5FEDA

Egfr kinase domain in complex with a covalent aminobenzimidazole inhibitor.
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
321
structure length
288
Chain Sequence
EAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKESPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDEMDDVVDADEYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of (R,E)-N-(7-Chloro-1-(1-[4-(dimethylamino)but-2-enoyl]azepan-3-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-2-methylisonicotinamide (EGF816), a Novel, Potent, and WT Sparing Covalent Inhibitor of Oncogenic (L858R, ex19del) and Resistant (T790M) EGFR Mutants for the Treatment of EGFR Mutant Non-Small-Cell Lung Cancers.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 92
structure length 288
sequence length 321
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5fedA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5fedA01
3ZXTA 3OOMA 4FZFB 1Y6BA 2BHEA 3LW0A 3KXNA 4BBFA 1H1PA 2C6LA 3Q5ZA 4K1BA 4LL5A 4EH3A 4ZAUA 2XM9A 3CSVA 4C3PA 3V6RA 4JOAA 2HWPA 4D1SA 2XMYA 1B38A 4DFBA 3TNWA 1H00A 1OM1A 1WBVA 1CM8A 3E7OA 3HRCA 2YLEA 4MBIA 4BHNA 4RQVA 3PXYA 5CAUA 1XO2B 3IGGA 3TCPA 2BRNA 5GJFA 4JXFA 1H4LA 5D12A 2H34A 2OK1A 4GK2A 3PVGA 2UV2A 4R7HA 4BCNA 4FV6A 4MD9E 1H24A 5HVJA 4Q2AA 2X4ZA 4FEQA 4TYIA 3V8TA 3EL8A 3VHEA 3VJOA 3WF8A 4OTRA 4YTHA 3QYZA 4YR8A 1Z9XA 5CSXA 4C34A 4PF4A 3R9OA 3R02A 2YM6A 1H0WA 5CF8A 1YOJA 2OF2A 4Q5EA 4HCVA 4I0TA 3F3UA 3BGZA 2W9ZB 2WD1A 5GZ8A 2C5NA 2P55A 3HNGA 5BX0A 5GINE 4YJTA 1K2PA 2XIYA 3Q5IA 5CU6A 4EJ7A 1SNUA 3BKBA 3MB7A 5FTGA 5J8IA 2Y6OA 5JK3A 2RL5A 3DA6A 4FV4A 2Y9QA 3VQHA 3NW5A 3KGAA 5IA3A 2UVXA 4ZTHA 3RAIA 5C26A 5D9HA 2CNUA 3DU8A 2X0GA 4C3FA 4C57A 3R8VA 4XV2A 3MH1A 3RAHA 3BGPA 5K4IA 3RNYA 4FG7A 2YERA 3EN4A 3Q4UA 4RC4A 4QPSA 4A9SA 2WTCA 2XB7A 2R3GA 4V01A 3R7UA 3ZYAA 3JPVA 4AF3A 4EC9A 3S0OA 3MA3A 1YWNA 5T3QA 4I92A 4EWHA 2XYUA 3AT3A 3D94A 4AS0A 2B0QA 4EKLA 4YC6A 5ITAA 2J9MA 4APCA 2X2LA 4YJNA 4XG8A 3ZO3A 4Y72A 5A6OA 4N6ZA 3LLTA 3QRKA 4RIYB 2I7QA 1HCKA 2BDFA 1ZWSA 4UZDA 4MBJA 4WUNA 3CR0A 5BVEA 2Y4IB 