1F3MC 2UZTA 3EB0A 4PDPA 4MD8E 3O51A 4F1OA 2IPXA 3KQ7A 2ITYA 5EM7A 2PMIA 3A7IA 3D0EA 3QD0A 4O21A 4BCOA 2HELA 3QCSA 4Z55A 3S1HA 3GNIB 3CTHA 4RWLA 2OIDA 2R9SA 3DY7A 2WTDA 2PE1A 4RX8A 3SGCA 2YIQA 4I21A 4YLJA 4E6CA 2HAKA 3UG2A 3MH3A 1Q5KA 2QKRA 4ACDA 2W99B 1OL2A 4DEAA 5DN3A 2CNVA 4RZWA 1OZ1A 1R39A 2Q0NA 4HYHA 4FNYA 3QRUA 1GZNA 4FIHA 3RCJA 3L9LA 4IC8A 3FYKX 2I0VA 2UZOA 1ZLTA 2YFXA 4XG8A 4DT9A 3BHUA 1ZXEA 4FTLA 3EYGA 3HDMA 4FVPA 4IJ9A 3BHHA 4TTHB 4J8NA 3RBWA 2XK7A 3TACA 3H9OA 4C4HA 2B7AA 5IUIA 3BLHA 3FQSA 4C59A 2OGVA 5C01A 3GC8A 4O7NA 3VWAA 2X4ZA 1FVRA 3NYOA 4RRVA 1DAWA 5CAPA 3Q4CA 3QZGA 4P2KA 1FGIA 5CSXA 3WF9A 5GIPE 4AA5A 4W9XA 1WBSA 2C5YA 4I94A 2E9OA 3Q52A 3ZLWA 4DEBA 5C8KA 1UV5A 5KKRC 3BGZA 3QCXA 4KIQA 1PKGA 3U54A 4L44A 4ZMFA 3BHTA 4YZMA 2ZV2A 5L4QA 2GQSA 3FYJX 3RAWA 3QUEA 5LQFA 5J9YA 3I6UA 4E7WA 5HOAA 2W9FB 4D0WA 3NUXA 2PY3A 4O0XA 2R0UA 4FZAB 5EOBA 4EK4A 3AC4A 3JYAA 4NM0A 4F0FA 2UZEA 3CD3A 2FUMA 2GQGA 1OL5A 4FV7A 4TYHB 4H39A 5A4TA 1KE7A 5FRIA 4DE4A 5CVHA 2JDVA 5D7AA 2YLEA 4KWPA 2QQ7A 2WTJA 4AU8A 5L6OA 2CKOA 2ITUA 4Z3VA 2I40A 5CF4A 1ZYJA 1APME 4J71A 2YJSA 3BWFA 4IFGA 1KE9A 5EYKA 4FTCA 4F6WA 4QNAA 5BVNA 2VTLA 2R3PA 5FG8A 4PMSA 4HW7A 5LOHA 4EHGA 4QTBA 3I7CA 4P7EA 5F1ZA 5GZAA 2Z7SA 2X6EA 5CF6A 3CJFA 2NNWB 2C6OA 4J8MA 4X7QA 4ZAUA 5J7HA 3H0ZA 4C58A 3EWHA 2BHEA 4HVHA 5DWRA 3KRJA 4DFNA 5EI2A 3LIJA 1NT2A 5IQDA 4H05A 4M69B 3DT1A 2QOOA 2R2PA 3OEFX 3BLRA 4PDYA 3ZLSA 3TI1A 4LGDA 3L8XA 4PPBA 3JR1A 4FTKA 1OIUA 3KEXA 4AXAA 2UVYA 4OTWA 2B54A 4M69A 2YACA 4BDGA 1Y6AA 4YGAA 3QYZA 4USEA 2ZM4A 4HCTA 2W5AA 4AP7A 4KIKA 2OJGA 3AT2A 4AZTA 3GB2A 3QXOA 3NAXA 1WFCA 4KRDA 3AMAA 3QQHA 4N6ZA 1P4OA 2CGXA 5DH3A 5DYJA 2YIYA 3VS5A 4AN2A 3R04A 4FTMA 4R6VA 4BCKA 5I4NA 3MTFA 3TUCA 3FI2A 5C27A 5L2SA 2XF0A 3BI6A 2EU9A 3VUHA 3Q4UA 5FBNC 4CEGA 2PSQA 3IO7A 3E7VA 2VX1A 1PKDA 