4OLIA

The pseudokinase/kinase protein from jak-family member tyk2
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
599
structure length
539
Chain Sequence
LSFHRVDQKEITQLSHLGQGTRTNVYEGRLRVELRVVLKVLDPSHHDIALAFYETASLMSQVSHTHLAFVHGVCVRGPENIMVTEYVEHGPLDVWLRRERGHVPMAWKMVVAQQLASALSYLENKNLVHGNVCGRNILLARLGLAEGTSPFIKLSDPGVGLGALSREERVERIPWLAPECLPGLSTAMDKWGFGATLLEICFDGEAPLQSRSPSEKEHFYQRQHRLPEPSCPQLATLTSQCLTYEPTQRPSFRTILRDLTRLQPPTVFHKRYLKKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDGTGEMVAVKALHRSGWKQEIDILRTLYHEHIIKYKGCCEDQGEKSLQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSIGLAQLLLFAQQICEGMAYLHSQHYIHRNLAARNVLLDNDVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVREDGDSPVFWYAPECLKEYKFYYASDVWSFGVTLYELLTHCDSSQSPPTKFLELIGMTVLRLTELLERGERLPRPDKCPCEVYHLMKNCWETEASFRPTFENLIPILKTVHEKYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the pseudokinase-kinase domains from protein kinase TYK2 reveals a mechanism for Janus kinase (JAK) autoinhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Non-receptor tyrosine-protein kinase TYK2
total genus 159
structure length 539
sequence length 599
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4oliA04
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4oliA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4oliA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4oliA01
1ZMVA 4G2FA 4FUYA 5HX6A 3NW6A 4G16A 1OL7A 3QTUA 2BVAA 3AC8A 2XRUA 2Y6MA 3OBJA 4O91A 4S33A 4O38A 5IA3A 5J5SA 4BDHA 4UALA 3PWYA 4DEIA 4BWXA 1JQHA 3LOKA 3OCBA 4F9BA 3MPMA 4X3FB 5DN3A 4MEDA 4BCGA 3KXNA 2OSCA 4DITA 5IG1A 1M7NA 1TVOA 4DFUA 3LFEA 4DEAA 3RNIA 4AW2A 4GVJA 2X7FA 5B2LA 3KXHA 3BGQA 4YJVA 5EQEA 4FKSA 3Q6WA 3QXPA 5A46A 4IJPA 5FBNC 5CU2A 2HW7A 3KCKA 4AU8A 3KXMA 4I24A 2QCSA 3FDNA 4LGDA 2C0OA 2A19B 3CS9A 3P23A 2FSLX 4J8NA 2YJSA 3EN6A 4NL0A 3ZYAA 2YACA 3BLQA 4FIEA 4FEWA 1WBSA 3Q4TA 3TZ7A 1OM1A 1YWVA 3BIZA 3LZBA 4M66A 3MFTA 3D2KA 4XCUA 2WTCA 5EW9A 3QU0A 3MY0A 5CT7A 3QCSA 2UW9A 4YC6A 3TZMA 3A7JA 2BRMA 3GFWA 4GS6A 3DXQA 4DT8A 2B4SB 3EQDA 2OW3A 5DR6A 4CG9A 5FRIA 1L3RE 4BKYA 1Q24A 2IZRA 5BQ0A 3EFLA 3QYWA 4FSWA 4R6VA 4EH9A 5JSMA 3PXFA 3RCDA 3DPKA 3HGKA 