3HDMA

Crystal structure of serum and glucocorticoid-regulated kinase 1 in complex with compound 1
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
298
structure length
285
Chain Sequence
QQINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEVFYAVKVLQKKAILVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNSTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFMEIKSHVFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design and synthesis of orally bioavailable serum and glucocorticoid-regulated kinase 1 (SGK1) inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Sgk1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 285
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3hdmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3hdmA01
3VS7A 4NJ3A 2JKKA 3W2RA 1YHSA 2YLEA 3MTLA 4HZRA 4AGUA 3FKOA 4H3BA 4M3QA 4OTWA 2HW6A 4EC8A 5LMKA 3HYHA 3ZONA 2GU8A 5M53A 4C0TA 1JOWB 2WTIA 3FAAA 3C0IA 4FSWA 4R3PA 2VWBA 4NM7A 5AV2A 4IW0A 4Q5EA 5E8UA 4ZJIA 4FSZA 3JYAA 2F2UA 4APPA 4QYYA 5AR3A 1P4FA 5HBEA 4ANMA 3OW3A 2C6EA 3VS3A 4QQTA 2X2KA 5FP6A 5GZ8A 3TNWA 1WBPA 3I6WA 5B2KA 3CBLA 4ZZOA 2X4FA 2F57A 2R3FA 1H8FA 5EYDA 5AUZA 4CYIA 2BZJA 4XRJA 3CKWA 4KS7A 4YZNA 1QPDA 3QAME 4CTCA 3P5KA 1PW2A 5AR5A 5JRSA 2C1AA 1VJYA 3EH9A 3GCPA 4NIFB 1ZXEA 2C3LA 2C69A 2UZOA 2YAAA 3UIBA 2UZBA 2Y8OA 4GUEA 2UW6A 2Y9QA 4MHAA 4NTTA 2QOLA 2W17A 4KUJA 3DAEA 4XV2A 1SM2A 4OTFA 3IPHA 3QRJA 4JG7A 3FL4A 2XCKA 1T46A 3GEQA 4QTDA 4IBMA 3NZ0A 2DS1A 4IZYA 5AV1A 4DEEA 4HGEA 4EOJA 3EQHA 5ANEA 3MVHA 3ZO1A 2WNTA 2DWBA 4U43A 4U41A 4XV1A 3UZPA 3DAJA 4QT1A 2WMBA 1H1QA 4KKHA 3HV4A 3VHKA 5IEVA 2WQMA 2ITYA 3FKNA 1H28A 4HGLA 4IX5A 4ASXA 4O82A 4IB0A 1OKYA 3M2WA 4GK2A 4LGHA 4Z3VA 4FTLA 3QTXA 3C4EA 4CTBA 1JAMA 2F7ZE 4MXXA 5ICPA 2IVVA 5C4LA 4H3PA 5LQFA 1Q5KA 4U7ZA 1OPJA 5IUGA 1R0EA 4D2VA 3TDWA 4A9RA 4B0GA 5AADA 4AOTA 3G9NA 4ZSEA 4DH5A 2W9FB 1XO2B 3OWLA 4Y85A 1PMNA 4KKEA 4ZSLA 3OF0A 3UMWA 5IPJA 5K0KA 2GNHA 2QO7A 4RVMA 5A46A 2W1IA 3G90X 3QQUA 1REKA 2ZJWA 5CSHA 3BYUA 4BCJA 5BYLA 4DN5A 