5CSXA

Crystal structure of b-raf in complex with bi 882370
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
273
structure length
261
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHASETKFEMKKLIDIARQTARGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDNTVKIGDFGLATVKSRSGSILWMAPEVIRMQDPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIEMVGRGSLSPDLSKVRSNCPKRMKRLMAECLKKKRDERPSFPRILAEIEELARE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title A Novel RAF Kinase Inhibitor with DFG-Out-Binding Mode: High Efficacy in BRAF-Mutant Tumor Xenograft Models in the Absence of Normal Tissue Hyperproliferation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 78
structure length 261
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5csxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5csxA01
2FSLX 3EFKA 1GZOA 1OKWA 2WEIA 2WQBA 3TM0A 1PW2A 3DK7A 5AM6A 3KRXA 5TR6A 3FMEA 3GP0A 4H58A 2WTVA 2QU6A 2UUEA 3ZEPA 2C6TA 3C4CA 3GU5A 2YIQA 3RWQA 4EI4A 4FNYA 4DH8A 3FI2A 3ZH8A 3OWPA 4PTCA 2QO9A 1Z57A 3EHAA 4KBCA 5FEDA 5HE0A 3SOAA 2YA9A 2VTSA 3SHEA 3ROCA 3KN5A 3MVJA 3VS2A 4HYIA 4MKCA 2OIBA 4IVCA 2QCSA 2VX3A 1E1XA 3P86A 4GIIA 4PPBA 1BUHA 2YJSA 3EYGA 3EQRA 3PPJA 3UQFA 3A4OX 3HDNA 4DAWA 4W4XA 1AD5A 3EQBA 2BUJA 2VTTA 2WGJA 3QCYA 3OCGA 4K77A 4NK9A 4BCKA 5AIKA 5M07A 2QOIA 3EZVA 3KMWA 3PE2A 4EH9A 5CAQA 5LWMA 2BTRA 5BYLA 4ZMFA 2UW3A 4QQTA 3FHRA 3REPA 3W2PA 4IM3A 5HLPA 1ERKA 3NMUF 4TYIA 4O6LA 4KSQA 4ASXA 3VUKA 3UNKA 4C0TA 4ENYA 3GXLA 3N9XA 4C3FA 5AV1A 1DS5A 2IZUA 5HG8A 4DEEA 5JFSA 3TDVA 1SVEA 3F5UA 1S9IA 4NW5A 3MYGA 3AMBA 3CLYA 5BUEA 4TT7A 4IX4A 4GCJA 3A8WA 1WBNA 4OAVB 2YZLA 4NIFB 2YHVA 2W96B 4NUSA 3TDWA 2PE2A 1HCKA 4BZDA 3P08A 3P23A 3QCXA 3M1SA 3FXZA 3BGPA 3E7OA 4PL3A 1STCE 5EH0A 4RFMA 3KCFA 5TO8A 4BRXA 3LCKA 4U6RA 3TIZA 4FT5A 3CQUA 4FSRA 4ZTRA 3AC5A 2R5TA 1XH9A 3JY0A 4L3JA 3QA8A 4WBBB 2Y6MA 1XH5A 3ZUVA 1BMKA 2Q0NA 2P4IA 1BYGA 4ZZOA 3DBEA 3ID6C 3BGZA 3ZM9A 2XCKA 2R3LA 4L53A 1APME 4NH1A 2XIYA 2UVXA 2IPXA 3QKLA 5AMNA 2GQRA 2IW8A 2HYYA 3R9OA 1JSTA 