5AUUA

Crystal structure of dapk1 in complex with luteolin.
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
276
structure length
274
Chain Sequence
TVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAESLTEEEATEFLKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structural Insight into the Interactions between Death-Associated Protein Kinase 1 and Natural Flavonoids.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Death-associated protein kinase 1
total genus 88
structure length 274
sequence length 276
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5auuA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5auuA01
4JQEA 4APPA 3PE1A 2GDOA 3QC4A 5IH6A 3S0OA 4ACGA 4FNYA 4FTUA 5BUJA 4R5SA 4KINA 2ZMCA 4J95A 4D0WA 4DEDA 5CANA 1OI9A 3CSVA 2P4IA 4TY1A 3CIKA 2XMYA 2Z60A 3HMOA 1XBAA 4C4FA 5E8SA 1UKIA 4IIRA 4O82A 1YXSA 5M53A 2Q83A 3R8PA 2GHMA 4GFGA 2GQGA 2VV9A 2G2FA 4EH9A 2C69A 4YTIA 4F6WA 2C47A 3U4WA 1NA7A 1J7UA 3FPQA 4AQCA 2ZYBA 2OJIA 4LUEA 2R3GA 4XNEA 3I0OA 3EFKA 1SM2A 2XK8A 3MA3A 3HV4A 5BYYA 3LJ2A 2HENA 2PVJA 5H8GA 4MAOA 2CMWA 3NZ0A 3MFUA 4FZAB 2W1ZA 3KXNA 4EHZA 2CSNA 4MNEB 4ZLYA 1YXVA 4FSQA 3FQEA 4WKQA 5HBHA 5JGAA 3FZRA 4BYJA 1OM1A 2GNJA 2JAMA 3V5TA 5BQ0A 4PF4A 4XLIA 5IQBA 3JXWA 5AAGA 3QRUA 5DRBA 2OU7A 4YJTA 3V8TA 3PA4A 1ZMUA 2F7EE 4X3FB 4G9RA 4W9WA 3AT2A 5BVNA 2B9IA 4A07A 3AD6A 3LM0A 4GEOA 4EK3A 4AN3A 5AX9A 5ACBC 1KUTA 3QBNA 2VGPA 2YIQA 3VBQA 3WZJA 3ZUUA 3UMXA 3OY1A 2XEYA 3OWKA 2VX3A 2XNEA 4YZBA 4DH1A 1XH6A 2FSTX 1GAGA 2J5FA 2WTWA 2ZMDA 5DHJA 4FTTA 3LXNA 4C7TA 1L8TA 3QRTA 5D11A 5DIAA 3TKHA 3AT4A 3ZZEA 2PUUA 1BLXA 2VWUA 3TACA 1YXXA 3NNUA 4QNYA 4DG0E 3KC3A 3C5UA 1P4OA 5C4KA 4O7LA 2CDZA 3BE2A 1WBWA 3EH9A 3IOPA 5CAOA 4I5MA 1LP4A 2OH4A 5B2KA 1CTPE 4ANNA 3DZQA 4FT7A 3CY2A 3UQFA 5BYLA 2QR8A 4IDTA 2CJMA 3R71A 4FEVA 1X8BA 1OIQA 2PZYA 3TZ7A 3KCKA 3LJ1A 3EQPA 4BKJA 4ZEGA 5IDPA 3UVRA 2PSQA 4BDBA 2R3IA 3Q9ZA 3QAME 5KX8A 3UOJA 2BFXA 1U46A 1UU8A 4JDIA 2F2CB 4XOYA 2ZDUA 2EXEA 3FI4A 3U9CA 3VW6A 