3P23A

Crystal structure of the human kinase and rnase domains in complex with adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
401
structure length
386
Chain Sequence
VVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKRILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQKDFAHLGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLVPGTEGWIAPEMLSEDNPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQRQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQFFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGTLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPYYFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase, transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the Ire1 autophosphorylation complex and implications for the unfolded protein response.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
total genus 105
structure length 386
sequence length 401
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3p23A02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 3p23A03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3p23A01
4AFEA 2VTSA 1U46A 2CGWA 3PY3A 4H36A 4NH1A 2HY81 4P90A 4YO6A 3NMUF 1Q8UA 2C6TA 4QMTA 3MB7A 1PXKA 5KUPA 1ZOEA 4FNWA 2W5HA 2Y6MA 5C1QB 5I9XA 4O7VA 5HD4A 5CNNA 2W05A 3LMGA 3DNEA 4CGAA 4WG5A 5EM6A 5EW8A 5DEYA 3V5WA 4OTIA 5GINE 1ZY4A 5DT3A 4G17A 3ZEWA 3F5PA 3P1AA 5FXRA 5GJFA 2WOUA 4FL3A 5HO7A 3L9NA 2BAKA 4J53A 3IW6A 3P08A 3CTJA 4E6CA 4L3PA 3KULB 1ND4A 1H25A 1JVPP 2ZM4A 1UWHA 2YDIA 3IOKA 4IB0A 4WT6A 2GQSA 3KMMA 2WGJA 3L9MA 5AUXA 4DFBA 5A4LA 5CS6A 4RX7A 4GK2A 5CT0A 4D5HA 3VS1A 2ITXA 1CKPA 1R39A 3RK9A 4BDCA 2ITVA 4I24A 3TNWA 5HO6A 1U54A 3FKLA 3UE4A 2ERKA 2VWWA 3K54A 4ZXTA 4DITA 2PU8A 3VBYA 2F9GA 2ZDTA 4GUEA 4NWMA 1H07A 2GNGA 2XNMA 3GU5A 5AAGA 5CAOA 3GCQA 3UIBA 3CPCA 4IZ5A 2C6EA 1Q8ZA 4XYFA 4BC6A 3MB6A 3PPZA 5HLWA 4G31A 4RQKA 5ANKA 3SG9A 3CD3A 2RG6A 3FMDA 