4KNBA 4M69A 3CBLA 1URCA 3QYZA 4IMYA 4F6SA 5CANA 1J7IA 4FG8A 4FEWA 3QRTA 5DR2A 3HP2A 1U5RA 1YI3A 3D9VA 2Z7QA 5FRIA 4CZYB 4QMYA 4DT8A 4MXYA 3IDBA 2BCJA 4ASEA 4D4YA 3ITZA 1U59A 3ORZA 4TWPA 1ZYDA 2PVLA 2UZLA 4R6VA 2VGOA 4EBVA 2R4BA 4QNAA 5F94A 2X81A 4ACDA 2PVHA 4HJOA 4TKSA 5HORA 2H6DA 3GI3A 4FNZA 3UQGA 4DFZE 4JQ7A 4MD8E 2PVJA 3BYVA 4JX3A 5AUTA 3OWJA 3WYYA 2GNIA 1QMZA 3HX4A 4X6RA 4KIKA 3UVQA 3ZFXA 5LMBA 5KMNA 3BYMA 3LW0A 5D9HA 3PDTA 2GQSA 2KTYA 3F5GA 1Y6BA 2PU8A 2WMAA 1J91A 3PY0A 3E8DA 4L67A 1T45A 4L8MA 5C4LA 2ACXA 1LR4A 3LM5A 4I1ZA 4Z9LA 5LMKA 1YI4A 3BLQA 3KVWA 3QC9A 4O21A 3EWHA 3GVUA 5H8BA 5HBEA 3R7OA 3VRYA 1YRPA 2WQMA 4LM5A 5HCZA 4IAFA 1R3CA 4ASZA 4ZS0A 3OW4A 3MH3A 1GY3A 1TQIA 2ONLC 4IEBA 1GJOA 4AS0A 4HVSA 2CSNA 1GIJA 4QPSA 5CEOA 4ANOA 1B6CB 2DWBA 3U6JA 3WZEA 3P7CA 3D14A 3LIJA 3WIKA 2HXQA 4RX5A 3ZFMA 4YZ9A 5K4IA 3B2TA 4O27B 4AZSA 3DBCA 1B39A 4BC6A 2F7EE 4E4LA 4G5PA 5H8GA 1VYWA 1OL2A 4O38A 3HV4A 4WG3A 4EH8A 2B1PA 1JKTA 3UVRA 1PKDA 4CMTA 3DB6A 5E8SA 3ZSGA 4BDEA 4FKRA 4AX8A 5HCYA 5IQBA 3LQ5A 2CCHA 3VS7A 2BZKB 1XBCA 2R2PA 1Q61A 1ZOEA 3I4BA 3L1SA 4M67A 4MVFA 3W55A 5DNRA 4ZMEA 4B99A 2GPHA 2F2CB 3EFWA 3KK9A 5JMSA 3POOA 3FQEA 1KE6A 4ZTLA 2OJGA 2VAGA 3W8QA 4BB4A 2IG7A 5CY3A 5IDNA 3EZRA 3KRWA 4K9YA 3LJ0A 3H9FA 3O8PA 3AC2A 3RTPA 5D12A 2OIDA 4ZLZA 4BBEA 3EQPA 2OZOA 2UV2A 2F4JA 4BY9E 2YABA 4FBXA 4I93A 5B2KA 4ANQA 4BDFA 4EHEA 3V8SA 5E1SA 2W05A 4R5SA 3HV5A 1J7UA 3LCSA 4LL5A 2R3FA 4ZJJA 4EHZA 2RKUA 1B38A 2I1MA 3P1AA 3SV0A 3ALOA 4B0GA 5CEMA 2DQ7X 2WMWA 4EC8A 3QHWA 5AV0A 5IZFA 5D1JA 2YDKA 4O6EA 2ETKA 4AT5A 4C8BA 5LVPA 1PYEA 2BIYA 3MFRA 1ZARA 2UW7A 4FKWA 1FGKA 3EQCA 2P33A 2YCFA 3BGQA 3QKMA 4TNDA 4AOTA 2VTRA 4IM0A 4AN2A 4YZCA 2HK5A 4D5KA 4YGAA 4YJNA 1YXXA 1H24A 3C7QA 5DWRA 4AZEA 4RIOA 1GZ8A 2PZYA 5DMZA 5M44A 5EW3A 2BDJA 1LEZA 1QPDA 1OL6A 4TZRA 4NM0A 3CS9A 3LFCA 3OP5A 3Q5ZA 4EUTA 3ZZEA 3OMVA 2W1ZA 1LP4A 1Q8UA 3KF4A 1JOWB 2JIVA 3FL5A 3IW7A 3Q52A 5JRQA 4B7TA 3ZUUA 4FKUA 3UO4A 3MFSA 2WTKC 2W1GA 3TL8A 5A54A 4CVAA 5JSMA 5B7VA 3B8QA 4L3PA 1FVTA 3GFWA 1WAKA 5IISA 4ZSAA 