1PXLA

Human cyclin dependent kinase 2 complexed with the inhibitor [4-(2,4-dimethyl-thiazol-5-yl)-pyrimidin-2-yl]-(4-trifluoromethyl-phenyl)-amine
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
298
structure length
290
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of a novel family of CDK inhibitors with the program LIDAEUS: structural basis for ligand-induced disordering of the activation loop
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 290
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1pxlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1pxlA01
2VTTA 1MRVA 4XP0A 5HICA 4NFMA 1OL6A 2YIYA 3NUAA 4X7QA 2OJJA 4DCAA 3DXNA 3QTIA 4HW7A 1VEBA 2Y4PA 3ZBXA 4ANOA 4C4HA 4M13A 4AGWA 3C4XA 3BE9A 5HVJA 4D5KA 3PXQA 4K1BA 2BFYA 3ZLXA 2V7OA 3V6RA 2QR7A 2WFYA 3EFLA 3ZSIA 3TN8A 2XK3A 4IWOA 2ZOQA 3DPKA 4ACHA 3SXRA 3ZFXA 2R9SA 5C03A 4AZEA 1KUTA 5AX9A 4O83A 4KABA 3BZ3A 3NW5A 4ZSAA 3HRFA 4G31A 4FNWA 5IQHA 3C0IA 3FZ1A 3GVUA 2F2CB 3MFUA 4DN5A 4EH4A 4LMUA 5C26A 4FEWA 4A7CA 1YDTE 2V22A 1LEZA 1NXKA 4LOOA 5BVWA 3F7ZA 3UP7A 3TUCA 3CC6A 4MH7A 1UKHA 4DFXE 4M7IA 4CT2A 3NCGA 3LKMA 5FXSA 3OWJA 4WNMA 4E5BA 5J87A 4EHGA 2V55A 5DG5A 1R78A 4AU8A 3BQCA 4PDPA 4CZUA 3Q2JA 5H2UA 3PJCA 4USFA 3EFJA 5CAUA 4NU1A 2B52A 3OD6X 4AN9A 4NEUA 5CQUA 5H9BA 4PL4A 3C7QA 4F63A 3CXWA 5AV4A 5AIKA 4D0XA 4BYIA 4QMNA 2HCKA 3PP1A 1TQIA 5E1EA 5L6OA 3OWPA 1WVWA 2WAJA 4R77A 1H27A 4RZVA 4O27B 4TRLA 3U6IA 3UJGA 2NO3A 4EOPA 1FVVA 2I0EA 4QMUA 5CAVA 4I5HA 5E4HA 3GQIA 4MXZA 4YZBA 5IH5A 3L9LA 2W99B 4AE9A 4EL9A 1O6LA 1UKIA 3Q3BA 5AP5A 3RNIA 1H00A 2QR8A 1BL7A 2R7IA 3HEGA 2IWIA 4KKHA 3SG8A 2QOKA 3RWQA 4TYGA 4EZ3A 3NW7A 3VS7A 2FYSA 4DH8A 5EOLA 2R3MA 3ACJA 1K9AA 3S1HA 1Q8TA 4UMTA 5HCYA 1LEWA 4ZLOA 3ORTA 3QTUA 4KINA 4RIXA 3WYXA 4EOJA 3ZUVA 2CCHA 2OJFE 4GG7A 1YOJA 4FI1A 3RALA 4ZTMA 3KRXA 4FTQA 4CEGA 3OWKA 4B8LA 4WD5A 4CRSA 5HU3A 4I94A 1I09A 1H24A 2JKOA 4RPVA 3FMLA 4J99A 2PUIA 3R2YA 4WKQA 3A7FA 3FZSA 4L44A 3F3ZA 3UOLA 1JPAA 4I5CA 