4FTJA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
277
structure length
266
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 266
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ftjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ftjA01
4JR7A 4OTGA 4OGRA 3F2AA 4FKWA 5E9EA 3QL8A 3QWKA 4FZAB 3C50A 5K5XA 2QNJA 3P78A 4RJ5A 3MGYA 1X8BA 3UBDA 4BKYA 3MY0A 2OJJA 3NUXA 3WILA 3ZBFA 5AA9A 3R8VA 4O84A 4L44A 3JXWA 4NM3A 4BL1A 3FMMA 3P79A 5CU3A 2F4JA 4BZDA 4AT4A 1YXXA 1DS5A 4WIHA 5CALA 2VTSA 4L01A 2VNYA 3MFTA 5CEKA 1UU3A 3M2WA 4FUXA 4JXFA 4OLIA 1OL7A 2CLQA 5C26A 2OSCA 1PYEA 3I5ZA 5CS6A 2QCSA 2IW9A 2W1ZA 4QMVA 3HDMA 2ZM3A 2BAQA 2ZV2A 4O27B 5AUWA 3VS3A 5CANA 5CF8A 3TN8A 4WSQA 3NYVA 4DEBA 4CMTA 3GU7A 4E4NA 5DT0A 3RK7A 2JKQA 4DCAA 3KF7A 3LCKA 2I6LA 2W4JA 3VBWA 2BALA 5LJJA 5HORA 5E8UA 3U6JA 1LP4A 3CLYA 5H8GA 4L43A 2F7ZE 3DTCA 4X2NA 3VS2A 2PL0A 2CKOA 3ORKA 4GFMA 5FXQA 4FZFB 2WMTA 5E8VA 4IX4A 5E92A 3TKHA 2RL5A 4FKPA 5KCVA 2JDVA 2V5QA 2YIYA 4A9UA 3GBZA 2CSNA 3IONA 3SLSA 3VQHA 4QQTA 5L6PA 3EKKA 5FBOA 3IDBA 4UV0A 4EORA 2C6KA 2OGVA 3LFEA 4X6RA 3HP2A 4RX8A 2JIUA 4WUAA 1UVRA 1YXTA 3O8UA 3HMMA 3I0QA 4PPCA 4Y5QA 3UO4A 4I1ZA 2E9UA 5AP2A 3V8TA 3VBVA 1KUTA 2VGPA 5CT7A 1PHKA 4XP3A 5AR5A 4HVIA 3R73A 4S34A 4ZY5A 3ZCLA 4Y95A 5H9BA 2WO6A 3UNKA 4DTBA 3LXKA 5K3YA 3C0IA 4YPSA 3LXNA 3DKFA 5IA3A 4CFWA 1GIJA 4FZ6A 2ZB0A 4O0SA 2OFVA 3ET7A 5HESA 3V5TA 2C3IB 4OTRA 4YPDA 3W2QA 4OTWA 5CXHA 4YMJA 5EK7A 3HMNA 2PMIA 5TOZA 4RZVA 4EHGA 4HVDA 1U46A 1O9UA 2X81A 3LXLA 4X2FA 4RRVA 2WEIA 4NK9A 4ITHA 2GQSA 2ITWA 1OM1A 3PIZA 4MWIA 2C5YA 3NNXA 3Q5IA 5EI6A 3TJDA 4FMQA 3RAKA 4X3FC 4IE9A 3NCGA 2ONLC 1PXIA 4DGMA 4TYJA 4YHTA 5C1QB 3B8RA 3G6HA 3FSKA 1XH4A 3KRWA 4I3ZA 3SHEA 1KV1A 2W99B 4PP7A 2YAAA 4I4EA 2PUUA 2C5XA 4TRLA 4RWIA 4KB8A 1CMKE 4C35A 5AV4A 5HG9A 2C3LA 3GC7A 4DG0E 1R39A 3KN6A 5HE3A 4O7VA 5AR3A 4FNYA 4V0GA 3QD3A 3BQRA 2UZWE 4BCHA 4ZXTA 4BC6A 