3TNHA

Cdk9/cyclin t in complex with can508
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
321
structure length
288
Chain Sequence
VECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTSIYLVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSNRYNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGML
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The CDK9 C-helix Exhibits Conformational Plasticity That May Explain the Selectivity of CAN508.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 9
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 288
sequence length 321
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3tnhA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tnhA01
2XF0A 2W99B 3W33A 1DAWA 2YLFA 1QCFA 1YHVA 2ERKA 4IANA 3S1HA 3TUDA 3DNDA 4RA5A 4F6SA 3HAVA 4MYGA 3QZGA 4YBJA 3EZVA 1Y91A 4YP8A 1YOLA 2OG8A 1ZYDA 2BVAA 5A6NA 3MH0A 3AC2A 1YXSA 2QHMA 5CI7A 5HBEA 4MXYA 4ACGA 3FPMA 4CFMA 3IONA 5HX8A 3KXHA 3I4BA 3LE6A 4RT7A 4F1TA 1PJKA 4D1XA 5CASA 2F2CB 2GFCA 2JFMA 3LXLA 3OOGA 4ZTSA 4ID7A 3COIA 3R9RA 3FYJX 3WYYA 2QKWB 4A7CA 1GIIA 2BKZA 3AMAA 4IWQA 3P4KA 4PTEA 4BGHA 5HE1A 4DAWA 4PDSA 1H08A 4BC6A 5EK7A 1QPDA 3V04A 1M7NA 5L2IA 3DZQA 4L45A 4CFWA 3R8PA 4DEEA 2HXLA 3R83A 3WF8A 3E8DA 4C4IA 1J7IA 2ZM1A 4HVGA 1UA2A 4OTHA 4O84A 4QQCA 3BHYA 2PVJA 3VF9A 3SXRA 3O71A 3G0EA 5CF4A 4IIRA 2P2IA 4JBOA 3GEQA 3OTUA 3KMMA 1H27A 4C4GA 4EORA 5DH3A 2OGVA 4JI9A 4YMJA 4XV1A 1UWJA 4BKZA 3QHWA 4FSMA 2OJGA 2Z2WA 4KKHA 3ZLYA 5M08A 4U40A 2OBJA 3RPVA 4IVAA 5F20A 1YKRA 2X9FA 4JL9A 3EQPA 4OTDA 3FHRA 4S33A 1FOTA 3SDJA 3NCZA 5J1WA 3OC1A 3OG7A 1CKPA 3FYKX 3QZHA 1P5EA 4O0RA 4XBUA 5I0BA 4FODA 1J1CA 5CZIA 3RPYA 4O1OA 3U4WA 4IWOA 2YDJA 3BIZA 4HZRA 4R3PA 5HOAA 3WZKA 5FTGA 3HP5A 5ANIA 1GIJA 2HW7A 2CKEA 3A8XA 3DK7A 3LJ0A 2W1EA 4X2JA 3SOAA 1ZAOA 5L6WL 3GGFA 2NRUA 4MKCA 4XRLA 4BCJA 4C57A 5BYYA 3VNTA 4Z55A 3VC4A 3NYNA 2JFLA 4B0GA 2WAJA 4WOVA 3TZ9A 5AP6A 3R7UA 3BHVA 4FG9A 4EKLA 4FIJA 3QTUA 3DKCA 3FJQE 2W96B 3PSCA 4HYIA 5HEZA 5IUGA 