1OL1A

Cyclin a binding groove inhibitor h-cit-cit-leu-ile-(p-f-phe)-nh2
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights Into Cyclin Groove Recognition. Complex Crystal Structures and Inhibitor Design Through Ligand Exchange
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1ol1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1ol1A01
4RJ8A 3R8ZA 4QMWA 3DPKA 4F08A 1J1BA 3CPCA 3P9JA 1KE7A 4J71A 2GQGA 1QPEA 4WG4A 4ZS4A 5I9VA 3EKKA 2OZAA 2FYSA 3F3VA 1S9IA 4D9TA 4KABA 4OT5A 4GMYA 3IQ7A 3L9PA 2OFUA 4BKYA 2PYWA 4OT6A 2JITA 4QMTA 1YI4A 2PE1A 3L9NA 3UMWA 4ITHA 4MEDA 5B2KA 4CFNA 1Q41A 3MI9A 3GC9A 4QMLA 4D5HA 3NYOA 3EKNA 3FKOA 4FC0A 3TL8A 2PULA 3BYSA 4IAIA 1CKJA 4EOKA 4AGDA 5F20A 4ORKA 2Y4PA 4BBEA 1G8AA 3VBVA 1JKKA 5F9EA 3UDBA 4EHVA 2R9SA 3LFCA 2H8HA 3KA0A 2A19B 2HCKA 1L3RE 5ANOA 3UP7A 1EH4A 2CHLA 4FT5A 3PVUA 3R8UA 4PP7A 3QGWA 4PDYA 3EL8A 4EJNA 5ACKA 3RAKA 4BZNA 4ALVA 4G34A 1GY3A 4RVLA 4I4FA 4FICA 3DGKA 3H9OA 4O84A 3DTWA 1BKXA 3G9LX 3L9MA 3KCKA 3RAWA 4R7HA 3U6IA 3D7ZA 3HDMA 4ITJA 4XBUA 5AA9A 4DT8A 4ZSLA 4R3PA 5CS6A 2R3IA 4EKLA 3GBZA 1B39A 4YJSA 3BZ3A 2QG7A 3D5XA 5M09A 4CKJA 5LWMA 5CU3A 4A4OA 2WIPA 1MUOA 3DZOA 2OH4A 4IC7A 4UZHA 3II5A 4Y5HA 1V0PA 5BMMA 4CLJA 2QHNA 2YDIA 4YHFA 1W83A 2HWOA 3BCEA 5FBOA 5KO1A 2OFVA 3LFFA 4ZK5A 1PXJA 3QHWA 1UWHA 4MWIA 5AIKA 3W2QA 4YU2A 4I0SA 2CGUA 4U81A 3UQFA 4I5MA 4AE9A 4CCUA 3ZDUA 5J1VA 4F7SA 2VTNA 2XIYA 3CQUA 3ZEWA 5IEYA 1GAGA 3ODZX 4R6VA 1XQZA 4LUDA 3ZLYA 1VR2A 3NYNA 3U8WA 3VBQA 3WE4A 1FINA 4DTKA 4BZOA 5BVWA 3DS6A 3VW8A 2BZIB 2C5XA 2JIUA 5AADA 1OB3A 5IA1A 3DXPA 3HUCA 2WMWA 1A9UA 3OEFX 1OL6A 4QT1A 2BAKA 3MH3A 2W1FA 4O0XA 4A9UA 2WD1A 3KFAA 1REKA 3QHRA 4HVGA 1H27A 3QALE 3WIGA 4RT7A 1PXNA 5L6PA 4EYMA 5KHWA 4O7NA 5EI2A 5AV2A 4CGAA 4FNZA 5M06A 3WF8A 4G6LA 3EQCA 4JS8A 5LVNA 4FKVA 2ITUA 1BI8A 3QA8A 4CV9A 3DXQA 2XK4A 3LHJA 4P5QA 4RX9A 5AP5A 4AACA 5IEXA 1KUTA 3NAYA 2NRYA 2PE2A 3Q4ZA 2QOIA 5DIAA 4AZTA 