4W8EA

Structure of mst3 with a pyrrolopyrimidine inhibitor (pf-06645342)
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
291
structure length
290
Chain Sequence
GLPGMQNLKADPEELFTKLEKIGKGSFGEVFKGIDNRTQKVVAIKIIDLEEAEDEIEDIQQEITVLSQCDSPYVTKYYGSYLKDTKLWIIMEYLGGGSALDLLEPGPLDETQIATILREILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEHGEVKLADFGVAGQLTDTQIKRNFVGTPFWMAPEVIKQSAYDSKADIWSLGITAIELARGEPPHSELHPMKVLFLIPKNNPPTLEGNYSKPLKEFVEACLNKEPSFRPTAKELLKHKFILRNAKKTSYLTELIDRYKRWKAEQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery and preclinical profiling of 3-[4-(morpholin-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]benzonitrile (PF-06447475), a highly potent, selective, brain penetrant, and in vivo active LRRK2 kinase inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit
total genus 95
structure length 290
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4w8eA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4w8eA01
3A62A 2J0IA 3NRMA 5HG7A 2PMIA 3BV2A 3OXIA 3ZBXA 3VIDA 3DK7A 3QUPA 4FIGA 1YI3A 2PZPA 2YDIA 2HWPA 5KZ0A 4TY1A 5IQAA 3V6RA 3OS3A 4X3FB 4WOVA 3V5LA 2GPHA 4YP8A 4DGLC 3KFAA 5CI6A 4BCMA 4XOYA 1IAHA 5IQDA 4B99A 4IWDA 2OIDA 4EH4A 3QCSA 5HE1A 3G9NA 2XKFA 2OF4A 4MCVA 3PXZA 4ZTLA 4AW5A 3PXRA 5ANKA 4AW1A 5M44A 3Q5IA 5DEYA 4ZAUA 3LLAA 3CTJA 4P2KA 2B9HA 3AC1A 3DXNA 4GVJA 4CG8A 1Q8YA 3OMVA 2HK5A 1ATPE 4APCA 2WB8A 2HW6A 4F7NA 3JY9A 1UKHA 3LM0A 2ZB0A 1SMHA 2E2BA 2PVFA 2ACXA 1F5QA 5HTBA 3NGAA 1H07A 2J51A 5CLPA 3C9WA 1PMNA 4ZS0A 1WBWA 3EYGA 4MK0A 4CD0A 4DHFA 4FL2A 4S32A 3L8XA 5KMMA 4G17A 3UNKA 5DLSA 4EK3A 1E9HA 3RPYA 4RQKA 3QQUA 5CASA 2BKKA 2YEXA 2O63A 1H24A 3L9LA 3PVUA 3NNUA 4KKGA 5CEKA 2BCJA 3E8EA 4USFA 3D15A 5KNJA 5E9EA 1YHSA 4E6QA 3ZHPC 4A4OA 4DE4A 3ZRLA 4LL0A 3TWJA 2UV2A 4KA3A 4O1PA 4GYGA 4ZLZA 4XBRA 3MYGA 4KKEA 3UO5A 3R63A 3VN9A 3MBLA 4S30A 5EH0A 2EU9A 4O1OA 3FV8A 3R8MA 5DMZA 2HW7A 3F2NA 3TUBA 3R1SA 4RC3A 3QZGA 4H3QA 4QQJA 3T9TA 2VTPA 3MJ1A 2QKRA 4F9CA 3POZA 5CQWA 4BBEA 2PPQA 2O65A 2QHMA 3UG2A 5L6OA 4QQCA 2JDOA 1NVRA 2CGXA 4FI1A 5CQUA 3U4UA 1MUOA 