2O64A

Crystal structure of pim1 with quercetagetin
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Characterization of a potent and selective small-molecule inhibitor of the PIM1 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
total genus 81
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2o64A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2o64A01
3I0QA 4ZSAA 4IWPA 3KRLA 3UPZA 1MQBA 3KRXA 4O0TA 5JFVA 2R3PA 2PL0A 3HA6A 3OCBA 4ACDA 4F65A 3P4KA 1G8AA 5JGBA 3RM6A 4FT9A 3U87A 2GPHA 2GNHA 1WVXA 1YRPA 4RC4A 5EFQA 4FG9A 5TF9A 2CHLA 4DH7A 4IQ6A 4YO4A 3MI9A 3DK6A 1KOAA 2IO6A 4GFOA 4JRVA 2XCKA 1CM8A 1WAKA 3FI3A 3G51A 1OITA 3I6WA 4OT5A 5A4LA 3NEWA 3RALA 4D28A 2BRBA 1JSUA 5FWKK 2WGJA 1URWA 5KHWA 2YIYA 3R01A 1XH7A 4BCIA 5IQDA 4LOPA 3FYKX 2W99B 5CEMA 4HYIA 2FA2A 2R7BA 3DBEA 3DY7A 3OEZA 3R1QA 4RVMA 4K77A 3ORKA 3H4JA 3DB6A 4GIHA 3MA6A 4J71A 4QMQA 3KXZA 4AA5A 5EKNA 1B6CB 2CGVA 4DEAA 5LQFA 2C6MA 5HOAA 3EN4A 3CIKA 3QC4A 4M0ZA 3WBLA 1IRKA 1W84A 5CWZA 4WO5A 2I1MA 4JDKA 4ZY5A 3SG9A 2WAJA 2YM8A 1OPKA 5IKWA 5TOZA 3QKMA 4OLIA 1JSVA 4FVPA 1F5QA 4NL0A 4N0SA 3AGMA 3KXNA 3SV0A 4D2TA 5CZHA 4FV0A 3UOKA 4HVIA 5CT0A 4E6AA 2C0OA 2CMWA 3O96A 4WT6A 3VQHA 4WSQA 3R6XA 1ZYDA 5I9XA 3TV6A 4O0VA 3OXZA 2X81A 4LGHA 3KULA 4MXZA 3RCDA 4EWHA 3KA0A 4K6ZA 1RDQE 3A99A 3PSDA 3MH3A 4G2FA 3MFSA 1W8CA 1YXVA 3L8XA 3UTOA 2OFUA 4G16A 5CAQA 4XG3A 2OKRA 2O63A 2AC3A 4DLIA 4FNWA 2QD9A 3D5VA 4IBMA 2DYLA 3QWJA 4MEDA 3R9NA 3NZ0A 3REPA 3WIGA 3CR0A 3E93A 3KRRA 4FL2A 4CFFA 1YWNA 3LFEA 5CX9A 2C0TA 3NS9A 2GFSA 3N9XA 1FGKA 3EFWA 5C1QB 4TYHB 3QKLA 4A4LA 4UWCA 2I40A 2X9FA 4DEDA 5IQHA 2E2BA 4X2KA 3QXPA 2YZLA 4Z9LA 2B55A 4HPUE 5ANOA 4DEBA 2XS0A 1H27A 2QOQA 2PSQA 1ZY5A 1Z9XA 3E62A 2HELA 4NSTA 3ACJA 3VBWA 4JDIA 3GC8A 3RZFA 5L2TA 5LCJA 2PULA 2OJIA 3HZTA 1YDTE 5ITAA 4K8AA 4DGOA 1Q8ZA 2X8EA 2X7FA 3Q4ZA 2C3LA 4DTAA 2QOCA 2GNGA 4ZS0A 1BI7A 4MX9A 5IDNA 4GS6A 4FKWA 1OZ1A 4DEHA 2G2IA 2YHVA 