4D4VA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
272
structure length
256
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFGKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 82
structure length 256
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d4vA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d4vA01
2H6DA 4B8MA 3KRLA 1ZYDA 2JIVA 3FSFA 4U80A 1XH5A 3GI3A 4D4VA 5IQFA 5B2MA 2OIBA 2XRWA 3UC3A 5FBNC 3I4BA 5TF9A 1ZYJA 3LM5A 5T6KA 4QT1A 4YJSA 2XVDA 3DXNA 4JVGA 4PDPA 3BHHA 4ONAA 3BV3A 4ZZOA 3GCUA 2QO2A 5CU3A 5FEQA 1R3CA 4FKLA 2JDTA 4ZJIA 2JGZA 3F3TA 3GENA 3W16A 5KBRA 3LHJA 4RWKA 2C3LA 2YM4A 4GS6A 3R9RA 1YVJA 2VN9A 3KRXA 4Y46A 4BWXA 5GHVA 4BTKA 1Y91A 4Q5EA 4WRSA 2WKMA 2O3PA 5TE0A 1JSTA 3VRZA 4I22A 3TKHA 1F3MC 3EYGA 3LCDA 4IANA 2VWVA 3UNZA 1X8BA 1WBWA 3PVWA 1YDRE 1QL6A 4EZ7A 1Z57A 4ANSA 3OEZA 4FTRA 2ZB1A 4FV6A 4KRCA 4B8LA 4BCMA 4MH7A 3Q9ZA 4O0WA 1ZOEA 1XBCA 4MWHA 1Q8YA 4WBBB 3H9OA 3QWJA 4FNYA 4Y95A 2W9ZB 3PA5A 3OW4A 4GFOA 2XJ1A 4DH8A 4J96A 5H2UA 4MWIA 4AT4A 1BYGA 5BUEA 3PTGA 1B38A 3O71A 2IJMA 4O22A 4XOYA 2DYLA 4AOJA 4UXQA 4GW8A 2GS6A 2WAJA 4QTCA 5EW8A 4G9CA 1O6LA 1GIHA 1QPCA 3DDPA 4CQEA 4GVJA 4L8MA 4HVIA 5M56A 4ASEA 4YO4A 2BRBA 3ERKA 3U4WA 4FKSA 4CFFA 5DLSA 5DEWA 4G6NA 5JQ5A 4U44A 3A8XA 4XUFA 3JY0A 1LR4A 1KV1A 3CD8A 5AFVA 3BX5A 5AR4A 3JPVA 4UV0A 3ORXA 4JR3A 2PUIA 4OTWA 2V62A 3F9NA 4XV1A 4S31A 4D4RA 4DCEA 2Y8OA 3R8ZA 4L53A 2BTSA 2OKRA 4PMTA 3A8WA 3VS4A 4OTHA 5M53A 4DLJA 4UXLA 4QMVA 4ZZMA 2GFSA 1ZYLA 5EYDA 1YXTA 4Q9SA 5KMKA 4D2SA 4X2NA 2UVXA 3UP7A 2G15A 5E8YA 5KMOA 4IH8A 5HX6A 1Y6BA 4N6ZA 4NIFA 2HAKA 5EDRA 4RFZA 3KEXA 3U8WA 2IVTA 5DI1A 4HCUA 1YOJA 1OKWA 3KC3A 3QZGA 4R77A 3CS9A 2XYUA 3DB8A 3MBLA 3Q9XA 1FINA 3DBEA 3PSDA 3R9DA 3REPA 3OCTA 1YW2A 1KE6A 1NA7A 1YI4A 4XG8A 3WF9A 5HNIX 1DS5A 2QOIA 4G34A 4JLCA 4OBPA 3OF0A 3V5TA 4ZLYA 4RT7A 3NCGA 3SW7A 3RK9A 1IG1A 3B8RA 3D7TB 4Y83A 3NPCA 4C58A 4A9UA 4CFWA 4PWNA 