4GSBA

Monoclinic crystal form of the apo-erk2
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
348
structure length
343
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Monoclinic crystal form of the apo-ERK2
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 111
structure length 343
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gsbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gsbA01
3R9OA 4XH6A 3LOKA 4BDJA 4GS6A 3E87A 3H9RA 1M7NA 3DDPA 4JQ8A 3LW0A 4QQ5A 1PXIA 4M69B 5K3YA 3FV8A 5CLPA 3BV3A 4JX3A 2PMNX 2PHKA 3MFTA 5KZIA 1Y6BA 4CKJA 4MNEA 4QNAA 4FSYA 4WNOA 3QA0A 5AMNA 4QD6A 5AUZA 1PKGA 2VTMA 3R71A 3PJ3A 5IKWA 4XV3A 4KD1A 2VTNA 2WMBA 4L68A 4BBMA 4FK6A 2VV9A 2CKQA 4PMMA 3ZXZA 2C6TA 4LG4A 4I23A 1TQPA 3FLWA 1MRYA 2OICA 3COMA 3BLQA 2LAVA 5A3XA 5ACBC 5FD2A 5IMXA 4IDVA 1J1CA 3FLYA 3C5UA 3LJ0A 4QT1A 3EL8A 1Q61A 2YIWA 3GCVA 3VBTA 4RC2A 3ULZA 4D9UA 2OU7A 4IZ5A 3RMFA 3KC3A 4I5CA 4A9SA 2VTSA 3EQHA 2R2PA 4J96A 3PG1A 2Y8OA 1KUTA 2F9GA 4F1TA 3OT8A 5M56A 3RPVA 5CVGA 3W55A 3RTPA 3V01A 3F7WA 5HE0A 5AUYA 2BRMA 4JBVA 3KU2A 3VBYA 4U44A 2HZ0A 4AN9A 2UW6A 4BCFA 3PRFA 4HGSA 4C4IA 3ZSIA 5CANA 1J7UA 4M68A 2YM5A 4DT8A 2BRHA 2FA2A 2YM6A 4NCTC 1YRPA 1H1RA 3UIXA 2BDJA 3VJNA 2V55A 3UJGA 2ZM4A 3FUPA 3COHA 1BUHA 3VVHA 1YWVA 3AG9A 3TNWA 4FSZA 2CHLA 5B0XA 3KRRA 5AUXA 4WIHA 5HLWA 3A8WA 3KK8A 3KXZA 3E3PA 4S30A 3S00A 1H07A 1DS5A 2EUFB 3WE4A 1OECA 3Q4CA 5LMAA 2GS6A 4AOTA 4BB4A 4C35A 3BGQA 1PYXA 2QOCA 2RIOA 2NRYA 5KZ0A 5ETAA 3VHEA 5CT7A 3G9LX 1ZYDA 3Q4TA 3HECA 1LP4A 3KL8A 4ACMA 3ZDIA 4HVDA 1LEZA 2J50A 3NLBA 1WBVA 4O27B 3F3VA 4C61A 4DN5A 5FBOA 3ZC6A 4F0GA 4QO9A 4N0SA 3F5XA 4HVIA 3ZMMA 3BYVA 1ZZ2A 4KIPA 3MVLA 3HEGA 3Q5ZA 4FTNA 3DJ6A 5DVRA 3UIBA 5EQYA 2WQMA 5TKDA 3LJ2A 5HE2A 4C4EA 2ZJWA 3BLRA 3R8UA 1IA9A 3P5KA 2RGPA 1K3AA 1OL1A 4WOVA 3R8ZA 4H3BA 2HY81 2OIQA 5L2IA 2GQRA 4FIHA 4FSQA 3QA8A 4M0YA 3IG7A 3BU5A 4WSQA 4YHFA 3PWYA 5B7VA 3CXWA 4OAUC 1J7IA 4EK4A 2RFEA 