3R9NA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-21
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
298
structure length
282
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 88
structure length 282
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r9nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r9nA01
2YCQA 2P2IA 2XK9A 3NW7A 3AC4A 2OLCA 4H3QA 1V1KA 4ANNA 2PZYA 3GOPA 2JDOA 4GMYA 3LCOA 4QP3A 1WBTA 2JAMA 3A62A 5AUVA 4L53A 4EZ5A 5IQHA 4RT7A 5HLPA 4G5JA 3LJ1A 3I5NA 4U40A 5I3OA 1LUFA 4ALVA 1W0XC 4AN3A 4YBJA 4C3FA 3MFSA 5C4LA 4PY1A 4YZDA 4L7FA 4XP2A 4AA5A 3O51A 4FSWA 4J8NA 3V5JA 3D5WA 2R3RA 2C6DA 4UWBA 4A9YA 3F6XA 4FZ6A 5AAGA 3W2QA 5CLPA 4FTNA 3ZO3A 3BPRA 5J79A 4FV1A 3OCSA 4EWQA 5CALA 3A4PA 3SRVA 1TQMA 2OW3A 1Y6AA 4FA2A 4NFMA 3DFAA 1U4DA 2XK8A 3EQGA 3C51A 3UQCA 5CVHA 4D4SA 3DZOA 5JFXA 1O6YA 4LRMA 4ASXA 4E5BA 4E6AA 4I5MA 1R39A 2HW6A 1QCFA 2QD9A 3FUPA 4MXYA 4RVTA 4TW9A 4X3JA 5BVFA 2REIA 4H58A 3HUCA 3SXSA 3DTCA 3R7GA 3OHTA 2CN8A 4S2ZA 4QTCA 1TQIA 4EH9A 3C4EA 3KULB 1UNLA 2UW7A 4BI1A 4EK3A 4XJ0A 5J9LA 4IVBA 5TT7A 4DG3E 4F1OA 2B9FA 2F57A 4MXOA 5AP4A 4W4YA 5D9HA 3R30A 4ALUA 3NW5A 3UODA 3QQGA 4WIHA 1JOWB 2A0CX 2UZUE 3NIZA 3UC4A 2GHLA 1Q8WA 4FTOA 2WELA 1M7QA 3R2YA 4HGSA 3FQEA 3NSZA 5AMNA 4AZWA 3I0OA 3PZEA 2QU6A 3PZHA 5LMBA 3KXHA 4MQ2A 3ZUUA 1OPLA 3ZHPC 4GK3A 4MTAA 3HRCA 4J97A 2IO6A 2RL5A 2UUEA 4FKPA 3TUBA 2WMTA 4NK9A 4NJDA 3BWJA 5EDRA 3W16A 2EU9A 3PUPA 1FOTA 3MFTA 3ORTA 4YBKA 2JDSA 3MA6A 2OZAA 4CCUA 1DAWA 1W82A 3EHAA 5EW8A 4BDAA 2OF4A 4FG9A 1YDRE 3HDMA 2YERA 5ETAA 3VBYA 2YHVA 5E8VA 4O22A 1REJA 4FV3A 4GU9A 3GVUA 4X6RA 5HKMA 5I9ZA 1I09A 2PE0A 3ZDIA 3DNDA 5IUHA 5DBXA 4IJPA 3ULIA 3CPCA 3DPKA 3FLSA 2XZSA 3MVHA 3MY5A 3ORZA 3KK8A 4AP7A 4FVRA 4D5KA 4F99A 5GNKA 2X2MA 5L6PA 2BZKB 4R78A 3DJ7A 5LWMA 1QPDA 3K3IA 4PDYA 3DDQA 5CEPA 2IVSA 2X81A 4DEIA 4W4WA 3RAWA 5IPJA 2QOKA 4IAAA 4EWHA 4Y72A 2W4OA 3G33A 2X1NA 3T3UA 1ZMWA 