3WARA 4JG8A 5D12A 2X7GA 5ACBC 5HGIA 4UY9A 4BCGA 4Y8DA 2BTSA 1P4OA 2W1HA 3EN6A 3QGYA 1J1BA 4HVIA 3D0EA 4DEGA 3P86A 2UW8A 4U9AA 3IW7A 3AC5A 2XJ2A 4NZWB 4F9YA 2X0GA 5HHWA 4KIPA 5ANJA 5HKMA 4F64A 2OFUA 5AEPA 4MWIA 4S33A 3ANRA 5CAQA 4M0ZA 3LMHA 1U54B 5EKOA 2JLDA 2YIWA 1PKDA 3PSCA 3H30A 1H07A 2OZAA 3R7UA 4CKRA 4CKJA 3GBZA 2X7OA 3HGKA 3OC1A 4ZAUA 3EFLA 3ODYX 2NP8A 5DA3A 5AP0A 3UODA 5DFPA 3ZZWA 5F9EA 4DT9A 3ENMA 1P2AA 3S95A 3PYYA 1S9JA 5M44A 4DGNA 4FT7A 2GFCA 2XK9A 3NIZA 4WNKA 2WMXA 2PYWA 4NM5A 3UG2A 3FMLA 4EBVA 4K0YA 3MIAA 5AP3A 5G6VA 4TYJA 5L8JA 5KHXA 3LM5A 4FIGA 5AJQA 2C5OA 3H0ZA 5AR8A 2DUVA 3KEXA 3LCTA 3NYVA 5DT3A 4E6CA 4WRSA 1W8CA 3ZHPC 4ITIA 4JRNA 4EOQA 5EDQA 2GSFA 2BKKA 5CF5A 4KD1A 5CX9A 4MWHA 2BR1A 5HNIX 4AT4A 3KKVA 3PXRA 4YPSA 4ANOA 3AMAA 3D14A 2CN5A 5KMOA 3G51A 5M56A 4GJ2A 3Q52A 4RJ3A 4RQKA 2YM6A 4OTRA 3TTIA 2QLUA 4QMNA 4CCUA 4FSUA 4CFXA 3R8PA 4EORA 1OIQA 1U46A 3O71A 1Q3WA 3UQCA 5AMNA 4YJTA 3VUIA 2J7TA 1PRYA 1M14A 2R3JA 4HVHA 5HQ0A 3ZSIA 2UVYA 4ZEGA 3HAMA 4JOAA 3UQFA 3R00A 4FNZA 4DGMA 4QYEA 5CZIA 3UQGA 4BTMA 3CLYA 2JFLA 4X6QC 2P0CA 4W4VA 3BX5A 4MNEA 4V01A 3UVPA 3DT1A 3KL8A 3NYNA 2WTVA 4AACA 5EQEA 2UUEA 4CV8A 3QGWA 3EZRA 4TT7A 3EQGA 4WHZA 1G8SA 3RP9A 4XOYA 3FHRA 3QL8A 3QBNA 5H9BA 2R7IA 3ROYA 3NUYA 3VBYA 4R78A 3OCBA 5DN3A 2OKRA 3LCKA 5ANIA 5H8BA 4FKOA 3D5WA 4R1VA 4TZRA 5FRIA 1H0WA 4M8TA 2B9FA 4RWJA 2VX0A 3C0GA 4L45A 2R7BA 2GHGA 2V5QA 3QZIA 2CPKE 2BRNA 2J90A 2JBPA 2BVAA 3RGFA 2FSMX 2JKOA 3A4OX 5KBQA 5CAUA 3AT4A 2YWPA 2H9VA 3JY9A 3WIKA 4EWQA 3VIDA 3DS6A 4CXAA 2Z8CA 4IANA 4EKLA 4XG2A 4WO5A 1OIUA 4F0GA 5GZ9A 3OUNB 1YXXA 3Q53A 5HCYA 2XRUA 1XR1A 2QD9A 2YM8A 5M07A 1W0XC 4I23A 5AAEA 3ERKA 4GV1A 4K11A 1AGWA 5CQWA 1PJKA 5TO8A 3R01A 4BVUA 4C4EA 2J0KA 4U80A 3BV3A 4EHZA 3LJ1A 5B2LA 5HE3A 5HLWA 3FZRA 2Z7QA 3RZBA 1FOTA 3UP2A 3TEIA 5KE0A 3KCKA 1OKZA 4D5HA 3QKMA 2IZRA 2QOIA 2XKCA 4AT5A 3ATTA 3CD8A 2CCHA 5LVLA 4XH6A 4ID7A 1XBAA 2QLQA 2QOOA 5DE2A 5AP2A 1YWVA 4FV0A 5JK3A 3DXQA 2Z02A 4O91A 3DTWA 4A9UA 4ZY5A 3AGMA 3FMMA 4FTRA 2B9JA 3P1AA 5I4NA 5JFSA 