3IW4A 5IA2A 1CDKA 4GT5A 4I92A 3VF9A 2J2IB 3SXSA 2XYNA 2J9MA 3OEZA 4RG0A 4TZRA 5A4TA 5CEMA 2GNFA 2XK4A 2Q83A 3SC1A 4PL3A 3NEWA 5BVDA 3MH0A 3MESA 4K6ZA 4ACGA 4YO6A 5HBJA 2OZOA 3DKCA 4WUNA 2W0JA 4RVTA 4YU2A 1PXNA 4KUJA 1OKYA 4UN0C 2JD5A 4LI5A 5HIBA 2BROA 4MEDA 3OUKA 1H1WA 4O0WA 3E3BX 3LQ5A 4QRCA 4K1BA 5BUIA 5CXHA 1J1BA 3BHTA 4O6LA 3VIDA 4H39A 1BX6A 2WTIA 3G2FA 3VNTA 4BDAA 5EYCA 5AR5A 1OPJA 3UOHA 3QKMA 2BZJA 1NXKA 3E63A 3GEQA 4FSRA 2EB2A 2W1CA 2XZSA 5JFWA 5GIOE 2QOFA 2C6MA 2G1TA 3VRZA 3VF8A 3GENA 4YC6A 3W2QA 3QLFA 2UZVA 4LYNA 3HNGA 5AFVA 4HCUA 3RPYA 3DAJA 3G6HA 4ZJVA 2V7OA 4EQCA 2WPAA 5I9UA 2PVYA 4X0MA 5EW8A 4KIQA 3UOKA 3I0OA 4AT4A 5EDRA 4EH3A 2YLFA 2ITQA 4RIOA 2CPKE 3IECA 3HA8A 4YJPA 4NZWB 1SNXA 1OL6A 4EH2A 4MXZA 4BIEA 5FXRA 4QMLA 2X7GA 3PTGA 5JRQA 2C30A 3GU7A 2WEIA 4WA9A 4Y8DA 3HUCA 1T46A 2PE2A 4FOCA 4K77A 2WNTA 4HGEA 2E9UA 3W8QA 4YZDA 4RLKA 4FG8A 4FIEA 4IAFA 4D55A 5ANOA 2BZHB 4BWPA 1YXVA 4XV9A 4CKIA 3R1SA 2XIKA 2XK7A 1MUOA 1JPAA 3WZUA 2JGZA 2I1MA 3H0YA 3D2IA 3I6WA 4FZAB 1CKJA 1GZKA 5DEWA 3FYKX 1JVPP 1R39A 4RRVA 2HXLA 4FKOA 4TTHB 4C2WA 2DQ7X 3FPMA 5KMLA 5KX8A 5IQEA 3D94A 1WMKA 4ZTRA 1TKIA 3R28A 2HENA 3PXFA 4XP2A 3TNQB 1OGUA 4JIAA 1LEWA 4ZLYA 2W1DA 5JSMA 4QMTA 4L3PA 5AR7A 5AV4A 3IKAA 4ZEGA 1FVRA 4GG5A 3IOPA 1Q8UA 1VEBA 4YZMA 4BTMA 4J95A 4ANSA 3Q53A 2VO7A 2VZ6A 3NDMA 4C37A 4GIHA 4EZ3A 4TN6A 2YM4A 4RWJA 4TYHB 4RJ3A 2BAKA 4CMOA 4RFMA 1AGWA 1VJYA 5M06A 2O0UA 4KIKA 4O22A 5JFSA 4DTAA 4KS8A 1SYKA 5AAGA 4W9XA 3VBXA 1XH5A 5AR8A 4ZJJA 3LMHA 5DT0A 2GTMA 2W5HA 3DU8A 3TKHA 1Q97A 4QTBA 3PLSA 4JG6A 4HGLA 4F1MA 1O9UA 2YDIA 3QTRA 4YJSA 5AUTA 3MY1A 2ZV9A 5AP3A 1U46A 3PP0A 4RC3A 3PY3A 5LVPA 1OKZA 5DFPA 4I0SA 1WBSA 3TUBA 2QU6A 2VO3A 3N9XA 5HLPA 3RNYA 3K5VA 5FEEA 3HDMA 3FZPA 3EQDA 2JDVA 5IQHA 3O7LB 4MXYA 4ZSAA 3E93A 3OHTA 2JKQA 1Y8YA 3TACA 3ZBFA 5KCVA 3GCQA 4Q9SA 4F09A 3I7CA 4D28A 4ZS4A 1G8AA 1ZMWA 3BRBA 3WOWA 4WSYA 2H34A 1U5QA 1WZYA 2YIRA 5EG3A 3EKKA 4O7YA 4G1WA 