4ZY6A 3RGFA 3TUDA 3H30A 5GZAA 2UZNA 4IMYA 4D2PA 4ZSAA 5HQ0A 5LVPA 4BYIA 2C5YA 2X8EA 3R02A 4UZDA 4IFGA 1BYGA 3DB8A 4HGSA 5AEPA 3C0GA 4AX8A 4AW1A 4HVSA 4G3CA 4C3RA 2O65A 1P5EA 3NNVA 4JOAA 3TXOA 1Q41A 3WF5A 4AWIA 2R3OA 1IASA 2UW6A 5DG5A 1KV2A 5AR7A 2CLXA 5HCXA 3QQJA 3TDWA 3DBFA 1Y6AA 3MFRA 3PSCA 1M2PA 4RLKA 3UPXA 5CF5A 4FTCA 3FC2A 2HK5A 1H26A 4RJ7A 4RWLA 3TUBA 3COKA 2OH4A 4J1RA 3G90X 1NVRA 3MIAA 4PPCA 1IA9A 4FGBA 2F4JA 3Q9YA 4ZZOA 1SMHA 1YXSA 3FZSA 3KVXA 4YHFA 3SOAA 3N4UA 3MESA 3PA4A 3VJNA 4JX3A 3VAPA 3KRJA 3NNUA 1V1KA 1GAGA 3IK3A 2J0KA 2UZWE 3D5UA 4ZSGA 4M66A 3BYOA 3VW6A 3TDVA 4QYFA 2YLEA 3DAEA 3FLZA 3V5TA 4AW2A 1JOWB 3GP0A 1H00A 4LOOA 4TL0A 1YOMA 3PVGA 3LMHA 2SRCA 3V5LA 2X4ZA 5KBRA 4GK4A 5AV3A 3PDTA 1OPJA 2VD5A 5AUTA 3P5KA 4NFMA 4OTWA 3U55A 1Y57A 4G2FA 1DI8A 3EFLA 3VN9A 4YSMA 1I09A 3RWQA 4U3ZA 3FV8A 4FL2A 2XNGA 3LPBA 5FWKK 1ATPE 2W1EA 5HU9A 5J5SA 2YM4A 1LPUA 2BPMA 3E62A 3AMYA 4CSVA 4ZS0A 2QI8A 3LAUA 5F94A 1ZYCA 3S4QA 2IZRA 2I0YA 1WBTA 3BQRA 1YXTA 3EHAA 2VAGA 4JDJA 4CT2A 4D9UA 3AC3A 5HNBA 5M55A 2JDTA 1STCE 3BWJA 5IH4A 3F61A 3DXPA 2BZHB 2JAMA 4OT5A 5LJJA 3ZCLA 3U4WA 5CLPA 1HCLA 5DI1A 5K5NA 4D55A 2BILB 5FD2A 5AR8A 3OXIA 5KZ0A 4KIKA 3TZ9A 1SNXA 2OBJA 1Q8TA 3DPKA 5HIDA 4ZJIA 2WMSA 4ITIA 1V0BA 4P2KA 3SV0A 3T9TA 4TYIA 2R7BA 4O0TA 4KS7A 3EZVA 3UVQA 4RT7A 4XG7A 5L8JA 4D58A 4DEIA 1ZARA 4MAOA 4YC6A 5C26A 3BU5A 2UZBA 2YDKA 1YOLA 1WMKA 4W9XA 4RIWB 2VX0A 4ASZA 1OKZA 4YTIA 5ICPA 3HMPA 3VC4A 5LMAA 3II5A 3R1QA 2ERZE 3FLQA 2PZPA 4BTMA 2P3GX 1VYZA 3JY0A 1G3NA 4N0SA 2VGPA 4ENXA 4AUAA 3NVMB 4UBAA 2DS1A 2BKZA 5IZFA 3PWDA 3ANRA 3E3BX 2OJIA 1Y8GA 4RC2A 3CSVA 2PVRA 2QU5A 3AD6A 5EHOA 5HG8A 4LFIA 5IQHA 3D5WA 2F57A 3P9JA 4IDTA 4PDOA 5LCKA 5CEIA 5E4HA 3MPTA 4FKQA 5D7VA 2JKQA 5HBHA 4ANOA 2RSVA 3QGYA 4XRJA 1BI8A 4EHGA 3RCJA 5JEBA 2R3MA 4XG9A 4W4YA 5IA2A 1FPUA 1HOWA 5LXMA 2HXLA 3WBLA 3IW4A 2IWIA 2J9MA 3PP0A 4DFNA 3HRBA 2RIOA 3NYVA 3ZRMA 3MVJA 