4GG7A

Crystal structure of cmet in complex with novel inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
281
structure length
278
Chain Sequence
QAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Multisubstituted quinoxalines and pyrido[2,3-d]pyrimidines: Synthesis and SAR study as tyrosine kinase c-Met inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 278
sequence length 281
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gg7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gg7A01
4KIOA 4FV0A 4U81A 5CENA 4GW8A 2W06A 3AC4A 3CE3A 3VW6A 4GVJA 4KAOA 2VTIA 1H01A 4X2KA 3Q9XA 2NO3A 1QCFA 3QTIA 1JAMA 2BRBA 2BKZA 2O5KA 1B39A 3QWJA 4Z7GA 5ETCA 3OF0A 4YR8A 2PMLX 4MH7A 1YW2A 4AGWA 2C6LA 3OCBA 3HMIA 5IQIA 4A4LA 3G9NA 3PJ1A 3FZSA 4GT4A 3V5TA 2WMXA 4C34A 1UU3A 2WMBA 4JDJA 3DK6A 3FC1X 1NVRA 1O9UA 3FPQA 3OTUA 3F2AA 4AT5A 3AQVA 4QQJA 4RFZA 4L43A 4XG8A 3B8RA 3MVMA 1X8BA 3C51A 5CAUA 3A7IA 2GQSA 2CDZA 5CU2A 1YDRE 5EM7A 3OCTA 1Z5MA 1XR1A 4J7BA 1BYGA 3PJ8A 4LOPA 2H8HA 5LCKA 2Z7SA 2W1GA 3DA6A 4MD8E 4WA9A 4CTCA 2NRUA 5CF4A 2J5FA 3KRXA 4CEGA 4F0IA 1ATPE 4C62A 4DFZE 5AP5A 5EOBA 3UDBA 2XIRA 2YIYA 3NRMA 3QA8A 5LVMA 3HA8A 3UOJA 5CLPA 1OL6A 4M3QA 3QGWA 1MQBA 5C26A 4XRJA 4BKJA 4IM3A 3W1FA 4O7SA 3GCSA 4XP2A 2F57A 3EL7A 4OTWA 3A4PA 5I9ZA 2PVFA 3LMGA 3RZBA 4X2GA 2XCKA 4OTQA 3U8WA 4DEIA 4E73A 5FXSA 2QKWB 5J7HA 4ZSGA 4FEQA 1VJYA 1OUKA 5HORA 4ACGA 1WBWA 2W17A 3Q52A 3FPMA 2O8YA 3QZFA 2Y6MA 2BZJA 4XG7A 1JKLA 3M42A 3W8QA 3V01A 3QTUA 5FUTA 3R01A 4YHTA 4YU2A 5LVOA 4A9YA 4LM5A 4FT7A 4L3LA 3V5LA 4YGAA 1HCKA 3QUEA 3DFAA 4I1ZA 3WZEA 3F2RA 4O38A 2W96B 4PDPA 2UW7A 1F0QA 4P2KA 1YWRA 4O0UA 2PE2A 4MK0A 2P2IA 4F6SA 2IWIA 4EOLA 3SAYA 4M0ZA 3MFSA 3TZMA 5KO1A 4AW0A 5K5XA 3EN5A 4BYJA 3G90X 4ALVA 4FEWA 4H36A 3TWJA 4J8NA 4F7NA 4RWLA 1FGKA 2WKMA 1OPLA 2WQOA 3EMGA 3GOKA 3NYOA 2O3PA 3CEKA 3FL5A 4QQTA 3UPXA 4BIBA 5HZNA 4NM0A 5EHYA 4M0YA 4JQ8A 3S0OA 1WVXA 2C5YA 3EQHA 3NZ0A 5A4TA 2PZRA 4O1PA 4U3YA 3LQ3A 