3SG8A 3PTGA 3LQ3A 3R71A 5KCVA 2UZTA 2VTJA 2BAQA 2W4JA 4FGRA 5FUTA 4JNWA 1ATPE 5ANJA 4U3YA 4F1OA 3R21A 3UO5A 2PUUA 4FKIA 4V05A 4L9IA 2DS1A 4YZNA 2JLDA 1OPJA 5HU9A 4K2RA 4CCBA 4K33A 3C0IA 2VWXA 1ZYJA 4RIYB 3DCVA 3OEZA 5K5XA 2OIQA 3HV6A 3SLSA 1UU3A 4U8ZA 4IVAA 4E6QA 5ETFA 5DR6A 4GEOA 4W8DA 2YWVA 4H05A 4P7EA 5BMMA 1ZAOA 2F7ZE 4IW0A 3QRKA 3OXTA 5IH6A 2X7FA 4X2FA 1K2PA 4FV5A 3N51A 1BLXA 1YXSA 2R0UA 3R83A 4DFXE 2VV9A 5FDPA 2JDSA 2Y4IC 2C6IA 3G9LX 3NYVA 4LMNA 3VC4A 4EOSA 4IX5A 3QXPA 4LRJA 4FVPA 2XJ1A 4L46A 4UYNA 4XG7A 4CLIA 5LOHA 2WQEA 4FV1A 3FC1X 2J0IA 5CLPA 3DDQA 1OL1A 5HE3A 3BHYA 3PY3A 4FT7A 4ZTQA 3VUHA 2PVNA 2IVSA 4MD7E 5DI1A 4FKTA 3F9NA 5CWZA 2BRGA 3CSVA 5BYYA 2GTMA 4FTRA 4D1SA 2XBJA 3CIKA 4DH5A 2C47A 2EXMA 5LXMA 2YFXA 1L8TA 4FSYA 4DFUA 3FQSA 4KS8A 2E9NA 3E63A 4E8AA 1IRKA 1WZYA 5HO8A 2E9OA 3R7IA 2RFEA 5FBOA 4EOKA 3D5XA 4HCTA 4F7JA 1OIQA 4BIEA 2EU9A 3KQ7A 4YO6A 2XP2A 4DITA 3ERKA 4LUEA 4XH6A 3UBDA 4A4XA 2CGUA 2HY0A 2QOLA 3MI9A 3MJ2A 3BYUA 2WPAA 4QP4A 4ALVA 4DTKA 3P9JA 2WU7A 4I4FA 3OT8A 4QQCA 4PPAA 2B7AA 3AGLA 3NEWA 5AX9A 3CPCA 5CT0A 5FTOA 3RAKA 1RW8A 5A6OA 5FTGA 5D10A 4U97A 5DN3A 2WQOA 4BTJA 3TKHA 5LCKA 3EB0A 5J9LA 4KS7A 3KXGA 2J0MB 2CGXA 2J9MA 2Z7LA 3ORTA 4JBPA 2V62A 4OTQA 3NDMA 4ID7A 2ZDTA 4GFMA 4IANA 3F2AA 1IA8A 4NM7A 5DG5A 5AWMA 5TE0A 4DHFA 2YM7A 3HRBA 4MBJA 2HY81 3VS5A 5CEQA 4FL2A 4M0ZA 3O8TA 4MXXA 3G33A 3OCSA 4JLCA 4NT4A 4YJTA 4AA4A 5L2IA 4DT9A 4EJ7A 4OTHA 4C36A 3MVMA 4G1WA 4AZTA 3K54A 5CSHA 4UMRA 1W0XC 4W4YA 3EQIA 4JVGA 3MTFA 3UYTA 4YO4A 4USFA 1H0VA 4ZAUA 5KKRB 4HZSA 5H3QA 3W8LA 3ANRA 3O51A 4RVMA 3QTRA 2J6MA 4S34A 2PVKA 5M51A 3SW4A 4DH7A 4AQCA 4BDCA 4CXAA 4FKGA 3NSZA 3NNXA 3LFEA 3TT0A 4O0RA 5E4HA 4U45A 4AW5A 2VN9A 5LMKC 4F1MA 3HMPA 2XF0A 5M06A 3A62A 2FSOX 3I7CA 2BR1A 2YLFA 2AC5A 4NIFA 5CZIA 5HVYA 5JFVA 4DGOA 1R0PA 5IH5A 3LOKA 4GK2A 3PFQA 5T68A 3SGCA 3NVKI 3R8MA 3ZDIA 3U54A 2JBPA 1NVSA 4UV0A 3MS9A 1Q8ZA 4F65A 5DIAA 1P14A 3ENHA 4S33A 4BCIA 4Y72A 4XYFA 4O0YA 4OTPA 1PKGA 5J5TA 4Q5HA 5IQFA 3JYAA 1QPEA 1H1RA 2HENA 1GIIA 4XV3A 4BVUA 4F6UA 1IA9A 