5IEYA 4CV8A 3V5TA 2XVDA 1GIIA 4DFBA 4PMSA 2E9UA 4HCVA 4O21A 4JAIA 5J87A 3BBWA 4XEYA 3LQ3A 3PP0A 4I6HA 4AP7A 4CFFA 5BUJA 3PTGA 4KIQA 4GJ3A 1J7LA 4UY9A 4AOJA 5CANA 3LMIA 2W7XA 1JPAA 5HNGA 3PSDA 2OZAB 4OTIA 3WIGA 4X3FC 2GDOA 5HKMA 3W8QA 4XV2A 1OITA 3UOJA 3R9RA 4RWKA 3PE1A 4GK4A 4YZBA 4F6WA 3D5VA 4AT4A 4J1RA 4FT0A 4G3GA 3DQWA 3TM0A 3L8VA 3R0TA 4IJ9A 2WTDA 2IVVA 4EOMA 2NPQA 2GNLA 4R3RA 2C6MA 4EOSA 3JVRA 4FV4A 5LVLA 3O96A 3PRIA 4LGHA 4NTSA 5CNNA 4LQMA 5E90A 4EOKA 2YCSA 4L9IA 4O0YA 3UQGA 5KZIA 2QI8A 3CEKA 3QTZA 4D4VA 4MWIA 2P4IA 4BB4A 2XZSA 4LMNA 3GU8A 1K2PA 2PE0A 3RCJA 3ZDUA 2ZV2A 4PP9A 1JOWB 3UVPA 5K4JA 1LR4A 4G3FA 2WMSA 4WUNA 5IF1A 3O7LD 4Y73A 2QO2A 3UG1A 1OUKA 3EZVA 4CEGA 1KUTA 2Q0NA 4DG0E 2X2KA 5AUYA 2ZV7A 4AT5A 3UZPA 4O7SA 3UZRA 3ZLSA 5D41A 3BLHA 4CFWA 1ZMUA 1XH6A 2QOHA 3RINA 1BI8A 5BQ0A 5HBJA 4IVBA 5BNJA 2CPKE 1OL6A 1Q3DA 4WNMA 1OL1A 1WBTA 5HE3A 3OEZA 5HLNA 5CSXA 1OIRA 2C3KA 4MH7A 5HCZA 4L43A 3NZ0A 2OSCA 4FKIA 4FK3A 3PPJA 4LRKA 2YWPA 2BTRA 4GT3A 4U79A 3WE8A 4GW8A 2XJ0A 2J0JA 4BF2A 3EIDA 4G6OA 3ACKA 1QMZA 2F2CB 4WRSA 2XK4A 4J99A 2QOQA 5FXRA 2OH4A 2X7FA 4CCUA 2J0MB 2BIYA 3RTPA 3ORTA 4OTWA 4OUCA 5ETFA 4UMTA 4BCHA 1YI4A 4B8LA 5DE2A 4YR8A 1O6YA 2V5QA 2PL0A 4FYNA 3DXPA 4RFMA 4PQNA 4Y8DA 3KRRA 3VUMA 1Y8GA 4ZY6A 4IQ6A 5BPYA 3GC0A 3UVQA 2YDJA 1OBDA 4AGUA 3OBJA 3D7ZA 3Q9ZA 5AP7A 3G5DA 3TL8A 4N6ZA 3A7GA 3KRJA 3FC1X 3PWDA 2EVAA 4FNYA 2JIVA 5JRQA 2W5BA 4I4EA 4O0WA 5HD4A 1JKKA 2CMWA 3AD5A 2WD1A 3AXWA 2A19B 3DU8A 4Y95A 4ZK5A 3VQUA 4A9SA 4E5WA 3M42A 4IX6A 2QO7A 2J0LA 1R39A 3II5A 5E8TA 2QO9A 2F7ZE 4LOQA 4E5AX 4FV3A 2UW5A 4OBQA 3BHHA 1ZAOA 2BZHB 3Q6WA 3R7UA 1PXJA 4F9BA 4OBOA 2XYUA 4D2TA 2ITQA 5M4UA 4GMYA 4BTJA 2XNPA 2FYSA 4WNPA 4EK4A 1WCCA 3BGPA 1Q8ZA 2IJMA 2OIQA 2GFSA 3PVGA 1M52A 5LCJA 3UIMA 4GCJA 2G15A 2XM9A 3R28A 5HCXA 4L01A 4BHZA 5I9XA 4O27B 5DFPA 4KSPA 4IADA 1QL6A 4B8MA 3E7OA 2J0KA 3VF8A 5EM8A 3ZO4A 4W4XA 4WO5A 4EOPA 4O7RA 2W1FA 3D9VA 3WOWA 3KB7A 3EOCA 2PZYA 2C6LA 3PSBA 4A9YA 2J7TA 3BHUA 5AX9A 4BKYA 3LFDA 4C4IA 2YLFA 2OJJA 2WMBA 3VHKA 4AZSA 2XIXA 3KMMA 2Y6MA 1DI9A 3BEAA 3CD3A 4QP8A 3VBYA 