4O0VA 4IHPA 3SA0A 4W9XA 2GU8A 4APCA 1H1RA 1ZYDA 1FOTA 3R00A 2FSTX 2Z2WA 5CEPA 3OWLA 4S2ZA 3UC4A 1XH4A 4EK6A 3W2CA 4FT7A 4O0RA 2HZ4A 3U9CA 3ZZEA 1OIQA 3EFJA 4I94A 3SOCA 3THBA 4MAOA 4DH5A 1ND4A 3FZPA 2GMXA 4OBPA 3TJDA 5IKWA 3VQUA 5J7HA 1CSNA 4JX3A 4BWPA 3QTZA 3MN3A 5IUIA 3LCOA 2QNJA 2BCJA 4V05A 3ULZA 3HRFA 2WGJA 3OC1A 3OXTA 4P5QA 4LI5A 5HBHA 1X8BA 2QG7A 2XBJA 4U43A 4YR8A 2PVKA 3Q9ZA 4HGLA 1LPUA 2J6MA 2RFEA 5E92A 3FBVA 3OBGA 4KB8A 2XJ1A 4R1VA 3F61A 3D94A 5EYMA 1MRUA 3R9HA 3WILA 2O63A 1W98A 3BYSA 5IU2A 4FKOA 4YBJA 4EZ5A 3NDMA 5FDPA 5FTQA 4TYEA 1ZRZA 4RJ8A 2ZJWA 3UTOA 3R8ZA 4MH7A 3W10A 2GPHA 3KK8A 2BDFA 4U3ZA 3C4CA 4FKWA 1Q3WA 4F09A 2R0IA 5LOHA 2R3HA 3PTGA 3R1NA 2HXLA 4TWCA 5H8BA 3TKHA 4LL5A 4ZJJA 3H3CA 2R7BA 4Y83A 5LVPA 1B6CB 4PDSA 2EXCX 3UQCA 5CTPA 4DG0E 4BGHA 3A4PA 4JIAA 4X2GA 3GGFA 3UO6A 4R78A 4EWQA 4X6QC 4P2KA 1R39A 2R3OA 1KE6A 3Q3BA 4RFYA 4RA5A 5LMKA 5IA0A 5ANDA 2I0HA 1R0PA 4FNXA 4IAFA 3WZJA 3ZH8A 2C0TA 3R0TA 3ORPA 4BY9E 4ID7A 1XBAA 3BYOA 4TNBA 4IB0A 1V0PA 4KIPA 4AF3A 5AR7A 4QNYA 3MY1A 1OPLA 3BCEA 4TYGA 3KCFA 4LRJA 4J96A 4YZBA 3BHYA 1OGUA 3HV3A 1RE8A 4B6LA 2ZV8A 4PDOA 3IW4A 3CIKA 4FSRA 5EKNA 3CEKA 4JIKA 4H58A 3RHXA 5EQYA 4Y5QA 4PF4A 3R2BA 4XHKB 4KIKA 4OR5A 2O64A 1H1QA 3P9JA 4GIHA 3WE4A 1U54B 3MVLA 3NUXA 4FKGA 5JKGA 2BILB 5AUWA 1YDTE 3DDQA 2GFCA 3GC8A 3ITZA 3OD6X 4AN2A 4AZSA 3DBQA 4J8MA 3SDJA 3TNHA 3U9NA 4F08A 1R3CA 4FEQA 2QOKA 3A62A 1H27A 2JD5A 5KX8A 1PXMA 3PXYA 4L7SA 2O65A 2UW7A 4MXYA 1YVJA 3I60A 3JS2A 4DN5A 3EL7A 2ZDTA 4EBVA 1PKGA 3I7BA 2FB8A 3KRLA 5KMLA 2OXXA 3IQ7A 1ZMWA 4DEEA 3A7HA 3Q2JA 4JBOA 3MVJA 2J0IA 3NWWA 3MA6A 4FZAB 5I9ZA 4AOJA 3CP9A 3UIBA 1UA2A 5KHXA 3CSVA 3OXZA 4FSNA 5J9YA 3V5LA 3K5VA 4CTBA 1AD5A 4WKQA 4FI1A 3POOA 3ORXA 5M57A 4QTCA 3EQBA 3QCYA 4L67A 4EQMA 2I0EA 3UQGA 4IE9A 4W4YA 4OT6A 4K2RA 4C7TA 4JDIA 2X8IA 1K2PA 4FSUA 3E63A 2JDRA 3QUEA 4DFXE 1BYGA 5KCVA 5ICPA 1E1VA 3TI1A 3IW5A 1PXLA 5AUYA 3UMXA 1YWNA 2PE2A 2VTMA 2ZM1A 3CQEA 2XK6A 3HX4A 4YZ9A 3ZO1A 5KKRC 1OBDA 4HZSA 3TZ9A 2VX3A 3QL8A 3ZBXA 4FTCA 2QODA 2VTIA 4V0GA 5CU4A 4CKRA 4FKLA 5HZNA 1LUFA 2IZTA 2RFDA 3B2TA 2R3FA 2HZNA 3C1XA 2PVYA 3FLNC 3EB0A 3TEIA 3PSBA 3TNIA 3KU2A 3RWPA 5C8KA 2XH5A 3M2WA 1M52A 3MSSA 