3DOGA

Structure of thr 160 phosphorylated cdk2/cyclin a in complex with the inhibitor n-&-n1
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
299
structure length
297
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title N-&-N, a new class of cell death-inducing kinase inhibitors derived from the purine roscovitine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
molecule tags Transferase, cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 297
sequence length 299
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dogA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dogA01
3BGZA 3NMUF 1UWHA 1BMKA 4HPUE 3NUPA 4QP7A 3IW7A 5JMSA 5CZHA 2IW6A 2QNJA 2NNWB 4IMYA 2QR8A 3DOGA 4XJ0A 5I3OA 2ITNA 4GIHA 4CD0A 2BHHA 3PPZA 2F9GA 3RBWA 2XK4A 4IWDA 3FC1X 1KSWA 2C4GA 3DAKA 4XG2A 3NAYA 1UU3A 2G15A 2QOOA 2OXYA 3NPCA 5KKRC 3EN7A 4DT9A 4LGDA 3MVJA 3O8TA 3W55A 5HG5A 1U5RA 3N4TA 1MRUA 1STCE 3R21A 3F5XA 4FGBA 4YJOA 4ANSA 3QQJA 4IVBA 2Q0NA 2F4JA 4WOVA 4J71A 5HTBA 3HMMA 1AGWA 3ROCA 1Q3DA 4RX7A 1YI6A 3EL7A 1URCA 2R3RA 5D41A 4H3PA 1XO2B 1JNKA 5ANJA 4BCNA 3ZS5A 1U46A 2CGVA 4S2ZA 4FV9A 4YJVA 2PUUA 4APCA 3AC8A 4EOLA 2GCDA 3GCPA 1UNLA 1GZNA 1W98A 4G5JA 4APPA 2I0VA 5HD7A 4G2FA 3TV7A 5AV1A 5I4NA 2VTOA 4QOXA 4L52A 4LRMA 1MUOA 2WAJA 3MWUA 3ZUTA 1DAYA 4FUXA 3EQRA 3GVUA 4Y95A 4X2KA 4N70A 4YHTA 3R7YA 3MJ2A 1YOJA 4FYOA 4IDTA 4AE6A 3LKMA 3WE4A 4L67A 3R8VA 3VS6A 4QO9A 4ACHA 4FTJA 3LW0A 3AT2A 3ZEWA 4B4LA 5CAQA 4D2TA 5A3XA 5T3QA 1BLXA 4FKVA 3AXWA 4KKEA 3MFUA 3RALA 4O2ZA 5JH6A 5AUYA 4RVTA 4Z16A 2WHBA 3OHTA 3ODYX 4ZTNA 3KULA 4BDBA 4FSTA 4RJ3A 2FGIA 3LFAA 3OOGA 5HG7A 3JS2A 5EYKA 2CGXA 4HYIA 3OP5A 2VTJA 3QX2A 2VO7A 4QP1A 3R8PA 3JY0A 3ACJA 2V5QA 4YC8A 5CXZA 4F70A 2C0OA 1SVHA 3H4JA 4WD5A 4FIEA 2CKOA 3OT3A 1OECA 1G8SA 1XQZA 3H10A 4WNOA 5M56A 4YC6A 3QXOA 3AT3A 4AGUA 5DT4A 3ZC5A 4G3GA 5LMAA 3O51A 1H4LA 4PQNA 4TL0A 4ASXA 3CR0A 4ITIA 3F3ZA 5EQPA 4TW9A 2R3LA 4FBXA 4EYJA 4O83A 3EQGA 3RK5A 3R63A 4O0SA 3AMBA 2C5VA 3QTUA 