4O4CA

Crystal structure of an inositol hexakisphosphate kinase apo-ehip6ka
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
HPDGQYLLKPCLSHRERDFYLHIKDDKEWTGTGIIPKFYGVELHEFGFGELEFIRMENLMYKYKRPFVLDLKIGTQTWDPETASSKMKKRLVVDSTSTTTSLGVRFSGMERNIGEEKPILYSRYLCTHEVNTRDSLKEYIKLFFNDGKKYRKELVPYFISQLDKMIEVMKKREYKMFSSSVLFVYDSTTTLEDKKYNCKMIDFAHNWILSEEECTVEDGFLFGLNNLKSILEDIENEFKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Inositol hexakisphosphate kinase
publication title IP6K structure and the molecular determinants of catalytic specificity in an inositol phosphate kinase family.
pubmed doi rcsb
source organism Entamoeba histolytica
total genus 78
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.4.21: Inositol-hexakisphosphate kinase.
pdb deposition date 2013-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 4o4cA00
1TZDA 1W2FA 4O4EA 4O4DA 4O4CA 1W2CA 4O4BB 2IEWA 4FRFA 2A98A 2AQXA 4O4FA 1W2DA 2IF8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VUWA 2YIYA 1DI8A 5M4UA 1OIRA 1OL6A 3R7IA 3MB7A 3RZBA 3OXIA 3HDNA 4RWLA 1CM8A 5AR5A 3HMMA 3PPJA 4QMSA 3O8TA 4ITHA 3PYYA 2F7XE 2WOUA 4QP2A 2RFNA 5M53A 4QMNA 4HNFA 2ITTA 2PWLA 5E8VA 5BPYA 3ZSHA 2W06A 2QKRA 2W99B 3OHTA 4JVGA 4M68A 4BKJA 4BCOA 2VNYA 4MQ1A 4DH3A 4E26A 2VTIA 1SMHA 1YXVA 2PVNA 4IM0A 4J95A 3S95A 4F0IA 4KRCA 4MYGA 5CU0A 2CHLA 4R6VA 4YC8A 4OTPA 4GJ2A 5IZFA 4O0UA 1OUYA 3PXQA 2BRBA 4MWIA 4QNAA 3W18A 3W1FA 5CF6A 3JYAA 2FGIA 4K33A 2ACXA 4EC8A 2VN9A 1WFCA 1YOMA 3LFAA 3KULA 4O0XA 3DS6A 4DEBA 4AGUA 5K5NA 2C3LA 2O8YA 3SXFA 3ZTXA 5DEYA 5GJFA 3FLYA 2VV9A 3HECA 4R1YA 4RQKA 4L52A 5AP2A 3GCSA 3O71A 3IO7A 2R3FA 4GUEA 4BCGA 5L8LA 4RIWA 3VUDA 4DG2E 5AA9A 4G16A 4D58A 2JBPA 1GIHA 1W2FA 2ETRA 2J51A 3G6GA 4EOKA 3A61A 3O96A 2O0UA 3QKMA 2XH5A 3I1AA 4O6LA 3WZDA 5CAOA 4YJVA 3U51A 2QONA 3QHWA 5TE0A 2OIBA 4J71A 3ULZA 4AA0A 5HTBA 4W4VA 5EYDA 4NU1A 3AQVA 1XKKA 4QTEA 4UX9A 2VTSA 1H1PA 3PXZA 3NGAA 4GT5A 