5LOHA 4JL9A 4V0GB 3A61A 5C01A 4FSWA 5A9UA 4JI9A 5CAOA 2C30A 3QQGA 4MKCA 4D2VA 1NA7A 3OWKA 5HEZA 2R3NA 2C6EA 3NCZA 4CQGA 1E9HA 3LFEA 5AUYA 5A4LA 4YJOA 2ERZE 2XRUA 3KGAA 3LHJA 5E8UA 3ZMMA 5L2QA 3VJNA 3Q6UA 5AIRA 3ORPA 3O2MA 4RBLA 4AAAA 4IAZA 3D94A 3F7ZA 3DDPA 4NU1A 4L45A 4BGHA 5FEEA 3RAHA 2JDRA 3KB7A 4QMXA 4BYIA 2CKEA 4ACHA 2CKQA 4MNEA 3KRJA 3R9HA 3VS1A 2AC5A 2C3JA 3E8DA 4MAOA 1G5SA 3QBNA 2WQBA 5B0XA 2CKPA 1ZMUA 2C6OA 1IA9A 3JR1A 4U79A 4D1SA 5H2UA 2ZV9A 2OGVA 2QOIA 3MSSA 3NYXA 3E92A 4IWDA 4PNIA 1Q4LA 1GZKA 1GIJA 3R8ZA 4AOJA 5GZAA 5IA1A 3MESA 2Q0NA 4IVCA 4FBXA 4B0GA 4L46A 3BYMA 1Y6AA 4GUBA 1FGIA 3F9NA 4QPSA 5GJFA 2B7AA 5KKRC 3KU2A 4RX8A 2BFYA 3K2LA 4X6RA 3MY5A 2V55A 5CQWA 2WMRA 4M68A 1PYXA 4K8AA 2J51A 4D28A 3KK9A 2Q83A 3ORMA 2QO9A 4XG6A 2DUVA 4ACDA 2BVAA 3NLBA 3KQ7A 4RLKA 2JFLA 2W1ZA 3BGQA 5IUHA 4OW8A 5CX9A 4DC2A 3QRIA 3OMVA 4AU8A 2XVDA 4ASEA 3C4ZA 4E20A 4DLIA 2HENA 3BZ3A 5AADA 4AFEA 3Q9YA 4C4JA 5AAEA 2ITYA 4R3RA 5F9EA 2BUJA 4UWYA 4AACA 4F1OA 3R8VA 5BNJA 2W4OA 4UZHA 3HV4A 2CHLA 4YJQA 3D4QA 4AXAA 3PG3A 4R3CA 3U6IA 4MQ2A 2YIQA 5L8LA 4QTAA 3Q04A 5J95A 4X2JA 3WZUA 3BPRA 3I5ZA 4TYIA 3GUBA 3QHWA 4O7NA 3PE2A 4R1YA 4UXQA 5JSMA 2IG7A 3WYXA 4FOCA 4YO4A 4YZ9A 3K5VA 3VUKA 2Y9QA 3Q4UA 3OBJA 4FVRA 5M53A 3R9DA 3VHKA 4CG8A 3D7ZA 2QVSE 2IZRA 2WHBA 4LI5A 3VO3A 3D7TB 4S31A 4BKYA 2WMSA 3GI3A 2YCFA 4F9YA 2C4GA 1PKDA 3FEGA 3NUXA 3LFDA 1U54A 2OJIA 1J1BA 2VWZA 3B8QA 1SM2A 1QPJA 3QGYA 3RNYA 3ANQA 2UW4A 3ACKA 1Y8GA 3F5GA 4GJ3A 4BCFA 5DR2A 3UOHA 3MPAA 4RJ5A 2JDSA 3EKKA 3BWJA 3ZSGA 4LGGA 2XK9A 2BDFA 4AE9A 1O6KA 3KN6A 3QD0A 1XH9A 1ZLTA 3C5UA 3IK3A 5AUVA 1W83A 2YM4A 3BE9A 3HP2A 2WMWA 3UP2A 5AR5A 4GH2A 4IHPA 4BDCA 3MVHA 5AJQA 4EH4A 3F3WA 4EL9A 2ACXA 4DFYA 4EZ3A 4RG0A 2VWVA 1HOWA 4QP6A 2UZNA 3KMUA 4AA5A 3I6UA 4L00A 3LFFA 4FSMA 4R3PA 4U5JA 5T6KA 4EHVA 5CF5A 4G1WA 4X2FA 4E7WA 4QQCA 5FEQA 3KXMA 4AZEA 3PJ3A 4AN3A 2PL0A 2PUNA 4CYJA 4LMUA 4FV2A 4FL3A 3LJ1A 4BBMA 4Z16A 2B52A 2BKKA 3MB7A 2W7XA 4XG3A 4O27B 