3VN9A

Rifined crystal structure of non-phosphorylated map2k6 in a putative auto-inhibition state
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
QNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of non-phosphorylated MAP2K6 in a putative auto-inhibition state
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2012-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3vn9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3vn9A01
3HV5A 3Q6WA 3B2TA 5I3RA 3HP5A 4FTNA 3H4JA 2HXQA 2R3KA 3LQ3A 4PPCA 4PV0A 4FG8A 1BKXA 5H9BA 2XJ1A 2Z7RA 3AT2A 3SKCA 1XQZA 4KIOA 4LRJA 2PUPA 4A4LA 1GAGA 3W8LA 5BUJA 1J3HA 2J50A 5EHLA 5L4QA 1ZMVA 2XNOA 2HIWA 4V0GA 3SG8A 4YTIA 4H39A 3EQGA 5JFVA 3QTSA 3RPRA 5KBQA 2UW0A 5AP5A 4EQMA 2V5QA 3TTJA 3WI6A 5T68A 4X2KA 2JC6A 5C03A 5CSXA 3EZVA 4ZSAA 4KAOA 2BHEA 3FMLA 3ODYX 5BNJA 3QTIA 5ANIA 3Q4UA 5IISA 4FKSA 1LEWA 3EYHA 1WMKA 4FIHA 5EI8A 3ZH8A 3UVQA 4O81A 1H1WA 4QMQA 2QKWB 5JKGA 4ALUA 3NGAA 2YM4A 3SG9A 5HO7A 4I23A 4D2VA 4AZVA 5F94A 2X9EA 4A4OA 5CEOA 3K5VA 4W4YA 5JGDA 4ZMFA 4FKTA 4AOJA 5AP3A 3QQKA 3R9RA 1YXVA 2WEIA 3DQWA 5HBHA 2FB8A 2PUUA 4CKJA 3WYYA 3OXIA 1BUHA 3O50A 4FZ6A 4G1WA 4JT3A 4XP2A 3S00A 3MESA 3CXWA 1UKHA 3ENMA 2DS1A 2OICA 5B2KA 4LQMA 4LGGA 4ASDA 3EFKA 5IUHA 3F3ZA 5D1JA 4EK6A 4ZTNA 3LFBA 2FH9A 4FSUA 2C5VA 2PVYA 4N4SA 3UNZA 2UZTA 2XIZA 5D7AA 3OEZA 2YLFA 4ZY6A 4XRJA 4FEVA 4MNEA 4B0GA 3T3VA 1U46A 3OXZA 5LARA 1ZYCA 5ANGA 4RGJA 4K77A 3CR0A 4C7TA 2CKEA 3OOGA 4C8BA 4RIYB 1YDSE 2X0GA 2R5TA 3SD0A 1H1PA 4DH7A 3ORZA 4JRNA 4F63A 4BICA 1FQ1B 4QP8A 2EVAA 4U44A 3Q4ZA 5CAQA 3BZ3A 4B4LA 4QMWA 3JVSA 2QHNA 1Y6AA 2Y0AA 2VAGA 4E6QA 5IQBA 4IQ6A 4KIQA 5ETFA 5KZ0A 3FLYA 4XP3A 5EOLA 3I7BA 2RIOA 1FMOE 4XG6A 3LXNA 4G31A 4TZRA 2BUJA 3L9PA 2BROA 3D4QA 4MQ2A 4DA5A 5F4NA 4CT2A 