3LCOA 4EOKA 3KA0A 4M0YA 2JDSA 3U9NA 5KHWA 3KXXA 3A8WA 4XH6A 1PYXA 3BYVA 5IA5A 5GJDA 2FA2A 3RZFA 3U6HA 4LFIA 1APME 3TN8A 4CTCA 4ORKA 1OUYA 2UZBA 3NUSA 3C50A 3LFDA 1XBCA 4GEOA 4DGLC 5DH3A 4FI1A 2IO6A 4OR5A 2PMOX 4RC3A 2PE1A 4QP6A 3WZEA 2PSQA 2GNHA 2OG8A 4M69A 4RJ7A 5EYDA 2WTJA 3LFSA 5LMKC 4NUSA 3WIGA 3EKKA 2XBJA 3QCQA 5LVNA 4C38A 3CY2A 2UVXA 2YJRA 2GTMA 3LJ0A 2EB3A 2GFSA 2WMWA 3NX8A 3OG7A 4A4LA 4YGAA 4PX6A 1Y6AA 1GZKA 3SQQA 1IEPA 2JDTA 4GSBA 1M2PA 2OSCA 3F5GA 2XH5A 4BTJA 1NXKA 3E8CA 1NVRA 3UVPA 3SOCA 3R8LA 5IEVA 5TT7A 4I4FA 4OTIA 1OKZA 3W33A 5BUIA 3PVGA 3GU5A 2W06A 2VO6A 3E5AA 3BE2A 3M42A 3AC1A 2FSMX 3PXFA 1YOMA 5ICPA 3EN6A 3KXGA 4RJ4A 3E8EA 4G3EA 1OKVA 2YM5A 2JKOA 4FKTA 4H36A 3COHA 1AQ1A 4IM0A 3WILA 4F7JA 4V05A 2J6MA 2QG5A 5AX3A 4BL1A 2JITA 3UTOA 4D2VA 5LVOA 4C57A 2VTQA 1Y91A 2XKDA 3PPJA 4FTCA 3VHEA 3Q04A 3V5QA 3QUDA 4B9DA 3WF8A 3OXTA 3MPAA 4C3PA 4R7BA 4XV1A 2OXDA 3DKFA 5HVJA 1BUHA 5IG1A 1ZZLA 1LEWA 3LHJA 5KUPA 4MD7E 3VUTA 2XBAA 4F7SA 5HVKA 4KS8A 1P4OA 4I92A 1ATPE 2A1AB 5K5XA 5IQGA 2R3KA 4E5BA 3F88A 5ANIA 4IX3A 3PIXA 4IVCA 4D2PA 1G3NA 2UW4A 2VTAA 4FKLA 3PLAE 2UVZA 1U54A 2XRWA 4M0ZA 4ANNA 1WVYA 3DB8A 2OLCA 3GBZA 3KCKA 3CIKA 3O17A 3P7BA 4WG3A 1MRVA 3AMYA 4EH5A 1U4DA 2BZIB 3R6XA 1M17A 3E7OA 4U3ZA 3RM6A 4XG8A 2JDRA 3QRKA 5CAUA 3ID6C 3NAXA 4DBNA 3VS3A 3EQFA 4N6ZA 4QMLA 3MV5A 4UMRA 3H9OA 4CV8A 1WVXA 4M67A 3R2BA 4GK4A 5HBEA 4DEBA 1KV2A 1R0EA 2R3OA 4E3CA 5HKMA 3TUBA 2ZB0A 2HXQA 2YFXA 4KKHA 2BFYA 4D4VA 2R64A 2J0KA 2VX0A 1O6YA 4O81A 5E90A 3HMOA 5F4NA 4ASZA 2CNVA 1WCCA 5FQDC 2UW3A 1KOBA 1YWNA 3LPBA 4LL0A 4NFNA 3GC9A 3HV4A 4ZP5A 5AV3A 4BI0A 5AR8A 3IONA 2JKQA 5CNNA 2JFMA 4Q9SA 4UYNA 3FSKA 4EYMA 2BRNA 3AT4A 3IGGA 3D2IA 3BCEA 5HHWA 4JIAA 3KMMA 5B2LA 1HOWA 3QWJA 3MA3A 5EOBA 4TYJA 2XMYA 3KVXA 5KO1A 2W1GA 1ZOGA 2X0GA 4RSSA 3HP5A 3UMXA 4DFXE 4JS8A 3F3UA 3D5VA 2OF2A 5IKWA 3PP0A 4USEA 3TNHA 5CAVA 4MX9A 4H39A 2XIRA 2BZJA 1QL6A 3UOKA 3QZHA 3UOLA 2CKEA 1NVSA 3ZBFA 2WQBA 2F2CB 3UO6A 1PMEA 2O2UA 5I9VA 2B4SB 4YJNA 