3FZTA

Crystal structure of pyk2 complexed with pf-4618433
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
271
structure length
259
Chain Sequence
IAREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRDELPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural characterization of proline-rich tyrosine kinase 2 (PYK2) reveals a unique (DFG-out) conformation and enables inhibitor design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein tyrosine kinase 2 beta
molecule tags Transferase
total genus 85
structure length 259
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fztA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fztA01
4ACMA 2ETRA 2VRXA 3MVMA 3O0GA 3QTXA 5IEVA 4QNAA 4BY9E 3MPMA 3PJ1A 2I7QA 2WKMA 4ZY6A 4FKJA 3TTIA 1R3CA 2W99B 1W8CA 3DPKA 3VQHA 2QOFA 3NUYA 5E8TA 4UMRA 3RCJA 2C6MA 4BYJA 4IH8A 4EONA 2FGIA 3HRCA 3NW6A 4NEUA 2DQ7X 2ZM3A 4N70A 5AMNA 3ULIA 4ALUA 1Q61A 5IMXA 4FKGA 2CSNA 3KREA 4WT6A 4FSMA 2X39A 3Q4CA 4FG9A 2GHLA 3F2RA 1PKDA 4NTTA 4G17A 4G9CA 5AUZA 3EJ1A 3QC4A 1T46A 4UV0A 4DLJA 2Z7LA 3SXRA 2GNFA 1J91A 5JK3A 1CSNA 4ZY4A 4Q9SA 3FI4A 5L2IA 5FTQA 3GCUA 4FMQA 1U5RA 3TWJA 1M2QA 4LOQA 3HV3A 3D5XA 3LFFA 4XOZA 3RWPA 3F5UA 2JBOA 2B55A 4JQ8A 4ZLYA 1IAJA 2ZM1A 5CEIA 4DT9A 3HA8A 5D12A 4JLCA 5D10A 4Z9LA 5EHLA 2F9GA 3UC4A 3MVLA 4J7BA 3ZUUA 4C02A 2XH5A 1VJYA 2ITVA 3ZBXA 2OI4X 4X3FB 2XIYA 3FMEA 4NKSA 4FT3A 4O1PA 4APPA 4L3JA 4JS8A 4ERKA 4BCPA 2VTJA 3D0EA 4FV1A 3P0MA 4YO6A 3V8SA 5B2MA 5HQ0A 3AC2A 4G3DA 3N4UA 3G0EA 2IZTA 3PDTA 5EDRA 2OG8A 3NUSA 4IAZA 3A2CA 5ICPA 4BIBA 3AT2A 2G2HA 3JVSA 4I92A 3EKNA 4IZYA 3BHYA 4U9AA 4JVGA 3UOKA 1YDTE 2VTTA 1XH8A 4I23A 3E8CA 4YBJA 1Q97A 5KMMA 4TYIA 2VWUA 4BVUA 3FPMA 5IQAA 4QYYA 5ITAA 2EVAA 2ITWA 5C9CA 1T45A 4RA4A 3VS6A 2JEDA 3IECA 1MUOA 2V0DA 3AGLA 4X3FC 3JY9A 3SG8A 5M07A 3CC6A 3PVUA 4PTGA 1P2AA 5DYJA 4CFVA 2XNNA 1R1WA 5IUHA 2OW3A 2EUFB 4AOJA 3UZTA 5J95A 4DE4A 3FXWA 4CKRA 5LWMA 1KE7A 3ERKA 4D2RA 1OPLA 5KCVA 1ZMWA 4YTHA 4IMYA 5D1JA 1WBPA 5H8GA 1URCA 4MD9E 