1JSTA

Phosphorylated cyclin-dependent kinase-2 bound to cyclin a
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
298
structure length
297
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Complex (protein kinase/cyclin)
source organism Homo sapiens
publication title Structural basis of cyclin-dependent kinase activation by phosphorylation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE-2
total genus 83
structure length 297
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 1996-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1jstA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1jstA01
5IQAA 5FM2A 2YM8A 3H10A 4E6CA 3QKMA 2JDVA 1PXJA 3LZBA 4ZP5A 1PY5A 4IJPA 3CSVA 2CN8A 4C58A 2FUMA 3U4WA 2VTAA 3ZXZA 2C5VA 3FL4A 4QQCA 3GU6A 3EN5A 3JY9A 3MESA 5AP1A 3ZO1A 3Q3BA 3KULB 1JWHA 2O0UA 3DBFA 3LMGA 4O82A 4C62A 4DINA 5IKWA 3F6XA 3OMVA 4DGGA 2CKOA 4DGOA 2W17A 4IC8A 3RPYA 2WQBA 1H26A 4G2FA 3SD0A 4FGBA 3VBWA 2XIKA 5AX3A 3ZHPC 4ENYA 4DE4A 2IW9A 4PMMA 5LXMA 1VYZA 3FKOA 3MB6A 3RK5A 3TACA 2ZB0A 3BHVA 4I5CA 4G17A 4RX8A 4NM0A 3VNTA 4C7TA 4E7WA 3PJCA 4XV2A 2VX1A 1XH5A 1GIIA 1BKXA 4B6LA 1BL7A 2VNWA 3QQGA 4U44A 2WOUA 3LJ2A 2CGWA 3BWJA 4FF8A 4FIFA 4D55A 5AP3A 1WCCA 2UW6A 3KK8A 2DS1A 4V0GB 3QGYA 1YHWA 5DMZA 2QOCA 4JOAA 2ZV2A 3SRVA 1H0VA 1DAYA 1PKGA 3SOAA 4XRLA 4BY9E 4DTBA 5I0BA 3OVVA 3DAJA 5CXZA 5M06A 1M2PA 3ORZA 4BGHA 4MXZA 3LPBA 4CMOA 4RSSA 3LCTA 3WIGA 4FKUA 3ZEPA 4D4SA 2OKRA 3U4UA 3UOKA 5CSVA 1FMKA 2RFNA 2YJSA 4RIXA 4WIHA 4BCIA 2VUWA 3FLWA 3PZEA 5DT0A 4CFNA 5EDRA 2FO0A 2X6DA 5HE2A 2X2MA 4JNWA 4AGDA 4TYHA 4O7YA 5AMNA 2VN9A 1U46A 3KQ7A 5C8MA 3R04A 3VUIA 5EHOA 3W8QA 3MSSA 5HBHA 2O3PA 4JG7A 1YKRA 5LMKA 3R9DA 3FZRA 5CXHA 4R7IA 1DM2A 3DA6A 1RDQE 3UNJA 3GBZA 3WIKA 4I6FA 3RM7A 5DH3A 5CANA 3F69A 3UYSA 3LQ5A 1OKWA 3EJ1A 4D5HA 3DJ7A 1YHVA 5LWNA 3BV3A 2KTYA 1CMKE 2V55A 4UN0C 1UNHA 4KIKA 3W2CA 5EM8A 2R3OA 3O7LD 3DCVA 2OIBA 4X7QA 3HRBA 2YCQA 2OJFE 3TJDA 4F1TA 4XH6A 5KMJA 5C4KA 4D9TA 4Y83A 2ITYA 4FV8A 