3EB0A 3KU2A 4YZCA 4AZSA 3HV5A 3QX4A 4XBUA 4F6WA 2B7AA 5IEXA 5HX6A 4OTHA 4PP9A 3NZ0A 2JDOA 4NIFA 4WBBB 3V04A 2PVKA 5FGKA 5I3OA 5IPJA 3IW5A 2E9NA 4ZSGA 4QQTA 5I0BA 4NFNA 2GNIA 3LJ2A 4QMVA 4D4SA 4FT9A 5JFWA 3BU3A 4CT1A 2ITZA 4IB5A 2CGVA 3BLRA 4QYGA 1B6CB 1U59A 3JUHA 2OIQA 3GT8A 4MHAA 3GFEA 4I24A 5H8GA 2OJ9A 2B9IA 3QTIA 3W1FA 3BHHA 1FINA 4EOOA 4IVDA 2C0OA 3FZOA 3IPHA 4K6ZA 4RFMA 3VHKA 4EK5A 4XNEA 3VS7A 3FWQA 4DLJA 5IQHA 1W84A 3RJCA 5DWRA 3FLWA 5IMEA 5EW3A 1XH8A 4E5AX 4XG3A 4NW5A 4QMXA 2WEVA 4IFGA 4D4VA 4EOQA 3KF4A 4FKWA 4QP6A 3LQ5A 5GNKA 3LHJA 5C1QB 4D5HA 5KO1A 2BR1A 4M12A 4CKJA 2GHLA 1HOWA 2VTSA 4DN5A 2VX3A 4FKIA 3NNUA 4JIAA 4D0WA 2JDTA 4ZSEA 4NM0A 4Y46A 4M13A 5B2MA 2WTKB 2PYWA 1MRYA 3TL8A 3RNIA 2GHGA 3FDNA 4IAZA 5D7AA 4I22A 2VWWA 5A4TA 4JBVA 1OIYA 5CAVA 1OBDA 1CSNA 5EK7A 2UUEA 4YC3A 4FF8A 2P2HA 4BCIA 3Q6UA 4N0SA 4BCJA 4KKHA 1J3HA 1UKHA 4JL9A 4QP3A 5GIOE 4FKSA 5CTPA 1V0OA 2EB3A 4RWKA 3MY5A 5HIDA 3QTUA 5HCXA 4ACHA 5BVOA 1FOTA 3QKKA 3A4PA 4AE6A 5CAPA 2UZLA 3FZSA 2PZ5A 3ZM4A 3JR1A 2WGJA 5C8NA 3A99A 3MPTA 5CSWA 3EKKA 4ACGA 3FLSA 2W5BA 3BBTB 3P7AA 4L7SA 4ALUA 1JNKA 4FTNA 3V01A 4JNWA 2E9PA 2ITWA 3BGQA 3NNWA 4PRJA 3QFVA 4FKOA 4GU6A 4H39A 4L3LA 5HEZA 5JGAA 3PXZA 3GENA 1I09A 3IW7A 5IKWA 3TNQB 1PYEA 4RBLA 2VO7A 2R3LA 3HGKA 5DE2A 3SA0A 2HW7A 4MVFA 2VTRA 3PSDA 4HYUA 3MYGA 2XKCA 4CCUA 2VAGA 3SC1A 3LE6A 4FTLA 4TYGA 3MV5A 3RTPA 3DS6A 3QZIA 4XP2A 4HVSA 1ZZLA 2XF0A 4WD5A 3DBEA 5IH6A 2HAKA 5HG5A 3E87A 3LMGA 4YU2A 4FG8A 3NWWA 3EOCA 5E90A 2X8EA 3ORPA 3KCFA 3L8PA 2I0EA 3OZ6A 4PDSA 2YWVA 2JKOA 5AX3A 2A4LA 3FHIA 2P2IA 4C2VA 2W17A 2QURA 5J9YA 1YHVA 5CQUA 2P33A 4TYHA 4YZNA 5FXQA 4BDKA 4BCKA 4ENXA 4O6EA 2RG6A 3UPXA 4F0GA 4KS8A 3VBYA 4PMPA 3GCPA 4I20A 1KE9A 3QRUA 2XK6A 2BUJA 1YHSA 3R1QA 5CU0A 3R8PA 4L53A 4L9IA 4XG7A 4F0IA 4BF2A 2CGXA 2DUVA 3ZMMA 4LRJA 1JSTA 1IAHA 2VNWA 3DFAA 3PG3A 4S31A 5FTOA 5G6VA 4OBPA 2QO7A 3RPYA 1NA7A 3A7FA 1J7IA 4ENYA 2C3LA 4APPA 1BL6A 4FSTA 4EH6A 3D0EA 2V55A 4AZTA 3H0YA 5DRBA 3ZLWA 3ZRMA 4PDOA 3MN3A 4EYJA 3ZSGA 2PUIA 3I7CA 4DAWA 3VF9A 2J4ZA 1GZ8A 4BDJA 1CKIA 2YAKA 4L67A 5JZNA 2ZAZA 