1KOAA 4E8AA 4A9SA 3U6IA 1RE8A 5B0XA 5KMJA 4MF0A 4OTIA 2EB2A 3WIKA 4XG4A 3HVCA 2VRXA 4A06A 3NYNA 4PDPA 4ASDA 1JKSA 1URCA 4U41A 4BIDA 4IJPA 4EYJA 2UZVA 5CU0A 2C6LA 3ORZA 3FSKA 3M42A 4KRDA 4LRKA 4ACMA 2X9FA 4YTHA 2VTQA 4R77A 4OR5A 4RVLA 2YAKA 4DAWA 5JFWA 5IQDA 2NP8A 3QQFA 3QTZA 4IVDA 4MYGA 3EFJA 1JBPE 2XIRA 4YLKA 1QMZA 2WIPA 3G51A 2NNWB 3IKAA 2C6DA 3UVPA 4HVDA 4TL0A 3GB2A 5FLFA 3RPOA 2G01A 2QO2A 3ID6C 3WBLA 4O6LA 3KQ7A 3FUPA 4ZY4A 4AT5A 2H8HA 1UVRA 3F5PA 4DCAA 3O8UA 4K77A 3S1HA 4DEEA 5L6WL 3LFDA 3MVMA 3FC1X 3RHKA 2CGVA 4O7VA 4LGHA 4D28A 5HVKA 4I94A 3ZXTA 4FSZA 5E8XA 4D58A 3PIXA 3PLSA 2FSMX 4LQMA 4EONA 3TNQB 5AEPA 4ZLZA 4YSJA 3LKMA 5AR2A 4AOTA 3NYOA 4JAJA 4OBOA 3NVKI 5A46A 3QLGA 1WBNA 3PA3A 5HTCA 4AP7A 3U6JA 5TO8A 4PTCA 4ID7A 3N4TA 1J91A 3P4KA 4AOJA 3KF4A 3MA6A 2P2IA 5FTOA 3BWJA 1ZARA 2YM6A 3D14A 1SNUA 3DY7A 4G3GA 2OXDA 5ETFA 2C0OA 4TYHB 1NXKA 4RWLA 4F99A 1XH5A 2R3KA 3QXPA 1O6KA 2XJ0A 4KIOA 4RG0A 3U4UA 3PRIA 4AZWA 1PRYA 4WNOA 1OIRA 1M2PA 2W5HA 2WEVA 4HCUA 3PXFA 3QZGA 2XCHA 2UZUE 3OWJA 1WFCA 2VTAA 4FZDB 2X6EA 2WOTA 4BI0A 2X2LA 3RBWA 4ASEA 3W8QA 2RGPA 2XK3A 2PVKA 2R3JA 3Q9YA 3PP1A 2WOUA 3LFSA 4G6LA 4W4XA 4MQ1A 1PXIA 2X39A 2IVSA 2X7OA 5DE2A 1H1QA 3UE4A 3UMWA 4ZS4A 4PDOA 4BTFA 3FWQA 2WTKC 4OTFA 1H25A 4IJ9A 4TWPA 5E92A 4D2PA 4GG5A 4O84A 1ZRZA 4ZAUA 3G9NA 1MQBA 1ZWSA 1J7LA 4CFUA 3QQUA 2HY0A 2JKQA 3FMLA 1ZYCA 4OTRA 3RPVA 4YURA 4C02A 3DBEA 3SRVB 3DXNA 2GQRA 4KKGA 3A62A 1GNGA 3CQUA 2ZV8A 3LCOA 4JIAA 2ZVAA 3KL8A 4NTSA 4YHTA 2Z7QA 5TKDA 3ZZWA 4AE9A 2VWVA 4C3FA 4C2VA 1Q61A 3Q5IA 4D9UA 5IMEA 3GCPA 5LXMA 5IQIA 3MS9A 2QHNA 1YW2A 3Q52A 4YNOA 4F6SA 4H3QA 5CALA 2W0JA 4L3JA 1OL1A 2XP2A 3V04A 4K6ZA 1Y6AA 3SDJA 2ZV9A 4WNPA 4ZJIA 1H8FA 2QOOA 3LCSA 3QD2B 5IUHA 4CFWA 2PWLA 4OAVB 4WA9A 3WE4A 4FK3A 5M08A 4ZIMA 4X7QA 2YACA 2W1GA 4FL3A 3VJOA 2I1MA 3UYTA 3EN7A 3QHWA 2J0JA 2IJMA 3DAKA 4ZSAA 4PPBA 4K8AA 2O65A 3HRCA 4RWKA 5CVGA 1UWJA 4YZDA 2I0HA 4PQNA 3POZA 3LXLA 4QTCA 5JK3A 3MDYA 5HG9A 4DT9A 4FKGA 4AG8A 2CGWA 4FIGA 4L9IA 4WUAA 4OTDA 