2OI4X

Crystal structure of human pim1 in complex with fluorinated ruthenium pyridocarbazole
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
275
structure length
275
Chain Sequence
EPLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIGGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ruthenium half-sandwich complexes as protein kinase inhibitors: derivatization of the pyridocarbazole pharmacophore ligand.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 275
sequence length 275
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-01-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2oi4X02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2oi4X01
2C69A 3OWPA 3QKLA 5FXSA 4ARKA 3RALA 2WMAA 4D5HA 2YM4A 2VTLA 4FODA 5J7HA 2W1DA 3GUBA 2PUUA 4ZTNA 3SXRA 3CBLA 4LV5A 2JKMA 3WF8A 4FEVA 1OKZA 2C3KA 3KXMA 2OICA 3ZDIA 3E93A 1P5EA 5CI7A 4G6NA 3WZDA 4EKKA 2BRGA 1GJOA 4QTDA 3CD8A 4W4XA 4O7YA 4RIXA 4PMSA 4NT4A 3MY5A 4WG5A 2Z7QA 4JS8A 3W2CA 4AZFA 1RJBA 3COIA 3I0QA 3UO4A 3ORLA 3S00A 2CGXA 4XP2A 4PTEA 1WVWA 3NEWA 3MBLA 3L9NA 5DVRA 2YCQA 2W5BA 4AE6A 2UW5A 4F9AA 4DTBA 4YJTA 3F3VA 4LOQA 2CSNA 4DFYA 5CAPA 4ZP5A 4NUSA 2B54A 1H8FA 2J50A 3AT3A 2EB3A 4IWPA 1K3AA 4FTRA 3WARA 1RDQE 2V5QA 4NFMA 4XBRA 4WBOA 4F64A 5M55A 3R1YA 1Y57A 1OIRA 3R8UA 1UNGA 3B8RA 5HGIA 2QR8A 4BBEA 5J5SA 3W10A 1OPJA 2Q83A 4X3FC 4ORKA 3HMPA 3KN6A 5LARA 2XNMA 3BLRA 2WTWA 3BYVA 3ZLSA 3VRYA 2ONLA 4DG0E 2EVAA 2Z7RA 4RFYA 1YI3A 3ZXZA 3KRJA 5EM6A 4ZSGA 2P4IA 4PP9A 4FZFB 3VBXA 3RK5A 3ELJA 4C4HA 3Q4ZA 5IUIA 4DLIA 5A4CA 3H0ZA 4HJOA 1KE6A 3F2AA 5HE2A 4DLJA 4B6LA 4G3GA 5CU0A 4JG6A 4PRJA 4GCJA 1XH7A 3WBLA 4BKZA 5E8ZA 5TF9A 1NA7A 5JMSA 1PHKA 4W9WA 4DGMA 4IQ6A 3MV5A 4USDA 3VN9A 4ZZOA 3E64A 5DA3A 3N4VA 3QCXA 3VAPA 4FNXA 4AACA 2CNQA 5C8NA 3QQHA 3ZZEA 2UZUE 5ACKA 2BR1A 4OTRA 3JXWA 4AA4A 2HENA 5F94A 2YCFA 3CC6A 4UV0A 3DK6A 3OG7A 5A4EA 4NFNA 5KNJA 3FEGA 3VVHA 4AT4A 3SG8A 4U41A 3LXPA 3QWKA 5AA8A 5CEOA 3L1SA 2EB2A 3TIZA 2HXQA 3WI6A 3LM5A 2FH9A 4ZSEA 3V5LA 4I20A 