4FVQA 5IG1A 3H9FA 3DKOA 2H6DA 2WU6A 3DAEA 4IX3A 4QMWA 5TR6A 4DG0E 1AD5A 5HX8A 5HLPA 3W2QA 4RX9A 3MTFA 4YTHA 3Q5IA 4RIYA 4RRVA 1PKDA 1KWPA 3BX5A 3FKLA 4ZJJA 4BL1A 4EOPA 1IEPA 4BI0A 1NW1A 1XBBA 3QTRA 4FKPA 3UBDA 4A9RA 5B2LA 3QL8A 4PPBA 3BHVA 2W1HA 3CP9A 4AT5A 4O81A 4RJ8A 2QKWB 2VN9A 4I22A 1T46A 4FGBA 4IAKA 4ACMA 4AOTA 4ASZA 4HVHA 3EQDA 4XG2A 5T6KA 4D55A 4YC8A 5LVPA 1JOWB 2QURA 4N6YA 3F2RA 2O2UA 2ITQA 2P2IA 2GTNA 2YN8A 5M06A 2C5VA 3G0EA 2J4ZA 4MQ2A 2QHMA 2PVNA 2ITUA 4EK4A 5CF5A 3EZRA 4D2PA 3BZ3A 3UC3A 4E7WA 1Q3WA 4E6QA 4PY1A 4HZRA 4AG8A 5HBEA 2R0IA 3LQ8A 3IGGA 1H1QA 4XYFA 4AZFA 4XG4A 1BUHA 5E90A 3CTQA 4I5PA 5F95A 3L8PA 3LMIA 4H3BA 2XA4A 3ZEPA 4HJOA 3UNJA 4FV9A 1FBNA 4PPCA 2OWBA 3I0OA 3KCFA 1Y6AA 3LKMA 2H8HA 4NTSA 1VZOA 4MWIA 2VTHA 2E9PA 3C0GA 3V8SA 5HZNA 3TNQB 1WVWA 4W9XA 4KIKB 4U7ZA 1J7LA 2OZAA 5TE0A 1OL1A 3VS5A 4GW8A 1KUTA 4YTCA 3KC3A 4MTAA 4QOXA 3ODYX 3LIJA 3KF4A 4FKRA 4IVCA 4YHTA 2Y0AA 2XNBA 5BPYA 2EB3A 1UU7A 2OXDA 3ZUVA 1FOTA 4U8ZA 4CV8A 4JBOA 2W1FA 3FMDA 4ZZOA 3FLYA 4QP6A 3FMKA 3R1YA 1URCA 2V7OA 5CYIA 3IOKA 3AC3A 3VHKA 4C2VA 5I9YA 2GS7A 5F20A 3LQ3A 3PE1A 4RX8A 3V6RA 5JSMA 1ZYSA 4CFXA 3ZXTA 3E5AA 3QAME 3OC1A 4AA0A 3FC2A 3BU5A 3DJ6A 3R28A 4OGRA 4PF4A 1XO2B 4BGHA 2BDJA 5A6OA 3EZVA 4ENYA 5CU0A 3F82A 4PDYA 2ZV8A 4L7FA 3FWQA 1DS5A 3ORNA 4PQNA 3P86A 5AM6A 2RKUA 4J8MA 3MSSA 3PLAE 4AF3A 1MRVA 2R9SA 4TWCA 4EL9A 3BLHA 3NMUF 4QTCA 5BYLA 2C6OA 3F61A 1VYZA 3WF9A 4E4NA 4RX5A 1QL6A 2QO2A 5J1VA 1A06A 5JRQA 3RM7A 4WIHA 5DOSA 3E63A 3I5ZA 3ZBXA 3GT8A 4EK5A 2YWPA 5DR6A 3VS3A 3TDWA 4EZ5A 4FKGA 5EQEA 1ZARA 5M44A 3KGAA 5F1ZA 2PVMA 5HD4A 4XP3A 5JGDA 3CKWA 1E9HA 1PXNA 3R9HA 3UG2A 2BIKB 2CLQA 2PMIA 3TKIA 3KVXA 4NZWB 3ZZWA 3VUHA 4FSZA 2SRCA 4KIPA 5IA4A 4Y95A 3LHJA 4QQ5A 5LXMA 5CASA 4QMLA 4CZTA 4EJNA 4D58A 5E91A 2ZOQA 3HNGA 3VS2A 3H0YA 4RWIA 3V51A 5A46A 4DFNA 3CGOA 5EDQA 3QZIA 3UC4A 2WMSA 1PXKA 1JKLA 3ANQA 4F4PA 5I9WA 1Q3DA 2W5HA 2YISA 2B0QA 5CF6A 3NUXA 3QCXA 