5AR3A

Rip2 kinase catalytic domain (1 - 310) complex with amp-pcp
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
305
structure length
279
Chain Sequence
ICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMGGTIIYMPPENYASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Human Rip2 Kinase Catalytic Domain Complexed with ATP-Competitive Inhibitors: Foundations for Understanding Inhibitor Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 279
sequence length 305
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ar3A00
3PXQA 3OEZA 4J8NA 2C30A 2VUWA 4CLJA 4UXLA 5TO8A 4P2KA 3UO6A 3EQRA 4AOTA 4N6YA 3NYNA 2GNJA 4QD6A 4FKOA 4F0FA 5AM7A 4MQ1A 2PHKA 3FZSA 2UV2A 4NJDA 4CYIA 4DYMA 3C5UA 4KD1A 3ZRLA 2W5AA 2YAAA 3M11A 3N9XA 2GFCA 3UP2A 2LGCA 4D4YA 1B6CB 3TUBA 2X2MA 5DR2A 3RBWA 5LOHA 4ANMA 3HDMA 4YSMA 3QTZA 3QWJA 1TQMA 4C0TA 3QRIA 4ID7A 4XOZA 3DY7A 4MXOA 2OI4X 3OT3A 3VRZA 5JGAA 2YJRA 4FSUA 4BB4A 4GVAA 4BI0A 2EB3A 4AAAA 2XM9A 4JDJA 3GFEA 1UNLA 3R9NA 3V6SA 3W2CA 2BDJA 4NTTA 1O6YA 3CIKA 2WU6A 3A7JA 4LG4A 3FZRA 5EM8A 5HVJA 1BMKA 4I4EA 2R7BA 2X7OA 2W5HA 1KV2A 3PG3A 2LAVA 5GJGA 3Q3BA 3W2SA 2VTHA 3WF9A 2GU8A 3VJOA 4J99A 1CKPA 2XNEA 4CKJA 3LM5A 3NAXA 4LFIA 2ITUA 3CD8A 2GS2A 3DJ6A 3KXNA 3EQHA 1CTPE 3G90X 4G3CA 3O0GA 2ZMCA 3UGCA 3V5WA 3VUDA 3PWYA 3LFNA 4G3GA 4IC8A 5DMZA 2O2UA 2VWZA 4FTJA 4GIIA 4F64A 3ZEWA 1FVVA 3FL5A 4GJ3A 5FGKA 3VJNA 5BX0A 5IA5A 5IPJA 4X0MA 3GC9A 3QALE 3UC4A 5EI6A 3SV0A 1UKHA 2ZJWA 2XMYA 4I94A 4IM2A 4MH7A 3OEFX 4C4HA 5AP5A 1E1XA 5AADA 3MH0A 3QC9A 3AXWA 4CMOA 3T3UA 3OCTA 3P78A 4QP9A 4RJ4A 5AIKA 3U9NA 4AXAA 3LFBA 3O50A 5CSWA 2X8DA 3R7YA 3VC4A 4M14A 3LQ5A 3VVHA 2Z7RA 3C1XA 2FSOX 4APCA 1KE9A 3BYMA 3IGGA 3ZYAA 2W4JA 3PPJA 3CPBA 3W2OA 2HENA 4MF0A 4FIJA 2O8YA 4BHNA 5L8LA 2XKFA 3AD6A 4JR3A 5EYMA 3CKXA 4TZRA 3NUNA 2VWWA 3EMGA 3LFFA 4IX4A 3QHRA 3DGKA 4PP9A 4X2KA 3FMHA 4HVDA 1QPEA 3KL8A 5AUYA 5IEYA 5HNIX 4FTAA 4I5HA 4CKRA 4GCJA 2CCHA 2WPAA 3EFLA 2CGXA 2DS1A 4MD8E 3QLGA 