4AX8A 3D7ZA 5HVKA 2GTNA 2WMRA 3E87A 2QR7A 4F7JA 5M53A 3G0EA 3UMXA 3L8SA 1CKJA 3CGFA 4XYFA 4AACA 4TL0A 1OBDA 3UVRA 2WZJA 4O0VA 2BMCA 4RWKA 4UN0C 1G8AA 1MRUA 2ZB1A 3N51A 5AUXA 4ASZA 2UW8A 3DU8A 3TTJA 5JSMA 3AOXA 5K9IA 2X6DA 4LRJA 4F1OA 2OXXA 4AGUA 5M57A 3ZM4A 1SNUA 1YWRA 1PYXA 2YACA 2VTRA 5FEEA 2J7TA 5KNJA 4BTJA 2WQNA 1I44A 2Z7SA 3AGMA 5HD7A 2EUFB 4FEWA 2VTQA 4O0YA 4PP9A 1H8FA 3VS5A 4XOYA 1NW1A 3OZ6A 1JBPE 5A14A 3H4JA 2VX3A 4Y72A 4F9BA 3MJ2A 3CY2A 3COIA 4GFGA 4N6ZA 4AOJA 3UP2A 4E6DA 2YM8A 3D7TB 4J98A 3QBNA 5CAPA 4AW5A 1FQ1B 5EDQA 3D5WA 5A54A 2XKEA 4ANMA 4L67A 3PZEA 1WBOA 5HG8A 4FV5A 3CBLA 4O2PA 2OK1A 5HO7A 3M11A 3BLHA 4NH1A 3RAIA 1GZKA 2NPQA 3W8QA 4U9AA 3COKA 4AT3A 4G3DA 4ZSLA 1VEBA 4DINA 5J1WA 4GU9A 3HDNA 2R3JA 3MFUA 3RCJA 4NWMA 4R5YA 4CFNA 2VWYA 4RPVA 4QQ5A 5EDPA 4QT1A 2HCKA 3HV6A 1OUKA 3LPBA 3FL5A 5LOHA 2E9OA 2WIHA 4ALWA 4YZNA 1BL6A 4ZLYA 4FSNA 4DYMA 3U87A 3VS7A 4U3ZA 2GTMA 5FM2A 4BI1A 4E5BA 4O7NA 4IW0A 2OJ9A 3R0TA 3UOKA 3F69A 2YN8A 3NAYA 1PXLA 4BYIA 3VBQA 2XCKA 4LQMA 4IDTA 5KBQA 1LR4A 3HVCA 3NW6A 5T3QA 2IW8A 3WBLA 4C61A 1URWA 4DBNA 4IX5A 3KA0A 5AP0A 3IW6A 3QA8A 5T68A 1UV5A 3TV6A 2RFSA 4KA3A 1XBCA 4D2SA 4CRLA 1H1QA 3TI1A 4Z3VA 2R3MA 3NNVA 5CEIA 4P7EA 4FK6A 3DBEA 4MH7A 4H36A 1U4DA 3ZLXA 3UOJA 5HIDA 1EH4A 4HPUE 3KGAA 4FV1A 1OB3A 3I6UA 4QYYA 3ZO3A 4G16A 3SV0A 4WNKA 4FZ7A 4USEA 4OT6A 4LUDA 3CJGA 4FSQA 4A4XA 2A27A 4J99A 3UQGA 1OL1A 4S32A 4NL0A 4FTRA 1YDTE 5CAUA 3PJ3A 3S4QA 4PF4A 3A7FA 3O0GA 5I9UA 4HVGA 5BYZA 5AP6A 1XH5A 3BKBA 4W4VA 3W16A 2R64A 3ZZWA 1GJOA 3FY0A 3GC8A 2XYNA 3V8SA 2BRMA 4YZBA 3WF6A 1YW2A 3DBQA 3EL7A 3EN4A 4JQ7A 3EJ1A 4LOQA 2RKUA 3WE8A 5IQEA 1SZMA 1IRKA 5EYKA 2XNMA 4XNEA 3F5XA 3EN5A 5HCXA 2XJ2A 2A0CX 3KXNA 3SRVB 3TXOA 3R71A 4PPAA 1Y8YA 2NNWB 4YTHA 3BGQA 1OL5A 2IO6A 4G6OA 4QMNA 3K54A 4XMOA 1Y57A 2XIZA 5DT3A 3KL8A 4QMYA 3TWJA 4WD5A 3W33A 3D83A 1YDSE 3ORTA 2VWXA 4G3EA 3A4PA 2JBOA 1ZMUA 3KXXA 