4FKPA 4CMTA 4AZFA 2GNHA 5JZNA 1XBCA 2BRHA 2YWVA 3NS9A 4JRNA 3NAYA 1GZ8A 4OTIA 2WQNA 2WMTA 4FV7A 3HDNA 3QRTA 5BVEA 5HU9A 5J79A 3I0QA 3V5JA 4A9RA 4RSSA 4DTAA 3KMWA 4JXFA 1URCA 2WB8A 3LXKA 5DBXA 3KRXA 3T8OA 2PY3A 2VWVA 3O0GA 4EL9A 4DYMA 4EZ7A 3HV4A 5ETIA 3QTIA 5I3RA 5I9VA 4D4VA 3QQLA 4RWIA 3C0HA 2WOTA 4QMYA 4YSMA 4C02A 2HELA 3I79A 3RAWA 3IPHA 2WMAA 4C4HA 2H6DA 2C6MA 3D7ZA 3O50A 5M06A 4CV8A 2FSMX 3QZHA 4C4IA 2HK5A 3KXZA 4TWPA 4I5MA 2BTSA 5DH3A 3FLWA 5EYDA 2WQMA 4GVAA 2C6EA 5C01A 4RFMA 5B2KA 3NUNA 3E7VA 5DRBA 2C5YA 3R1YA 4A9TA 4IH8A 4KAOA 1GIHA 4D4YA 1H0WA 4J52A 5F1ZA 3E3PA 3PE2A 4HGSA 4E73A 3N4UA 5HBJA 2HWOA 3I0OA 5TT7A 4CFUA 3SQQA 4GEOA 1ATPE 3LM0A 3SXSA 3DJ7A 5FGKA 2P0CA 3NUSA 2CNQA 2QO2A 3PXQA 3L9PA 4JQ8A 1OL5A 5FP6A 4CTCA 4K6ZA 5CF4A 5HE0A 4QMTA 4G1WA 5LVLA 3BEAA 3REPA 5DWRA 3IECA 2XEYA 3DAEA 3QBNA 4B8MA 2ONLA 4EOQA 5M4CA 3N4TA 3MYGA 4DT9A 4ZTLA 3NW5A 4WRGA 4RIYA 4D9UA 2XJ0A 3UC3A 5HNBA 4FGRA 2VO3A 3MB7A 1PYEA 4YHTA 1JPAA 3S4QA 4JL9A 4YPSA 5C27A 4AZTA 1M2PA 4FODA 4M8TA 3V5QA 1P4FA 1W0XC 1H4LA 4RRVA 5CENA 4IDTA 3PZHA 3ERKA 3FE3A 3GP0A 3FQEA 2BKKA 3VS1A 3WF7A 5EYKA 1PHKA 2Z8CA 3ET7A 4H1MA 3MB6A 3E62A 1TKIA 4FGBA 4U0IA 3VRZA 3ZRKA 1WBNA 4F0GA 2X1NA 3JY0A 2EUFB 5K9IA 3D7TA 4NWMA 3WI6A 4JNWA 3UP7A 1LEWA 1NY3A 4BGGA 4UXLA 2OXYA 3UOLA 4QD6A 4EC9A 1ZYSA 3HV6A 3HMMA 4CNHA 3MY5A 2CKPA 4JS8A 3H10A 1ERKA 4EK5A 4PWNA 1UU9A 1YWRA 4D55A 4C4JA 4U42A 5CF5A 4B8LA 5CT0A 4N0SA 1ZMUA 3R7GA 3JYAA 4I92A 2DYLA 1J1BA 5HBEA 3T3UA 5DYJA 4GL9A 2VZ6A 4M84A 4WT6A 4F1OA 2YCFA 3Q4UA 4C34A 2RKUA 2VNYA 4MNEB 2RIOA 4HJOA 3KN5A 3RPRA 4QMWA 3LPBA 4BCIA 4DH7A 4ARKA 3O71A 4KIOA 3C0GA 4IB1A 2PVJA 5EW3A 2QR7A 4ASDA 3DB8A 5AUVA 3EWHA 3JVRA 4FTLA 2WO6A 4G6NA 4LV5A 5HTIA 3UE4A 4IVAA 4GSBA 4L52A 3UODA 3WIKA 5C9CA 4EEVA 2WTKC 3F5XA 4C61A 3UIMA 4MXZA 5A6OA 3IS5A 4BTJA 1PY5A 2WMWA 2EXMA 4Y73A 4F70A 2I40A 3I6WA 3O51A 5CSXA 1GNGA 2UZWE 3ODYX 5GNKA 2XJ2A 5DRDA 5CEMA 4I21A 3CTHA 2C6OA 5JMSA 4XV9A 4EOLA 3TUBA 3GNIB 1KE5A 3Q5ZA 4PRJA 3HUCA 5IMEA 3UOKA 3KY2A 3AGMA 1JKSA 2OU7A 3OFMA 3QLGA 2C5NA 3D14A 3OT8A 1YXXA 3RPVA 4GFMA 2QKWB 4FV6A 4JG7A 5HOAA 4AQCA 3ETAA 4C35A 3KQ7A 3ZEWA 4CKIA 1Q3DA 1E1XA 3HA8A 3FPQA 5KMIA 5IQIA 1VEBA 