5AR2A

Rip2 kinase catalytic domain (1 - 310)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
307
structure length
277
Chain Sequence
EAICSALPTIPYHKLADLRYLSGTVSSARHADWRVQVAVKHLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMGGTIIYMPPENYEPSIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structures of Human Rip2 Kinase Catalytic Domain Complexed with ATP-Competitive Inhibitors: Foundations for Understanding Inhibitor Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
total genus 88
structure length 277
sequence length 307
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ar2A00
1DM2A 3QLGA 2XRUA 5F20A 2C0IA 4G34A 4HGTA 4JQ7A 4MD7E 4RZVA 4PL3A 2H8HA 4W8DA 4XV9A 5A46A 2OIDA 3DOGA 2GHLA 2XCHA 2YIWA 3IOPA 3RPRA 5BYYA 1E1XA 3VNTA 1XH4A 2CGXA 3QZHA 4YJUA 3DNDA 2X1NA 3EZVA 5IDPA 1LUFA 3A7GA 3JXWA 2PVKA 4EH9A 2WXVA 4KB8A 2XNEA 3UVPA 4GK3A 1ZLTA 4RJ3A 3Q6WA 4OTGA 3BYOA 5ETCA 4JBVA 3QKMA 4M67A 5DI1A 4YR8A 1U59A 3PXKA 4MF0A 3OUKA 2X39A 4NEUA 4XG2A 2YAKA 3PZHA 3TL8A 4E73A 3GU8A 4PTGA 1HOWA 5EW9A 3ORXA 4QTBA 3CKWA 1XBBA 1Q62A 4J8MA 5CEPA 3HLLA 4ZTNA 5GZ8A 2C6MA 1OKZA 1K3AA 3DU8A 4K18A 5C8MA 3D14A 5K3YA 2JDTA 5KNJA 3E87A 2V7OA 2BCJA 4GT4A 4G2FA 1VYZA 1A06A 2I6LA 3NSZA 3VUHA 1SYKA 4MNFA 5I3RA 3ORPA 4JI9A 3W55A 4QMVA 3EKNA 2R3JA 2IWIA 4IQ6A 3GCPA 4KBKA 5HI2A 1PXKA 4A4XA 4EK6A 4I94A 5EKOA 5GNKA 2OIQA 3CY3A 4G31A 5IMXA 3DA6A 3RALA 3IG7A 4Z9LA 4E4LA 4UWCA 5HCZA 4LGHA 2F7ZE 4KKGA 4C3RA 4I0SA 5HG9A 2RF9A 4FV2A 2CN5A 4UMTA 4AFEA 4F1MA 3OWPA 4BDHA 2C5YA 3W2PA 4FTTA 4UY9A 1E1VA 4F9CA 3N9XA 3KCFA 2EXCX 1Q3WA 2CSNA 3TUDA 2JAMA 1YXSA 4QMLA 1H4LA 3OS3A 5DR9A 4KD1A 4BZNA 5KKRB 2GMXA 1DAWA 2EWAA 3RNYA 2FSMX 4CV9A 4ENYA 2WMBA 2YDIA 3MY0A 2W1HA 4L42A 1Q8UA 4XG8A 3OCGA 3NYNA 4C2WA 5KX8A 4DHFA 3LE6A 3A62A 3WBLA 5CANA 1GOLA 2YCFA 5C8KA 3TACA 2J4ZA 2YAAA 2FO0A 4PTCA 1M2PA 3VIDA 5LCKA 4YJTA 1JKTA 3NZ0A 4PMTA 1V0BA 4S31A 5AADA 4MQ1A 4XOZA 5AUXA 5DH3A 1ZYDA 3QLFA 4QTAA 5CNOA 5CVFA 5H8BA 4JJRA 2PE2A 1BMKA 