4WUNA 4TL0A 3R04A 3LFAA 4KWPA 2VTTA 1PXIA 4HOKA 5D7VA 5BVFA 1A06A 3R7YA 2J51A 3OP5A 4F65A 5L6PA 4LRKA 1OPJA 1W7HA 3KMWA 3GVUA 3WIGA 4FSQA 2XEYA 5DR9A 5ANEA 3FI2A 3C4ZA 4FA2A 1JPAA 3DAJA 4OAUC 3SVVA 3VF8A 1XWSA 2G1TA 3TDVA 3VS1A 2BTSA 1JKKA 4V05A 1J7UA 1OL2A 2RFSA 2QODA 2J0IA 4MNFA 3RKBA 3TIYA 5GJGA 2W9ZB 5EM5A 2PMNX 4AF3A 5B2LA 2PY3A 2IJMA 3IQ7A 3QLGA 4I4EA 3H4JA 4M12A 4NW5A 4CT1A 3MTLA 2OJJA 3QTQA 3LJ1A 1ZXEA 4YPDA 2F7EE 1XO2B 4KS8A 4FSTA 3IK3A 1XBAA 5CX9A 3EN7A 1WBPA 2IZTA 5L2WA 5HD4A 3UOHA 4O7NA 2VTQA 4BDDA 2P0CA 2XBAA 2YIQA 4V0GA 1GZ8A 1KE7A 1LEZA 4L68A 2I0EA 4I0RA 3PXQA 1OBDA 5A3XA 1L3RE 4E7WA 2CGXA 2H9VA 3BQCA 4PMPA 5C26A 4LUDA 2XNNA 2EUFB 5EDPA 3FLWA 2FSMX 3MVHA 3GB2A 3R1QA 4H3BA 3W2CA 4BI2A 4O7VA 4C34A 3Q2MA 4FIFA 2J4ZA 2B53A 2OW3A 2Y9QA 3GFEA 3Q4ZA 2ZV9A 4BCKA 3F5PA 2XZSA 3MPMA 4HNIA 3W2PA 4BDIA 1R3CA 1SVEA 4NUSA 5DRDA 4CTBA 1UU8A 1OM1A 1PF8A 5E8SA 4XLVA 4KKGA 2EVAA 3PZHA 5ETAA 1IAJA 2ZV2A 3PG3A 1M2QA 2DQ7X 5IQIA 4BWKA 3KCKA 1FINA 4KA3A 3QTRA 3WI6A 5C8NA 2JDOA 3PA3A 5B2MA 3O96A 4YNOA 4RX5A 2CKPA 3ZYAA 4FZ6A 5HKMA 3BU6A 2R0IA 5H8BA 5HNGA 2BALA 2ITXA 4RX7A 4EK3A 3VJOA 4BTFA 4KABA 1ZZ2A 5HICA 2YM7A 4Q5EA 4O6LA 4C4FA 2JD5A 1WMKA 4AZEA 2V5QA 2IVSA 3BEAA 3PVBA 3Q32A 4MNEA 4EWQA 1Y8GA 4IM2A 3EYGA 3LIJA 4YJRA 4CMUA 5K4IA 5C8KA 1M7QA 4HCVA 1RW8A 3GU4A 3MWUA 2WMQA 3NNXA 2B0QA 2VAGA 2IW6A 2IPXA 1WBTA 4QMVA 5I9ZA 4DTAA 2YAAA 1APME 3ZCLA 1JSTA 4RGJA 3VWAA 2GNGA 4MCVA 3GU5A 4BBMA 2VTLA 5H3QA 5HCXA 3AC5A 5M4FA 3PTGA 3E8CA 3ALNA 2CKQA 4UYAA 3MIYA 4U41A 3LFSA 2PVYA 5CEPA 3MBLA 5J7HA 1WBOA 4OLIA 2UZDA 4O0VA 1K3AA 4ACHA 3CGOA 2UZWE 4JIAA 4MVFA 5JFVA 3E88A 4BI0A 3ZRKA 4NM5A 1QL6A 3MIAA 3UG1A 5HTCA 4O83A 3CJFA 1UWHA 2E9UA 3MESA 3CQUA 4AGCA 4YJNA 5KMKA 4PRJA 4YBKA 1ND4A 1REKA 5J79A 4L3JA 4EK8A 2PTKA 4PMMA 4IX6A 3MA3A 4I5PA 2HZ4A 3FWQA 4IQ6A 4EOKA 4F99A 3UDBA 2JC6A 4ASXA 2C6TA 3E62A 4IZ7A 4BKYA 3ACJA 3FL4A 5C27A 1WBNA 5GHVA 3AC8A 5IA0A 1OBGA 3BWFA 5DRBA 4EHEA 2Q83A 2VV9A 4LRJA 3EKKA 1GAGA 4WNPA 2X2LA 1OECA 3R6XA 4BR3A 3IW6A 3QRIA 