5M09A 4N4SA 3EQCA 3FWQA 4QYYA 4UEUA 4G5PA 4FKVA 4ZIMA 4TYGA 4DH7A 3E63A 3JUHA 2J90A 3FI4A 3QQFA 5KZ0A 4XMOA 5AUTA 4QMMA 1OVEA 2XNPA 2VO6A 4DGMA 2E9VA 3NNXA 5IDPA 3DXPA 1XH7A 4TWNA 1FVRA 2CNVA 3DTWA 2BAKA 4RPVA 2QC6A 1KE8A 3QHRA 4NZWB 3UGCA 3DS6A 4F1MA 4H1MA 4ZK5A 2UZVA 4JAIA 4CFWA 2EWAA 3Q2MA 3DQWA 4I6QA 5HKMA 2BRMA 1ZYLA 4GMYA 4O91A 3L9NA 4CGAA 3DNDA 3C4EA 4BIDA 4HJOA 3R21A 3FE3A 2JIIA 4FV9A 5CTPA 2PVJA 3LJ2A 3PTGA 2C6KA 3QZGA 5EM5A 5JGDA 1OECA 2HW6A 3CLYA 3K3IA 4WUAA 3TNIA 4WNMA 4AT3A 4EWHA 3RJCA 3HAVA 3MW1A 4IB1A 5IUGA 3NAYA 4DG2E 5HBHA 4L6QA 4BTKA 1PMVA 4RQVA 3UO5A 4KRCA 4O82A 4MVFA 4O0XA 3FHIA 5FBNC 2HCKA 5D12A 4TRLA 1JLUE 2AYPA 3UMXA 4CFFA 4F6UA 3T9TA 1M7NA 3Q6WA 5BUJA 3PY3A 3CKXA 3GT8A 3JVSA 5L6OA 3F5UA 4BDAA 4FT0A 2X2MA 4I6HA 4USFA 2UV2A 2YM8A 3DJ7A 5CU4A 1K2PA 4HVGA 4FKUA 5LVNA 4GEOA 4I93A 3UIMA 1PXLA 2CGXA 3R9RA 2XNOA 4WNOA 5AA9A 1KE5A 1WVWA 4IQ6A 1IAHA 1REKA 3NCGA 4TYEA 3PPKA 4UMRA 4AOIA 4KIKA 4YBKA 4JQ7A 1OKYA 3AC3A 5FTQA 3ZO3A 2UZWE 2XZSA 3FBVA 2ITNA 5E4HA 2FSMX 2ITQA 4FIFA 5DE2A 5TOZA 2Y8OA 3E62A 5GZ9A 1TKIA 4JDKA 3ZHPC 2R64A 4C2VA 1Y91A 1NVSA 5A4CA 3BYOA 3EL8A 3PFQA 4KIQA 4AF3A 4CV9A 4DEDA 2QODA 4KNBA 3W55A 5F1ZA 3Q53A 4L9IA 5H8BA 4L8MA 2QG5A 3RAKA 4EOIA 5C4KA 4FG8A 5IG1A 5L8KA 3BV3A 4NK9A 2CCHA 3DJ6A 3QUDA 2R9SA 2XA4A 4OTFA 2W4KA 3MJ1A 3RM6A 5I4NA 4IWOA 3SG8A 5DH3A 2ITPA 1XHAA 3AG9A 3H30A 2FH9A 3VHEA 3FLZA 4RJ4A 2Z7QA 2I7QA 5DRDA 3IG7A 4IADA 5M55A 3R7IA 3ZLXA 1OBDA 4LL5A 4RIXB 4IBMA 3SVVA 1V1KA 1BI8A 2RF9A 2LAVA 3SW7A 3FKNA 3FLYA 4WRSA 4AZWA 4RIWB 4I0RA 4XG9A 4M8TA 3U55A 4CVAA 4IH8A 5L2WA 2GSFA 3QC9A 3V51A 3BHTA 5FDPA 1I09A 3NDMA 4MF1A 4RVLA 2O65A 4QMZA 5AP2A 3LM5A 3LZBA 2C5VA 4CCUA 4YSJA 3WARA 2WOTA 2JDTA 3UZTA 3QTRA 5FGKA 3AMBA 4PX6A 5IEVA 3EYGA 2OFUA 4O0TA 4Y5HA 2ZV8A 3ZFMA 5DMZA 4EWQA 3ZM9A 4WOVA 4M13A 3OWJA 5CEQA 4EH7A 1OGUA 3MA3A 4QP4A 3VBYA 3RK9A 2QD9A 4GL9A 3JYAA 3VVHA 5ETIA 4E3CA 5ANGA 1Q3DA 3TL8A 4BTMA 1BKXA 1YWNA 3BYSA 1T46A 2OJGA 1DAWA 