3HYHA 4UYNA 2OIDA 3ITZA 5DFPA 3TL8A 4C33A 5EKOA 3ZH8A 4IZYA 3ZEPA 2QO9A 1L8TA 1TVOA 4W4XA 3I7BA 1FVRA 2W17A 4IVDA 5TR6A 3FLWA 2QI8A 1PXNA 4OR5A 1Y91A 3KRLA 5L6OA 4DT8A 1XHAA 3V6SA 4N57A 2GPHA 1W98A 4GH2A 4C0TA 3KEXA 4FI1A 3PA3A 5I9WA 3QA0A 1XO2B 4AE6A 2XK9A 3QUPA 3NW5A 4RX7A 4G2FA 4S33A 5EOBA 5A4EA 5G6VA 2W4KA 3EFWA 3KXGA 1NT2A 4FX3A 3F5PA 3O50A 3PPKA 3ZDIA 3PPZA 3VBXA 4BDHA 1ZYLA 3W1FA 3FI8A 1H1PA 2ESMA 4FV0A 3RPRA 5HTIA 2ZMCA 4BKZA 3UPZA 2CGXA 3LAUA 4YZDA 5IH6A 3I0OA 5HCYA 4O86A 3HECA 4GKHA 3W2OA 4FSTA 3W55A 3QZGA 3KXMA 3F9NA 3NMUF 1Q8ZA 1XWSA 3A7GA 3FQSA 2R3FA 3FZOA 4M15A 4JT3A 2OJGA 2P2HA 1YI6A 3PJ2A 4IAIA 4MD7E 3PXYA 3H30A 4C3PA 3R6XA 5DBXA 3NVKI 3ENHA 2CGVA 3EZVA 5CAVA 5LVNA 3DNEA 2OIBA 1WCCA 2PMOX 3BYOA 3NNWA 4FK3A 3SXFA 3GVUA 4I0SA 2YM3A 4QMTA 4XX9A 3M1SA 2HYYA 4NEUA 4B7TA 4YGAA 4CFVA 3N4TA 4Y46A 3FMNA 3F3WA 3FMJA 1M7QA 2PE2A 2PVFA 2WXVA 3QGYA 5AP7A 4AFJA 3PIXA 3R7GA 5LARA 3PVUA 1J7UA 4AA4A 3MIYA 5IA4A 4D58A 4ZOGA 4TYGA 2BZKB 2JDOA 3R8LA 1Z9XA 4EYJA 5BMMA 1XH7A 3CIKA 2FYSA 3P7AA 3QZFA 5E8XA 3RK5A 4RFZA 1NXKA 3MSSA 4DF3A 3L8PA 3L1SA 4FZDB 4BDFA 1R0PA 4FE2A 2PVLA 4B9DA 1JKTA 2R5TA 3R7OA 3DFCB 5GIOE 4F7NA 4YURA 3S0OA 5HNBA 4WG4A 5KMJA 2C3KA 4FV2A 5L2SA 4MXAA 4OW8A 3MH1A 3R22A 4BDKA 4BR3A 1OECA 2VWBA 2WKMA 2XNEA 3DZQA 2AC3A 1YOMA 1E1XA 4D2RA 4AQCA 4CKRA 3OC1A 4RVMA 2R2PA 4A9TA 2PUNA 1CKPA 2Q83A 1B38A 2E9VA 4B0GA 2PVHA 1OVEA 3F6XA 4OTHA 5C01A 5LCJA 2Y9QA 3EOCA 5HG5A 4TWNA 2OWBA 4W8DA 4ANNA 3Q4TA 1RDQE 5KMOA 3H9RA 3KU2A 4E4XA 3IDPA 4MBIA 3I60A 5EW9A 4IWDA 2I0YA 4XG7A 5BNJA 5IUGA 2JDSA 2YCQA 2UW5A 5BVEA 4ZY4A 3G9LX 4ALVA 1WVYA 3MBLA 3A62A 4X3JA 3ATSA 3V01A 1M17A 3R7VA 4D4SA 3PIYA 3UOHA 4TYHB 4C4HA 1REJA 4IAAA 3TIYA 3PXQA 3PY3A 5KMKA 3D5XA 3MA6A 4FG9A 4O0WA 1IAJA 2AC5A 4RLKA 3PSDA 4IANA 4FTOA 1JQHA 3LQ5A 4KWPA 3DGKA 3ORXA 3VVHA 4BFMA 3BHVA 3R8PA 3FY2A 4DLJA 4I0RA 4I22A 2Y4PA 4NM5A 4QMXA 2WTKB 3F82A 2XJ1A 