4ZTRA 4QMWA 5EDPA 3F88A 1FQ1B 4CFFA 3O50A 4A07A 4RG0A 5EM7A 4KWPA 4YJUA 3BHUA 2IVVA 3BKBA 5GJDA 4BRXA 1A48A 1SM2A 3EL7A 2OKRA 3ZM4A 4BL1A 5BMMA 2YIWA 5AV1A 4ZP5A 5EDRA 4IBMA 1G8SA 3BZ3A 4FV6A 2YM8A 4K11A 4MXOA 3AT4A 2UW4A 4YJOA 4XOZA 4EWQA 5KHWA 5JZJA 2OI4X 5BVDA 4XEYA 3D2KA 4LL5A 2J90A 4I5PA 2QO7A 2UW0A 4BDGA 5AA9A 4X6RA 3FMKA 2BALA 3KCFA 1ZZLA 4BDDA 5IQIA 3QTRA 2W17A 4GFMA 1H0WA 4KRDA 4I22A 2GHLA 4IW0A 4RVTA 4A06A 3EQFA 3GC7A 4R3CA 2QHNA 3WYYA 3SKCA 4YUQA 1K3AA 4JQ7A 2R5TA 3SG8A 1I44A 1M2RA 5BVFA 2UW9A 4E73A 3O0GA 4O84A 3DXNA 4F9WA 4U42A 3MY1A 4FTKA 2XM9A 4UYNA 3OW4A 3MH0A 3FI2A 4RSSA 1QPEA 4K77A 4FZ7A 4I41A 3V6RA 4IE9A 3VF8A 5J9LA 4FZ6A 3FLYA 5I5ZA 3QXOA 4A4XA 4C8BA 1K9AA 4FG7A 5EW9A 2WHBA 4JRVA 5EYKA 2VTAA 2WTWA 5DBXA 1FVTA 3QRTA 4UMRA 3OC1A 3ZDIA 5GZ8A 3R1SA 5HX8A 2BRHA 3OZ6A 2BCJA 3LM5A 2J5FA 3ET7A 4CRLA 4EI4A 4IC7A 2ITQA 1V0OA 2PVHA 2XS0A 2V7AA 4J98A 1RE8A 4BGGA 4MF0A 5K0XA 3UOJA 4KABA 3RP9A 4G6OA 2XKEA 1OPKA 1WVWA 2W5BA 2YISA 4FMQA 4WBBB 4QP7A 2UV2A 4LGHA 4MVFA 2ZJWA 1WBNA 3UO6A 4JDIA 3NCGA 4USDA 5HTIA 4KBAA 2G15A 3E7OA 5LVLA 5ACKA 3Q9ZA 3RPYA 3RK5A 3S00A 4LUEA 3NYOA 5F20A 5CU6A 4DEAA 4D1ZA 4RX8A 4EK3A 2QURA 2HW7A 2NP8A 3UG1A 4F9CA 3IOPA 5DLSA 3HAMA 1H28A 5CF4A 3PZHA 1XH7A 2W4OA 1VEBA 4E5WA 1OECA 4PMPA 2BIKB 1YI6A 5FM3A 3MTLA 1CMKE 4EH2A 1Q61A 3TG1A 4B4LA 4WNKA 5D12A 3HEGA 4CZTA 4AG8A 3TZMA 4BGQA 3A7FA 3V8SA 5BX0A 1H1PA 2JDOA 4I20A 4PDPA 5D41A 2HWOA 4BIDA 4YJPA 2GNJA 3R73A 4QYYA 4S34A 4DLJA 4NU1A 2GCDA 2W99B 3R6XA 4I4FA 3FDNA 3KQ7A 4IDVA 4ZK5A 2JIUA 4D4YA 1YOJA 5IUGA 4NK9A 4QPAA 5G6VA 3PVWA 5AR4A 3OCBA 4NTSA 3BGQA 3CD8A 4YLJA 3TJCA 3ZXZA 3OTUA 1OPLA 5H9BA 4E3CA 4CTBA 3PJCA 4DTBA 2UZTA 2CCIA 4W8EA 4FVRA 4BB4A 4QMNA 3DNDA 3KF4A 5C8MA 2JAVA 4F4PA 3OHTA 2PTKA 4C4GA 5IA4A 3U6HA 5KE0A 2BFXA 4L00A 3UYTA 1H27A 4QTBA 2OF2A 4BBFA 2OJFE 2F7ZE 1REJA 3KULA 4QD6A 4ANBA 2XK8A 2EU9A 4RWKA 5H8GA 3LXKA 2W1FA 4X2NA 4A9RA 5TF9A 