3JY9A 4HVIA 4GT5A 5HU9A 3IGOA 3F3ZA 4JQ7A 5K0KA 3TUDA 4U3YA 3ORKA 3V6SA 4ZTNA 2YM4A 2JD5A 4IZ7A 4Y73A 3VUIA 2XIXA 2XJ2A 4M14A 4G3FA 4X0MA 3HYHA 2GNHA 4J99A 3RM6A 4H36A 5AMNA 2QLUA 3EFKA 3EIDA 3Q9XA 1MUOA 4YLKA 5FEDA 5KUPA 4Y8DA 3R8ZA 2Y0AA 2JBOA 3NGAA 3NUPA 2CCHA 3C4EA 3MFSA 4NM3A 4BHZA 4AG8A 1LR4A 2F7XE 2YZAA 3ZM9A 2F49A 4EH2A 5CNNA 3FLQA 2GNLA 3EQFA 2B52A 3QRIA 3PSCA 3BCEA 3QAME 2YM5A 1BX6A 4QTEA 1VEBA 4U8ZA 2ITXA 3KULA 3UIUA 3W2CA 3NSZA 3OT8A 3QX2A 4F7NA 4BTJA 4AW0A 4OAUC 3NS9A 4MXOA 5CU3A 4A07A 3R63A 3ZO2A 4BDEA 3D4QA 4EHGA 4U41A 4EUUA 4E4MA 3KEXA 5B0XA 5A3XA 2WMAA 4I5PA 4NTTA 2VTMA 1YXXA 4EOJA 2I40A 2PMIA 2PZPA 1KWPA 3HV3A 4R3PA 5L8LA 3CKXA 3DK7A 4JDHA 4YJUA 3WZEA 4J7BA 1PMUA 3G0FA 3PSBA 5BYYA 1YDRE 5AR5A 3OY3A 1QL6A 2GFCA 4EOSA 4CZYB 5L6PA 4AACA 3FMLA 2RFNA 4QMSA 4EK6A 3DJ6A 4J71A 4O38A 3BYVA 4QQ5A 3RKBA 2YISA 4NUSA 3VIDA 2YN8A 2HELA 3CBLA 3MY0A 3WE8A 3ZZWA 3VBQA 2PVLA 4UYNA 4M15A 2X7GA 3OTVA 2QO2A 5L6WL 2QHMA 2QNJA 4QO9A 3UODA 3AC3A 4DFXE 4C59A 2VTAA 4D1XA 4AGCA 3LMHA 1XH9A 5FUTA 4FG9A 2Q83A 3TIZA 3U54A 5CASA 3UNZA 3ZFYA 3H30A 3QQJA 3HA6A 5EI8A 4GYIA 2CJMA 3U9CA 4C33A 4EJNA 5C8KA 1S9JA 3AGLA 4FYOA 2OXDA 5EW9A 2ZMCA 3W55A 4FKGA 4N70A 4CLIA 1Y57A 3HMMA 1W7HA 2WMTA 4XMOA 2WAJA 3V8WA 3PY0A 3RALA 1GZKA 1OECA 5D11A 3IW4A 3GC0A 3M1SA 4DEDA 5KMIA 4WRGA 5CVFA 2ETKA 4M84A 1T45A 2Y6MA 1WBTA 1MQ4A 3VO3A 3R28A 1Q4LA 3G9LX 2O5KA 2F4JA 5IH4A 4FUXA 1OUKA 2VWVA 5CEQA 4RA5A 2XKDA 5HO8A 3KC3A 4DEGA 1STCE 3PPJA 2BZHB 4JJRA 2ETRA 4F99A 1M2PA 2UZTA 4JRNA 3BEAA 5K5NA 4AW2A 5HI2A 2F7ZE 3MA6A 2R2PA 1QPDA 5CU4A 5HG8A 3GQLA 1OPLA 3AMYA 3VQUA 2WMBA 4O84A 5J7HA 5E9EA 3VBVA 4S30A 4EBVA 4XH6A 1IG1A 3A7HA 4R1VA 4ZSJA 4FL1A 4XV9A 4I6BA 1H08A 1OL7A 2QC6A 4CFXA 3FPMA 3DDQA 2XIKA 5CT0A 1QPCA 4DLIA 4I6FA 3V8SA 4Z3VA 3C4FA 3FKOA 5IEYA 4NCTA 3RCJA 3AD4A 4YP8A 4BCGA 4ZS4A 3V5WA 3DXNA 5CI7A 4W4YA 5EYMA 2O64A 2E9VA 4BKYA 2WTIA 4QMZA 4CNHA 4E93A 4EKKA 5CT7A 1U5RA 4XEYA 5CEKA 5KBQA 3GB2A 3U6JA 3R9RA 4OLIA 3A8WA 2PUPA 4JRVA 3FZRA 3OD6X 3ORNA 3H9RA 2EXMA 4DYMA 3JS2A 4NIFB 4BDDA 4U97A 2CGWA 3K2LA 1KOAA 4EOMA 1VYZA 