3G90X 2C6EA 1UU3A 2B9JA 4I4FA 4BZOA 4O0SA 4EQCA 1HCKA 2R0IA 4IZAA 4S32A 4QPAA 5TF9A 5KZ0A 5ANIA 5IF1A 2IVSA 1ZARA 3KK8A 4CXAA 2NPQA 3G6HA 4J52A 1OKZA 1XH9A 4OT5A 2QD9A 3C4WA 4DLJA 2WZJA 3BWJA 5IUHA 3COHA 2QNJA 1GIIA 4MWHA 4TWNA 4BI0A 4NSTA 4KRDA 1O6YA 2EXCX 3EQDA 3F3UA 5ETIA 3I0QA 3V5TA 4RWJA 4TPTA 3DGKA 5K4IA 3U6JA 2WAJA 5IISA 5BVWA 3EMGA 3DFAA 3T3UA 1FGKA 1Q4LA 3DU8A 2G2HA 5HEZA 3PTGA 4KNBA 3ULIA 4CQGA 1R1WA 3MPMA 2XIXA 2WIPA 1OM1A 3LFSA 1H26A 4EK6A 5H3QA 1WBSA 4I94A 4A4XA 4ALWA 1R0EA 2REIA 3EN5A 4A9RA 3QQGA 2QG5A 4C4EA 2C0TA 3ZDIA 3D5VA 3FLZA 4GS6A 1PMVA 2Z60A 3UG1A 1W0XC 3PXRA 4MBJA 3W2RA 4EEVA 3HUBA 2YABA 3L9LA 4ZAUA 4IWQA 5CXZA 2XNPA 4XMOA 5HE2A 4GG7A 4F63A 2E2BA 2FUMA 2VD5A 3FV8A 3MH0A 5E8XA 4D4SA 1Q8TA 5HCYA 4GIIA 3UOHA 1H1SA 3DAJA 4A9SA 1T46A 4F7JA 4UBAA 4ZS0A 2IF8A 4PMMA 5HIEA 5C26A 3LLTA 2YZAA 3KF4A 4CMTA 3V04A 5JN2A 3E87A 3V5JA 2YM5A 5FP6A 3F3WA 4JQ7A 4QP8A 2QO9A 5EDRA 3B2TA 2E9NA 1I44A 2VTHA 2B52A 3QCQA 2C30A 3DBFA 4O91A 2QQ7A 2YCFA 4R7IA 2C3KA 5HICA 2V7OA 3F6XA 5C8NA 3ZYAA 5AAGA 2YIQA 1VZOA 2HY81 3PWDA 4QD6A 3NWWA 1EH4A 4I21A 4PPAA 3OCBA 3C51A 5HI2A 3UMXA 1YI6A 1LPUA 4C4GA 5JFSA 2VTNA 3GC9A 4GV1A 1ZMUA 2PMLX 3GGFA 2HW7A 3MY0A 4YLKA 4BDGA 3DBDA 4AGCA 2FSOX 4JG8A 4E93A 3DAEA 2CN8A 3RMFA 4YJNA 1QPJA 2JLDA 5JH6A 1ZYCA 2Z7SA 4HOKA 3U6HA 3SV0A 2XK6A 2VWZA 4LL5A 2QOBA 5CEOA 3LXNA 3QD2B 3COKA 5HU3A 4CYJA 4K9YA 3BU5A 3TUBA 3Q52A 1ZZ2A 4BDIA 3JUHA 3UQFA 1TQPA 4ZLOA 3U9NA 4XH6A 3TKUA 4PP7A 2XK7A 4ASZA 3G51A 2PZ5A 2OWBA 4MBIA 2WEVA 3NLBA 3QFVA 4OW8A 1JSTA 1YWRA 2QHNA 4F0FA 4TRLA 3ODZX 4MKCA 2Z7QA 3A7GA 3R7EA 4C4HA 2ITZA 4FUYA 4G6OA 2E9VA 3W32A 1CKJA 2QOOA 3CJFA 3EQPA 4TYHA 5D9HA 2OXDA 3DJ6A 4RIYB 1BL6A 1ZY4A 2G01A 3RI1A 4DC2A 3VWAA 4GVAA 4WRGA 2BTRA 5H8EA 2JITA 3CXWA 2B54A 4FEQA 4RG0A 1OIUA 4U8ZA 3VQUA 4NIFB 3PP0A 3R71A 3R9DA 4YJPA 2JDOA 3R1YA 3PJ3A 3QD4A 4I93A 1V0OA 3EN4A 1V0BA 1Q62A 4AN9A 1DS5A 2VX1A 2Y0AA 5ANOA 5JEBA 4NM0A 