3L8XA 4C37A 4X7QA 4XBUA 3H10A 3QBNA 2C1AA 5ETCA 2YWVA 5HE1A 2BTRA 4HCVA 2BKKA 5L2TA 3DBCA 2JLDA 5ETIA 4FKWA 4IAFA 4I0TA 5HVJA 3ROCA 5CEMA 1NT2A 3ERKA 4L8MA 4JIKA 3DAJA 1H1RA 2YIYA 4EQUA 2OICA 3QYWA 4Z7GA 1OMWA 2BRGA 4QMVA 4WRSA 4DCAA 2XH5A 5FEEA 2W4KA 2H9VA 2J0IA 5HBJA 3BLHA 4RJ5A 3L8SA 3KK8A 5IUIA 3VRZA 2F7XE 5EI8A 3U4UA 3TT0A 1BL7A 2ITOA 4PX6A 3PXRA 3GB2A 4FT5A 2WQEA 3VS7A 2YAAA 3IECA 3R7UA 2W96B 3WILA 3O96A 4E5BA 1KV1A 3JY9A 3SXSA 4CZUA 2X2KA 2WAJA 4WO5A 2ETMA 4EHEA 2WQBA 3SC1A 3ZO3A 4FZDB 4FIJA 1KOBA 4XG2A 4ASDA 4MXYA 1NW1A 2I0VA 2JD5A 5M08A 3ZDUA 4IEBA 3OBGA 1O6KA 4AZTA 3QHRA 3PJ3A 2PE1A 2E9VA 3NIEA 4LV8A 5CNOA 5FTGA 3BYSA 4ACMA 4APPA 4FI1A 5M4UA 5HG5A 3DBQA 4E4XA 4TYHB 1IG1A 2W1IA 1MQ4A 4OTPA 3KL8A 4HOKA 5CVFA 3OCTA 3KVWA 2CNUA 4O0SA 4DGNA 4HYSA 1VJYA 4AT4A 1YWVA 5HE3A 2JIVA 4FV9A 3DTCA 4ANLA 4P4CA 4NT4A 3E8DA 3MV5A 3OW3A 3SX9A 4EJNA 5GIPE 3CTQA 4IAIA 5FXQA 5I9WA 5IA0A 4GKIA 5HNGA 1J7UA 3MS9A 4EZ5A 4U3YA 4WBOA 3GCVA 3KRXA 5A6NA 5ANOA 4CVAA 5J5TA 4AZVA 4YGAA 3SA0A 2QOQA 1M17A 2YHVA 3DA6A 5DMZA 3B2WA 5EQEA 3R8VA 1JKTA 1P4OA 2PUNA 2QONA 2YJSA 3TV6A 3WIKA 3CTHA 5K5XA 3PG3A 2QNJA 3ULZA 3VBQA 2F7EE 2Z8CA 5M56A 1W8CA 4BDKA 3GUBA 3JVSA 4EQMA 3HA6A 1OZ1A 4UN0C 2WFYA 3G0EA 5HIBA 3ATTA 4M69B 1ZMVA 2HZ0A 1PXNA 3KREA 3AMAA 4FKOA 4IC8A 4OTQA 2JBPA 4OGRA 5KZIA 3NLBA 3UOHA 4D1SA 1HCKA 4LUDA 5A4TA 4IACA 4R3PA 1U5RA 4AS0A 4RLLA 2BFYA 2QO2A 3BIZA 3DDPA 3KC3A 1YXUA 3UPZA 1Z9XA 3LVPA 3BHHA 2R3RA 3GENA 3HV6A 3NUXA 5J79A 1FBNA 4C3PA 1KOAA 2OXXA 2UW7A 4EH6A 3QXPA 2X2LA 5F4NA 1KE8A 5JK3A 2BAQA 1MUOA 4GRBA 4IX3A 1YXXA 2UZLA 3FI8A 4XOYA 4EONA 4UMPA 4AOTA 4F7JA 5M51A 3NNWA 5HCYA 3A7IA 3F5XA 3NW6A 5IDNA 4BCPA 4PRJA 3OOGA 1J3HA 1V0PA 2GFSA 4JBPA 3R9NA 4N57A 4Y83A 3ZMMA 2FH9A 3QL8A 2FSMX 3TUCA 4TN6A 4BVUA 3TL8A 2JFLA 3A7JA 3UDBA 5I9VA 4GV1A 5BVKA 3PJ1A 4DFZE 4CQGA 1EH4A 2YCQA 5DRDA 4BCOA 4J8MA 1RW8A 1GJOA 4IM0A 4RIWA 2C30A 3QTSA 4O22A 