4NKAA 4BBEA 4YTCA 3BEGA 3PP1A 3QD0A 5KNJA 3FC2A 1W98A 2WMXA 3PLAE 1KWPA 4IVCA 2VWXA 4BWKA 4X7QA 4PWNA 2J0IA 2ITNA 4C36A 1W84A 5ANEA 3C0HA 4KINA 5JRQA 4D55A 4QMMA 5FUTA 2C68A 2PVKA 2V0DA 5EI2A 3RAHA 4ZEGA 1URCA 2YJRA 3L8PA 4FEXA 5BYYA 4QMPA 5C26A 2BFXA 1FPUA 1RDQE 3O17A 4ITIA 4UMRA 1M2QA 3AC4A 4GK4A 4NK9A 3RGFA 3V8TA 4E4NA 4YC8A 3PXYA 5AUZA 3VAPA 3GXLA 2GMXA 2WAJA 1OL6A 4G3DA 5E8TA 3VUKA 3R8UA 1MQBA 3ORKA 2PVFA 3QRTA 4OR5A 4QP7A 5B2MA 3R7OA 4DG3E 4FIIA 4PDOA 3DDPA 1OMWA 2EXMA 4FVQA 4MXOA 5HIBA 3MJ1A 4BTMA 2JLDA 3LFSA 4LRKA 2HZIA 4TNDA 4BFMA 1HCKA 2UW7A 5L2QA 1U5RA 3BX5A 2JBPA 2XYUA 4C4GA 2WELA 4PL5A 5AA8A 2YIWA 3QL8A 1G3NA 4P90A 4RLKA 4XX9A 3U4UA 3KCKA 5BX0A 4QQJA 2YA9A 3G51A 4AW2A 5H8BA 2PWLA 3U6HA 4FV4A 3BEAA 3DLSA 3F3UA 5J5TA 5DLSA 1NVSA 2E9OA 1H07A 3SAYA 2EWAA 1RW8A 4K9YA 5IQGA 3UVPA 4IAKA 2C6IA 2F7ZE 4YJNA 3TZ8A 2VTNA 3HUBA 3U6JA 1JPAA 3DBQA 1NXKA 4JBOA 4MBJA 3F66A 4EOSA 3Q3BA 3QC4A 4FSYA 4IWOA 4QQCA 4BKYA 4IADA 2ACXA 3F5PA 5JFWA 2IZTA 3Q04A 4CZUA 3L8VA 3MH3A 4D1XA 5M4IA 2UZLA 3DOGA 2YZLA 4QP6A 3R8ZA 3RNIA 1XBBA 5A4LA 4BI0A 2RFEA 4R7BA 3KRRA 3F7ZA 3MPMA 3ZFMA 4ACHA 2G01A 5E92A 1ATPE 4AA4A 3CQEA 1PXIA 4FT9A 3GOKA 4D4RA 2BZJA 1Q4LA 3V8SA 5ITAA 4PDSA 2BKKA 2SRCA 3THBA 2JD5A 4CMOA 2ITOA 5HBJA 3G9NA 4U41A 4CFXA 4RIWB 1BI7A 1U59A 1WBTA 3NNUA 4TW9A 2Y4PA 3OT8A 1AGWA 3E88A 3CPBA 3PJ8A 4QPAA 5CVHA 5FP6A 5HNGA 4LOPA 4O2ZA 3ACKA 3A7JA 4IANA 2XKFA 3E93A 2UW9A 2WMUA 4C3PA 4BBMA 3FI4A 1YXSA 3IPHA 4CGAA 3EN9A 4GIIA 4DEGA 1PW2A 3KMWA 4O0YA 4D4YA 1OGUA 1OUKA 4IWDA 5BVFA 2UUEA 5GZAA 3DNEA 4QP4A 3UNKA 5HVKA 5D10A 5GZ8A 3R9DA 3OWPA 1OBDA 3POOA 2GFSA 2WIHA 3GC8A 4UZHA 4EHVA 1GZNA 4FL2A 4O0TA 3MH1A 4CVAA 3PE2A 2VNYA 4L8MA 3UZRA 5KUPA 4XRLA 2I40A 4U8ZA 1PRYA 2QOBA 2X1NA 3DK3A 4IWPA 4EKKA 3ET7A 