4R78A 4QPMA 4ZY4A 1SYKA 2BRGA 3QA8A 4QRCA 4EOLA 2I6LA 4MXOA 4NWMA 4BHZA 5JFSA 3MVMA 1TVOA 2JKMA 3CS9A 3ZFYA 3SQQA 3ZHPC 4BY9E 4OTFA 2WTJA 4EYJA 3ZCLA 2JKQA 4J8NA 4KIOA 1CKIA 5EKOA 1J3HA 3IECA 2JIUA 3UIUA 1JVPP 1O6LA 1P4FA 1I09A 3NGAA 4F7LA 3ORTA 3OUNB 5IU2A 3KMUA 3F2NA 3G6HA 3ATTA 3ZTXA 2RFEA 3MYGA 5E8ZA 4BCPA 2XBJA 1NVRA 4DLJA 3V5QA 4E20A 4CNHA 2JD5A 2C3IB 3H10A 2XEYA 1KE5A 4KA3A 3NDMA 3W55A 4ONAA 3WZDA 2VTNA 4DINA 3QX4A 5EI2A 5AUYA 2C0IA 2WTDA 3WOWA 3NUYA 4EJ7A 2YDKA 4YHFA 5FG8A 5K5XA 2UZNA 3B2WA 3IDCA 4AWIA 3SX9A 2WQEA 4V0GA 1OL6A 2JAVA 5EQPA 5ANEA 3RINA 4RLKA 3HKOA 3KRWA 4U97A 4IZ7A 2XEZA 2A19B 4RA4A 4DTBA 4K18A 4W4YA 5FGKA 2I0YA 2BR1A 2X7GA 2WQBA 4RWKA 5KMIA 3PDTA 2AYPA 2FH9A 3HAMA 3TZ7A 3S1HA 2ZYBA 4IVBA 3PRFA 3H9OA 1CDKA 4DC2A 5D7VA 5I0BA 3MH0A 3IW5A 4G3CA 2B53A 3LJ0A 2VX0A 3FZSA 3P7BA 3W2OA 2CGUA 2VTSA 3ZONA 4QP8A 3DTWA 5ANIA 5HIDA 5JZNA 4CFVA 3UYSA 4O7VA 2ITPA 4CGAA 4EQUA 5D7AA 2ZV2A 3CXWA 2GS6A 3PPZA 4DEGA 5M4CA 4M12A 3QRTA 4XP2A 5M51A 5HG5A 1WFCA 4A07A 4CCUA 4FSYA 4KD1A 3H3CA 2H34A 3BYVA 2BCJA 2J9MA 3BLQA 2OJGA 4CRLA 1PXOA 1PMUA 1VR2A 3VBQA 5CEPA 3PP0A 4FT0A 4Q5EA 3FI8A 4O0SA 4I4FA 3ITZA 3O8PA 3K5UA 2F57A 3EQCA 2JBOA 3POZA 2RIOA 4BWXA 3RK9A 4IJPA 1LEWA 3F9NA 2YA9A 4MWHA 5DRDA 3A61A 4I24A 4FTLA 2ITOA 4I93A 3E3PA 2C6EA 2F2CB 2ZM3A 4MBLA 1UVRA 5ANDA 5FXSA 5CXZA 4PDOA 4IZAA 3IW7A 4G3EA 3UQGA 3LZBA 4EOSA 4PWNA 3QUPA 4UALA 3RWPA 3OP5A 4EQCA 2X39A 3ZEWA 4PRJA 3QTXA 4OW8A 3MY1A 4C4FA 1OIQA 2UZWE 4FA2A 3VUGA 3DKFA 2W0JA 3A8WA 3NW6A 3O7LB 3KMWA 1FGIA 3C5UA 3IDPA 4ZSGA 3VF9A 1JNKA 4RJ5A 3E8NA 4BDEA 4XJ0A 5I4NA 2GQSA 3FY0A 4X2GA 5E8TA 4EK6A 2F7EE 4FKUA 4BB4A 2R2PA 4YJRA 5KKRB 3ATSA 3KREA 4C62A 4RJ4A 5GNKA 4AN9A 2JDTA 4BDFA 4E93A 1R3CA 4D5KA 4I21A 4DCEA 5CAOA 4A7CA 3TNIA 4GV1A 3A7HA 3HMOA 1PYEA 3Q53A 2ZDTA 3PXFA 5I3OA 4O27B 3NNXA 3PRIA 3R7YA 2HZNA 4PNIA 4BN1A 5K4IA 1BLXA 4FTNA 4P2KA 5EH0A 5LARA 3DBFA 5HX6A 3FZTA 4OBQA 2UW8A 5BMSA 