4C35A 4YLJA 5AV0A 5TR6A 1SYKA 3E7VA 3RAIA 3BU5A 2VZ6A 4YTCA 1RJBA 5HE1A 2XVDA 2CLQA 5HEZA 1H0VA 1ZY5A 1T46A 1R1WA 2BALA 4HCVA 4RIWB 4CQGA 3AGMA 2BIKB 4J96A 3ZBFA 3HMPA 3P79A 4HPUE 4EQCA 1PXLA 2QHMA 4GMYA 5HTIA 5EOBA 4CVAA 4N4SA 4FA2A 4YO6A 2WD1A 1IA8A 3BEAA 4PTGA 4EH3A 3PJ2A 4OT6A 4R7IA 5EH0A 1PKGA 1B39A 1CDKA 3FJQE 2UW7A 5FM3A 3GVUA 2PMOX 5FDXA 1ND4A 4BL1A 1O6YA 1FGIA 2BDFA 4ZTNA 5L2SA 5A4TA 3VS6A 3OCBA 4K2RA 4QT1A 1U4DA 1WZYA 2YEXA 4GU9A 5EM6A 3PSDA 4ALVA 5HD4A 3W2RA 2UZEA 4GIIA 4DGNA 3SW7A 4XG6A 3DQXA 3AQVA 2GMXA 2QLUA 5HI2A 3LLAA 5K3YA 3P7AA 5KKRC 2XF0A 1R78A 3KCFA 4EH8A 5GZ9A 2CHLA 4I5PA 4RIXA 3TG1A 2Z8CA 3D2IA 3DAJA 3I6WA 5K4IA 2W1HA 5ETAA 5T6KA 4BDKA 3A2CA 3CKWA 4DFZE 3G2FA 3SOAA 4I20A 4IADA 4QTAA 2UW6A 3LHJA 2WTJA 5KZ0A 5IA3A 2YITA 3QGWA 4KA3A 5DFPA 1VZOA 4FT0A 1G8SA 3LLTA 4IB3A 1YI4A 4WRSA 2YIXA 3R00A 3VIDA 5EDRA 4N6ZA 4U81A 3OVVA 3EWHA 4RX5A 5I9UA 1OPLA 2YIYA 1SMHA 3EQDA 4U40A 3HMMA 2WGJA 3T8OA 3O8PA 1Q8TA 5D7VA 5JT2A 2Z02A 5EW9A 4F9YA 1FOTA 1W83A 4FV5A 4FKSA 3RMFA 4MF1A 3EYGA 5IKWA 4CMUA 4R3CA 1FVTA 1OKZA 4YJQA 3Q6WA 1Q99A 1V0BA 4L43A 3ZDUA 2XS0A 3I79A 3MV5A 3MY1A 2GU8A 4BN1A 4HVHA 3IW8A 4CLIA 4MXOA 2V7AA 1KOBA 4QMZA 1PJKA 4C62A 5A4CA 2GNHA 4KUJA 2YM8A 4I0RA 2BR1A 3W33A 1YWNA 2Y8OA 2X7GA 3ZBXA 1H1WA 3D7TB 2HWOA 4AXAA 4F1TA 2HZ0A 3FI3A 4PP9A 2VWWA 4GCJA 1SVHA 3DBFA 4Y5QA 3W55A 3ZO1A 4BGQA 2GS6A 3P23A 2O0UA 3R2YA 4BKYA 4FKOA 4DINA 3RPRA 3R9OA 2Z2WA 5DOSA 1YRPA 4C0TA 3W2OA 1REJA 2FUMA 4UMTA 5LCJA 3M2WA 5HO7A 4ONAA 4F65A 2BHEA 3A60A 3AG9A 4IM3A 5A9UA 3CD3A 4NIFA 2PZPA 2WFYA 3NPCA 2BHHA 1Z5MA 3HRBA 3HDNA 1ZOGA 3DNEA 5IA4A 2R7BA 5JFVA 4FOBA 4J53A 2JDTA 3RAHA 1H07A 4QMPA 4RRVA 4M66A 4MEDA 3HMIA 5C03A 4CT2A 3D94A 5IUGA 4X6QC 4O1OA 2OG8A 3UTOA 2XYUA 2OF2A 3QCSA 4YC8A 5HLPA 3G6GA 3W1FA 3U87A 3PYYA 3TV4A 1YDTE 3NCGA 4I93A 3RALA 3IW4A 2ZV7A 4EH5A 3C51A 2OO8X 2WHBA 4CZYB 5GJGA 2A19B 4C4EA 5J9ZA 3EKKA 4YPSA 4NFNA 5AR7A 3VBWA 2XNPA 3CY3A 3OOGA 5HU3A 5IA2A 4XX9A 3V01A 4DN5A 1SNXA 4B7TA 3OW3A 4FTOA 3LMGA 