4BZDA 2HWOA 4BRXA 3D5XA 5H8BA 1OGUA 3PIZA 4FT5A 4BI0A 4C4JA 5A14A 3F3ZA 4DT9A 3FZOA 3IS5A 2NP8A 4L67A 3OCBA 2YITA 1Q41A 2UW3A 5IEVA 4B4LA 3R9NA 4FEQA 4TT7A 4ALUA 4ZJVA 2XMYA 4GK2A 4F63A 1H1RA 4M12A 2CKEA 1L8TA 1G5SA 1OIUA 1LEZA 2BDJA 4HOKA 5DT0A 1XWSA 4G9RA 4XG4A 2WMQA 4CV9A 4BIEA 2ZYBA 4WRGA 5HIDA 4O2ZA 4EHVA 2VWIA 3GT8A 3DY7A 4KS8A 2BDFA 2IO6A 4BCQA 5I9ZA 3NVMB 2R3HA 4MXZA 5T6KA 3S0OA 3L8PA 2XS0A 3HDNA 1KE9A 4UV0A 2CGWA 2C1AA 3OOGA 4OT6A 2VWXA 4ZSEA 4QQ5A 2C6KA 3EKKA 1URCA 4C2WA 3E7VA 3QRIA 3S00A 4RX5A 2PE2A 1UVRA 4AOTA 3BCEA 4V04A 3GBZA 3QTWA 3MY5A 2JC6A 2OJGA 3MA6A 3O0GA 1W84A 3PJ1A 4KINA 2WMRA 4BCPA 1GZKA 1WBSA 2H9VA 3GCVA 4GVAA 1UNLA 2HAKA 3C0IA 3TNHA 3PIXA 3U9NA 5AM7A 2R4BA 4O7LA 4LV8A 2F2UA 3TNQB 4AU8A 3DOGA 4M13A 4QP1A 3BLRA 4XX9A 1LP4A 2E9OA 5FD2A 2C6IA 2XK3A 3CKWA 3MB7A 4ACHA 4TXCA 2JBPA 3CIKA 5E8SA 4DCAA 4FEUA 3VHEA 3R9HA 2UW6A 3HL7A 5BVDA 1M2RA 3G2FA 1QPDA 2PK9A 4L7FA 3DS6A 2YIWA 3PLSA 1Q97A 4WNKA 3GCPA 4F0FA 3FLYA 4MNEB 4YHJA 4IWQA 4S33A 1Z9XA 3QQJA 4E8AA 4PDPA 3UIBA 3B2WA 3TV7A 2RFDA 5HI2A 4FTTA 3QKKA 3F7ZA 3CPBA 2WGJA 3CXWA 3GC7A 3MN3A 3Q9XA 4ENXA 5CXZA 4TNDA 1U54B 1Q61A 1UWJA 3DZOA 3I79A 2GSFA 1YRPA 5CAVA 5IUGA 4FKTA 3K2LA 3AD4A 2VWYA 3HA6A 3FMMA 4H3PA 4XV9A 4C34A 5J5SA 4U41A 3FMJA 3G15A 1Q8UA 2LGCA 5AP6A 4BC6A 4JIAA 1HCKA 5EDQA 3W16A 4BI2A 2C5NA 4FKQA 1MQBA 3COIA 4IW0A 3KXNA 4QTBA 2GCDA 5DRDA 2ONLA 2VV9A 5HG9A 4CFUA 5AP2A 4KRDA 3MJ2A 1OKWA 2R3OA 3D94A 3HV4A 4MBJA 3DK6A 5B2MA 3E8DA 3GFWA 4TRLA 3SRVB 2PVJA 3FBVA 4FKLA 1P4FA 3AGLA 4F70A 1XH5A 4NKSA 3U6JA 2I0EA 3MTLA 4L7SA 5FEQA 3RPOA 4C3FA 4R7HA 4W4WA 3JUHA 2VWZA 2HXLA 2X6DA 2XK8A 4QTEA 5K4IA 4HGLA 3UDBA 3DFAA 2XNNA 3OFMA 4RZWA 1QPJA 4ZP5A 3HV7A 4BVUA 3QCQA 3SRVA 2VTQA 4DLIA 3W55A 1XO2B 2R0IA 4RZVA 3CPCA 4FTRA 2W1IA 1CKJA 2VD5A 4FK6A 5DH3A 5HLPA 3TDWA 2NRUA 4I94A 3ZBFA 5FWKK 4D28A 4DG2E 3Q5ZA 3CQUA 4FZ7A 4F64A 4ZTHA 3Q3BA 2W96B 1YXVA 3VS7A 4BGGA 3D7TA 4D0WA 1QPEA 4X2FA 2I40A 3TIYA 4B0GA 2UZOA 3PXFA 4PWNA 4W9XA 3ZRKA 1XBAA 4J95A 1LUFA 3A60A 3GU7A 4DTBA 3T8OA 4EYJA 5CXHA 2UW9A 3PXYA 3IG7A 2BZKB 4ANMA 3E63A 