2F49A 4JR7A 5DH3A 4FKJA 4X3FB 4A9RA 3GC9A 2WQMA 4X3JA 5FXRA 4F99A 5JSMA 2IG7A 4CSVA 5BMMA 1H25A 4L43A 2X9FA 4TPTA 3E3BX 4O0YA 5BYYA 4BDIA 4EL9A 3QU0A 2UVZA 2B9JA 3PVUA 3Q6UA 2JBPA 1R0PA 1E9HA 4BDEA 3BEGA 4GK2A 5D7AA 3IOPA 3AOXA 3NUPA 4NJ3A 4HVGA 4FV2A 3QQFA 3UG1A 4KRDA 3W33A 4F6SA 4FTTA 4L44A 4U6RA 5DPVA 4AZWA 2W7XA 4C7TA 4YSMA 5I9ZA 3DTCA 4KBCA 4CCUA 4USDA 1DI8A 1PMEA 2UZBA 4LGDA 5AX3A 5EG3A 5K5NA 3R8LA 5IQEA 2CCIA 2VWYA 4NUSA 2W9FB 4XH6A 1M2PA 4BI0A 5L2IA 5L8KA 2UVYA 2W1HA 4ZIMA 4E1ZA 2XK9A 5HD4A 3EOCA 5K4JA 4O91A 3VUHA 2ITWA 1MQ4A 1RQQA 4QP9A 4APCA 3F7ZA 4ACGA 5T68A 3EZRA 4F70A 4M3QA 4QPSA 2IZTA 4UY9A 4BZDA 1ZMVA 2X1NA 3BQCA 2OJJA 4FG9A 4E4MA 1STCE 4CCBA 3DAJA 4QMMA 2QR7A 3VULA 3PJ8A 4ALVA 5C8MA 2G01A 3W2SA 2CMWA 3NVMB 1GJOA 5JEBA 2YIRA 3EQIA 4FTCA 3F88A 4FT3A 3KXGA 3RTPA 3HRBA 2FVDA 1ZOHA 3QQGA 3V51A 3GOKA 3KU2A 4CKRA 3COIA 4IC7A 4RPVA 4FEUA 5KZ0A 2CNQA 2XM8A 5AWMA 3N51A 3COHA 4AZFA 3FJQE 3FWQA 4AT3A 2UW4A 3WARA 2C5OA 1M2QA 1OVEA 3AC5A 3KFAA 3UO6A 3VHKA 4KWPA 2I0EA 3VUTA 4FTLA 1XWSA 4QNYA 4R1VA 5AUWA 3ZRLA 3RWQA 3A4PA 1KUTA 3DOGA 4BDBA 4K9YA 2PZPA 4FL2A 4LL0A 3B8QA 4JDKA 1VR2A 1H1RA 3QRUA 4MD7E 5JQ8A 3VQUA 1SZMA 5DT3A 1HCKA 3P86A 2BDFA 3UIUA 4QP4A 4ZY5A 5IF1A 4M67A 4BCGA 4O84A 1OI9A 4WT6A 1TKIA 5EQPA 3PJ3A 3FLSA 4YJOA 4M7IA 4B99A 3HX4A 1DI9A 4LRJA 4FTKA 3L8SA 5TT7A 3K5VA 5IA2A 4O27B 3EFLA 2R3RA 5CNOA 2FA2A 4FA2A 4WO5A 3NIEA 2WEIA 4BF2A 2YM7A 3BU5A 3UJGA 2ESMA 4DITA 3LPBA 5AR3A 4YHJA 2ZDTA 5EM6A 5L4QA 3F82A 4ZS0A 1CDKA 2LGCA 3CXWA 1U5RA 4U5JA 3QD4A 3HZTA 3OW3A 4ZXTA 5I9YA 2V22A 1KOBA 2F9GA 3TUCA 3PZHA 3E88A 2IW9A 4JG6A 1Q8WA 4Z7HA 3FZRA 3IPHA 3FY2A 3PG1A 3TZ9A 2X2LA 3EQDA 2C30A 2R3IA 4C0TA 4DBXA 2HY0A 1UU3A 2JEDA 3ORTA 5HBJA 3ZUTA 5HBEA 4RIWA 4BL1A 4BZNA 4M0YA 3GC8A 4I3ZA 2W96B 5EI8A 4IQ6A 2GMXA 2OJ9A 5AUVA 3NNXA 3QXPA 3WE8A 5HO7A 5C03A 2GSFA 4L67A 4RVMA 1FBNA 4O7ZA 2ITTA 2JFLA 1ZZLA 3IGOA 4HGLA 4C4IA 4ZLOA 3DY7A 3QCQA 