5CZHA 3WIKA 4BWXA 4LRMA 5HIBA 5CQWA 1J7UA 2WIPA 5IQBA 4PL5A 3EN7A 3FBVA 3U9CA 4E1ZA 4CZYB 3ZXTA 2XK9A 2VO7A 1JNKA 2XK8A 5M09A 4AZVA 4XBRA 3NYNA 1KV2A 2X6EA 4I93A 3H4JA 4FZ6A 3LXPA 4QMMA 3KREA 4EK8A 3MB6A 4GT5A 3BLHA 5D10A 5GNKA 4Y95A 4IH8A 3QHRA 4O96A 1H4LA 4L43A 5IH6A 2VTAA 3MVMA 5HG7A 3W2RA 4BWKA 2X9EA 5IUHA 4TTHB 4EKLA 3QLGA 4OTRA 4DG3E 3PIXA 5FUTA 3S3IA 2G2HA 2PVRA 4UALA 3DFAA 3BYVA 3WBLA 1VZOA 2R3GA 3D14A 3OY1A 5KMLA 4JNWA 5DRDA 2C47A 1B38A 5HEZA 4D4RA 5K0XA 3R04A 4AOJA 3DT1A 4D2RA 2XM9A 2QC6A 4FIFA 3KULB 3DGKA 4LI5A 1XWSA 5FWKK 3WF8A 2QLQA 3KY2A 4TYHA 3FWQA 2YZLA 5J9ZA 4ANLA 1YXTA 4Q5EA 3LFDA 3ZH8A 4ZMFA 3FLSA 3NAYA 3NVKI 4G3DA 4PNKA 5AFVA 2W0JA 3E87A 1NVRA 3V3VA 2XNBA 4YHFA 3HP5A 3WF5A 4C33A 5EG3A 4NIFB 5M06A 2ITPA 4E20A 4WNPA 3ZU7A 1NT2A 4RQVA 3GNIB 5M56A 3PDTA 2XNNA 3RM7A 4RLLA 1IA8A 3VS4A 5AAGA 4NCTA 2GNIA 2BDFA 4FV0A 3WZJA 1JVPP 4NTTA 2WQEA 3R8VA 3POZA 5J1WA 2I7QA 2PE1A 1CMKE 5A6NA 5E8XA 1Q3WA 1I44A 3F5GA 3SC1A 2WMUA 3QRIA 3R0TA 5CZIA 3LJ2A 3MFRA 4G3FA 5JFWA 1H1SA 5HZNA 2Z60A 3DKFA 3FLQA 1CTPE 3KU2A 2JBOA 3D7TA 4BVUA 5L2TA 3JVSA 2B9FA 3H0YA 3D5VA 5GINE 4YSMA 4C3FA 4M69B 2PUNA 3CTHA 4UXQA 3GCSA 3H3CA 4WOVA 2XNEA 5DPVA 4M3QA 3I7BA 3RPVA 3HV7A 1XBAA 3O23A 3Q4CA 3Q2MA 3BV3A 4FTOA 5FXQA 4CLJA 3W8LA 3H9FA 2C0IA 3D5WA 3QZHA 4QYFA 5IA1A 3LCOA 1P4OA 1TQMA 1YRPA 3V8WA 2C6IA 2B9IA 4O7VA 4DG0E 1MRYA 2C1AA 3QYWA 1J91A 3A60A 2CN8A 4FKWA 3DDPA 3ZMMA 2PY3A 4BDKA 4BKJA 5L4QA 2YIXA 3EYHA 4HGTA 3O96A 5H8EA 5IUGA 4I6FA 3SRVA 5E8UA 2W17A 5AP4A 4JDIA 4MNFA 1JBPE 5AEPA 4KS7A 3D0EA 4GEOA 4BI0A 4UMPA 4RFZA 4OLIA 3PXFA 3AMBA 4IAIA 4LOPA 5HKMA 4DH7A 3G6HA 4KAOA 4DA5A 4TL0A 4CG9A 3RPYA 4BFMA 1J7LA 2XBAA 3I5NA 4J71A 4FSUA 3GFEA 4X2FA 4JAJA 2VO6A 5JT2A 4ZS4A 3MW1A 1H01A 4RA4A 3I0OA 2XB7A 5K4IA 3KCKA 3OXIA 3TKUA 4R5SA 5CY3A 4MXYA 2UZTA 3HAMA 4L8MA 4YBKA 4AGCA 4U5JA 4K11A 5EW9A 4R8QA 3V04A 3BI6A 5I9UA 3R9DA 2IO6A 4YZCA 3RAHA 3PYYA 4JOAA 4XOYA 5LVOA 3I1AA 5IQAA 3ZLYA 1OKZA 3TTJA 3DNEA 1YWNA 5F4NA 4I5PA 3VC4A 