3QRKA 2EB2A 3VVHA 2XIRA 4EH8A 5CSPA 5HNBA 3HMNA 2BIKB 4YBKA 1GZOA 3V5JA 2PVYA 4EOLA 4JQEA 3EFKA 4K1BA 3CR0A 1VYZA 5D12A 2WZJA 1NY3A 5AUUA 2LAVA 5A9UA 2OZOA 2R2PA 1UV5A 4JL9A 3G6HA 4NW6A 2JIIA 3TJCA 2ONLC 2VNYA 4GFMA 4AGDA 2J9MA 2YIYA 3H3CA 1WBVA 3VWAA 5FRIA 1PRYA 2R5TA 5FM2A 2F7EE 3W8LA 4YZNA 2PVLA 2XKEA 4LG4A 3SDJA 1XKKA 4BWXA 1IA9A 1M17A 3OT3A 4YPDA 4Q9ZA 2F7XE 3QTUA 4BCGA 4NM0A 3IGGA 4HGSA 3IDCA 5HX8A 3M1SA 5BUIA 3Q4TA 3KN6A 4QPAA 5F9EA 3COKA 1M7QA 5GIPE 1J3HA 3O8UA 4ANNA 2CN8A 3ODYX 4EJ7A 3PG3A 4Q5EA 4D5HA 3RZFA 2GFCA 3MIYA 3ZM4A 4PNKA 3FHRA 3AT4A 2PVKA 2W99B 4FT7A 4RLKA 4HVSA 5BUEA 2OFVA 5J7HA 1NA7A 1T46A 4GT4A 4NJ3A 1PXLA 4FUYA 5ETCA 5JFWA 2X8EA 2J6MA 3KA0A 4L52A 3RNYA 3VBQA 1H1SA 2VWVA 4YPSA 2WPAA 4E26A 3PPKA 1CKPA 3L8SA 5CAPA 5L2IA 3NAXA 3R7VA 2PULA 2OXDA 3BYUA 4Y72A 4UMUA 2PY3A 4HPUE 2KULA 5ACBC 3QTQA 2FH9A 4I4FA 3KXMA 4AQCA 3F6XA 4RIXA 2PVHA 3IK3A 5CZHA 3LFFA 4C4GA 5M51A 2ZMDA 4ZJIA 3VAPA 4QQTA 4IAKA 5AA8A 4UX9A 2YM6A 2CSNA 1ZOEA 4ASZA 4EHZA 5L2QA 2RIOA 4R8QA 2B55A 4BIDA 1W0XC 5B2LA 3QKMA 4RJ6A 1JKSA 2GHGA 1OVEA 3E8CA 5HZNA 4QMZA 4ARKA 4F7SA 4XG7A 1G8SA 3UNJA 4C02A 2CNUA 3DFCB 2E9VA 3OHTA 4W8DA 4ANQA 5CSWA 2R3QA 4UXQA 1OKZA 3RKBA 5IG1A 3POOA 2BUJA 4M69B 4ALVA 5CEMA 3R8PA 3ATSA 4FA2A 3HRFA 3WYXA 5EDRA 2C0TA 3BYSA 3D0EA 5CU2A 5JKGA 3QWJA 2YIRA 3TEIA 5I4NA 3OBGA 2ITXA 2UZBA 2PVNA 1BYGA 3ZXZA 4D5KA 4F1OA 3TG1A 3RJCA 4EORA 5J95A 3MESA 4G31A 3QUEA 2W05A 1ZYSA 2IW9A 4BBFA 4FVQA 2VGOA 3NNVA 5EOLA 4HYIA 4U7ZA 2PUIA 4FTAA 3OWLA 4EQMA 4MX9A 2IVSA 4U5JA 4Z55A 2R7IA 4I22A 4FEWA 4KIKB 4K77A 4JOAA 1ZZ2A 5HO8A 2R0UA 2VTRA 4GKHA 2Z60A 3LFCA 4DFXE 2RFNA 4HZRA 2VTJA 2XNGA 3FMDA 3NWWA 2VWBA 2QD9A 3HKOA 3R6XA 5HIBA 4BI1A 5EYDA 3KC3A 4OLIA 3CLYA 3PIYA 4FZAB 5E8VA 2C0OA 2WQBA 3QALE 4RJ8A 3R7GA 3A4OX 4DTAA 3I6UA 2OXYA 2XIYA 4BCKA 1PYEA 3LM5A 3FLQA 3QQKA 3P9JA 4LMUA 2JIUA 3IO7A 3ZUVA 4DGOA 1APME 5JFVA 3TXOA 5E8ZA 4CLJA 4HYHA 1PXNA 5H8EA 3IGOA 1WFCA 4GS6A 3NYOA 4FIFA 4BL1A 4IBMA 1E1XA 3TT0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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