5IA0A 1WVYA 4OTWA 2W1IA 2OXYA 4A9TA 3B8QA 5D10A 3VN9A 4G6LA 3EFJA 4NM0A 2XNOA 2I0EA 1WBWA 4IX4A 3HX4A 4GW8A 4L43A 3LCTA 2A19B 4ASEA 5A54A 2WTKB 3OVVA 5HZNA 3QZGA 1E1XA 3JS2A 4GS6A 5IA5A 3OXTA 4KKGA 1OZ1A 3LPBA 3RK5A 5DI1A 4RIWB 2O3PA 4O21A 2YJSA 4JI9A 4BDBA 4X0MA 2IW6A 4QMLA 2VX1A 2GU8A 3CIKA 2W5HA 4V0GB 4H1MA 1OI9A 2WMXA 4ACMA 2X2LA 3QD2B 4JG7A 5CSWA 3UP2A 2B9IA 4K1BA 4C0TA 2VTMA 4CMUA 3EWHA 1SZMA 4AG8A 1XQZA 5LVLA 4O82A 4RJ6A 4O83A 3R00A 5AM6A 3DQWA 5F94A 4L67A 4HOKA 1ZOHA 2QOIA 3TNPC 5L2WA 3R63A 5A6NA 3E88A 3REPA 2B1PA 3AMYA 3MTLA 5CYIA 2YIYA 3E8DA 3CEKA 3P7CA 1UU9A 2QI8A 1KE7A 2DYLA 3ZFMA 4FK3A 3LFBA 2E9NA 4PMMA 2YAKA 3SV0A 3A99A 3PE1A 4B9DA 5DLSA 5HTBA 5E8YA 5CXHA 3UMWA 4ZZNA 3KRWA 3GENA 4WHZA 4GJ2A 3EL7A 4P90A 2WXVA 3OCTA 4FTKA 2ITWA 4EOJA 2UW9A 3WARA 3D83A 5A4TA 1AGWA 4WNMA 3UYSA 4JVGA 5L2TA 3KQ7A 3IDBA 3QD3A 3OTVA 4XEYA 1BX6A 3D2KA 3II5A 3NNXA 4G3DA 4FX3A 3EQPA 3EIDA 2ETMA 1URCA 4XG9A 4KWPA 4Y85A 4O86A 1URWA 3L9LA 4QPAA 3JY0A 2C6MA 3PG3A 5CU3A 3EQDA 1FBNA 3N9XA 3MESA 1U5RA 3KN6A 4UY9A 1OIYA 3VS0A 4DH7A 4DEEA 2QOHA 3RCDA 4E6DA 3DBDA 3L9PA 3QXOA 2XM8A 4AFJA 4XX9A 2NPQA 3G0EA 3VVHA 1YWRA 1BYGA 2E9OA 4Q2AA 2J0IA 3WOWA 3GU7A 2WQMA 2XK4A 4JBOA 5ANGA 4G16A 1GZOA 5FM2A 5JN2A 4BL1A 4UX9A 3WYYA 3DZQA 1IEPA 3FLYA 3ORNA 3UJGA 5AWMA 3EKKA 3SAYA 2YISA 2GPHA 4I5PA 4WNKA 4GKIA 5TO8A 4EEVA 4JIKA 4FOBA 1DI9A 4D4YA 5LVNA 1CTPE 3QKLA 5BVWA 3HMPA 4ZJJA 4IZ7A 4YLLA 2XMYA 3M1SA 1OUYA 3EQCA 1OM1A 2ONLC 2XIZA 1HCLA 2PE1A 4O27B 4MXCA 4EOPA 2PMOX 4D0WA 3NYVA 1OGUA 1NW1A 3O7LD 2W96B 4LYNA 3DGKA 1Q61A 4OTIA 4FI1A 4L3PA 3HGKA 5E8SA 2V0DA 2EVAA 4KIKB 3EN7A 1PXPA 1UKIA 4R7HA 4ZJVA 5DEYA 4UWCA 4JG6A 4LL0A 3W2CA 4BC6A 4EK5A 4F70A 5LQFA 3DKOA 5FWKK 3ZTXA 4AGCA 4W4XA 5FXRA 2BIYA 1OPKA 3FYKX 4FKJA 4YHTA 2R64A 1OBDA 3FLNC 4AN9A 4QP6A 4E5WA 2QKWB 4BZDA 3F2AA 2JBPA 3VBTA 2P3GX 3UIBA 2BALA 3AD5A 2WOTA 4K18A 4F6SA 2QHNA 4JDJA 3KXZA 5T6KA 5JGBA 5AEPA 5FBNC 