3NCGA 4F7NA 1WVWA 2PL0A 4IAYA 3QRIA 2OWBA 2A1AB 4RJ8A 5AIKA 4BGQA 3S2PA 2VUWA 3HA6A 2OXYA 4ANLA 1YHWA 3NLBA 4JJRA 5KBRA 3VC4A 2VX1A 2XEYA 3FKNA 5AIRA 1B39A 3DK6A 3CD8A 3NUPA 3VQUA 4MCVA 4RVTA 4IZAA 5CI6A 3R02A 2HW7A 4L52A 4PY1A 3OUNB 4YPDA 3QXOA 3UP7A 4DITA 4RWJA 5F9EA 2BRBA 1H1SA 4PL3A 2OJFE 3F5GA 3FL5A 3FBVA 3QD2B 2GCDA 3KMUA 2J0KA 4ZJJA 3SXRA 4HVSA 4U9AA 1CDKA 2LGCA 3R2BA 2DYLA 3GCVA 3M1SA 3PXZA 3FPQA 3FZSA 4ANQA 5ANDA 4EH5A 2KULA 4BWXA 5I3OA 3RP9A 3PP0A 4C38A 4GFGA 4ZZMA 2NO3A 3KRXA 3SRVA 4BTFA 1IASA 2NRUA 3D0EA 4AZSA 5CVGA 3Q5IA 2JITA 2YAAA 2B9HA 4MWHA 5FM2A 3O7LB 3NIEA 4BGGA 1F0QA 1XR1A 3C4EA 4MWIA 3NVKI 4W4WA 4KD1A 2RF9A 4RPVA 5EM6A 4UMTA 2C6TA 3RVGA 3OS3A 5A6NA 4IW0A 4RIXB 5CSWA 4R5SA 3NCZA 3C9WA 4NM7A 2WMSA 3F3TA 4EK3A 3DS6A 3LFFA 3NUUA 2BIKB 4R8QA 2HW6A 2VWZA 1OB3A 3I6WA 4HYIA 3QHRA 4Q9SA 2X81A 3VIDA 2ZM3A 4FF8A 2HY81 2XKDA 1UU7A 4G3CA 2IZUA 3GCPA 2W4JA 2XBJA 4NJ3A 4WG3A 1WBSA 5JMSA 1ZWSA 4AN3A 2Z7LA 2C0IA 1XH4A 3V3VA 2GNFA 4I0SA 3UO4A 4EJNA 5J1WA 2RFSA 4XG7A 3NNVA 4FI1A 4BKJA 3CGOA 4FNZA 4TTHB 5AA9A 1IEPA 3EL8A 4YJVA 4AOIA 5IA2A 2RFNA 2WTVA 3D5UA 3BPRA 4F9AA 2R64A 4FNYA 3ZRMA 1QPJA 3S4QA 4AT5A 4USEA 4PMMA 2ITQA 3LQ8A 2GS6A 2P2HA 3MVJA 4I5MA 2BAKA 4M0YA 3GU8A 3L8SA 3E7VA 5EDQA 3PVWA 4FR4A 3ZXZA 2F2UA 3GT8A 4A07A 4DH1A 4ITJA 3T9TA 2CMWA 4JQEA 3NAYA 3WARA 3IW4A 4FSRA 1OKWA 5L8KA 3KXZA 3PY3A 4NM5A 2GU8A 5B7VA 5J7HA 4D58A 4G34A 3B8RA 4J7BA 2XUUA 4DFXE 2W1IA 2QG7A 4WNPA 4YJSA 4EBVA 4EH7A 1TVOA 3A60A 4R6VA 4EK4A 2J0LA 4DT9A 3BU3A 2OIQA 3UJGA 3VS3A 5CEMA 1E9HA 2OF2A 4PMPA 2YFXA 1OM1A 4PNIA 4WD5A 3ITZA 2HENA 5AJQA 2FYSA 2V55A 2YIYA 1JKKA 5G1XA 5HI2A 2ETMA 5FGKA 1YWRA 4AACA 4CQGA 4M12A 2X8EA 3VS0A 4CV9A 1G8AA 3DNDA 4OTQA 5EQPA 5FTGA 3QYZA 3I0OA 3N51A 1KOBA 5C01A 4AXAA 1HCLA 