4MD9E 4CFVA 4QMTA 1HCKA 1R0PA 2EXMA 3UGCA 3R8VA 1T46A 4ZLZA 2FSLX 5FXRA 1GAGA 2JFLA 3DBEA 5HBJA 3Q60A 1Q8YA 5DEYA 5IQIA 1WBWA 3IG7A 2VO3A 1F5QA 2H6DA 4AZWA 5A4TA 4RMZA 3TV4A 3BWJA 4O2PA 3R2BA 3LPBA 4N4SA 1IEPA 2PUPA 2JDSA 2Y6MA 4QYEA 4OR5A 1VYZA 3G5DA 3TCPA 1KWPA 2R9SA 4RJ7A 3ZSHA 4KRDA 4WD5A 5KMKA 3E3BX 2GPHA 4N0SA 3PVGA 3PXZA 4OT6A 5KMIA 2WIHA 3A62A 3I79A 4FMQA 1MQ4A 3PA3A 3D2IA 4BIBA 2VAGA 4G34A 3LFBA 3QKKA 4XRLA 3BHUA 3BYOA 5ACBC 3I1AA 4IFGA 3NS9A 4CYJA 4C2VA 3ZONA 2HOGA 5HO6A 2XYUA 1L8TA 1PMNA 3VC4A 3DBDA 3QD0A 4F9BA 2XP2A 4XS2A 3MYGA 4HYSA 4O91A 5AUUA 4CGAA 4D4YA 4TWNA 3DDPA 3VUMA 2OF4A 2VTQA 1PJKA 1GIJA 4EH8A 2YABA 2QHMA 2NNWB 4DN5A 3QC9A 3H9RA 4R1VA 1DAYA 2FSOX 2IZUA 4FKJA 5BQ0A 4WKQA 5AR5A 2YITA 4TL0A 2B9JA 3D7ZA 3PJ8A 3EZVA 5CEQA 4CLJA 4TRLA 4DT8A 3DZQA 5KMMA 2Y4IC 3KCKA 3LE6A 2PHKA 4ITHA 1I44A 4RZVA 5GNKA 4QRCA 1YHWA 4ZLOA 3O96A 5JQ5A 2YZAA 5HLNA 4L3JA 5CEPA 2YDKA 3VNTA 3U6JA 1R3CA 4ALUA 3DJ7A 2FSMX 3T9TA 4BL1A 4RIXB 5KO1A 3EFWA 4TYIA 5JKGA 4G6LA 3R1QA 5HCZA 5L2SA 3LXKA 5T3QA 3VUGA 3O2MA 4BCNA 2X9FA 2C47A 4GIIA 2RGPA 1REKA 4FSMA 3BEGA 4M12A 1WBTA 4C36A 1GIHA 2OU7A 4QTEA 3NPCA 3R9DA 2G2IA 3MB7A 1W7HA 3I4BA 3ZH8A 3EQIA 4FL2A 3VQUA 4R3PA 4YJOA 4RX7A 5IEXA 3P78A 2WHBA 4PQNA 2FB8A 3K3IA 3FZ1A 3ZO3A 1YXSA 3GI3A 3MPTA 4IAZA 2X2LA 3EYHA 4F0GA 4RJ6A 3W2OA 2GS7A 4C58A 4ZTHA 4X3FA 1KSWA 2WMVA 2XNNA 3F3WA 2QG7A 4XUFA 2OJ9A 1UU9A 2EU9A 2VTNA 3GGFA 4PL3A 4L7SA 4E93A 1STCE 4L43A 3D5XA 4PDOA 4XX9A 4F1TA 4W4WA 3KMUA 4EHGA 3DT1A 4TWOA 2NRYA 4YZMA 4ANOA 5TKDA 3RCDA 3HP5A 3MDYA 3Q4TA 3GCUA 5CQWA 4EORA 4MTAA 5A6NA 4CSVA 3VUDA 5HLPA 1W84A 4K11A 4MEDA 5DN3A 3MESA 4MX9A 3V6SA 2XRWA 3LMHA 3LIJA 4IVAA 3VBVA 4BDGA 4A9YA 3MWUA 4XEYA 4ZTRA 3DOGA 3TL8A 2IO6A 4IX5A 4O27B 2IZTA 5HX8A 3UPXA 3JPVA 3MTLA 4CTCA 4ERWA 5A46A 2OXDA 2VWBA 5AUTA 2OK1A 4QPAA 3C1XA 1FGIA 4P5QA 2Z02A 3Q4UA 4W8DA 2O65A 2PMLX 2OJFE 2VTRA 3FI8A 3MS9A 1M7NA 3DBCA 3LJ0A 2OWBA 2V55A 5C9CA 3C4FA 4IDTA 4D4SA 1P4FA 2GNIA 1YHSA 4CVAA 2GCDA 4GYIA 4WRGA 4DEIA 3QFVA 