2WKMA 3DZOA 4DLIA 1AGWA 4QMUA 4TZRA 3AT2A 3HL7A 4KKGA 1ZARA 4WUAA 5FBOA 3P7CA 3IO7A 3ANQA 5IZFA 3GFEA 1V0OA 4MBLA 3VS7A 5ANKA 1Y8GA 4N4SA 4KIQA 4D0XA 5E7RA 5G6VA 3NZ0A 3AC4A 5GIPE 2X9FA 1L8TA 5FG8A 4AWIA 4DFBA 4PMSA 4QMZA 1U5RA 1YI6A 2Y0AA 3QGYA 3D15A 4KS8A 4M69A 4U7ZA 2PZPA 4UZHA 4CLJA 2JAVA 3FQHA 3NNVA 2VWUA 3MH1A 3PLSA 3CGFA 5BVDA 4KIKB 3VW8A 2Y4PA 5IQAA 2CLQA 2OFVA 5J7BA 4CFFA 4GYIA 3H9OA 1WCCA 2DS1A 4IZYA 4YTCA 3RVGA 4L46A 5HCYA 4R5YA 3CGOA 2W9ZB 4FEXA 1M17A 3ZSIA 2JKMA 5CNNA 3BE2A 2OZAB 1FGIA 5AUZA 4Q5EA 2A1AB 4J95A 4ACHA 1OPJA 1UU7A 2YDKA 4BB4A 4E20A 5E8TA 5DHJA 4JR3A 4FSMA 2WMVA 5E8YA 2P2IA 3V8WA 3TXOA 5BVWA 4XJ0A 1VZOA 4YHJA 4KSQA 4S31A 5J8IA 4O7WA 3P78A 4BCPA 5AUXA 4FK3A 3V04A 1F3MC 3ZLWA 3R9RA 4BDKA 4EZ3A 3I4BA 3VS3A 5HO7A 2B9IA 3CY2A 4BDAA 5L4QA 1PMEA 4RIWA 4M97A 1ZY4A 3GOPA 5C4KA 5L6WL 4Z7HA 2R7IA 1YI4A 3HYHA 4ZSJA 4F1MA 4WOVA 4QMSA 5KMNA 3E5AA 3SW4A 1PKDA 2RL5A 4MF0A 5AA9A 2OJ9A 2R3PA 4IJ9A 4V0GB 2R3QA 3ZRLA 5CLPA 2OWBA 4FICA 5L2TA 3ACJA 3E8DA 3QTQA 2ZV9A 4HPUE 3DBCA 5L8LA 2J9MA 4XP0A 4XP2A 2C47A 3EQGA 2J2IB 1APME 3QTXA 1WVXA 4LRKA 4WUNA 2ZMDA 4AXAA 1VJYA 2PUUA 4QYHA 3OS3A 2HXQA 2O5KA 3SKCA 4I23A 4YP8A 4BDJA 4D5HA 4M67A 3IOKA 4FVRA 3U6HA 5HVJA 5T3QA 4FG7A 4L00A 2H34A 3FV8A 4QOXA 4HGEA 5HO6A 5IPJA 4YBKA 3LFAA 5AR4A 5CWZA 3R9OA 5H8EA 3NYOA 3ZM9A 3Q4CA 5CEOA 3AQVA 4RC3A 1OZ1A 5GZ8A 3DBEA 4PPCA 4FA2A 4DCAA 5M56A 2XIZA 2C3JA 2ERKA 2PHKA 2W1IA 3EHAA 3QD2B 4R5SA 5CYIA 3TUDA 4CCUA 4XX9A 1CKPA 4V01A 2CKOA 1UU3A 4PTGA 4FNZA 3PVUA 4AZEA 3R6XA 3CQWA 4U44A 4C38A 3LXNA 5GZ9A 5K5XA 2XKDA 3DOGA 3R7IA 3FAAA 4D2SA 3FC1X 4FV1A 3AXWA 3ZDIA 2W9FB 3E92A 4EOKA 1T45A 4QQJA 3TV7A 5HTCA 3BLHA 1UU8A 4K9YA 3AMAA 4USEA 4MD8E 1V1KA 3V5TA 1OVEA 3SLSA 1U59A 3KVWA 3NYVA 1MRYA 1QPDA 2WMRA 3KC3A 4FUXA 3TT0A 5EHOA 1KWPA 4X0MA 4QTEA 5AX3A 5DNRA 4JVGA 4FBXA 3DJ5A 1U46A 4BDFA 4A06A 3NMUF 1PJKA 3G15A 4IAAA 3I81A 3O7LB 4TWOA 3QC4A 4U6RA 4NW5A 3C5UA 2YCRA 3MBLA 4K77A 4O0YA 3VJNA 3PVWA 4EONA 3OG7A 4FT5A 4JR7A 2WTVA 3RINA 2XKEA 4IZ5A 4F7LA 5KKRB 4QP2A 3UPZA 2VAGA 4MYGA 4XUFA 3Q9YA 5BVFA 2CGWA 4KA3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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