2VTOA 3NIZA 1ZOGA 4LOOA 4G3FA 4IACA 1HCKA 4PMMA 2R0UA 1R0EA 2HWOA 2YM6A 4IX6A 1JSUA 1WFCA 2ACXA 4NKAA 1KE5A 5KMNA 1J91A 1LPUA 2Y7JA 4FIJA 3U51A 4P4CA 3BHUA 3DXNA 4O21A 3VUMA 2OLCA 3DKGA 3WIGA 5AUTA 4FNZA 4I93A 3DA6A 2VWVA 2OH0E 4NCTC 3DAEA 3RBWA 2BFYA 3P1AA 4U43A 1W7HA 2GQGA 4FTJA 5FTOA 3NZ0A 2QOBA 4DEGA 4I41A 2YWPA 4O7YA 4FT7A 2VTHA 4YSJA 4QPMA 3EZRA 4QQJA 4UEUA 4NUSA 4C59A 2R9SA 3ELJA 2YERA 4QTBA 5C03A 2J90A 5DPVA 4L8MA 3TNQB 4M0ZA 4QD6A 3GFEA 4ZZNA 2JKKA 3FC1X 4EUTA 3PZHA 4FTUA 4LYNA 1GIIA 4FV7A 4R78A 1YI4A 3Q3BA 2XVDA 4GVAA 3F5GA 3C7QA 5E8TA 4TYEA 3PVWA 2BDJA 3KB7A 4XJ0A 2GHLA 3ROYA 3FE3A 3H9FA 4BGHA 4GVJA 5ETCA 5DNRA 3BEAA 3N9XA 4WOVA 2WTIA 3EN7A 3G90X 1JKLA 5KKRB 3SRVA 3UIMA 3TTIA 5AAFA 4C7TA 5J8IA 3GU4A 3ZHPC 4P5QA 5GJFA 4E26A 5E8WA 1IAHA 3PJ8A 2A4LA 3WIKA 3NUSA 4ZAUA 3OXTA 4GIIA 4Q2AA 2HIWA 4FSZA 3OTUA 4YC8A 3OVVA 5I3OA 2DS1A 4FKLA 4O2ZA 2F9GA 4YJQA 4C34A 4F0GA 2JKMA 4CV9A 4IC8A 4QO9A 3BV2A 3THBA 3HV5A 2YHVA 3QCXA 3M42A 4A9RA 1Q99A 2ZM1A 2EB3A 4QNYA 3Q32A 3LFBA 2X8EA 4S30A 4MXZA 2C47A 3HNGA 3QRUA 4H3PA 3N4UA 3EMGA 4MEDA 4X7QA 4I5CA 1WVXA 1ZY4A 2P4IA 4TWOA 4AA5A 3D5UA 4IB1A 3HA6A 4O7ZA 3Q53A 3QALE 4G9RA 3WZEA 5HVJA 3UTOA 3E8CA 3ORLA 4O0RA 2HXQA 5EW3A 1AGWA 1FMOE 4MF1A 5CVHA 1WZYA 3SKCA 4OAVB 5HHWA 5CSXA 2YWVA 1U54B 4U45A 4UY9A 4YLLA 3VUHA 5HBJA 4UZDA 3CTJA 2O2UA 5CY3A 4DG2E 5JZJA 4GKIA 3NAXA 2I1MA 4FR4A 2HAKA 2BRNA 3IGOA 3MV5A 4BKJA 2HZNA 3LFAA 5FXSA 2IVTA 2G9XA 4XV9A 4YJRA 2C6EA 1IG1A 3BLRA 4I4FA 2DQ7X 3R04A 1ZY5A 4H1MA 4ASXA 3KKVA 4Y73A 4EBVA 3OFMA 2I0HA 2PMNX 1UA2A 2R3GA 3GOPA 4RSSA 5AX3A 3HMPA 2VV9A 1GZ8A 4LGDA 4V01A 1P2AA 3D14A 5H2UA 4AN2A 4C4GA 5HCZA 4D0XA 5JK3A 3MVLA 3QF9A 2QOQA 4F9AA 5ANGA 5B7VA 2UZVA 3FL4A 4V0GB 5IA5A 3PP0A 3UVQA 3SVVA 3BZ3A 3R9OA 4K33A 4AGDA 5BVKA 3K2LA 4JIAA 1G8SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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