4GT3A

Atp-bound form of the erk2 kinase
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
348
structure length
347
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ATP-bound form of the ERK2 kinase
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 106
structure length 347
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gt3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gt3A01
3QZIA 3R7VA 5HX6A 4D9UA 2Q0BA 2J50A 5FTQA 4WT6A 3DBQA 5DR6A 3BELA 3BLHA 3W2QA 4EOJA 2IZRA 1BMKA 4FKIA 3AC1A 3AOXA 2XMYA 5HZNA 3FMNA 4JR7A 1OBGA 1P14A 3A7FA 5FP5A 5IQDA 2XYUA 4FTNA 2XIXA 2YHVA 4JNWA 4BKZA 5IEVA 4FTQA 4II5A 2HW7A 4NKAA 4ERKA 4XMOA 3IG7A 2C1AA 4J8MA 3TG1A 4D55A 3LHJA 4XG7A 3PVWA 5TE0A 3HMNA 1UKHA 1SMHA 5DT0A 3BRBA 2OW3A 4BCFA 2GDOA 2CJMA 4WNMA 3ETAA 3UOJA 4ZEGA 4B8MA 2ITWA 2BKZA 3BE2A 5CEPA 1J7IA 5CEIA 5IKWA 3C0IA 3ZLXA 4Q9SA 5IPJA 4J71A 5CAVA 2X81A 4UMTA 5F95A 4K8AA 4G31A 4YZMA 2WMXA 3HDMA 2JKQA 3PUPA 2C30A 3NYXA 1J3HA 2EXCX 3PZEA 4TY1A 3MB7A 3EFKA 3OWPA 4J52A 4K2RA 4TXCA 5H3QA 4A7CA 4C8BA 5IDPA 2GSFA 3WZJA 2W17A 2FB8A 5BVNA 3AC8A 3HV4A 3R00A 2UV2A 4AZEA 4RGJA 4LRMA 4IM3A 5KMJA 5CXZA 2VTAA 3F3VA 4EH7A 4F9CA 4QYFA 5D10A 1Q8TA 4LMUA 4D0XA 1PMNA 3B8QA 3R73A 4HPUE 4APCA 2F7ZE 2QR7A 4I94A 4AGUA 4RFZA 2FA2A 4M0ZA 4HNFA 3Q04A 4FKPA 4JDHA 4JOAA 4DLJA 5C4KA 4RWLA 3PA3A 1KOAA 3A2CA 4BFMA 2GHGA 3V5JA 2C6LA 3A60A 2CCHA 3Q32A 2BZJA 4IFGA 1WVXA 1YXUA 4CCUA 1FPUA 2VWZA 4K0YA 3UP7A 3FSKA 1OL5A 2WMRA 4ZLOA 2ITTA 5HO7A 4RLLA 4B4LA 3JVSA 4EH9A 2EWAA 2ZYBA 3QCXA 4ZIMA 4WSYA 4YHFA 2C6IA 3JPVA 2JD5A 2R3FA 3ORXA 4FICA 4IAZA 2QI8A 5AA8A 5JQ8A 2JAMA 4EUTA 3LCDA 2FSTX 3GQLA 2PVKA 3W1FA 2XH5A 3BHVA 3CJGA 3F2NA 2VV9A 2BRBA 1PMVA 3OMVA 4G5JA 3POZA 5ICPA 1GJOA 4QMYA 2XRWA 5K0KA 3VRYA 3NUAA 4M7IA 3CBLA 4M67A 3UQFA 4WNPA 4C4EA 3KB7A 4RWIA 2YCFA 4IMYA 2ETRA 3B2WA 3QQFA 3MV5A 4DF3A 3O7LD 5IA3A 4S32A 3ZBXA 1Q62A 3EWHA 3V04A 3ZCLA 4G34A 3EN9A 3FAAA 3ANRA 4OTWA 3POOA 