2PY3A

Crystal structure of fgf receptor 2 (fgfr2) kinase domain harboring the pathogenic e565g mutation responsible for pfeiffer syndrome
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
299
structure length
282
Chain Sequence
LPEDPKWEFPRDKLTLGKPLFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVGYASKGNLREYLRARRPEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTN
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title A molecular brake in the kinase hinge region regulates the activity of receptor tyrosine kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fibroblast growth factor receptor 2
total genus 93
structure length 282
sequence length 299
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2py3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2py3A01
4NTTA 4PMMA 3COIA 4QP1A 3PJ2A 4MD8E 4YGAA 3L8PA 2C0OA 3MVLA 3QBNA 5DNRA 4C4GA 3QRKA 5AV1A 1P4FA 2W7XA 1GZ8A 1M2PA 3GNIB 5AR3A 5KCVA 4FSZA 2VV9A 4DGLC 5AX9A 3U55A 2X0GA 1PXIA 4FV6A 1BUHA 1PJKA 4C4FA 4O21A 3FHIA 5LVOA 5FXSA 5BVKA 4AAAA 3KK8A 1IAJA 1XH9A 1WCCA 5HIDA 5BQ0A 1GIHA 3CC6A 5FM3A 4RJ7A 3L8XA 3OCBA 3R63A 3VULA 1OECA 2VO0A 3P5KA 4F09A 3BWJA 2G1TA 4C3FA 4NCTA 4BCOA 4BKYA 3UO4A 4RVKA 5JGAA 3ITZA 2GCDA 2O3PA 4AFEA 1W98A 4BZDA 3BKBA 1ZMWA 2BIYA 5HO6A 4GL9A 4FF8A 2IW6A 1UWJA 3NZ0A 4EZ3A 4FSQA 4IACA 4YSMA 2BZKB 3CCNA 3P08A 4H1JA 4UX9A 3DAJA 3FXXA 3MGYA 3PLAE 4KNBA 3D7TA 3H9FA 4NFNA 4ZTRA 1OITA 4CKRA 1YVJA 4A4LA 2PYWA 5IEXA 4IZYA 4KRDA 1O6KA 2QOHA 4RIOA 3R01A 3TJDA 4U7ZA 3E8CA 3NUAA 5IQFA 4PMPA 2ITTA 3V5LA 4DGGA 1Y8GA 4Z16A 4X0MA 5FP6A 2ETRA 2UW8A 3ZLWA 4MYGA 4XV2A 4NJDA 3RWQA 4XMOA 2J0IA 5FEEA 3ZEPA 4FA2A 3U54A 3D94A 4AN3A 3U4UA 2ZDTA 2JKKA 3LXNA 2B9FA 2QKWB 4IIRA 4GG7A 4MBIA 4AGUA 2R3HA 5TOZA 3L1SA 3SOAA 3ZO1A 5M4FA 2VTMA 3ZSGA 3VS3A 4FV2A 4OTWA 3JXWA 4P2KA 4RFYA 2XRWA 4O84A 4IADA 1MRYA 4UMPA 3C0IA 1KOBA 5L6OA 4TYHA 1PXPA 3DY7A 4ASZA 1RJBA 3NYOA 3MFTA 1JPAA 2ZMDA 3QHRA 3TI1A 5LMBA 2X7GA 4FUYA 4EOIA 1YXXA 1MQBA 4ANBA 1L8TA 3G5DA 4L7SA 3I4BA 4APCA 3U6HA 4EOKA 