4R3CA 3W32A 3BHHA 4C8BA 3H30A 3GQLA 4RVLA 2WQNA 3RKBA 4I0RA 3ZUTA 3EJ1A 5M08A 2X8EA 2OXYA 1KE8A 4WBBB 2JAMA 1L3RE 4WRSA 2YISA 4E6DA 5BQ0A 2GQSA 1SMHA 4EWHA 4PTCA 2BDWA 5LCKA 2OZAA 3R9NA 4AA4A 2VRXA 2IW9A 2XCHA 4QQCA 5L6PA 2XP2A 3HA8A 3BYUA 1M14A 2WU7A 3R63A 2A1AB 5GJFA 3JY9A 4O0UA 3E7VA 3FE3A 1TVOA 3FKLA 5EI2A 3I7CA 1YI4A 4CG8A 2Q0NA 5CSHA 5ETAA 5KO1A 5GIOE 5LVPA 1ZLTA 4BDJA 5LQFA 5J5TA 1SNXA 3PA3A 4BCKA 4G2FA 3FC1X 1PRYA 4BGQA 2E2BA 4C38A 5HVYA 2UW3A 2J9MA 2WQOA 3RK7A 3MJ1A 4IAZA 3MI9A 4XG4A 4W4XA 3TCPA 1H25A 4TNBA 4UWCA 5ACBC 5ICPA 4ZEGA 4DITA 3RM6A 3FQEA 2R3JA 3Q32A 1CDKA 1RDQE 3EN5A 3E88A 4OR5A 4PPAA 4TPTA 3VJOA 2XK7A 1WBSA 3DOGA 3LFSA 3PVBA 4BL1A 4CYIA 4ZY4A 5DMZA 4OTIA 2GCDA 3R01A 1JKKA 5D41A 3RPSA 4RIYB 4IB5A 4W9WA 2DWBA 2IZUA 3BYOA 5E7RA 5E8TA 2J0LA 1Q97A 4ZP5A 4IDTA 2G2FA 4UX9A 1MQ4A 2X39A 5EW8A 1OMWA 4U81A 5DH3A 4QQTA 2XYNA 4KB8A 3HDMA 2OSCA 5JH6A 4KBKA 2VO3A 5FD2A 4F08A 4GS6A 1OL1A 4FICA 3VAPA 1G5SA 3BU5A 3NNUA 1OIUA 2VN9A 4R1VA 4W4YA 5I4NA 4HNIA 4GSBA 5HTBA 2GHLA 1O9UA 2WD1A 3A62A 5C01A 2BTRA 2YZAA 1SVHA 5D11A 3VUIA 3F66A 4PTGA 4OTHA 4FKTA 3AD5A 3DAJA 4BKZA 3LVPA 1H0WA 3UP2A 1W98A 3DK7A 3DBCA 5LWMA 5AP6A 3V51A 3KXGA 2XNMA 3EQCA 4C58A 2CGWA 4L45A 3U55A 4OW8A 2A4LA 3T9IA 5FDPA 2BAKA 1GIHA 2YJRA 1PKGA 3HUBA 3ORKA 1QMZA 2XJ0A 4XX9A 1X8BA 5AR5A 2CMWA 3W2SA 3G0FA 4HCTA 5E91A 4KD1A 3CPBA 5LVLA 2YWVA 3F3VA 2YIQA 3O2MA 2C6MA 4MWHA 4DTKA 4F0IA 2QG5A 4IX4A 5FQDC 4OTGA 1CKJA 5CT0A 3QTXA 3BGZA 3PG3A 4DTBA 4F9AA 3OC1A 4PRJA 3R73A 1YOLA 3IW4A 1R0PA 2GMXA 3HV3A 4XMOA 1FINA 3UTOA 3GCUA 4AZTA 1XH6A 4FV1A 2RKUA 1YI3A 4K6ZA 4TY1A 2FSOX 4UB7A 2G15A 5AR4A 3Q53A 4OTDA 3MDYA 4WA9A 5AUWA 2H9VA 3QX2A 3R7UA 4D4YA 2BR1A 3FL5A 5FG8A 4IAKA 5HG9A 1YXXA 3QKLA 2JGZA 5KMKA 3PVUA 2BKZA 3TNQB 1GAGA 2O63A 4TWOA 3L8XA 4BGHA 4CFWA 3TV7A 3DXQA 4U7ZA 3MA6A 2NPQA 4L7FA 2UZVA 3VJNA 3FL4A 4BDEA 4BBEA 3TZ8A 2PVNA 4M68A 3PIYA 4G3EA 3AD4A 5JZNA 5J7BA 5EDRA 3PXZA 2QOBA 4GYIA 2B7AA 2PUUA 4IC8A 4EH7A 5A54A 4EONA 5M4FA 