3GP0A 3ZS5A 3QYZA 1ZOHA 3FQHA 4IX6A 4A9YA 3OXZA 4V05A 4A4LA 1RDQE 5ANEA 4W9XA 3LE6A 4PMSA 1H0WA 4RJ8A 3MFRA 4Y85A 1YHVA 5EYMA 4I0TA 3HDMA 4BDCA 2QKWB 4FV0A 1RJBA 2YAKA 5HG7A 3AOXA 2VWWA 3KMMA 5KMMA 4J97A 4DBNA 3NUXA 1SVEA 4GG5A 4KKEA 2JIVA 3R9NA 4XS2A 2BKZA 3LFCA 3NUSA 3VUIA 3SOAA 2BDWA 4TXCA 3LVPA 3PIZA 4YGAA 3TIYA 1ZOGA 4YC6A 4AN3A 3DK3A 1Z5MA 3C0HA 5B7VA 2X8EA 4R3RA 3V5LA 3WOWA 4EOSA 2JAMA 3P9JA 4WA9A 1JKSA 5L2QA 2PHKA 4H39A 3VUTA 4AOIA 2UVYA 4NKSA 4PF4A 2Y8OA 5G6VA 3PJCA 4FKLA 5EOLA 5HCXA 3UE4A 2OXYA 4G5PA 3TIZA 3DLSA 2F7EE 3DCVA 4FOCA 3IONA 2CGVA 5KNJA 4UXQA 3MTFA 2OFVA 3FPMA 1UWHA 4U81A 4RGJA 4CFXA 2QURA 4D0WA 2UZDA 3OBGA 3FSKA 2GPHA 4MF0A 5KCVA 5IEVA 1Q99A 4YPDA 2ETMA 3BX5A 3FDNA 5FXSA 4ACHA 3I5NA 5E92A 2X8IA 1P14A 4A9UA 3TUDA 5KMIA 4BZDA 2XM8A 3RK5A 3QC9A 2WOTA 3D7TA 1YVJA 2O65A 3MFUA 2XF0A 4DEEA 3BBTB 3ZU7A 2VRXA 5AP0A 4BHZA 3SRVB 3TNHA 3NYOA 3L1SA 2ZB1A 2PZYA 4ZLYA 3QKKA 3PIYA 4CKIA 3PJ2A 3ZFXA 4M15A 5DA3A 4HW7A 2VZ6A 2VTQA 4UN0C 4TN6A 5FP5A 4IVDA 5BVEA 3IW7A 4C57A 4RFMA 3GI3A 3KRRA 3ZRLA 1M17A 2XRUA 3G9LX 2XNEA 3CCNA 4FIIA 4AFEA 5HORA 4C4IA 4AZEA 3TV4A 5JFWA 1PXJA 4HJOA 2ZYBA 3PSBA 4QMUA 4D4RA 4WUNA 4E5AX 4GRBA 3R01A 3JVRA 4ZK5A 4EH2A 4P2KA 2DQ7X 4RA4A 4BL1A 2CLXA 3CGFA 1SYKA 4HCVA 4HPUE 3ZHPC 3RAIA 4L44A 1B38A 3CQEA 4KWPA 3MGYA 1DM2A 5IA1A 2YHVA 3DFCB 5JMSA 4BC6A 4IDTA 5AAFA 4IC7A 3D5WA 4KKGA 4XEYA 3ZXTA 4TTHB 1M2RA 3DQWA 4A06A 4LOOA 4E7WA 4NCTA 2JKOA 3LFQA 4IADA 4UEUA 2A2AA 4BWXA 2XRWA 3FYKX 3I7CA 3VS6A 3OOGA 4ACGA 4XG2A 3GEQA 3QZIA 4L3JA 2X2KA 4R7HA 4HGEA 4OAVB 2XK8A 4USEA 4NTSA 4AG8A 2BZJA 3OEZA 1PXKA 3HA6A 4GYIA 5LXMA 3VRZA 2GFSA 2IN6A 3ORNA 3F69A 4FKOA 5KX8A 2QCSA 4TZRA 4M8TA 5AX3A 2BDJA 3PA5A 3QQJA 4OTRA 5IU2A 4RX7A 4I5PA 1R0PA 4E4NA 4DFZE 3IKAA 3LM0A 2XNGA 5J5SA 1BI7A 2AQXA 2I6LA 3I79A 3MW1A 4FBXA 4EH3A 4IACA 3SXRA 3HMIA 4IAZA 3L8VA 4OR5A 3OVVA 2WHBA 2Y6OA 4KKHA 3ZZWA 1QL6A 4CV9A 5EH0A 2Z8CA 4EWQA 3VS2A 3BYVA 