2UVZA 1YWRA 2VWWA 4I0SA 3F7WA 4BBEA 5AAEA 4JDIA 2GS7A 5A6OA 3VUTA 2ERZE 5FDPA 4G34A 2WZJA 3TV4A 4B8LA 3Q2MA 5CYIA 3O23A 4I21A 2CJMA 4ITHA 4MD9E 4F63A 4YU2A 2B53A 1YDTE 5ANGA 4L8MA 3HA6A 4ZLOA 2W1ZA 1VEBA 1HCKA 1XJDA 2R3FA 3NNWA 5DH3A 4AA4A 2NO3A 5H3QA 2YM5A 4JJRA 4QMQA 4RBLA 1BLXA 2R0IA 2WMSA 3BCEA 1V0OA 1F3MC 2HW6A 2ZYBA 3GBZA 3R7YA 3VBWA 5HE3A 4CG8A 3MB7A 5DI1A 3Q3BA 3UMWA 4V01A 4HJOA 5DT0A 3VF9A 2BRNA 2JDSA 3H10A 3CP9A 3H9OA 3QKLA 3HMPA 4D2WA 4D5KA 1WBWA 2BFYA 3KF4A 3EN4A 3FI4A 3ALOA 3DT1A 1NVRA 3COKA 3LFDA 5JZNA 2IW9A 2R3JA 1OL6A 2YDJA 3FI8A 4DTAA 2UZLA 5CQUA 4Z3VA 2VO7A 3DAEA 5IA1A 1WVXA 3RTPA 5BMSA 3GFWA 2Z02A 4F7JA 5AV0A 4IWOA 3K2LA 4QMVA 4RPVA 4AW0A 5M56A 3P7AA 1ZY4A 5IQHA 4E6AA 1TQMA 4M14A 2XKFA 3IDPA 1OL1A 4C38A 2EVAA 4CFMA 3ID6C 4C7TA 5KMIA 4YJNA 3NIEA 4O2PA 5F20A 5C01A 4JBVA 4JRNA 5HU9A 4YC3A 4V0GA 3D5WA 4K9YA 3PFQA 4PWNA 4CZTA 4D2RA 5IH6A 2W1DA 2XM9A 1AQ1A 3AGMA 3WF5A 2H6DA 4NEUA 2BDFA 4HYHA 3MIAA 1YQJA 2C4GA 4I94A 4FKTA 2Z7SA 4FSYA 4O2ZA 1WBSA 2W4JA 3HX4A 4L67A 3NUSA 4M15A 1CTPE 4YJTA 4BHZA 2YITA 3AD4A 3QTSA 4PTCA 5CZIA 4UYNA 2BCJA 4N57A 4FEUA 3MVMA 2XCHA 4NM0A 5AP2A 4E4XA 4PDYA 4DEIA 4DLJA 3BHHA 3E93A 2VO6A 2IW8A 2CNVA 4S30A 4TTHB 2CGUA 4TPTA 5DIAA 2VX1A 2HZIA 3EFKA 3CKXA 4FGRA 4RWJA 1T46A 4NTSA 2R3QA 2RKUA 3OVVA 4YJRA 4BCKA 4RWIA 2VN9A 5H8BA 4JBQA 4C61A 4IDVA 4GK4A 3PIXA 2HELA 2GNLA 4IVBA 2OZAA 4GK2A 4WNOA 3FLWA 3ULIA 4D0WA 3AT3A 3EMGA 1OPJA 4DTKA 3W8QA 4FNZA 3BRBA 4CLIA 1Q61A 4QYYA 5KZ0A 4EEVA 4FEVA 2R9SA 2PVLA 3QCXA 3MA3A 4Z7HA 3LFCA 3TTIA 3BZ3A 3NDMA 3SDJA 3FWQA 2OIQA 5A54A 4WT6A 4L43A 3FV8A 2QQ7A 4ANOA 2ETMA 2VTAA 5EFQA 4I93A 2Y6MA 5HI2A 4CZUA 1WBNA 4KBCA 4KIKA 3TACA 2WU6A 3E87A 3P0MA 4P5QA 1Q97A 3OWPA 1YXUA 4D4VA 4AT5A 4J1RA 3H0YA 4IBMA 4EQMA 3WARA 3A61A 4FKSA 5JFSA 5EQEA 3PA5A 5C4KA 1YHWA 5HO8A 3ZRLA 1YOLA 2XIRA 2Y8OA 3QZHA 5M44A 3IDBA 3BLRA 5FM2A 4LL5A 4IFCA 1XWSA 4C37A 1ZYLA 3AD5A 4E26A 3LOKA 4WNPA 2X2MA 4MQ1A 5M4IA 2HCKA 5D9HA 1UU8A 1LR4A 4BCPA 1Q8YA 1OIUA 2REIA 5AM7A 4ZZOA 3PRFA 3O0GA 1BKXA 5DA3A 1M17A 