4U81A 3BBTB 4RX5A 4CLIA 5J9LA 3QXOA 1KE6A 3VUTA 3JR1A 2VTQA 4IXPA 3PRIA 1YWRA 1ZYLA 3QCYA 1VZOA 4V04A 3A2CA 4GVJA 3LPBA 2BZKB 4G3GA 5CU6A 3HVCA 1R1WA 3KXMA 4BBEA 3CSVA 1NW1A 3TNQB 4AAAA 3E7VA 5LVMA 4ZXTA 2XZSA 2QO2A 3A7FA 4HVGA 5K5NA 4MTAA 3PFQA 3FQHA 3UIXA 2PK9A 2VNWA 4IJ9A 3BHHA 4MX9A 3FDNA 4FVRA 3QXPA 3VW6A 1ZLTA 3WF6A 4BKJA 3F69A 4JDIA 4C2VA 4FSNA 3G6HA 1TVOA 4FUXA 4DC2A 5HX6A 5IZFA 5M06A 2IVUA 4D28A 3PPJA 2FB8A 1JSUA 2HY0A 5EH0A 5TE0A 4AZEA 2ITNA 3BPRA 1YXSA 2IJMA 4HNFA 4W4XA 5A4CA 4XLIA 4C4GA 3RZFA 3U6IA 5FM2A 3R7VA 4ALWA 1PMUA 2UZVA 3P78A 2W1DA 1NXKA 4BKZA 3H0YA 4PF4A 4L68A 4DGOA 1FINA 2BIKB 3GC7A 5EFQA 3ZOSA 4IX6A 2IW9A 4EHGA 3WOWA 1ZARA 4FKQA 4JIKA 4BDBA 3D5XA 2BPMA 4EH4A 5LMKC 3KMMA 4AOIA 3F61A 3BEGA 4YTHA 5BX0A 3KRLA 4RVLA 4G3CA 5EI6A 4X2NA 1UNLA 3FL5A 4LV5A 3KULB 4BDAA 5KMJA 1L8TA 2PUPA 3LXPA 2WELA 3SXFA 2QG7A 2BZIB 2HIWA 2IW6A 2RSVA 1BMKA 2NNWB 2VWUA 4GKHA 4U3ZA 2C0TA 4YR8A 2BIYA 3QCQA 5KNJA 3UC3A 2QU5A 2XK4A 5CXZA 4QP1A 4KIQA 4FNXA 3LQ3A 5HE1A 4TNDA 4QQCA 3CJFA 3VW8A 5IMEA 3NSZA 5LVNA 2BCJA 3TZ7A 5DLSA 3BZ3A 4FIIA 4I92A 3E7OA 5J7HA 4GYGA 4XHKB 1WVYA 1KE5A 4DH3A 1SVEA 3A7JA 3QHWA 3FZ1A 3O50A 1G3NA 1E1XA 1GAGA 1UU7A 2O65A 3D94A 3TIZA 1YI6A 2XK6A 5HE0A 3NCGA 3R7YA 2V7OA 3RI1A 2PHKA 4BDGA 1Q97A 3DB6A 4X7QA 3U9NA 5HESA 4ZTQA 3CS9A 2F2CB 2PMIA 4U44A 4AG8A 4G9RA 5EKNA 1JKTA 2OICA 2C3KA 1CKJA 1HCKA 2G2FA 1O6KA 1OKVA 1WAKA 2SRCA 4MNEB 4YHJA 3NEWA 2PZRA 2QI8A 3U4WA 3W16A 4DEDA 5G1XA 3TI1A 5A4EA 4E5AX 5CAVA 1Q3DA 5IEXA 5I5ZA 3ZUTA 2J5EA 4WIHA 1W98A 4FKTA 2WFYA 3AC8A 3EQCA 4DYMA 4YLKA 2HOGA 3RAIA 3O8PA 4XLVA 5J8IA 4QPAA 2WMSA 4WUAA 2V55A 3PG1A 3K3IA 3KFAA 3QZFA 4GIIA 5C8MA 3KGAA 4GW8A 1H1WA 2ACXA 5I9ZA 5CALA 2PVMA 4XG7A 2WO6A 4UB7A 4AN3A 4KIKB 3PUPA 2CGUA 4DFNA 3AD5A 1NY3A 1H00A 2GQSA 3KREA 4DEBA 4WRGA 3BU3A 4KKGA 4QMZA 2VGPA 4OBPA 3DJ7A 3BQRA 3R0TA 4MQ1A 5HVJA 4F1MA 4JDJA 3FXZA 2B0QA 1UU9A 3DBEA 4ASZA 2IZTA 2F9GA 3SKCA 2UW9A 3QQJA 3R1NA 4ZZNA 3R30A 1TQPA 3IKAA 1UNGA 4YMJA 4FI1A 4GG5A 3HP5A 3SXRA 3W55A 4FTIA 3ZDIA 2XJ0A 3I1AA 