5A4EA 1JKLA 5HGIA 1UU8A 3M11A 4CQGA 3F7ZA 3KXGA 2PMIA 4IC7A 3VUTA 3LMGA 4HZSA 3NVKI 3LLTA 4L9IA 2V5QA 2QU5A 4MHAA 3R9RA 2R0IA 4ANBA 2BALA 5HIEA 3MY5A 3EN4A 1O6KA 1BL7A 2O3PA 3P7BA 4YJVA 3UE4A 3L9PA 3B8RA 4EKKA 3VS7A 2J7TA 2HZ4A 4FVPA 2PE1A 4GMYA 3LFFA 4A4XA 2PUPA 3F2NA 1YXUA 3QZFA 1BKXA 4A9RA 5CEKA 4BDEA 5HG8A 4D2WA 5BYYA 1HCLA 3R7VA 2VWWA 4MD9E 3AGMA 5KMNA 1V1KA 3OCSA 4OTDA 3TJDA 3D7TA 4LV5A 5D7VA 4I93A 4EK8A 5GJDA 4CYIA 1UU7A 2G2IA 4V0GB 4K9YA 3D5UA 4KS7A 5BVFA 3D5VA 1Y8GA 2JKOA 2XA4A 4XOZA 3T9IA 4E26A 2CKPA 2EXEA 3LFCA 3FQHA 5HNGA 5IQFA 3TV4A 3TV6A 3WYXA 4BRXA 3R8LA 1ZOEA 3TEIA 5EI8A 4FEWA 2VX0A 2B9JA 2HXQA 4NUSA 3O2MA 1ZWSA 3MFSA 1QMZA 2GNGA 5L8JA 2CKEA 4QMPA 3DAEA 2W5BA 3MDYA 3OWJA 3PVUA 3MN3A 3R21A 2AC3A 4YUQA 3QALE 3E88A 5CAUA 4CFWA 5GZ8A 2HW6A 3BLHA 3COIA 1A9UA 3EL7A 3JS2A 5J8IA 2GCDA 2G01A 4NWMA 2NP8A 4M12A 4M84A 1JSVA 4U40A 4AZSA 3CQUA 3GFEA 3Q9WA 5C03A 1REJA 3NWWA 2JLDA 4IAAA 4KIOA 3M2WA 5CAQA 5HO7A 4QQTA 4QMVA 2O8YA 1GAGA 4CRLA 5A4LA 3FI8A 2BFYA 2J6MA 2R3IA 1CSNA 1F0QA 4JBPA 4BCMA 3KK9A 4LMNA 3OCTA 3QBNA 4FL3A 4FMQA 2C69A 4FIFA 4YNEA 3ZH8A 4ANLA 5M57A 1TVOA 2PVFA 4RFYA 3VJOA 2IW8A 4DEBA 3ZSHA 3Q5IA 2IN6A 4G6LA 1KV2A 4BTJA 3S1HA 1JSUA 2RL5A 2YM7A 3E8CA 4YZCA 1W83A 2IZTA 4YSMA 4ZSGA 2W1ZA 2XNNA 3DBDA 3QQKA 5ACKA 3VS4A 4EOKA 2ZDTA 1NVRA 1YI4A 4O91A 4S2ZA 2C3LA 3Q04A 3Q9ZA 4EBWA 2YWVA 1PMUA 4U3ZA 5EQEA 3KMUA 5BMMA 4EWQA 3TZMA 1UNGA 3QXPA 2Z8CA 3K3JA 3D9VA 4CZTA 4C4GA 3PPJA 2OF4A 1KE9A 3LIJA 3C7QA 4MK0A 2QHNA 5EH0A 1UKHA 5HU9A 2QVSE 2B1PA 4DBNA 4JLCA 3H9FA 4ACDA 2UZEA 2P55A 3U6HA 4ZTSA 3MGYA 4LL5A 3VUMA 3ZEWA 4MF1A 2XKFA 1XHAA 4Q9ZA 1XH8A 4NL0A 4AXAA 4CZUA 4EL9A 5EI6A 1GZ8A 3AOXA 2EXMA 4BWKA 5J1WA 4NFNA 1PMVA 5LVLA 2I6LA 4NSTA 1PXKA 3OMVA 3QUEA 3R04A 2QQ7A 2R9SA 4FKRA 4OTFA 4XUFA 4PP7A 1YHVA 1JLUE 2FO0A 1R0EA 3QD0A 3L8XA 4FKQA 1JSTA 2OH0E 3GT8A 2RG5A 3F3TA 4WG3A 5J87A 2IZRA 3MB7A 3IS5A 1GJOA 3OXIA 5DRDA 4D2RA 1FINA 3TG1A 2IVVA 2BKKA 