5IQIA 2HY0A 2OWBA 3ZLYA 2GFCA 3MY5A 4JRVA 3DPKA 4YHTA 5I3RA 3O2MA 2CKOA 4QYGA 2WO6A 2WTVA 3BIZA 4FTKA 3KVXA 4G16A 3PXYA 2E2BA 3ENMA 5LOHA 4H36A 1R0EA 3ZO3A 3BU3A 3ZO4A 2R7BA 3TXOA 5AR4A 4C2VA 4EKLA 4EUTA 5IG1A 4FNYA 2CSNA 5H9BA 2IVTA 4FODA 2CKPA 3QTQA 4D28A 4FSUA 4AZTA 4CV8A 1H28A 3GQLA 4WG4A 4EYJA 3MPMA 1NA7A 4O0XA 3KXZA 3KXGA 4O82A 5AP0A 3T3VA 3G90X 2FA2A 3KQ7A 4BKZA 3D0EA 4IVCA 4FTIA 1JAMA 5EI8A 5ACKA 1OBGA 1Q4LA 4J97A 3GOKA 2ZM3A 2XIZA 3VS0A 3G9NA 3DFCB 3G33A 3HMMA 5HGIA 4QMLA 2W5AA 1NY3A 3W32A 3I79A 4GRBA 5HG8A 2F7EE 3SW7A 5EDPA 3MJ2A 2CKEA 3UIXA 2G2IA 2B9HA 4S2ZA 1TVOA 5I9ZA 3LJ0A 4USDA 2IO6A 3A60A 2E9VA 5HE0A 4GUEA 4L52A 1YDRE 3FC2A 2YA9A 3NUPA 4MBLA 5EDQA 2OJGA 4RX7A 4F9AA 4ID7A 3TN8A 4APPA 3BU6A 1JOWB 3E3PA 4S34A 3VS4A 1FINA 4C58A 5HG9A 3U6IA 2YM8A 3MBLA 5ICPA 3FL5A 5E8ZA 1W0XC 3LCSA 3OXIA 4NKAA 5FBOA 2FSLX 3FDNA 3R8LA 2WPAA 3MYGA 2X81A 3OXZA 4DAWA 5GHVA 4FIJA 4BKJA 1ERKA 3OCGA 4IM3A 5HG7A 3PVWA 3UG2A 3TV7A 1H24A 3AMYA 3HMNA 5DE2A 2OKRA 3VS2A 2QOOA 2VTTA 5A4TA 5HIBA 2R4BA 4QOXA 2ONLC 4YJOA 4AZSA 2E9PA 1XBAA 3F69A 4I92A 3AXWA 3DKGA 5E1SA 3D5XA 4F70A 2GS2A 5LVLA 3OY3A 4GMYA 5DRDA 4FV9A 4FV0A 1SYKA 4MKCA 2OU7A 3MS9A 3DBCA 4K11A 4G9CA 4ZTSA 3NMUF 2JC6A 4YP8A 3SV0A 4IQ6A 2BTSA 1WBPA 3LMIA 1OKVA 4FTLA 4ACCA 2FGIA 4MCVA 5IPJA 3CQWA 4I6BA 2YACA 4DFLA 5ANIA 1TKIA 2PUIA 1R39A 1QMZA 2JLDA 5JQ8A 3RINA 4FTUA 2Z7LA 3GQIA 4AX8A 4UN0C 2C5VA 4FTRA 4O7LA 4EOOA 2ITVA 1XH4A 3QU0A 2ZV2A 4FV7A 4CFNA 3IGOA 4MNEA 1PMUA 3OS3A 5J9LA 3JPVA 2J5EA 4LGDA 1RQQA 3BEGA 3HMIA 5BVFA 4XJ0A 2O63A 5I0BA 4DFUA 4LV8A 3C0HA 4FK6A 4AZWA 3KXXA 4QNYA 3H3CA 3ATTA 4XG7A 4RG0A 4XP3A 4FKPA 3C50A 4YURA 4GH2A 2VTNA 1YI4A 3ATSA 5DBXA 3MN3A 3I7CA 3NYVA 4YPDA 3P78A 3PE2A 2ITPA 3RZFA 5ETCA 1JLUE 4F7LA 1FVVA 2YEXA 1GZKA 3JY9A 1UU3A 4F9BA 3A7FA 1ZMVA 3RWPA 5LWNA 4IFGA 4J8MA 5H2UA 4G3GA 4XP0A 4K6ZA 3F61A 3SHEA 3Q9WA 4U40A 2A4LA 1VZOA 4FKLA 3OTUA 3BGZA 4WRSA 2XP2A 5E8SA 4EK4A 4YMJA 4EHGA 1YXVA 3L9PA 4I5HA 4GYGA 4YNEA 4BDDA 2XNMA 1OL5A 1PXLA 2UW7A 4FIFA 4QO9A 1T45A 3C4FA 5EHOA 2YDIA 