4QP1A 3LMIA 2CGVA 1P5EA 2VN9A 2YDKA 5AR8A 5JT2A 3U54A 2BCJA 3VRZA 2OJIA 1WAKA 2ITTA 2WO6A 3BWJA 3D15A 3EN6A 3FQEA 4R5YA 4I1ZA 4NUSA 4WUAA 5HLPA 4AA5A 4AZEA 3MIYA 3V6SA 3HMOA 2ZYBA 2WPAA 5AUUA 2OFVA 4KSQA 4O7RA 2J7TA 4OTWA 2R3LA 3PSDA 4DBXA 2QOKA 2YIXA 3VJOA 3NNXA 4XLIA 4HVDA 5DOSA 4FODA 4U43A 4F9YA 3MTFA 1LP4A 5IH6A 3F2RA 4KBCA 4OGRA 4FSWA 1GZ8A 4WUNA 3NIZA 4Y72A 2QG5A 3QU0A 2BZHB 3PYYA 3WF7A 2PZ5A 4I6BA 5CEKA 4PQNA 4JVGA 4F1OA 3WZKA 2JIIA 3LCDA 5L8JA 1OKYA 1NT2A 3ZM9A 2YWVA 2W1ZA 3CKXA 3LXLA 3NR9A 4ACMA 3UODA 4D2WA 3PA4A 3HYHA 1WVXA 4ZTLA 2A4LA 3PIYA 3VS2A 2R3OA 4CRLA 3BE9A 4WG5A 4XG8A 1RJBA 2C6KA 3FL4A 1OUYA 1Q62A 3KC3A 4FK3A 3RWQA 3S3IA 4BYIA 4JG7A 4UBAA 1VEBA 1FINA 5D7VA 3V04A 2IW6A 2YM5A 4M97A 4H3QA 4AFEA 4LG4A 4EL9A 4UX9A 2ETRA 2GNGA 4AZWA 1TQIA 1T46A 2W1GA 4DC2A 5CWZA 4Q9ZA 4KBKA 4QMOA 4BZNA 2E2BA 5IZFA 4FEUA 3R7IA 1UVRA 2G15A 3KA0A 4D1ZA 4YURA 4XYFA 2CKPA 1PMVA 3D5WA 3WILA 4GIHA 5FD2A 4BGHA 3MFTA 4IJPA 1PYEA 2XIKA 2VTHA 4XOZA 4ZXTA 5BUIA 4FYOA 4YNOA 3R7VA 2IVSA 5IA1A 3TZ9A 1CKPA 2AYPA 3TACA 4NM0A 5HNBA 3WZUA 1OBGA 2BR1A 1WBOA 4OTRA 3R21A 5G6VA 4L45A 3F88A 1VYZA 3GEQA 3MFRA 3EOCA 2VZ6A 3BHUA 3CTHA 4OTGA 2LAVA 5EM8A 5AP6A 5A3XA 4BZOA 4EYMA 4L7FA 4AW5A 4ANSA 4FK6A 2V7AA 2Q83A 3PPKA 3PWYA 3W2OA 4QT1A 4YLJA 4GVJA 4DE4A 4MK0A 2BZKB 3SDJA 5K9IA 1O9UA 4EH9A 5EHOA 2Z02A 3DQXA 2ESMA 4MF1A 3Q2MA 1H25A 2YLEA 2WGJA 3HV4A 4QO9A 2GSFA 4ERWA 3FPMA 4IVDA 3GVUA 2WTIA 4EZ5A 4NL0A 4M84A 4ZS4A 4ALWA 5CU2A 2C6LA 3O71A 5HD7A 4JDIA 3I0QA 1YKRA 3I6UA 5EG3A 3OBJA 5HO8A 3DB8A 2CNQA 2FVDA 3KN6A 4L46A 2HWPA 4DYMA 3VBYA 4O82A 3OY1A 3PVBA 4ITHA 3DLZA 4JBVA 4BCNA 5F20A 4B9DA 4OAVB 5DR2A 3OCGA 1MRUA 3PWDA 5JZNA 4EONA 3ULZA 2NPQA 5DG5A 4KB8A 4DGMA 3OTUA 2FUMA 3LXPA 3PJ3A 4J97A 4MBLA 4HW7A 5KHXA 3MBLA 3R7UA 