3A7GA 3O71A 4EK5A 4F9BA 5D12A 5CU0A 2BR1A 1HCLA 2NO3A 4RIOA 4C8BA 2YJSA 4QRCA 4D5HA 5AUXA 2HZ4A 1PMNA 5BVEA 4C58A 4D55A 2BHHA 4DEDA 3WF7A 4YR8A 2EXCX 4YU2A 3U51A 2GPHA 3V04A 2JFMA 4C35A 2AC3A 2OXXA 3KA0A 3VS5A 1V0PA 3UVPA 4IQ6A 3PVGA 3WOWA 2WTIA 5CAOA 2QODA 4LM5A 4RFZA 2X4FA 3EKNA 3I79A 1YI4A 2WAJA 4UN0C 1AGWA 3BBTB 4C4GA 3L8SA 4H1JA 2YM3A 2C3IB 3RINA 3DOGA 3W2PA 3K5VA 4R3RA 1KWPA 5DH3A 3BBWA 1BI7A 3MFTA 3I0QA 2OF2A 4FR4A 4GJ2A 3ZC6A 2B9FA 3O7LD 4XV1A 3MH1A 1FGKA 3MV5A 3NPCA 3OW3A 4W4VA 2EXEA 5H2UA 4GFGA 5HVKA 4TPTA 4F1MA 4NM0A 2HWOA 1OKVA 4TYIA 4M84A 2QCSA 2HZIA 3UPZA 2VO6A 5CT7A 2R3RA 3R9DA 1OL5A 4ASZA 2BZJA 1I44A 3CPCA 4QMTA 5AP2A 1WMKA 3WYXA 5BUEA 4OTFA 5FG8A 4TTHB 3QX4A 4IDVA 4U9AA 5EFQA 5HIEA 5EH0A 4RWLA 3ZSHA 3Q52A 3KF4A 3OVVA 3SVVA 2R3PA 2BRNA 3DBEA 3Q4TA 5ACKA 3HECA 3ERKA 1GY3A 4L42A 5CEOA 4K77A 3MFRA 4EH3A 5HTIA 3I4BA 2DYLA 2O5KA 3AMBA 3E62A 3AG9A 2IVTA 2W1ZA 3NW6A 2WMTA 3QL8A 4TYGA 3W2QA 3OC1A 5E7RA 4BCOA 3W10A 2YITA 2QU5A 3FY2A 4RG0A 3ULZA 4FKTA 3VAPA 5CS6A 5L6PA 2F7ZE 4L7FA 1BYGA 4FV9A 3PTGA 4AW0A 5JRQA 3IECA 1ZZLA 3ET7A 2BAJA 3LVPA 2VX3A 1Q5KA 2UZEA 4YUQA 4Y83A 4MXAA 2X8EA 1LEWA 3LCDA 2JITA 1GZNA 3I7BA 5HG8A 4ZJIA 2YAKA 5IMXA 3EYHA 3LFEA 4AW5A 3EWHA 2YIYA 1DAYA 2V5QA 4WT6A 2G1TA 2PZ5A 3E7VA 2BTRA 4DEGA 2F49A 4OTRA 4YZNA 3HP2A 4UALA 1XH7A 3CD3A 3L9NA 3GU4A 4GK2A 3O51A 4WG3A 3LM0A 3CCNA 5FEEA 4TWCA 3BLRA 4F0GA 5C26A 4BWPA 4QMZA 4P5ZA 1YXVA 2R3OA 5ETCA 3NUYA 4WKQA 3E3BX 3FDNA 4AT5A 1OB3A 2GS7A 5EKNA 2OGVA 2OZAB 4PRJA 5EM6A 1ERKA 3I5NA 4I41A 4OBQA 5CF5A 3LE6A 4FV0A 3F5GA 4FOCA 4YNOA 3ACJA 3BHVA 2F2CB 4ACHA 3QKLA 4XRJA 4GSBA 1ZZ2A 4OR5A 3KK9A 5CEPA 4A9UA 3Q53A 3R1NA 2OH4A 2P3GX 5HEZA 3WBLA 5HLWA 1REKA 2J6MA 4WD5A 2B54A 1PMVA 2CCIA 4FG8A 5M55A 3UJGA 4EK3A 3GU7A 3MA6A 2ZM4A 2F4JA 2J4ZA 1W84A 3O96A 3V5JA 1XJDA 5ANKA 4KS7A 3ZU7A 1M2RA 3QAME 2PSQA 4C34A 5C1QB 4KAOA 5JGDA 4WG5A 3NNUA 3TNQB 3UVQA 3D5UA 1KE6A 5CQUA 1URWA 2QG5A 3DKFA 3VHEA 5H8BA 5EDPA 4O27B 1UV5A 