4FT3A 3DXQA 5EI8A 4RVTA 3QUEA 2PMOX 3Q32A 3UJGA 1H01A 4MQ2A 5L8LA 4EJ7A 4FV7A 1PW2A 5CQUA 4MF0A 5CALA 4WBBB 4BTFA 2ZDUA 4KSPA 3NAYA 4CEGA 5M06A 4FIHA 2XIKA 2YEXA 3GP0A 2LGCA 3FL5A 3FMNA 3BV3A 3EQCA 4C4IA 3DB8A 3I7BA 4EQUA 5KX8A 2HZNA 5CY3A 4BDAA 1F0QA 3OWJA 4XP3A 3W2PA 4YZ9A 5AV3A 2QLQA 4AGCA 4D2TA 3B8QA 5HTCA 3QRKA 3FXWA 4C2WA 1XKKA 4O0WA 2DQ7X 3HDMA 4BCJA 1H1WA 4FA2A 2R0UA 4JDHA 4R1YA 5EI6A 5K5XA 1Y91A 3R00A 3R30A 3LFEA 3HDNA 3LQ3A 4F7SA 3NVKI 3UODA 5IA5A 3NRMA 3PLAE 5AV2A 5LCJA 3RP9A 1OB3A 2KTYA 3E8EA 4M69A 3ZUVA 4CYIA 3NLBA 2WQEA 4B8LA 5CAUA 4NYEA 5M53A 3Q3BA 4GMYA 2HYYA 4GT5A 5D41A 4BCGA 2XBJA 3BGZA 3UPZA 2YJSA 4UWBA 4FIFA 4TYEA 3ZUUA 4KKGA 4EH3A 2LAVA 3O51A 2ZMCA 2YAKA 5J1WA 3GENA 4TY1A 5A4LA 1WBVA 4DGGA 4O6LA 5CASA 4JX3A 3M1SA 2C0TA 3ZBFA 3P4KA 4FTIA 3RPOA 3AMAA 2ZM3A 3JS2A 1ZRZA 3NDMA 2ZYBA 4KBKA 3THBA 3GVUA 4GL9A 4AAAA 4BDIA 2IVUA 2QO7A 2WQMA 3ORNA 2JKKA 1J7IA 2ERZE 3NUSA 3AGLA 3O23A 3L8PA 3KXXA 3VO3A 2B53A 3GNIB 5HBHA 3RAKA 4O7LA 1OUKA 3BLQA 4RIYA 4WNKA 3BIZA 3LLTA 2XK6A 3A4PA 4FTKA 4QP8A 2VNWA 2YIYA 3OW4A 5DR9A 4AFEA 4O0UA 3N4TA 3ORIA 1JBPE 5FTGA 1LPUA 4K9YA 3VIDA 2PZ5A 4XLIA 2GFSA 3ZLXA 4ZY5A 2HZIA 5EQEA 4U9AA 3FL4A 2OI4X 3GFWA 4I5PA 2WD1A 3D83A 5G1XA 4AU8A 4CFNA 1OBGA 1DM2A 4YHJA 4U81A 2QG5A 2UVYA 3WOWA 4GUBA 4KKHA 3WZKA 4JG8A 1MRVA 4Y5HA 2GTMA 2ZMDA 3SC1A 4O7NA 2UZLA 3MPMA 2CN5A 1Q61A 2PVKA 4I5MA 4OTWA 2WXVA 1ND4A 2GQSA 4FGRA 2UW7A 3QQJA 3OUKA 5HO7A 5M07A 3WIGA 2I0VA 1SVEA 4EC8A 4UX9A 4OT5A 4RBLA 2VTOA 4UMQA 4X2NA 1JVPP 2YCSA 4X3FB 1M7QA 4JVGA 4EYJA 1WAKA 1W0XC 4UXLA 4YSMA 5E7RA 1YQJA 5AR2A 4NJDA 4L45A 3BKBA 3RBWA 5M56A 5L6WL 5HOAA 3MH2A 3GC9A 4YO6A 3TDVA 1CSNA 1FINA 3U4UA 4FV2A 3PA5A 2ITPA 5EK7A 3OCGA 4E4LA 2PMIA 3O7LD 4O7VA 3IW4A 4ANQA 2F7EE 2X81A 4AS0A 3SD0A 2XIRA 3LVPA 3BYSA 5C01A 4A9SA 4LRMA 4EZ3A 3RPYA 5JGAA 4RQKA 5ETAA 3L9LA 4M14A 1AGWA 3DDQA 2PVJA 4IM3A 3IECA 4ZTLA 2WELA 3R9RA 4FX3A 4G3FA 2CHLA 2GS2A 3KVWA 5B7VA 4V0GA 2QCSA 4YJSA 4ACCA 3CTJA 2CKPA 3SLSA 3II5A 4FKPA 2J0LA 4DFUA 2CJMA 