4O7RA 4MNEA 3PSCA 4JI9A 3SVVA 2C6OA 3TWJA 5C8NA 3BBTB 4TWCA 3PSBA 3U87A 4K2RA 4OT5A 5CENA 1J3HA 5LCJA 3M1SA 3P7CA 2ACXA 4NCTC 1ZZ2A 4YTCA 2OIDA 5IA3A 4I4EA 4U80A 4A9SA 1WBOA 2HW7A 1R0EA 2P55A 2WTVA 3OG7A 2RF9A 3TT0A 2YITA 3ZXZA 4F0FA 3TDVA 1JKTA 2PVMA 1OL2A 3Q4TA 3ZO3A 3CS9A 4BDBA 2YEXA 1BYGA 4DF3A 4ZTRA 4IB0A 2VTPA 2JBPA 2XNOA 1GJOA 4Y5QA 4E93A 3EN6A 4FKSA 2QKWB 4R7BA 4I5MA 3DFCB 4IM2A 4UMUA 3NS9A 2FSLX 2R3FA 3VBXA 4D5HA 4YJOA 1G3NA 1H26A 2OLCA 5BNJA 5J79A 1H08A 4JS8A 5E8SA 3M42A 3C4CA 5I3OA 2PVHA 2VWBA 5HHWA 1U54B 1YDSE 3EZRA 4AN2A 3CSVA 3KQ7A 2PL0A 3QHWA 5L2QA 3O8UA 3S2PA 3TG1A 4BIEA 2QKRA 2BRHA 4LMNA 3BRBA 1IAJA 4GCJA 3S00A 1ZYJA 1Z5MA 2GSFA 3GCPA 4XP3A 2ITNA 1Q8YA 4UWBA 1NY3A 2KULA 4CV8A 2OI4X 5DVRA 3W55A 4BF2A 5ETFA 2XUUA 3CR0A 3GCVA 4OAUC 5L6WL 2E9VA 3AC4A 3U8WA 1VR2A 2P3GX 3R21A 4CFNA 3SW4A 1QL6A 4BI2A 3HV4A 4D1XA 3ZSHA 3QCQA 3NWWA 4JIAA 1R3CA 3SXFA 3EKKA 3HZTA 3W2QA 5EM6A 3GOPA 2YACA 3IDCA 4KA3A 4QMLA 1BL6A 4FTJA 2CNQA 4QYHA 4I41A 3NNVA 2GDOA 4HGLA 2PMNX 4RSSA 4DBXA 3TZMA 3GBZA 3BHTA 2B9HA 4NWMA 5ANOA 3A61A 3O7LB 4YZMA 4M14A 4CFVA 1RJBA 4PQNA 1QPCA 4C4JA 3AT4A 3BEAA 4PNIA 1LUFA 3TJDA 3F88A 3R71A 4GU9A 4JBVA 5AP3A 4FIHA 5GJDA 4AFEA 4ZY5A 3LJ1A 2YERA 3E8CA 3MVJA 3V5TA 2WMQA 2BVAA 5KZ0A 1YHVA 2G01A 2HELA 2W7XA 2W1EA 4Y5HA 2BAJA 4FV7A 1WFCA 4IVAA 3UVRA 4FT3A 3DA6A 4IXPA 4UXLA 3PPZA 1V0OA 2HWPA 3EH9A 2XYUA 2O3PA 4F7LA 3T9TA 3Q5IA 4BBMA 5DIAA 3QGYA 4GJ3A 3PUPA 3UZTA 4CKRA 3OFMA 4UV0A 5CU0A 2B54A 3F5UA 1V1KA 2YLFA 3MBLA 1OL7A 3PVGA 3PY3A 2R64A 4F9CA 2PYWA 2X4ZA 1QPJA 3QUPA 4G5PA 4DGMA 4U43A 3IG7A 3WF9A 3RJCA 1ZOEA 1WZYA 3EZVA 3QF9A 2JITA 5FBOA 4GU6A 3DY7A 4FT5A 5LARA 4O7SA 3FKNA 4F99A 4YURA 2YHVA 5ANKA 5DNRA 2WTCA 2OFVA 1A9UA 4FYNA 4CXAA 5B2KA 1OIRA 1Z9XA 3PPKA 3UNJA 4ARKA 4DTAA 2VGPA 4A4LA 2FSTX 4X3FA 4YJTA 1U5QA 4JQ8A 5TF9A 1UVRA 2CNUA 3DBDA 4C35A 5CEQA 4FT9A 3PJ8A 4IAFA 1UV5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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