3LCTA 2WQBA 4I5CA 4GT4A 5J5SA 3CLYA 3F5XA 4D2VA 1YDRE 3BU3A 4FV3A 2F57A 4EI4A 5AR3A 2RGPA 3NYXA 2ITPA 4RLKA 5KE0A 3W8LA 3IOPA 2XRUA 2R3GA 3LQ8A 3FY0A 1YW2A 3FQHA 2QR8A 4IADA 4M15A 5CAPA 4JX3A 3MW1A 4IB1A 4YHTA 2UZLA 3BYUA 5CVGA 4AA5A 5JH6A 5AAFA 1CKJA 4FUYA 3VUTA 3W18A 2AUHA 4J8MA 4TWNA 5T68A 4HVIA 4H58A 3SXSA 1OL7A 4KBAA 2Z7LA 2IN6A 4O0UA 4BTMA 5JGBA 2FGIA 4LMUA 3QTXA 4L44A 3H30A 3CR0A 4DH5A 3KQ7A 2QLUA 1JOWB 2VN9A 3IG7A 4A4LA 1Q3DA 2C68A 4OBOA 3VBWA 3PE2A 4DGNA 3PIZA 3D5XA 4CQGA 3QRTA 4G6LA 1OGUA 4R5SA 3I6UA 4Z7HA 3VS1A 3NS9A 2OG8A 2ETMA 2ZDUA 4LRKA 2R3KA 4C2WA 3QA0A 3PJCA 3DT1A 3TJDA 2UZDA 4EK6A 3ETAA 4DFYA 2ERKA 5KO1A 3MVHA 3OMVA 5JFWA 5DT4A 4ZTQA 4TW9A 5FBOA 1RW8A 2W1IA 3BYVA 5E91A 3BV3A 3Q6UA 2XP2A 3A62A 2W17A 3EJ1A 4OLIA 5GZ9A 4AFJA 3WZKA 3I7CA 3HYHA 5AJQA 4DLIA 3QKKA 3BHHA 5EK7A 3UQGA 3VUGA 2HCKA 3KMUA 1UWJA 3OWLA 3QA8A 5J87A 4DH1A 4EWHA 5KKRC 4OTHA 5IISA 1GIIA 1ZYSA 3CQEA 4GMYA 4QMMA 2FSLX 3F3WA 4U6RA 3C4XA 1OECA 5KNJA 2OW3A 4WOVA 3HVCA 1DI8A 2R7IA 3FSFA 4LOPA 3HDNA 3LFQA 5FRIA 4AA0A 4MWIA 5EW9A 3RZBA 3MJ1A 3NWWA 5ETFA 4BIDA 4H1MA 4LYNA 3HRFA 3KF7A 4QYGA 3DA6A 4JQEA 4ZTMA 3R9OA 2ETKA 2VTNA 4D1SA 4F1TA 4L3LA 2QOFA 4MNEB 4AGDA 3QTSA 3VF9A 2JIUA 4MQ2A 5BPYA 1ZARA 2BUJA 3EIDA 4JRNA 4S30A 3FMKA 4O1OA 2YM5A 2YIWA 3UMXA 3UYTA 3ZFMA 1M2PA 1Q8ZA 2HXLA 3QQGA 3JUHA 4YLKA 4YJTA 1Y6AA 4MTAA 3ORIA 4YJPA 5AR7A 3IO7A 4ENYA 5LVMA 2ITVA 3SOAA 3RPSA 2H34A 1DS5A 4PPAA 4I21A 2C6KA 5L6WL 4U3YA 1WBWA 1FMOE 3AC5A 2X0GA 2JEDA 4UZHA 2A19B 2C69A 1PXPA 2XCKA 3NW7A 1PXOA 3EH9A 5I9YA 1H1RA 2CDZA 4ZJJA 5K0KA 3BQRA 4HYIA 3OOGA 5AR4A 5HGIA 3ZFXA 2WMAA 4QTBA 4ACCA 4BBMA 2WMSA 3AC1A 4XYFA 3P9JA 5EHYA 1OKYA 2ZV8A 4R5YA 1WBPA 5CI6A 4TRLA 4EL9A 3LW0A 3FHRA 2BMCA 2BROA 1WAKA 4FTCA 4E5AX 1OMWA 1VYWA 4IAAA 3RPVA 5L2IA 4YP8A 5CSXA 2FSMX 5HO6A 2XJ1A 2GCDA 4JJRA 3JY0A 2R3MA 3OWKA 3ACKA 5M4IA 3PP0A 4RWIA 4FKRA 3DQWA 4G2FA 4QYHA 4U43A 4IM3A 5HIBA 3EFKA 4XP3A 4BGHA 3PVBA 4GT5A 3V5LA 1HCKA 2EB2A 2JKMA 