5HVKA 5F1ZA 3NMUF 3QRJA 2Z8CA 3PIZA 4MKCA 1R78A 4QP7A 4JDIA 5HD4A 5E91A 5HG7A 2W1ZA 5GIOE 5HIBA 1S9IA 2ZOQA 4NH1A 3U6IA 4C2VA 3FI8A 2C68A 3H10A 4RJ3A 1ERKA 4FK6A 3WZUA 3PXZA 1ZARA 5FLFA 4RIOA 3MVMA 5J7BA 3DXQA 1GZOA 4F7LA 3A7JA 4NUSA 4QQ5A 3FLQA 1MRUA 3DTWA 3BYOA 1OIRA 4GFMA 3ALOA 4YMJA 4AW1A 2BUJA 2JKOA 3R2YA 2IJMA 5L2IA 3AT3A 3MH0A 4DBNA 5CWZA 3CC6A 4OT6A 4YZ9A 4A4OA 2PYWA 5HVJA 4FTMA 5J8IA 4E6DA 4FNYA 5KMKA 5E92A 5TT7A 3FZ1A 3RKBA 3VUHA 3WARA 1HOWA 5LVPA 3ORPA 5IA5A 1Q3WA 3COMA 1PXLA 2P33A 3EFWA 3M11A 4EOIA 3IGOA 4DINA 2CKEA 3EJ1A 4ID7A 3FZPA 2EU9A 5AJQA 4BIBA 5M4IA 1JBPE 3A7HA 2YCRA 2W9FB 2C0IA 1Q61A 3AT4A 4MQ2A 4CMOA 4AN3A 2OXYA 3EQHA 4PY1A 3FXXA 5CSXA 4QP9A 2UW3A 2YDKA 4O2ZA 4PMSA 4WOVA 2UW0A 3OUKA 1ZZ2A 2V7OA 2DQ7X 1V0OA 4RG0A 4RIWB 5CQUA 5EFQA 4DA5A 3ZO2A 3DK7A 4LOOA 3ZC5A 1GNGA 3ENMA 2RG6A 4QMUA 5AAEA 3ET7A 4WKQA 5I4NA 4MXAA 1PXKA 3DV3A 4KIQA 5HO6A 4DG2E 4DH3A 3CKWA 3PRIA 1E1XA 2QU6A 4PV0A 2JIUA 3KXHA 3OBJA 1MP8A 3GBZA 1FBNA 1YKRA 3PZHA 4ZZOA 3O96A 3MFRA 4RBLA 5IISA 4E4MA 3VS7A 3DB6A 3UIXA 3MI9A 1M2PA 3R8PA 1ATPE 3NS9A 3FSFA 4MX9A 3F7ZA 2X1NA 3NVMB 3Q9XA 4FEUA 3QWKA 2W05A 4JAIA 4JBOA 3BLRA 1SVEA 5DLSA 2PVRA 3W33A 2E9NA 3QUDA 3QYZA 4GK4A 5HLWA 4U7ZA 3LMHA 4IC7A 4Y83A 1PXOA 5CS6A 4C4IA 4CFFA 5F9EA 4KINA 4FL2A 2VTLA 3RPRA 3COKA 4ALUA 5JFWA 2B1PA 3EQDA 3ORMA 4R77A 3EQGA 2ITUA 4RA4A 3UOLA 4QMTA 4TRLA 3UG1A 5GJFA 4CYJA 5CF8A 4FEQA 4F08A 5DYJA 2IW8A 3TJDA 3JR1A 3ATSA 5M56A 4CZTA 4IB5A 3U4WA 1GZNA 4MF0A 4ALWA 3TNIA 1VYWA 1H24A 2GNJA 2VWBA 2WTCA 2UW4A 2BCJA 2R64A 3R9RA 3HAVA 1SVGA 3KVWA 4O86A 4P4CA 1M7QA 5EOLA 5BQ0A 4TW9A 3BE9A 4C57A 3BCEA 3F3UA 3CTQA 4V05A 2QVSE 2GU8A 4DFBA 4G9RA 2OIQA 1H0WA 1KV1A 1R0PA 3TNHA 4PL3A 3P86A 1OUYA 5I9VA 4RT7A 3W10A 5GINE 3QF9A 3AC5A 3SRVA 3QXPA 4EZ5A 1T45A 3W2OA 2ZV7A 4JJRA 2J6MA 3D5UA 4C2WA 4KABA 4ACHA 2CSNA 2QOBA 3W16A 3MDYA 4Y8DA 1PHKA 5AP1A 2OLCA 2XK3A 4CG9A 4X2FA 4CRLA 2W9ZB 4PUZA 4GEOA 4WNOA 4UMRA 