2VTJA 3U6HA 4LGHA 4F64A 3E8NA 3DAJA 3LOKA 4FL3A 4TYHA 4U9AA 3ULZA 1ZYSA 2BDFA 2GS6A 4JRVA 1OL5A 3QGWA 1DAYA 5AX3A 5CENA 3P08A 3DKFA 3SHEA 2BCJA 2ZYBA 4IIRA 4EH7A 5AAEA 3E64A 3FY2A 3ANQA 3HYHA 3VBVA 4EQCA 3AG9A 4AZVA 3BIZA 3NUXA 4M3QA 3KA0A 4JL9A 2CGXA 3KL8A 3OBJA 1GIIA 4K11A 4O0VA 3S3IA 3VQHA 5JKGA 3UNKA 4ZK5A 4D2VA 2JITA 4ERWA 4FNZA 5DYJA 4EH4A 2OSCA 2BUJA 4TL0A 4QMVA 5HG8A 2X2KA 3H9FA 4G2FA 2W05A 4CT2A 4O0SA 5JRSA 2QODA 3KFAA 2FA2A 5KMKA 3D0EA 4TYEA 3RAIA 1XR1A 3R0TA 5K0KA 4RX9A 2GFCA 3P1AA 4NTSA 3PJ3A 2OJ9A 2I40A 2P55A 2BTRA 3Q2MA 3Q32A 3Q5IA 4O38A 3HNGA 4C3PA 1TVOA 5BMSA 2G1TA 3A4OX 3F2NA 3OWPA 3PFQA 3QTRA 4O91A 3VS6A 3W8QA 3MJ1A 3QCXA 2WQOA 3E8CA 3FSKA 3IQ7A 3FJQE 3OS3A 4K6ZA 3NYXA 4DEHA 2PE2A 1PKDA 4ACGA 3CLYA 4MYGA 4QQCA 2IG7A 3PP0A 5HOAA 1BI7A 3FXXA 1T46A 2BPMA 2OIBA 3IGGA 1BI8A 4FZ7A 4ZP5A 4BCIA 3HEGA 2W06A 3HMMA 3VUMA 4RG0A 4CZTA 4L42A 4HVDA 4TTHB 3QTSA 4X3FA 2VWUA 1RDQE 4FIFA 2JKMA 3ZRLA 3DLZA 5JZNA 4XV3A 4PDSA 2X8IA 4RVLA 1ZLTA 5IA4A 2WMVA 5DOSA 2GNGA 1FVVA 4UALA 3EYGA 4CNHA 1M14A 3UYTA 3ANRA 3T3VA 4KB8A 3FC1X 2W5AA 1XH7A 2VX3A 4AX8A 1YOLA 3WIKA 4E4MA 5L8LA 3FBVA 2CJMA 3LQ5A 1CKJA 4Z55A 4PQNA 3Q4ZA 5E1EA 1KE8A 3CQUA 4OBPA 4OUCA 4S34A 3S4QA 5CAQA 4E6QA 3SKCA 3TV7A 5M56A 5E92A 1MP8A 4IZYA 2VTIA 2OJIA 4XRJA 3OROA 2OIQA 3G2FA 3A7GA 4RFMA 5HBHA 3QZFA 1ZY4A 1X8BA 3GB2A 4YJSA 5CF4A 1KOBA 4O7WA 1R0EA 2NRUA 1CDKA 3CY3A 3V51A 4CTCA 2CKEA 4L6QA 3O7LB 2ZV7A 4M7IA 3ORXA 4NU1A 3V6SA 3ZCLA 3E87A 5BYLA 2XJ2A 2XIKA 3LAUA 5EYCA 3RVGA 2WTCA 2W1EA 3LCDA 2WTKC 3FZTA 2YM7A 5EOLA 2J5FA 4FTMA 5CT7A 4USEA 1H24A 4KSQA 4IM0A 1QPEA 3RZFA 1HCKA 4ASDA 1YXTA 4AW5A 4ZLYA 4BBMA 2Z7RA 4DBXA 2OI4X 1NA7A 3BGQA 3JXWA 4U81A 3RWPA 4Q9ZA 2OXDA 3SC1A 2JFLA 5ETCA 2Z02A 2CDZA 3DS6A 3HZTA 4PX6A 5AR5A 4BDHA 4ZMFA 2JGZA 1NY3A 3BGPA 3GU8A 5EM6A 5F95A 5J1WA 3NUYA 1KOAA 3KREA 4JR3A 4YZCA 2OICA 3LW0A 4A9UA 4U42A 1UNGA 2PVYA 1GIHA 3LXPA 4FODA 2LGCA 1M2PA 5J7HA 