4RGJA 4M68A 3R8MA 3RPRA 4JIKA 1XH6A 5J9ZA 4RC4A 5TF9A 1XBBA 4QTEA 5AAGA 5KMMA 2BFYA 3BWJA 5E8WA 5AA9A 3R71A 4FUXA 4YO4A 4F99A 4FT5A 3KMWA 3ROYA 3E3PA 2JDSA 1PJKA 1SVEA 2YLFA 3AD5A 4O2PA 2J2IB 3IGOA 4DTKA 3FC1X 3EFJA 3QXPA 4F1OA 3MTLA 2VTSA 3REPA 4LQMA 4JXFA 1OVEA 3DTCA 4U3ZA 4WBBB 4EOPA 4QPMA 4PTCA 4GYIA 1LR4A 5T6KA 3HEGA 2GNGA 4FKLA 4C4IA 1ZOGA 4O21A 1WBSA 1Y91A 3BV2A 3A7FA 5BVFA 4HNFA 2IW9A 3UNJA 3EQDA 4I6HA 4XG9A 1YOLA 2XK6A 5HE3A 3WF8A 3LIJA 3MY0A 3P86A 2X6EA 3FKOA 5EOLA 3EFWA 3VUIA 4OTPA 5HX8A 4DGOA 1ZAOA 1J1BA 4CT1A 4U44A 4LOQA 4AW2A 3NR9A 2BZKB 1ZOEA 1OIYA 4FKUA 4BVUA 4NJ3A 2JAMA 1NA7A 1YXUA 4A06A 4L01A 1TQPA 3FYJX 5K5NA 4AN2A 1IEPA 4AG8A 5A6NA 5FBNC 1F3MC 5CXHA 3MGYA 5DGZA 3BGZA 1UU9A 5AX3A 3T9TA 3NCGA 2WTWA 2GHLA 1WBTA 4TYEA 4W8EA 3R7EA 4MD9E 4X2FA 5DRBA 3F61A 3EZRA 5KMJA 1YWNA 4FNWA 3F88A 3OHTA 5DR9A 4J95A 2PL0A 3PWDA 4WIHA 5CEKA 3SLSA 5LVLA 4WNPA 4IAZA 5C8KA 2BZHB 3E8EA 1QPCA 3DV3A 4NH1A 4DEIA 5KBRA 3GCUA 3R9HA 2UW5A 3EQIA 2WGJA 3QQFA 4XG8A 3OUKA 4X3FA 4XG2A 5H8EA 5D7VA 4YC8A 1IRKA 3DKCA 3GOKA 2QOCA 4IX3A 3S95A 2J5EA 1WVYA 1URCA 2GNFA 5HKMA 5L8JA 2ESMA 5CENA 4O1PA 3RKBA 2X7FA 3Q9ZA 4A07A 1KE7A 1ZYLA 3I1AA 2YM7A 3SRVA 2BDWA 1ATPE 3R01A 5HD4A 5G6VA 4QO9A 2XRWA 4L9IA 4YJNA 2A4LA 4GW8A 4OBPA 1EH4A 4OAUC 3ZFYA 2XH5A 3UOHA 4R7IA 2FB8A 2QOQA 3OTUA 4FNYA 4FV7A 4JBQA 5A6OA 1NVRA 5J79A 1H0VA 1U54B 2BPMA 1OKZA 4DFXE 2P4IA 5A4CA 1WBNA 2OXYA 4BTFA 3UPXA 2ZV7A 3SQQA 4BKYA 5E90A 2UZOA 4EZ5A 5EYDA 4USFA 4FYNA 3U6IA 1XQZA 4EKKA 1SZMA 1B39A 4D4VA 1M7NA 5BNJA 5ACBC 4XG3A 3BHYA 3ITZA 3UNZA 4YNEA 1H27A 4CCBA 3HV6A 4KSPA 4IAYA 4O2ZA 4KINA 2C0OA 2C6TA 4O0RA 1H4LA 1UU3A 2XB7A 3DB8A 3RCDA 5C9CA 1JKSA 2X9FA 3H9OA 3FL4A 3BYSA 4FIHA 3HV7A 4QPSA 5DBXA 1S9JA 5EG3A 4IBMA 2PE1A 2WQMA 3GENA 4MXCA 3LJ0A 4NT4A 2YHVA 4S32A 3IONA 1MP8A 1V0BA 2QO9A 3PUPA 4FL1A 3BEAA 4EHEA 4FTMA 3MY1A 4J53A 3RHKA 2FVDA 3F3TA 2OU7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3ORX A;  3R1Y A;  4PL3 A;  4AOJ A;  5BUI A;  5LQF A;  3TT0 A;  3P79 A;  3TAC A;  3D2K A;  3AC4 A;  1WCC A;  4HGL A;  5DG5 A;  1YRP A;  4BCH A;  2WTD A;  3FPM A;  3FLZ A;  3V8W A;  4FV1 A;  4DLJ A;  3GVU A;  4F7S A;  4BL1 A;  4MWH A;  1OL6 A;  3SD0 A;  4XV3 A;  4JX7 A;  3ALO A;  3CTJ A;  3ZXT A;  4CQE A;  4RC3 A;  2IWI A;  3TNP C;  3PZH A;  4XH6 A;  4QMQ A;  4J7B A;  4D2W A;  3HRC A;  1SMH A;  1CMK E;  5AP3 A;  4FBX A;  4RIX A;  4FI1 A;  1GOL A;  4F4P A;  3ZO1 A;  1FOT A;  4AGC A;  2C0I A;  2PML X;  4GK3 A;  1WZY A;  5KBQ A;  2PVK A;  2NP8 A;  3P1A A;  1XH8 A;  1CKI A;  3UE4 A;  2IZS A;  3OBJ A;  4C4E A;  4CXA A;  4JR7 A;  3BPR A;  1BUH A;  2OK1 A;  4RJ3 A;  3RGF A;  3ODZ X;  2CHL A;  5C01 A;  2CMW A;  3WE8 A;  1GJO A;  3B2W A;  5ANJ A;  1Z5M A;  1E9H A;  2VTO A;  2OH0 E;  1WBV A;  1KOA A;  3GOP A;  2GFS A;  4NW5 A;  4XV2 A;  5HO8 A;  3MVL A;  4PNK A;  3PSC A;  3MDY A;  2IJM A;  3DQX A;  3EQG A;  3IOK A;  4L52 A;  3F3V A;  4C2V A;  1J1C A;  2I6L A;  4O0X A;  3ZH8 A;  1Q3W A;  2WXV A;  4AZF A;  4M66 A;  5AV1 A;  5HOA A;  4GVJ A;  3BGP A;  4WUN A;  5HTB A;  4XBR A;  2XNM A;  3C13 A;  4FYO A;  5IEV A;  2IZT A;  4PDO A;  3HV3 A;  3KRW A;  4F7N A;  5IDN A;  3VN9 A;  4OGR A;  3TNI A;  4C4F A;  2V22 A;  5LMA A;  4FG7 A;  3ZDI A;  4TT7 A;  3R7I A;  3ZLS A;  3DK7 A;  3OCB A;  3DAJ A;  1M52 A;  3ZLY A;  4CSV A;  3QLF A;  4DIN A;  4R1V A;  4RIY B;  5EYK A;  1NVQ A;  3GCV A;  4LGD A;  4CEG A;  2PVF A;  4M69 B;  3TV4 A;  4ZSJ A;  1APM E;  1H25 A;  4EOR A;  3LFS A;  3RM6 A;  3TNH A;  2FH9 A;  3BIZ A;  1I09 A;  2WFY A;  2ZAZ A;  4GU9 A;  5FQD C;  4UV0 A;  2HAK A;  2FA2 A;  3P4K A;  4FV8 A;  4IIR A;  5AND A;  5TOZ A;  5HTC A;  5L6O A;  5LXM A;  2WIH A;  3BX5 A;  4GUE A;  4QNA A;  4X2J A;  5JN2 A;  2CN5 A;  5DEW A;  3QQK A;  3EN6 A;  1ZRZ A;  2H6D A;  3F66 A;  3V6R A;  4ZJV A;  2Z7Q A;  5TKD A;  5HU3 A;  2C3L A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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