5HVKA 4CCBA 2YACA 2R3MA 3HL7A 5D1JA 4ZOGA 4GKIA 3FZSA 2XA4A 3LLTA 5CAVA 4KA3A 4HGEA 5HG9A 3SV0A 3ZDIA 4BI2A 3QC4A 1OIRA 1XH8A 3MY5A 3KRLA 2HWPA 3RBWA 4KIKB 1J7LA 1NXKA 4O27B 2REIA 3R7GA 4YBJA 5HE3A 5K5XA 4HPTE 1V0BA 5JH6A 1FGIA 2FSLX 1M52A 4CT1A 3KVWA 4A06A 2EWAA 2WELA 3JPVA 1W7HA 2C6DA 3AC1A 3P7AA 3OXTA 5HIEA 4FVPA 4JOAA 4XHKB 3NNXA 4GH2A 3ZUTA 1F0QA 1KWPA 3GU6A 4EOOA 5BUEA 5LXMA 4PDPA 4JVGA 5IUHA 2SRCA 3FQSA 2X7OA 1Q8TA 3PJ8A 3D5UA 3UZRA 2PK9A 3QTUA 3ORLA 3H10A 3MVMA 1UU8A 1NVQA 5M51A 4DE4A 3RK5A 4AFJA 1BL6A 5CT7A 4IM3A 4FYNA 4L7SA 5BYYA 3RVGA 3TKUA 3DBQA 5IMXA 2BALA 2C6TA 3WBLA 2BDFA 3NDMA 4D2TA 3PRFA 4FSQA 1ATPE 3WZUA 4C3FA 4DGMA 4FKSA 2BMCA 1Q8YA 1IR3A 3F3ZA 4J7BA 3CJFA 3PSCA 5ICPA 1JOWB 1BUHA 5F4NA 1VYZA 4ANMA 4V0GB 1SNUA 1YDSE 2PVNA 2YCSA 3PJ1A 3EQFA 1R78A 2ITQA 1Q3DA 1YHWA 2P2IA 3F6XA 3QTQA 3BV3A 3QC9A 4IDTA 4KNBA 4N6ZA 4EI4A 4AU8A 5JZNA 3VNTA 2XEYA 1MQ4A 3R7IA 3VN9A 1XR1A 4HCTA 2XK3A 4HNFA 3ODYX 3VRZA 5HO7A 3C4ZA 5KBRA 2ETKA 4FKTA 3N51A 2ITWA 4ZZMA 1GIJA 4KKEA 1H00A 3E87A 4OBOA 5ANKA 4NT4A 4FEXA 2PMLX 2UW7A 2PHKA 1WBSA 2QC6A 3FMHA 4TYGA 4IAFA 2X8IA 5CYIA 3F2NA 1YW2A 4L00A 4F09A 1K3AA 3BYVA 4GRBA 4X2KA 2ZDTA 4R7BA 2A1AB 4CG8A 4GJ2A 1Q24A 3LFNA 2I0VA 4O81A 4JJRA 4QMMA 5ETCA 3RZBA 4D4RA 4XP3A 4ALUA 4CT2A 5DOSA 1H1WA 2C0TA 2XS0A 4E7WA 5I9ZA 4X21A 4AZEA 4QMYA 2DYLA 3OXZA 5CASA 3R01A 4IIRA 4QYYA 3ZMMA 5KKRC 2GMXA 2P3GX 4UX9A 3R04A 2BTRA 4M69B 2BRBA 4FIJA 4ZY6A 4FKLA 3NW7A 4CXAA 3O7LB 1WCCA 4OW8A 2B55A 3DCVA 5AUWA 4GK4A 2EXEA 4CYIA 1NY3A 3FLSA 3PLSA 1OKYA 4K33A 4MTAA 1DS5A 5M56A 4FV9A 3UNKA 3NSZA 5C4LA 3FMLA 4I41A 2QODA 2X0GA 2W5BA 5TOZA 4FVRA 3TEIA 1JNKA 1U59A 4UMQA 1PHKA 4BCJA 4MD8E 2HZ0A 4KRCA 4F70A 4YC6A 2YLEA 3AG9A 3Q4TA 4PUZA 2FSOX 3QZIA 2ZV8A 2XNMA 3DQWA 1YHVA 1J7IA 2C3LA 2FGIA 3ZONA 4E5AX 3DK3A 3DY7A 3O71A 4XRLA 3LXKA 4O2PA 2WOUA 5A4TA 5I9WA 4L46A 1G5SA 5CAPA 5J5TA 3NVKI 4U40A 2VWBA 3VAPA 2XH5A 5IA0A 4II5A 4YJTA 