3FPMA 4KS7A 2HW7A 4YC6A 1UWHA 5E8WA 2VO6A 5AP7A 4DT8A 2XRWA 3P0MA 4LV5A 1JKSA 1R0EA 2WZJA 4JVGA 5ANJA 2VWZA 2J5FA 3UQCA 4IWDA 3H30A 4M69A 5A6NA 5CI7A 3R9OA 4FOBA 4RIOA 3IW4A 2P55A 1FINA 4BDHA 3NVMB 4QYHA 3VRYA 5LVMA 1V0OA 2CKQA 4FTAA 2GSFA 1AQ1A 2W1CA 2PUPA 5HICA 1O6KA 2YAAA 3IS5A 1BI8A 3GEQA 4EOKA 2XIRA 1G5SA 1M52A 4ASXA 5FM2A 3FQHA 3IDBA 4TNDA 1P2AA 4CCBA 1HCLA 2WTCA 4CTCA 3TZ9A 3QQKA 3VS0A 5AUZA 3AOXA 4UBAA 5GJFA 4D4YA 4LUDA 2BAJA 4A9TA 4O0XA 3VHEA 3ZZEA 3C4WA 4FKQA 1SNXA 1YVJA 4QMNA 1ZOGA 4U3ZA 2ETRA 5BUEA 1PYXA 2QOIA 1XR1A 5FM3A 5HTIA 1LEZA 3HMMA 4FKJA 2W05A 1H1WA 4DEIA 3S95A 4I94A 3UNKA 1FQ1B 1JWHA 3HL7A 3HRFA 5JN2A 5L8LA 1Y6BA 3PVWA 5T68A 2W1DA 2YITA 4PMTA 3D83A 3DB8A 5E1SA 1UKHA 1OKZA 5C8MA 4IM3A 3UO5A 4UN0C 3WF8A 2XK3A 2ERKA 3HLLA 3Q9WA 2CJMA 4FNYA 4MD9E 3UOHA 2UW9A 3QKKA 4CLJA 2H9VA 5HGIA 5KKRC 3KEXA 2Y6MA 3UP7A 4ZLYA 4IMYA 3QQJA 2NPQA 3HUCA 4JRNA 4U44A 3PPJA 4QYEA 1UU9A 1OPLA 3R7UA 3BRBA 5IUIA 5M4FA 4F6UA 3FI2A 2IW6A 5H9BA 4DTKA 2QI8A 3EFLA 4I0TA 4JQ7A 2WKMA 3LW0A 4PUZA 4EYMA 2B9IA 2DQ7X 3GC9A 3GU4A 5EHLA 4ASDA 2UW0A 2EUFB 4L8MA 3ORXA 2BFXA 3IW6A 3VULA 3NX8A 4IC8A 1Q99A 2GHMA 2PMNX 4CFNA 3TZMA 3S2PA 2QOLA 5L2QA 2Y6OA 4TTHB 3BHHA 4E73A 3D15A 3FBVA 4W8DA 4GKHA 4PTCA 4I41A 3UOJA 4DYMA 5EM6A 5KBRA 1Q41A 1FMOE 4C59A 5L6OA 3POOA 2ZMCA 5EW8A 2UZBA 4FYOA 3PTGA 3BV2A 4TWPA 4WUAA 5BVOA 4GT3A 3M11A 4D4RA 1NVSA 4IZYA 4UY9A 2ZM4A 4TKSA 1SVGA 3NCGA 3QU0A 4XBUA 3V5TA 4C36A 1NXKA 3OCTA 3ET7A 1ZXEA 2VWVA 2ITTA 3V6SA 3P79A 3GI3A 4F7SA 3ZBFA 2V62A 3U51A 3U6HA 3PA4A 2VNWA 3GCPA 3HV6A 2GNFA 3O8UA 4ZSLA 3SC1A 4EONA 2HW6A 3ZSIA 1XH8A 4GG5A 4ZTRA 3G33A 2OXYA 4EH6A 4C3FA 4WG5A 1LUFA 4K2RA 3LFQA 4EQMA 3RBWA 3ZOSA 1ZYLA 1GAGA 2BUJA 4AN2A 5HTCA 4CG9A 3AC2A 2BKKA 5C01A 4XHKB 3V5JA 4RJ3A 3MA3A 3DBDA 4FR4A 3A7IA 5CANA 3PPKA 3HUBA 3EL8A 4FT5A 3MY0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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