3PJ8A 5FGKA 3UJGA 3NVMB 4IX3A 2CDZA 1XHAA 1GZNA 3CGFA 3QGWA 5HD7A 5CF6A 3H3CA 3I0QA 4EZ3A 3MFUA 2VTNA 2UZDA 1PMVA 5AV3A 4IFCA 3VS3A 3PYYA 4S2ZA 2OG8A 2Y8OA 4AFEA 4YTIA 3ANQA 3JS2A 4QP3A 3FLWA 3VQHA 3L9MA 1R0EA 2V7OA 3TCPA 2ZJWA 4BI1A 4E4NA 2OXDA 4QP9A 3U87A 4KIPA 4WSYA 4ZTSA 4C57A 2W1DA 4YJRA 3F61A 4LI5A 5CU3A 4NW6A 5JQ5A 4RIWB 2O65A 5AR4A 1XH7A 1ZOGA 2YM6A 4RX7A 4BDBA 2XKDA 3PIZA 2CNVA 2W1IA 4J52A 3G0EA 5M09A 4M84A 1P5EA 3PA4A 2GCDA 5CF4A 1W98A 4FUYA 1PMNA 5J7BA 4FZ7A 4LGDA 4RZVA 3GU4A 3BEGA 3QQHA 5EYMA 4QYFA 4DH1A 4LOQA 5GIPE 3HRFA 4S32A 3GENA 2XM9A 5EM5A 3G2FA 3TI1A 3WI6A 5F1ZA 5E8YA 4JBQA 2B9JA 1IG1A 5AA9A 1KE8A 1U54B 3ORLA 3VBQA 5EW8A 5AIRA 4G3GA 1JQHA 4FG7A 3FXWA 4RC2A 5L8LA 2GHLA 3ORIA 4I92A 3FMDA 4RSSA 4QMLA 3TNQB 2ZAZA 4CT2A 3F5XA 4X21A 5IA2A 1KE9A 1ZY4A 1XKKA 5AUZA 3H10A 3DQWA 4ZEGA 3WZDA 4UMPA 4WT6A 3UQCA 4IFGA 3RI1A 4S30A 3QQKA 2R3MA 3VBTA 2W1EA 3ZLXA 4F7LA 1T46A 2JFLA 1Q41A 3KXMA 4IAKA 4L42A 4OTRA 2W4OA 1Q8WA 1FMOE 2WELA 4XRLA 3QD3A 3FAAA 4L68A 4APPA 5GINE 3NAXA 3OY3A 1F3MC 4DC2A 3LJ1A 3IOKA 3RPRA 3DB8A 4FMQA 1PXLA 3FLSA 3MIAA 3OY1A 3KEXA 2OJJA 4FI1A 3W2SA 5A4CA 4IVBA 4QMPA 3DA6A 4AU8A 3V6SA 2WMTA 3MJ1A 2QQ7A 3A7IA 5I5ZA 3R9NA 3EJ1A 4IXPA 3ZSIA 5KBQA 2W1FA 5KO1A 5J9YA 3P5KA 4OTDA 1H08A 3IGOA 3RHKA 3QUDA 2XNEA 3UPZA 3GC9A 3Q4CA 4FKPA 2BFXA 2YJRA 4UMTA 4U9AA 4QP1A 2B55A 3S2PA 1YVJA 4MTAA 4W4WA 4APCA 3BHVA 2XK3A 3V5JA 3BU3A 5JGDA 4DTAA 4QMSA 4QQ5A 5M53A 3IW5A 4ACHA 1Q99A 2W9ZB 3MA6A 3G9NA 4WNKA 3DU8A 1UU9A 4ZY5A 2X6DA 4DG3E 4GKIA 3JVRA 4L6QA 5JFXA 5HO6A 3SX9A 4BTKA 4G34A 3OUKA 4O81A 3K5UA 4FIIA 3EL8A 3FWQA 4XP3A 5E7RA 5IA5A 3UOLA 1JAMA 5LVMA 5KMMA 4BCFA 4AN9A 3CCNA 4O7NA 3TJDA 4DFNA 4ZZMA 4BDGA 1IEPA 3A7GA 4GL9A 1W84A 4KRCA 2OICA 3GC7A 3DK6A 4RIXB 2WTWA 5KMOA 1KUTA 1H07A 5IG1A 2W1CA 5HIDA 1IAJA 5CYIA 5IA3A 4U81A 1UWJA 2CLQA 4FGBA 2IWIA 4O7TA 4EC9A 4UWYA 4G3DA 4X7QA 3E8NA 3G51A 4I4EA 4R78A 2BRHA 3FZRA 3KC3A 4C37A 3PP1A 4JDIA 3HRCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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