4IHPA 4ZSGA 3BIZA 5EW3A 3NUXA 3REPA 4CLIA 4MWHA 4RJ6A 3DLZA 3EIDA 3VHKA 4I5PA 4XBUA 4ANLA 4W4XA 3L9NA 3U6JA 5HI2A 2WQNA 3QHWA 4BDIA 4BCHA 3FY0A 3VVHA 3KF4A 4EQCA 3M11A 4J52A 3NNXA 5GZ9A 4FTIA 3BHUA 4RGJA 3G15A 2WTWA 4I6BA 1PXNA 4F6UA 3BYUA 2QOFA 3FHRA 4TRLA 3V5WA 4DH3A 1IA8A 4BI2A 5M08A 3V51A 5DRBA 1PXIA 3G5DA 3HUBA 4QMYA 4U7ZA 3R00A 2WU7A 2PWLA 2FSOX 4KABA 4MH7A 2XCKA 4OLIA 3DFAA 4TYIA 5HESA 4ZEGA 3UP2A 2VRXA 3DNDA 3GFEA 3OUNB 5DG5A 4BDJA 2C68A 3OXIA 2X81A 4FTQA 4I6QA 2YDJA 4JRNA 4EWHA 2PPQA 3D5XA 4ZAUA 4KKGA 4PL5A 4NCTC 3R01A 3VNTA 3A7FA 4ZS0A 4JQ8A 2P3GX 2J5FA 3Q9XA 4JNWA 4ONAA 2X1NA 3HX4A 4XV2A 3FDNA 5LMKA 2PMNX 4C61A 3W2PA 5I9WA 4U3YA 2B9JA 2XB7A 5FRIA 3KVWA 3FLNC 4WO5A 4WNKA 3UDBA 1QPDA 4D9UA 1BL7A 1SVGA 2PVRA 2W7XA 2ESMA 3H30A 5ETCA 3QL8A 4RBLA 3PDTA 4JG8A 5G6VA 5C9CA 3FKLA 5HG9A 3B2TA 2C0IA 2W96B 1YQJA 3A60A 1JBPE 3E88A 4QTDA 3L9MA 3MY1A 4AW1A 1I44A 2X7GA 3VS7A 3DCVA 3VUMA 4BBMA 4D0WA 2PZRA 3R0TA 4DITA 2GSFA 4BCQA 5IQCA 4AXAA 3WOWA 5IEYA 2EWAA 3AD5A 5F9EA 4BIDA 1X8BA 4RIXB 4UMQA 4UV0A 3FV8A 1ZYLA 5IQHA 4FSYA 4L3PA 5AAFA 4XP2A 3EQPA 2IW9A 3TACA 4EUUA 5HE0A 2YDIA 3R22A 3ZOSA 1CKIA 1P5EA 2XYUA 4YUQA 3KFAA 3QTQA 4HVDA 2XNOA 1JPAA 3F66A 5BNJA 5JFSA 3ZEPA 4BYJA 2YM4A 4CVAA 1FQ1B 3GOPA 3L8XA 3VUKA 3Q9YA 3EB0A 5D12A 4NKAA 5CEIA 3VF9A 4L8MA 4OBQA 5E92A 2QQ7A 3UOJA 2QURA 1PKGA 4FKSA 4IZAA 3OEFX 4O0XA 5C8KA 3ETAA 3L1SA 4FSUA 3KGAA 3PXZA 4HJOA 4WIHA 5EK7A 3CTQA 3ZFYA 2CGWA 2ACXA 2EXMA 2JEDA 3I81A 3G0FA 5E8UA 4PMTA 4UY9A 1YHSA 3FXZA 3GNIB 1JSVA 4PL3A 4I23A 5IU2A 5EM8A 4FV6A 3ZXZA 1Q4LA 4FA2A 1UA2A 5DA3A 5FEEA 4HOKA 4X6RA 1JKTA 1GNGA 4FVPA 2QLUA 5CSWA 3S95A 4F9CA 4MNFA 3G0EA 5IISA 4X6QC 2GNLA 5BYYA 1YDTE 3OEZA 4PDYA 2JAMA 3A61A 2UZEA 3AC5A 3VS1A 3JYAA 3W8QA 5JEBA 3VRYA 4EI4A 3KN5A 4DA5A 2YAAA 3A7GA 3OC1A 2LGCA 2PMLX 1FGKA 4GH2A 4U45A 5TKDA 1MQBA 3PRFA 3QBNA 4YC3A 2CGUA 2GU8A 2UZVA 4BCIA 3EWHA 5CTPA 2RFNA 4I0SA 3MPMA 5A4QA 1GIHA 4QTAA 4W9WA 2WTVA 3R9NA 4B8MA 5TF9A 4R7IA 3NYXA 4ZLZA 2RG5A 1Q24A 