3PPZA 4FZ6A 3BU3A 1IR3A 1BKXA 2R7IA 3VAPA 2CCIA 3OUKA 5B7VA 2HYYA 4Y85A 3QGWA 3NDMA 3UYTA 3BRBA 3MH3A 3MESA 2XCHA 3PVBA 1ZMUA 4RIWB 2JIUA 3FMKA 4PDSA 4TNBA 2OZOA 2YIRA 3II5A 1ZWSA 5BYZA 4USFA 5KMOA 4F0GA 3NEWA 3CCNA 3L9NA 4R3RA 4C3RA 5F20A 2FSLX 1TVOA 4N4SA 5HO7A 4BHZA 5T68A 5BX0A 3U6JA 1CKPA 5EG3A 2WHBA 4B8MA 4GCJA 4L67A 3RK5A 5HTIA 3UNKA 3AD6A 2XK3A 3UPZA 4BKZA 4AAAA 2UZTA 3QCXA 4HNIA 3SLSA 3T3VA 4NTSA 4F7SA 1KWPA 4X3FA 3EQDA 2YIYA 5TR6A 5A4TA 4O0SA 1SM2A 2F49A 1QL6A 2W1DA 3PXKA 1XBAA 1Z5MA 4E6AA 2ZMCA 5H8BA 4EORA 2H34A 4JOAA 4IAIA 4FA2A 2R3FA 3RPSA 4EHEA 3PA3A 3VULA 3HUCA 3NAXA 3KN6A 1APME 4DEEA 3EIDA 5B2LA 2PVNA 4GU9A 3BLRA 2V5QA 2QC6A 1ZMVA 2XJ1A 3COKA 3CXWA 4EH5A 4YTIA 2X4FA 3ZYAA 2PZ5A 4G5PA 4F9BA 4DFZE 3G6GA 4TN6A 1PYXA 2BIYA 2EB2A 2QU5A 2B0QA 3OP5A 1UVRA 4I6QA 2V22A 3FLQA 4IX6A 4BGQA 4ITHA 4DH3A 3FY0A 1O6YA 4M14A 4DFXE 4QD6A 3ZRKA 2V7OA 2VWYA 2J0LA 1UKIA 1M7QA 1UNGA 3ROCA 3F69A 3ANQA 2H6DA 4GK3A 4FEXA 4GEOA 3CIKA 3D4QA 3HP5A 4W4XA 3GBZA 4QMPA 4C62A 4FV2A 2IVUA 4E26A 2R3RA 4F1TA 4AA5A 5AP2A 3EQIA 5HG8A 3H9RA 3MA6A 4FL1A 5LQFA 2BILB 2JDOA 2EU9A 2YDIA 5CVFA 4D1ZA 2XMYA 3RJCA 5I9VA 5M4FA 1OI9A 3QQKA 5I9XA 1JAMA 4PMPA 3HV6A 2G01A 3V8WA 2WU6A 1FVVA 3VUHA 4EH7A 2OFUA 3KMWA 3MPTA 4MTAA 4M69A 4RIWA 5AWMA 5HKMA 4CFFA 3ALNA 3VS4A 3TKUA 2ZDTA 2BDFA 2RFSA 2WMQA 4IB3A 5ANEA 5CENA 4YHFA 1BI7A 3EFJA 3PG3A 2O64A 5CU4A 2PVRA 4FKTA 5J7HA 3OW4A 3H9FA 4EQCA 4FNWA 3ALOA 4CFWA 2CNUA 4FEWA 3VF9A 4CG9A 2AUHA 3DOGA 4YU2A 3RVGA 1U54B 3MDYA 3UVQA 5JT2A 3NYOA 4BIDA 3KK9A 3NCZA 4XBRA 5CF4A 3KQ7A 4YHTA 5FDXA 3K3IA 5EYKA 4IM0A 2J0IA 3GC0A 3FLZA 3HMMA 4MK0A 1YOJA 1NXKA 4DG2E 3ID6C 2VX3A 4XP0A 3PWYA 5IA0A 4RQVA 2WOTA 4M8TA 3SOAA 3CGOA 1JPAA 4S32A 2YISA 3RPYA 3EQPA 5AM7A 3HDMA 1GOLA 3ZLWA 4OGRA 5L4QA 2IW6A 2VO6A 4G9RA 4BF2A 4P4CA 3HA6A 5E8UA 3S0OA 4XOYA 3DS6A 4KIKB 2C30A 3O7LD 4JRNA 3WF6A 4K6ZA 5H9BA 3TTJA 3OUNB 1TKIA 3SX9A 4L43A 3RPRA 3TNIA 3ZUTA 3CTJA 4XX9A 3FMDA 4EI4A 2BHHA 3GNIB 4M3QA 1LEWA 5AUUA 5DRBA 3OXTA 4EKKA 4AN2A 