3BPRA 3I6UA 4O22A 3ZC6A 5AAGA 1E1XA 3QD2B 2XMYA 4IW0A 4B8MA 3HAVA 3CJFA 3IKAA 4QP4A 5BUIA 5LWNA 5EYDA 2NPQA 5F95A 2G1TA 4F99A 4MK0A 5AP7A 2GDOA 4XG9A 1AQ1A 3TNIA 3KQ7A 3QA8A 4IMYA 4CQGA 3TN8A 1OBDA 1XH4A 4W4YA 3LCSA 4R7IA 2I0EA 3Q53A 4MXOA 3QLFA 4M66A 4BDBA 3CR0A 2X9EA 4M84A 4IAKA 2F4JA 2B52A 2VO6A 3FZSA 3GU6A 1UU3A 2J7TA 3HYHA 1WBNA 3PXFA 4YPSA 2C0OA 5EDPA 5IH6A 4LMUA 3SRVA 5KHWA 5IQCA 4CMOA 4DYMA 3QC4A 4CLIA 2WMTA 4RC4A 4DBXA 4M13A 4RIOA 2P2IA 3KEXA 4R8QA 3VUHA 3DV3A 2XEZA 4M69B 5H8EA 3PY3A 4UB7A 2XNEA 4JBQA 2FGIA 5AR3A 3V3VA 1H08A 4R3RA 1PXKA 5CSXA 4C8BA 1K9AA 2XK9A 3FBVA 4PPBA 3BWFA 2YM3A 3TM0A 1B38A 3LQ5A 4PNIA 4JJRA 4BHZA 1KOAA 3I7CA 2XBAA 2OXYA 3GQLA 4XOZA 3FJQE 5I9WA 2UW0A 4ZJIA 2IW8A 3G0FA 3FPQA 5KBQA 5IEYA 4O0VA 4IADA 5CI6A 4IWDA 2P3GX 1JKTA 4DGNA 5IF1A 4NM0A 3RMFA 4I22A 4MNFA 3QKMA 5HI2A 3MIAA 5L8JA 3NMUF 3FZRA 2WOUA 4O96A 4AQCA 3U55A 5HICA 2R3HA 3SOCA 1XHAA 3ETAA 2UW6A 3AMYA 3EQGA 3F5GA 4RIYB 3GC8A 4ZIMA 4OBPA 5K0XA 2ZM4A 3G6GA 4EJNA 4MWHA 1XJDA 3VUIA 4FTCA 3UTOA 3SDJA 3EHAA 3OXZA 4LRKA 2C6IA 4AOJA 3R01A 4O38A 4DEBA 3PWYA 4AFJA 5JSMA 3G6HA 4QO9A 5EM7A 3TNWA 2R64A 4A06A 4DH5A 5KKRB 5GZAA 4G17A 4XG4A 4QMMA 3KK8A 4FYNA 5DG5A 4K1BA 5DYJA 3TDWA 3QXPA 4YO4A 2EUFB 4FF8A 3C4XA 4X2KA 5M4UA 1G3NA 4MYGA 3S1HA 3RCJA 4QTAA 2PULA 3GU4A 4HGTA 1Y8GA 1X8BA 3NUUA 4JL9A 3QBNA 1PF8A 4P5ZA 5HU3A 2ITYA 2PMNX 1O9UA 2W1FA 1FOTA 3OHTA 3ORTA 2OIDA 4YNOA 4HYIA 1RW8A 1ZMVA 3PSCA 3PP1A 4O84A 5AFVA 5IMEA 1YI6A 2FO0A 2ITXA 2OH0E 5HCXA 4G5PA 3NUNA 2WZJA 5B2MA 4L9IA 4NZWB 3VRZA 4FT5A 2BILB 4L52A 3TNQB 4BGGA 5E8UA 3E5AA 2ZM1A 2PYWA 2VTMA 3LFNA 1H07A 2ITOA 3RM7A 4CXAA 3MVHA 4HVSA 3A99A 4FSRA 4FK6A 1ZARA 2RF9A 1QCFA 2ZJWA 3P7AA 4MH7A 3IS5A 3ZDUA 1SVGA 1QPJA 2J0JA 5AAEA 2OZAA 5BVKA 4O21A 2PVYA 5I9XA 3JY9A 1WVYA 3ZSIA 4F63A 1IAHA 5BYZA 5KMNA 3CIKA 4FVQA 3BQRA 5I5ZA 3D14A 2PUNA 2ONLC 1FVRA 1LEWA 2BFYA 1OPLA 2UZBA 3HEGA 2PK9A 2XA4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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