4ZY6A 3BYUA 2F7ZE 3II5A 3OWJA 5EOLA 5EK7A 2BKKA 3UIBA 3R8UA 3QX4A 2PVLA 3QTWA 3DKGA 2I7QA 5KMJA 5HGIA 4PPAA 3LFNA 4C61A 1LP4A 1XH7A 2HOGA 2UUEA 3FC2A 4MQ2A 3VS7A 3NW7A 3CPBA 5DHJA 4FSMA 5HIBA 1REJA 1H24A 4X3FA 3BWFA 3QZFA 5T3QA 1OKYA 2X0GA 3K3IA 4I5PA 2XIRA 1WMKA 3FC1X 2XK6A 4EK3A 4EOIA 1WFCA 2BVAA 3NYNA 3WF6A 4JRNA 3JR1A 3DNDA 4OTDA 2BPMA 4C02A 1T46A 2XK4A 4ORKA 2RGPA 4EOMA 2VZ6A 3ZS5A 5FRIA 4DFUA 3FLYA 4TN6A 3VUIA 5HNBA 5GJDA 4XG9A 3TACA 4EH2A 4FSRA 5M44A 4G5PA 4W9XA 3MA3A 2F57A 5A46A 2W05A 4FR4A 4UWCA 3FI2A 4O96A 4BDFA 4LRMA 5C8NA 5KKRC 4OTFA 3KRRA 3ODYX 4FV9A 1FVVA 4WIHA 2WPAA 4IB5A 4C4JA 3NS9A 4AF3A 4RJ3A 1BMKA 1RE8A 3FMNA 4JQ8A 4IZ5A 3ORLA 5TKDA 2PU8A 2JDOA 3HDNA 4I21A 4JX7A 3K5UA 3EYHA 3CKXA 3W32A 4B6LA 4PTEA 2PVKA 1FMOE 4N4SA 3ZRKA 4GKIA 4FEXA 1OIRA 3ZUVA 2A27A 2ITYA 1XR1A 4Z7GA 3VO3A 1YOMA 4TYHA 5LMAA 2GNFA 4MK0A 4V01A 2IVVA 2C69A 4DGGA 2V55A 5ANOA 1OBDA 4U41A 3QRKA 5HX8A 4YTHA 3BGZA 4ZTHA 3QALE 3EQFA 4J8NA 3QRJA 2PZ5A 4C4FA 4NH1A 2WTDA 4W4YA 5A4CA 5GZAA 5HU9A 4IMYA 1NVSA 4G9RA 4TWCA 3V6RA 3R00A 3VS5A 3P7AA 1OL7A 3RVGA 3DBCA 3PP0A 4FYNA 4ZTRA 4DTAA 2BMCA 4ZAUA 4Q2AA 4KKGA 1TQPA 4DAWA 2ZAZA 3PY1A 3UE4A 2BZIB 4DLIA 3VS3A 2ONLA 4NTSA 4XP0A 4PQNA 2FSTX 4D4SA 4F7NA 3FLNC 3KXZA 4YLKA 4EHZA 4IB3A 2RSVA 5EKNA 4UX9A 2RL5A 1V1KA 3I7BA 4X21A 3R63A 4XRLA 4FGBA 4GEOA 4FOCA 3V5JA 1M14A 4YU2A 4GFMA 3KREA 4J1RA 3KULA 3UIMA 3ZO1A 3BLHA 3UQGA 1M17A 3FQSA 2GFCA 4CMUA 3R9NA 5L3AA 4A4OA 5L2WA 3W2CA 1OUKA 4IX6A 4LV8A 1FVRA 2H9VA 4FKOA 1JSUA 4XP3A 4FODA 3UODA 4EYMA 3LLAA 3QC9A 4JXFA 2X8IA 1M7QA 2ITZA 3KXNA 4C57A 2IZUA 2FO0A 3KCFA 1IASA 2BFYA 2X81A 3BV2A 4DG2E 4E6DA 3F2RA 4NWMA 2WB8A 4AN2A 2YISA 4WUNA 2QCSA 5HG8A 1IAJA 2QO9A 1BI7A 3QWKA 3EN4A 1AD5A 2XM9A 3QGWA 1IR3A 4KS8A 3C5UA 2OJIA 2W1GA 4MF0A 4OBOA 4XOZA 3R8VA 3SXSA 4D1ZA 3KMMA 3NYOA 2OW3A 4USEA 2RFNA 3NGAA 1JQHA 5CU0A 4OTRA 5DMZA 5IEVA 3PY0A 2PK9A 4ENXA 4CNHA 1M2RA 3CCNA 3HYHA 4U97A 