1J1CA 1PXOA 3C13A 3ET7A 3HDMA 3MSSA 2V62A 4D4RA 2C3KA 4EH8A 3L8VA 1R78A 4FV1A 3MFTA 3RM7A 4E4NA 3EQBA 3GGFA 4R1YA 1K9AA 4ZTRA 3WYYA 3ULIA 4TN6A 3Q32A 5E8XA 2G1TA 2WTVA 3GFWA 4FC0A 3FZPA 3O8UA 4IDVA 4BZOA 4QT1A 5CEPA 3E8EA 4QOXA 4DGNA 2O8YA 3MVJA 3RHXA 4CG9A 3RI1A 4QMMA 3L9MA 3VS1A 4YTIA 4AA4A 5AR7A 3DNDA 2WFYA 3PP1A 4F1MA 2C6IA 3UZRA 2PMNX 4M3QA 1XBBA 3NYNA 5DYJA 3MTFA 5EYDA 4AA0A 4RIOA 1H27A 4FIFA 3QA8A 5FM3A 2F7EE 3ZUVA 4ZXTA 2RFEA 5M57A 2H96A 3FEGA 3KF7A 4XJ0A 2O65A 2XJ0A 4NT4A 3IW8A 4CMOA 5BYLA 3C51A 4G5PA 5J7BA 4KKGA 4NKAA 4MCVA 4WG4A 1WVXA 2BMCA 2IW9A 1WBSA 1SM2A 1XH6A 2V7OA 2YA9A 4XS2A 5LMAA 4EH4A 4EH5A 4UWYA 5IISA 4WO5A 2XNGA 3HV7A 4UV0A 3BI6A 3HV4A 5FTQA 5GJDA 4BTMA 3ZEPA 5BNJA 3LLAA 5I9ZA 1Q8UA 2XCKA 4W9WA 3MH2A 3RBWA 1ZYLA 4FV3A 3T3UA 4B0GA 5EKOA 2H8HA 4CKIA 4FOBA 4FTKA 5CWZA 3F3WA 5JRQA 3NUNA 4EHZA 3KVWA 3GU7A 4I0RA 3VNTA 5HLPA 4A9RA 5LVPA 3H10A 4ZP5A 2CNVA 3HV6A 3FMJA 4Y5QA 2OJGA 4IAIA 4H1JA 3RK5A 3E3PA 2JLDA 2YM8A 2PU8A 3P5KA 1OB3A 2Q0BA 4K18A 4EH9A 2XK9A 2XS0A 4PL5A 2XKEA 3O23A 2NRUA 4IX3A 3NX8A 4JX7A 2A2AA 2W96B 5AM7A 3UIBA 4E5BA 2JDVA 2ESMA 2VTPA 2W05A 3TNPC 4UN0C 5FRIA 4A7CA 1A06A 2OICA 2PE2A 3ROCA 4D9TA 2C5YA 2A27A 2FSTX 2WO6A 2XEZA 1YXSA 3KN5A 3PE1A 5C9CA 5A9UA 3BYUA 2B53A 3NIEA 4DEBA 4I5HA 1TKIA 2EWAA 4EK8A 2CCIA 4RSSA 5B2KA 3R9DA 4MAOA 3KXZA 4Z7HA 2BAKA 5CS6A 4A06A 4EZ3A 2X8DA 5AR4A 5TR6A 1FVRA 4R77A 2QLQA 3FPQA 4D2TA 5BQ0A 3CIKA 1NY3A 2R3MA 3FXXA 4WNKA 3PLSA 4DBNA 2PVRA 3D83A 2DWBA 2HY0A 2RIOA 3R6XA 4W8EA 4QMOA 5H9BA 1XH7A 4AW5A 1U5QA 1Y91A 4MBLA 2JAMA 4XG9A 1GOLA 3F5XA 3PJ1A 4U0IA 4LRMA 4AXAA 2AC5A 3DT1A 4TYHB 3EQDA 3VUMA 3NW6A 4YJQA 5EW8A 5DVRA 3N9XA 4ZZNA 4ZTSA 1OUYA 2LAVA 2G2IA 4K0YA 2I0VA 1Q5KA 2PSQA 2UW0A 3A62A 4FKJA 4WBOA 4PTCA 3GXLA 5HBEA 5KZ0A 5HQ0A 2FUMA 3N4TA 5LJJA 4G34A 5BMSA 3TUBA 5AR8A 3RAKA 1JWHA 1Q24A 3DQXA 2J2IB 4GV1A 5M09A 3BHVA 1Q97A 4UMTA 4WNMA 3TWJA 3QUDA 3PA3A 3Q53A 3DJ5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZXT A;  3OOM A;  4FZF B;  1Y6B A;  2BHE A;  3LW0 A;  3KXN A;  3W0P A;  4BBF A;  1H1P A;  2C6L A;  3Q5Z A;  