4NIFB 3MTFA 4EH8A 4XLIA 5DLSA 4BI1A 4C35A 3NUUA 5DFPA 5L2SA 1CTPE 5GIPE 3LXNA 1HCLA 4BZOA 5JT2A 4EBVA 4UWBA 3R9DA 1QPEA 2W99B 3HMPA 2XEZA 4K8AA 5E7RA 3EQDA 3POOA 4ALWA 2UZLA 4XG9A 1IR3A 4AG8A 4LL5A 3PJCA 5LARA 3WE8A 5J95A 4FX3A 4BKJA 4FIJA 3PLSA 3FZRA 3T8OA 1H0VA 4B0GA 4FZ6A 3LLTA 2O8YA 2UW5A 4I5HA 1MRYA 4M68A 5AA9A 2OJIA 3NW7A 1TQIA 4IAZA 4NZWB 5KMIA 2JGZA 4ZTRA 3PUPA 4FZFB 3SHEA 4ZSJA 2HZ4A 3HVCA 4AA4A 3P9JA 1ZYSA 4H58A 2REIA 1MQ4A 4U5JA 2OZOA 1BI7A 3HKOA 4DYMA 3LLAA 1TKIA 2H9VA 2J7TA 4IB3A 4NIFA 2W1IA 2C0TA 1WFCA 3DKOA 3PJ8A 3R9OA 5LXMA 5A4EA 2OZAB 4F7NA 3UQGA 3PXYA 1VYWA 4EORA 4J95A 4PL4A 2B9HA 4BTKA 2R3PA 3NUNA 3FEGA 1ZYDA 4O2PA 4BCOA 3LMGA 4NCTA 2QHNA 5M57A 3RCDA 2ZMDA 3RWPA 4O21A 3GCUA 4JG6A 4Y5QA 4I3ZA 3UMWA 4W4WA 4MXOA 3DTCA 2G2IA 4AW2A 1PXMA 4EZ7A 3DBFA 2VUWA 1JLUE 2XKCA 3CQEA 4OTHA 4AS0A 4BDEA 3N51A 3DXQA 4I4EA 4CZYB 2AC3A 3QZIA 4FEUA 5H3QA 2W17A 2OF4A 5CZIA 3QU0A 3ZLSA 4DFYA 5C01A 2OGVA 4PNIA 4DFBA 3PXRA 4F9AA 4JDHA 4E8AA 1L3RE 4HYUA 4RVMA 3VF8A 2WIPA 1DM2A 3LFBA 5ITAA 3PXQA 2AYPA 2OZAA 1PXLA 4LGGA 2R7IA 4NM3A 3ZDIA 5BVDA 4ZSEA 4E7WA 3D14A 4BB4A 3CBLA 3CLYA 4FNXA 1JKKA 3RWQA 4C59A 2YERA 1ZOHA 5HO6A 4AOIA 4ITHA 2V62A 5FDPA 4F7LA 2PVKA 3HAVA 2ITPA 3PJ2A 3EQIA 4GYGA 4JBVA 4K18A 3F2AA 3RAHA 2OFUA 5DN3A 5J1VA 1HCKA 3V5JA 3ZO2A 3FKNA 4DG2E 3E3PA 4HVSA 3F82A 4K6ZA 2ITUA 2YAKA 4Y72A 3L8VA 3NNUA 3HP2A 5CX9A 5GNKA 5J9ZA 4NJDA 4PP9A 4KINA 2VTHA 3FQSA 1FVTA 2NRYA 2HW6A 3F5PA 3IOKA 1XKKA 4BYIA 2C6KA 4PDPA 5IQFA 1CKPA 5FTGA 2J5EA 2ZAZA 2EXCX 4NM7A 4WNMA 2XYNA 2CKQA 2PMIA 4BICA 4U43A 4AGDA 2BMCA 3BLQA 4CQGA 4ZTLA 3VC4A 4RC2A 1DS5A 2W4JA 1ZWSA 5FXQA 1FGIA 3P7AA 3DQWA 4TWPA 1A48A 3MYGA 4CG8A 1J1CA 3A4PA 5EI6A 2ZJWA 2P2HA 5CSXA 4GS6A 3EH9A 1J1BA 4ACDA 4A07A 5BQ0A 4OAVB 4FKUA 4O22A 4BIEA 3BPRA 5M44A 1OZ1A 4BZNA 3VBXA 4MXZA 2XM9A 2JDOA 2C6LA 4AOTA 1WBWA 5AIKA 2CDZA 4C4JA 4FKWA 5AJQA 2XIYA 4Z3VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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