4FX3A 4IAYA 3QTSA 1BL7A 3OWJA 4Z7GA 2CN8A 4ZSJA 1U54B 3FMEA 4JS8A 5AP3A 2ITZA 3BZ3A 4O0RA 5KMLA 2BAJA 4IE9A 4BKJA 5CANA 1O6YA 1AGWA 4MXXA 3M11A 5TF9A 4F70A 4BDCA 4E4LA 4CTBA 1FINA 4GIIA 4U5JA 3OFMA 3FSKA 3DFCB 1WVWA 4OBOA 3TWJA 3HA8A 3FXXA 3IW7A 4RJ4A 2WQBA 4ANBA 4Y72A 4ZZNA 5JGAA 5CVGA 3TKHA 3TNHA 5HIBA 4BIDA 4MXOA 4IACA 2X7OA 4YJOA 2YN8A 5JT2A 2LGCA 3ORZA 3A8WA 4BDIA 3ZM9A 2JITA 2IWIA 3H3CA 3P86A 4FTRA 4DT8A 3ZTXA 3SQQA 4EH3A 2W1CA 3G9LX 4X2JA 4APPA 2JBPA 4G16A 5CS6A 3BQCA 1L3RE 1Q61A 5HD4A 5EW8A 3CKXA 3UNJA 3MYGA 5ACKA 4FV6A 1F0QA 1B6CB 4V0GA 1PXOA 1YOLA 3MA3A 4QMSA 3UC3A 3TZ7A 1YQJA 1H27A 2ZB1A 1QPDA 3MB6A 4EH2A 3OW3A 2XIYA 2YAKA 5FTQA 3S0OA 3GP0A 3FMHA 4M13A 3FLNC 3KRRA 4I0RA 4FTUA 5DLSA 5TE0A 2ACXA 5D12A 3FL5A 2I7QA 4CQGA 4CFUA 2CKQA 2PVYA 3FI4A 5AAGA 4B7TA 2CJMA 3QC9A 3G2FA 5ETFA 3DKCA 3RPVA 4RFZA 3AQVA 5F9EA 4FICA 2WAJA 5E92A 4IH8A 2PVMA 3DXPA 4ZMEA 4W8EA 5JZJA 4PRJA 4DINA 4OR5A 4FNXA 2BRGA 4HGSA 2UW4A 3MVMA 2GS6A 5KMNA 3QLGA 3LCSA 4IX5A 5EI6A 4HCUA 5EI8A 4F9WA 3EN5A 4D28A 1UU9A 3A8XA 2VWWA 4I22A 2O64A 4OTRA 5GJGA 5D9HA 3VUIA 2OXYA 5BX0A 2YCQA 1OL6A 3IPHA 4G17A 3IW4A 4FKRA 3EQPA 4WD5A 3OOGA 5LVMA 3AC1A 1XH6A 1YHWA 4OTIA 3KF4A 4RGJA 3NW6A 2QKWB 5CU6A 5IH4A 4EWHA 3KCFA 2HIWA 2B0QA 3A2CA 1Q97A 3ORTA 5CQUA 5FTGA 2FVDA 4FL1A 5DHJA 1YI6A 5HNIX 3QUPA 4LV8A 4M7IA 5DPVA 1YXVA 4GFOA 2J4ZA 3KF7A 2CGWA 2R3QA 3ZLXA 4ORKA 2XKFA 3I6WA 3KA0A 4G1WA 2UUEA 4JBPA 1H28A 3PG3A 5IEYA 2RG6A 1Q8UA 2YAAA 4HYSA 4I41A 3MIYA 4XJ0A 4C57A 2XK9A 1P2AA 4O0VA 2X0GA 5EYDA 3HLLA 3CGOA 2VTSA 4B9DA 4EK3A 3E93A 5CF8A 3MH1A 3ZDUA 2Y9QA 4B6LA 5EQPA 5M4UA 5I9WA 5BVEA 4Q5EA 5AR5A 4AOTA 5KMMA 3UQGA 3E88A 2BILB 3MH2A 4XOZA 4RLKA 4YTHA 5IPJA 5AM7A 3TN8A 5AR4A 2BTSA 3ANRA 4G31A 4DGGA 4RQKA 3DB8A 3VBYA 3OZ6A 5TOZA 2XB7A 1R0EA 5C8NA 3SA0A 3BBWA 2OKRA 3ZRMA 3F3UA 5HGIA 