3EQBA 2ITYA 4GV1A 1BYGA 2C6TA 4BCKA 2OICA 2GHLA 3RHXA 3QQKA 4YTCA 2BRMA 4H3PA 2P3GX 2WZJA 3BHUA 2VWYA 4EK6A 4BGGA 4P2KA 4AG8A 1UNGA 3OUNB 3EIDA 2B7AA 1WBNA 4S33A 4TL0A 5DNRA 5CT7A 1GY3A 5DN3A 1WCCA 1Q8WA 5D1JA 1P2AA 4OTIA 3RJCA 4F9YA 5KNJA 2HY0A 4G6OA 2XNEA 3EHAA 5E8YA 5L2WA 3OWKA 5KMOA 2HOGA 4NZWB 1ZYCA 2PE1A 3QX2A 3E8CA 3KXNA 4J97A 3F66A 1Y57A 3P78A 3R30A 3SA0A 5GZ9A 1ZZLA 4A9UA 3UO5A 1OM1A 2PZ5A 3FZTA 1YDRE 5K0XA 3R7IA 3OTUA 3OW3A 3OW4A 5LMAA 3VUIA 4NTTA 2W1EA 3PE1A 4MBJA 3L9PA 3EH9A 2RL5A 3QD0A 4IDTA 4G3CA 3JYAA 5HGIA 2OZAB 3G51A 2H8HA 3MFUA 5LJJA 4I24A 4XEYA 2QU5A 3GGFA 4A4LA 1FVVA 4Q5HA 4IX5A 4DBXA 3ZZWA 3HRCA 2WU6A 4FOCA 4W4VA 3UPZA 4CLJA 3FWQA 4DCEA 1I09A 3VC4A 4O0UA 1VEBA 5I3OA 2BIYA 3A8WA 3F69A 4NTSA 1RDQE 1PXPA 3SX9A 2YM8A 3R7YA 4JAJA 3QZHA 4DEGA 4UWCA 3EMGA 4C62A 2QOHA 3LFFA 2ETKA 1TQIA 2XNOA 3OZ6A 1FMKA 4D5KA 5CU0A 3PXYA 1H8FA 4IVAA 4RVLA 1NVQA 4GL9A 3G90X 2IO6A 2VTQA 4L6QA 4C61A 3DBFA 3R63A 5CU2A 1XH6A 5JFVA 3SGCA 2QURA 3QD3A 2UZVA 3WILA 1OECA 3QLFA 3VHKA 4BTKA 4CSVA 5EK7A 4BZOA 4RZVA 2W1GA 4M8TA 4XP2A 3VULA 1O9UA 2F2UA 4IM0A 4XV1A 5LVNA 3S00A 1V1KA 1Q8YA 2J4ZA 2I40A 1CMKE 1OZ1A 2PWLA 3PYYA 5A4LA 3FEGA 3TM0A 3QKKA 4FVQA 2X0GA 1YWRA 5AR5A 4BDCA 5IMXA 3Q5IA 2CGWA 2RFNA 4YC6A 3REPA 3TKIA 4H1JA 2R0UA 3MN3A 4O38A 2YAKA 5FTOA 2A0CX 4U9AA 4AW0A 4ZTRA 4EH6A 4B7TA 2CGVA 4D2TA 3BYUA 4DEDA 1VJYA 2ZVAA 3DBCA 3OTVA 5ACKA 3Q9WA 4EOSA 5LXMA 1Q3DA 2WTKC 4TNBA 1OPKA 4DC2A 2ONLA 5AV2A 2XA4A 4L52A 5DFPA 3BWJA 4QPSA 2OJJA 4A07A 3S4QA 2WB8A 4R3PA 5FP6A 2X9FA 2WOUA 2C1BA 3LJ0A 3ZXZA 3TTJA 5BNJA 3WF6A 3ZU7A 2JBPA 4FT0A 4FEWA 4X3FA 4KIKA 3UZPA 1R1WA 4KWPA 1YXSA 5CF4A 3DCVA 3C9WA 4U5JA 5AR7A 5FDPA 1Q8UA 3ZLWA 1J7LA 4FT3A 3ZLYA 3RPSA 3P7BA 5L8JA 1T46A 2JDVA 3FHRA 3O8PA 4FV0A 4I6BA 5L8LA 4KBAA 4BGHA 5C9CA 3W18A 4FNXA 3FYJX 1L3RE 5EYKA 4K11A 2I7QA 1CM8A 5D11A 4FVPA 3BI6A 4JG6A 2QG7A 4EH4A 2UZBA 4O84A 5EOBA 5FXQA 2B4SB 1URCA 3LLTA 4H3BA 4C02A 4KRDA 5IU2A 2PHKA 2Q0NA 1H1RA 3VRZA 4UX9A 2UUEA 5DMZA 2X6DA 3U4UA 3A99A 5LARA 3VW8A 3F5GA 2X9EA 3FLYA 3GUBA 3N9XA 2DYLA 4AA4A 3TEIA 2Z7SA 4XG4A 4K18A 3LFSA 4MQ1A 4PTGA 3CR0A 3K5UA 3UZRA 1M17A 2QCSA 2UW8A 2PVFA 3MFSA 4FKJA 3R8LA 3QRIA 3FBVA 3AT2A 3SOCA 3WE4A 4AZVA 5KBRA 5AP7A 4ZZMA 4O96A 5IEXA 2BTRA 3DPKA 4R5SA 4XV2A 4BGQA 2PUNA 4IAFA 5DI1A 2UZNA 2F7XE 3DDPA 3IDBA 4U80A 4X2JA 3AMAA 5D7VA 4ZS0A 5EM6A 3ORKA 3T3VA 3PJ3A 3GOPA 3TV4A 4RC3A 2ZM4A 3LFQA 5E8VA 3UMWA 2GMXA 2I0VA 1KE9A 3A4OX 2C6MA 4I22A 4QNAA 4IAKA 3LMIA 2QQ7A 3G6HA 4WIHA 5AP3A 4YJTA 1U5RA 3MPTA 5FD2A 1R39A 5ETAA 1ZOEA 4IB3A 3TUCA 3QGYA 4IWDA 2PVMA 5B7VA 3QCYA 2W4KA 3NYOA 3CE3A 4TYJA 4WUNA 2LGCA 1KE8A 1OVEA 2ETMA 4PL4A 3NR9A 2C6EA 4LM5A 5IUGA 2V0DA 3B8RA 1JKTA 4MD7E 1G8AA 2C47A 3GFEA 2Y0AA 3KRLA 4QP8A 4X2NA 4KBKA 5KZIA 5M4FA 1Q24A 4O22A 3Q60A 2FUMA 4P7EA 3UDBA 5A6OA 3IDCA 3E3BX 4M0YA 4PMTA 3NW5A 3MPAA 2OH0E 4J99A 2VO6A 3A7IA 3FMDA 3ORTA 3PIXA 3BQRA 2OJ9A 3BV3A 4G3GA 4L53A 4DHFA 3TWJA 2JFMA 4CTCA 2R9SA 1JNKA 4YJOA 3OF0A 5HIDA 4IXPA 4R6VA 2R5TA 1PXNA 4EYMA 1UKIA 2E9OA 2ZB1A 3R8MA 4FSYA 2HENA 1EH4A 3K2LA 2WEIA 2XK7A 5DE2A 4RC4A 4O2PA 5E90A 4UV0A 5GNKA 5KO1A 3RGFA 1TKIA 1OKVA 4FMQA 1KUTA 4S30A 4WNKA 1PKDA 2OBJA 3DK3A 2BDFA 1NVSA 4PP7A 1QCFA 5BUEA 1ZAOA 3BGQA 4X3JA 1LUFA 2YJSA 2UVYA 4DFYA 5I3RA 1KV2A 3PFQA 4C35A 4UBAA 3KKVA 3B2TA 4MK0A 5BYZA 1P5EA 3IO7A 3PXFA 3HP2A 4IB0A 4TWCA 1LPUA 4R3RA 4BL1A 3GCSA 3BBWA 3IW8A 2ITVA 2WMVA 3MPMA 5HCXA 2BTSA 4HZSA 4Y85A 2QO2A 4OLIA 4L3PA 4QTEA 1UU8A 5CAUA 3OOMA 3D14A 4XLVA 3RM6A 4E5BA 4ITJA 3VIDA 5LQFA 2ONLC 2ZDUA 2NO3A 3II5A 2BHHA 1YI3A 3ZYAA 3VF8A 3BHTA 3KMWA 4EOPA 1DI9A 3CD3A 4TYHB 1DS5A 3LJ1A 2WMAA 4X3FC 3UGCA 3NVKI 4MXYA 3QHWA 4JG8A 1YRPA 3RZFA 4NYEA 3E64A 2WD1A 1WZYA 4QOXA 3KRXA 3RAWA 3UVQA 1YOLA 1FGKA 4IE9A 3QRUA 5HCYA 1NY3A 3KCKA 5KBQA 3PG1A 2QOIA 1IRKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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