1PKGA 4JI9A 4WNKA 1XH8A 4YLJA 3F69A 3MSSA 4AZTA 3GUBA 3OMVA 3MVLA 4EK5A 5CAQA 4TW9A 4JG8A 5GJGA 3ELJA 3D5WA 3KXXA 2EWAA 4L00A 3V01A 3TXOA 3PVBA 4HGSA 3OCGA 5ETAA 2FSMX 3GQLA 4BR3A 2R3OA 5KZIA 2YM3A 4O6EA 3AT2A 3ZSGA 2PYWA 2QO7A 3E87A 4IVBA 3IW4A 4J99A 5FTQA 1OZ1A 3JYAA 2BILB 3IO7A 4GL9A 3CY2A 5GNKA 3D14A 2Y9QA 2GHGA 4FKTA 3U51A 1XH6A 5AP4A 2BCJA 3HV4A 1ATPE 2W1EA 2YN8A 4F0FA 4A07A 4FE2A 3DAEA 4C3PA 4AGWA 3AGLA 3DK7A 5B7VA 3EIDA 2R64A 1MUOA 4X3FC 1OL5A 5JKGA 3H10A 2WIHA 3TIYA 4Y85A 5CSPA 4O81A 5JFVA 5BUJA 5LMKA 3F2NA 5H8BA 4EEVA 3TV4A 4QMXA 3VRYA 1AQ1A 4BCPA 3W8QA 5HCYA 4EC8A 2Z7SA 3NNWA 1FOTA 4PL4A 2WD1A 2BHEA 2J51A 2VV9A 2J0KA 2JDRA 1KSWA 4JAIA 1F0QA 2C6KA 4RWIA 4DINA 2JDSA 1OIYA 3OOGA 4NL0A 3QF9A 4FIEA 1CMKE 5H8GA 3TIZA 3UOLA 3V5QA 3WOWA 4PMMA 2YITA 4P90A 4L3PA 4RGJA 3WYYA 4FL1A 3C13A 3QD2B 3UO4A 4AACA 2YLEA 4QP7A 5EDPA 3KB7A 2VO3A 2R3KA 3ZSHA 4C35A 2ITXA 2W99B 4TWNA 4CGAA 3F3UA 3OEFX 3VS0A 4ALUA 4WG3A 2WU6A 2GHLA 2X2MA 3E62A 5HCZA 3G0FA 4ERWA 1YDSE 3ZU7A 2QI8A 1OM1A 4JRVA 2O65A 3A61A 4N0SA 5AV3A 4B0GA 4GT3A 5J1VA 2Q0NA 1XBBA 2C6DA 2C3JA 3PLSA 4ZTNA 1ZZ2A 4OAVB 4RA4A 4E3CA 3HMNA 3QXOA 3COKA 4DHFA 4LOOA 3FYKX 4QMPA 5I9XA 3PPKA 4WD5A 2O2UA 4W4XA 4YJVA 2Y7JA 1SNXA 1GZOA 2WHBA 3GNIB 4EZ5A 2XEZA 2WU7A 5JH6A 5GZ9A 3HMIA 1YHVA 3VF8A 3VWAA 4AS0A 1W98A 1QPJA 5IA1A 2OO8X 3T3VA 4IDTA 4Z16A 4BWPA 2R0UA 5CEQA 3QKLA 4HYSA 4K11A 4EQUA 1UNHA 5CF8A 3LOKA 3N9XA 5BNJA 3QCYA 5K0XA 4EH9A 4F6UA 2ZDUA 4U42A 4YJQA 4IVCA 4DEHA 4DA5A 4FVQA 5BYZA 1R1WA 3IOKA 4JG7A 4DE4A 3LFQA 3PXKA 5KNJA 2CKQA 2BIYA 3GU5A 3QA8A 4I94A 4USFA 4D58A 3FQEA 2VWZA 3LFBA 2ITPA 5JZNA 1H1QA 5B2KA 5E8TA 4FZ6A 3L8PA 3WBLA 3OBGA 2I0VA 3FKLA 3KF7A 3ZLWA 1Q62A 2XKCA 5J9LA 4BIEA 2Z02A 3KY2A 4I6HA 1H26A 2IO6A 1GZ8A 4IJ9A 2XJ2A 3SD0A 5AIKA 3DZQA 1U54A 2HZ4A 4JDJA 5HE0A 2FB8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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