4LGHA 3ZOSA 2ITUA 2JAMA 3QKLA 3P08A 4ZOGA 2IG7A 1U59A 3ERKA 4NCTA 4RX8A 3WF8A 1WBPA 2FSTX 5FEQA 4CNHA 4FEXA 4R1VA 3QQHA 4R3CA 4XEYA 5BYLA 3KULA 4R7IA 3CPCA 2QHMA 5H8BA 1STCE 5K0XA 5LMBA 4IXPA 3EHAA 4DH1A 3PSDA 4RX5A 4FEVA 5HG5A 2BRNA 4F63A 2GNHA 4YP8A 2W1EA 4G2FA 4YC3A 4ZIMA 3NMUF 4RT7A 4O7TA 3AT4A 2VRXA 3VBQA 1J3HA 2XS0A 3GU6A 1KOAA 4R8QA 2G2FA 4Q5HA 3VS3A 2OO8X 2UW4A 4EOJA 3QTQA 4EBVA 3FZTA 3TNHA 3NW7A 4XP3A 5CSWA 4G6OA 2P0CA 3LFQA 4BN1A 2B55A 2ITXA 3ENHA 3PXKA 3MIAA 4QPMA 1U54B 3G5DA 1Z5MA 1FPUA 4I94A 5I5ZA 3C5IA 5EHLA 3PIYA 5FP6A 3UNJA 3EFJA 2I0EA 3ZRMA 1G5SA 3SX9A 2OFUA 4ANQA 4BF2A 4LFIA 4FZ7A 1R1WA 4D2PA 3CSVA 4O7LA 4QTAA 3C4CA 4EEVA 3BYOA 2CN5A 3L8SA 4EKLA 2BTSA 4G3DA 2VAGA 4C02A 4QP3A 5I4NA 2QOIA 3I6UA 1YDRE 2OH4A 2W1FA 4FV5A 1OKVA 4FV9A 3ZFYA 4BDIA 3F9NA 4MXCA 4U5JA 4J7BA 4UXLA 3ZBXA 1CKPA 3KN6A 3QCQA 2BAQA 4ZTLA 3OFMA 4GL9A 4DG3E 1JOWB 5IA3A 3OOGA 5CZHA 3FWQA 3KXNA 5C1QB 2VGOA 3PUPA 2HOGA 5E8ZA 4G9RA 3LFEA 4G9CA 1APME 4FSTA 4FTIA 3PE2A 3C0HA 5BYZA 3UO6A 1P2AA 3GOKA 4AGCA 3U4WA 4FKUA 2OWBA 1CM8A 2B9HA 4QYYA 3PJCA 3ITZA 1H1QA 4UMUA 3ATSA 3FMHA 3C1XA 4G17A 5K5XA 4O83A 3NCGA 4LRMA 3KMMA 5IDPA 4KKHA 3WF9A 4B6LA 2V0DA 2C1BA 3C13A 5CF8A 3N4TA 4P5QA 1BLXA 4IAYA 3HRCA 2R3NA 4L52A 4O2PA 4TXCA 4GJ3A 2UVZA 4O0XA 5DRBA 3F66A 3HMNA 4AGDA 1XH6A 5GNKA 4FTKA 5JFVA 4OTRA 5F4NA 3SV0A 4DLIA 3LQ3A 2Y4IB 4CT1A 4YGAA 5IA0A 2DWBA 2QLQA 1H1SA 4FKJA 5HNIX 2R3JA 4C62A 3CD3A 3FYJX 3VUDA 3EWHA 4U81A 4C4JA 3UPZA 2X7OA 2QG7A 2X7FA 5AUWA 4HNIA 1DI9A 4YPDA 3QTIA 4EK6A 5IA4A 3S3IA 3TJCA 1ERKA 3LCDA 2JKMA 3OXZA 3QCSA 3U51A 3ALNA 3AMYA 3FJQE 5IUGA 5BX0A 5L2WA 2HYYA 4XX9A 5CXZA 2H8HA 2ITNA 5HESA 1ZYSA 4I0RA 4EH4A 1ZY5A 3GCSA 4EOQA 1URWA 4XG4A 5JGAA 2XB7A 4EORA 3BHUA 3I79A 4HJOA 3E7OA 3BYUA 1LR4A 1BI7A 3UBDA 2JBOA 2IVUA 3D14A 4XRJA 2J0LA 3W2CA 2X39A 3U6JA 3R7OA 3UG2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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