3F82A 3QFVA 5J1VA 4O0WA 4R5SA 1A48A 4AX8A 2P33A 3KXNA 5I9YA 4HCTA 5JGBA 4QMWA 2VN9A 2XYNA 2Z7RA 1Z9XA 3ZEPA 4BRXA 4HVSA 3P7AA 2R3GA 2JIUA 2VTJA 4I5HA 1OL6A 4CZYB 2XYUA 4QNAA 2I0EA 3N4VA 2LAVA 1FPUA 4I4FA 3THBA 4G34A 3TUDA 3DOGA 3TUBA 1UKIA 3D7TA 4YUQA 2BROA 5HEZA 2VUWA 4NTSA 3MFRA 4D55A 2CJMA 4BCFA 2W0JA 1WBNA 3QD0A 5FQDC 4Z7GA 4O7YA 3EQBA 4IFGA 3V5WA 3IW5A 4DCEA 3C4XA 4O0SA 5TKDA 4FNWA 3RM6A 2OFVA 2W4KA 4O7TA 3K54A 1OZ1A 3DBCA 3FY2A 2BMCA 4QMTA 2OSCA 5HTBA 4NL0A 3NYXA 4MXYA 1VEBA 3BYVA 2WAJA 3FSFA 1U59A 4RLKA 5ETCA 3ZO3A 2JDTA 2R3HA 2VTSA 4GIHA 2WQBA 4FSQA 2ZMCA 3P9JA 2NRUA 3PVWA 2JAVA 2XK3A 4CVAA 5CVHA 4DFXE 4FT9A 5K5XA 3BU5A 2XNOA 5FDXA 2F49A 4C4FA 2ZVAA 3PXYA 3RK7A 2IVTA 1Q99A 4G3DA 4LOPA 1PY5A 3VULA 3NX8A 4S2ZA 3O7LB 3ORLA 4JBVA 5DIAA 1OUKA 1JQHA 3KXZA 1P5EA 3MGYA 4QP7A 3R9DA 1HCLA 4MNFA 4BBFA 3E8DA 5AP5A 3QTUA 2QOHA 5E90A 2YABA 1PF8A 2O2UA 3MY1A 3MV5A 4FIEA 2HZNA 1YKRA 4G6NA 4FODA 4WKQA 2R3IA 4CSVA 4QPSA 3UMXA 4DF3A 1XBBA 2GTNA 3D9VA 5C1QB 2HZ4A 1BL7A 5JSMA 5DT4A 1H01A 3OXTA 3QQHA 5DI1A 3SDJA 4RMZA 4UMPA 4GK3A 3A8WA 4FA2A 4H3QA 3DKCA 3VUHA 4AE9A 4EQMA 4XYFA 5AP4A 2YDIA 3TG1A 2C6MA 1U5QA 3A60A 2Y6OA 4ORKA 1PXMA 2XIRA 4O1OA 5LOHA 2CMWA 4EOOA 2VTOA 5EM7A 5IEYA 1W83A 2PZIA 2BDFA 4QMUA 3S00A 3JVSA 4MBLA 3GB2A 2R3NA 2ITZA 4O7LA 4BR3A 2G9XA 2QG5A 2CLXA 2UVZA 4X2FA 3KF4A 4E3CA 3ZRKA 5IQFA 5IQCA 2XS0A 1NT2A 1NA7A 4L43A 2UZTA 3BGZA 3ELJA 4AFJA 4DCAA 4F7NA 3FMEA 4IAKA 3LW0A 4FTQA 4QTCA 5IQHA 1Q8UA 2OU7A 4XNEA 5CNOA 4D2RA 3EYHA 4FV9A 4L3JA 5L2WA 4KRDA 4N0SA 1GNGA 2BRGA 3BGQA 5JKGA 3MH2A 4J98A 4OUCA 4FEVA 2NRYA 5E8WA 4L44A 5E8YA 1G8AA 2VWIA 3E88A 3ET7A 3IOKA 4FKIA 3R22A 1YVJA 4CLJA 4FTCA 4TPTA 1KV1A 3R71A 4MF0A 3TTJA 1ZRZA 1YHWA 3PIXA 3RJCA 4ALUA 3HRCA 2XKFA 4HPTE 5L6OA 1X8BA 4XOZA 2YCSA 5ACKA 5CEIA 1FGKA 3TM0A 4MXCA 4JVGA 4FTAA 4KBCA 3Q9YA 4BI2A 1H27A 2BRBA 3OHTA 3V5LA 2IWIA 5AV3A 3ZC5A 4D58A 3F2AA 4W9WA 4JIAA 1VYWA 4TYHA 4IH8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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