3RWQA 3ZSGA 4OTQA 4CTCA 2UVXA 3NGAA 4CQEA 5AM6A 1PHKA 4GIHA 4JDIA 3VO3A 4GT5A 3B8RA 4OW8A 1MUOA 4NU1A 3KN5A 4E5AX 5TKDA 3G33A 3VUKA 4LG4A 3PZEA 5ANOA 2VGOA 2XYNA 1GJOA 2Z7RA 2ZB1A 3EHAA 3FMMA 3HMNA 4I24A 5EM6A 3BLQA 3ZXZA 4BFMA 3KRWA 4CD0A 5CF5A 4O0WA 5HU3A 1WVWA 4RLKA 4QP3A 4M66A 3E93A 4AZSA 2R2PA 2VN9A 2IO6A 3EN4A 4EKKA 2Y0AA 4BCNA 3GT8A 3Q52A 4FT7A 4ZTLA 5HQ0A 4WRSA 3ZLWA 3OUNB 2J0JA 2C3JA 1XKKA 3EQGA 3PA4A 3R2BA 5EHLA 4ZY4A 4R7BA 4FZFB 5IQGA 3ANRA 5M51A 1M17A 2DWBA 2GSFA 4BI1A 3QQFA 4IADA 3TKIA 5JMSA 4O0SA 3MVJA 5LQFA 4HPUE 5CI6A 4W4XA 2HCKA 5EHOA 2WMUA 2ITNA 3EN9A 5IQBA 5GINE 3ORTA 1P4FA 4UZHA 4GFGA 1H28A 3TKUA 4BHNA 4MEDA 4RC3A 4DH1A 1Z57A 1GNGA 3Q4UA 5L8JA 4ARKA 2WTIA 2A4LA 5HLPA 1FGIA 2Z60A 3D5VA 3O51A 4QYHA 5CEQA 1PXOA 4U81A 4C61A 2OIBA 2HY81 5DR6A 2C6MA 3SKCA 4TPTA 4EBWA 4EJ7A 3PA5A 5LARA 2XNEA 4NIFB 4RRVA 1H1SA 4DEHA 3KB7A 4MD7E 3ELJA 5L3AA 4QYYA 3DLSA 4WA9A 4O6EA 3Q5ZA 3DXQA 2OICA 4TWPA 5CNNA 3TNHA 2GQGA 3BHHA 3DXNA 3E7VA 3FC1X 3VW8A 3R00A 4IVDA 4CVAA 1KV2A 4G2FA 3GC8A 2BRHA 3MW1A 5C03A 3FKOA 1ZMWA 3ZZEA 3WILA 2PZPA 5KBRA 3E8EA 3KXMA 3NYXA 4B7TA 4UALA 4HVSA 4L00A 1Z5MA 3LMIA 5CU3A 4X21A 3R8ZA 4K8AA 4BYIA 2XRWA 3R9NA 4QRCA 3UC3A 2J50A 4RVLA 5HNIX 5EYMA 4XV2A 2WHBA 3RALA 5HLNA 3CLYA 3HMPA 3EN5A 4RZVA 4AOIA 5LMBA 4KSQA 5FLFA 1Q8ZA 5KZ0A 5AWMA 2VTSA 4I93A 5E8XA 4B9DA 4E26A 1OL6A 4IC8A 4J96A 1WBSA 2YHVA 2HWOA 3P5KA 4FT5A 5FM3A 4QMUA 2Y4IC 3CPBA 3POOA 3PVGA 3AC3A 3K5VA 4YUQA 4ANNA 2H96A 3C9WA 4ZLOA 3T9TA 4ALWA 3COHA 4GV1A 4ZSAA 3ZZWA 3DBEA 5H8EA 4YZCA 2GPHA 3MGYA 4FKIA 3D5WA 3DFAA 4BCPA 4D5HA 5HLWA 3SG9A 4AFJA 1DS5A 2JKQA 2B1PA 4D58A 3MSSA 4QTCA 1FVRA 2YACA 5FEEA 3MDYA 4OTIA 5A4CA 5LVNA 3UQFA 3PVUA 1ZYSA 4RWLA 1S9JA 3SXFA 2VTOA 5AV4A 2JIVA 5LMKC 4NJDA 4AT4A 1X8BA 3MVLA 4ZOGA 2W17A 3UOLA 4UMTA 3SD0A 1J3HA 4G17A 5EW9A 1FQ1B 5KKRC 3KRRA 3NCGA 4FF8A 2I7QA 1JSUA 4H58A 2WTKC 4U3ZA 3LFDA 2C6DA 5D7AA 2YFXA 3BWJA 1XHAA 1U59A 4WRGA 4PDOA 4BYJA 2QOQA 2GQSA 2ZJWA 4CG9A 3DQXA 4HJOA 4WHZA 2XIXA 4CGAA 4KBKA 3BHUA 3G51A 1NA7A 