3L9MA 4V05A 2QG7A 2W1HA 3NIZA 4IJ9A 4EK8A 1OBGA 3EQCA 2ACXA 3ORNA 2HCKA 2XK8A 4I0SA 5F95A 4NM7A 4I94A 3RK7A 3O50A 5FRIA 3QWJA 4NIFA 4P5QA 4LOQA 4J52A 2G9XA 2OWBA 4G9RA 3HV6A 3OCSA 3Q2MA 3CC6A 2OSCA 3VUDA 3IS5A 3ZBXA 4NTSA 4BTMA 3RP9A 3DGKA 4R5SA 3VS5A 5H8EA 4AZTA 2VX3A 4EUTA 2JKOA 3VULA 4B4LA 4UBAA 2WMUA 3LFEA 3OUKA 3RWQA 4EKLA 4JVGA 3O8PA 2EWAA 2J6MA 4TWOA 2BKKA 3FMJA 1DI9A 1YXUA 3UG1A 3NS9A 4AW0A 2G01A 3MJ1A 3QCQA 4WHZA 1R0PA 3VJNA 3UO5A 1LPUA 3NZ0A 3QZGA 3G9NA 4A4XA 3V8WA 4A4OA 5DOSA 3HV3A 2BRMA 5D7VA 3TZ7A 4PX6A 2OO8X 3HYHA 3AC4A 4YHJA 4G5PA 2PU8A 4IIRA 3SXRA 4H1MA 4FV9A 5B2MA 2FVDA 2OFVA 4XG6A 3MA6A 4II5A 4O6EA 4QYFA 3R9NA 3ZSHA 5HORA 3OY1A 5TF9A 4MHAA 4KKEA 4M12A 3B8QA 3NW7A 1OMWA 4FBXA 3TV4A 5CF4A 2UW3A 4JQ7A 3DB6A 1P5EA 2OXXA 4MD7E 2X4ZA 3ATSA 4JRNA 2V62A 2YIQA 1FMOE 3HA6A 4GYGA 5DEWA 3ZDUA 3BYOA 4GSBA 1U59A 2WMSA 4X3FA 3R0TA 3GCSA 5IU2A 3G0EA 4IZ5A 1YW2A 3G5DA 4KKHA 2C30A 1GZ8A 2OGVA 1ZMUA 1PXLA 3QWKA 2W9ZB 2JDRA 3QRIA 4JBQA 3D94A 3TG1A 2VTTA 3R02A 4YTHA 1JPAA 2Z7SA 3P4KA 5AP0A 3ET7A 3HV7A 3VN9A 1WBOA 1OIQA 2HYYA 3R2YA 3AOXA 3LFFA 4EH9A 3BI6A 3MTLA 4IWQA 3NUPA 2YIWA 4NT4A 5KMNA 1M7QA 5HIBA 5BYLA 3D83A 4Y85A 2GDOA 1J91A 5HU3A 4MBJA 2ITQA 4RJ3A 4U80A 5HVJA 4PMPA 5HI2A 3VIDA 1KOAA 3UOJA 5HESA 1XO2B 2CCHA 4HNFA 4ANOA 3P7BA 4FTUA 5FG8A 4CMUA 1NA7A 5JGBA 4GIIA 4QMVA 2OZAA 2EB2A 4JG8A 3N9XA 4M3QA 4WUNA 4FUXA 4O96A 2YDIA 2WTWA 2WXVA 4FT9A 4YZ9A 4U9AA 3ZZEA 4PP9A 3SX9A 4M68A 1OKZA 2UW4A 3KF7A 4R1VA 4QMLA 4GT5A 4UZDA 4WG3A 3DKCA 5DBXA 2GU8A 2H8HA 3TZMA 5A4LA 4L46A 3TM0A 4ZS0A 4YTIA 4BZOA 3K5UA 3ZMMA 3E8DA 3CQUA 2GTMA 3MPAA 4QYYA 3BRBA 3QU0A 2RKUA 4FIIA 4JS8A 5LMKC 3LFSA 5FD2A 5J5TA 1V0OA 1BI7A 5A6NA 4RMZA 4RZWA 4HGSA 4E6QA 3EKKA 1MRUA 1Z5MA 4RIOA 2V22A 4XG3A 3F5PA 3V8TA 1H0WA 2Q83A 4L3JA 4MTAA 3FQSA 1QPEA 2DUVA 4CFWA 3OWPA 5I9YA 4FOCA 5H3QA 5JZJA 3ZFYA 3A2CA 4O7LA 5DR9A 4F9CA 3IKAA 2OLCA 4EKKA 2HOGA 3F2NA 3DBEA 3R1SA 4AACA 3KXZA 4Y72A 5DGZA 5HX6A 1BI8A 1SVHA 4EORA 3RAIA 3LQ8A 1Q8UA 2YISA 2CLQA 