5HD7A 3FSKA 4TYEA 3RTPA 1U5RA 1NT2A 1KOAA 4NW5A 3D14A 4DCEA 1YWVA 4XOYA 4XRJA 1M2PA 4N0SA 2G9XA 3KL8A 3LMHA 3F5UA 1H1QA 3TJCA 4C38A 1H1RA 1W84A 4CMTA 4W8DA 1NVRA 3GGFA 3G6GA 5L3AA 2ONLA 3EQRA 3A4OX 4FSRA 1DM2A 2XIXA 2XNOA 3PUPA 2X7GA 2YCRA 2CKQA 2OBJA 3ANQA 4XUFA 4DLIA 4CG9A 5HVYA 3ZFYA 4E3CA 3NVMB 1GZNA 2E9NA 2YM4A 3QD0A 2W4OA 5EI6A 5EW8A 2CGWA 4FNWA 4EH7A 4FTNA 3QQHA 5IH4A 1Q99A 2B54A 2R3HA 3HV4A 4FZ7A 5DRBA 2PVYA 3FHRA 3WILA 2BHHA 2OXDA 1H01A 4B8LA 2OG8A 2ZAZA 4L8MA 4BR3A 3F66A 4IVDA 4MNEB 4OTPA 4AAAA 5KX8A 3PWYA 3MIAA 2UVZA 2J51A 3JS2A 5T3QA 3GP0A 3W8LA 2R7IA 3DKOA 4LGDA 5CU6A 4QMQA 4ACMA 3SC1A 4YZBA 4JDHA 4UMPA 4H36A 3ULIA 3FEGA 3SG9A 2VTMA 2IZTA 2I1MA 2QOKA 2R3JA 4MX9A 4RIXB 2YAKA 3D83A 4D2RA 1XHAA 1WFCA 2BZKB 2I6LA 3G90X 3PJ3A 2G15A 4G9CA 2G01A 2KTYA 4J53A 4RBLA 3TV6A 2IVVA 3AOXA 2VU3A 3U51A 2AC5A 4G31A 2W96B 3TJDA 3R7EA 4UMRA 1UKHA 2QU6A 3BPRA 4ACHA 4I6QA 3MJ2A 4JBPA 3MYGA 3VS7A 4XV2A 4C4IA 5EOLA 3UQCA 3VRYA 4FODA 2C5OA 3E5AA 3VVHA 2V22A 4H1MA 4DHFA 3KQ7A 1ZY4A 3ZLSA 3Q53A 3Q04A 3BU6A 4KIQA 4O0VA 4AG8A 3O50A 4RIYA 1X8BA 4C02A 4EQCA 4DG3E 3KEXA 4BDEA 3CEKA 3OOGA 4D4SA 2OF2A 4BTKA 4YPSA 2G1TA 2WMBA 2EXCX 3RM7A 3KMWA 4EOPA 3UOKA 4NW6A 5AM7A 5HU3A 4O7TA 1FMKA 4UWYA 2ZV2A 4D2SA 3OZ6A 3PVGA 4B0GA 3G51A 4WA9A 4WUNA 5K0KA 2BIYA 4ZSAA 3PDTA 5DG5A 4EK4A 2RF9A 3DLZA 4YSMA 5AIRA 4I4EA 4USEA 3KY2A 4XV1A 5AR5A 3ZU7A 4J52A 4BCHA 5J1WA 5CLPA 3I5NA 3I60A 4BDCA 4Y8DA 1H4LA 4BWPA 2ITVA 1WBWA 2JKQA 3Q5IA 4DCAA 2WOTA 2XK9A 4GG7A 4LYNA 5EHYA 3R9HA 4WG5A 3UIBA 4U8ZA 2WTKB 4AN3A 5HO8A 2CN8A 3I6WA 4A9SA 4BCQA 3FZTA 4ZP5A 4F6SA 3E64A 2F9GA 3ZBFA 3SOCA 3LMGA 4F0GA 1P5EA 2VTPA 3MS9A 5AV3A 5TT7A 3D5VA 1JVPP 4K1BA 3ORNA 5C1QB 1H0WA 1TQIA 2WO6A 3OT8A 3W55A 3EHAA 3BGZA 3PA4A 3VULA 5AP0A 4IH8A 5A4QA 3HGKA 2C3IB 3CSVA 5GIPE 3MDYA 4OTWA 3CJGA 2JDOA 4Z3VA 2Q83A 5HORA 2GSFA 5GZAA 4IW0A 4WT6A 4FEVA 3R1QA 3Q96A 2HY81 3BHUA 3DKGA 2WTWA 4QMXA 5FXQA 4HZRA 2R0IA 