5CI6A 2GHGA 5EQPA 4CG9A 4IX4A 1OM1A 3BX5A 4X3FB 3MFSA 4FV5A 5IZFA 3QXOA 4L45A 3FKNA 5AV2A 3UNKA 3UIUA 5AV4A 3F5UA 5KMMA 4O83A 4Y46A 3NR9A 3WF7A 2WMTA 3CGFA 4UWCA 2YLFA 4JDHA 2YZAA 4B7TA 4ZXTA 2XK7A 5ETFA 5EW3A 3FMLA 3F3ZA 3HLLA 1H07A 3PZEA 4I3ZA 4OTPA 4FYOA 2X9FA 3CGOA 1MQ4A 3KRJA 5M07A 4I6QA 5A9UA 5AUWA 3R28A 4PL3A 4C33A 3TUBA 1BX6A 4CTCA 3A7JA 4MH7A 4PDOA 3VNTA 5FBNC 4ERKA 3BYSA 3UIBA 4ARKA 2JITA 4I22A 4R78A 5GZ8A 4D55A 2GHLA 1JSUA 2DS1A 3UMXA 3CD3A 4TL0A 2P55A 3OWLA 3IK3A 1UKIA 2W1CA 4X3JA 3FMEA 3EQGA 2YM7A 2PVKA 2V7OA 3POZA 2PPQA 3AG9A 4FC0A 1YI3A 3CJFA 4A06A 4AW5A 5CS6A 3S3IA 3PVUA 4XLIA 3IO7A 1J7LA 3ROYA 4F4PA 5IA3A 4R5YA 1MP8A 4KD1A 4QMSA 5BPYA 3S0OA 2C5NA 5E92A 5CENA 5A14A 1KSWA 2ZM4A 3JYAA 5C8NA 1YDSE 3CEKA 2QOFA 4WNKA 4ZSAA 2C0IA 2YISA 1RE8A 3NW5A 3Q4CA 4L68A 4L9IA 1OL7A 5DLSA 4BVUA 4EBWA 4X7QA 3HRBA 4ZJJA 2YWVA 1V0BA 5E9EA 5EM5A 5AR8A 4M0YA 3VBTA 1W84A 1ZAOA 2XKEA 3LFFA 1MUOA 4JT3A 2OXXA 4EH3A 4E8AA 4LL0A 4LOOA 1JBPE 5C03A 3GC7A 4X3FC 3FPQA 4CFVA 4PV0A 4O38A 3FZRA 3DDQA 3FMHA 4I4EA 5F94A 2PVRA 3T9IA 3KC3A 5BYLA 3TDWA 2BALA 3HZTA 4CFXA 4DH3A 4FT5A 4G3EA 4O7RA 4F6SA 4QPAA 4NK9A 3Q9XA 3ZBFA 4E6CA 3GU6A 3AC8A 3F3UA 2ZB0A 3GU5A 4QMPA 4HYUA 4BIBA 1KE5A 3NUXA 3PXFA 4U41A 4YZMA 4GJ2A 3ZC5A 4JVGA 4EOSA 3LCTA 2VTJA 2VTRA 3QAME 2V5QA 4L44A 4BYJA 5GIPE 3PRIA 5EM6A 4IVAA 3GU8A 3O51A 4O0WA 4E4NA 2F49A 2HAKA 3Q6WA 2BRBA 3FSFA 3DBEA 3R00A 4IAIA 4XCUA 4TNBA 4ZSJA 5HNGA 2PMIA 4RJ5A 4AFJA 3LIJA 5E91A 5KMOA 4LMNA 5F1ZA 2YLEA 2ZB1A 1XH8A 5GZAA 2YM4A 3C0GA 1V1KA 4QQ5A 2JIUA 3KCFA 4HNIA 4EK5A 3FY2A 4IHPA 3P86A 4GU6A 2P33A 3VHKA 4F64A 3DAKA 4TN6A 4UZDA 3BYVA 5EOBA 2UW3A 3K5UA 3PVBA 3ZUTA 4YC8A 2OLCA 3R9HA 2XNOA 1Q99A 3DKCA 5FEQA 2O65A 3R21A 2VWXA 3UOJA 3L8VA 2X8DA 4MHAA 5AAGA 3VUIA 4F9CA 4C0TA 3NRMA 1J3HA 5DPVA 2H9VA 1PXKA 1IR3A 3LXKA 3GGFA 1R78A 4BRXA 4UWYA 5BMMA 3S95A 2E9OA 3OG7A 3S4QA 3B2WA 3B2TA 2O8YA 3UNZA 2R3PA 5CAQA 1H1QA 2OG8A 5CWZA 4EQCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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