3I0QA 3BCEA 3QZIA 3T9IA 4OTDA 1NVRA 2QNJA 4O0WA 3V5QA 3E3PA 4GG5A 4M13A 5BVDA 1GAGA 3U9CA 5JSMA 2BRNA 2JKQA 3C4WA 3WOWA 3HP2A 2Z7RA 4U7ZA 3EB0A 3ZTXA 4YC6A 3SOCA 3CE3A 3R30A 5HGIA 4YSJA 3RVGA 3DXPA 3H3CA 4E1ZA 4L42A 3BGZA 4FTJA 1JSVA 3GQIA 4IFCA 4EHEA 4NM3A 2NPQA 4HZRA 1WZYA 4U41A 3DJ6A 5IF1A 2OF4A 5T6KA 2WZJA 3EKNA 5HEZA 5IEVA 3OXIA 3AC1A 4NK9A 3O96A 3BE9A 5FEEA 3RTPA 2YIYA 1H08A 4FUYA 3RHXA 4TYJA 3UZPA 2UZVA 2VWUA 4E3CA 4G6LA 4BI1A 3A62A 2WO6A 3GP0A 3NDMA 4DAWA 3V5LA 1QMZA 4USEA 2IZTA 4KRDA 3UVPA 3LM5A 4ZSJA 4ZS4A 4J96A 2E2BA 3HX4A 2UW7A 1A9UA 3C0IA 3QTWA 5E8YA 3GC7A 3JYAA 4HCTA 4AQCA 3BLHA 2GHLA 2WD1A 3H9OA 3KVWA 3WZUA 4XMOA 3E88A 2ITTA 2B9IA 2VO0A 1XBBA 3WF7A 3COMA 4HZSA 5GZ8A 1GJOA 4TN6A 2ITPA 2J9MA 4K8AA 3DXNA 5L2IA 3VUTA 3ACJA 4X3FC 4Z55A 4PDPA 5CF8A 5JFXA 2QCSA 2VTOA 3RMFA 4AP7A 4V0GA 5TR6A 2XKFA 4EH5A 1OL2A 2FSOX 2GFSA 2WPAA 3OWLA 1QPJA 4OBPA 1L8TA 5GNKA 2QOLA 3MFRA 4BIDA 5EQEA 2VV9A 4WNOA 4R7HA 4BDAA 5A3XA 5GINE 1B38A 4OR5A 4ZLZA 4IWPA 4FG7A 3ZS5A 5E9EA 1RE8A 1ZARA 2B9HA 2HELA 4M0YA 2WQEA 3VS6A 5HO6A 5EH0A 4DFXE 4GMYA 4IWOA 2ZDTA 3OEFX 3Q53A 3L9NA 2R0IA 4O0VA 3JS2A 3CIKA 3MH0A 2ZJWA 2QOFA 4QMTA 2BAQA 2VRXA 4J8NA 4E6DA 5T68A 4L7SA 5CALA 4NM5A 4FVQA 3RZBA 3TNPC 3VO3A 4YR8A 3U55A 3L9LA 2AUHA 4IVDA 2QLQA 5DT3A 4DC2A 1LUFA 3NGAA 4J1RA 4F64A 3ACKA 1DI8A 4TYEA 3MVLA 5A4TA 3OCGA 1ZZ2A 5ITAA 3O8UA 3GC8A 4O6LA 2JC6A 3VRZA 5ETAA 4MEDA 3E8NA 1IR3A 3PY0A 1KE5A 4K33A 4TNBA 2XNBA 4RBLA 4UWCA 3UPZA 3C13A 3LCKA 3WZKA 2WTIA 5HLPA 5IQFA 1H1QA 2A19B 4HVGA 1WVXA 3E8CA 1AGWA 4IDVA 2ZOQA 5CVGA 3M2WA 3C1XA 5IDNA 4JDJA 3TNHA 3WE8A 3DK6A 3HMNA 1FGIA 3MY1A 4G3EA 4A9YA 3KXGA 3W8LA 3UQCA 2OFUA 1R1WA 3CTJA 4XNEA 5FXRA 5KHXA 2JGZA 2Y4PA 2JDTA 4ERKA 3N4TA 4ITHA 4DN5A 2J4ZA 4FICA 2HY0A 5FEQA 4C3RA 2YCFA 5M07A 5DIAA 2YEXA 1OL6A 1XHAA 4F9BA 4YLJA 4V01A 4EYJA 5E4HA 5EDQA 5EM7A 5BMSA 4BDFA 4U0IA 4C33A 5L4QA 4BZNA 2R3KA 3P7AA 4JXFA 3QTIA 4FK3A 5F1ZA 5J87A 2J51A 1PXKA 3G6HA 3HP5A 4GFGA 4RIYB 4X6RA 4FV3A 3GCVA 3UMWA 