1XJDA 2VD5A 3ZC6A 4RWIA 4IZ5A 3PPZA 5E8WA 4ZJJA 4D1ZA 1BYGA 4E1ZA 4FEQA 4I23A 3MFSA 2OH0E 4RVKA 4RFYA 4AW0A 3HRFA 2J6MA 3K3IA 4L01A 1PKGA 1PXMA 1O6YA 2EB2A 4I5PA 1ZWSA 4PL5A 3Q9WA 5M51A 5FXQA 3KU2A 4AZTA 4D2SA 1WCCA 5F95A 5FP6A 1V0PA 3H9RA 4IM0A 4YLLA 2GNHA 5DHJA 1NY3A 2WQNA 2ITQA 2W4OA 4WRSA 5CSXA 3LM5A 4FA2A 5BUEA 4E6AA 3B2TA 4L8MA 4BDCA 4BCPA 4EOIA 3DTWA 3HX4A 4Y73A 3GEQA 2VN9A 3QRKA 2WMWA 3FLQA 4QQCA 2VTLA 4PPBA 1REJA 4UYNA 1ZYSA 2J0IA 5E7RA 2J51A 4ZSLA 4FSRA 4HNIA 3FKNA 2X7OA 4V04A 2Y8OA 3A7FA 1PMEA 2WTKC 3QQLA 4KIOA 4IXPA 4NIFB 5BYZA 5ACBC 4E6DA 4MXYA 3RHXA 2ZDUA 2E9UA 2WOTA 2W7XA 2QO9A 3AD5A 3LIJA 4GFMA 4KBCA 3QCQA 3DBEA 4QP3A 4FL2A 3ZLYA 4YSMA 3KULB 3WILA 2BHEA 3ZONA 1R0PA 1H25A 3IPHA 3PIXA 4C3FA 4PNKA 2EVAA 3M2WA 1YHWA 3O8UA 5H8EA 2WGJA 1MP8A 4DH1A 2BDJA 2ITNA 3HNGA 4RIYA 4IIRA 4B4LA 2C4GA 2JLDA 3ALNA 2ZV7A 5HE0A 3FPMA 4BF2A 4E7WA 5HIEA 3OWLA 4M97A 4ZLYA 3HA8A 3ZYAA 3QUDA 4X3FC 4G3DA 2B54A 3BGZA 3GCSA 2FH9A 2ZV2A 4O6LA 2PSQA 4FIFA 3UDBA 3BPRA 4BZDA 3LXNA 4OUCA 2ZOQA 3OY3A 3NS9A 3OWKA 5I9WA 4ZY6A 2J0KA 2UW6A 3ZO1A 2PWLA 3Q32A 1WBSA 2G1TA 4FT3A 5E91A 4EZ7A 4EBWA 3DK6A 4Z3VA 2OFVA 3FQEA 3CXWA 3GC9A 5EHYA 1IA8A 4H1MA 2O8YA 2XIYA 3PP0A 3QTRA 4L7SA 1J3HA 3FMHA 1P14A 4G3FA 3TV7A 3NNXA 5FM2A 4ASEA 3LM0A 3QHRA 4YMJA 2G2FA 4QMTA 3V04A 2C6DA 1M2QA 1ZOHA 3LFCA 3R7VA 4FIEA 2C3IB 5EM5A 2X4FA 4CVAA 3IW8A 4AT3A 1OKYA 2O2UA 2GDOA 3C4XA 2B52A 2SRCA 4EKLA 3GENA 1R78A 4WOVA 5CT7A 2HYYA 3OFMA 3T3VA 3BYMA 4RX8A 5FEEA 4HW7A 4QRCA 5B2LA 4D4YA 3HV4A 3PJ1A 3TCPA 4YTCA 3G90X 4RFZA 1FMOE 3OBJA 2ITZA 4FIJA 4EQCA 1KE7A 2UVXA 3FKLA 3L9PA 3MVHA 5C9CA 4J53A 4HPTE 1MRVA 3HMIA 4D1SA 3HV7A 3KVWA 4IVBA 3PXFA 4OW8A 2GQGA 5FWKK 3TT0A 2R9SA 3BHVA 1OIUA 4RIOA 4BDJA 2ZM4A 3Q60A 4ONAA 5L8KA 2J9MA 2QHNA 4FKVA 3EQIA 1JOWB 3EL7A 2ZAZA 3QCYA 4IH8A 4MXZA 5J5TA 2XZSA 5DE2A 2VX0A 1OIRA 3P4KA 5DRBA 2A2AA 3ZLSA 2WIPA 2ZV8A 5BUJA 4DEEA 3TJDA 2W5HA 2I0VA 2QOIA 3OT8A 2IW9A 4G1WA 5KMNA 3S4QA 3WE4A 4AW1A 3CKXA 3A8WA 4K2RA 2F7XE 3V5JA 