4J52A 5LVOA 4DAWA 2C6OA 2XCKA 4FSYA 5CEQA 1JQHA 4K9YA 3DT1A 3EQIA 3RPVA 2PVNA 4FF8A 1Q8YA 2ZMCA 3PXFA 3N51A 4QMPA 3P7BA 4JDHA 4BCMA 4E20A 1MRUA 3QTWA 4HNIA 3RBWA 4RJ4A 3VUIA 3I7CA 4S32A 1MRVA 3ZSIA 3PE2A 4YSJA 4OTRA 4BDKA 5E8ZA 2OG8A 3PA3A 1S9IA 2C6EA 2QOFA 4EUUA 2R9SA 5HVKA 3NEWA 4O2ZA 3WF8A 4PL5A 4GG7A 2R3MA 3RALA 4APCA 5L4QA 4U43A 3P9JA 3OMVA 2PL0A 4L3LA 3MH0A 2JDVA 2Z60A 5L6WL 2ZAZA 2V22A 4KABA 5TOZA 4GYIA 2R3KA 3TI1A 4ZSAA 2YM3A 2B55A 3G0FA 4IWQA 1J1CA 2ZM1A 4BR3A 4IZAA 5D7VA 4ANMA 5KCVA 3VO3A 4X2JA 1W83A 4MWHA 4EOMA 3TXOA 5BUIA 3KVXA 4BCHA 2FH9A 2YIXA 3NNUA 4CLJA 1KE6A 2Y4IB 2ITZA 3Q04A 4MK0A 4TZRA 2C0IA 4GVAA 5AA9A 1L3RE 4P5ZA 3QQFA 3R9HA 4Z7GA 5K9IA 3E5AA 3DXQA 4BGGA 1TQPA 4BN1A 4GUEA 5DH3A 3TNWA 4E5AX 4MBLA 3R9RA 4EHGA 5H8EA 3D9VA 3Q60A 5EW9A 1OL7A 3PRIA 5GIPE 1G5SA 4OAVB 1OL2A 3TV6A 3HMIA 3RHXA 5C27A 1VEBA 2Z7LA 4CRSA 4DHFA 2VTOA 4I6HA 1NT2A 4TNDA 5EFQA 2J0LA 3CXWA 4ZAUA 3R02A 4TWPA 5EW3A 5CQUA 4RJ3A 3C0GA 3BYVA 2WNTA 5TKDA 1J7UA 3MY0A 4DGLC 4EQMA 5AX9A 4RMZA 2C4GA 3UOJA 2SRCA 4YHJA 4FKOA 3A61A 4UN0C 3LZBA 2XNNA 3F82A 4DCEA 1P5EA 4UV0A 3E92A 3LFQA 1NVRA 5D1JA 4EZ3A 4OTGA 2JKQA 4IFCA 1H0VA 4LGGA 3GEQA 4EKLA 4KIOA 1LEWA 2VTSA 4LGDA 4ZTSA 1QL6A 2ITQA 4IAZA 4OT5A 3CTQA 1DM2A 4O1OA 4TYHB 2R4BA 3HDNA 3I6UA 2BIKB 4KAOA 5FTOA 4V01A 2CNVA 2GS7A 5CX9A 3EMGA 5AA8A 4PTGA 3BE2A 3I81A 5F9EA 4FKUA 3DJ6A 4MWIA 5BVDA 5JQ8A 1GIJA 2C0TA 4HGLA 5KMJA 2IVTA 1PXOA 1YRPA 2YCFA 5DFPA 4Z9LA 4BCQA 3R1YA 4EK8A 5CEOA 2WTVA 3R83A 5LWNA 3SXFA 3UNJA 2IVVA 3QRJA 3D94A 3LLAA 3ZSHA 2VN9A 4AT4A 4QQTA 1YDSE 5EDQA 5HNIX 2X7GA 3EFKA 2Z7QA 4FTCA 4UMRA 2O8YA 4ARKA 5C26A 2F7ZE 3BQCA 4WT6A 5FEDA 4IZ5A 4OBQA 4IACA 3PIZA 2X8DA 4HGEA 4O7ZA 2UVZA 4DA5A 3QCQA 3PPZA 2J5EA 3KMWA 4L8MA 4NM3A 4CGAA 2PSQA 4A7CA 3QRKA 4IX6A 4FEVA 3LE6A 3HKOA 2BZIB 3RM6A 2G01A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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