3BX5A 2VTIA 3A62A 4QMNA 3QA0A 2HK5A 4P5ZA 2UW4A 5CAOA 4FVQA 4JR3A 3CQWA 3R22A 3MWUA 1M2RA 2F57A 1OL2A 4FTKA 3LFAA 1WBPA 1RE8A 1PY5A 2C0OA 4IZAA 5BVKA 1PXPA 4CNHA 4R3CA 2YM3A 3I79A 1HCKA 2WIHA 2UZBA 2ZYBA 3GU5A 5F94A 3VUTA 2H6DA 5FDXA 3LFDA 4AF3A 5IQBA 4D58A 1P2AA 4YUQA 3LFQA 2BKKA 4QYGA 5C9CA 3F3TA 4MQ1A 4J8MA 4RFMA 4CD0A 4M66A 3CLYA 4ZLYA 4BDDA 3C4EA 2JDVA 3LJ2A 4QMUA 4CKRA 4Q9SA 3SRVB 3ZS5A 4RJ7A 3TDVA 3C50A 5CEPA 4TYHB 4NJ3A 3P5KA 4Y83A 4D9UA 2EB2A 3GOKA 3MFSA 5E8WA 4AGUA 2PZRA 4IWPA 4C33A 3QD4A 2JFMA 3PSDA 3T9TA 1FVTA 5M08A 4PNIA 3NUUA 4XJ0A 4K2RA 3UYSA 2VD5A 4BRXA 3S0OA 1F3MC 1O9UA 3ZC6A 2YZLA 4KB8A 5IQDA 3KXGA 3E7OA 3QWKA 2XK7A 4RQVA 3UTOA 4BIBA 4EORA 5HHWA 4JAJA 4DEGA 4GIHA 4FX3A 3VHEA 3DA6A 4TYJA 5ANDA 2F4JA 2JAMA 4LRJA 3UPZA 3HMMA 3KK8A 2B52A 3OY1A 3FY2A 3KRRA 4QP2A 3DBEA 5I3OA 3PY0A 4FKRA 1Q5KA 4QMOA 3P79A 4O0RA 4KIOA 5L8LA 4BCIA 4BBMA 4X2FA 4NFMA 5CY3A 4HVHA 4F1OA 5JFWA 3RPRA 4DA5A 5DT0A 2WMVA 4NM0A 5M4UA 3UIMA 1H24A 4ZY5A 1QMZA 3KN5A 4M67A 4K9YA 3UZPA 1Y57A 4AZVA 4IFGA 2O5KA 4ASZA 4FKOA 4PY1A 5IQAA 4D2WA 3PXRA 3AGLA 4XOZA 4AA0A 5I5ZA 2CKPA 1XO2B 4QMSA 3HMNA 3FPQA 4E8AA 3TUDA 2CMWA 4YPDA 5A4CA 3ANRA 3PVWA 5DFPA 4P2KA 2OWBA 3EQPA 4X3FB 3KVXA 4FTRA 2AYPA 3QFVA 3H30A 3PE1A 4KIKA 3COIA 4O1PA 4YJPA 3RNIA 3FMNA 3GU8A 4JNWA 4AP7A 3LE6A 2PUIA 4O6EA 4UB7A 3CIKA 2R0UA 4FT9A 4G5JA 1Y6BA 2WQEA 3BRBA 4EOSA 4BDIA 2J0MB 2J0IA 4AUAA 5AMNA 5H8BA 3DBDA 4Z16A 5HU9A 3LCTA 5JZJA 4DFZE 4FKJA 3SXSA 4D5KA 3COHA 5IDNA 2C6OA 2XCHA 1OBDA 2B9HA 4IX5A 2RG6A 4I22A 4CKIA 5HG5A 1OUYA 2W4KA 3DXNA 3GEQA 4I5PA 1ZYDA 5LMBA 3DAEA 2VGPA 2UVYA 4FUXA 4FV1A 3UNJA 4L44A 4GVAA 4CVAA 3OUNB 2IJMA 1Y8YA 4FL3A 4FTIA 3VF9A 1PYXA 2DS1A 4FV7A 2W5HA 2YIRA 1QPDA 3HP5A 4B6LA 4DEBA 1BLXA 2DUVA 2F2UA 4L67A 4RVMA 2WEVA 3GUBA 3EQHA 3R2BA 3ZBXA 2ITNA 3G0EA 5KKRB 3P78A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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