4FG8A 3DQXA 3UZTA 2BILB 2BCJA 4YJQA 3PUPA 2WTDA 2YITA 2WGJA 2JIIA 2XIYA 3HMPA 4IVBA 2XK6A 3ZLYA 4RRVA 4BL1A 2XRWA 3FZ1A 3SAYA 1JKTA 3B2TA 3O51A 3NVKI 4QRCA 5AM7A 5C8NA 2JKMA 4DEEA 1TQIA 1URWA 2J2IB 2JDSA 4FVPA 3WE4A 3L1SA 5HLWA 2PWLA 5KMOA 2OJIA 2QHNA 3LCSA 4K9YA 5DE2A 5KKRB 4LUDA 3C4CA 3FMDA 2DYLA 3NX8A 4IE9A 3NNVA 1LEZA 3II5A 2P0CA 3HGKA 5C01A 5M09A 2Z02A 1WBSA 2BIYA 1NVSA 4C3FA 3K3JA 5IH5A 3CJGA 1YWVA 1YVJA 4RVTA 4TWPA 3RPOA 4CEGA 2QVSE 2WNTA 4MXCA 3UGCA 3FHIA 3BEAA 5GJDA 3SC1A 5JN2A 4OAVB 4GRBA 3PE2A 2QU5A 2EXEA 1NXKA 4QTDA 4I5MA 5DLSA 4IFGA 2IZRA 3CGFA 1IRKA 4MD8E 3PA5A 4L52A 4A9TA 3D14A 4RIXB 3K2LA 1OVEA 4IH8A 4B99A 2X4FA 3M1SA 4UWBA 3E7VA 1JQHA 4FEXA 2OJJA 4FX3A 3ORLA 2CDZA 3G2FA 4A4LA 4D2SA 3D5UA 4E73A 4RA4A 5E8SA 2ZMCA 3F61A 1XH6A 4B0GA 4FV4A 2VGOA 5EW8A 4OAUC 1J7IA 3DFCB 4RX7A 3R1YA 4JBVA 5FQDC 5D10A 5ANEA 1GY3A 5C8KA 2W1EA 2I6LA 3OG7A 2PVRA 1YDRE 3LIJA 2GNIA 5FLFA 1PJKA 4BDEA 1VEBA 4D4VA 2OXYA 3TZ9A 4EZ5A 5J9LA 5IISA 1OKVA 2G1TA 4RJ4A 4I0RA 1B39A 3AGLA 3RPRA 3VUMA 4JT3A 4OT6A 2WTJA 4GVAA 5EHLA 5C27A 4K11A 4QP3A 3KA0A 2FB8A 4ZJVA 2UZBA 4N6YA 5EDPA 5AX9A 1KE7A 2BDFA 3PPKA 3TV6A 4IANA 2HZ0A 1WMKA 4MK0A 4ENXA 2G15A 4EI4A 3R1NA 2YIXA 3MH3A 4NIFB 3SQQA 5M56A 3EHAA 5HVYA 4MNFA 4QMWA 2KULA 2Y9QA 3FSFA 2PMOX 3GUBA 5HHWA 3EN6A 3ERKA 3EN4A 3IW7A 4I6HA 4O2ZA 5J79A 4JDHA 3FZOA 4ZY4A 4XLVA 4U45A 3UTOA 4GKIA 3A7FA 4Z16A 4MXXA 2XRUA 3HA8A 3FY0A 4O38A 2FSMX 4YTFA 4F99A 4L6QA 5CQUA 2WHBA 3KXNA 2JFMA 4LM5A 5CEKA 3D5VA 1ZOGA 2XK9A 4EONA 2JAMA 3IDCA 3CS9A 2YM7A 4WBOA 4KIOA 2JFLA 3F9NA 1BX6A 5E8TA 3NWWA 4FZ7A 1F3MC 3A61A 5FBOA 1MQ4A 1KSWA 2O63A 4QPAA 3RAWA 4C37A 4ASDA 3M11A 5J7HA 2R3NA 5K4JA 1SNUA 4C02A 2VO7A 1ZAOA 5DN3A 3VBQA 3RALA 4AZSA 4ZIMA 4RX9A 4USFA 4DYMA 2Q0BA 4HYIA 4Y46A 1IA8A 2BUJA 4K2RA 4NW6A 2VWVA 3Q9WA 2W5BA 2YABA 3T3VA 3NNUA 5ETFA 4RC3A 4EWQA 2UW8A 4AOIA 3CXWA 4OTHA 3EQFA 1BYGA 3EFKA 4RJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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