5HTCA 3FMLA 2VWIA 5DN3A 2WQBA 2W1IA 4O4FA 3V8WA 1ZMVA 4QMPA 4RJ4A 5E8WA 4XG7A 4JJRA 5HG9A 3OUKA 5D41A 2WU6A 3MY5A 1K2PA 5CT0A 3HV6A 4FTMA 2EWAA 4LMUA 4Y73A 4AACA 3VC4A 5ETCA 2ITXA 4NH1A 2J0MB 2XS0A 3L8XA 1QMZA 4R5YA 3FY0A 4IVAA 2CJMA 2QOLA 3V6RA 3O50A 5KHXA 4MVFA 4OTDA 5K9IA 3CEKA 3FXXA 4PX6A 2YERA 5AAEA 4FSNA 4TW9A 3EH9A 3AMYA 1WMKA 3IW5A 4NM5A 1WBOA 3FI3A 4BDBA 3P23A 5J8IA 2YN8A 3UVPA 4EYMA 5KUPA 1XH6A 4CFMA 4D5HA 2YM6A 4JX7A 2F7ZE 4HVGA 2XZSA 3Q9YA 2GNGA 4IWPA 5IH6A 4B8LA 4DGGA 5LVOA 3KKVA 2WXVA 3VS3A 4YTFA 5H2UA 5IMEA 4H58A 4F08A 2YITA 4H1MA 4NUSA 3SA0A 4W4WA 3A4OX 3RAHA 3UIUA 2XVDA 2AUHA 3BV3A 2OJGA 3GNIB 4RC4A 4N6YA 1Q24A 3M42A 2AC3A 1YXXA 2JKKA 3OWKA 5EI6A 2ITVA 2LGCA 5TOZA 5JQ5A 3F88A 3BZ3A 3CD8A 4KS8A 3SXSA 4D1XA 2C3JA 2PVHA 2XYUA 4AA5A 1SVHA 3OUNB 3HKOA 2GMXA 2V62A 4EUTA 1MQBA 3QGYA 2A27A 3RALA 3VF8A 2BFYA 1OPLA 4P4CA 2Y7JA 3NZ0A 1O6LA 1CDKA 4K8AA 3WF9A 5IG1A 4BI2A 1TVOA 2VTLA 4CZYB 2QOIA 3F5XA 2B4SB 2BAKA 3COMA 5HE3A 5DOSA 5EOBA 4WNMA 2VNWA 3OROA 4I6QA 4WOVA 4E6AA 2HXQA 4QQJA 4NCTC 5L2SA 2IZUA 5BVKA 4P90A 4LUDA 3ZRKA 3R7YA 4JI9A 5L2WA 4CFFA 4I6FA 3FLQA 1QPDA 4X2KA 4Y5QA 2JDSA 3TEIA 2WTDA 2CSNA 2F2CB 4IZ5A 4C4FA 3UVQA 4CZUA 4HVSA 3KGAA 3VVHA 3GBZA 3FE3A 3SQQA 5K3YA 3TACA 2UW8A 2OSCA 3HZTA 3MIYA 4QYEA 1YI3A 2EB2A 1M2QA 3DAKA 3VS4A 3RHKA 2ITYA 3NIEA 3QHRA 4JT3A 4APCA 3DKFA 4AX8A 4V04A 3UMWA 1JWHA 3MPAA 5F94A 1JAMA 5DPVA 2EU9A 2QR7A 3N51A 4M13A 5HNBA 5AEPA 2XIRA 4JBVA 3LQ5A 2BRMA 1BUHA 2YLFA 4EKKA 5EYCA 3BGPA 3F3VA 3QRUA 5AP5A 3CP9A 4NFNA 3I0OA 5F20A 4JIAA 1I09A 4UWYA 5CU4A 4FV6A 2ITWA 4MHAA 1U46A 4L8MA 4ZJJA 3NRMA 1JKLA 4XG3A 3FMMA 4UWCA 5EHLA 5ACBC 2UZBA 3VBVA 4FV2A 3DV3A 4QTBA 2BUJA 2O63A 4WRSA 3ZFMA 3A7IA 2YJRA 4KB8A 4ZTMA 1PXPA 1T45A 2RF9A 2X1NA 4FR4A 3C5UA 3ZLSA 3RPOA 5T6KA 4O2PA 4MD9E 5C27A 4E5BA 2WU7A 3SVVA 3DQXA 1YDRE 3NYNA 2B7AA 2IO6A 3KN5A 3TZ9A 4KIQA 4M0ZA 4QP7A 3C4XA 2RFDA 5DHJA 3TNWA 1NXKA 4CRLA 4IQ6A 2PVRA 