1NVQA 4IVCA 2UZTA 1IR3A 2J90A 4XYFA 3C4FA 3OBJA 5TR6A 4PNKA 4AA0A 3V51A 2BUJA 4QTEA 3E8NA 1H01A 5A14A 2GTMA 4RLLA 3Q9XA 2ZDTA 5IU2A 3VS4A 3IDCA 4IB3A 2YJRA 2ZM3A 4IMYA 5DVRA 3ZO1A 1MQ4A 4MX9A 4IACA 4R77A 3R7OA 4FKTA 3DAKA 2UW8A 4IX4A 2AYPA 3DQWA 4QMXA 3NW6A 5CWZA 3RZBA 4JXFA 3ZUUA 5KE0A 4UY9A 2WOUA 4Y72A 5FGKA 4TNBA 5CSXA 4D4SA 4PL4A 4FGBA 4BCOA 1PXNA 5DEYA 4Z16A 1KWPA 1SNUA 4O0UA 3SOCA 4BL1A 3RCJA 5FBNC 4O7ZA 3LFNA 4C8BA 5C8MA 3RBWA 5FTQA 2B52A 4BCHA 4D2WA 4DYMA 3I60A 5IQDA 3V5WA 4EH7A 5FUTA 4GUBA 4E4LA 2YIWA 3VS7A 2ESMA 4F70A 4BB4A 2C3LA 4EEVA 2WB8A 3UYTA 2DS1A 1VJYA 1HCKA 5DEWA 3MV5A 2C5NA 4PPCA 1Q41A 4FYOA 4JAJA 4NEUA 3JYAA 5AJQA 4C38A 4EQUA 4RFYA 2CLXA 3KRLA 2X8DA 3EN6A 4O0YA 2W5HA 3GU7A 2WIHA 3DA6A 3HYHA 4EH5A 3C7QA 3HKOA 2FSTX 4TW9A 3RAHA 4K9YA 4MBJA 2NP8A 3R1SA 1U54B 1ZZLA 3FMKA 3LCDA 1WCCA 5HG5A 3V8WA 4ASDA 4GG5A 3KK8A 1BLXA 5L2TA 3BRBA 4UXQA 4JDKA 3V5LA 3VIDA 4L6QA 4AZTA 3HLLA 4C36A 2OWBA 1P4OA 3L1SA 2ITQA 4ZEGA 4EHGA 3DBFA 2X7FA 2ZMDA 5TOZA 3NUXA 4BF2A 3SAYA 1I09A 2O64A 1SNXA 1OPKA 1IA8A 5BMMA 3LXNA 4H36A 4EONA 4XRJA 3TEIA 3CSVA 4ACDA 4M3QA 1OIQA 1H4LA 1ZYJA 3QZFA 4U80A 1NW1A 4ALVA 2WELA 5I4NA 3HV5A 3F66A 2GTNA 3A4PA 4HGSA 4KKEA 4IVBA 4RIYB 5HIBA 2P33A 2YIYA 4QMWA 2OLCA 2PVKA 3PJ1A 1ZLTA 3UGCA 5L6OA 3OMVA 5HCYA 1YWRA 4DFNA 2I40A 2CMWA 3F3ZA 4HGTA 2G2HA 1XBBA 3K54A 4ACCA 3KXGA 1YWNA 4HW7A 4D55A 3SLSA 5IQHA 5DN3A 1HCLA 3M2WA 4FOBA 2BROA 4FGRA 4N70A 4UMUA 3F82A 2B7AA 4JDHA 3VS0A 4BIDA 2OIDA 1H1WA 2XVDA 4ZMFA 4FV7A 3KGAA 3PRFA 1W84A 3R2YA 3VS5A 4DEIA 4IH8A 4C62A 3THBA 1GIHA 3EMGA 4U7ZA 4BDKA 1V0OA 4YTHA 2O5KA 4YJTA 2BAQA 4M97A 4C3RA 4F08A 2XIYA 4LFIA 4JAIA 3TL8A 3C4CA 1UNGA 3ANQA 1XJDA 3BX5A 3FZTA 4MXCA 4F9WA 2X2KA 3ZLXA 3U6JA 3NVKI 2QC6A 4WUAA 3TZMA 2ITOA 2JDVA 3GC0A 3MPTA 4B8MA 3P79A 4IWDA 3N4UA 2WMTA 1PKDA 4DE4A 4FL2A 4DFXE 2RG6A 2YM5A 3UNZA 4ZS0A 4M15A 5IUIA 4HVDA 5A46A 3O50A 3ORXA 3E63A 4AW1A 3NPCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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