3GENA 4AT3A 2OBJA 3R8PA 3BYOA 2ITQA 4BTMA 5CAQA 5CI6A 5EDQA 2QG5A 3UO5A 5HO6A 2W5HA 3GC7A 2HXLA 2YDJA 2Y6OA 3S2PA 1Q3DA 3W10A 4KIOA 5IQGA 2J5EA 5ETIA 3ZC5A 2PE0A 1A06A 3R22A 3KVWA 4FKSA 3V5PA 4Z3VA 4YJUA 4E5BA 3MPAA 4AN9A 1MQBA 5I9UA 3R1QA 5J8IA 4XG7A 2J9MA 2CGUA 3HDNA 1H1RA 4EOIA 3AOXA 3P9JA 4BFMA 3L8VA 4GRBA 5FRIA 2X2MA 4G5JA 3IW7A 5AUYA 3TKHA 5C03A 4FTOA 1SMHA 5IUGA 1AGWA 2GNHA 5CANA 4X3JA 4QMXA 3NYXA 4FG7A 2JITA 3QX4A 3R7YA 3PG1A 4CTBA 5DT0A 3LXLA 4N0SA 3RKBA 4BYIA 3C50A 5FP6A 4EZ5A 1STCE 4FKIA 2ZAZA 1OVEA 5EM6A 3G6HA 4LYNA 4RG0A 1M17A 4RJ8A 5EI2A 2VX1A 3SQQA 4D4VA 5B2KA 5CT0A 2C3JA 4G3GA 1U54A 2C0IA 2J51A 2QOQA 4IE9A 4JG7A 5E8VA 2C5XA 3VRYA 3PSDA 4AOIA 4ZOGA 5EFQA 4C8BA 3NS9A 2W06A 1ZOHA 1OL5A 4FTUA 2BCJA 1FINA 4LOOA 3EB0A 5CSVA 3RINA 3C4FA 5KKRB 3F5XA 3LFDA 4BN1A 1H24A 3DLZA 4PV0A 3DB6A 3KU2A 4DCAA 2JBPA 4I20A 3E62A 3A7GA 3R73A 4KIKA 5J87A 2YAKA 4WA9A 2ITOA 3K54A 4PL3A 5FEEA 3LCOA 3MW1A 5HIBA 2PL0A 1GY3A 1VYWA 1Q8YA 3FXXA 3PXFA 5FM2A 5KE0A 4PWNA 4CVAA 1Q62A 5L2QA 2PUNA 3UYSA 1YI6A 1PW2A 5JGBA 3SKCA 3R83A 4FZFB 1DI8A 2RL5A 4GV1A 4HZSA 4RC4A 4EOJA 3GQLA 4L6QA 4XYFA 4MXZA 4UMTA 2X7GA 5HG5A 4ZY5A 4UXQA 5AX3A 3VVHA 3R8UA 4K2RA 2GNLA 4GH2A 2ZM4A 4KBAA 3OXIA 4J53A 2OLCA 4RLKA 4QMZA 4U0IA 5KKRC 4O0XA 3H10A 3O17A 5IQBA 1FOTA 1Q5KA 3G2FA 5CF5A 4QT1A 2LAVA 5CX9A 4WG4A 5A4QA 2E9OA 4PPCA 3UNJA 4BI0A 4C3FA 3GCQA 4S31A 4EUTA 4DG0E 4ID7A 5EHOA 5IQFA 3QHRA 2W1FA 2XJ0A 5EW3A 2QCSA 4IAKA 4E4XA 3G5DA 3HEGA 3QU0A 4EZ3A 5CNOA 4Z7GA 4U81A 3VHEA 4ANOA 3RAKA 5AIKA 3WARA 2XKDA 4QP3A 4ASZA 2YN8A 2E9PA 4I3ZA 2EXEA 4YJTA 2F2CB 3DU8A 4XNEA 4RGJA 3BBWA 4KWPA 3R9RA 2I0VA 2VWBA 1UA2A 4L7FA 4XH6A 4O0TA 3NX8A 5JGDA 4FBXA 3HLLA 4R8QA 3W2QA 1Y57A 4IX3A 2JDTA 5HICA 3BHVA 2FSMX 1FVTA 4L44A 4LV8A 4YZDA 3W18A 4NCTC 4B99A 2ZVAA 1J7LA 2PE1A 4DEAA 3R30A 5DEYA 5TE0A 4A9TA 5EQEA 1UU7A 1WVXA 1PMNA 3MA3A 5BVWA 3V5WA 3RHKA 4BGHA 4WNMA 1IASA 2YFXA 2UVXA 5EM5A 2CGWA 3R2BA 2BDWA 3C4XA 1YXXA 1WBNA 3E7VA 1UWJA 3ZDUA 3RNIA 1JVPP 4IC8A 3DLSA 4YLJA 