4RJ8A 2XKEA 2OGVA 4NM5A 4XP3A 4JDHA 1W84A 4IDVA 2PUNA 1P2AA 3OXZA 4GT4A 1TVOA 2YJSA 3L9LA 2W06A 4RIYA 3EZRA 5DPVA 4TWNA 3N4UA 4UYNA 3UZTA 3W2CA 3F82A 1PY5A 3FMMA 4QMXA 5E8ZA 4CLJA 2HELA 1VYZA 4HJOA 5HBEA 4FIEA 1OB3A 2JIIA 3MPAA 3RNIA 5TT7A 4EHEA 3Q9WA 3DA6A 4QMLA 4EH6A 5LWNA 2OJGA 3A8XA 2OICA 5DA3A 4X2GA 3VUGA 3D0EA 4G1WA 4R78A 2CNQA 2XCKA 3IQ7A 4QMUA 2OIBA 3ITZA 2X7FA 4AAAA 4I4EA 5HNBA 2PMNX 2PYWA 3ORMA 3PZHA 3GP0A 1WVYA 4EKKA 3GNIB 2PK9A 4QP7A 4J52A 4TXCA 4X2FA 1RQQA 2B7AA 3QZIA 4G9CA 5I9ZA 4YZCA 2XJ2A 5AUTA 4MNFA 3VS7A 4X2KA 2Q0BA 4NWMA 4OW8A 2RFSA 4TNBA 5CWZA 4BF2A 5IUIA 4CFVA 4FNWA 2P33A 2UVYA 3LMHA 4LOPA 5BMMA 3PJ3A 3PWDA 3DPKA 3Q6UA 3V8WA 4FI1A 1GIHA 3C9WA 2RG6A 2IZUA 4JXFA 2W1IA 3MIAA 4JQ8A 2C0TA 2J51A 3VS0A 4G34A 1GZKA 1WMKA 5FGKA 5L2IA 3P78A 2PY3A 3CTQA 3HV3A 3O96A 4U79A 3G15A 3ZCLA 4XUFA 4I21A 4Y83A 2B52A 1XH7A 3R63A 4FNXA 4I92A 4D0XA 3RNYA 3S95A 4CV8A 3W18A 4CZTA 4U97A 3OCGA 4JG7A 4FT3A 3F69A 5I4NA 5FRIA 2YCSA 5GNKA 3V6RA 5IU2A 3HUCA 2WPAA 4RC2A 3QU0A 4O7RA 4RLKA 4O81A 1MRYA 5ETCA 4GG7A 5M06A 1WCCA 3UC4A 5HVYA 3CGOA 5IEXA 3F2RA 2IZSA 3TNPC 4AN2A 2OIDA 5LQFA 2YZLA 4GV1A 1PMUA 1EH4A 2QKWB 1ZZ2A 4GT3A 4AZTA 3H9OA 2VUWA 3SV0A 4FV2A 3RAWA 3F9NA 1YDSE 3PXZA 4EJ7A 2AUHA 5DR6A 4RPVA 3SXSA 2CLXA 4B8MA 5E1SA 4ANSA 4DFLA 1JSVA 1Q62A 3OEZA 4PP7A 2X6DA 1FBNA 3UP7A 1OKYA 2J2IB 3KRLA 4NK9A 4TYJA 1NVQA 2YLFA 4G5PA 2GNGA 2C3KA 5CY3A 5ANGA 4BBMA 1LEWA 5IQCA 1VR2A 1VEBA 4GVAA 1JWHA 5JFXA 4OBQA 3RK5A 3A4PA 2J50A 5B7VA 4WT6A 1TQIA 4GW8A 2VTIA 2XNOA 3OCTA 3NW7A 5CU2A 3A7HA 5C9CA 3PIYA 4BCMA 3PPZA 4FG7A 3C5IA 4QQCA 2QO7A 2FH9A 3VNTA 2W5BA 4D2VA 4EOSA 4DTAA 1B6CB 2DS1A 4WBBB 3I60A 3IK3A 1H1RA 3OCSA 3OP5A 4BTJA 4J71A 1CSNA 1MUOA 2OIQA 5FTQA 4CMTA 1J7IA 4UN0C 4NCTC 3IGOA 3E8CA 5AV2A 4LOQA 4IAFA 4JBQA 5J1VA 2R0UA 5FXSA 2W5AA 2BAQA 3QTUA 1UWHA 4CRLA 3Q9XA 3CXWA 4JQ7A 3MY5A 5HKMA 2RIOA 2Y6MA 4FE2A 1OKVA 1W8CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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