2OIDA 2RFSA 4CQEA 3FZTA 2UZEA 4EH9A 3R9HA 4E73A 4MF1A 2W9FB 3WYXA 2H8HA 2CGXA 5DGZA 2BALA 1QPCA 4RSSA 5AX9A 4GFOA 4EH6A 2YACA 4FNZA 3BQCA 2G15A 3LXPA 3JXWA 1KE6A 4BIEA 5IUGA 1ZYLA 1WBTA 4LFIA 4OTWA 3FHRA 3CTJA 3QX4A 4IAFA 5F95A 3FHIA 4R5SA 2GS2A 4XP2A 3Q6WA 4ZJIA 4UMQA 2ZMCA 3FY2A 4NM3A 4GU6A 4QMZA 5D7VA 4JG6A 5JKGA 3F61A 2ERKA 1M14A 3UGCA 2W0JA 3PY0A 3W8LA 5LWMA 4OTGA 3AC2A 3O7LB 5JGBA 4U9AA 4BTJA 2OBJA 4X0MA 4M3QA 4QMMA 3UZTA 4JRVA 3ORLA 5KMOA 3U6IA 3TTJA 2ONLC 3KFAA 5FD2A 3H0YA 3RAKA 4XUFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VUW A;  2YIY A;  1DI8 A;  5M4U A;  1OIR A;  1OL6 A;  3R7I A;  3MB7 A;  3RZB A;  3OXI A;  3HDN A;  4RWL A;  1CM8 A;  5AR5 A;  3HMM A;  3PPJ A;  4QMS A;  3O8T A;  4ITH A;  3PYY A;  2F7X E;  2WOU A;  4QP2 A;  2RFN A;  5M53 A;  4QMN A;  4HNF A;  2ITT A;  2PWL A;  5E8V A;  5BPY A;  3ZSH A;  2W06 A;  2QKR A;  2W99 B;  3OHT A;  4JVG A;  4M68 A;  4BKJ A;  4BCO A;  2VNY A;  4MQ1 A;  4DH3 A;  4E26 A;  2VTI A;  1SMH A;  1YXV A;  2PVN A;  4IM0 A;  4J95 A;  3S95 A;  4F0I A;  4KRC A;  4MYG A;  5CU0 A;  2CHL A;  4R6V A;  4YC8 A;  4OTP A;  4GJ2 A;  5IZF A;  4O0U A;  1OUY A;  3PXQ A;  2BRB A;  4MWI A;  4QNA A;  3W18 A;  3W1F A;  5CF6 A;  3JYA A;  2FGI A;  4K33 A;  2ACX A;  4EC8 A;  2VN9 A;  1WFC A;  1YOM A;  3LFA A;  3KUL A;  4O0X A;  3DS6 A;  4DEB A;  4AGU A;  5K5N A;  2C3L A;  2O8Y A;  3SXF A;  3ZTX A;  5DEY A;  5GJF A;  3FLY A;  2VV9 A;  3HEC A;  4R1Y A;  4RQK A;  4L52 A;  5AP2 A;  3GCS A;  3O71 A;  3IO7 A;  2R3F A;  4GUE A;  4BCG A;  5L8L A;  4RIW A;  3VUD A;  4DG2 E;  5AA9 A;  4G16 A;  4D58 A;  2JBP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2X0O A;  1TZD A;  1W2F A;  4O4E A;  4O4D A;  4O4C A;  1W2C A;  2X0Q A;  2IEW A;  4O4B B;  4FRF A;  2A98 A;  2X0P A;  2AQX A;  4O4F A;  1W2D A;  2IF8 A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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