5HLNA 2C69A 4NIFB 3GOKA 4GFOA 2A4LA 3O96A 4NJ3A 2JAMA 1PMUA 3SC1A 3QKKA 4HVIA 1JSVA 1R0PA 4CGAA 5IQHA 4FF8A 5D7AA 4ANSA 3V5LA 3ZRLA 1KE6A 4E8AA 3MIYA 4X7QA 4XP3A 4F64A 3NPCA 3CQWA 1OM1A 2R2PA 1ZZ2A 3IGOA 5F4NA 5A3XA 4AW0A 1OIUA 4D2TA 4PNKA 1OB3A 2ITZA 5HVJA 4TXCA 4OBPA 3POOA 2REIA 4YJQA 5FTGA 4YSJA 3W2PA 2WPAA 3HZTA 4EH4A 3ZONA 2UW6A 5AFVA 4QP2A 4NCTA 5DFPA 2VO7A 4IB1A 3QTRA 4DTAA 4RJ3A 2W4OA 5BVDA 4RVMA 3O51A 1W84A 1IA9A 3I7CA 3VJOA 2Z7SA 4YO4A 1U4DA 2VWVA 5DI1A 3NVMB 4K8AA 2QOIA 1MQ4A 3B2TA 3C5UA 3W8QA 5C1QB 1O6LA 2WMXA 3R7GA 5KHWA 4HOKA 3ZU7A 4J98A 4J96A 3QUDA 4E4MA 1X8BA 1IRKA 4YR8A 3SXFA 4O6EA 5CAOA 3NAYA 4ZTHA 5IDPA 2XB7A 1G5SA 1H1QA 3ZXZA 3SV0A 1PMVA 2XK6A 3Q5IA 4QQTA 5HG7A 4U3YA 1DAYA 2XKCA 4QYHA 3V5QA 4EYMA 3M2WA 1W83A 4ZSLA 5IH4A 4JX7A 3NZ0A 3WF8A 3MVJA 4GIIA 5A6OA 3R28A 2E9VA 5BVKA 4YBKA 4BCIA 5J1VA 5B0XA 4YZCA 4IWOA 4CXAA 4DEIA 4UYNA 1WBWA 1MRVA 2QOHA 3MTLA 4XV3A 5AP7A 4D2VA 4DH8A 2F57A 3BZ3A 3WZKA 3FQEA 1OGUA 3L8XA 4RBLA 2BKZA 4FV3A 3C7QA 4OLIA 1XR1A 2UZNA 2BIKB 4FV4A 4ACGA 4NIFA 4U79A 5ETCA 2CKOA 2OU7A 5D11A 1OL1A 4C58A 4J52A 3R9DA 2WO6A 4EEVA 3LPBA 4W4YA 4IX5A 3QTQA 1BX6A 3FPQA 4JL9A 3DK3A 3NUXA 3Q32A 4FK3A 1OECA 5ANJA 5J7BA 4FEUA 4ACDA 3DJ5A 1H1WA 3COIA 3QCSA 4TYJA 3AQVA 3DQXA 4V01A 1U59A 4YJOA 3WIKA 4BCFA 4IADA 4EQUA 1H01A 3FC2A 3JPVA 5EYDA 2WMSA 3QRJA 3KXXA 3RP9A 4DAWA 4BR3A 4CTCA 1W7HA 1DS5A 1OIYA 2WFYA 3LFBA 4AT4A 4G2FA 1YXUA 4IVDA 4O21A 5GJFA 2UW3A 3EZRA 4GFMA 3GCVA 1VEBA 3ORZA 5HBHA 2IO6A 3MH2A 2HXQA 3AC8A 3DXNA 5FTOA 3CTHA 3QWKA 4KSQA 1JSUA 2HWOA 4DFLA 3P1AA 4GU6A 5HZNA 3AMBA 1PKGA 3MJ1A 5E92A 2OJFE 5HU9A 2BRMA 4CYJA 5IA1A 5CU2A 3TI1A 3DCVA 3QTWA 4RZVA 3UP2A 4JRVA 4PP7A 1W82A 3W2RA 3CD3A 4GYGA 1RE8A 2RG6A 3C0GA 4IAAA 3P78A 4FV5A 4JJRA 4UN0C 3VRZA 3PRIA 1PXOA 4LGGA 3MBLA 3VBXA 4TWCA 4B9DA 1WBVA 5BUEA 4E6QA 3GXLA 3OC1A 3QGYA 3ZEPA 3RK9A 3EYGA 3OCSA 4Q5HA 5AEPA 5CEMA 5IDNA 4M7IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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