4K1B A;  4LL5 A;  4EH3 A;  4ZAU A;  2XM9 A;  3CSV A;  4C3P A;  3V6R A;  4JOA A;  2XAL A;  2HWP A;  4D1S A;  2XMY A;  1B38 A;  4DFB A;  3TNW A;  1H00 A;  1OM1 A;  1WBV A;  1CM8 A;  3E7O A;  3HRC A;  2YLE A;  4MBI A;  4BHN A;  4RQV A;  3PXY A;  5CAU A;  1XO2 B;  3IGG A;  3TCP A;  2BRN A;  5GJF A;  4JXF A;  1H4L A;  5D12 A;  2H34 A;  2OK1 A;  4GK2 A;  3NFF B;  3PVG A;  2UV2 A;  4R7H A;  4BCN A;  4DDI A;  4FV6 A;  4MD9 E;  1H24 A;  5HVJ A;  4Q2A A;  2X4Z A;  4FEQ A;  4TYI A;  3V8T A;  3EL8 A;  3VHE A;  3VJO A;  3WF8 A;  4OTR A;  4YTH A;  3PUF C;  3QYZ A;  4YR8 A;  1Z9X A;  5CSX A;  4C34 A;  4PF4 A;  3R9O A;  3R02 A;  2YM6 A;  1H0W A;  5CF8 A;  1YOJ A;  2OF2 A;  4Q5E A;  4HCV A;  4I0T A;  3F3U A;  3BGZ A;  2W9Z B;  2WD1 A;  5GZ8 A;  2C5N A;  2P55 A;  3HNG A;  5BX0 A;  5GIN E;  4YJT A;  1K2P A;  2XIY A;  3Q5I A;  5CU6 A;  4EJ7 A;  1SNU A;  3BKB A;  3MB7 A;  5FTG A;  5J8I A;  2Y6O A;  5JK3 A;  2RL5 A;  3DA6 A;  4FV4 A;  2Y9Q A;  3VQH A;  3NW5 A;  3KGA A;  5IA3 A;  2UVX A;  4ZTH A;  3RAI A;  5C26 A;  5D9H A;  2CNU A;  3DU8 A;  2X0G A;  4C3F A;  4C57 A;  3R8V A;  4XV2 A;  3MH1 A;  3RAH A;  3BGP A;  5K4I A;  3RNY A;  4FG7 A;  2YER A;  3EN4 A;  3Q4U A;  4RC4 A;  4QPS A;  4A9S A;  2WTC A;  2XB7 A;  2R3G A;  4V01 A;  3R7U A;  3ZYA A;  3JPV A;  4AF3 A;  4EC9 A;  3S0O A;  3MA3 A;  1YWN A;  5T3Q A;  4I92 A;  4EWH A;  2XYU A;  3AT3 A;  3D94 A;  4AS0 A;  2B0Q A;  4EKL A;  4YC6 A;  5ITA A;  2J9M A;  4APC A;  2X2L A;  4YJN A;  4XG8 A;  3ZO3 A;  4Y72 A;  5A6O A;  4N6Z A;  3LLT A;  3QRK A;  4RIY B;  2I7Q A;  1HCK A;  2BDF A;  4DDG A;  1ZWS A;  4UZD A;  4MBJ A;  4WUN A;  3CR0 A;  5BVE A;  2Y4I B;  3EB0 A;  3KU2 A;  4YZC A;  4AZS A;  3HV5 A;  3QX4 A;  4XBU A;  4F6W A;  2B7A A;  5IEX A;  5HX6 A;  4OTH A;  4PP9 A;  3NZ0 A;  2JDO A;  4NIF A;  4WBB B;  3V04 A;  2PVK A;  5FGK A;  5I3O A;  5IPJ A;  3IW5 A;  2E9N A;  4ZSG A;  4QQT A;  5I0B A;  4NFN A;  2GNI A;  3LJ2 A;  4QMV A;  4D4S A;  4FT9 A;  5JFW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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