5AX3A 1PKDA 2ZAZA 3ODZX 4FTRA 1P4FA 4H05A 4ZSJA 2C68A 2XKCA 5CU2A 3LQ5A 2GTMA 4TW9A 1W83A 3GOKA 4EOPA 4DG3E 3IG7A 2G2FA 2VX1A 3Q52A 4HZRA 5KCVA 3QC9A 4YJQA 4Y95A 5CF6A 5EKNA 1W84A 4TWOA 2YLFA 4YNEA 3LCOA 4I5HA 4BWPA 2H6DA 2ITYA 3MH2A 4BCGA 3OFMA 4U40A 2HZNA 4B8MA 4UMUA 4B8LA 4PDYA 3F82A 3E3PA 4X3JA 3HRFA 4DG2E 3F3ZA 4IVCA 3BHVA 2FYSA 3VS2A 3AT3A 1FMOE 3R7GA 5CTPA 2ONLA 3U8WA 3TV7A 4M12A 3Q6WA 4HNIA 4IM2A 4UYAA 4FTMA 2ZV2A 3LLAA 1W7HA 4IB5A 3GVUA 2GDOA 3KU2A 1NVSA 1YXVA 3A2CA 3EH9A 3DLSA 1ERKA 4XNEA 5FTOA 1GZNA 3FKNA 2BRMA 2R2PA 1F3MC 1GOLA 2R3KA 4LOQA 4LYNA 4TWPA 4CYIA 1MQBA 4FEUA 3T9IA 3IDBA 4DH3A 4IJPA 4M14A 5H3QA 4XJ0A 2GSFA 3VWAA 4Y8DA 3DXQA 4JDKA 5LVOA 4CFUA 1ZY5A 4CG8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4AFE A;  2VTS A;  1U46 A;  2CGW A;  3PY3 A;  4H36 A;  4NH1 A;  2HY8 1;  4P90 A;  4YO6 A;  3NMU F;  1Q8U A;  2C6T A;  4QMT A;  3MB7 A;  1PXK A;  5KUP A;  1ZOE A;  4FNW A;  2W5H A;  2Y6M A;  5C1Q B;  5I9X A;  4O7V A;  5HD4 A;  5CNN A;  2W05 A;  3LMG A;  3DNE A;  4CGA A;  4WG5 A;  5EM6 A;  5EW8 A;  5DEY A;  3V5W A;  4OTI A;  5GIN E;  1ZY4 A;  5DT3 A;  4G17 A;  3ZEW A;  3F5P A;  3P1A A;  5FXR A;  5GJF A;  2WOU A;  4FL3 A;  5HO7 A;  3L9N A;  2BAK A;  4J53 A;  3IW6 A;  3P08 A;  3CTJ A;  4E6C A;  4L3P A;  3KUL B;  1ND4 A;  1H25 A;  1JVP P;  2ZM4 A;  1UWH A;  2YDI A;  3IOK A;  4IB0 A;  4WT6 A;  2GQS A;  3KMM A;  2WGJ A;  3L9M A;  5AUX A;  4DFB A;  5A4L A;  5CS6 A;  4RX7 A;  4GK2 A;  5CT0 A;  4D5H A;  3VS1 A;  2ITX A;  1CKP A;  1R39 A;  3RK9 A;  4BDC A;  2ITV A;  4I24 A;  3TNW A;  5HO6 A;  1U54 A;  3FKL A;  3UE4 A;  2ERK A;  2VWW A;  3K54 A;  4ZXT A;  4DIT A;  2PU8 A;  3VBY A;  2F9G A;  2ZDT A;  4GUE A;  4NWM A;  1H07 A;  2GNG A;  2XNM A;  3GU5 A;  5AAG A;  5CAO A;  3GCQ A;  3UIB A;  3CPC A;  4IZ5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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