4KKHA 4RIXB 2VTOA 3JVRA 4RIOA 4ACMA 3ALOA 4A9UA 4AFEA 4CRLA 4EWQA 3AC8A 3AT3A 4W4WA 4HVGA 2O65A 2OH0E 4QP4A 1NVQA 4F0GA 5IQBA 3PSCA 4RIYB 4X3FC 5EG3A 2X6DA 4RA4A 3PVBA 4RIXA 4YJRA 3RCDA 5L8KA 3F3WA 2QU5A 5LMAA 3RAKA 3W32A 2B55A 3G90X 4ZY5A 4IM2A 3E8DA 3OBGA 2YABA 2O3PA 2YIXA 2VWZA 5BYZA 1PMVA 4UWCA 5K5NA 4YO6A 4QMTA 4UMRA 3FAAA 4I6FA 4PTGA 3FLWA 2YA9A 2YZLA 4EC8A 3QZIA 2CLXA 4LMNA 3BQRA 1M17A 3PIZA 4FK6A 4D9UA 5AUTA 4OTHA 4YLKA 2YERA 2PWLA 2YLFA 4BDFA 4DTKA 4E3CA 3MH0A 5IDNA 4ALWA 3LXPA 3P78A 4FK3A 3WYXA 2CLQA 5H8BA 3KL8A 3PWDA 3DBQA 4R3CA 5D11A 5EKNA 4L3JA 1H25A 3DBFA 4FZ7A 3LHJA 4Y5HA 4KKGA 3SW7A 3DXQA 3TT0A 3A7JA 4JG7A 5BUIA 2UW0A 1KE8A 3LFDA 1ZY5A 3R00A 4KB8A 1VEBA 2Z02A 4AZSA 5J95A 3C4CA 2PVJA 3D7TA 3ROCA 1PXPA 3TKUA 2J5FA 2HY81 3CC6A 3O8UA 5CU3A 3DS6A 2QG5A 2XH5A 3L8PA 3QL8A 3H10A 3WILA 3LFBA 5T3QA 4RJ3A 1S9IA 4EBWA 1H00A 5KKRB 3MVHA 4BTKA 1WBTA 2H8HA 3R02A 3V01A 4FEXA 4U81A 3AMYA 4XG4A 3VW8A 2QR7A 4KBKA 3GXLA 3ZOSA 2ESMA 2X9FA 4HPTE 2QOIA 2BPMA 2AUHA 2X7GA 3FE3A 4L45A 2PVRA 4NSTA 4O6LA 4CMOA 5HZNA 5IH6A 3R8LA 3F5PA 3RAIA 2VO0A 4K6ZA 3AD6A 4N4SA 3FBVA 2WU7A 4G3CA 2PMNX 4ZSLA 3UNZA 3NUUA 3SDJA 3ZO1A 3FMNA 4M8TA 5EQYA 2F7EE 1RDQE 4YHJA 4IX3A 3C9WA 3LXLA 5CI7A 4NM3A 4E73A 5HE3A 5AM6A 2C5OA 2R64A 1FPUA 3PRFA 3FPMA 3O7LB 4MHAA 3IW8A 1BI8A 3SXRA 2VTAA 4FV9A 4QMYA 4FL2A 3ZSHA 1KOBA 4RJ6A 3HMNA 4YJQA 3DOGA 1W82A 2BDWA 4MYGA 4DN5A 3NUSA 4L52A 4D5KA 2W1EA 5HE2A 5AUWA 5AP1A 4KBAA 4PUZA 3RJCA 5B7VA 4YBKA 3LLTA 3C13A 2OU7A 3EFKA 4AWIA 4MXYA 4FVQA 3MJ2A 2PPQA 2PVNA 3UIMA 2QHMA 3FUPA 5TO8A 3ZBFA 4CGAA 3EL8A 3U51A 3RNYA 3D14A 1W7HA 2Y4IB 3EN7A 3MDYA 4CZTA 2G01A 5KMOA 3QCQA 4HGEA 3C0GA 4ZIMA 5K3YA 1H26A 1M2PA 2NO3A 4D2RA 2W1HA 4YPDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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