4C4FA 3F2NA 3LW0A 4RBLA 2FVDA 5E8XA 5AR5A 4AE6A 4EWHA 4D0WA 3AC4A 2Q0BA 2YITA 3EFKA 4FVRA 1OIQA 2WQOA 1XH5A 3DJ5A 1G3NA 4HZRA 5HD7A 3FLZA 5KHWA 3O96A 2R0UA 4O2PA 3W2CA 4IFCA 2G2IA 4BVUA 4J7BA 2CKEA 4RC2A 5ANJA 3P78A 5DT0A 3R1QA 4KINA 3PRFA 5I4NA 4YJSA 5EYKA 2VU3A 3BWJA 3KXNA 3UQFA 2V62A 1JNKA 4HYIA 4ZAUA 4EBVA 3JY9A 4JG6A 3AD6A 3HL7A 2X7GA 5EHLA 3TG1A 3ZO4A 2V7AA 2X4ZA 4BCNA 4DG3E 3FKOA 4XV1A 2A27A 4BCJA 4FX3A 3QYZA 2XYNA 4GK4A 4S32A 4WHZA 4BYIA 1PMUA 3K2LA 5J1WA 1GIIA 2CHLA 2ZYBA 4PMMA 3A61A 2BMCA 3TZ8A 4GJ3A 4AOJA 2VWUA 3ZSHA 4D2TA 2WMQA 4I6BA 3PE1A 3GCVA 4U81A 3PJ8A 2QR7A 3TI1A 1FVVA 2ZM3A 2VTPA 3SW7A 4JDJA 5AAEA 4D0XA 2XIZA 5I5ZA 4EHGA 5C1QB 3FLWA 3MVLA 3PTGA 5IU2A 4KS7A 3ZOSA 2V22A 1H27A 2R3RA 3VN9A 4EORA 5K4IA 1WBPA 4I6QA 3RI1A 2PMNX 1OPKA 3R7IA 3UTOA 3UZPA 2UZWE 5IA1A 1UU3A 4FNYA 2JBPA 5E90A 3KFAA 4M68A 3VUDA 5EI2A 4U8ZA 5L2TA 3QUEA 3UQCA 3POZA 1FVTA 2GHMA 4BCMA 4ZTRA 4WD5A 5I9VA 2Z2WA 2XK3A 4FOBA 4JX3A 5EDQA 4IVCA 4C35A 5B2MA 3C4FA 4PDPA 4YJRA 2W99B 2OWBA 3DGKA 4C36A 3TV6A 5FTOA 4HOKA 5E8VA 3VS3A 1UWHA 1VEBA 3ORLA 4I41A 3LCKA 2CLXA 3BX5A 2R3HA 3TJCA 3WYYA 3MFUA 2IVVA 5BPYA 4QMXA 2JFLA 4Y72A 3OCSA 3KRWA 3AT2A 4L53A 4RIWA 2BALA 4J71A 5CU4A 4CCBA 4FNZA 2IW8A 3SW4A 5AIRA 4BCGA 4AP7A 4UX9A 1BKXA 4QP7A 2O65A 2XNGA 3ZRKA 4F64A 3NYOA 5IA4A 4AS0A 3PYYA 3CPCA 4G17A 3JS2A 3LZBA 2R3KA 4OGRA 3H0ZA 3F7ZA 5E8YA 3AC5A 4ACHA 1ZY4A 3E7OA 3UNZA 2VWWA 2YACA 1BL7A 4U43A 4YJOA 3I7CA 3WZJA 4BFMA 3FZTA 2PMLX 3WIKA 1OL7A 3PG3A 1IR3A 1RQQA 4QTCA 2GHGA 3P86A 5IZFA 4FSWA 2R0IA 3ZCLA 3FQHA 4PPAA 5CSPA 4QP9A 3KKVA 3EYGA 4MXAA 2UVZA 4QPSA 2BIYA 1M17A 5DWRA 3FZOA 4BDEA 1U54A 3RZFA 2OO8X 2WMAA 4UZDA 4AZFA 5J8IA 5FGKA 3F3ZA 5HKMA 3EJ1A 3BEAA 3UJGA 3VHEA 4CQEA 2AYPA 4BDAA 4WSYA 3HV5A 3CEKA 1M52A 2RL5A 4IWOA 4A9SA 4JT3A 5CTPA 5AV2A 4GEOA 2R7IA 4ARKA 2W96B 3S0OA 3IECA 4ERWA 3ACJA 3TXOA 3QQGA 3IOKA 1WBWA 4MD9E 4RWLA 4EK5A 3Q5ZA 1XHAA 4I24A 1W8CA 5K4JA 2QLUA 3C13A 5JFVA 2WELA 4RIXB 4FTRA 5CY3A 1NVSA 4KKHA 4BBEA 5KCVA 