3UNJA 3ZFXA 4U80A 5AV3A 3L8XA 4D2PA 1PMEA 2J51A 4AX8A 2WMBA 4A4XA 2C1AA 3LE6A 1XJDA 4FSZA 2WTDA 1YXTA 3MPAA 4AS0A 3QXPA 3V5LA 1YWNA 2XKCA 3NW6A 5FQDC 3PPJA 2VTOA 4MXZA 2QI8A 2WU7A 3QRKA 2I0EA 4L3LA 3CIKA 2FSOX 2YAKA 4C2VA 5BYLA 4GKHA 3GU4A 3C13A 4L43A 4DCEA 5KO1A 4YJOA 4DBNA 3ZU7A 4NKSA 2ITPA 3D9VA 3TUCA 3PG3A 2Y6OA 3FUPA 4QMTA 5HEZA 4IM2A 3PSBA 5ETCA 3G33A 4UB7A 4FTJA 1Q8UA 2RG5A 3LCOA 4U81A 3R8LA 4A9YA 1TQMA 4JDJA 2XNPA 3KF4A 4RT7A 2WTJA 4BDFA 2HYYA 5L2IA 4FV9A 5A46A 3A2CA 2ERKA 1ZZLA 3ZLWA 1NVRA 1SMHA 3FXXA 4F9CA 1TKIA 3MJ2A 5J9LA 3SQQA 4YC3A 3R8MA 1W7HA 2AUHA 5EKNA 5T6KA 3SHEA 3FMJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HV5 A;  3Q6W A;  3B2T A;  5I3R A;  3HP5 A;  4FTN A;  3H4J A;  2HXQ A;  2R3K A;  3LQ3 A;  4PPC A;  4PV0 A;  4FG8 A;  1BKX A;  5H9B A;  2XJ1 A;  2Z7R A;  3AT2 A;  3SKC A;  1XQZ A;  4KIO A;  4LRJ A;  2PUP A;  4A4L A;  1GAG A;  3W8L A;  5BUJ A;  1J3H A;  2J50 A;  5EHL A;  5L4Q A;  1ZMV A;  2XNO A;  2HIW A;  4V0G A;  3SG8 A;  4YTI A;  4H39 A;  3EQG A;  5JFV A;  3QTS A;  3RPR A;  5KBQ A;  2UW0 A;  5AP5 A;  4EQM A;  2V5Q A;  3TTJ A;  3WI6 A;  5T68 A;  4X2K A;  2JC6 A;  5C03 A;  5CSX A;  3EZV A;  4ZSA A;  4KAO A;  2BHE A;  3FML A;  3ODY X;  5BNJ A;  3QTI A;  3PUF C;  5ANI A;  3Q4U A;  5IIS A;  4FKS A;  1LEW A;  3EYH A;  1WMK A;  4FIH A;  5EI8 A;  3ZH8 A;  3UVQ A;  4O81 A;  1H1W A;  4QMQ A;  2QKW B;  5JKG A;  4ALU A;  3NGA A;  2YM4 A;  3SG9 A;  5HO7 A;  4I23 A;  4D2V A;  4AZV A;  5F94 A;  2X9E A;  4A4O A;  5CEO A;  3K5V A;  4W4Y A;  5JGD A;  4ZMF A;  4FKT A;  4AOJ A;  5AP3 A;  3QQK A;  3R9R A;  1YXV A;  2WEI A;  3DQW A;  5HBH A;  3AKL A;  2FB8 A;  2PUU A;  4CKJ A;  3WYY A;  3OXI A;  1BUH A;  3O50 A; 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