2ITUA 2VO7A 2OI4X 2OW3A 4Y5QA 4TZRA 3FSKA 3ORXA 1YDSE 5BVOA 4K11A 5K0XA 4ANSA 5BVKA 3IONA 5J7BA 1H28A 3KXXA 3PA5A 2W05A 4EKKA 5CI6A 3DBFA 5HESA 4AZTA 3PVUA 2UZLA 2G01A 3W2CA 2ZM3A 4A4OA 4PV0A 3E3PA 2XYNA 4E6AA 2YCSA 3PIYA 3F2NA 4EOKA 2VGPA 3LLTA 3C0IA 1GJOA 2ITTA 2ZMDA 2XKDA 4IIRA 5EYDA 4PY1A 3IDCA 4C0TA 2Y7JA 1OL7A 4W8DA 3K54A 4L53A 4D2TA 3LVPA 4KBAA 4RJ8A 4RVTA 4FSUA 1JQHA 2G2FA 2Y0AA 3K3JA 3AMAA 5CU3A 5JRSA 3FMLA 3V3VA 5I0BA 3QFVA 1RE8A 1V0BA 5J1WA 3CQEA 4W4VA 2XUUA 3MY1A 4G3EA 5D41A 3HRCA 4XG2A 3JY0A 4K9YA 4BDGA 4E6CA 3S00A 3T3VA 4J97A 3AT2A 3LFNA 2QR7A 4QTCA 3RAWA 3F88A 3DK7A 3IW7A 3M2WA 4D9UA 2X9EA 2Z2WA 2ZOQA 3P5KA 4V01A 4U43A 3HRBA 4L52A 4GS6A 4RX5A 2GFSA 2PMOX 4J99A 5HU3A 2UVXA 3C4XA 4BDFA 2WTKB 3LCTA 3E8CA 3PE1A 2ETMA 2OXXA 3NS9A 5GJGA 3A62A 3TV4A 3CPCA 1GZ8A 2H34A 2QOBA 2YN8A 3MB6A 4DGLC 4IFGA 5L3AA 3SRVB 1OZ1A 2VU3A 4D0XA 1ZRZA 4RJ7A 4E1ZA 5CSVA 4YUQA 3EN7A 2QU5A 3R2YA 5AP3A 4DFNA 4HGLA 5IA3A 1M17A 4J52A 2BZIB 4FIEA 3SDJA 4EYMA 4GG5A 1TQIA 5TKDA 4EHGA 2BAJA 5T68A 1BUHA 2B9FA 3DKOA 3Q32A 4CD0A 4FSZA 4YJRA 2JIVA 2XK4A 3DXNA 2HELA 4R7IA 3I0OA 4RFMA 3W2SA 1MRVA 3MWUA 4FSTA 3PVWA 3F6XA 3UC4A 4FI1A 2A27A 3NUSA 4HOKA 4M84A 2R3KA 2CN5A 3HMPA 3GFEA 3QZIA 3G5DA 4HZSA 4NM5A 4OBQA 3RK7A 5HVKA 3LPBA 4BCIA 2WTVA 2OXDA 4HVIA 5EHOA 3VUTA 4O84A 3FZTA 3R1NA 2VTNA 3EHAA 1OPJA 3AMYA 2RIOA 3LXNA 3FYJX 4JBVA 4K1BA 3KC3A 4TTHB 3FQHA 4F9AA 2WOUA 4I0TA 1CKJA 3DV3A 2BDJA 4YJNA 2XH5A 4AE6A 5LCJA 4C4GA 4P4CA 3BKBA 3D5UA 3T8OA 2E9NA 4ZMFA 5A4QA 2EB3A 4JG6A 3CD3A 4FTTA 5C03A 4BDBA 1YOLA 2CLQA 2OZOA 2VTPA 2IPXA 3VUMA 5EYKA 2YFXA 4R8QA 3FKLA 4DCAA 1BI7A 2RG6A 3MH3A 3IDBA 3OC1A 4EC9A 5I9XA 3HMNA 4D2SA 1OITA 5CEIA 3RPSA 1T45A 5DGZA 5AV3A 1YHWA 1B6CB 5IMXA 1PXKA 4BHZA 4IEBA 1H4LA 2I0HA 1YDTE 1OM1A 2ITXA 5FWKK 5I9WA 4RX9A 4ZOGA 3F61A 2O2UA 3HL7A 4HCVA 4HNFA 4DE4A 2OJJA 4B8MA 3NR9A 3ZYAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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