3BKBA 4RJ8A 3V5LA 3PY1A 3CC6A 4N6YA 2WMXA 4U5JA 3CD8A 4FIGA 1PF8A 1CM8A 4FNWA 1YWVA 1PXOA 4AQCA 3U9CA 2X6DA 3FUPA 4NM0A 2C0OA 2GTMA 2NO3A 4XV2A 5I9ZA 4I93A 4EC8A 4JR3A 4F9YA 3NDMA 4G9RA 2OKRA 2W4JA 4W9XA 4USFA 3F88A 3MH2A 3QCXA 2CGVA 3R83A 4F0IA 3VF9A 4EQMA 4NH1A 2UZOA 4IWDA 4LL5A 4NW6A 3KXMA 2HIWA 5M44A 2UW5A 3ZZWA 3FZ1A 4IE9A 4MWHA 5IA2A 4XBUA 3HP2A 5ANEA 3H0YA 1M14A 1UVRA 2IO6A 4FBXA 4MX9A 4LRKA 3ZLWA 4BGGA 1VJYA 4FSYA 3MIAA 2GU8A 3ZDIA 3L1SA 3R2YA 4X2KA 2Y4PA 3ZEWA 4APPA 2WQEA 2QO7A 2XH5A 2XKFA 2KULA 4JIAA 4FZAB 4BC6A 4QNAA 4FKWA 4FSUA 3BV3A 2R7BA 1OM1A 3EQPA 1BL6A 2I0EA 3JVSA 5TE0A 1H07A 3L9NA 5HIBA 3QHWA 4PX6A 1URCA 4BTJA 4UMRA 2YN8A 2ITTA 2P33A 5ANIA 1BI7A 1YQJA 2YLFA 2LGCA 3RAHA 5JZJA 3MSSA 3PLSA 4ZJIA 4D28A 3MDYA 4PTEA 3EN9A 4TTHB 5HBHA 3FLNC 2Z7RA 4L3PA 5AP5A 1UKHA 3DQXA 2ZV9A 2IZUA 1H1RA 2HXQA 2OXXA 2XK7A 3DT1A 4H3QA 5LCJA 1DI9A 2QD9A 5KZ0A 2VUWA 4E20A 2VTIA 3SOCA 4IAYA 4F9AA 2F57A 4M84A 3FC2A 5CSWA 4YJPA 1FVRA 3QTZA 3I0QA 4MEDA 1CDKA 5A4CA 4U40A 3R02A 4ZS0A 4V05A 1KV1A 3ZM4A 2C6LA 2NP8A 4CCUA 3UODA 2JDRA 4CEGA 3RBWA 4QT1A 5KE0A 1ZOGA 3PVWA 2OJJA 3C50A 3EQGA 4TYHA 5FM3A 4UEUA 4ZTSA 4FTIA 1OKVA 4UV0A 5HVYA 1Q24A 3C51A 3DTCA 4IDTA 4B8MA 4L52A 2CJMA 3G6GA 4NTSA 4NUSA 4WUNA 3WZKA 1TQPA 1UV5A 4IZ7A 3UP2A 3OROA 2BR1A 2I0YA 5HU9A 5J9LA 2B9JA 2ITOA 5HLWA 5EFQA 1UU9A 3MB6A 4O22A 2UW0A 3FDNA 4JAIA 2BTSA 3E63A 1QCFA 4FL1A 4Q2AA 4QO9A 3VBXA 2VX1A 3WF5A 3OW4A 5HVJA 4I0RA 4L7FA 5DIAA 4ZTQA 3SLSA 3LFEA 2XBAA 3LPBA 3DS6A 5AV0A 3FLYA 3LLTA 3IDCA 3PVBA 4N6ZA 5TOZA 4YU2A 3B2WA 2PE1A 5CAPA 2G15A 4FK3A 2WNTA 4KAOA 4P5QA 3Q4UA 3WOWA 4O1PA 5AV4A 2J50A 3EN5A 3O7LB 3LJ1A 3MBLA 4NJDA 3IK3A 4U79A 3ZEPA 4ACCA 3VBVA 4HVIA 4AA5A 1OI9A 3R8MA 3RPVA 3HKOA 4C33A 2WMVA 3W10A 3QXPA 5CEOA 5HLNA 4QMPA 5EI6A 4U80A 5HGIA 4JQEA 1BLXA 3CQUA 2ESMA 4QTDA 3AC2A 3OVVA 4R8QA 3R8PA 3RPOA 5HCXA 4ANQA 4BL1A 4IX6A 4M66A 4EOJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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